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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0347200 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0347200.1 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Rop guanine nucleotide exchange factor, putative; TAIR: AT1G31650.2 RHO guanyl-nucleotide exchange factor 14; Swiss-Prot: sp|Q56WM6|ROGFE_ARATH Rop guanine nucleotide exchange factor 14; TrEMBL-Plants: tr|K7K403|K7K403_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0347200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:82383184..82406573) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GGAAGTTAGTAAGAAGATGGGGTATGCAGCCACTTCTCTTTCGTGCTTGTGACATATATAGGCTTTGACACTCATCCCTG CTACTATACTACCATGTGTTAAGTTTGAATTCTGAATTTTTTAGTTGGATTGGAGTACATTGCCCAAGACTTATTTTTGT ATCCTCACTTTTTCTCTCTTCAATTTTTGTCTTTTATTTTTATCAATCTCTGCTTTTTTTCATATCACAACCACCAATCA AATATATTTCTATCCAAGCAAACCAATTTTACACCATTAAATAGGGTGTGAAATGTATTTTTTTCTGTATTTTTCATAAG AAAAATGTTTGATGAAGAGATCAGAGAAAAATAATAGAGATGCATAACTAAAAATGTAATTAATGTAAATTTGTTTGGCT TCCCAAGATATGCCAATAATCGACAATCATAAGACTAATCCTGTAGAAATTTTGAGAGATCACGTTAAGTGGGTATAGTA GACATCTCCCAACAAATGCTTATCCATACGCATCGCGGGAGAAACATTTGTGAATGTTAAATATAATTTCAAAAGTGAAA TCCAAATGCACCATTTTGATTTTTGAACTTAAATAATAAATAGTGAGTGATAGGGCGCTCTATGCTGGTCCCCAATTTCT TCAAATAGAGCAATCTAAACCGTCCAGATTGAACCGGACCCACTAGATTCAACGGCCGTAATTCAGTTACTGCAGGGGAG CCTCCTTGTTCTCCATTCTCAAATCCATATTCTCTCTGCTATTAAACACAGCAATTCCATTGCTTAATCTCATTTCTTCT CTCACTTCCTCTTTGGTGCCATTGCTTCATCGTCATTCATCGTTTCAGCGAACAACAATGCTAGCTCTTCAATTCTGAGG TATGTTCAGTATTCTCTTCTCTTCATTTATCAAACCATTTGTAAGATCATGCAATATTGTAATCAAGGACGCCATTCTGT 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TGTCTGTTGTCTCTCATACTTTACTAACTGTATTCATTTGTTGCTTTTGTGAATGCCCTAAGTTAACCTAATATAACTGT ATATATATATTACAAGATGATATTTTTTTTGTACTTATAATCTGAGGGAAAACATAAAGACGATGATACTTAGAGTCCCT TATATCATTTCCTTGCATCAGAACTTTTCAAAAGACTTCAAGTCTACAACACTTATTCATACCTAACCCCATAGAGTTTT TATACATAAGCTGACAAAGCTGTTATCTTTTTTTACTATTTCAAAATTTGATGTTAACAAATTAAAAATTTAATCCTTAG