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LotjaGi3g1v0000400.2

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi3g1v0000400
Transcript ID LotjaGi3g1v0000400.2
Related isoforms 1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description p-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein, putative; TAIR: AT1G16800.1 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q00416|SEN1_YEAST Helicase SEN1; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0FU35|A0A0R0FU35_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0000400
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr3:72007..88123) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

GGGGTGCAAAACCCAATAGGTGGGGTGCCAAACCCAAATCCCTAATTTCCGCCATTCCCCTTGACCTGAACGGAACGTCG CATTTTGAGTATCTGAAGTGGAAACCCTACCGACACCGTTACCAACGACAATGGCGAATACTAGACGGGAGCTACTGGAC CGGTGGAGAGGCATCGAGAAAGAAGAAGAAGAAAACGCCGACGACGATAATCTTCATCCCTCTAAGCTTCGTCGCCTCCA CCTCCTCAAAGAACAATGGTTCTCACCAATTCCCCTCCCCCTTATTGTCTTCAACACTAGTAACAATCAAACTATTCTCT ATTTGTTCTAATAATCCTAGAGTTATATGTATATTAGGTTTCTGTTTAACTCTGATATTGTATTTTATTTTGAATGGAAG TTTTTTTTACTTGTTGCTGAAAGAAGTAATTTTAGAATGATCATACTTCAATCAGATAGATGTTCACTCCATTTTGTGCT TGTACATCATACTCATTCCCTCCCCCCGAATAAGCACGGGATCAAACATGGTAAACTTAAAGAATAATCAAATAACAAGT TTCACTGTGAAACATAACCATTAATCATAATCGTGACTTGTAGCGCCTCATGAAATAACCCCTTTAATTATTGTCAGGTT TGCAGATGCATATAATTTTCTAATATGTTTGCCGTGTGAAGATCATATCTGGTGTGGCTTTTGGGATATAATGGGCCCCC TTTTGGAGACCTTTTACAATTACTTCAAAGATGACCGCCAAGATTCACCTCTTAGGCGGTTATGGAAGAGAATGTCTGAT GAAATGAGGCACTGCTTGCAATGCATTTCTCAGCATCATCAAGCCCAAGACATGTATGATATGGAGTATGAGTCCAGCTC TATCGGTCCTCTTCTCGATATCTTGCAAAAGCTTGATTATGAGAGGGTGACATCACACTTGAGAGATATCAATGCTAAAG 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ATTATATCTATAATCCTAAAATTGTTCATGAAGAATAATTTAATTGAGTTCTTATTTCATTTTATCATATTGTACTTACC TGTACTTGCATATATGTGAAGGTTCAATGTTTTAGGTTATGTCACCCTAAAGATGACATAAAGGAACAGAAGACTTCCCC AGAGTTTATAGCAGTGACAATTTATGCAGGCAAAAGTTCAAAAAATTATCTAATATTTTCACCTATAAAATCCATTTTTC AGTTTACAAATGAATGCCGGATTTGTGTTTGTTGTTTGCATTTTCCCCTGAATGAGGTTTTTTTTGATTTTTATTTTTTT TCAGTGAGACCAGATCAATGAACATGGGATTAAGGAAGGAACGATTTTTCTGAGGACAAGGCTGAAGCTTCACATCTTTG