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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0126900 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0126900.1 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Callose synthase; TAIR: AT1G05570.1 callose synthase 1; Swiss-Prot: sp|Q9AUE0|CALS1_ARATH Callose synthase 1; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0ISM0|A0A0R0ISM0_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0126900 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:15588416..15625572) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CACAGTTCTCTTTCTTTTTCTAAAATGTTTCTTTACTGACTAGAAACCACACAGAACCTCATGTTCATGACGTGGCCTTC TCTAATTGGTGCAACTTTACCCGCTAAAAGGGCATTGACTTGAAACAACGCATCTCAGTTTACTTACACTGCTCTCTCTC TTCACTGCTTTGCAACACAACACTCACCATCCATCAGCTATTGCTCTTCCATTTCACTCTCTCTCTGTCTCTCACACTTT CTAACACCCATGTGAGTTTCTTTCTTCGATTTGTACTTCGTTTCTCTTTCTATCTTGTTTCAATTTTTTATCCTTCACTG AGCTTTATCTTTTCCCCTTTTTTTTTAACCTATTATTAATAATTGAGTGGTAAACTTGATCTTTCATATGCTTAGATGCC CATCACTTGATTCATGTAAAAATTGAATCTTTTTACTTTTTTGCATGATGGGTTGGTCTCAGGTTGAGGGAAACTGAAGA AATTTTATTGCTTGATTGGTTTTTCTTTCAGATTTGGAACAGAGTTTCATCCATTGGCCATAGCTTTCTGATTGAGCTGC ATAACCAAGTTTGATTTCTGTTTCTTTTGGTTCATGGTAATGGAAATAGATTGATATAACAAAAGTTGTGGAAGGTCAGT TTTCAGATTTGCTTTAATTTTTCCTATGGTTGTTATCTTTTTTCTTTTTTTCTGAATTTATTTGCTTTTTGATGCTTCAA TTTGATATAGATTGATAAATAGAGGTGGCAAGATGTCTTATAGAAGGGGGTCTGATCAGCCGCCGCGGAGGCAGATACTG CGGACACAGACTGCTGGGCATTTAGGATCAGACCCGGTCTTGGACAGTGAAGTGGTGCCTTCCTCACTAGTTGAGATAGC TCCCATTCTCCGTGTTGCTAATGAAGTTGAAGCTAGCAATAAAAGAGTTGCTTATCTATGTAAGTAACTATTGTGTGTGT 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TGGCATAAATGGATAAGCAACCGTGGCGGTATCGGTGTGTCTCCTGAAAGAAGTTGGGAATCCTGGTGGGAAAAGGAACA TGAGCATCTCCAGCACTCCGGAATACGTGGTACTGCTACTGAGATAATACTAGCCCTCCGCTTCTTCATATATCAATATG GACTTGTGTATCACCTTTCAATCACTGATTCGAGTCAAAGTGTTCTGGTAAGTACTTCTCTCATATCTCTGTCCCTAGGA GTGCTCCTTTGGCTGTTCATGATCCTAGCAAATAGGATAGCAATTTAATTGCAGTTACTGTTGGCTTTCAGGTTTATGGT GTTTCATGGATGATCATCTTTCTAATTTTGGGTTTAATGAAGGTGAGCATTCAAATTACTATATTTTGTATCTTTAAAAT ATTGGTGTAATTCTTTGTCCAAGGAAAATTCTGATGACTGCTTCCACATGCATAACCAGCAGATTTATTTATATGAACAT