Your browser is unable to support new features implemented in HTML5 and CSS3 to render this site as intended. Your experience may suffer from functionality degradation but the site should remain usable. We strongly recommend the latest version of Google Chrome, OS X Safari or Mozilla Firefox. As Safari is bundled with OS X, if you are unable to upgrade to a newer version of OS X, we recommend using an open source browser. Dismiss message
| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0341400 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0341400.5 |
| Related isoforms 6 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Formin-like protein; TAIR: AT1G31810.1 Formin Homology 14; Swiss-Prot: sp|Q7G6K7|FH3_ORYSJ Formin-like protein 3; TrEMBL-Plants: tr|B9GZX5|B9GZX5_POPTR Formin-like protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0341400 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:81831942..81842155) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AGCTAAACGATTCATTTAGCTGAATGTTCCGTCGTTGTAACTTGGCTCTCCGCTCTCGCCGTTGATTCCTCCGGCTCCGG TGGTGTTGTATTCCGTGTCTCCTTCCTGTGCCCTCTTCCAGGTACACCTTTCATGATCGTGGTTGATTTTATTTATCAGA TTGATTCTATAGAATGTTCTAGTTTGTGTGCCATGTTAAATTGTTAATGATAAAATAATCAAAACACTTGTAATGGTGTA TTGGATGGAATGTCTTTTCTCATGTTTCATTTCATCACATCTTATTTAAGTAATGAAACGATTCTATTATTTCTATCTAT AGCCTATTCTTCAATACTTTGAACTATGCCATTTTTGCCTTGGTGTTTGTGTTTTAATTCTTGGATTTCACTGGTTGATG GATGATCAGGTAATTAGTTGTCTTTGCTAATTTTTTTGTTTAGGTGATTGTCGACTTGTCGTCGTTGGAGGTGGTGGTGC TCTTGCTCCTACTCCTGCAGGACCAGTTATGGATGTTTCTTCTGTGGTTGTGGGAGGTGGGGATACTGCTGTTCCTGCAG AAGGTGCGGCCTCGGCAGGTGAGGCTGCTCCACATGAAATACTACTATATTAGATAATGTCATATCATTCTTTCTTGCTG CATTAATTTTATTTTACTTATAACTCTTATTTGTTGACAATTGACATTGTTGTTTGTGTAATTAAATTTAAATAATAATG ATATACAAATCGTACGATACGTATTACATTTATCACATTCAAACTTTCTACTAAAATATCCACTCCATGGCAACATATAA CGAATAAATAGCCATTATTCATAGCACCTTAAACTATTAGAGATACTGTATGTTAGTCAGAATTGTATTAGTTAGAAGCT TTTAAGAACTAGGGTAAACAGAGAAACTGAATTGTAAACAGTATTTCATCAATCTACAGAGTTACAAAAGAATACTAGTT