TTCTGATAACCTTTTCGACTTCTCTTGGATGAAGATTTTTTGCTTCGCAGCTGCTGCTTTCCAATCGATGATCTAATGGA GAGTGGATTGTAGTTAATTGTGATATGGAGATCACCGGAAATTTTGAAGTGATTTAGTTTATTCCGGTGAATGTTGGCTA TGGATGAGGAACAATAGCTATTTGTATATATAGCGGCAGATTTGTGTAAATGCAACGAATTTTCTTCAAAGTTGGAATAA TTGTATCATTTTGTTCCTAATGATGAAAAGAATAAGTGACTGCAGATCTCCTTTTATAAACGTTTTCGATCCGTGTATTA TAAAACGGTGGCAACACAAATATATCATTGTTTTCTC 

CDS sequence (LotjaGi3g1v0000400.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGCGAATACTAGACGGGAGCTACTGGACCGGTGGAGAGGCATCGAGAAAGAAGAAGAAGAAAACGCCGACGACGATAA TCTTCATCCCTCTAAGCTTCGTCGCCTCCACCTCCTCAAAGAACAATGGTTTGCAGATGCATATAATTTTCTAATATGTT TGCCGTGTGAAGATCATATCTGGTGTGGCTTTTGGGATATAATGGGCCCCCTTTTGGAGACCTTTTACAATTACTTCAAA GATGACCGCCAAGATTCACCTCTTAGGCGGTTATGGAAGAGAATGTCTGATGAAATGAGGCACTGCTTGCAATGCATTTC TCAGCATCATCAAGCCCAAGACATGTATGATATGGAGTATGAGTCCAGCTCTATCGGTCCTCTTCTCGATATCTTGCAAA AGCTTGATTATGAGAGGGTGACATCACACTTGAGAGATATCAATGCTAAAGTAACAGGGGAAGAATATGATTCTGGTCGT GATAATGCTGAAGTTGTTAATGTCTTGTATGAGGTATTGATGTTCCCACTCCTCTTAGATTATCAGCCTCTATTCACTGA GTTTGAGTTGTTTGTTGAAGCTATTGATAATAAGCATGAACTGGTTTTGTCTGGGCATCAACAATTTCCGGGAGTGTATG CATTACTTTTTTGCAAGAGAAGTGTTCGTTCTGTTGGATATCGCTTAGCAGGGTCAATGGGAAAACTGAGGAGAGCAACG GACTTGGAACCTTTGCAGCCCTTACTTAAGAAATTTATTGGCAGTTTAGAGGCAGATGCTTTACCACTGGATTTGGAGAC TTCACCTAGAATTCAGCTGGATCGTGTGTCTTCATGGATTGGTATCAAATCACTACTTGGCTTCTTGGATCCTCCAACTT TTGAAGAAGGGATATTGGAACGTTATCCCTTTTTTCTTGATATTGTACTCAATCATATCAGTGGTGATTCACTTGAATTT TCACATGCTGTTACTTGCTTGAGACAACTTTTCGAAATGCTAGGTTGTAAGCTTTGGTTAAGGTCTACATTGTCTCCAAG TGTAATGCACAACACTCTAATTGGTCAATGCTTCCATACTCGCAACGAGAAAATCCATAAAGATATTTTTGGTCTATTCC AACCTTTTCTACAGTCTCTTGAAGCTTTGCAAGACGGGGAGCATGAAAAGCAACGTAGGCATTTTCTCTATTTTCTCCTC CATCAAGTGCCAGTGAGCAGTAACTTCAGCATTCTAACAAGAAAATTGGCATGTCAGATAGCACTTCTTGTTGTACACCG AGGTTACAAGATGAACCCGCCCTGCCCTCCTTTTGAGTGTGCACATATGTGGGGGCCTTCCCTTGTTTCATCTCTGAAGG ACTCCTCGCTTCACAGTTCTCTCAGGCAACCTGCTTTTGACCTTGTAGAGACTATCATAGTATCAGATGCTACTGCTTTA ATATATTCAGTGCTGAATTGCGGCACAGCTTCAAGCACTGTTAGTAGCATGACATATGAGGTCATTGATTTGGATAATGA AAATGATATTTGGTTACCAAATATTCTTCTAGATGGTGAAGAGCAGGATAGTAGTACTAATAGTTCTTGGAGTCAATTCA GTATGCAGAGTGGGATAACTTCTCAAGTCTTCCGAGAGTGGATGTGCATTCCAATGTTATGGGTTGATGTTTTAGTTGAT ACCAATCTCTCACTCCTTCCAATCTCAGTTTCGAAAGCTGTTTTCTGGGCACGATCTCATTTTCCTATGGTAGAACTTGA