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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0141500 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0141500.4 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Tripeptidyl-peptidase 2; TAIR: AT4G20850.1 tripeptidyl peptidase ii; Swiss-Prot: sp|F4JVN6|TPPII_ARATH Tripeptidyl-peptidase 2; TrEMBL-Plants: tr|A0A151T4Q0|A0A151T4Q0_CAJCA Tripeptidyl-peptidase 2; Found in the gene: LotjaGi2g1v0141500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:51484914..51505042) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GCGGCGATAACGGCGGCGATAACAGCGGCAAGAAAAGCGATGGTTCTTCTCTCCGTAATTTCAAGCTGAACGAGTCAACC TTCTTGGCTTCACTCATGCCGAAGAAAGAAATCGCCGCAGATCGATTCATCGACGCTCACCCTACCTACGATGGCCGCGG TGCTCTCATCGCTATCTTCGGTAACTTCCCCTACCCCTTTGACTCCCATTTCTCTGATCATTTTGTTTCTCTTTGAATTG ATTTTGACTTATCATGCTTTGTGCTGTGCTTGAATTAATCTACTTATCATGCTTTTTTTGATTGTTTAACTTGATTCCAT TGAAGAATTGTATATTTTGCATATGAATAATGGTGTAAAATGAGTTCAGTTGCAATTCTCTGCTACTAAAATGTTTGTTG GGGTTATAAATCTATTGTTTGAATTCTGATGTGTTATACTGTAATTGCAAGTGATTTGTGTTGCGAAGTTGTTCAATGAT TCGATATGCATGTTTACAGATTCTGGTGTAGACCCGGCTGCGGATGGATTACAGATTACCTCGGACGGGAAACCGAAAAT TCTTGATGTCATTGATTGGTAAAGAAAACTATTTCATTTTGGTCTTTTAGCTGATGCTTCTTTTGGTGTTTTGACTGGTT TTCGAATAAAGATAAGATATCTTACCTTTTCTTTCTTCAGCACCGGGAGCGGAGATGTTGATACCTCAAAGGTGGTGAAG GCTGATGCTGATGGTTGTATTAGTGGGGCATCTGGTTAGTCCTATGGAATATTGCGTAGTCTGTTTGTATGATTACAAAT AATTATGGTCAGACATTCTTCAATATATTGTAGCATTTGCTCAAGAGGTATTCGGAAAAAGAAACTACACACTCAGCTTG TGATGATGTAGCTCCTTGTTTGCTGCTGAAGCTAGACAATTATTATTATTCTTGAATTTGCCTAAAAAGAATAAAGTTAT 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TCTCTCATAATAATTACATTTTAATTTTCCTTTTTATATAACCATTGATACTCTCAAATTAATTTCTTTCATATTTCTAT GTTACTCTAAAATTTCCTCTTTTTCCTAAATCTCTTTATGCGCTCGCTTCGTTGAATAATTATGCTTATCTTCTTTGTAA TTTTAAATTTATCAAAAGTTTCACAATATTTATGCAATGCATAAGCATGCAAGACTGGTAAGAGCAAAGATTTGTTGTTA TTGTTTTTTTTTTTGAAAGATAAACATCTTATTGAATTCTATGAAGAGACATGAGAACAACCTTCTTAGGAAATAGGTGA AAAAGAAAATACCCACCCAAAATACATCTTTAGAAGTCATGGATCTCTAGATTCCACCTATGCAGTACATTAACAGCTAG CAAAAATCAGTACCCTCTTACAAGTAGAAGCCCAAACAAAATTGAAGACAAAAAACAAAAAAGACACCTTTAGGTGGGTA TTTTTTTTGTTGTTATTGTTTAATGAAACTAGAAGCATGAATACACATCTCAGACTATCACAATTATATAATCTGTTATC