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LotjaGi2g1v0160000.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0160000
Transcript ID LotjaGi2g1v0160000.1
Related isoforms 5
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1; TAIR: AT5G51660.1 cleavage and polyadenylation specificity factor 160; Swiss-Prot: sp|Q9FGR0|CPSF1_ARATH Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1; TrEMBL-Plants: tr|I1MQ84|I1MQ84_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0160000
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:56179241..56201975) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CTGGAAGTGACACACTCTTCTCTAGAAAGAGACTGGGGGTGGAGAGTGACTACTGATTAGAACAACACTCACTCACTCCC TCCCGCCAAACTCAAAACGCAAACCCTAATTCAGGGTTTAACCTCCGACGGAGAAGAAAACCTCCCATTCCGTTCTCCGC CATGAGTTTCGCGGCGTACAAGATGATGCAGTGGCCCACCGGCGTCGAACACTGCGCCTCCGGCTTCCTCACCCATTCCC GCGCCGACCTCGCTTCCCACACCATCATTCCTCCCCCCGACGACGACCTCGATTCCGACTGGGCCCCACGTCCCCGCCAC CCCTCCCCTCTCCCCAACCTCGTCGTCACTGCCGCTAACGTCCTCGAAGTCTACATCGTCCGCCTCCAGGACCGCCATCC TTCAAAGCCCTCCTCCGCCCGCGGTACACTCCTCGATGGAATCTCCGGCGCCTCGCTTGAGCTCGTTTGCCATTACAGGT TTGCGCCTCCTCCTTCCTTCAGCTCTGATTTCGCATTTCGCAATGTGAAATCGAGAAATGGTTTTTGGTTTCATGAGCAC ATTGGGGATTTAGGGTGTGTTTGGATGAGCTCTTGCAAGCTTGGTTTTAGATGAACTTGATTCCGCGAAATGATTTGGGG TTAAAATTGAGTTTGAAATGAAGTGGTTTTTGTGAGTTGAAAACTGGTTTTTGATGCAATTGGTTGACTTGATGAGACAC ATTTTGGTTTTAGGCTGTGGAAATTTTGTTAAGAGCCATTTTGAGATTCGGTTCTGTGCCTGGTGCCTGTTTTTACGCGT TCTGACAAGTTTACTACGGAAAAATATGAATTGCGATGCCAAAACGTGAACTGAGCTGAGTCCTTCCTTTTTGTTGAAGT AATTTTAGGTTTATGTAACTGCCAACACAAACATACACTTAGTGATGGTTATATGGCTCTGTTCTGATTCAGAATCTGAA 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TCATCAAGTAACTTACTTTGCAGAGAAGAATTTGTATCCGCTTATTGTTTCATTTCCTGTAAGCCTCTTCTCTCTCTGTC TCATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCCAGTCTCATTTGCCAGCAAATACCAATATTCAAAGACCATAATTGATAGGC GTACAAGGTTATATTTATTACACAATTTATCATAATGACAAGTAATATCACTAGCTTGAATCATACAAAATATTTAATGA TTCATTCATTTGTAAACACTTGTATTGTATAGTGTAAATTGACAAATTATTTCCAACTTTTAAACTTTGAATTAGACTAC ATAAAATAATTCTGCATTTAAAGTTTCTTTCTCCATTTGCTTGTATCTTGATTAGTAAATTGTGTTATATATTATTAATA CATTCCGTATTATTGAAAAATGTATATTTAGGATTGAGCAATGATACATCCTGCTACGTATCTTCCGATTATGAAAATAT ATTAAGTGAAAAAAGTAAATTCATTCAATATCTTGTAAACATAAAAAGCTTTCAATACTTTCTTAATTTAATAGTTAGAA