GAGTAGTGCAGAAATGGTGCTTCCTGTCATGTCTTGCCTTTCATCTTTTGCTGCAGAATTATCCTCTTCATTTGGGTGGA AGGTTCCAACTGGCTCTGATGATGGTGGAGATGGAAACAAATCAAAAAACTCAGTTGAAGTGTTGACTATGTCTTGTCCT TTGATAAGAACATTTAAAAGGTTAACAACACATTTTCTAGTTCAGATGAGACAAGGAGAGCTTCGAAGTCGGTGGATTTG GGAACCACTGATGAGTGAGAGCTTGATCCTTTCGCTTTTGGATCCGAACGATGATGTTAGACAATTTGGAAAGTCTATGT TGGAACAAGTGTCAGATACCCGAGGTCTTTCATGTGGATTGCAGTTTCTTTGTTCTAACAAGTCCTCGTTGTATGCAACT ACTTTGGGCTTCAAACATGCTATGAAACTGGTTCAACTGGATTCTGTTCTATTGAAATTTCATACTCTACATCATTTTTG GTTTCTTTTATGCAAATTACTCAAAGACGGAGGTCTACCTGCTCCAGAGTTGCCTGAAAATACACCTAGTGAGTTAAGGG TGCCTAGATTCTCTTCACAAGGCGGGTTTCTGAAGCAGCCAGATTTTGATTCTCTGCCTGTGGATATCGATAAACATGTT ATCGATGTCGAATTGAAAACAAAGGAAAAATTTAGTTGCTTACTATCTGAAATGGCATGGCCTATTTTCTGTAGGTGCCT GGTAAAAGGCAAGGAATTTATTGATTACAATCTTTGCCAGATGACTTGTGTTAGGTTACTTGAGATTTTTCCTGTTCTTG TTGATCAACTCCACCTTTTTGGTGGTAAAGATCCGGGGAATTTCACAATGCTGGTAAAAAATAAATTGGGTTTCAAATGG CTTCATGATCTCATGGAATGGGGGAAGTCATCACTTAAAGTTGTAATTGTTTACTGGAAGCGAGCCATTACTTATTTACT GAATCTGTTTAAAAGTTCTTATGATAAGACTTCTCTGTCAACAATCATGATCATTGAAAATCTTATTTCGACTGATGCTT ACAGCTTGGAGGAATTGACAGAACAAGTGTCTGGCCTGTCTGTCTCTCTGTCTAGGGAAGGCACTCATAATTTTCAGGAG GCAAATGTGAATCCCAAATCATTGATATCTGAAAGCTGGCCTATTAAAAAGAACTGTTTTACTTCACATATCCATTCTTC ATCCATGGAGGATATAGGTGTACAAATTGTGGACTCGAAAATGACACCTGACGAAAAGGATACTGAAACTGTAATTATTC TTTCGGATGATGAAGTGGAACCACAAGATCTTTCCAAGAAGGTCATTTTATCAGTTAGTGAGGCAGGCCACCACATATCT GATGGCAATAAAATACCCTGTTATGCTGGTAATACTTTACCAACTCCTGACCTTGCTATCCAGAATGTTTCTTACAAGAA AACTTCCAATGAAATGAAGGAGACCTTCCAGAGAAAGGACAATACTGAAGTTTTCAGCCTTTCTTCTCAGAAACAAGACT CTAGGTATGTACATGATAAGCTTGAGGCCACTTCATTTGTTGATTCAGAAGGCTCAGACAGTTGTAGGGGGGAAGCTAGC TCAAAATCCAAGGTTAGGATCAATTTGGCAAAAAATTCTTCCGAAGCTGTCAATGCTAAAAATTTGAGTAAAGCTTGCAG GAGTACAACTTCCAAAACTGCTGACACTATGTCAAGTACTGGTTATAAACAGTTAAGCGATTCTCAGAATTCTGAAGATG ATCTGCTAAAGACTGCATTTAAATCTGTGGAACGTATCCAGTTGCATGTACCAAAGCCTACTTCAGTCTTGAGAAGACAG GTGATTCAACTCAGAACACCTCTTGAAAACAGATCTGGAGGTCTCCATAAATTAGAGGACCCAGTGAAAAGATTCAAGCC ACCAAGGTTGGATGATTGGTATAAACCTATTCTTGAAATTGATTATTTTGCGACAGCTGGATTGTCATCTGCAAGAAAAG ATGAAAACAAAATTGTTAACAAATTAAAGGAAGTTCCTGTATATTTTCCATCACCTGAACAGTACGTGGATATATTTCGG