AATGTTGCACATGTATATCACACTGACTAATAATTTAGGCATAATTTATATAGAAAGTCTCTAAGTAATAATTTAAACAC ATTAAAACTCGGAAAAGAAAAATTAATCACAGGCTTGTTACAATATTTTATTAAAGAAGGAAAATACATGAACAAGAAAA GGATAATTGGTAGCAACTGTATGATGACACTGTTTGTCTTTTACATCATATCTTTTGGGGTTGTTATGCAGTCTGCCTCT GTCTAACCACTGTAGGGAAGAAACTTTTGATTAAGTTAAGCTCTCTTATGACATGAACCATGCTCATTCTCTCTTTTGCT GATTCCATTGAACATGCAAGAGCAATCCTAAAGAGTGAAAGTAAACGTTTCTCTACATTAGGTTGCAATTGCATAATGCA AAGGTTCCCATCCTCAGTAGCCTGATTGAATTCATTGAGGAGAATAATCGGGTCTACAATTTGTAAAAGACTTTCTGAAA TTGAAACTTCAACATAATTATGGAGATTATGACCATCTTTGAACATTTCATCTGTGGGTTTCTTTCCGGTTAACATTTCT AAAACCAGAATTCCAAAGCTATACATGTCACCCTCAATTGACACCTCTGAACCCATTCCATACTCTGAAATGTAATGCAG ATCATTAATATCATCAAAGTTATCATCAAATTTACTCAAATAAATCAAAGATCCAAAAGAAAGAGCTTAAACTTGAAATT AAAATATTTCACAACTTTACCGAACAATATAACGTCATACCTGGAGGAGCATAGCCAACCGTCCCCTTTATTCCAACTGT GCTACTTTGCATCTGAGTGACTCCAAAACATGGGAGCAATTTTGCTAACCCAAAATCACTCACGTGAGGTACCATGCATT CATCAAGAAGAACATTGCTAGGCTTTAAATCACAATGAATGACAGGCTGCTCACATTCGTAATGAAGTTAATGAAATGCT GAAGCAACATCAATTATGATATTTAGCCTTTGTTCAAGGTTCAATGATCTTTGTTGATCTTCAATTTCTGTTGTTGGATG AAGCCATTGCTCTAAGCTTCCATTTTTCATGTACTCAAAAACAAGAGCTTTAAATTCTTGACCTTTGTAATCTGTACTGG AGCAACATGTTAAAATCTTTACCAGATTTCGGTGTCTAATATTTTTAAGTGCATTACACTCAGCAATGAAACTTTTGTTA GCTCCCTTCTTTTGAAGATTCAAGACCTTTATGGCAACAACTCTATCTTCTGACACAATGTTTCCTCTGTACACAGAACC AAAACCTCCTGATCCAATCAGGTTTCTGGCTGAGAACCCATCGGTTCCATGATGTAAGTCTCGGTATGAAACCTTAGCTA ACTGGTCAATTGTTGGTGAATCAAAAGATGGTTTCTTGTTTCTTTTTCTCATCCAGTAGATGGTTAGAATAAATGACAGT ATGAGAAGAAAGGCACCCACACTAACTATCACTGCTATCAACTTGAAATCATGGTGTTTTGCAGGTTTCACACCTTTGAC AGGGCAAGGCGGTAGATGCAGCTCTGAAATACCTCCACAAAGGTTTTTGTTTCCAAACACTGCTAACGCGCTTGCATTTT GAAAGACACCTTCTGTTGGCACTTCACCATCCAACTTGTTAAAAGAAACATTCAAGTATTCTAAATATTTAATGTTCTGC AAACCATTAGGAATTGATCCAGACAAGTTGTTTCGTGATAGGCCTAAACGTTGAAGACCTTTAAGTGAAGTCAAAGAGAA TGGCACGATTCCATGGAAGGAATTCCCTTGCAAATAAAGGTACCCCAAGCTTATGCATCCTCCAATTGTTCCAGGAAGGC TACCAGAAAGATGATTCTCAGAGACATCTAGCCAATGGATACTTTTTAGCCTACCCACTTCATCAGGTAGATTGCCACTC AATGAGTTTTGTGACAAATTCAATAATAAAGAGGGAAGGTTAAAAACTTCAAAGGGTATGGTTCCTGTAAGTTTGTTTTG