CATTTATGTGTTTCAAGCACTATGTTGCTTACAAAAATAATAAATACACAAATGAATGATAAAATAAAACCAAAATTCAC CGTGTAGAAGTTTTAACTGCCATACAATTACAAATTGAGACATTTCACTGTTGTATCTTAGCAGTTGGTTGACTTGGTTC ACTTAAGTATTATTTGGAAATTTTCACCTTGTAGAAGTAATTCTAGTCATACACTCCCTTTCTTTCTCTTACACCCCTCA CACATACCTTTCTATACTTCTTGAATTGTTATTAACCCTTTCTTTACTATTATGCTGCATTTTTTTGCAGGGTGTATCTG CTGGAAGGCGCCGCCTCAGTGCAGACTTCCAGCTCTTTTTTCGGTTGATTAAGGGTTCTATTTTCATAACATTCCTTACC ATCTTCATTGTGTTAATAGCAGTGGCTAAGATGACCATAAAAGACATAATAGTTTGCATCCTAGCAGTCATGCCAACAGG CTGGGGGTTGCTGCTGGTCAGTAATTATTCCTTTTCCCAAACTTTCTTTGCATGTAATTTTCTTTAGGTATTACTTTTTG TTCATAATCCTGTTTGAGCATTTACTGATCACTGTCTTTTCTGTTTTCTTATTTCTTTTTGGCTCTTCAAAAGATTGCAC AAGCTTGCAAGCCTGTCATTAAAAAGGGAGGGTTTTGGGGGTCTGTTCGCGCACTTGCACGGGGATATGAAATCATAATG GGCTTGCTTCTCTTCACACCAATTGCTTTCTTGGCATGGTTCCCATTTGTTTCAGAATTTCAAACAAGAATGCTTTTCAA CCAAGCTTTCAGTAGAGGTTTGCAGATTTCTCGTATTCTTGGTGGACAAAAAAGAGACCGCGCCTCCAACAACAAGGAGT GATTATATCCCAACAATTATCAAGGTGTACATAAAGTTTCATAGAGTATTAATTATAACCCAAACATACAGTACCATATT GTACATAAAGATTCATTTTGATCTATAAACTTTCAGCCTTATGTTGCATTTAGAAAAGTTTGACTTCAAAGGTTAGTATT ACCATAATCAAATTCTTAGATAATGTGACCAGACAATTGGATGAAACTAAAGATAATAAGATGTTTGTACATTATATTTA CATTTTGCCATTTTGTGAATGACAACTTCTATCATGC
CDS sequence (LotjaGi3g1v0126900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTCTTATAGAAGGGGGTCTGATCAGCCGCCGCGGAGGCAGATACTGCGGACACAGACTGCTGGGCATTTAGGATCAGA CCCGGTCTTGGACAGTGAAGTGGTGCCTTCCTCACTAGTTGAGATAGCTCCCATTCTCCGTGTTGCTAATGAAGTTGAAG CTAGCAATAAAAGAGTTGCTTATCTATGTCGGTTTTATGCCTTTGAAAAAGCTCACAGACTAGATCCAACATCTAGTGGG CGTGGTGTACGTCAATTCAAAACTGCTCTTCTTCAACGTCTAGAAAGGGAAAATGACACAACATTGGAGGGAAGAGCAAA GAGTGATGCTCGTGAAATGCAGAGTTTTTATCGGCACTACTACCAAAAGTATATTGAAGCGCTAAGCAGTGCTGCTGATA AGGATCGTGCCCAGCTCACAAAAGCATATCAAACTGCTGCTGTTTTATTTGAGGTTTTGAAGGCAGTCAATCAAACAGAG GCTGTTGACTTAACTGCAGAGATTGAAGCTCATACCAAGGTTGAGGAAAAAAAGCAATTATATGCCCCTTATAATATTTT GCCCCTCGATCCTGAGAGTGGGAAAGAGGCTATTATGAGATATCCTGAGATTCAATCTGCTGCCTCTGCACTCCGTACAA CCAGGGGTTTGCCTTGGCCAAAGGATCATGGTAACAAAGTAAATGAAGACATTCTAGATTGGCTTCAGCTGATGTTTGGT TTCCAGAAGGGCAACGTGGAAAATCAAAGGGAGCACTTGATTCTTTTGCTTGCAAATGTACATATACGACAAGTTCCGAA ACTTGATCAGCAACCCAAGTTGGATGATCGTGCTTTAAATGAAGTGATGAAGAAACTCTTTAGAAACTACAAAAAGTGGT