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LotjaGi3g1v0126900.3

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi3g1v0126900
Transcript ID LotjaGi3g1v0126900.3
Related isoforms 3
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Callose synthase; TAIR: AT2G31960.1 glucan synthase-like 3; Swiss-Prot: sp|Q9SL03|CALS2_ARATH Callose synthase 2; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0ISM0|A0A0R0ISM0_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0126900
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr3:15588691..15624820) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ATGTCTTATAGAAGGGGGTCTGATCAGCCGCCGCGGAGGCAGATACTGCGGACACAGACTGCTGGGCATTTAGGATCAGA CCCGGTCTTGGACAGTGAAGTGGTGCCTTCCTCACTAGTTGAGATAGCTCCCATTCTCCGTGTTGCTAATGAAGTTGAAG CTAGCAATAAAAGAGTTGCTTATCTATGTAAGTAACTATTGTGTGTGTATAAAAGGTGTATGTTTTTTGACAAGTTTTTA TCATTTTTGGTCAAATCACAGTTGGATATATTCTTGTTCATTATCAATAATATCCCTTCTAATCTGGTTTTTGATTGAGC TCAATGGCGTAGTGTGATCCATATAGCCGACCTCACTGAGTGGGATAAGACTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGT TGTTGTACTGTTGGATATATTTTTGTTCCTTTAGGATGCACAGAAGCTAAAAAATTCCGATATTGTTTAGAAGCTTATGC TTTTAGAAGAGATGACAAGGCGTTGCTATTAATCATTGAGAAAGCAAAACATGTGGTTTTAAGCTCTCATTGATCAAATG ACTTTCTAGATTTCTGGTCTTTTTGGAAATATTGCTGAGGAGTTGTATTGAAAAATGGTCTTGCACATTTATGTCATTGA AAAATGGTCTTACTAGGTGGGAAGTTTTTGGAATGTTGTCGTAAACCAATCTTTGCATGAATGCTTAATTTTTTTCCTAT AGGTGCTCAATAGTTATGAGTGCATTATGCTTTTCTTAATTCGCTAATAAATTTATTCCTTTTATAAATGTTAATGATTG GTAGTTTCTGGTTCTTTAAAACTCACACATGAATTTATTCCTATTTGCTATGTGAGCATCATTGTTCCTTTAATTGGCTA AATCTTCAGTTAACTGCTCTTTATAGACCCCATAAATTTTCGATTCTACGAAATCTTTGTATGTTAACTTCATTTCTATC 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CTACTCTCGCAGTCATTTTGTTAAAGGAATTGAGTTGGTGATTCTGCTTGTGGTCTACCATATATTTGGTCATGTATACA GAGGAGTTGTTGCCTATATTCTTATTACCATAACCATGTGGTTCATGGCAGGGACTTGGCTTTTTGCTCCCTTCCTTTTC AATCCATCAGGCTTTGAGTGGCAGAAGATTCTTGAGGACTGGACAGATTGGCATAAATGGATAAGCAACCGTGGCGGTAT CGGTGTGTCTCCTGAAAGAAGTTGGGAATCCTGGTGGGAAAAGGAACATGAGCATCTCCAGCACTCCGGAATACGTGGTA CTGCTACTGAGATAATACTAGCCCTCCGCTTCTTCATATATCAATATGGACTTGTGTATCACCTTTCAATCACTGATTCG AGTCAAAGTGTTCTGGTAAGTACTTCTCTCATATCTCTGTCCCTAGGAGTGCTCCTTTGGCTGTTCATGATCCTAGCAAA TAGGATAGCAATTTAATTGCAGTTACTGTTGGCTTTCAGGTTTATGGTGTTTCATGGATGATCATCTTTCTAATTTTGGG