ATATACAAGAGTTAACTAGCTTAGACACATGTCTTGAGAAGCTTGATGATGAGAATTTCCTTTTGTGGAAGCAACAGGTT GAACCTGTTATTATTGGCCATCACTTGCATTGTTTCTTGGTGAATCCTTCGATTCCACCTCGATTCCTCTCTGACGCAGA TTTCGTCGCTGGCAACAAAAATCCAGCCTACCTTTTTTGGGGGCAACAGGATATGCTCTTATTCATCATTTAGTATATCT CTCTTTTAGGTGAAAGTAATGGTGGGACTGCTGCTCCAAAGAAAACTTTGTTAATGCCCCTACTTTGGGAGACAATTGAT CATGTAACAGAAGGGAGTTTTTGGGATGATTCACGTCCCAATGCATTTAGGTACTACTGATTATTTAGTTTTCATATCTC TATGCCCCCACCCCTAATTTGGATAGGACTTTAGGACGATGAGATTTTATGTCCAATTAGCATTTCTGATTACAGACTAT GAAAGTTTGTTTCAGGCTTCCTGATTTAGATATATCAGAACTTGAGATCCTGTTTTCAGTAGCGGCCGCTTCTGATTGGA GCAGTACTAAAGGTGGAGGTCGGCATGGTTCTTATATTAACAAACCTGAGAAAATACGATTGGTATGCTACAACTAATTA ACAGATTATTTAGCAACCTGATGCTTAAGTGTTTATTTGCAAGCTAGAGTATTCTATAGTGATACTCAACAATCACTTTG GTATCAAATGGCAACAAGAGATAATAAGCATCACAACTATTGTCCCAGAAAGATTTTGTCTGCTCTTGCTATTTGGATGT TAAATGAGAAAGGAGGAAAAGATACAAAAATATTTGATTGCAAGTTTTTTATATTGGATTGAATTGATAATTTGATATGC AATTTTCTGTTGAAACAAATACTATTCCTTACACAGCTTGCAGGGGTATTGAGATACCTTTTCTTCTGTCTAAACCTAAT TAAATGGAGATACTATACTACTTCCTCTTTATTGTTTTTGTCTAATTTATTGTTTGATTTATAAAATGAATTTATAACTA ATAAACTCTAATTTCCTTTTTTCCACTGCTAGATGGGTAGAGCATATAACCGTGAAATAATGCTCTCTACTATAAAAAAA ACTTTGCCAGATATGATTGTAAGTTTCCCATCCCTTTGTTCAATTTACTTAGGGGTTTTGTATTTACTCGATGAAATTAC ATCTTATTTTAGTTTCAGATGATTTCTTTTGTTGTATATCATATATTTTGATAGAGCACACTAGTGTCTATTTATCCATG TAGGCGAAACCGTTGGTGTTGTTGGTATTCATGTTAAATATGTGGATGAAGTTATGGGGCTAATTCTCAACTAAATTTTC TGAAAAGGTAGCTATTGGGATTGGATTATCATAGGAGGATTCCTCAGGTTCCTTATTCTTTTATAACAGAAGAACAAAAA ACTGGGGTCCTGTTTGCGGTTTTTGAAAACTATATTCTGTTTTGAAGGTAACTTGTTTGTCAACCCGTTTTCATGAACTG TTTTTGAAAACCGTTCTCATTTTCAGTTTTTAAAATTAAAACATTATTTTCTGCTTTTACTTTTCAAATTGCAGTTTTAT TAACATTGTAAAACATAATTCGAACAGTTTTTTTCCTTTGAATAATAGATTTATAAAATGGTTTTTGAAAATTTATTTTT ACTTTTCAATTCAATTTTTTTAATATTTTAAAACATCATCCAAACGGGTTTTTCTTTTGAATAATTGATTTTAAAAAATG GTTTTAATTTTTTTAGAAAAATCAGAAAACTAAAGCAGAAATCAAACAATGATTTTATTTATCAACATTAACAGTTTCAC TCATATAAGCCTGTGTATTTGAGTATGGCAGTTGTTTTCCCAATCTATTTCTGAAAGTTTACTACAGAGATGTTAGGGAG