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LotjaGi2g1v0364600.2

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0364600
Transcript ID LotjaGi2g1v0364600.2
Related isoforms 4
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description V-type proton ATPase subunit a; TAIR: AT2G28520.1 vacuolar proton ATPase A1; Swiss-Prot: sp|Q8RWZ7|VHAA1_ARATH V-type proton ATPase subunit a1; TrEMBL-Plants: tr|A0A1J7GFZ0|A0A1J7GFZ0_LUPAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0364600
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:86202587..86212456) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

TTGTTTCCCGGGAAAATGGATCACTTCATGGAAAACTTGCCGCCAATGGATCTCATGCGCTCCGAGAAGATGACCTTCGT TCAACTCATCATCCCCGCCGAGTCCGCTCACCGCGCCGTCTCCTATTTGGCCGAACTCGGCCTCCTTCAATTCCGTGACG TACGTAACTTCCCCTCTCATCTCAGATCCGAACTTCATTTTCCTTTTCTATTTCAAATTCTGTCATCTTGTTTTTCGCGC CTTTTCTGTTCTTCGTTATTGCTTCAATGCGGAAAAATGCTTGTTGATTTTAGTTCTGGAGTTTGTTGCATTGTTCGAGT TGAGTGTGAATGGTTTTGCGTTTCCCTCAAGAAATGATTCAAATGCTGCATTGTTTAATTCATGCGTTGAATTCAGGAAT CTGGTGCCAGTGCGCTGATTTGTTCATAGAATTCATTTTTGTTGTTGTTGTTGTGCTGTTGGTTTGGATTTTGGAGGTTT GGTGAACAGTGTTTGCAAAATGTGATGAAATCCAACACCTAAGTGTATTGTTAACTTTATTGAATTTAATTGTGGTTTGA GAGTAGTTTAGTTGCACTAATGGTTTGCTTAAGTTCAATGTTGTGTGTAAAATGCAGGCAACTAAGCAATATTAGATAAT TAGTTTATCGTGTTACTGATAATCCCCGTGCTCTTCGGAGGTGGGTTAGATATATTTTCTGATTGGTTCAGAGATGATGG CTAGGTTTTGGTTAACGACTTCCTACTTAGATTTCCACTCTGTTCGCTGTCTTGCATTGTGCATTGTTGCATGTAGGTTC GGATGGTTAATTTTAGAAACTTGATTATTTGGTTTCATGTTTAGATTGCGTGTCAATGTGGTATGCTGCCACTATTGATA ATGGTAAAGTCCATTGATAATTAAGGACTAAAAGGTGTCACTAATGGATGGTTGATTATTCTTTGCCCATCAGTCATGTG TTACAGGACTATATTGTTTGAGACTTATCACTCATTATACGTTATTATTACTATTGCTTTTGCCATTTGCATCTTTTTGA TTAAAATGGACCCTCTTTAGTAGTTTCTTCATTAAGTGTGACCATAAGAGTAAAAATTGATGGTGAACTATCTATAACGT AGGAGAATTGCTGTAAGTCTTGAAATTTGTGACTCTTGGGCCTAGAGTCATGGTTGAATCAGTATCTGAATATTTCAGGA TATGTGGGGTATGCAAAACCTTAGATATCTGTCATGCATTTTCACTGGGAGTGACTAAAAGTGGAGTGCTATTTAAATTT TCAAAGGAATATCTTTATTTTTGCAATATCATATACAATGCTGTCTCTTGTTACAAACGATGTTTTGGGTGGCAACTTGC AACTGCATGTTTTAGGAAATAATCAAAGTTTGCTTTAATTTTTTCTTTTACTGCCATATGTGGGCTTCAAAAAGTAAGTG