TATTTGTGTATTAAGCAGCATGCATCATAATCAAACTTTATTGTACACCTCTTCTCTATTTGGAAATTTCCATCTTTCTT TCTATATTTCAAATTAGGTGCCAGTCGATAAAGCACCATAAACTGCAGGCTAAATTTGAGGACCCATTTAAATTTTTGTG AAACTGTAGGGATTTTAACTACGCAGTTTTAATATATATGGGGACCTAAGTTCTCAATCACTAGAGCGACTTAATTGAAA ATTCTCAACTAGTTAGGACCCAGTCCTGTAGATTAATTTAGCCTTCAATTAACTTAGTCTAGAAATTATGGAGTTGATAA TAGTGTAAACTTTTGCCCTGATGGTATCTCACATTTTCTTCACAAAGTTTATCATAAAAGTTAATTCTTTGTTTATAAAT GAATGGTGCACTACTTTCACAATGCACAGTGGTACTTGAGAATTGAGAATAAATTTCAACGGATATCCTTATGAATTGCT CTATTTATTTGTACTTAGCATACTGATTTTGTGTGTTTCCTTTCTTAAGGAATTGTTAGTTTGATTTCTGTTTTAATGTT CTGTTCTTTCTTTCCAATTTACCAAAAAAAGCATACTGATTTTTTTATCATACATGAAAAAACAAATCCAACATTTATTT ACATTAGTAAAAATGAACTATTGGACCATTTTCTAGAATACTAATGTTTCCAATGCTTAATTTCTATCTCACTGTAGAAT ATCAAGAAAAAGTTTGAGTCAGCTCGAGACCAGTTAGCAGAGGCACTTTACCAGAAGGGGCTTGCGCTGGCAGAGATCGA GTCTTTAAAGGTTAGAGCTTCTATTCTTTTTTTCTCTTCAGCTATCATAATATGAAAACATGCTAAGCAATGTGAAGAAC CTGGCAGATGATATTTCAGAAGTCAGTTTCATTTGTCATGTTAGGTTGATAGAGAACTTCGATCCAAAGTAGCTGTTTAA AGCAGTAGTGCTTGGTCTTGTAAAAATATTCAAAATATCTTGAAGAATAGGATATCCTTGCAAACTAAGATCAAAATTGA ATTATTCTTCTCATGTGCAAACCACGCCTATTATGTATATATAATTTCTTGTAAATCAGCAGTTGTCGTCGGCATGATAT TACCAATATTGTTGCCCACAAGTACTATATACTATAGCTATTGCTATTGAAGTCAACAGCTTTTCACATTCAGGCTCCTA TGGTTATTTTGAACTTACTCATGCATTATACTTCGTGAGAAAATGTCAAAGGAGTCCGTAGTTATTTTTCCATTATGATA ATTGTAACATATAGTTATTTTTTCTATCGAATAAAAGTTGGCAGACTTGACTTGGTGTATATTGTCAAAGGACGTAGATA AGTTCTTGGCTTTGGAGGCGGGGACAGGAGGTGCAAGAAAAGATGTGGACAATGAGCAATCTACAGATGATGGCAGCCAT CCAGATTCGTTCGAAGAGAATTTTCAAGAACTGAGGAAATGGGTTGATGTAAAGTCACCTAAATATGGAATCCTCTTAGT AACACGCGAGAGGCGTTCTCAAAGGCTTGGGACAGCGTTAAAGGTATTTTCTTTTGCAAGTCATTGCATTGGTTGCTGCA TGGATGATAATTGACCAATTTATTAATTACTAACAGTATCATATGACATGCTGGTGTCTATTCAAGTTCAAAGACCGAAA GTTCTCGTTGCTCCTTAATAAGAGATTATTTTTGGATAGTTAAATATTATCTTTGTGGTAAAAACTGACCAAAACATTGA ACAACATTTATTCATAGTTTAATGGTCGAAAAGGAGGAATTAATTGTGTTTTCAATTTTTTTATAATATAAATAAGAAAC ATAATGAAAATATAATTTTTGTTCATAACAGGTAATATGATTGTATTCAAAGTTTAGTCGATGTAACATTCAAAAGTTGT AACATTATGAATTACATCATGACAATATTTCAAATAAGCACCTGGTTTACACCTGAGTGGTCGGTTTTTCAGTTGAATGC GCCGGTATGATCCAGTCCAGTTTCGTGATTGATAGATAAAGTTGTGTTTATGTGGAAGCTTACTTTATGCTTTTAATGAT GATATGTGATGAGGGAAGGGGCATTGATTAGATAAATTACTATGATTCAGGTACTGTGTGACATAATTCAAGATGATGCA GAGCCTGCCAAGAAGAAATTCTATGAACTAAAGCTCTCTTTGCTTGATGAGATTGGATGGACACATTTAGCAACTTATGA GAGACAATGGATGCTTGTGCGTTTCCCTCCAAGCTTGCCCCTTTTCTAG