AAATTATTAGGATAAATAAGTAGTAGGAATTAGAATAATTCTGTACAATTTACTTATGAAGTAATCACTTTCACTAGTTT GTTAATTTACTAGTGCATTTCAACGTTGTCAGTGGTTCTTTCAATATTTAGGTGATTGAGTATATTATTTTGTTGGCTTG GTGTTAAATGAGATTTTGTCCTACTCTGCTGGATCACTTGAAATTTTTGCTTGATTGCTCTATGTGTCACAGATTTTTTA ATGCAACTTTTTAATTATTCTCATCAGGTTCTTAAGCCACTAAGTCAAGTTGTTTCTCTGGTTGACCCAGATGCCAACCA TCAGACTGAGAATCCGAATTTGAACTCTGATGAACAAAACCGCTTTTATACTGTTGATGAATTTGAGGTTCGTATCATGG AGCCAGAAAAGTCTGGTGGCCCTTGGCAAACTAAGGCAACCATACCTATGCAGAGTTCTGAAAATGCCCTCACTGTGAAG ATGGTTACTCTGGTGGTAGGTTTTCTCCCTTGGTTTTCAAAGCAAACTGAATGCTGAATATGGTAATACAAGTATACAAC TAACTGTGGTGATTGCTTCTGGCCCTTATTAATTTTTATGTGAAATCTATCTTCATCGTAGAATACAACCTCAAAAGAAA ATGAAACACTTTTAGCCGTTGGTACTGCTTATGTGCAAGGCGAGGATGTTGCTGCGAGAGGTCGAATCCTCTTGTTTTCC TTGGGCAAAAATACTGATAATCCACAAAATCTGGTAACCAATATTGTCCTCTATTTTTATCTAATTTTGGGTGATACTTT CATTTGGACATCATTTAAAATGTTCATCTCATCTCCTTACAGGTTTCAGAGGTTTACTCGAAGGAATCAAAAGGTGATGT GTCTGCATTGGCCTCACTTCAGGGCCATCTATTAATAGCATCTGGTCCAAAAATTACTCTGCATAAGTGGACTGGCACTG AGTTGACTGGTATTGCATTTTTTGATGCACCACCATTACATGTTGTGAGCTTAAATATTGTAAGTGACATTTCCTTAAAT CTTTTATCATTAGGATAAAATGGGCAATGTATCAAAGACATGCAAAGTTTAGTTATTTAGATGTCTTTAGTTTTCCCAAG TTTCTCTTGCAAGATGTAAAGTTTCACTGTTTTCATTTTAGAAATATTGTGTTCACAGCTGTTTTTTAGTGTTATCATTG AATGCTTAATAAGATTCATGATACAATTTATAAATTGGCAGAGAGCTAAAAATAACATAATGAAAACTCAGATAATTGGA CGTTAACTAAGGCACATTAGTTTTTCTCTTTTGGTTGATACCTATTAATGATTTTGCAGGTAAAGAACTTCATTCTTATC GGTGATGTCCATAAAAGCATATACTTTCTTAGTTGGAAAGAGCAGGGTGCTCAACTTAACTTGTTAGCTAAGGATTTTGG CTCTCTTAATTGTTTTGCGACAGAATTTTTGATTGATGGAAGTACTCTGAGTCTCATGGTTTCAGATGATCAAAAAAATA TCCAGGTCTGACCATTTATTTGTTCTGATTTGCATTTACCATTTTTAAATGATAACAGCAAAAACCTTATTCCACTAAGT GAGGTCGGCTATTTGGATCACACGACGCCATTGCGCTCAGTCAAAAACCAAATTTTGTGGTATATTATTGACCATGTGAC TGTTTTTAAAATATCTTCCTACGTCCTTTTTGGCTTCTTGTACCTCTTATCATAGGGCTGAAAACCTTGTTATCAACCTT TCTGATTGGTGCCTCAGAATGTCTTCTTTGCACTGAAAACCTTGTTATCAACCTTGATAGCTTTCATGTGAAATGGTCAA GGTGATATTGGCAATTTTTAGTCAGTCAGTCAAATTGGATTACATTGACCTATTGGGATTTTGGAATGCACATTCTGCTG CAGTTCGTTGTACCATGATTTTATTTTTTCTTAATTAGTTACATTTCTTATTTTTGACTTTATTAATATTTAAAGTCTTG CCTTATTTAGTATATTTAAATGTTACCCGATTCATCTGAGAAGTTGCTTTCATTTCATAAAAGCATAATTATATATGCTG GGGTTTTTCCTTGGCTGAAAGTGTTCATTTGCCTAGTTCTTTTTAAATTTATAGTATGTTACATTTTCCTTTTCTTCTTC