CCATTGGTTTTGGAGGAGTTTAAAGCACAGTTACAAAATTCTTTTTTTGAATTGTCTTCATGGGAGGAGATGTTTTATGG AATCCTTTCTGTGATTTCAGTGGAGAGAGTTGATGATTTCCATCTTGTTCGTTTTGTCCACGATGATGGTGATTCAGCAA CATGCAGGAGCTTTTCAGAAAATGACTTGCTTTTGCTAACAAAAGATCATCCACAAAAATCTTCTCATGATGTTCATATG GTTGGAAAGGTGGAAAGGCGTGAGAAAGACTATAAAAGAAGTTTAAGTATTGTTCTCATCCGGTTCTATTTTCAAAATGG TTCCTCACGTTTAAATCTAGCTAGAAGGAATCTCACTGAACGAAGTAAATGGCATGCATATCGTTTAATGAACATTACTC CACAAATTCGAGAATTTCATGCATTGTCGTCAGTAAAATACATTCCCTTGCTTCCACTCATTTTAAACCCTACCAAGGAT TCCTCTTGTCTTGATGAATGCAAAAAAATAGATCTCAGTAAATTGTGCCAGTCATTGCAGCGGACTCTGAGATCATCATT TAATGTTAGTCAACTTGAAGCAATAAGTGATGCTATTGGAAGGGCTAAACCAAAGAAAACTGTTGAGTTATCTCTTATTC AGGGTCCTCCAGGAACTGGGAAGACGCAGACTATTGTTGCGATTGTCAGTGCCCTTCTAGCTTCTTCTCCACAAAAGATG AATTGTCTACAAAATTCCTTAAATGAAAACTTAAACCAAAATTCTTTTTCTACTACCTATTCGAGACCAAAGATTAGCCA GAGTGGTGCCATTGCAAGGGCATGGCAGGATGCAGCCTTGGCTAGACAATTAAATGATGATCTCCAGAGTTCATCAAAAT CTTCTGAAAATTGTATGAGACAAAGAGTGCTTATCTGTGCTCAATCTAATGCTGCTGTGGATGAATTGGTATCAAGAATT TCTAGCCATGGTCTTTATGGAAGTAACGGGAAAATGTACAAGCCTTATATTGTGAGGGTTGGAAATGCAAAAACAGTCCA TCCAAATTCTCTGCCATTCTTTATTGACACACTTGTTGACCAACGTGTAGCAGAAGAGAGGATGCATTCAAATGATGGGA AGAATGATTTGAGGATAGATTCATCAGCGGGGCTGCGGTCTAATTTGGAGAAACTCGTTAATTCTATTAGGTTGTATGAA GCCAAGCGTGCTAACGTAAGGGATGGGAATTCTAATGTTAAAAGTCAACCACATGGCGACTCTCATATGGGGCATGAAAA GGAGATGTCTGATGCAGAAATTGAAATGAAGCTGCGTAAACTATATGAACAGAAAAGACAAATATATAAAGATCTTAGTA ATGTGCAGGCTCAGGAGAAGAAAGCCAATGAAGAAACCAAGTCTCTGAAGACTAAGTTGCGGAAGTCTATTCTAAGGGAA GCTGAAATAGTGGTAACTACACTAAGTGGATGTGGTGGGGACCTTTATGGAGTTTGCTCGGAGAGAATTTTAAGCTCCAA GTTTCGGGGTTCATCTGAACATACCCTCTTTGATGCTGTTATAATTGATGAAGCTGCTCAAGCTCTTGAGCCAGCTACTT TGATTCCTCTTCAGCTTTTAAAATCAAGTGGAACCAAATGCATTATGGTTGGTGACCCAAAGCAGCTTCCTGCAACTGTA CTATCAAATGTTGCAAGTAAATTTCTTTATGAGTGCAGCATGTTTGAACGTTTACAAAGGGCTGGGCATCCTGTTATTAT GCTCACTGAACAGTATAGAATGCATCCAGAGATATGCAAGTTTCCTTCGTTGCATTTCTATGACAACAAGTTACTAAATG GCTGCCAAACTTCTAGCAAATCAGCACCATTTCATCAGACCAAGGGTCTCGGGCCTTATGTATTCTATGATATTACTGAT GGGCGGGAGGTTCGTGGGAAAAACTCAGGTGCAATGTCACTTTGTAATGATCAAGAAGCTGATGCTGCAGTTGAATTACT AAGTTTTCTCAAGAAAAGGTACCCAACTGAATTTATTGGTGGAAGAATTGGCATTATTACTCCATACAAGCGTCAACTTT CTCTTCTGCGATCTCGTTTTCTTAATGCATTTGGATCTTCAAGCATAGATGACATCGAATTTAACACTGTGGATGGTTTC