GCAAGTATTTGGGTCGCAAAAGTAGCCTTTGGTTGCCTACTATTCAGCAGGAAATGCAACAACGCAAACTATTGTACATG GGCTTATATCTTCTTATATGGGGAGAAGCTGCAAATTTGAGATTTATGCCAGAATGCCTCTGTTATATCTACCATCATAT GGCATTTGAGTTGTATGGGATGTTAGCTGGGAATGTCAGTCCATTGACGGGTGAACCTGTAAAGCCTGCCTATGGTGGTG AAACTGAGGCTTTTCTGATGAAAGTAGTAAAACCAATATATGATACAATAGCAAAGGAAGCTAAGAGGAGTAAATCAGGA AAAGCAAAGCACTCTCAGTGGAGAAACTATGATGATTTGAATGAATATTTTTGGTCAGTTGATTGTTTCCGGCTAGGTTG GCCTATGCGTATGGACTCCGGGTTCTTTTCTGTACCTCTGCCTCATGAGCAACGTTCAGGTGACAAAGATGAGGAAAACA GAGCTAATGATGAAGATCGGTGGCCTGGAAAAGTTAATTTTGTTGAGATACGCACATTTTGGCACATATTTAGAAGTTTT GATAGAATGTGGAACTTTTATATACTAAGTTTACAGGCAATGATAATAATAGCTTGGAATGGCTCTGGCAATTTAAGCTC AATATTTGATGGCGAGGTTTTTAAGAAAGTTCTCAGCATCTTCATAACTGCTGCAATATTGAAGCTTGCCCAAGCCATTC TTGACATAGTCCTGAATTGGAAAGCAAGAAAAGTCATGTCATTTCATGTGAAGCTGCGATATATATTTAAAGCCATTTCA GCTGCAGCATGGGTCATAGTTTTACCAGTCACTTATGCTTTTAGTTTGAAAAATCCATCTGGTTTTGGACAAACCATAAA GAATTGGTTTGGCAACGGCACTCGTTCTCCTTCTATGTTCATTTTGGCTGTCATCATCTATTTATCTCCAAATATTCTCT CTGGATTGTTATTTGTGTTCCCATTCATGCGACGGTATCTTGAGAGGTCCAACAGTGGCATTGTGAAATTCATGATGTGG TGGTCCCAGCCTCGGCTCTTTGTTGGTAGAGGAATGCAAGAGGGCCCAATTTCACTGTTGATGTACACTTCTTACTGGGT TTTACTAATTCTATCTAAATTAGCATTCAGTTACTTCTTGGAGATTAAGCCTCTTGTGGGTCCAACAAAAGCCATCATGC AAACTCATATATCAGTTTACCGGTGGCATGAATTCTTCCCGCGTGCCAAAAAAAATATCGGGGTAGTGATTTCTATATGG GCTCCTATCATACTTGTGTACTTTATGGATACACAGATTTGGTATGCTATTTTCTCTACAATTGTAGGAGGCATATATGG TGCATTCCGTCGTCTGGGAGAGATTCGAACATTGGATTTATTAAGGTCTCGCTTTGATTCGATTCCTGGTGCTTTTAATG CTTGCTTAATTCCCATGGATCAGAGCAAGGAGAAAAAGAGAAAGGGACTAAAGGCCACTTTCTCTCGTAAATTTGATCAG GTCTCTTCTAATAAAGAGAAGGAAGCTGCAAGGTTTGCGCAGTTATGGAACAAAATAATTACTAGTTTGAGGGAGGAGGA CCTAATTGATAACAGGGAAATGGACCTCATGCTTGTACCATATTGGGCTGACCGTTCCTTGAACCTCATCCAGTGGCCTC CTTTCTTACTTGCCAGCAAGATCCCAATAGCAGTGTCTATGGCCAAAGACAGCCTTGGAAAAGGACAGGAACTGGAAAAA AGGTTGTCAAGGGACAAGTACATGAAATCTGCTATTCTTGAATGCTATGCTTCTTTCAGAAATATTATTAACTTCTTGGT TCTAGGAGAACGTGAGAACACGGTTATACAGAACATTTTTCAACGAGTTGATGAGCATATAGAAAAAGAAGATCTGCTTA CTGAATTGAATCTGAGTGCTCTCCCTAATCTATATGACCGTTTTGTTAAACTGATTGAATGTTTGATGGATAACAAAAAG GAGGTCAAGGATCAAATTGTCATTCTCTTGCTTGACATGCTAGAGATTGTGACCAGAGATATAATGGAAGGAGATGTTGA