ATCGTAATTGTAATTCTTTAATATCTAATAGGCTGTTGGTTGCATGTTCCTATTTGCCTCCTGTTGTTACAGTGAAATGA AAACCTGAAATCATCATTGTTGGGTTTGTTGTGTTTGTTTGTATTATATTTTCGGCCTTTTAGTTGAGACATAAGTTATA ACCTTTGTAATGTCTGGACTCTGGAAGCAGATTTTTTACTATGCTCCAAAGATGTCTGAGAGTTGGAAAGGACAGAAGCT TCTTTCAAGGGCTGAATTTCATGTTGGTGCACATGTGACTAAATTCTTAAGGTTGCAGATGCTATCCACTTCTGACCGAA CTGGTGCAGGTCCAGGCTCAGATAAAACCAATCGATTTGCCTTATTATTTGGTACCTTGGATGGCAGTATTGGTTGCATT GCTCCTCTTGATGAAATCACGTTTCGTAGACTGCAATCTTTGCAGAGGAAGCTTGTAGATGCTGTACCGCATGTTGCTGG CTTGAATCCAAGAGCTTTCAGGCAGTTCAATTCAAATGGAAAGGCCCATCGGCCTGGCCCTGACAGTATAGTTGACTGCG AGCTTCTATGCCAGTATGTTCTATCTTCGCCCAAAACATTATTGTATATGCCATTAAGTAATATATATATATATATATAC ATTTAGTGTTACAAAAGTGAAAAAATAAAGTAGATTATTCAATACATGTTAATGAATTGTGTTTTGCAACAAGAAAAGAA TGTTCATATAAAAGGCACGAAACCTGCACAGTCAACCAGAGTTGAATCATAAGAAGTTAAAACCAACAGATAACTGCAAG AAAAATGTTGGTGATTTCTTCACTTGGCTTAGTCAATCTATTGTGGTGGATCCAGCTAAAGAGCTATATCTAGTACTAGT AGTTACAGACATGACTTGTTTTTTATGTTTACAACTTAAGTATATTTTGTTAATATGTTAGTTGCTTGTTTTTAATTGGG CTGCTTTGTTACAGTTATGAAATGCTTCCATTGGAGGAACAGCTTGAAATTGCTCACCTAATTGGGACGACTCGATCACA AATTCTCACAAATCTAAGCGATCTGTCCCTTGGAACAAGCTTCTTGTGAACACAGTCATCTTTTTTTGATCAAAAAACAG TGCCTGCCCATATCTTGCCATTTATGGATTTTGATCCATTGGCATCTTATTATTACTATAAGTGCTTTAATATGGTTGAA GGCTAGGGTAAGTCATTAAATCGTATCCAAATACTATCTTACAAGCAGTGAACACAATCAGCCCTTGGATAGTGATATCC AGCATTAATGCCGATGCAAGTTTCATATTCTGCAGATCAAATGTAAATTGTTGTCTTTCCACATGGAGTCATCAAGTTAT GCTTTTCTAGAGTTGGGAAGTATGAGTCTGTTAAGTTCCTAAATGGGAAGAGCTGGATGTAGTGTAGCATGATTCCATTC CCCCTAAGAAGCAATTTGAACTGAATCGCTAGAAGCTTGGATTCTTCTATGTATGTCAGCATTAAGAATTGTCTGTAACA TTATGTAATTAGTCATTTCTTGTTTATTCATATGAAGGTTTAATAACAAACAGCATTTCAAAATAACAGCTGTATATACG GTGTTATGGAATAACCTTTAAAGTTGAATTACTATTAGTAATTCTGGGCATCGAATGTTCTTGTATTAGTATGGTGTGTA ATGTTTAATGGTATAAGCATATATTTGATATCGTGGATGCTTGTATGTGCTTAACGGATAATTAGATGAGTTTCACAATT GAAAATGAAATTTAG 

CDS sequence (LotjaGi2g1v0160000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGAGTTTCGCGGCGTACAAGATGATGCAGTGGCCCACCGGCGTCGAACACTGCGCCTCCGGCTTCCTCACCCATTCCCG CGCCGACCTCGCTTCCCACACCATCATTCCTCCCCCCGACGACGACCTCGATTCCGACTGGGCCCCACGTCCCCGCCACC CCTCCCCTCTCCCCAACCTCGTCGTCACTGCCGCTAACGTCCTCGAAGTCTACATCGTCCGCCTCCAGGACCGCCATCCT TCAAAGCCCTCCTCCGCCCGCGGTACACTCCTCGATGGAATCTCCGGCGCCTCGCTTGAGCTCGTTTGCCATTACAGGTT