ATGTATGTTTTACTTTCACCACCTCGTGGGAAAAAGCTTTGTTGTTACTTGTTATAAATCTTTGTTTTTGATGTTGGAGG TGTAAAATTCTAAGATTTTAATCACTGCATTTCTTAAGAACTCTGTTTTCTCATTTGTAGTTAAATGATGAAAAAAGCCC CTTCCAGAGAACGTTTGTCAACCAGGTAATCAACACTACACTCATTGCTAGAACTCCTGTTGCTTTTTTAATGCCCTCAA TTTTGGTACGTTTTTGGAATGGTTGCTCATTAGTGTGTGTATTTTATGTTAAGACAAATTTTACAACTGGGATTAGAAGT TCTTCTATGGGTCAATTGTGATGACACTTTGTTCTCAAATTACTAATTACAAAATAATCAACCCTGTAATTGTTTCCCGT GCATCAGATTAGTTATCCAAATACTCCCGATTTGATAGAAAAATATGGAAGAAATATGTTCAAGATTTGGAAAATAGTTT GCTTTTGATGTTTTCCTCTTTTTTATAGAATTTACACAAATTGATAACTGAATTTGGTATATAAAATATTGACATTGATG AAATTATTGGAATTTAGGTAGAACCGTAGAAGAAGTGCAAAAGAGAGATATTTGTGACCGTGGATAATATTCTCTAATGG TTTGGCTAACAAATGGAACTAACTTTCTTTATTATAATTCTGGGCTCATTTCAGAATTCTGGTTAGATAAGGAAACAAAT CATTAAATATGATGAAATATGGGAAGTTGGGAACCACTTTTGAGACGCTATTTAGATATTTAAAATATTGGGATACAATT ATGATATTAAGAGATTATTTTCTGAATATTCTAACACTTCCCCTCTTCAAGCTTGTTACAAATGAACCCTTTAAAAATGA AAAATAACAAGAGCTATTATAATGATATGACGTATTTAGTGAGAACCTTTTTTTATGTGAGAGTGAGAGGAGTAAATCCT GATCATATAGCCATACATAGATGGTCAGGACTAGAAGTTATTTTATTGGTCACATGATTATTTAAAAAAGCCACATGACA TGACTATTTAAAAAAGTACCATGACTTCATGTTTTAAGATTGGCCATTCATGGTTCGACCTAATGGGAGTCTCACATTAA ATAGACCATGCGTTTGCTACATTTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTAGGAATGTTAGAGATGTCAAAGAGATAAGTTTTGAA AGAATGGTTTGAATGACCATCAGCTTGAGGAATTGGTTGGAGTGTTGCATGGCCTAGAAAGAAGAAACTTCACTGGAATG ATAATCAACGGAAATTTCCTAACAAGTGATTACAAATAATTTTCCATTTACAATACTTACTGCGTTTTTGTTTTTTACAG GTAAAGCGATGTGCGGAAATGTCAAGAAAACTACGATTTCTCAAGGATCAGATCAGTAAAGCTGGTTTAATCTCTTCTCA TTCCATCTTGCAATCAGATATTTTCTTGGAGAATTTAGAGGTCCTTCTTTATTTTACTACTTTTTCCCTATCAATATGAT CATTGTTCCTAGGGCTTGCATTTAATATTCATGTGTCACCCAAACAGCAATAACATGATGATGTCATTTTTGGTTTTTTC AGTTTCACCAGTATATATGGGGGTTTTTACTCTTGAATCTGACATAGTTTTGTTGAATTTCTCTCAAAACAGATACATCT TGCTGAGCATGAACATGAAATAATTGAAATGAACTCCAACAGTGAGAAACTTCGGCAATCATATAATGAACTCCTGGAAT TCAAAATTGTACTGCAAAAGGTATTTTTCTTGGCTATTTGTTTGTGATTAACATATTATCTTGTTACTTTTAAATTATTA GAGGATTCCTCATGCTCTTTATTATTTTGGTTACAGTAGTTTTTCCGGCTTGAATCCAGTTAGCCAATAATGGTCTTTCT GATCATAACTTAACCTTAGTTACTGGAGTGTTTAGTTCAGCTGTTGCTCTACTGTATTTCTGATTTTAATCTATTCCGTC