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LotjaGi2g1v0284100.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0284100
Transcript ID LotjaGi2g1v0284100.1
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Phosphate transporter PHO1-like protein; TAIR: AT1G68740.1 EXS (ERD1/XPR1/SYG1) family protein; Swiss-Prot: sp|Q93ZF5|PHO11_ARATH Phosphate transporter PHO1 homolog 1; TrEMBL-Plants: tr|I1J6T3|I1J6T3_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0284100
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:75706485..75726925) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

TCCCCCTTCCCCACACACCAATTAAAAAGAGAGAAAAGAAGGAACCAAAATATCGCATCTTTGGGGTAGGCTATCTTAAG GGCGCTGTCAGTTCTCCACAATTATCATGGTGATTTTGCAATCCATGTCTTGGAAGAAAACTGAAAAGATAGCACCTTTG TATGTTTGTGTGTTTGAGAGAGGAAGTGAGAAGAGGAGTGAAACGGCTACAGGTTTTAAATTTTTGTAGTTTTCTATAGA AGGTCCCATCATGCTCACAAGTTGTCTAGTTAGTGGGATTAGAACCAAAGAATAGAACATGGTAGCTCCTTCACTATAGC TTCTACTGCAATTAGCATTTAGCAAGGTGTATACCAAATATATTACCAGCATCATTACAGGTCATCACACTATTATACTA CTTATCCTTATTACATTGTACAGGCAGTGTGGAGGAATTATTCTATACACAAAAAAGTGGAGCCTAATCTGCTGTTATTT CCCATGTATCAAGATTCCCCAATCTAACTATGGGAACTTGCCTAATATTCAATAACAACAACAAATGTCTTTTCACATTA AGTTAGGTCGACTATTAGTATGTTTGGATTTACATTTAGATCTTCCAGAATCAATTCTGCTACCACAAAAGCTACTAGGA GTAGCTTCTCTCAAAATCAATTCTCTTTCAGACATGAAAATCTAATAATCTACCGTGTATCCAAACATGTTGTGGATCAA TTGATTCATATTAAAGATGCGGCAAGTTTTATGTTAGATGCCACAGACCTAACTCAACTTTCCTTCTTTAACCTGGCTTA GGAGCGGCTATGACACGCATCATAGGCGAAGTTAAGTTTGTGCATTTTCTTTTTCTTGGCACAGGAAATAGGGGAGCAGG AAGGTGGTTCTGTCCTTCTATTGTTAGTCATTGTACAAATTTGACTTGTCACAAACCCCTCTCCAATGGAAGTCTTAGAA 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AATGAATTTTCTATGTTCGTCGCTTGTTTCCTTTAACAGTGTTTCTGATATTTCTAGATTCCCTTTCCTGCCACTGGATG TTCTTCGTGATGACAATGCTGTCTCAACTTCATCACAACCAGACACTTCAATATCTGTAGAATGCTGTGTTCTTCTGTTC CCTGTTTGAATATATGCCTTGTTTGTTTTCTTATCCAAATAGTCAACAAAAGATGAATTTTCTTCATCACTGACTCGCTT TTGTGAAGTAGATGCGTTTACATAACCGGAGTCATCTGTTGTAAATACTCTTGAATGCATACCTTGGTTTTCTCCCGTGG ACTCTCTTTCTTGCATAGTTCCCTCTTCCAGCTTCTTTTCAGACTTCTTCCTCATGTTCCAATCAATATCCGCAGCAAAT GCAATTTTTTCCTTCTTTGAAATTCCCTGCACCTTTTTCAAGTCATCTCTTTTCCTATTGAATTCTTCATTTACTTTTCC