CAAGGAAGGGAGGTGGATATATTGCTACTTTCTACTGTAAGAGCAACGCATGCTAGCATCGCTGCATCTAAAAGCAACTC AAGTTCTATTGGATTTGTGGCGGATATAAGACGGATGAATGTTGCTTTGACAAGGGCCAGGCTATCACTTTGGATTTTGG GTAATGCAAGAACTTTACAGACAGACCATAACTGGGCTGCTCTTGTTAAGGATGCTAAAGAAAGAAACTTGGTCATGACG GCTAAGATGCCTTATCATTCAATATTTGAAACAGCTAAAGATAAGTGTGTTTTTGAAAATTCTGATAATCATGCTAGACC ACTGAAGCATGAAAAGGTTAAAGATAGTGGCCACAAGGTGACACAGGTTTTGGTTAATGACAATGGTACCTTTGAGAGGA AAAAGAAATCTGCTGCTTCTAAAGTAAAGGACAAAAATAAGGGCAGTGAGGAAGAAAATACCATTTCAGCTTTGGTAAAA AGTGCTCAATGTAACGAAAAAAATTCCAAAGATGAGCATGTCTCCAAAAAGAAGGATACGACATGTCTAGCTGCAAAACG TGAAAGCAGAAGCTCCTGTGATGGTGCGGTCACAATGTTAGATCAACCAGTTTGCAATGGTGGACGAGAAGGCAAACATA AAGTTAAGACTAACATGGGAAGGACAACATTGAATAAAAGACAATCAAATTCAAGGAATAGTTTTGATCATCCAGTGGAA GAGACAGATGGTGGAGAAAAGGCATCAAAACTTCCCAGAGGGGATAGGAGCAGTTCTACGGAAGTTTCTGCTTCCGCAAT AAAAGGATGTCATAAAGAGAGAGATGCAGATAGTCAAGGTAGAGCTCCTAATCACAATAAAGCTGCTGAAATTTCAAAAA GGAAACAACAGCGTGAAGCTGTTGATGCTATTCTTTACTCATCTTTGATATCTACAAAGAAGGATGAGAGATCGACAAAA GTTTCTGTGAAAAGGCCTGTTTCATCATCTGTAGCAAATGCGAGCATGAAACCAACCAAGAAAAGAAGTGGTTCAATGTT TTAG 

Protein sequence (LotjaGi3g1v0000400.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MANTRRELLDRWRGIEKEEEENADDDNLHPSKLRRLHLLKEQWFADAYNFLICLPCEDHIWCGFWDIMGPLLETFYNYFK DDRQDSPLRRLWKRMSDEMRHCLQCISQHHQAQDMYDMEYESSSIGPLLDILQKLDYERVTSHLRDINAKVTGEEYDSGR DNAEVVNVLYEVLMFPLLLDYQPLFTEFELFVEAIDNKHELVLSGHQQFPGVYALLFCKRSVRSVGYRLAGSMGKLRRAT DLEPLQPLLKKFIGSLEADALPLDLETSPRIQLDRVSSWIGIKSLLGFLDPPTFEEGILERYPFFLDIVLNHISGDSLEF SHAVTCLRQLFEMLGCKLWLRSTLSPSVMHNTLIGQCFHTRNEKIHKDIFGLFQPFLQSLEALQDGEHEKQRRHFLYFLL HQVPVSSNFSILTRKLACQIALLVVHRGYKMNPPCPPFECAHMWGPSLVSSLKDSSLHSSLRQPAFDLVETIIVSDATAL IYSVLNCGTASSTVSSMTYEVIDLDNENDIWLPNILLDGEEQDSSTNSSWSQFSMQSGITSQVFREWMCIPMLWVDVLVD TNLSLLPISVSKAVFWARSHFPMVELESSAEMVLPVMSCLSSFAAELSSSFGWKVPTGSDDGGDGNKSKNSVEVLTMSCP LIRTFKRLTTHFLVQMRQGELRSRWIWEPLMSESLILSLLDPNDDVRQFGKSMLEQVSDTRGLSCGLQFLCSNKSSLYAT TLGFKHAMKLVQLDSVLLKFHTLHHFWFLLCKLLKDGGLPAPELPENTPSELRVPRFSSQGGFLKQPDFDSLPVDIDKHV IDVELKTKEKFSCLLSEMAWPIFCRCLVKGKEFIDYNLCQMTCVRLLEIFPVLVDQLHLFGGKDPGNFTMLVKNKLGFKW LHDLMEWGKSSLKVVIVYWKRAITYLLNLFKSSYDKTSLSTIMIIENLISTDAYSLEELTEQVSGLSVSLSREGTHNFQE