CATGATCTGGGTTGTTGGAGATATTTTTATTGTTGACAACCTCAAGTTTCACCTGTGAGTCTATTGGACTGGAGGCTATA AGTGTTTAACTGACCCAAAGTCATGGCATTAAGTAAGGTTGATAATCCTTCACAGGTGTTCATGATAATATTCGGTTGGA GGATTTTATTAGTATTTCCGCTTATGTTAGCTAAGAGTTTTACCCAGTATTGAATATTAATTTTCTTACACTTCCATTTG TCATGTGGGTTGATTTTAGATGACATCATTTTTCATATTTGCTGTTAACAAATGTGAAATTTGTGGGTTTTGTTTTTTGT TCCAGAAGGCAATTCTGGCATTGGATTCTTCTGTTCTGGATATTGATCAAGTTGAGAATCTTATCAAACTCTATCCCACT AAGGAAGAGATTGAGATGTTGAAGGTACTCCTCTCCTCTCCTCAGTTTCCGGGAACTTTCAAAATTCTTTGAACTGCAAT GTGTTTATTTAATAAAATTGAAAGGAGAAAAACTGAATTTAAAAGAGAAGCTGAATATTATTTCTCAAAAATACAAACCT TACATAATGCAATTCAATATATAGGTAGTGTTTGGCCCAACTTTTTTAGAGCTTAAAAGCTACTTATAAGTCTAAGTTTA AAATAAGAGCTCAAAAAATAAAGATAAAGCTGTTTGGTGGTTTTCATATTTTTACATTATAAATGTGACTTTTAAGCTAA AAGTTGTTTGATTAATCATCTATATTTTCTCACATACACTGTTCTAAACTTTTTATCAAATGGTTGGTGTGCAGTACATA CATAAATGTTTATATCATTCATCATTGAAACCTCCACAAGATTAGCACCACGTTCTTTCCATCTGACTAGCCTTCTTTGG ACACAAAACCAGCAAGCTTACATAAGAAAACAGAAAGCAAACCAGATTACCAGAGGCCCCGACCTGTTATCCTAATGCAC CACTAAGGATTCCCTTCCTAAATCATTGTAATTGATAACCCAACTCAGTAAAACCAAGCTTCCGATTGCTACAGTTTGCA TCTATCGAAGCATAAACAATAATTTTCAATCCACAACATTAACATGAAAAACAACCTCCTCTTCCCAATGCTCACCGTCG AGGAAACCCTCACCCTCACTGAGGAGTTCTGATTACCTCGCACACTCCTAATCGAAGAAAAAGGCTTGTGTTCAGGCCTT AATCGACGCTAGGCGTTCGGATCACCGTAAAAACTGTAATTTGCGATGAAGGCCACTGTGGCGTCTCCGACGAAGAGCGC CGCCGTGTGTCCATTGGAATTGACATAATCCATGACTCAAACCTGCTGTTTCTAACCGAGCCAACCTCCGGACTGGACTC AACAAGCGTGTTCATGGTGGTGAATGTGTTTCAGAAAATCGCAGAGCGGAAGAATTGGATCATTTGCGATCTAGTCAGAG ATGGAAACCTTCAGCAAACACGGTTATTTGAATGGAACGAGATGGAAAGTTTGTGAGGGAAGAGGGAAAAATAAGCTCGT AAAAAGCTCCTCTCTCAAACTTATTTTATTAAGGAGCTTCTCTTTATTTTATAGTATACCAAATAAGCCCCTTAAAATTT TAGACCTTTTTTAAAATTGTGTTTGGCCCAACTTAAACTTATAAATAACTTAAAAGTAAAAAAAAAAAAGTTGGGCCAAA CACTACCATAGACTAGCTAAATACTTCATTTTCTAAAATTAAAGCTGAATCTCTGAATAGTTTACAGTTACAACAAAGAT GACCAATGTGGGATGGCAGGACTGTTAAAACAAATACAACACCAACAGCAGCCTTATCCCGCTAAGTGAGGTTGGCTATG TGGATCACACTATGTCATTTAGCTCTTAATAAACTAGCTTCAGGGGGAGTGATGTTTCTTTTGGCCTCCCTCTACGGATC