CDS sequence (LotjaGi2g1v0141500.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCCGAAGAAAGAAATCGCCGCAGATCGATTCATCGACGCTCACCCTACCTACGATGGCCGCGGTGCTCTCATCGCTAT CTTCGATTCTGGTGTAGACCCGGCTGCGGATGGATTACAGATTACCTCGGACGGGAAACCGAAAATTCTTGATGTCATTG ATTGCACCGGGAGCGGAGATGTTGATACCTCAAAGGTGGTGAAGGCTGATGCTGATGGTTGTATTAGTGGGGCATCTGGG GCATCTCTGGTTATCAATACTTCGTGGAAAAATCCTTCTGGTGAATGGCATGTGGGCTATAAATTGGTTTATGAGCTCTT TACAGAAACATTGACTTCTCGTTTGAAGAAAGAAAGAAAGAAAAAGTGGGATGAGAAAAACCAGGAGGATATTGCAAGGG CTGTTAAACAGCTTAATGATTTTGATAAGCAACACATCAAGGTGGATGATGCGAAACTTAAAAGGGTTCGTGAAGATCTC CAGAATAGGCTTGATCTTCTGAGAAGGCTTTCTGAGAGCTATGATGATAAAGGGCCAGCTATAGATGCTGTTGTCTGGCA TGACGGAGAGGTCTGGAGAGTTGCTCTTGACACACAAAGTCTTGAGGATGATCCTGATTGTGGGAAGCTTGCCAATTTTG TGCCTTTAACTAATTATAGGATTGAGAGGAAGCATGGCGTCTTCAGCAAATTAGATGCTTGTACATTTGTTGTTAATGTG TATAATGATGGAAATGTCTTAAGTGTTGTAACAGACTGTTCTCCCCATGCCACCCATGTTGCCGGTATAGCTAGTGCTTT CCACCCGAAGGAGCCCTCACTGAATGGAGTTGCACCTGGCGCACAATTAATATCTTGCAAAATTGGCGATTCTCGCTTAG GTTCAATGGAAACTGGAACTGGTTTGACTCGGGCACTGATAGCTGCTGTGGAGCATAAATGCGATCTTATCAACATGAGT TATGGTGAAGCAACATTACTGCCAGACTATGGACGCTTCATTGACCTAGTGAATGAAGCGGTGAACAAGCACCGTCTGAT ATTTGTGAGCAGTGCTGGTAATAGTGGGCCAGGATTGAGCACTGTCGGTGCACCCGGCGGTACAGCTTCGAGTATTATAG GAGTTGGTGCATATGTTTCTCCTGCTATGGCTGCTGGTGCTCATTGTGTTGTTGAACCTCCATCTGAGGGGCTTGAATAC ACATGGTCGAGCCGAGGACCAACAGCTGATGGAGACCTTGGTGTTTGTATAAGTGCTCCTGGTGGTGCTGTTGCTCCTGT TCCTACATGGACTCTTCAACGACGTATGCTGATGAATGGGACATCTATGGCATCACCTTCAGCCTGTGGAGGAATAGCAT TGCTCATAAGTGCAATGAAGGCTGAAGGAATTGCTGTGAGTCCATATAGTGTGAGGAAGGCTCTTGAGAATACGTCAGTT CCCATAGGTGATTTACCTGAGGATAAGCTATCCACTGGACAAGGGCTTATGCAAGTTGACAAGGCTTTCGAATATATACA GAAGTGTCAAAATATTCCATGTGTTTGGTATCAAATAAACATCAATCAATCGGGAAAAACAAATCCTTCATCAAGGGGCA TCTACCTTAGAGAGCCTAGTGCTTGTCGACAATCGACTGAGTGGACAGTGCAAGTTAGTCCCAAATTTCATGAAGATGCC AGCAACTTTGAGGAATTGATTCCATTTGAGGAGTGCATTGAGTTACAATCTACTGGAGAGACCATTGTGAAGGTCCCTGA CTATCTATTGCTTACTCATAATGGTCGCACCTTCAATGTAGTTGTAGATCCTTCCAATCTATGTGATGGTCTTCATTATT ATGAGGTCTATGGTATTGACTGCAAAGCTCCATGGCGTGGTCCTCTTTTCAGAATTCCAATTACCATAACAAAGGCCAAG GCTGTAACTAACCAGCCTCCACAAGTTTCATTTTCAAATATGTTATTTCAACCAGGCCATATAGAAAGGAGATACATAGA