AAATAATAACGATTTTTGGTTCAAAATTATTAATTCAATCCTGCTCTTGAAATGTAAAATATTTCCTATTTCCTATATGC TTTCTTCATGCACCGTTCGTATCATATAAGTTTGTTGGTATATTTCAGGCATGTGGTTTTCTTGTTTCAAGTCATGGCCT TGCTGTTTCAGAAGAGAGAGAACTAGAGGAGAATGTTTACTCAAATGGAGACTATGTTGAGACACCATTTTTGTTTGAAC AGGTTCCTTGTAATATCCCTTATAGCCATAGACACTTTTCTTCTGTGAAAAGTTTAAATTCTGTCAGTAGTTTTTCAATT TTATTTTATCTTGTGAAGGCACTATGATAAATTGTTTATTTTACAGGAAATTAAGCCTGAACCATCGAATCAGTCTGGTT 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TGTCTTCTATTTGTCTTTTAACAGCTATGATTTATGTGCCAGTTGATTGTTTTTTTACCCAGTACTGTATGCACAATGTA ATATTTGTTGGTGTTTTATTTTGCCTCTTCTATTTTTTACTAATTTGAGTTGACATTAACATTGATTATTTTTATCTGTT TGTTGAGAACTCTTTTATTTATAAAAAGGAGAAGGTTAGAACTTACATACCTTAATTGCTGCTCTTCTCTTCTCTTCTGC ATTGTCTTTACTTCTTGCATCTGTGCATTATGAACACCAATGAGGTAAAGATTCATCTTACATTCAACTTTTTCACTTCA ATATGCCATCTGAGCAGTTAGCACAGGTGGTTGGGATGGGTGGATTTTGGGTAGAGTTCATAACTTCAACTATTCATGTC ATGGTAATGACTCCTTTAAGTATTACCAAATTCTAATTCAAATCATTCTGCTACTCTAGAGTTGTAGACCACCATAGCGG AAATAATCTTTTTCATCAAATGCATTTATCTGCTGTAAGCTGTCTGAGAGATGTATTAACATCTGACATTATGTCTGTTA CCATTAAAATAAAAACTGAAATGGTTATTTATTTGAACTGATTCACTTTTCTCTTAAAGTTATTTACCTTTAAATCCATG TAATCTACTCATTTGATTGCCATCTCTTGCAGTTGCACTCTTCTGTTGTGCTTTCTGTCTATACTATTTTTCTCCTTCAA AATTGTGCTAATTTGGGTATTTGTATTGTCAGAGGATGTATATATTGGAATCTTGTTTTTGGCTAGGTTTTAACTTGATG CTGTGTGATAACTTTTATCGCTCTCTACCCTTTATCAGGGATGCACATACCACTGGCTTAGTAAAATACCGAGAACCATA CCCATTCGGTGTGGATCCCAGCTGGCGTGGAAGTCGTTCAGAATTGCCTTTTCTGAACTCTCTCAAGATGAAGATGTCCA TTCTGTTCGGTGTGGTGCATATGAACTTAGGAATTATATTAAGCTATTTCAATGCTCGATTCTTTGGCAATTCACTTGAT ATAAGGTATCTCACTTTTCTAACTTCCCTCTTCTTCTATATTTTACTGTCTGAGTAGAATGCTTTAACTTACTCTTCATG TTGCTTTTAGGTACCAGTTTGTGCCGCAGATGATTTTCCTTAACAGTCTATTTGGGTATCTTTCTCTTCTCATTGTTGTC AAGTGGTGTTCTGGCTCTCAGGCAGACCTTTATCATGTAATGATTTACATGTTTTTAAGCCCCTTTGACAACCTTGGTGA GAATCAGTTGCTCTGGGGCCAAAGGCCACTTCAAGTATGGTTCTAGTTCTTTTCTTCATTGTTGCTTGATGCATGTTCTA TTTTTTGGCTTTCATCCTCCTGAATCTGTTCATCATAAGCAGGTTGTGTTATTGCTTTTGGCTGTAATTGCAGTTCCATG GATGCTCTTTCCAAAACCTTTTATACTAAAGAAGCTTCATAATGAGGTACCTCTTTTGCTCCACTTGTATATGATTTTAA ACGTCTATAATTTTATTCACCAAAGACCGAACTTCTTGATTAAATGCAAATAAATATGTCTCCGTCCATTACATAAATAT