TTTAATGAAGGTGAGCATTCAAATTACTATATTTTGTATCTTTAAAATATTGGTGTAATTCTTTGTCCAAGGAAAATTCT GATGACTGCTTCCACATGCATAACCAGCAGATTTATTTATATGAACATCATTTATGTGTTTCAAGCACTATGTTGCTTAC AAAAATAATAAATACACAAATGAATGATAAAATAAAACCAAAATTCACCGTGTAGAAGTTTTAACTGCCATACAATTACA AATTGAGACATTTCACTGTTGTATCTTAGCAGTTGGTTGACTTGGTTCACTTAAGTATTATTTGGAAATTTTCACCTTGT AGAAGTAATTCTAGTCATACACTCCCTTTCTTTCTCTTACACCCCTCACACATACCTTTCTATACTTCTTGAATTGTTAT TAACCCTTTCTTTACTATTATGCTGCATTTTTTTGCAGGGTGTATCTGCTGGAAGGCGCCGCCTCAGTGCAGACTTCCAG CTCTTTTTTCGGTTGATTAAGGGTTCTATTTTCATAACATTCCTTACCATCTTCATTGTGTTAATAGCAGTGGCTAAGAT GACCATAAAAGACATAATAGTTTGCATCCTAGCAGTCATGCCAACAGGCTGGGGGTTGCTGCTGGTCAGTAATTATTCCT TTTCCCAAACTTTCTTTGCATGTAATTTTCTTTAGGTATTACTTTTTGTTCATAATCCTGTTTGAGCATTTACTGATCAC TGTCTTTTCTGTTTTCTTATTTCTTTTTGGCTCTTCAAAAGATTGCACAAGCTTGCAAGCCTGTCATTAAAAAGGGAGGG TTTTGGGGGTCTGTTCGCGCACTTGCACGGGGATATGAAATCATAATGGGCTTGCTTCTCTTCACACCAATTGCTTTCTT GGCATGGTTCCCATTTGTTTCAGAATTTCAAACAAGAATGCTTTTCAACCAAGCTTTCAGTAGAGGTTTGCAGATTTCTC GTATTCTTGGTGGACAAAAAAGAGACCGCGCCTCCAACAACAAGGAGTGA 

CDS sequence (LotjaGi3g1v0126900.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGTCTTATAGAAGGGGGTCTGATCAGCCGCCGCGGAGGCAGATACTGCGGACACAGACTGCTGGGCATTTAGGATCAGA CCCGGTCTTGGACAGTGAAGTGGTGCCTTCCTCACTAGTTGAGATAGCTCCCATTCTCCGTGTTGCTAATGAAGTTGAAG CTAGCAATAAAAGAGTTGCTTATCTATGTCGGTTTTATGCCTTTGAAAAAGCTCACAGACTAGATCCAACATCTAGTGGG CGTGGTGTACGTCAATTCAAAACTGCTCTTCTTCAACGTCTAGAAAGGGAAAATGACACAACATTGGAGGGAAGAGCAAA GAGTGATGCTCGTGAAATGCAGAGTTTTTATCGGCACTACTACCAAAAGTATATTGAAGCGCTAAGCAGTGCTGCTGATA AGGATCGTGCCCAGCTCACAAAAGCATATCAAACTGCTGCTGTTTTATTTGAGGTTTTGAAGGCAGTCAATCAAACAGAG GCTGTTGACTTAACTGCAGAGATTGAAGCTCATACCAAGGTTGAGGAAAAAAAGCAATTATATGCCCCTTATAATATTTT GCCCCTCGATCCTGAGAGTGGGAAAGAGGCTATTATGAGATATCCTGAGATTCAATCTGCTGCCTCTGCACTCCGTACAA CCAGGGGTTTGCCTTGGCCAAAGGATCATGGTAACAAAGTAAATGAAGACATTCTAGATTGGCTTCAGCTGATGTTTGGT TTCCAGAAGGGCAACGTGGAAAATCAAAGGGAGCACTTGATTCTTTTGCTTGCAAATGTACATATACGACAAGTTCCGAA ACTTGATCAGCAACCCAAGTTGGATGATCGTGCTTTAAATGAAGTGATGAAGAAACTCTTTAGAAACTACAAAAAGTGGT GCAAGTATTTGGGTCGCAAAAGTAGCCTTTGGTTGCCTACTATTCAGCAGGAAATGCAACAACGCAAACTATTGTACATG GGCTTATATCTTCTTATATGGGGAGAAGCTGCAAATTTGAGATTTATGCCAGAATGCCTCTGTTATATCTACCATCATAT GGCATTTGAGTTGTATGGGATGTTAGCTGGGAATGTCAGTCCATTGACGGGTGAACCTGTAAAGCCTGCCTATGGTGGTG AAACTGAGGCTTTTCTGATGAAAGTAGTAAAACCAATATATGATACAATAGCAAAGGAAGCTAAGAGGAGTAAATCAGGA