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LotjaGi2g1v0311600.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0311600
Transcript ID LotjaGi2g1v0311600.1
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Phospholipid-transporting ATPase; TAIR: AT1G59820.1 aminophospholipid ATPase 3; Swiss-Prot: sp|Q9XIE6|ALA3_ARATH Phospholipid-transporting ATPase 3; TrEMBL-Plants: tr|I1KXN1|I1KXN1_SOYBN Phospholipid-transporting ATPase; Found in the gene: LotjaGi2g1v0311600
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:78562742..78579217) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

GTAATGAAAGATTAGTGAGTGGTGAGCACGCACGCTCCATGTACATGCACACCACGAACGCGAAAGGCCAAACGTGGGAA CGAAGAATTTGCATTTGCAATGACGCCAAGGGTTGGATTAGAGAGAGGGAGGTTGAAATTCTGAACCCCTCTCTCTGGTT CTCACTTTTCACATTTCATTTTCAGCGGAAAACGCATGACATTGGAGGAGCCTCAACCGTCATCTTCATCTTCATCTTCA TCTTCATCTTCCAGAATGGACCAGAGCGTTCCTTCATCTCGAACGTTTCGACTCGGCCGAGTCCAGCCTCAAGCCCCTGG CCACCGCACCATCTTCTGCAACGATCGCCTCGCCAATCTTCCCGTCCGATTAACGGTTCGCTCTCTCACATTCCTCTCTC CTGGTTTCTATTCATTCTTCCATTTTCGAACCAGCAAAACCCTTGCAACTCTAGATAGTTTCTCCACTGCGTTTTTAATT TTCGATTTTAGTTCCTGAATCTCGAATGATTTAGTTTCTGCAACTGTTCACTAGAAATTTGTTTATCACTGGATGATTGA AGTAAGTTTACTGTTTGTTTGAAATTGAGGAATGCTATTGTGTAAGGAAATCATGGTTACTTGAGTTTAACAATTTCTCA CCCTAACTATGCTGTTGATGATGCTGAATTGCTGATCAATTGTTGTATGTGAGAATCAAAGGCCATTTTATGTCTATCAA GTATGAATTAAACAAGTTCCTAGTGATCACCAACATGATTGAACAGTAATGGCATTCTGTATGAAATATTTTGCATCTTT AGTATTTCTGTGTTTTACTGAACTTATACATTGAAAGAAGATGGCCTAGCACTGTGCTTACAAATTGTCTAAGGAGTATA TACACCTAGGTTCCTTAGTATTCTGTTTGCATGATTCCAGATATTGGAATTCATATTATACATGTCACATAGCTTGATTT 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GACTTAGAGATAACATTAAGTGGGGTGGTCTCACTCAACAAATCATTCTTTATACACATCAACTAGGGGTTGAACCTTGG ACTAGATGCTTAAAAAGTCAAGCTATCTATCAGTTGTGTTAGACCTTGTTGGTAACCAAACAAAATATTAAACCGG 

CDS sequence (LotjaGi2g1v0311600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGACATTGGAGGAGCCTCAACCGTCATCTTCATCTTCATCTTCATCTTCATCTTCCAGAATGGACCAGAGCGTTCCTTC ATCTCGAACGTTTCGACTCGGCCGAGTCCAGCCTCAAGCCCCTGGCCACCGCACCATCTTCTGCAACGATCGCCTCGCCA ATCTTCCCGTCCGATTAACGGGGAACTCAATATCGACTACAAAGTACAACGTTTTCACTTTTCTCCCAAAAGGATTGTTT GAACAGTTCAGGAGGGTTGCTAATATCTACTTTCTTACAATCTCAGTCTTGTCTACCACACCCATCAGCCCTGTCTCTCC AATAACTAATGTGCTTCCTCTATCTCTGGTGCTTCTCCTCTCTCTTATTAAGGAAGCTTTTGAGGACTGGAAGCGTTTTC