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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0014700 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0014700.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | N-alpha-acetyltransferase 16, NatA auxiliary subunit; TAIR: AT1G80410.1 tetratricopeptide repeat (TPR)-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q9BXJ9|NAA15_HUMAN N-alpha-acetyltransferase 15, NatA auxiliary subunit; TrEMBL-Plants: tr|A0A072VDQ9|A0A072VDQ9_MEDTR Amino-terminal acetyltransferase, putative; Found in the gene: LotjaGi3g1v0014700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:1548402..1566203) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AAAAAAAGAAATTGTGTTAGGAATTGATGGATGGAATCTTGGCACACACAAATTCAATTGTGAAATATTCATTCCTTTCT TCTAGTTGACAGTAGGGTTGTCCTTACAGAAGCTCACAAAAACAAAACCCAAAACAAAAACGCCATCCATCCACAACTCA ACACAACACAACACAACCAGAACTAGTAGAACTAGTATAAACTCACCGCAACTCGTTTCTCTTTCTTTCTTTCTCTCTAA ACACTTCCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCGACGACGTCGACAATGGGTGCTTCTCTTCCTCCAAAGGAAGCCAAC CTCTTCAAGCTTATTGTTGTAAGCTCCGATTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCTTCGATTGCTTCACCCTCAAA AACCCTAGATTCTCCTGATTCTCGCTACTTTCTTCACACTTTGTTTGATTGATTCATTGCTCGCTCACAATCCATTAATT AGTTTATACAAACACACAGTTCTACACATTGAGGTTTTAGCTATGTGGTTTTAGCGTTGTGTTACTCTGATTGGTGTTGT GTTACTGTTAATTGCATTCGTTTTATTCTATGTTGTTTTTGTAATTGCAACTATTGGAAGCAGGAAGGAAGGTTGATATG TCTTCCTTGACTGCTTCCCCATGTCAAAACCCTAGATTCTCTCCTTATTTTGGTCACTTTGTCACCTTTGTTTGATTGCC GACAATCCAGTAATTAAGTTAGCTTTACTGTGATTGGTGAGGTCCACCGTTATTCTAGGAATCAGGGCGGGGTTGAAAGC TCGTGAGCTCGGGAGTTTGAGTTAATTGCATTTTTTGTATTATTTGTTGCTGTTTTGTTTCTTGTAAATGCAACTCTAGG AAGCAGGAAAGATGTTTGAAATGTTGTCACTCTGCAAATTTTAAGAGTTCTGGTTATATATTTTATTGATTTGCAAGTAG 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GGTTGAATTTTTTGTTCGTTCACCCCCTTTTTCTTGAGGGATGTTAGAGAGCAGGCTCAATGGATTTGCATCATCACCAT TGAGGTAGCCGGGAGAGCTACAGATAGTTTATGTTGCTGGTACTGCATGTGGCCAGCATATATACACAGAGAGCGTGTTG TACTTCTCTTACTTGTTGGCTTATTTATCATGTATAAATATTAAACTATGAAAATTTTGCTTTAGATTTGATGCATTGTG TGAATCCTGCGGTTGAATTCTAGCCAATTGTAAACGAACGCAATTCGGTAGAGTTTTTAACTACAAGTGTACAAAAGTTT AACAATTCAAAGATTGATTAATTTAGGACTTTAGGGGTAGTTAATAAAGCCTTTTCTTTAAAATTTATAATAATAAAAGG ATTAAATTATGATGTGTCTAACTTTTTGCTTTTCCAATTTTTCTGTTGTAACTGGAAACATGCAAATGTACTATCGTTCA ATTACATGTTTTTCTAAGAGATGTAAATTAAGTTTTAACATG