ANVNPKSLISESWPIKKNCFTSHIHSSSMEDIGVQIVDSKMTPDEKDTETVIILSDDEVEPQDLSKKVILSVSEAGHHIS DGNKIPCYAGNTLPTPDLAIQNVSYKKTSNEMKETFQRKDNTEVFSLSSQKQDSRYVHDKLEATSFVDSEGSDSCRGEAS SKSKVRINLAKNSSEAVNAKNLSKACRSTTSKTADTMSSTGYKQLSDSQNSEDDLLKTAFKSVERIQLHVPKPTSVLRRQ VIQLRTPLENRSGGLHKLEDPVKRFKPPRLDDWYKPILEIDYFATAGLSSARKDENKIVNKLKEVPVYFPSPEQYVDIFR PLVLEEFKAQLQNSFFELSSWEEMFYGILSVISVERVDDFHLVRFVHDDGDSATCRSFSENDLLLLTKDHPQKSSHDVHM VGKVERREKDYKRSLSIVLIRFYFQNGSSRLNLARRNLTERSKWHAYRLMNITPQIREFHALSSVKYIPLLPLILNPTKD SSCLDECKKIDLSKLCQSLQRTLRSSFNVSQLEAISDAIGRAKPKKTVELSLIQGPPGTGKTQTIVAIVSALLASSPQKM NCLQNSLNENLNQNSFSTTYSRPKISQSGAIARAWQDAALARQLNDDLQSSSKSSENCMRQRVLICAQSNAAVDELVSRI SSHGLYGSNGKMYKPYIVRVGNAKTVHPNSLPFFIDTLVDQRVAEERMHSNDGKNDLRIDSSAGLRSNLEKLVNSIRLYE AKRANVRDGNSNVKSQPHGDSHMGHEKEMSDAEIEMKLRKLYEQKRQIYKDLSNVQAQEKKANEETKSLKTKLRKSILRE AEIVVTTLSGCGGDLYGVCSERILSSKFRGSSEHTLFDAVIIDEAAQALEPATLIPLQLLKSSGTKCIMVGDPKQLPATV LSNVASKFLYECSMFERLQRAGHPVIMLTEQYRMHPEICKFPSLHFYDNKLLNGCQTSSKSAPFHQTKGLGPYVFYDITD GREVRGKNSGAMSLCNDQEADAAVELLSFLKKRYPTEFIGGRIGIITPYKRQLSLLRSRFLNAFGSSSIDDIEFNTVDGF QGREVDILLLSTVRATHASIAASKSNSSSIGFVADIRRMNVALTRARLSLWILGNARTLQTDHNWAALVKDAKERNLVMT AKMPYHSIFETAKDKCVFENSDNHARPLKHEKVKDSGHKVTQVLVNDNGTFERKKKSAASKVKDKNKGSEEENTISALVK SAQCNEKNSKDEHVSKKKDTTCLAAKRESRSSCDGAVTMLDQPVCNGGREGKHKVKTNMGRTTLNKRQSNSRNSFDHPVE ETDGGEKASKLPRGDRSSSTEVSASAIKGCHKERDADSQGRAPNHNKAAEISKRKQQREAVDAILYSSLISTKKDERSTK VSVKRPVSSSVANASMKPTKKRSGSMF 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 664 2178 1515 4.8E-205
PANTHER 664 2178 1515 4.8E-205
MobiDBLite 1148 1168 21 -
SUPERFAMILY 1464 2078 615 9.53E-65
Pfam 1467 1842 376 1.8E-63
CDD 1467 1873 407 5.87031E-76
MobiDBLite 1686 1707 22 -
Coils 1718 1752 35 -
Pfam 1850 2056 207 4.3E-59
Gene3D 1872 2088 217 6.9E-52
CDD 1874 2073 200 2.69042E-61
MobiDBLite 2128 2347 220 -
MobiDBLite 2129 2151 23 -
MobiDBLite 2165 2185 21 -
MobiDBLite 2233 2254 22 -
MobiDBLite 2267 2300 34 -
MobiDBLite 2323 2347 25 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

Unable to find any GO terms for the transcript with the identifier.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi3g1v0000400.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…