GGGTTTGCTAGATTCAAGCCATGGTGGATCTTATGGAAAAGATGAAAGGATGACACCACTTGATCAACATGATCAGATTT TTGGTAGACTTCAGTTTCCTGTCACAACAGATACTGAGGCTTGGTCAGAGAAAATAAAAAGGCTTCATTTACTGTTAACT GTCAAGGAGTCTGCTATGGATGTACCATCCAACTTGGATGCTAGGAGGCGTATATCTTTCTTCTCCAATTCTTTATTTAT GGATATGCCACCTCCTCCAAAAGTTCGCAATATGCTGTCCTTCTCTGTCTTGACACCATACTTTGATGAGCTTGTTCTTT TCTCCCTAGAACATCTGGAAGAGCCAAATGAAGATGGAGTGTCTATTCTCTTTTACTTGCAAAAGATATTTCCAGAAGAA TGGAAAAACTTTCTTCAACGTTTTGATTGTAAGGATGAAGAAAAACTCAGAGGAGAGTTAGAGGAAGAACTCCGTTTATG GGCATCATACAGGGGCCAGACATTGACTAAAACTGTTCGAGGAATGATGTATATCCGACAAGCATTGGAGCTACTGGCTT TTCTTGACATGGCAAAGGATGAAGATCTAATGAAAGGTTACAAGGCTGCAGAACTTGAGAGTAAGGAAAATCCAACCAGT GAGCGGTCACTGTGGACACAATGTCAATCATTAGCTGACATAAAGTTTACATATGTGGTATCGTGTCAACAATACGGTAT TCACAAGCGATCTGGTGATTCTAGGGCCAAAGAAATTTTAAAGCTCATGGCCAAGTACCCATCTCTTCGAGTTGCTTATA TTGATGAGGTTGAAGAGCCTCGGAAAGGTTCATCTCGAAAAACAGATAAGGTTTATTATTCAGTTCTAGCCAAAGCTTCT TTACCGGCAAAATCAATGGATTCATCTGAAACAATTCAAAATTTAGACCAGGATATTTACAGAATAAAGCTTCCAGGGCC TGCAATATTGGGTGAGGGGAAGCCAGAAAATCAAAACCATGCCATCATTTTCACACGTGGGGAAGGCTTGCAAACAATTG ATATGAATCAGGATAACTACATGGAAGAAGCTTTCAAAATGAGAAATTTGCTGCAAGAATTTCTCAAAAAACATGATAGT CCAACATTCCCAACAATACTTGGACTCAGAGAGCATATATTTACTGGCAGTGTTTCTTCCCTTGCATGGTTTATGTCCAA TCAGGAGAACAGTTTTGTGACAATTGGACAAAGATTGTTGGCTAACCCCTTGAAAGTGCGTTTCCATTATGGCCACCCTG ATGTATTTGATAGACTTTTCCATCTGACAAGAGGGGGCGTAAGCAAAGCTTCAAAGGTTGTCAACTTGAGTGAGGATATA TTTGCAGGTTTCAATTCTACACTGCGTGAAGGCAATGTCACACATCACGAGTACATACAAGTCGGTAAAGGAAGGGACGT GGGTCTTAACCAGATATCAATGTTTGAGGCAAAGATAGCTAATGGGAACGGTGAGCAGACAATGAGTAGGGACATATATA GGCTTGGACACCGATTTGATTTCTTCCGAATGTTATCTTGCTATTTCACCACAATCGGCTTCTATTTCAGCACAATGCTG ACTGTCCTCACAGTTTATGTATTCCTTTACGGTCGCCTCTATCTCGCCCTGAGCGGACTTGAAGAAGGGCTGAACAACAA GAAGGCCATAAGAGAGAACAAAGCTCTTCAAGTAGCTCTTGCTTCTCAATCTGTTGTGCAAATTGGATTTTTGTTGTCCT TGCCTATGCTGATGGAAATTGGCTTGGAGAGGGGATTTCGTGAGGCGTTGAGTGAATTTGTACTAATGCAAATACAGTTG GCTCCTGTATTTTTCACGTTTTCTCTTGGAACAAAAACACACTATTATGGAAGGACACTACTTCATGGAGGTGCACAGTA CCGAGGCACTGGTCGTGGTTTTGTGGTGTTTCATGCCAAGTTTGCTGATAATTATAGGCTCTACTCTCGCAGTCATTTTG TTAAAGGAATTGAGTTGGTGATTCTGCTTGTGGTCTACCATATATTTGGTCATGTATACAGAGGAGTTGTTGCCTATATT