AAAGCAAAGCACTCTCAGTGGAGAAACTATGATGATTTGAATGAATATTTTTGGTCAGTTGATTGTTTCCGGCTAGGTTG GCCTATGCGTATGGACTCCGGGTTCTTTTCTGTACCTCTGCCTCATGAGCAACGTTCAGGTGACAAAGATGAGGAAAACA GAGCTAATGATGAAGATCGGTGGCCTGGAAAAGTTAATTTTGTTGAGATACGCACATTTTGGCACATATTTAGAAGTTTT GATAGAATGTGGAACTTTTATATACTAAGTTTACAGGCAATGATAATAATAGCTTGGAATGGCTCTGGCAATTTAAGCTC AATATTTGATGGCGAGGTTTTTAAGAAAGTTCTCAGCATCTTCATAACTGCTGCAATATTGAAGCTTGCCCAAGCCATTC TTGACATAGTCCTGAATTGGAAAGCAAGAAAAGTCATGTCATTTCATGTGAAGCTGCGATATATATTTAAAGCCATTTCA GCTGCAGCATGGGTCATAGTTTTACCAGTCACTTATGCTTTTAGTTTGAAAAATCCATCTGGTTTTGGACAAACCATAAA GAATTGGTTTGGCAACGGCACTCGTTCTCCTTCTATGTTCATTTTGGCTGTCATCATCTATTTATCTCCAAATATTCTCT CTGGATTGTTATTTGTGTTCCCATTCATGCGACGGTATCTTGAGAGGTCCAACAGTGGCATTGTGAAATTCATGATGTGG TGGTCCCAGCCTCGGCTCTTTGTTGGTAGAGGAATGCAAGAGGGCCCAATTTCACTGTTGATGTACACTTCTTACTGGGT TTTACTAATTCTATCTAAATTAGCATTCAGTTACTTCTTGGAGATTAAGCCTCTTGTGGGTCCAACAAAAGCCATCATGC AAACTCATATATCAGTTTACCGGTGGCATGAATTCTTCCCGCGTGCCAAAAAAAATATCGGGGTAGTGATTTCTATATGG GCTCCTATCATACTTGTGTACTTTATGGATACACAGATTTGGTATGCTATTTTCTCTACAATTGTAGGAGGCATATATGG TGCATTCCGTCGTCTGGGAGAGATTCGAACATTGGATTTATTAAGGTCTCGCTTTGATTCGATTCCTGGTGCTTTTAATG CTTGCTTAATTCCCATGGATCAGAGCAAGGAGAAAAAGAGAAAGGGACTAAAGGCCACTTTCTCTCGTAAATTTGATCAG GTCTCTTCTAATAAAGAGAAGGAAGCTGCAAGGTTTGCGCAGTTATGGAACAAAATAATTACTAGTTTGAGGGAGGAGGA CCTAATTGATAACAGGGAAATGGACCTCATGCTTGTACCATATTGGGCTGACCGTTCCTTGAACCTCATCCAGTGGCCTC CTTTCTTACTTGCCAGCAAGATCCCAATAGCAGTGTCTATGGCCAAAGACAGCCTTGGAAAAGGACAGGAACTGGAAAAA AGGTTGTCAAGGGACAAGTACATGAAATCTGCTATTCTTGAATGCTATGCTTCTTTCAGAAATATTATTAACTTCTTGGT TCTAGGAGAACGTGAGAACACGGTTATACAGAACATTTTTCAACGAGTTGATGAGCATATAGAAAAAGAAGATCTGCTTA CTGAATTGAATCTGAGTGCTCTCCCTAATCTATATGACCGTTTTGTTAAACTGATTGAATGTTTGATGGATAACAAAAAG GAGGTCAAGGATCAAATTGTCATTCTCTTGCTTGACATGCTAGAGATTGTGACCAGAGATATAATGGAAGGAGATGTTGA GGGTTTGCTAGATTCAAGCCATGGTGGATCTTATGGAAAAGATGAAAGGATGACACCACTTGATCAACATGATCAGATTT TTGGTAGACTTCAGTTTCCTGTCACAACAGATACTGAGGCTTGGTCAGAGAAAATAAAAAGGCTTCATTTACTGTTAACT GTCAAGGAGTCTGCTATGGATGTACCATCCAACTTGGATGCTAGGAGGCGTATATCTTTCTTCTCCAATTCTTTATTTAT GGATATGCCACCTCCTCCAAAAGTTCGCAATATGCTGTCCTTCTCTGTCTTGACACCATACTTTGATGAGCTTGTTCTTT TCTCCCTAGAACATCTGGAAGAGCCAAATGAAGATGGAGTGTCTATTCTCTTTTACTTGCAAAAGATATTTCCAGAAGAA TGGAAAAACTTTCTTCAACGTTTTGATTGTAAGGATGAAGAAAAACTCAGAGGAGAGTTAGAGGAAGAACTCCGTTTATG