AAAATGACATGGCAATAAACAATGGTACGATAGATGTACTGCGAGATCGAGAATGGGTGTCTATACCCTGGAAAAAGTTG CAAGTTGGTGACCTAGTCAAGGTTAAGCAGGATGAATTCTTTCCTGCAGATCTGCTTTTCCTGGCTAGTACAAATGTTGA TGGTGTCTGCTACATTGAGACAGCTAATTTGGACGGGGAAACCAATTTGAAGATTAGGAAAGCATTGGAAAAGACTTGGG ATTACTTTACTCCAGAGAAGGCATCTGAGTTCAAAGGTGAAATTCAGTGTGAACAACCAAACAACTCATTATATACCTTC ACTGGGAATCTTATAATTCAAAACCAAACTCTTCCTGTCAATCCAAATCAACTGTTGTTGCGAGGATGCAGTCTCAGGAA TACAGAATATATTGTTGGGGTTGTTATTTTTACAGGACATGAAACAAAGGTGATGATGAATTCTATGAATGTTCCTTCCA AAAGAAGTACATTGGAGAGGAAGCTTGACAAGCTCATACTCACTCTTTTTGCAACTCTCTTTGTGATGTGTTTTATAGGA GCCATAGGCAGTGCTATTTTTGTAAACAAGAAGTACTTTTATTTACATCTTGAATCATCAGAGGAGGGCTCAGCACAGTT TGACCCCAGAAACAGATTTTTGGTTTTCCTTCTGACTATGTTTACCCTCCTCACTTTATACTCAACAATCATCCCTATTT CACTTTATGTATCGATAGAGATGATCAAATTTATTCAGTCCACTCAATATATTAACAAGGACTTGCACATGTACCATTAT GAAACCAATACCCCAGCATTGGCCAGAACATCAAATCTGAATGAAGAGCTTGGGCAGGTGGAATACATTTTCTCTGACAA GACTGGAACTTTAACAAGAAACTTAATGGATTTCTTCAAGTGTTCAATTGGGGGAGAGATCTATGGTAATGGCGTGACCG AAATTGAGAAGGGAATAGCAGAGCGTAGTGGCATTAAAATTAAGGAAAATGTCTCACCAAATGCAGTGCGAGAGAGGGGT TTTAATTTTGATGATGCTAGGCTTATGAGAGGAGCTTGGAGGAATGAGCCGAATCCTGATAGCTGCAAGGAATTCTTCAG ATGCCTTGCTATATGCCATACTGTGCTTCCCCAGGGGGATGAGTCCCCTGAGAAGATCTGCTATCAAGCTGCATCACCTG ATGAGTCTGCTTTGGTAATTGCTGCGAAGAACTTCGGTTTTTTCTTTTACAGACGCACGCCTACGATGATATATGTTCGT GAATCTCATGTTGAGAAAATTGGTAAAATTCAAGAAGTCTCGTATGAGATTTTGAATGTGCTTGAGTTTAACAGTACAAG GAAGCGTCAATCTGTTTTATGCCGTTATCCAAATGGGAGGCTTGTATTGTACTGTAAGGGTGCTGATTCTGTAATCTATG AAAGATTAGCAGATGGTTATAATGATATTAAAAAAGTGACTAGGGAGTATTTGGAACAATTTGGATCTTCTGGACTACGC ACATTATGCCTGGCTTACAAAGAATTACATCCTGATGTTTATGAAAGCTGGAATGAGAAGTTCATCCAGGCCAAATCTTC TCTACGTGATCGGGAAAAGAAGTTAGATGAGGTGGCAGAACTTATAGAAACTGATCTCATTTTAATTGGTAGCACTGCCA TAGAGGACAAGCTTCAAGATGGAGTACCAGCCTGCATAGATATTCTTCAAAGAGCTGGCATTAAAATTTGGGTGCTCACA GGGGACAAGATTGAAACAGCAATTAATATTGCCTGTGCATGCAATTTAATAAACAATAAGATGAAACAGTTTATTATCAG TTCAGAAACTGATGCAATTAGAGAAGTTGAAGACAGGGGGGACCAAGTAGAAATTGCACGGTTTATTAAAGAAGAAGTGA AGAAAGAACTGAAGAAGTGCTTTGAAGAAGCAAAAAGCCATTTTAGCTCTCTATCTGGACCAAAATTAGCACTTGTAATT GATGGAAAATGTCTAATGTATGCATTGGATCCTAGTTTGCGAGTCATGCTGCTGAATTTGAGTTTGAATTGTCATACAGT TGTTTGCTGCCGCGTTTCTCCTTTACAGAAAGCACAGGTCACGCGTTTGGTCAAGAAAGGTGCACAAAAAATAACACTTA GTATTGGTGATGGAGCCAATGATGTTAGCATGATCCAAGCTGCTCATGTTGGCGTTGGGATAAGTGGATTGGAGGGGATG CAAGCTGTGATGGCAAGTGATTTTGCCATTGCACAGTTTCGTTACCTTGCAGATTTGCTGCTTGTTCATGGCCGGTGGTC