CTTATTACCATAACCATGTGGTTCATGGCAGGGACTTGGCTTTTTGCTCCCTTCCTTTTCAATCCATCAGGCTTTGAGTG GCAGAAGATTCTTGAGGACTGGACAGATTGGCATAAATGGATAAGCAACCGTGGCGGTATCGGTGTGTCTCCTGAAAGAA GTTGGGAATCCTGGTGGGAAAAGGAACATGAGCATCTCCAGCACTCCGGAATACGTGGTACTGCTACTGAGATAATACTA GCCCTCCGCTTCTTCATATATCAATATGGACTTGTGTATCACCTTTCAATCACTGATTCGAGTCAAAGTGTTCTGGTTTA TGGTGTTTCATGGATGATCATCTTTCTAATTTTGGGTTTAATGAAGGGTGTATCTGCTGGAAGGCGCCGCCTCAGTGCAG ACTTCCAGCTCTTTTTTCGGTTGATTAAGGGTTCTATTTTCATAACATTCCTTACCATCTTCATTGTGTTAATAGCAGTG GCTAAGATGACCATAAAAGACATAATAGTTTGCATCCTAGCAGTCATGCCAACAGGCTGGGGGTTGCTGCTGATTGCACA AGCTTGCAAGCCTGTCATTAAAAAGGGAGGGTTTTGGGGGTCTGTTCGCGCACTTGCACGGGGATATGAAATCATAATGG GCTTGCTTCTCTTCACACCAATTGCTTTCTTGGCATGGTTCCCATTTGTTTCAGAATTTCAAACAAGAATGCTTTTCAAC CAAGCTTTCAGTAGAGGTTTGCAGATTTCTCGTATTCTTGGTGGACAAAAAAGAGACCGCGCCTCCAACAACAAGGAGTG A
Protein sequence (LotjaGi3g1v0126900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSYRRGSDQPPRRQILRTQTAGHLGSDPVLDSEVVPSSLVEIAPILRVANEVEASNKRVAYLCRFYAFEKAHRLDPTSSG RGVRQFKTALLQRLERENDTTLEGRAKSDAREMQSFYRHYYQKYIEALSSAADKDRAQLTKAYQTAAVLFEVLKAVNQTE AVDLTAEIEAHTKVEEKKQLYAPYNILPLDPESGKEAIMRYPEIQSAASALRTTRGLPWPKDHGNKVNEDILDWLQLMFG FQKGNVENQREHLILLLANVHIRQVPKLDQQPKLDDRALNEVMKKLFRNYKKWCKYLGRKSSLWLPTIQQEMQQRKLLYM GLYLLIWGEAANLRFMPECLCYIYHHMAFELYGMLAGNVSPLTGEPVKPAYGGETEAFLMKVVKPIYDTIAKEAKRSKSG KAKHSQWRNYDDLNEYFWSVDCFRLGWPMRMDSGFFSVPLPHEQRSGDKDEENRANDEDRWPGKVNFVEIRTFWHIFRSF DRMWNFYILSLQAMIIIAWNGSGNLSSIFDGEVFKKVLSIFITAAILKLAQAILDIVLNWKARKVMSFHVKLRYIFKAIS AAAWVIVLPVTYAFSLKNPSGFGQTIKNWFGNGTRSPSMFILAVIIYLSPNILSGLLFVFPFMRRYLERSNSGIVKFMMW WSQPRLFVGRGMQEGPISLLMYTSYWVLLILSKLAFSYFLEIKPLVGPTKAIMQTHISVYRWHEFFPRAKKNIGVVISIW APIILVYFMDTQIWYAIFSTIVGGIYGAFRRLGEIRTLDLLRSRFDSIPGAFNACLIPMDQSKEKKRKGLKATFSRKFDQ VSSNKEKEAARFAQLWNKIITSLREEDLIDNREMDLMLVPYWADRSLNLIQWPPFLLASKIPIAVSMAKDSLGKGQELEK RLSRDKYMKSAILECYASFRNIINFLVLGERENTVIQNIFQRVDEHIEKEDLLTELNLSALPNLYDRFVKLIECLMDNKK EVKDQIVILLLDMLEIVTRDIMEGDVEGLLDSSHGGSYGKDERMTPLDQHDQIFGRLQFPVTTDTEAWSEKIKRLHLLLT VKESAMDVPSNLDARRRISFFSNSLFMDMPPPPKVRNMLSFSVLTPYFDELVLFSLEHLEEPNEDGVSILFYLQKIFPEE WKNFLQRFDCKDEEKLRGELEEELRLWASYRGQTLTKTVRGMMYIRQALELLAFLDMAKDEDLMKGYKAAELESKENPTS