GCATGGAAATGTTAAAAGCATGGCTGTCTTGAGCATTGGGGGTGGTGATACTTCTAAAAGGAGAGATTCTATCATCTTAA CTTTTAAAGATGCGAAGATTTCAGTTCTAGAGTATGATGATTCTATTCATGGACTCCGAACTAGTTCTTTGCATTGCTTT GAGGGTCCAGAATGGCTCCATTTAAAAAGAGGCAGGGAACAATTTGCAAGAGGTCCAGTGGTAAAGGTTGATCCTCAAGG AAGGTGTGGTGGAGTTCTAGTCTACGATTTGCAAATGATAATACTAAAGACTACTCAGGCTGGTTCTGGTTTAGTTGGGG AGGATGATCCGTTGGGTTCTGGAGGTGCAGTTGCTGCTCGCATTGACTCATCTTATATGATAAATCTGCGTGACTTGGAT ATGAGGCATGTAAAAGATTTTACATTTGTTCATGGCTATATTGAACCTGTGATGGTGATCTTGCACGAACGTGAGCTTAG CTGGGCTGGGCGTGTCGCATGGAAGCATCATACTTGCATGATATCAGCGCTTAGTATCAGCACAACTTTGAAGCAACATC CACTTATTTGGTCAGCTGTTAATCTGCCTCACGATGCTTACAAGCTTATTGCAGTGCCCTCTCCAATTGGTGGTGTTCTT GTAATTGCTGCTAATACTATTCATTATCACAGTCAGTCTGCTTCTTGTGCACTGGCCTTGAACAGCTATGCGGTTTCACT TGATAGTAGTCAGGAGATGCCAAGATCATTTTTCAACGTAGAACTTGATGCTGCCAATGCTACTTGGTTGTCGAATGATG TGGCCTTATTGTCAACAAAAACTGGTGAATTGCTATTGCTTACTCTTATTTTTGATGGAAGGGTTGTACAGAGACTTGAT CTTTCCAAGTCAAAAGCTTCAGTTCTGTCATCTGGTATTACGACAATCGGAAATTCTCTGTTTTTTCTCGCCAGTCGATT AGGAGACAGTATGCTAGTGCAATTTTCTTGTGGATCAAGTGTTTCAATGTTGTCTTCCAATCTAAAAGAAGAGGTCGGTG ATATTGAAGGAGATGCTTCTTCAACAAAGAGATTGCGGAGGTCACCTTCTGATTCTTTACATGATATGGTTAGTGGTGAG GAACTCTCCTTGTATGGATCTGCTCCAAATAGAACAGAATCAGCACAGAAATCCTTCTCGTTTGCAGTAAGGGATTCATT GATTAACATTGGTCCTTTGAAAGATTTCTCATACGGTTTGAGAATAAATGCTGATGCAAATGCTACAGGGATAGCCAAGC AGAGTAACTATGAATTGGTCTGCTGTTCTGGTCATGGAAAGAATGGTTCTCTGTGTGTTCTTCGGCAATCAATTCGCCCA GAAGTTATTACTGAGGTTGAACTTCCTGGGTGCAAAGGAATTTGGACTGTTTATCATAAGAGCGCACGCTCTCATATTTC CGATTCTTCTAAGCTGGCCGATGATGATGATGAGTATCATGCATACCTTATTATAAGTTTGGAGGCTCGTACTATGGTAC TAGAAACAGCCGATCTGCTAAGTGAGGTTACTGAAAGTGTTGACTATTATGTTCAAGGAAAAACACTTGCGGCAGGGAAT TTATTCGGAAGGCGTCGAGTTATTCAAGTGTATGAACGTGGTGCTCGGATCCTAGATGGTTCTTTTATGACCCAAGATAT AAGCTTTGGGCCTTCTAACTCTGATTCTAATTCGGGATCTGAGAGTGCTTTAGCACTCTCGGTGTCTATAGCTGATCCAT ATGTCTTACTCAGAATGAGTGATGGAAGTATTCGACTTTTGGTTGGAGATCCTAGTACATGCACCATTTCTGTCACTTCT CCAGCTTCATTTGAGAGCTCTAAGGAATCAGTTTCTTCATGTACACTGTATCATGATAAAGGACCTGAGCCATGGCTAAG GAAGACAAGCACTGATGCATGGCTTTCTACTGGTGTTGGTGAGGCTATTGATGGCACTGATGGTGCACCTCAGGACCATG GGGATATTTATTGTGTTGTTTGTTATGAAAATGGAAACCTTGAAATATTTGATGTGCCCAATTTTAGTTGTGTTTTTTCT GTTGAGAATTTTATGTCTGGAAAGAGCCATCTTGTTGATGCTCTGACGAAAGAGGTGGCCAAAGATTCTCAAAAGGGGGA TAAAGGTTCTGATGCAGTGGCCAACCAAGGCAGGAAGGAAAATGTACTGAATATGAAGGTTGTAGAGTTAGCCATGCAGA