TACCTTTTCACAATATTAAATATCATGTTATCAACCATTCTCACCGGTGCCCCCAGAAATCTTCTTTGTACATTTCAACA CCACCTTAACCAAATATTATAAGTACAACATATATCTTAATAGTTTGGTATCCAGTGATTCCGTGAATGGTCTTGGTTGC AATGTTTTAACCATGATATTCTGTTGTACTCGGTTCTAGCCTTCTAGGTTCGATATCTTGAATGACAACATCTTACATTT ATTTTGTATAGATGGAGATTGTCATCTTTGCATCATTTAGTGACATTTATTTTTAGCAAGGACATAAGCCAAAGTTCCCT ATCGTCTTGACTTGAATTCAATTTTTTAGGATTTGAACTTAAGTAGTTATCTATTTTGCTGGCTTTATACCATTTTGGTT AAGAATTTGTGCAAGTGACAGCCACTAAGAGGTTTTTTATGTTAAAAGGCAATCTACATGGAGTATTTCCGCTCAAACCT TTTGAAATAAACTGTCGGCCTTTCTAATGCTGCATTGCGCATTAGGGAAGAAGGAATGTCCTATTTGTCTTTATTGGCTA AAAATCTCTGTCTTTCAGAATTATACAGGGGACAAGGAAATGCTCGGAAAGTGTGAGCAGGTTCTCTCATTCTTAATTCC CTTTAGTTTATGAATCATTGCAAATGTTATATATTGATTGTAATAAATTTTTTTATAACTTCATCAGTTTTTTATGGAGC TCATAAAGGTTCCACGAATAGAATCCAAGTTATGGGTGTATGCTTTCAAAATCAACTTTTTTAAGAAGGTATGTTATCTA GTTATTATTATCTGTGCATGGTTCTGAATGCTTTTTCTTTTAATAATATTTCATGCTTAACAACCTGTCTTACTTGCTTC TCCAGGTGAGCGATTTAGAGGAAAATTTGAAAATAGCCAATGGTGCAGTCAGAGAGGTACTGTTTAATGTCTCTTAGCCG ACTAATATTAACGCTTTATTGGGCTTTGCATCTTTACGTTGTTACTTATGCTCACAGGTGAAAGCTTCTGTGAAATTGGC TGAGATAATGCTGACTATGCTTACTTTGGATAATGGCTTTGCCTTGAATCAGGGAACATCACAGGGTATTTTGTTAAACT ATAATCCTGCATGATTATCTTTTAATTTGAGATGAAATTTTTATTTCCTGGTTCACCTCTACTTTGACAAAATGAGAAAA TTTATAGTTATGTTGATCATAGATTATATTTTCTATGTTCATCGCAGGATCAGCAATAGATTTCAAGTTGGAGATCCTTC TTAAATTTTCTGATAATCGCGCAAGAAATGACAAAAGGACCTTGATGCATGATTTGTGTCAGGTATATATCAAAGTTTTT AATTTTGTGCATTTACTATTTTATCTTTGAAGTAATTGTGTACTACTGGACTTATTTATTCTAATGTCGATATACTCATA TAAAAGATTGTATGAAAGAAAAGAAATGTCAGATGTAGCTGACTAATATTCGTCCAAAAAACCTACTTTGTTCCTCATGA CTACCGATTAATGTGACATTTCTAACTCACCAAAAAAGTGTCTCATTTGTTGTTTTTTTTATTGGTTCTGTTACCTTGTG CTTCTCAACACTTCTCTCCATCTGCTAATGTGTTTCCTGCTGTTGTGCATTTTTAGTAATTGTTGCGGGCTAGTGTTGAC CTTGGGAATGATGAATGATTTGCATTTTGTCATCGTATTGATGCTTTTTGGAGGGGCTGAATATTGAAACTTCTATTTTG ATTTATGGTTTGGATTTTGTGTTATTTCAAGGTTTATTATATGAAATATCTGCTTATGTTTCAATTTATGACTTGATTTC TTTAACGATGCATAAAAAATTCGATTCACAATTTGGAAAATAGGTCAAACGATCCACAGTTCAAATTTTGATTCAATAAC CATGCTATATCTTACCATTTTTTTACCTCACTAGCTCCTTGCTGAGAAAAAGCCAGAATTGCTAGATTTCTATAAAGATT