GGCATCATACAGGGGCCAGACATTGACTAAAACTGTTCGAGGAATGATGTATATCCGACAAGCATTGGAGCTACTGGCTT TTCTTGACATGGCAAAGGATGAAGATCTAATGAAAGGTTACAAGGCTGCAGAACTTGAGAGTAAGGAAAATCCAACCAGT GAGCGGTCACTGTGGACACAATGTCAATCATTAGCTGACATAAAGTTTACATATGTGGTATCGTGTCAACAATACGGTAT TCACAAGCGATCTGGTGATTCTAGGGCCAAAGAAATTTTAAAGCTCATGGCCAAGTACCCATCTCTTCGAGTTGCTTATA TTGATGAGGTTGAAGAGCCTCGGAAAGGTTCATCTCGAAAAACAGATAAGGTTTATTATTCAGTTCTAGCCAAAGCTTCT TTACCGGCAAAATCAATGGATTCATCTGAAACAATTCAAAATTTAGACCAGGATATTTACAGAATAAAGCTTCCAGGGCC TGCAATATTGGGTGAGGGGAAGCCAGAAAATCAAAACCATGCCATCATTTTCACACGTGGGGAAGGCTTGCAAACAATTG ATATGAATCAGGATAACTACATGGAAGAAGCTTTCAAAATGAGAAATTTGCTGCAAGAATTTCTCAAAAAACATGATAGT CCAACATTCCCAACAATACTTGGACTCAGAGAGCATATATTTACTGGCAGTGTTTCTTCCCTTGCATGGTTTATGTCCAA TCAGGAGAACAGTTTTGTGACAATTGGACAAAGATTGTTGGCTAACCCCTTGAAAGTGCGTTTCCATTATGGCCACCCTG ATGTATTTGATAGACTTTTCCATCTGACAAGAGGGGGCGTAAGCAAAGCTTCAAAGGTTGTCAACTTGAGTGAGGATATA TTTGCAGGCATGTTTCTATATCTCTTTATGTGTTTCAATTCTACACTGCGTGAAGGCAATGTCACACATCACGAGTACAT ACAAGTCGGTAAAGGAAGGGACGTGGGTCTTAACCAGATATCAATGTTTGAGGCAAAGATAGCTAATGGGAACGGTGAGC AGACAATGAGTAGGGACATATATAGGCTTGGACACCGATTTGATTTCTTCCGAATGTTATCTTGCTATTTCACCACAATC GGCTTCTATTTCAGCACAATGCTGACTGTCCTCACAGTTTATGTATTCCTTTACGGTCGCCTCTATCTCGCCCTGAGCGG ACTTGAAGAAGGGCTGAACAACAAGAAGGCCATAAGAGAGAACAAAGCTCTTCAAGTAGCTCTTGCTTCTCAATCTGTTG TGCAAATTGGATTTTTGTTGTCCTTGCCTATGCTGATGGAAATTGGCTTGGAGAGGGGATTTCGTGAGGCGTTGAGTGAA TTTGTACTAATGCAAATACAGTTGGCTCCTGTATTTTTCACGTTTTCTCTTGGAACAAAAACACACTATTATGGAAGGAC ACTACTTCATGGAGGTGCACAGTACCGAGGCACTGGTCGTGGTTTTGTGGTGTTTCATGCCAAGTTTGCTGATAATTATA GGCTCTACTCTCGCAGTCATTTTGTTAAAGGAATTGAGTTGGTGATTCTGCTTGTGGTCTACCATATATTTGGTCATGTA TACAGAGGAGTTGTTGCCTATATTCTTATTACCATAACCATGTGGTTCATGGCAGGGACTTGGCTTTTTGCTCCCTTCCT TTTCAATCCATCAGGCTTTGAGTGGCAGAAGATTCTTGAGGACTGGACAGATTGGCATAAATGGATAAGCAACCGTGGCG GTATCGGTGTGTCTCCTGAAAGAAGTTGGGAATCCTGGTGGGAAAAGGAACATGAGCATCTCCAGCACTCCGGAATACGT GGTACTGCTACTGAGATAATACTAGCCCTCCGCTTCTTCATATATCAATATGGACTTGTGTATCACCTTTCAATCACTGA TTCGAGTCAAAGTGTTCTGGTTTATGGTGTTTCATGGATGATCATCTTTCTAATTTTGGGTTTAATGAAGGGTGTATCTG CTGGAAGGCGCCGCCTCAGTGCAGACTTCCAGCTCTTTTTTCGGTTGATTAAGGGTTCTATTTTCATAACATTCCTTACC ATCTTCATTGTGTTAATAGCAGTGGCTAAGATGACCATAAAAGACATAATAGTTTGCATCCTAGCAGTCATGCCAACAGG CTGGGGGTTGCTGCTGATTGCACAAGCTTGCAAGCCTGTCATTAAAAAGGGAGGGTTTTGGGGGTCTGTTCGCGCACTTG CACGGGGATATGAAATCATAATGGGCTTGCTTCTCTTCACACCAATTGCTTTCTTGGCATGGTTCCCATTTGTTTCAGAA TTTCAAACAAGAATGCTTTTCAACCAAGCTTTCAGTAGAGGTTTGCAGATTTCTCGTATTCTTGGTGGACAAAAAAGAGA CCGCGCCTCCAACAACAAGGAGTGA 