GATGGTCAGGGCAGCACAGCCGCCCATTTCTTTTTGGTATTTTGAGTGATGGAACAATACTTTGTTACCATGCTTACCTT TATGAAAGCCCTGATGGTACTTCTAAAGTTGAGGACTCAGTTTCAGCCAGTGGACCTGTTGACCTTAGCAGCACTAGTGT TTCTAGGCTTAGAAATTTGAGATTTGTTCGTTTGCCATTGGATGCATATCCCAGGGAGGAGACATCAAATGGATCACCTG GTCAACATATTACTATTTTCAAGAATATTGGTAGTTATGAAGGGTTCTTCCTATCAGGGTCAAGACCGGCTTGGGTTATG GTATTGAGAGAGCGACTCCGTGTTCATCCGCAGTTATGTGACGGGTCCATTCTTGCTTTTACTGTCCTACACAACGTGAA CTGCAATCACGGACTCATATATGTTACATCACAGGGTGTTCTAAAGATATGCCAATTACCTACTGGCTCAAACTACGACA GCCACTGGCCTGTACAGAAAGTTCCATTGAAAGCCACACCTCATCAAGTAACTTACTTTGCAGAGAAGAATTTGTATCCG CTTATTGTTTCATTTCCTGTTCTTAAGCCACTAAGTCAAGTTGTTTCTCTGGTTGACCCAGATGCCAACCATCAGACTGA GAATCCGAATTTGAACTCTGATGAACAAAACCGCTTTTATACTGTTGATGAATTTGAGGTTCGTATCATGGAGCCAGAAA AGTCTGGTGGCCCTTGGCAAACTAAGGCAACCATACCTATGCAGAGTTCTGAAAATGCCCTCACTGTGAAGATGGTTACT CTGGTGAATACAACCTCAAAAGAAAATGAAACACTTTTAGCCGTTGGTACTGCTTATGTGCAAGGCGAGGATGTTGCTGC GAGAGGTCGAATCCTCTTGTTTTCCTTGGGCAAAAATACTGATAATCCACAAAATCTGGTTTCAGAGGTTTACTCGAAGG AATCAAAAGGTGATGTGTCTGCATTGGCCTCACTTCAGGGCCATCTATTAATAGCATCTGGTCCAAAAATTACTCTGCAT AAGTGGACTGGCACTGAGTTGACTGGTATTGCATTTTTTGATGCACCACCATTACATGTTGTGAGCTTAAATATTGTAAA GAACTTCATTCTTATCGGTGATGTCCATAAAAGCATATACTTTCTTAGTTGGAAAGAGCAGGGTGCTCAACTTAACTTGT TAGCTAAGGATTTTGGCTCTCTTAATTGTTTTGCGACAGAATTTTTGATTGATGGAAGTACTCTGAGTCTCATGGTTTCA GATGATCAAAAAAATATCCAGATTTTTTACTATGCTCCAAAGATGTCTGAGAGTTGGAAAGGACAGAAGCTTCTTTCAAG GGCTGAATTTCATGTTGGTGCACATGTGACTAAATTCTTAAGGTTGCAGATGCTATCCACTTCTGACCGAACTGGTGCAG GTCCAGGCTCAGATAAAACCAATCGATTTGCCTTATTATTTGGTACCTTGGATGGCAGTATTGGTTGCATTGCTCCTCTT GATGAAATCACGTTTCGTAGACTGCAATCTTTGCAGAGGAAGCTTGTAGATGCTGTACCGCATGTTGCTGGCTTGAATCC AAGAGCTTTCAGGCAGTTCAATTCAAATGGAAAGGCCCATCGGCCTGGCCCTGACAGTATAGTTGACTGCGAGCTTCTAT GCCATTATGAAATGCTTCCATTGGAGGAACAGCTTGAAATTGCTCACCTAATTGGGACGACTCGATCACAAATTCTCACA AATCTAAGCGATCTGTCCCTTGGAACAAGCTTCTTGTGA 

Protein sequence (LotjaGi2g1v0160000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MSFAAYKMMQWPTGVEHCASGFLTHSRADLASHTIIPPPDDDLDSDWAPRPRHPSPLPNLVVTAANVLEVYIVRLQDRHP SKPSSARGTLLDGISGASLELVCHYRLHGNVKSMAVLSIGGGDTSKRRDSIILTFKDAKISVLEYDDSIHGLRTSSLHCF EGPEWLHLKRGREQFARGPVVKVDPQGRCGGVLVYDLQMIILKTTQAGSGLVGEDDPLGSGGAVAARIDSSYMINLRDLD