CGAAAGGTCTAGGTCCTGCAACATGTGGCAATTTCCTATGCTTGGGGGAATTTTTCCTTCTAACATATTATCTTTCAGAC CCAAACGAGTCAACTTACTGAGATTACCTATGAATGCTGGTATATCTCCTGAAAGTTTGTTATGGACCAAACTTAATACT TGCATCTTCTGAAAATTGCCAAAAGTTTTCGGAATAATCCCTGTAAAATGGTTCCTTTCCATACCCAAGACAATTAAGCT ATATAAATTTCCTAATTCTATAGGAATTTTTCCTGTTATCTGATTACCTCCAAGGTAAAGCATTCTTAGTTGGGTGGATA AATTGCCGCAGGAATTCGACAAACTGCCTCCAAAGTTATTAGAGGCTATAGATATTTTTTCCAACTTACTACAATTTGTC AATGATGTTAAAAAATCCAAATCCTTAGTTGAATTGCCACCTAAATTGTTCAATTCCAAATTTAACCGCCAAAGGTCTTG TAGCTTACCTAGACTTGGAACATGGCCAATGAATTGGTTTCGACTGATCTCGAGTACTTTTAGGGTTGAAGCATTTGCAA TTGAAGTAGGGATTGGACCAGAGATTTGATTATCACCAATGTAAAATTTTTGGAGATTGGGGAGGGTGCGGAACATGTTC GATGGAAGAGAGCCGTTAAATTCATTGGCTGGAACTGAGATTATTGTAAGAGTTGACATGTTATAAAGACAAGAAGGAAG TGCACCTGAAAGTTTGTTGCTTGATGCGGACATCTGCATCAAGCTTCTGTGTCTACATATTTCTTGTGGAATATCTCCCT TTAGGTTATTGAAAGCCAGCCCGAGAGCAGTTAAGGATGAAAAATTCCCTATGAATTTTGGCACTCCTCCTGTTAAATTG TTTTTTGCAACGATAAATCTTTGAAGCTTCCAAAGAGAACCAATTTCAATTGGAATTTTTCCAATCAGTTTATTTCCCGC TAAGTATAAGCCTTTGAGACCTGAGCACCTTGTTAAGTTCATAGGAATCTCCCCTTCCAAGAAGTTATCGGTGAGATTGA GCTTCTGCAAGTGTAATAACCGACCAATCTCTTGTGTGATTTTTCCGAAGAAGTTGTTGTTGGCGAGGTTCAGGATTCTC AGGAAAGAGAGATTGCCAACATGGGAAGATATAGATCCATGCAAATCATATCCTTCTAGGTTCAACTCTGTAACTCTTTG ATGCTTGGGGCTGCATTTGATTCCATGCCAGTGACAGAAGTGGGTTGAACTATTCCAAGAGACCAATCGATCTTTGGATA TTGATTCTTTGAATTTGATCAATGCCAAATGGTCAGTATGGTTTCCTAATGTAGAGTCAGCTATTTTTGGGCCAAAGTTG AAAGTAAAGAGAAGATATAACCAAAATGAAAATGTAGGGAACATGGTACACAAAGGCTTCGAGGAACAACAAGAGGCTCG TAGGTTGTGAAATTTGAATATCATTAGTTAGATAGCTATGTATATATAGATATGCAGGTTTGATTGTTTGACTTGGAACA GAGAAGATTCTTCCCTCTGGCTGTGATACTGATTGATCTTTTTATTGTTTGTCTGATATTGATCAATTTAATTACAAGAG ATAACATATATTATGGTGTCTTAAAATTAGATTTTTAACTACATTGTATGTCTCTTCTAATGAATCAATGATTTGTAACT TGATCCTTCCATTTTGTTGTCGCTGATTTGTTAGCACTAACACCTTCACATGTAGGCAAAAGGCCAAAATAAATCTCTGG TCACTTCAACTCCATCAAACCTGTAAGTTAAGCCATTATCTAAAGTGATTGGATGTGAATTGTTATGCACGTTTCTCATT TATTTATACATGGAAAAGTTTTAACTCTAAACTTGGTCCAATTTTATCTGGTCTAAGAAGTTGGGACCTCTCTTTCATCA TCTTCCTGAGAATGGATTTGCCACTTAACCTATGTTTTAGCTGCAACAATAAAGGTGTGCCGGCAAGGATTTGTAGCTGT