AGTGCCACATGGTGCGTCTTGGGCTGAAGCAACAATGAAAACATCAGGATTTGACACAGCTCGAAGATTTTATTTGGACG CTGTTCAGATGTGCCCATTGCAAAGACCTTTGAAATGGGAGAGTGTTGCAACGTTTCCTTCCCCTGCTTCCAAAAGCTTT GCCTTTAGGGTAGTAAGTGGTCAGACATTGGAATTAGTCATTGCTCAGTTTTGGTCAAGCGGCATAGGAAGTCATGATAC TGCCAGTGTGGATTTTGAGGTTGCGTTTCATGGGATAAAAGTCAACCAAGAAGTCATACTTGATGGTAGTGAGGCGCCAA TTAAGGTCCCATATCGACCAATAGATTCTAAGATTAGTGCACTTTCAACAGATCGTGACAAGCTGCCCTCTGGAAAGCAG ATACTAGCACTGACTTTGACGTACAAGATTAAATTGGAAGATGGAGCAAAAGTGAAACCTCAAATACCATTACTAAATAA CCGGATATATGACACTAAATTTGAGTCTCAGTTCTTTATGATTTCTGACTCAAATAAGCGCGTATATTCATGTGGAGATG TCTATCCAAGCTCTTCTAATCTTCCCAAAGGAGAATATAATTTACAGCTATACTTGAGGCATGACAATGTGCAGATTTTG GAAAAGATGAGGCATTTGGTGTTATTCATTGAGCGGAATTTGGAAGAGAAGGTCGATGAGGACAAGGGAAAAGGTTCTTC CTTATCTTCCAAGAAGGCTGTGTCTGACCGTATAAAAGAAGAGGTAAGGGATGCAAAAATAAAAGTTCTGGGAAGCCTAA AACAAGAAACTGATGAAGAGCGTGTGGAGTGGAAAGAGCTATCTGCCTTGCTTAAATCAGAATATCCAAAGCACACTCCA TTGCTTGCAAAGATTTTGGAAGGTTTAGTTTCTAGGAGTAATATCAAAGACAAAATTCAACACGATGAAGAGGTGATCGA TGCAGCCAATGATGTGATTGACAGTATTGACTGCGAAGAGTTAGCCAAATTCTTTGCACTAAAAAATGATCCAGAAGATG AGGAAGCAGAGAATATCAAGAAAAAGTTTGAGTCAGCTCGAGACCAGTTAGCAGAGGCACTTTACCAGAAGGGGCTTGCG CTGGCAGAGATCGAGTCTTTAAAGTCAACAGACGTAGATAAGTTCTTGGCTTTGGAGGCGGGGACAGGAGGTGCAAGAAA AGATGTGGACAATGAGCAATCTACAGATGATGGCAGCCATCCAGATTCGTTCGAAGAGAATTTTCAAGAACTGAGGAAAT GGGTTGATGTAAAGTCACCTAAATATGGAATCCTCTTAGTAACACGCGAGAGGCGTTCTCAAAGGCTTGGGACAGCGTTA AAGGTACTGTGTGACATAATTCAAGATGATGCAGAGCCTGCCAAGAAGAAATTCTATGAACTAAAGCTCTCTTTGCTTGA TGAGATTGGATGGACACATTTAGCAACTTATGAGAGACAATGGATGCTTGTGCGTTTCCCTCCAAGCTTGCCCCTTTTCT AG
Protein sequence (LotjaGi2g1v0141500.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MPKKEIAADRFIDAHPTYDGRGALIAIFDSGVDPAADGLQITSDGKPKILDVIDCTGSGDVDTSKVVKADADGCISGASG ASLVINTSWKNPSGEWHVGYKLVYELFTETLTSRLKKERKKKWDEKNQEDIARAVKQLNDFDKQHIKVDDAKLKRVREDL QNRLDLLRRLSESYDDKGPAIDAVVWHDGEVWRVALDTQSLEDDPDCGKLANFVPLTNYRIERKHGVFSKLDACTFVVNV YNDGNVLSVVTDCSPHATHVAGIASAFHPKEPSLNGVAPGAQLISCKIGDSRLGSMETGTGLTRALIAAVEHKCDLINMS YGEATLLPDYGRFIDLVNEAVNKHRLIFVSSAGNSGPGLSTVGAPGGTASSIIGVGAYVSPAMAAGAHCVVEPPSEGLEY TWSSRGPTADGDLGVCISAPGGAVAPVPTWTLQRRMLMNGTSMASPSACGGIALLISAMKAEGIAVSPYSVRKALENTSV