CTCCATATTATTTGCTTCATCCTTCTTATATCCCTGTGAGAATTCTTCCACATCAATCTTTTGCTGAGCTTCCAGGTCAC TCTCAAAATCTCCGGACGAAAGCGAGTAATAAGATGAACAACTAGACACATCTCTTCGCTTCCTTTGATTTTCACTTTTT GTAAAGGCTTCCCTGTCTTTGTTGGGCCTTTCATACGCTCTTCTCAAGTCTATGGCGGATGTCTCATGCTGCTTCAAATT TCCATTTTTCTCTGTTTCTACTCTCTCAGCCAAACTTAAATGTTTCTCTCTACTCAAATTTTTCCTTTTCTTATCAGCTT CCGTTCTTTTGGATGAAGACACATTCTTCCATTTGACATCAATAGCAACTTTATCGGCTTCATCACTCAAAATGCTGAGA ACTGATTCACAGTCATCAGAGCCAACTGAACGGAAATTTTCTCTCCCTTTTTGTGAGGCTGCACAATAACATCTTCCCTT TATTCTCCTTCTACTTCTATTGCAAACAGTTCTCTCGTTGGCCGAACAATTAACCTCAAAAGAACCTCTGAGAAGACTGT AAGCTGGTGTCCTGGAAAAGCACTGGTCTTCACAACCCAGAGTCAACCTTCTAGATGCTGACAATTGAAGGAGAGCGGAT TGCCTCAATCCATTGAGAAGAATAGGCTTTATGGGTACTCTGTAAGTGGAGAGTGCACAGCAATCACAATAACCACAGCA AGATGAACAGTGTGATGGGGTTCTATCAAATCTTTCACACCAAAAGTTTGAGTAGGCATTGGAAGGTAAAGAATATGATT CTTTACACCTAACAGTATATATCACTGAGCTGAAATATGCGTTGTGCATGGTTGAATGCGTCTTCCAACTAACAGTCGAA AAGCGTACCTTGATGAGAGAGCGGGTTCTTTTAATTCAATTAAAATTGAGCTATAGCAAGTAGAGAAATCATATCAAGTG GCATATATTAGAAATGCTCATTGATAAGACAGGAATGGCAATGAGCAGCAGGCCACAATCAGTTAAGTGCTGATATAAGA TTCCAAATAGTAATAACCGATGCAGCCACATAAATGGTGAATTGCCTTAAAAGAAACACTGATTTGACATCCATGCTCAG CTCCCATCTTTCACACCTGTACCAATACATAGTTCAGCTAAATCAGAATGATTGTCACAGTTCAACTAAATCAACTTATC CAAGCATCATAAAATAACTAAACTTCAGAATAGATGGAAATTGGAAGGAAAAAATTTTACATAAAATGTCTCTTAAAAAG GAATTCACTCATCATGCCTCCTGACTGTCTAATTTCACAATAATCCCAAAATGCTGAAAGTTTACCCATCTGGCTCTTTA AAAGAGAACACTAATCAAACAAGTTCATTAACCAAATCACCACAAAACACTAATCAAAAACTAATCACAGTCCAAAAATG CATGCTCATTGCTCATGTTTCACTCAAGTTCATTAACCAAATCACCATAAAACTCATCAATTAGCACTTCAAATCTCCAC AACACACTTCAGCCGGGCAATTCCATTCATGGCAGTAAAGAGACTTGATTTCACACAGTGACCAATGCTTAAACAATAGA AATTACAATCTTTTGTGTAATTAATGTTAAATTATTTTAATAATTAATGTGGCCCATGTAACTTATAGAACTAATTTTAT GAAAAGATCCTCAATGTGATGGTCATTAGGATATTAAAGCA 