CDS sequence (LotjaGi3g1v0014700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGGTGCTTCTCTTCCTCCAAAGGAAGCCAACCTCTTCAAGCTTATTGTTAAATCCTATGAATCCAAACAATATAAGAA GGGCCTCAAAGCAGCCGATACGATTTTGAGGAAATTTCCAGACCATGGAGAAACTTTATCGATGAAGGGTTTGACATTAA ATTGTATGGATCGTAAACCTGAGGCATATGAACTGGTTCGGCAAGGATTAAAGAATGATCTGAAAAGTCATGTTTGCTGG CATGTTTTTGGTCTCCTTTATCGGTCAGACAGAGATTATAGGGAAGCGATCAAGTGCTACCGTAATGCACTGAAAATTGA TCCAGACAATATTGAAATCTTACGAGACCTGTCGCTCTTACAGGCTCAAATGCGAGATTTAACTGGCTTTGTTGAGACAC GGCAACAGCTTCTGACTCTCAAGCCAAACCATCGCATGAATTGGATTGGCTTTGCTGTTTCACATCATCTGAACTCTAAT GCATCAAAGGCTATTGAAATTCTTGAAGCGTATGAAGGGACAGTAGAAGATGATTATCCTCCACAAAATGAACGGTGTGA GCATGGGGAAATGCTTTTATATAAGATCTCTTTGTTAGAGGAATGTGGTTTCTTTGAGAGAGCTCTTGAGGAGTTGCAGA AGAATGAGTCAAAAATTGTTGATAAGCTTGGATATAAAGAACAAGAGGTTTCACTTTTTGTGAACCTTGGTCGCTTAGAA GAAGGCGAGAAATTGTACCAGGCATTACTTGCCATGAATCCTGACAATTATAGTTATTATGAAGGCCTCCAAAAGTGTGT TGGGTTATATTCAGAAGATGGCCATTTTGCTCCTGATGAGATAGATCGGTTAGATGCCTTGTACAAAACACTTGGGCAGC AATTTAAGTGGTCTTCTGCTGTTAAGAGAATACCACTGGATTTTCTACAAGGTGATAGATTTCGAGAAGCAGCTGATAGT TATATGAGACCTCTCCTTACTAAGGGAGTTCCATCTCTATTCTCTGATCTTTCTTCTTTGTACGATCACCCTGGGAAGGC AAACATTTTGGAACAACTTATTCTTGAGTTAGAGAATTCAATTAGGACTACTGGTACATACCCTGGGAGGGTGGAAAAAG AGCCCCCTTCAACTCTTATGTGGATTTTGTTCTTGTTGTCTCAGCATTATGACAGGCGGAGTCAATATGAAATTGCTCTT TCTAAAATCAATGAGGCTATTGAACACACACCTACCGTCATTGATCTATATTCTGTCAAGAGTAGGATACTGAAGCATGC TGGTGACTTGGCTGCTGCTGCTGCATTTGCAGATGAAGCTAGATGCATGGATCTTTCAGATCGCTATGTTAATAGTGAAT GCGTTAAACGCATGCTGCAAGCTGATCAGGTGGTTTTGGCAGAAAAAACTGCTGTGTTATTCACAAAAGAAGGGGATCAG CACAACAACCTGCATGACATGCAGTGCATGTGGTATGAGCTTGCCTCTGCTGAAAGCTATTTCCGCCAAGGTGATCTTGG ACTGGCTCTCAAGAAATTTTTAGCAGTGGAGAAACATTATACAGATATTACTGAAGATCAATTTGATTTTCATTCATATT GCTTAAGGAAAATGACATTGCGTACGTATGTGGAGATGCTTAAATTTCAAGACCGGTTGCATTCACATGTATATTTTCAT AAAGCCGCTGTTGGTGCTATCAGATGTTACATAAAATTGCACGATTCTCCTCCAAAGTCTACAGCTGAGGAAGATGATGA TATGTCTAAGTTGCTTCCATCTCAGAAAAAGAAATTGAGGCAAAAACAGAGAAAGGCGGAAGCAAGAGCTAAGAAAGAGG CAGAAGAAAAGAATGAAGAATCAAGTGCCAGTGGGATATCAAAGTCTGGGAAACGACAGGCAAAACCTGTTGATCCAGAT CCACGTGGGGAAAAATTGTTGCAGGTTGAAGACCCACTGTTGGAAGCTACAAAGTACTTGAAGTTGCTGCAGAAGAATTC ACCTGATTCATTGGAGACACACTTGCTCTCTTTTGAATTACATATGAGAAGACAGAAAATTTTGCTAGCCTTCCAGGCTG TAAAGCAGTTACTGAGGTTGGATGCCGAACACCCTGATTCTCATCGCTGCTTGATTAAATTCTTCCATAAAGTGGGATCC CTAAACACTCCTGTGAATGACAGCGAGAAGCTCGTCTGGAGCGTCGTGGAAGCTGAACGCCAAACTATTAGTCAGTTGCA GGGGAAATCTCTGTTTGAGACAAATAAGTCATTCCTTGAAAAATATGAAGATTCTTTGATGCATAGAGCTGCTTTTGGAG AAATGATGTACGTTTTAGATCCCAGCAGAAGGTCTGAGGCTGTCAAGATTATTGAAGGGTCAACCAATAGCCCTGTGTCA AGAAATGGCACAATCGGACTGGTCAAGGATTGGAAACTAGAAGATTGTATTGAAGTTCATAAACTTCTTGGAACCGTCCT