PIGDLPEDKLSTGQGLMQVDKAFEYIQKCQNIPCVWYQININQSGKTNPSSRGIYLREPSACRQSTEWTVQVSPKFHEDA SNFEELIPFEECIELQSTGETIVKVPDYLLLTHNGRTFNVVVDPSNLCDGLHYYEVYGIDCKAPWRGPLFRIPITITKAK AVTNQPPQVSFSNMLFQPGHIERRYIEVPHGASWAEATMKTSGFDTARRFYLDAVQMCPLQRPLKWESVATFPSPASKSF AFRVVSGQTLELVIAQFWSSGIGSHDTASVDFEVAFHGIKVNQEVILDGSEAPIKVPYRPIDSKISALSTDRDKLPSGKQ ILALTLTYKIKLEDGAKVKPQIPLLNNRIYDTKFESQFFMISDSNKRVYSCGDVYPSSSNLPKGEYNLQLYLRHDNVQIL EKMRHLVLFIERNLEEKVDEDKGKGSSLSSKKAVSDRIKEEVRDAKIKVLGSLKQETDEERVEWKELSALLKSEYPKHTP LLAKILEGLVSRSNIKDKIQHDEEVIDAANDVIDSIDCEELAKFFALKNDPEDEEAENIKKKFESARDQLAEALYQKGLA LAEIESLKSTDVDKFLALEAGTGGARKDVDNEQSTDDGSHPDSFEENFQELRKWVDVKSPKYGILLVTRERRSQRLGTAL KVLCDIIQDDAEPAKKKFYELKLSLLDEIGWTHLATYERQWMLVRFPPSLPLF
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 912 | 912 | 0.0 | – | |
| CDD | 1 | 482 | 482 | 0.0 | ||
| PANTHER | 1 | 912 | 912 | 0.0 | – | |
| ProSiteProfiles | 1 | 503 | 503 | 24.895 | – | |
| Gene3D | 3 | 97 | 95 | 1.2E-8 | ||
| SUPERFAMILY | 13 | 514 | 502 | 1.23E-52 | ||
| PRINTS | 20 | 39 | 20 | 4.2E-11 | ||
| Pfam | 20 | 485 | 466 | 1.5E-78 | ||
| Coils | 150 | 177 | 28 | - | – | |
| Gene3D | 188 | 513 | 326 | 4.0E-72 | ||
| PRINTS | 252 | 265 | 14 | 4.2E-11 | ||
| PRINTS | 439 | 455 | 17 | 4.2E-11 | ||
| ProSitePatterns | 440 | 450 | 11 | - | ||
| Gene3D | 517 | 650 | 134 | 1.2E-35 | – | |
| Pfam | 774 | 899 | 126 | 8.4E-47 | ||
| Gene3D | 912 | 1173 | 262 | 1.3E-39 | – | |
| Coils | 1016 | 1036 | 21 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Serine-type endopeptidase activity | Catalysis of the hydrolysis of internal, alpha-peptide bonds in a polypeptide chain by a catalytic mechanism that involves a catalytic triad consisting of a serine nucleophile that is activated by a proton relay involving an acidic residue (e.g. aspartate or glutamate) and a basic residue (usually histidine). | ||
| Biological process | Proteolysis | The hydrolysis of proteins into smaller polypeptides and/or amino acids by cleavage of their peptide bonds. | ||
| Molecular function | Tripeptidyl-peptidase activity | Catalysis of the release of an N-terminal tripeptide from a polypeptide. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0141500.4, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…