TTTTTTGAAAATCTTGACCATATCATATAATGTTGAGAATTGAGATAGACTAGATTTTTTTTCCATATGCATAACTTATA TATGTACATTGGCCGGTCATTCTTGAACAAAATTAATTGAATTTCTTTCATAACATGATAGTGGTATGCTTGAGATGAAA ATGTTTGAAATTTTAAATAAGATTTTAACCTTTATAACTCTTGTTTTTGTAATGCCAATGTTTTACTTGTGTGAATTTCA TTTTATGCACTCTGCAGTACATATATCATCATGGAAAATGATTTTAACCAGAATTGTCAATATAATTGTAAGGTTTGTTG GGTATTCATTCTTTAATTGTAATTGACTTGAGCAATGTCAAACAATCACGTTTCATGATGCAGACAAATACAATGAAAGA TTCAAGTGATCATAACATTGCACCTGAAGGCTTCATTTGATTCGAAGATCAGAAGGTTAAGACTTCAGAGAATCAGAGTG TGTGTATGCATTATGGATAGGGATTCTACAATGACTTGACTTTAAGATGGAGTTAATTAGGATAAAAAACGTATACTACA TGTGAACGGCCATGCCCTAAGGTTGAAAACTTTTCAATTAAAAGAAGAGGCAACAAATAATACACATTTAAACAGTTATA TTTGAAAGTGAAATTTGGGTAGCGTTTGGTGACGGAACGAAACAGGACAGAATAGAACGGAACGGGACAGAACAGGATGA CACAGGACAATAATGTTTTGTGTGTCGTGTTTGGTAACTCCAAGTCAATAGAACGGAACCATGATTTTAATTACATATAT AACCCTGCATGCTTAATATTTGATTGAGAA
CDS sequence (LotjaGi2g1v0347200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGACATACAATGGCCTTGAGAGTTGCATTTTAAACAATCAGTCTTATGAAGAAGAGAGCAGAACTAGTAGAGGAGATGG GTGTATAACTGATTCATTTGATGAAGACGATTCCAGTTGTTCCTCTAGCAAAGATGCTTCTGGATCATTCTCTTCAAATT GTTTGAGAATGAAAAGAGATGAAAAGGGATTGGAAGAATGGAAAGTCTCTCAAAGTCCTCAACGTTTTTATGCCAAAGAG AAGAAGCCTGCTTATGTCATGCAACATTCAGATATAGAAGCCATGAAGGAGAAATTTTCAAAGCTCTTGCTAGGGGAAGA TGTTACAGGAGGAACTAAGGGCCTCAGCACAGCTTTGGCTCTGTCTAATGCCATCACAAACCTTGCGGTAACGGTTTTTG GTGAGCTATGGAAATTGGAACCTTTATGTGAAGAAAGGAAGAACAAATGGCGAAGAGAAATGGAGTGGTTACTGTCTCCT ACTAACTATATGGTTGAACTTGTTCCTGCTAAGCAAATCAGTGCCAATGGTGGGAGGATCTTTGAGATTATGACCCCGAA AGCTCGTGCAGACATCCACATGAATCTTCCGGCGCTTCAGAAGTTAGACTCTATGCTTATTGAGGCTTTAGATTCTATGG TGGATACAGAGTTTTGGTATGCTGAGGGAGGAAGCCGTGCCGAAGGGAGGAACTCGAGTGCACGGCATAGCCAACGATGG TGGCTTCCATCACCCCAAGTACCAAAAAATGGCCTTTCTGATACTGAAAGATTGAGGTTGCTTCATCAGAGAAGGGTGGT GCGTCAGATATTCAAGGCTGCCAAATCTATCAATGAAAATGTGTTGCTTGAAATGCCTGTGCCAGCAATTATCAAAGATG CACTTGCAAAGTCTGGGAAGACAAACCTTGGACAGGAGTTGCACAAGGTTTTGTTGGATGAATCAAGCAATGGAGAAGAC ATGCTTAAATCCCTCAATTTGAAATCTGAACATATTGTCCTTGAGACCATTAATAGATTGGAAGCTGCTATTTTCTCATT