CDS sequence (LotjaGi2g1v0284100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGTGAAGTTCTCAAAGCAGTTTGAGGGGCAACTCATTCCAGAATGGAAAGAGGCCTTTGTAGATTACTGGCAACTCAA GAAGGACCTCAAAAAATTCCAACCTTTCAACATTACCAACAACACACCCAACAAGCACCAAAGTAGTTCTGTACCTAAGT ACATAATTTCATCAATAAGAAACTACTCTTTATTTGGTCATCCACATGGAGAGCATGGACCAATTCAAGTCCATAGGAAA CTTGCTTCATCATCTTGTGTGGGGGACATGTATGAGACAGAACTACTAGAGCAGTTTGCTGACACTGAGGCAGCTAAAGA ATTTTTTGCATGTCTGGACCAGCAACTAAACAAGGTGAATAATTTCTATAGAACAAAGGAGAAAGAGTTCATGGAGAGAG GGGATTCCCTGAAAAAACAAATGGACATTCTCCTTAAGCTCAAATCTACATTCAAGGAGCAGCAGAGCAAAGGAGGCTCT TCCCATGGCTCCAAGGAGGACCAATCTATTTCTTGCACATTCTCCAATGAGGAAGACTCTGTTAGGAACAGAGCACAGCA AGAAGAAATGCAGGACATGAGCACAGATGATTTGGAGAAAACTGAAGTGCCATTTTCAGATGAAATTGGGAAATCTATGG AGATGAAAAGAGAAGATGGGAAATTGAGATCACTTTCTGGCCGTACTATCAATTGCCAAGGGAAGAATCTGAGGATAAAC ATTCCCTTGACAACACCATCTCGAACCTTCTCAGCCATAAGTTACCTTCTTAGAGAAGATTTGCTCAATCAATCATCAAG GAAATGTGGTGGAGAAGTATGCAAGATTCATCTTAACAAAACAAAGCTGCATCATGCTGAAAAGATGATCAAAGGGGGTT TCATTGAACTATACAAAGGACTAGGGTATCTCAAAGTTTACAGGAACTTGAATATGCTTGCATTTATAAAGATCCTGAAG AAATTTGACAAGGTCTCTGAGAAAGAAATTCTTCCCATCTATCTCAAAGTTGTTGAGAGTTCCTATTTCAATAGCTCAGA CAAGGTGATGAAGTTAGCAGACGAAGTTGAGGAACTATTCATCATAAATTTTGCTGAAGATAATCGAAGAAAGGCCATGA AATACCTTAGGCCAAGCCAGCGTGAAGAATCACATACAGTAACTTTCTTCATTGGACTATTTACCGGATGCTTCGTGGCG CTTTTCGCGGGATATGTTATAATGGCTCACATAACCGGCCTGTATGGACGACAACCAAATTCAGTTTACATGGAAACTGT CTACCCTGTGCTTAGCATGTTCAGCCTTGTGTTTCTACATTTCTTTCTCTATGGTTGCAATATTCTTGCATGGAGAAAGA CTCGTATAAACTACAACTTCATTTTTGAACTGGCCCCTACTAAGGATCTTAAGTACAGAGATATATTCTTAATTTGTACA ATGGCGATGACTGTTGTGGTTGGGGTAATGTTTCTTCATTTGACTCTACTGACGAAAGGGTATCCTTATGACCAAATTCA TGACATTCCTGGATATCTTCTTCTGGTCTTCTTACTAATATTGGTGTGCCCTTTCAACATTTTATACCGGTCAAGCCGAT ATCGTTTCCTTTGTGTGATAAGGAACATAATTTGGTCACCCCTTTACAAGGTTGTCATGCTAGACTTTTTCATGGCTGAT CAACTTTGTAGTCAGGTGCCAATGCTAAGGAACCTAGAATATGTAGCATGCTATTATATAACTGGGAGCTACAAAACTCA GGACTATGGTTACTGCATGAGGACAAAGCACTACAGAGATCTAGCTTATGCAGTGTCATTTCTACCTTACTATTGGAGGG CTATGCAGTGTGCTAGAAGATGGTTTGATGAAGGGGAAACAAGCCACCTTGTGAATCTGGGAAAATATGTATCAGCAATG TTAGCAGCAGGTGCTAAAGTGGCTTATGAGAAAGATCCTAGTATTGGATGGCTTTGTCTTGTTGTGATCATGTCTAGTGG AGCAACTGTGTACCAATTGTACTGGGACTTTGTAAAAGACTGGGGTTTGCTTCAAGTGAATTCCAAGAACCCATGGCTCA GGAATGAATTAATGCTTCGCAGAAAAGGCATTTACTACTTCTCAATGGGATTGAATTTTATTCTGAGGCTTGCTTGGTTA CAAACTGTCCTCCATTCAAGATTTGAACATGTTGATTATCGAGTAACGAGCATATTTTTAGCAGCTCTTGAAGTTACCAG AAGAGGGCTGTGGAATTTCTTCAGATTGGAGAATGAGCATCTAAATAATGTTGGCAAGTTTAGAGCAGTGAAGATAGTAC CACTTCCTTTTCATGAAGTGGATGAGGAAGACTAG 