TTGTCAAGTTGGAAAAAGCTTCTAAGGTACTCTCTTCAACGCCAAGACTTTCTGTTCCCTTTCTTGATGATTGATTTGCT TCAGTTTAACTTGTGTAAGGTTAATTGTTTATGGATTGGTGCCATCTTTGTCAAATATCTAGATCCAACTAAAAGCAGTA GCTGACGGAATGCAAGTTCTATGTGAAGATTTAGAGAAAGTTGACCAAGAACTCCATGCTTCTGAAACGGAATTTTACAA GGTGAGGAATAGAAATATTTCCTTTTAGGCTTTTACTTTTACTTAAAATGAAATTTTATGCTCTTAATTGAAGATATTTC TTTTGTTATTTACTTGAGAGAACATAGTAGTTTGTCCTGTTGAACACAATAACTGCAACTCAATACTTGCATGTATTATT TGTCTGTTAATCCATTCCTCATCATACCCATCTTATCTCCTCAACTAGCATATTTATGCATTGAAGAAACTGTTGGAAGC AACTTCAGCTTCTCCTATTTGTTATGTGAAAAAACTAACCTTTGGTTTGGTCGTAGAAAATAGAACGAAGAGTCGAAGAG AAAGAAAATGAGTAAATTTTGTCTTGTTTGGTATTAGAGGAATAAGAATGAAGAAGAGTACAAAGAAGTGTACGTCTGTT TTTTTGAAAGAACTAAAATGCCCCTAGGATTAAAAATGGTATGGTGAGACAGTGAATTGGATGAGGGTATGGTGGGAAAA ACAAATAACAGGAGAGTTTTTCTCTTCCTTTTATTCTCAATTTGGAGAGAAGATAAAAAGATTGGGCCTCATCCCTTTCT TTTCTCTCTTCCCCATTTTCTCCTATCAACCAAACATGCATGTTTCCCAAAATCACTGCTTTCAATTTCTTCTCAAATTC CATCCAACTCAACGTTGCATAAAGGAAGTCATGAGGGCATACATTCAAGGAATCAAAACAAAACTAGATGTTAACTTTGG GTGATCATTATATGATAACAGCTGTATGCTGTGGGTCTTCACTGAAGCCTTCACCAATAGATTAAAATATGTTAACAACT GCTTGCTATCATGCATCTATCTGACTTTTTTTATAAGACATATCTTATGTCCCCATGGAGAAAACTTTGGTTTGACTATA TTCTAGTAATATTTCTTTTGCTCAGGTGTTGAAGACTTTTCTGGATGACGCCGAAGCTAAGATGGGGTCACTTGTATCAT CGTATACAAATGCGGTGAGTCCTGTTATAGCTAGTGTTTCTCTTTTCTCCCTCCTTTTTTGGGTGCTGATCTTGGCTGGG AGAATGAGCCGGAGATTGCCTACATAGAGGAGAGTTTAGTGTATTGTCCAGTTAATGGATAGGACTATGTTGATAACTAA TTCTGCCAACTGCTGCTTATTTTTCATTTTCGGTCTGAACTTTCTTTTCCAGAGAAGATTTGCAGATTCTTTGTCCCGGT ACTTTGGGGCGAATCCAGCTACATGCCCATTTGAAAAAGGTCTGTTGTTTTCTAGTTGCATAGGATTGAGTTTTTGTCAC CCAATTTTGGTTATAAGGATTAAAGCTCTATGCACTTTGAACTTAATTTGTAATGTTCGTATTGCTGCTTGATTGTCAGA ACAGATGGGAAGAGACATTAGAAAATGGGTATAAGGGGGTAACCACTTTTTCTTTCCCCGTGTGTGTTAAGTTCTATAGC TGTTATGGATAGTTGTCAGGGTTTTTAATAGTGCACTACAGCGGTACGTAGCAGCCCTTGACCGCTCCTAGTGGTTGCGT AGCGGTGCAGGTTAGTGTAGCGACTATTGCGGCCGCTAAAGCGAAGGAAATAGCAGCCATAGCTCTGCTATTTGGTGGAA CTGATAAAAACCCAAAAGCAACTCACAAAAAGTTCATTTTTGGGCATTTTGAGGAGGTATTTCAGGCTTTGCTTCGGAAA