GAAAGAAAAGATTACAGAACAAGTTAGTCGCAAATCCCCAGCTCGAACCTCATGGTCTTTTGTGAAGGACTCTCTGTCAG AAGTAGATAAAATGGGGTTATTAATGGACCGTGCAGAAACACTCTTACAGCTGCTTAAAATCAGATTCCCAAACCTTCCT CCAACATTTCTAGATGCTACTAAAGTTCAATATGGCAAGGATATTGGACATTCCATTTTGGAAGCTTACTCCAGAGTTCT TGGAAACTTAGCTTTCAGCATATTGTCTAGAATAAGAGATATATTGCAGGAGGATTCTTTTAGCAATCCCAATTCGCCTG CGGCGGCGATAAATCTCTCTGAAACTTGGGTGGTGGGTTCTCATGTAAGACACTCCTTACTTGACAAAATGAACAAGGCA AATGGACAATGTTGTGATTCTAGTTTTGATAGTACTTCAGATTTAGAACTATCTATTGATGCCAAATCCAGTGTTGAAAT AGCTACACCAAGCCGGAGTAGTGCCTGGTGTATTAGTAGAGAGGCTTGTACAAGTGTGTCTCCTCAAAATTCCCCATAG
Protein sequence (LotjaGi2g1v0347200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MTYNGLESCILNNQSYEEESRTSRGDGCITDSFDEDDSSCSSSKDASGSFSSNCLRMKRDEKGLEEWKVSQSPQRFYAKE KKPAYVMQHSDIEAMKEKFSKLLLGEDVTGGTKGLSTALALSNAITNLAVTVFGELWKLEPLCEERKNKWRREMEWLLSP TNYMVELVPAKQISANGGRIFEIMTPKARADIHMNLPALQKLDSMLIEALDSMVDTEFWYAEGGSRAEGRNSSARHSQRW WLPSPQVPKNGLSDTERLRLLHQRRVVRQIFKAAKSINENVLLEMPVPAIIKDALAKSGKTNLGQELHKVLLDESSNGED MLKSLNLKSEHIVLETINRLEAAIFSLKEKITEQVSRKSPARTSWSFVKDSLSEVDKMGLLMDRAETLLQLLKIRFPNLP PTFLDATKVQYGKDIGHSILEAYSRVLGNLAFSILSRIRDILQEDSFSNPNSPAAAINLSETWVVGSHVRHSLLDKMNKA NGQCCDSSFDSTSDLELSIDAKSSVEIATPSRSSAWCISREACTSVSPQNSP
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 2 | 517 | 516 | 2.4E-267 | – | |
| PANTHER | 2 | 517 | 516 | 2.4E-267 | ||
| MobiDBLite | 14 | 51 | 38 | - | – | |
| MobiDBLite | 19 | 41 | 23 | - | – | |
| ProSiteProfiles | 82 | 455 | 374 | 98.247 | ||
| Gene3D | 84 | 324 | 241 | 6.3E-95 | – | |
| Pfam | 90 | 448 | 359 | 2.0E-159 | ||
| Gene3D | 343 | 455 | 113 | 2.9E-15 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Rho guanyl-nucleotide exchange factor activity | Stimulates the exchange of guanyl nucleotides associated with a GTPase of the Rho family. Under normal cellular physiological conditions, the concentration of GTP is higher than that of GDP, favoring the replacement of GDP by GTP in association with the GTPase. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0347200.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…