ERSLWTQCQSLADIKFTYVVSCQQYGIHKRSGDSRAKEILKLMAKYPSLRVAYIDEVEEPRKGSSRKTDKVYYSVLAKAS LPAKSMDSSETIQNLDQDIYRIKLPGPAILGEGKPENQNHAIIFTRGEGLQTIDMNQDNYMEEAFKMRNLLQEFLKKHDS PTFPTILGLREHIFTGSVSSLAWFMSNQENSFVTIGQRLLANPLKVRFHYGHPDVFDRLFHLTRGGVSKASKVVNLSEDI FAGFNSTLREGNVTHHEYIQVGKGRDVGLNQISMFEAKIANGNGEQTMSRDIYRLGHRFDFFRMLSCYFTTIGFYFSTML TVLTVYVFLYGRLYLALSGLEEGLNNKKAIRENKALQVALASQSVVQIGFLLSLPMLMEIGLERGFREALSEFVLMQIQL APVFFTFSLGTKTHYYGRTLLHGGAQYRGTGRGFVVFHAKFADNYRLYSRSHFVKGIELVILLVVYHIFGHVYRGVVAYI LITITMWFMAGTWLFAPFLFNPSGFEWQKILEDWTDWHKWISNRGGIGVSPERSWESWWEKEHEHLQHSGIRGTATEIIL ALRFFIYQYGLVYHLSITDSSQSVLVYGVSWMIIFLILGLMKGVSAGRRRLSADFQLFFRLIKGSIFITFLTIFIVLIAV AKMTIKDIIVCILAVMPTGWGLLLIAQACKPVIKKGGFWGSVRALARGYEIIMGLLLFTPIAFLAWFPFVSEFQTRMLFN QAFSRGLQISRILGGQKRDRASNNKE
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 1942 | 1942 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1 | 1942 | 1942 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 1 | 28 | 28 | - | – | |
| Phobius | 1 | 483 | 483 | - | – | |
| Gene3D | 28 | 188 | 161 | 4.1E-16 | ||
| Pfam | 42 | 182 | 141 | 2.4E-17 | ||
| SMART | 314 | 430 | 117 | 9.8E-74 | ||
| Pfam | 316 | 428 | 113 | 2.1E-36 | ||
| Phobius | 484 | 501 | 18 | - | – | |
| TMHMM | 484 | 503 | 20 | - | – | |
| Phobius | 502 | 512 | 11 | - | – | |
| Phobius | 513 | 534 | 22 | - | – | |
| TMHMM | 518 | 540 | 23 | - | – | |
| Phobius | 535 | 553 | 19 | - | – | |
| TMHMM | 552 | 574 | 23 | - | – | |
| Phobius | 554 | 574 | 21 | - | – | |
| Phobius | 575 | 598 | 24 | - | – | |
| Phobius | 599 | 620 | 22 | - | – | |
| TMHMM | 600 | 622 | 23 | - | – | |
| Phobius | 621 | 658 | 38 | - | – | |
| TMHMM | 658 | 680 | 23 | - | – | |
| Phobius | 659 | 680 | 22 | - | – | |
| Phobius | 681 | 711 | 31 | - | – | |
| TMHMM | 712 | 729 | 18 | - | – | |
| Phobius | 712 | 728 | 17 | - | – | |
| Phobius | 729 | 732 | 4 | - | – | |
| Phobius | 733 | 749 | 17 | - | – | |
| TMHMM | 734 | 753 | 20 | - | – | |
| Phobius | 750 | 1511 | 762 | - | – | |
| Pfam | 1048 | 1756 | 709 | 2.5E-234 | ||
| TMHMM | 1508 | 1530 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1512 | 1535 | 24 | - | – | |
| Phobius | 1536 | 1555 | 20 | - | – | |