CATACTGAAATTGGTATAGTTTGAGGAGGATGAGGAGGAAGTGATATAGATTTTTCATGTTTTTAAGCAGTACAGCTTGG GAATTAGAGACTCAAACTTCTTGGTTACCTTGACTTTTGTTGGTACTAGTATGTTTTATTTAAGACTATGACTTTTTAAT GTTAATTATGAGTGCCCCGAATTTTCAGTATTTTTTTTATATTTATATGCATATTATTATATTATATAAAGTTATAAACT ATACAAAAAATTCAGCTTAGCGCCCATCCCGCTATCTGCTAGACCACAATAGCATTTTGGTGGTTGGCAGCTATCCGAGA TTGACAACACTTGTTAGTTGAAGTCTTTTAAAGAGGGTTTATTACACAATCATTAGGAACAGAGAACTAATACTGTATAA ATACGAGAACTCAAGATTATGATGCAATTTTCATAGTAGATCAGTTTCTGTTTCTCTCATGTATTTCCAGTCTTTCTTTC ATTTTCCATTAATCACTAATTACTGAACATTTATTCCACACTATAGCTGACTTTTTGCTTGGTTTTTTGTTGTTGTTGTC AAGTTTATATTGATTGTCAAACTTGTGCTTTTGTTGCAGTGACACAAATACTTGTTACCTTTGTCAAGATGTTCAAGAAG ACAAGGGAGGAGAACAAAAAACAAGGAGATGCTGAAAAGGAGAATTTACATGCTGAAAGAGGGAATTTAAGAGTCCATGA AGGACAAGATATTATGTGTGTCCAATAACTAAAGATGAAAAAGACATCTCTGCTTAGATTGTCAACGAACAGTGCCAAAG TTGCCAACAATGTTTATAATCCCAAAAACTTAGCCCCCTGAACTCAGCATCGTTAGATAAGAACCTGTGATACCCACTAA CAGGGCCACGAGATTGTCCATGGTGTGACATAGGCTCCTGATATGTACTTGGTTTACAAACAAGCGATTGTAAACACTGG GGCTGCATGGCTTAGGCTCCTTGCATGTCTTTGATTTACTAAAAAGCTAGTTGAATGTGAAGTATGTTTGGGTCATGGTA GTCATTCTCCGCCCACCCCAAAAGTGGGGTAGTGTGCATAGTGGGATGACCACTATTCTAACTTAAATTCTAATGAGAAG TGTTATTCTAATTTTTAAGTCTTAAAAAATTGATGAGTTGAATAATAAACATAATTAATTTAACTTGACATCATGTAACC AAACAGTATCACTGAATTTGTCTATTTTCGTCGAGGATGAAGTGGTGCCATATTTATTATTATTGATTTCTAATAACATA CTACTACAGTTAGATATGTCTAACTACTCATGATTAAAAAAAAGGGAAAAATAAGTCATTTGGGCCTTTAATCTTTTAAT CATGATCATTCATAATTATAACTGAACTGCATGATTAATTTCTACGATTCTCATAAAATATTTCACAAACAAGAAAAATA GTAGAGAAATACAAAACCAGAACGGAGAATCATAATTTATCACTTACTACACCT
CDS sequence (LotjaGi2g1v0341400.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTTTCTTCTGTGGTTGTGGGAGGTGGGGATACTGCTGTTCCTGCAGAAGGTGCGGCCTCGGCAGATGGGTAGAGCATA TAACCGTGAAATAATGCTCTCTACTATAAAAAAAACTTTGCCAGATATGATTAAGGCAATTCTGGCATTGGATTCTTCTG TTCTGGATATTGATCAAGTTGAGAATCTTATCAAACTCTATCCCACTAAGGAAGAGATTGAGATGTTGAAGAATTATACA GGGGACAAGGAAATGCTCGGAAAGTGTGAGCAGTTTTTTATGGAGCTCATAAAGGTTCCACGAATAGAATCCAAGTTATG