Protein sequence (LotjaGi3g1v0126900.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MSYRRGSDQPPRRQILRTQTAGHLGSDPVLDSEVVPSSLVEIAPILRVANEVEASNKRVAYLCRFYAFEKAHRLDPTSSG RGVRQFKTALLQRLERENDTTLEGRAKSDAREMQSFYRHYYQKYIEALSSAADKDRAQLTKAYQTAAVLFEVLKAVNQTE AVDLTAEIEAHTKVEEKKQLYAPYNILPLDPESGKEAIMRYPEIQSAASALRTTRGLPWPKDHGNKVNEDILDWLQLMFG FQKGNVENQREHLILLLANVHIRQVPKLDQQPKLDDRALNEVMKKLFRNYKKWCKYLGRKSSLWLPTIQQEMQQRKLLYM GLYLLIWGEAANLRFMPECLCYIYHHMAFELYGMLAGNVSPLTGEPVKPAYGGETEAFLMKVVKPIYDTIAKEAKRSKSG KAKHSQWRNYDDLNEYFWSVDCFRLGWPMRMDSGFFSVPLPHEQRSGDKDEENRANDEDRWPGKVNFVEIRTFWHIFRSF DRMWNFYILSLQAMIIIAWNGSGNLSSIFDGEVFKKVLSIFITAAILKLAQAILDIVLNWKARKVMSFHVKLRYIFKAIS AAAWVIVLPVTYAFSLKNPSGFGQTIKNWFGNGTRSPSMFILAVIIYLSPNILSGLLFVFPFMRRYLERSNSGIVKFMMW WSQPRLFVGRGMQEGPISLLMYTSYWVLLILSKLAFSYFLEIKPLVGPTKAIMQTHISVYRWHEFFPRAKKNIGVVISIW APIILVYFMDTQIWYAIFSTIVGGIYGAFRRLGEIRTLDLLRSRFDSIPGAFNACLIPMDQSKEKKRKGLKATFSRKFDQ VSSNKEKEAARFAQLWNKIITSLREEDLIDNREMDLMLVPYWADRSLNLIQWPPFLLASKIPIAVSMAKDSLGKGQELEK RLSRDKYMKSAILECYASFRNIINFLVLGERENTVIQNIFQRVDEHIEKEDLLTELNLSALPNLYDRFVKLIECLMDNKK EVKDQIVILLLDMLEIVTRDIMEGDVEGLLDSSHGGSYGKDERMTPLDQHDQIFGRLQFPVTTDTEAWSEKIKRLHLLLT VKESAMDVPSNLDARRRISFFSNSLFMDMPPPPKVRNMLSFSVLTPYFDELVLFSLEHLEEPNEDGVSILFYLQKIFPEE WKNFLQRFDCKDEEKLRGELEEELRLWASYRGQTLTKTVRGMMYIRQALELLAFLDMAKDEDLMKGYKAAELESKENPTS ERSLWTQCQSLADIKFTYVVSCQQYGIHKRSGDSRAKEILKLMAKYPSLRVAYIDEVEEPRKGSSRKTDKVYYSVLAKAS LPAKSMDSSETIQNLDQDIYRIKLPGPAILGEGKPENQNHAIIFTRGEGLQTIDMNQDNYMEEAFKMRNLLQEFLKKHDS PTFPTILGLREHIFTGSVSSLAWFMSNQENSFVTIGQRLLANPLKVRFHYGHPDVFDRLFHLTRGGVSKASKVVNLSEDI FAGMFLYLFMCFNSTLREGNVTHHEYIQVGKGRDVGLNQISMFEAKIANGNGEQTMSRDIYRLGHRFDFFRMLSCYFTTI GFYFSTMLTVLTVYVFLYGRLYLALSGLEEGLNNKKAIRENKALQVALASQSVVQIGFLLSLPMLMEIGLERGFREALSE FVLMQIQLAPVFFTFSLGTKTHYYGRTLLHGGAQYRGTGRGFVVFHAKFADNYRLYSRSHFVKGIELVILLVVYHIFGHV YRGVVAYILITITMWFMAGTWLFAPFLFNPSGFEWQKILEDWTDWHKWISNRGGIGVSPERSWESWWEKEHEHLQHSGIR GTATEIILALRFFIYQYGLVYHLSITDSSQSVLVYGVSWMIIFLILGLMKGVSAGRRRLSADFQLFFRLIKGSIFITFLT IFIVLIAVAKMTIKDIIVCILAVMPTGWGLLLIAQACKPVIKKGGFWGSVRALARGYEIIMGLLLFTPIAFLAWFPFVSE FQTRMLFNQAFSRGLQISRILGGQKRDRASNNKE 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