ATATCTTCGAATATGCAAGGTGGTGACTTACTTCTTTTACAAGAATCTCACATTCACTCTTACTCAGTTTTGGTTTACCT TTCAAACTGGGTTTTCTGGCCAGAGATTTTATGATGATTGGTTTCAGTCATTATATAATGTTATCTTCACAGCACTTCCT GTGGTCATTGTTGGACTATTTGACAAGGATGTCAATGCATCTCTATCCAAGAAGTATCCTGAACTATACAGGGAGGGAAT AAGAAATGTATTTTTCAAATGGAAAATTGTGGCTATATGGGCCTTCTTTTCTGTCTACCAGTCTTTAATATTCTTCTATT TTGTGAGTTCGTCCAGTTTAAGTGCTAAAAATTCAGCAGGCAAGACATTTGGACTCTGGGATGTCAGCACAATGGCCTTC ACATGTGTTGTAGTAACAGTCAACTTGCGAGTTCTTATGATTAGTAATTCAATCACAAGATGGCACTACATTAGTGTTGG TGGAAGTATATTAGCGTGGTTTATTTTTGTTTTAATAGATTCAGTGATCAGCACTCCTTATGATCGACAGGAGAATGTGT ATTTTGTCATATATGTCTTGATGAACACATTATATTTCTACCTCACACTAATTCTTGTCCCTGCCGCGGCACTTTTTGGT GACTTTGTGTACCAAGGGGTTCAGAGATGGTTCTTCCCTTATGATTATCAGATAATTCAAGAGATGCACAAACATGAGAA TGATGACACCGGCAGGGCACAACTGCTAGAGACAGGGGACCGGCTTTCTCCATCTGAGGGAAGGAGCTATGCCCTATCTC AACTATCACGTGAGACAACAAAGCACACTGGGTTCACTTTTGACTCACCTGGTTATGAGTCATTTTTTGCCGCACAGTTT GGTGTACATGCCCCACAAAGGGCCTGGGATGTTGCAAGACGAGCAAGTATGAGATCTCGGCCAAAGATTGTACAGAAAAA GTAA 

Protein sequence (LotjaGi2g1v0311600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MTLEEPQPSSSSSSSSSSSRMDQSVPSSRTFRLGRVQPQAPGHRTIFCNDRLANLPVRLTGNSISTTKYNVFTFLPKGLF EQFRRVANIYFLTISVLSTTPISPVSPITNVLPLSLVLLLSLIKEAFEDWKRFQNDMAINNGTIDVLRDREWVSIPWKKL QVGDLVKVKQDEFFPADLLFLASTNVDGVCYIETANLDGETNLKIRKALEKTWDYFTPEKASEFKGEIQCEQPNNSLYTF TGNLIIQNQTLPVNPNQLLLRGCSLRNTEYIVGVVIFTGHETKVMMNSMNVPSKRSTLERKLDKLILTLFATLFVMCFIG AIGSAIFVNKKYFYLHLESSEEGSAQFDPRNRFLVFLLTMFTLLTLYSTIIPISLYVSIEMIKFIQSTQYINKDLHMYHY ETNTPALARTSNLNEELGQVEYIFSDKTGTLTRNLMDFFKCSIGGEIYGNGVTEIEKGIAERSGIKIKENVSPNAVRERG FNFDDARLMRGAWRNEPNPDSCKEFFRCLAICHTVLPQGDESPEKICYQAASPDESALVIAAKNFGFFFYRRTPTMIYVR ESHVEKIGKIQEVSYEILNVLEFNSTRKRQSVLCRYPNGRLVLYCKGADSVIYERLADGYNDIKKVTREYLEQFGSSGLR TLCLAYKELHPDVYESWNEKFIQAKSSLRDREKKLDEVAELIETDLILIGSTAIEDKLQDGVPACIDILQRAGIKIWVLT GDKIETAINIACACNLINNKMKQFIISSETDAIREVEDRGDQVEIARFIKEEVKKELKKCFEEAKSHFSSLSGPKLALVI DGKCLMYALDPSLRVMLLNLSLNCHTVVCCRVSPLQKAQVTRLVKKGAQKITLSIGDGANDVSMIQAAHVGVGISGLEGM QAVMASDFAIAQFRYLADLLLVHGRWSYLRICKVVTYFFYKNLTFTLTQFWFTFQTGFSGQRFYDDWFQSLYNVIFTALP VVIVGLFDKDVNASLSKKYPELYREGIRNVFFKWKIVAIWAFFSVYQSLIFFYFVSSSSLSAKNSAGKTFGLWDVSTMAF TCVVVTVNLRVLMISNSITRWHYISVGGSILAWFIFVLIDSVISTPYDRQENVYFVIYVLMNTLYFYLTLILVPAAALFG DFVYQGVQRWFFPYDYQIIQEMHKHENDDTGRAQLLETGDRLSPSEGRSYALSQLSRETTKHTGFTFDSPGYESFFAAQF GVHAPQRAWDVARRASMRSRPKIVQKK 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