GCTTGTTCGTTTGAGCATCCCCTTTGGCCTTTATGACTACATTTCTGCTTTAGGTTACCAAACTTCAATCCTCCTAGAGA TCCATTATATGATCATTTTTCTTTGGACTAAAAAATGCTAGTTCTAAATTTTAAATTACTGACAACTTCAATTGGTTGAG CAATTTTTTTTTCTTTTCTATTCTAGCTGTAGTTTCTTTTGTATACTTTTGTTACATCTGTTTATTCACGAAGCAATGCT AAGTAGTTTGTGAAGATTATTAATCTTCTATCCTGATGTTATTATAGAGATTTCAAGGACGTACTTATGGTGTGCTTAAT ACCTCTGAGGTGGATCTTGAGACGGAACCAGATTCTGCCCGGAAACATCACGAGGAATTCAATTTTAGTGAGGTCTTTGT TCACCAAATGATTCACTCTATCGAGTTTATTCTGGGTTCTGTTTCTAATACAGCATCATATCTTCGACTATGGGCATTAA GGTTTGATCAGCCATGATTTTCCTTCATTGCCACAACTTCCTGTTTTATAAATTCTTGATTTGCTCGACTTTTTGTGACC ACTCTGCAGCTTGGCTCACTCAGAACTTTCTACTGTTTTTTATGAGAAAGTCCTGCTACTTGCTTGGGGGTAAGTTTGAT TTATAAGTTATAACCTTCATATGGCATACTTTTTATTCAACCTTCATATGGCCCCTGATGTGCATCCCATAGTAGAGGAT CTATCGTTTATAGTCAAAGTTGGATTGAATGTTCTTTGTGCAATTTCACCGAGAGCACTAAATCATTTGGCTGAGATGAA TAGTGTTCTGATATTTTTATCATTTGAAATAATGATGAAGACCCTGACAAGTGACAATAGATACAGTCAAAATATGAATA ATCATCAAATTCCTTAACTACGTTATTATTTTAAACTATAGAGTAAATTCTTTAATCGATTCTCCAAAGATTAGGGTATC ACCTGTTAAGTCTTCTAGTTTCTCCAATATTCAAGTGCTACCAAATTAATCCCTCAATGATACAAAGTTGCTACTAAATT AGTCCTGTGTATGAGGGAGGCTAATTTGGGGCCTTAAGTACTAAATAAGCTCCACTTATTTAGTGCATTTTCCCATATAC TTGAGGGACTAGTTTAGTTAAAAAATTGAAGTTATAATATGGTACGTTGGTAACACTTGAATCTTTGAGGAATTAATTAG TGACTAAAACCTCTGTCATGTCTGCATTCCTTTGTTTAGTCTTTAGGCTAAAAAATTATCCATCTATTATGTTTGCATTC TGTTGCAGCATTTATCCTTTTTAGTCTGTAATCATGTATGTCATTGTGGACTGCAATTATGACAGGTATGACAATCTTGC CATTCGGTTCGTGGGGCTAGTTGTTTTTGCTTTTGCAACTGCCTTTATACTACTTATGATGGAGACTCTGAGCGCTTTTC TTCACGCCTTGCGTCTTCACTGGGTAGAATTTCAAAATAAATTCTACCATGGTGATGGCTACAAGTTTAAGCCTCTTTCC TTTGCCTCCTTAATTGAGGATGAAGATTGA 

CDS sequence (LotjaGi2g1v0364600.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGCAGGTGGATGCACATACCACTGGCTTAGTAAAATACCGAGAACCATACCCATTCGGTGTGGATCCCAGCTGGCGTGG AAGTCGTTCAGAATTGCCTTTTCTGAACTCTCTCAAGATGAAGATGTCCATTCTGTTCGGTGTGGTGCATATGAACTTAG GAATTATATTAAGCTATTTCAATGCTCGATTCTTTGGCAATTCACTTGATATAAGGTACCAGTTTGTGCCGCAGATGATT TTCCTTAACAGTCTATTTGGGTATCTTTCTCTTCTCATTGTTGTCAAGTGGTGTTCTGGCTCTCAGGCAGACCTTTATCA TGTAATGATTTACATGTTTTTAAGCCCCTTTGACAACCTTGGTGAGAATCAGTTGCTCTGGGGCCAAAGGCCACTTCAAG TTGTGTTATTGCTTTTGGCTGTAATTGCAGTTCCATGGATGCTCTTTCCAAAACCTTTTATACTAAAGAAGCTTCATAAT