MRHVKDFTFVHGYIEPVMVILHERELSWAGRVAWKHHTCMISALSISTTLKQHPLIWSAVNLPHDAYKLIAVPSPIGGVL VIAANTIHYHSQSASCALALNSYAVSLDSSQEMPRSFFNVELDAANATWLSNDVALLSTKTGELLLLTLIFDGRVVQRLD LSKSKASVLSSGITTIGNSLFFLASRLGDSMLVQFSCGSSVSMLSSNLKEEVGDIEGDASSTKRLRRSPSDSLHDMVSGE ELSLYGSAPNRTESAQKSFSFAVRDSLINIGPLKDFSYGLRINADANATGIAKQSNYELVCCSGHGKNGSLCVLRQSIRP EVITEVELPGCKGIWTVYHKSARSHISDSSKLADDDDEYHAYLIISLEARTMVLETADLLSEVTESVDYYVQGKTLAAGN LFGRRRVIQVYERGARILDGSFMTQDISFGPSNSDSNSGSESALALSVSIADPYVLLRMSDGSIRLLVGDPSTCTISVTS PASFESSKESVSSCTLYHDKGPEPWLRKTSTDAWLSTGVGEAIDGTDGAPQDHGDIYCVVCYENGNLEIFDVPNFSCVFS VENFMSGKSHLVDALTKEVAKDSQKGDKGSDAVANQGRKENVLNMKVVELAMQRWSGQHSRPFLFGILSDGTILCYHAYL YESPDGTSKVEDSVSASGPVDLSSTSVSRLRNLRFVRLPLDAYPREETSNGSPGQHITIFKNIGSYEGFFLSGSRPAWVM VLRERLRVHPQLCDGSILAFTVLHNVNCNHGLIYVTSQGVLKICQLPTGSNYDSHWPVQKVPLKATPHQVTYFAEKNLYP LIVSFPVLKPLSQVVSLVDPDANHQTENPNLNSDEQNRFYTVDEFEVRIMEPEKSGGPWQTKATIPMQSSENALTVKMVT LVNTTSKENETLLAVGTAYVQGEDVAARGRILLFSLGKNTDNPQNLVSEVYSKESKGDVSALASLQGHLLIASGPKITLH KWTGTELTGIAFFDAPPLHVVSLNIVKNFILIGDVHKSIYFLSWKEQGAQLNLLAKDFGSLNCFATEFLIDGSTLSLMVS DDQKNIQIFYYAPKMSESWKGQKLLSRAEFHVGAHVTKFLRLQMLSTSDRTGAGPGSDKTNRFALLFGTLDGSIGCIAPL DEITFRRLQSLQRKLVDAVPHVAGLNPRAFRQFNSNGKAHRPGPDSIVDCELLCHYEMLPLEEQLEIAHLIGTTRSQILT NLSDLSLGTSFL 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 1 739 739 0.0
PANTHER 1 739 739 0.0
Gene3D 56 447 392 6.4E-44
Pfam 129 690 562 1.1E-37
PANTHER 773 1432 660 0.0
PANTHER 773 1432 660 0.0
SUPERFAMILY 777 1290 514 8.09E-5
Gene3D 974 1358 385 1.0E-76
Pfam 1085 1417 333 1.1E-85

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Nucleic acid binding Interacting selectively and non-covalently with any nucleic acid.
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).
Cellular component Nucleus A membrane-bounded organelle of eukaryotic cells in which chromosomes are housed and replicated. In most cells, the nucleus contains all of the cell's chromosomes except the organellar chromosomes, and is the site of RNA synthesis and processing. In some species, or in specialized cell types, RNA metabolism or DNA replication may be absent.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0160000.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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