Protein sequence (LotjaGi2g1v0284100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MVKFSKQFEGQLIPEWKEAFVDYWQLKKDLKKFQPFNITNNTPNKHQSSSVPKYIISSIRNYSLFGHPHGEHGPIQVHRK LASSSCVGDMYETELLEQFADTEAAKEFFACLDQQLNKVNNFYRTKEKEFMERGDSLKKQMDILLKLKSTFKEQQSKGGS SHGSKEDQSISCTFSNEEDSVRNRAQQEEMQDMSTDDLEKTEVPFSDEIGKSMEMKREDGKLRSLSGRTINCQGKNLRIN IPLTTPSRTFSAISYLLREDLLNQSSRKCGGEVCKIHLNKTKLHHAEKMIKGGFIELYKGLGYLKVYRNLNMLAFIKILK KFDKVSEKEILPIYLKVVESSYFNSSDKVMKLADEVEELFIINFAEDNRRKAMKYLRPSQREESHTVTFFIGLFTGCFVA LFAGYVIMAHITGLYGRQPNSVYMETVYPVLSMFSLVFLHFFLYGCNILAWRKTRINYNFIFELAPTKDLKYRDIFLICT MAMTVVVGVMFLHLTLLTKGYPYDQIHDIPGYLLLVFLLILVCPFNILYRSSRYRFLCVIRNIIWSPLYKVVMLDFFMAD QLCSQVPMLRNLEYVACYYITGSYKTQDYGYCMRTKHYRDLAYAVSFLPYYWRAMQCARRWFDEGETSHLVNLGKYVSAM LAAGAKVAYEKDPSIGWLCLVVIMSSGATVYQLYWDFVKDWGLLQVNSKNPWLRNELMLRRKGIYYFSMGLNFILRLAWL QTVLHSRFEHVDYRVTSIFLAALEVTRRGLWNFFRLENEHLNNVGKFRAVKIVPLPFHEVDEED 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 1 784 784 0.0
PANTHER 1 784 784 0.0
Phobius 1 386 386 -
ProSiteProfiles 2 336 335 31.492
Pfam 2 38 37 3.9E-12
CDD 3 332 330 1.19984E-38
Pfam 76 338 263 2.7E-48
MobiDBLite 153 180 28 -
MobiDBLite 153 202 50 -
MobiDBLite 181 202 22 -
Phobius 387 407 21 -
TMHMM 387 409 23 -
Phobius 408 426 19 -
Phobius 427 450 24 -
Pfam 428 761 334 9.3E-85
TMHMM 429 451 23 -
Phobius 451 474 24 -
Phobius 475 497 23 -
TMHMM 475 497 23 -
Phobius 498 508 11 -
Phobius 509 529 21 -
TMHMM 512 529 18 -
Phobius 530 654 125 -
ProSiteProfiles 593 784 192 25.42
TMHMM 653 675 23 -
Phobius 655 674 20 -
Phobius 675 703 29 -
TMHMM 703 720 18 -
Phobius 704 724 21 -
Phobius 725 784 60 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Cellular component Integral component of membrane The component of a membrane consisting of the gene products and protein complexes having at least some part of their peptide sequence embedded in the hydrophobic region of the membrane.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0284100.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…