TGTTGATAAGGATGCGGCATTGAGATGGAAAGTACGGTGTGCTGAAATTTTCCCGTACTCTGTATACTTTGAGGGTCGTC ACAGTTCTGCCTCTCCCAACTCCGCTCTCAATCAGATATGCAAGAAAAGCTTTGAAAATGGAAGTTCTAGCCATTCGGTA GGTAATTGCAAAGTGGAATCTATTACATCAAATGGGAAGCTAGATACATTTAAAGATCTCACTATTTGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0014700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MGASLPPKEANLFKLIVKSYESKQYKKGLKAADTILRKFPDHGETLSMKGLTLNCMDRKPEAYELVRQGLKNDLKSHVCW HVFGLLYRSDRDYREAIKCYRNALKIDPDNIEILRDLSLLQAQMRDLTGFVETRQQLLTLKPNHRMNWIGFAVSHHLNSN ASKAIEILEAYEGTVEDDYPPQNERCEHGEMLLYKISLLEECGFFERALEELQKNESKIVDKLGYKEQEVSLFVNLGRLE EGEKLYQALLAMNPDNYSYYEGLQKCVGLYSEDGHFAPDEIDRLDALYKTLGQQFKWSSAVKRIPLDFLQGDRFREAADS YMRPLLTKGVPSLFSDLSSLYDHPGKANILEQLILELENSIRTTGTYPGRVEKEPPSTLMWILFLLSQHYDRRSQYEIAL SKINEAIEHTPTVIDLYSVKSRILKHAGDLAAAAAFADEARCMDLSDRYVNSECVKRMLQADQVVLAEKTAVLFTKEGDQ HNNLHDMQCMWYELASAESYFRQGDLGLALKKFLAVEKHYTDITEDQFDFHSYCLRKMTLRTYVEMLKFQDRLHSHVYFH KAAVGAIRCYIKLHDSPPKSTAEEDDDMSKLLPSQKKKLRQKQRKAEARAKKEAEEKNEESSASGISKSGKRQAKPVDPD PRGEKLLQVEDPLLEATKYLKLLQKNSPDSLETHLLSFELHMRRQKILLAFQAVKQLLRLDAEHPDSHRCLIKFFHKVGS LNTPVNDSEKLVWSVVEAERQTISQLQGKSLFETNKSFLEKYEDSLMHRAAFGEMMYVLDPSRRSEAVKIIEGSTNSPVS RNGTIGLVKDWKLEDCIEVHKLLGTVLVDKDAALRWKVRCAEIFPYSVYFEGRHSSASPNSALNQICKKSFENGSSSHSV GNCKVESITSNGKLDTFKDLTI
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PIRSF | 1 | 818 | 818 | 0.0 | ||
| PANTHER | 1 | 897 | 897 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1 | 897 | 897 | 0.0 | – | |
| Gene3D | 2 | 503 | 502 | 9.5E-218 | – | |
| ProSiteProfiles | 9 | 144 | 136 | 17.513 | ||
| SUPERFAMILY | 21 | 263 | 243 | 3.13E-20 | ||
| SMART | 43 | 76 | 34 | 220.0 | ||
| SMART | 77 | 110 | 34 | 1.6E-5 | ||
| ProSiteProfiles | 77 | 110 | 34 | 11.948 | ||
| Pfam | 84 | 123 | 40 | 2.7E-7 | – | |
| ProSiteProfiles | 111 | 144 | 34 | 5.723 | ||
| Pfam | 187 | 696 | 510 | 6.9E-198 | ||
| Coils | 195 | 215 | 21 | - | – | |
| ProSiteProfiles | 223 | 256 | 34 | 5.576 | ||
| SUPERFAMILY | 233 | 450 | 218 | 7.97E-9 | ||
| ProSiteProfiles | 380 | 447 | 68 | 7.644 | ||
| ProSiteProfiles | 380 | 413 | 34 | 6.874 | ||
| SMART | 380 | 413 | 34 | 180.0 | ||
| Gene3D | 505 | 726 | 222 | 1.1E-74 | – | |
| MobiDBLite | 577 | 594 | 18 | - | – | |
| MobiDBLite | 577 | 645 | 69 | - | – | |
| Coils | 596 | 620 | 25 | - | – | |
| MobiDBLite | 606 | 622 | 17 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0014700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…