GAGAGATTTCAAGGACGTACTTATGGTGTGCTTAATACCTCTGAGGTGGATCTTGAGACGGAACCAGATTCTGCCCGGAA ACATCACGAGGAATTCAATTTTAGTGAGGTCTTTGTTCACCAAATGATTCACTCTATCGAGTTTATTCTGGGTTCTGTTT CTAATACAGCATCATATCTTCGACTATGGGCATTAAGCTTGGCTCACTCAGAACTTTCTACTGTTTTTTATGAGAAAGTC CTGCTACTTGCTTGGGGGTATGACAATCTTGCCATTCGGTTCGTGGGGCTAGTTGTTTTTGCTTTTGCAACTGCCTTTAT ACTACTTATGATGGAGACTCTGAGCGCTTTTCTTCACGCCTTGCGTCTTCACTGGGTAGAATTTCAAAATAAATTCTACC ATGGTGATGGCTACAAGTTTAAGCCTCTTTCCTTTGCCTCCTTAATTGAGGATGAAGATTGA 

Protein sequence (LotjaGi2g1v0364600.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MQVDAHTTGLVKYREPYPFGVDPSWRGSRSELPFLNSLKMKMSILFGVVHMNLGIILSYFNARFFGNSLDIRYQFVPQMI FLNSLFGYLSLLIVVKWCSGSQADLYHVMIYMFLSPFDNLGENQLLWGQRPLQVVLLLLAVIAVPWMLFPKPFILKKLHN ERFQGRTYGVLNTSEVDLETEPDSARKHHEEFNFSEVFVHQMIHSIEFILGSVSNTASYLRLWALSLAHSELSTVFYEKV LLLAWGYDNLAIRFVGLVVFAFATAFILLMMETLSAFLHALRLHWVEFQNKFYHGDGYKFKPLSFASLIEDED 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 41 41 -
PANTHER 4 313 310 5.4E-206
PANTHER 4 313 310 5.4E-206
Pfam 12 305 294 1.7E-118
Phobius 42 60 19 -
TMHMM 44 66 23 -
Phobius 61 79 19 -
TMHMM 79 101 23 -
Phobius 80 97 18 -
Phobius 98 131 34 -
Phobius 132 149 18 -
TMHMM 133 155 23 -
Phobius 150 207 58 -
Phobius 208 230 23 -
Phobius 231 249 19 -
TMHMM 249 271 23 -
Phobius 250 271 22 -
Phobius 272 313 42 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Proton transmembrane transporter activity Enables the transfer of a proton from one side of a membrane to the other.
Cellular component Proton-transporting V-type ATPase, V0 domain A protein complex that forms part of a proton-transporting V-type ATPase and mediates proton transport across a membrane. The V0 complex consists of at least four different subunits (a,c,d and e); six or more c subunits form a proton-binding rotor ring.
Biological process Proton transmembrane transport The directed movement of a proton across a membrane.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0364600.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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