MobiDBLite 1 28 28 -
PANTHER 1 1950 1950 0.0
Phobius 1 483 483 -
PANTHER 1 1950 1950 0.0
Gene3D 28 188 161 4.1E-16
Pfam 42 182 141 2.4E-17
SMART 314 430 117 9.8E-74
Pfam 316 428 113 2.1E-36
Phobius 484 501 18 -
TMHMM 484 503 20 -
Phobius 502 512 11 -
Phobius 513 534 22 -
TMHMM 518 540 23 -
Phobius 535 553 19 -
TMHMM 552 574 23 -
Phobius 554 574 21 -
Phobius 575 598 24 -
Phobius 599 620 22 -
TMHMM 600 622 23 -
Phobius 621 658 38 -
TMHMM 658 680 23 -
Phobius 659 680 22 -
Phobius 681 711 31 -
Phobius 712 728 17 -
TMHMM 712 729 18 -
Phobius 729 732 4 -
Phobius 733 749 17 -
TMHMM 734 753 20 -
Phobius 750 1519 770 -
Pfam 1048 1764 717 8.8E-230
TMHMM 1516 1538 23 -
Phobius 1520 1543 24 -
Phobius 1544 1563 20 -
TMHMM 1564 1586 23 -
Phobius 1564 1585 22 -
Phobius 1586 1596 11 -
Phobius 1597 1618 22 -
TMHMM 1601 1618 18 -
Phobius 1619 1660 42 -
Phobius 1661 1678 18 -
Phobius 1679 1683 5 -
TMHMM 1683 1705 23 -
Phobius 1684 1708 25 -
Phobius 1709 1765 57 -
TMHMM 1763 1785 23 -
Phobius 1766 1786 21 -
Phobius 1787 1791 5 -
TMHMM 1792 1814 23 -
Phobius 1792 1813 22 -
Phobius 1814 1824 11 -
Phobius 1825 1849 25 -
TMHMM 1827 1849 23 -
Phobius 1850 1854 5 -
Phobius 1855 1876 22 -
TMHMM 1856 1876 21 -
Phobius 1877 1896 20 -
TMHMM 1896 1918 23 -
Phobius 1897 1917 21 -
Phobius 1918 1954 37 -
Coils 1946 1954 9 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Cellular component 1,3-beta-D-glucan synthase complex A protein complex that catalyzes the transfer of a glucose group from UDP-glucose to a (1->3)-beta-D-glucan chain.
Molecular function 1,3-beta-D-glucan synthase activity Catalysis of the reaction: UDP-glucose + [(1->3)-beta-D-glucosyl](n) = UDP + [(1->3)-beta-D-glucosyl](n+1).
Biological process (1->3)-beta-D-glucan biosynthetic process The chemical reactions and pathways resulting in the formation of (1->3)-beta-D-glucans, compounds composed of glucose residues linked by (1->3)-beta-D-glucosidic bonds.
Cellular component Membrane A lipid bilayer along with all the proteins and protein complexes embedded in it an attached to it.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi3g1v0126900.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…