| Phobius | 1556 | 1577 | 22 | - | – | |
| TMHMM | 1556 | 1578 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1578 | 1588 | 11 | - | – | |
| Phobius | 1589 | 1610 | 22 | - | – | |
| TMHMM | 1593 | 1610 | 18 | - | – | |
| Phobius | 1611 | 1652 | 42 | - | – | |
| Phobius | 1653 | 1670 | 18 | - | – | |
| Phobius | 1671 | 1675 | 5 | - | – | |
| TMHMM | 1675 | 1697 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1676 | 1700 | 25 | - | – | |
| Phobius | 1701 | 1757 | 57 | - | – | |
| TMHMM | 1755 | 1777 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1758 | 1778 | 21 | - | – | |
| Phobius | 1779 | 1783 | 5 | - | – | |
| TMHMM | 1784 | 1806 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1784 | 1805 | 22 | - | – | |
| Phobius | 1806 | 1816 | 11 | - | – | |
| Phobius | 1817 | 1841 | 25 | - | – | |
| TMHMM | 1819 | 1841 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1842 | 1846 | 5 | - | – | |
| Phobius | 1847 | 1868 | 22 | - | – | |
| TMHMM | 1848 | 1868 | 21 | - | – | |
| Phobius | 1869 | 1888 | 20 | - | – | |
| TMHMM | 1888 | 1910 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1889 | 1909 | 21 | - | – | |
| Phobius | 1910 | 1946 | 37 | - | – | |
| Coils | 1938 | 1946 | 9 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Cellular component | 1,3-beta-D-glucan synthase complex | A protein complex that catalyzes the transfer of a glucose group from UDP-glucose to a (1->3)-beta-D-glucan chain. | ||
| Molecular function | 1,3-beta-D-glucan synthase activity | Catalysis of the reaction: UDP-glucose + [(1->3)-beta-D-glucosyl](n) = UDP + [(1->3)-beta-D-glucosyl](n+1). | ||
| Biological process | (1->3)-beta-D-glucan biosynthetic process | The chemical reactions and pathways resulting in the formation of (1->3)-beta-D-glucans, compounds composed of glucose residues linked by (1->3)-beta-D-glucosidic bonds. | ||
| Cellular component | Membrane | A lipid bilayer along with all the proteins and protein complexes embedded in it an attached to it. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0126900.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…