MobiDBLite 1 34 34 -
Phobius 1 85 85 -
Pfam 46 110 65 1.0E-21
TIGRFAM 60 1141 1082 0.0
CDD 61 1015 955 0.0
SUPERFAMILY 62 1133 1072 1.96E-46
Phobius 86 102 17 -
Phobius 103 107 5 -
Phobius 108 127 20 -
Gene3D 124 287 164 1.3E-8
Phobius 128 304 177 -
SUPERFAMILY 142 285 144 9.55E-19
Pfam 143 380 238 7.6E-10
PANTHER 220 1225 1006 0.0
PANTHER 220 1225 1006 0.0
Phobius 305 328 24 -
TMHMM 306 328 23 -
Phobius 329 352 24 -
TMHMM 353 375 23 -
Phobius 353 377 25 -
Phobius 378 913 536 -
SFLD 406 906 501 0.0
SFLD 406 906 501 0.0
SUPERFAMILY 412 897 486 2.03E-33
PRINTS 424 438 15 2.2E-5
ProSitePatterns 426 432 7 -
SUPERFAMILY 431 693 263 2.83E-22
Pfam 529 615 87 1.0E-10
Gene3D 553 674 122 4.4E-18
Gene3D 686 895 210 9.2E-54
TIGRFAM 828 934 107 5.4E-32
PRINTS 855 874 20 2.2E-5
Pfam 883 1133 251 4.5E-80
Phobius 914 932 19 -
Phobius 933 951 19 -
TMHMM 948 967 20 -
Phobius 952 971 20 -
Phobius 972 991 20 -
Phobius 992 1015 24 -
TMHMM 996 1015 20 -
Phobius 1016 1029 14 -
TMHMM 1030 1052 23 -
Phobius 1030 1049 20 -
Phobius 1050 1060 11 -
Phobius 1061 1083 23 -
TMHMM 1061 1083 23 -
Phobius 1084 1094 11 -
Phobius 1095 1119 25 -
TMHMM 1098 1120 23 -
Phobius 1120 1227 108 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Nucleotide binding Interacting selectively and non-covalently with a nucleotide, any compound consisting of a nucleoside that is esterified with (ortho)phosphate or an oligophosphate at any hydroxyl group on the ribose or deoxyribose.
Molecular function Magnesium ion binding Interacting selectively and non-covalently with magnesium (Mg) ions.
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Biological process Phospholipid transport The directed movement of phospholipids into, out of or within a cell, or between cells, by means of some agent such as a transporter or pore. Phospholipids are any lipids containing phosphoric acid as a mono- or diester.
Cellular component Integral component of membrane The component of a membrane consisting of the gene products and protein complexes having at least some part of their peptide sequence embedded in the hydrophobic region of the membrane.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0311600.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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