GGTGTATGCTTTCAAAATCAACTTTTTTAAGAAGGTGAGCGATTTAGAGGAAAATTTGAAAATAGCCAATGGTGCAGTCA GAGAGGTGAAAGCTTCTGTGAAATTGGCTGAGATAATGCTGACTATGCTTACTTTGGATAATGGCTTTGCCTTGAATCAG GGAACATCACAGGGATCAGCAATAGATTTCAAGTTGGAGATCCTTCTTAAATTTTCTGATAATCGCGCAAGAAATGACAA AAGGACCTTGATGCATGATTTGTGTCAGCTCCTTGCTGAGAAAAAGCCAGAATTGCTAGATTTCTATAAAGATTTTGTCA AGTTGGAAAAAGCTTCTAAGATCCAACTAAAAGCAGTAGCTGACGGAATGCAAGTTCTATGTGAAGATTTAGAGAAAGTT GACCAAGAACTCCATGCTTCTGAAACGGAATTTTACAAGGTGTTGAAGACTTTTCTGGATGACGCCGAAGCTAAGATGGG GTCACTTGTATCATCGTATACAAATGCGAGAAGATTTGCAGATTCTTTGTCCCGGTACTTTGGGGCGAATCCAGCTACAT GCCCATTTGAAAAAGTGACACAAATACTTGTTACCTTTGTCAAGATGTTCAAGAAGACAAGGGAGGAGAACAAAAAACAA GGAGATGCTGAAAAGGAGAATTTACATGCTGAAAGAGGGAATTTAAGAGTCCATGAAGGACAAGATATTATGTGTGTCCA ATAA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0341400.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MFLLWLWEVGILLFLQKVRPRQMGRAYNREIMLSTIKKTLPDMIKAILALDSSVLDIDQVENLIKLYPTKEEIEMLKNYT GDKEMLGKCEQFFMELIKVPRIESKLWVYAFKINFFKKVSDLEENLKIANGAVREVKASVKLAEIMLTMLTLDNGFALNQ GTSQGSAIDFKLEILLKFSDNRARNDKRTLMHDLCQLLAEKKPELLDFYKDFVKLEKASKIQLKAVADGMQVLCEDLEKV DQELHASETEFYKVLKTFLDDAEAKMGSLVSSYTNARRFADSLSRYFGANPATCPFEKVTQILVTFVKMFKKTREENKKQ GDAEKENLHAERGNLRVHEGQDIMCVQ
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| ProSiteProfiles | 1 | 336 | 336 | 45.235 | ||
| SignalP_EUK | 1 | 20 | 20 | - | – | |
| Phobius | 1 | 2 | 2 | - | – | |
| Phobius | 1 | 20 | 20 | - | – | |
| Phobius | 3 | 15 | 13 | - | – | |
| SMART | 3 | 345 | 343 | 2.0E-6 | ||
| Gene3D | 16 | 340 | 325 | 1.5E-82 | ||
| Phobius | 16 | 20 | 5 | - | – | |
| PANTHER | 17 | 326 | 310 | 5.1E-124 | – | |
| PANTHER | 17 | 326 | 310 | 5.1E-124 | – | |
| Phobius | 21 | 347 | 327 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 24 | 326 | 303 | 5.36E-75 | – | |
| Pfam | 25 | 311 | 287 | 9.6E-73 | ||
| Coils | 119 | 139 | 21 | - | – | |
| Coils | 230 | 250 | 21 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi2g1v0341400.5, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…