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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi3g1v0126900 |
Transcript ID | LotjaGi3g1v0126900.3 |
Related isoforms 3 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | Callose synthase; TAIR: AT2G31960.1 glucan synthase-like 3; Swiss-Prot: sp|Q9SL03|CALS2_ARATH Callose synthase 2; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0ISM0|A0A0R0ISM0_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0126900 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:15588691..15624820) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGTCTTATAGAAGGGGGTCTGATCAGCCGCCGCGGAGGCAGATACTGCGGACACAGACTGCTGGGCATTTAGGATCAGA CCCGGTCTTGGACAGTGAAGTGGTGCCTTCCTCACTAGTTGAGATAGCTCCCATTCTCCGTGTTGCTAATGAAGTTGAAG CTAGCAATAAAAGAGTTGCTTATCTATGTAAGTAACTATTGTGTGTGTATAAAAGGTGTATGTTTTTTGACAAGTTTTTA TCATTTTTGGTCAAATCACAGTTGGATATATTCTTGTTCATTATCAATAATATCCCTTCTAATCTGGTTTTTGATTGAGC TCAATGGCGTAGTGTGATCCATATAGCCGACCTCACTGAGTGGGATAAGACTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGT TGTTGTACTGTTGGATATATTTTTGTTCCTTTAGGATGCACAGAAGCTAAAAAATTCCGATATTGTTTAGAAGCTTATGC TTTTAGAAGAGATGACAAGGCGTTGCTATTAATCATTGAGAAAGCAAAACATGTGGTTTTAAGCTCTCATTGATCAAATG ACTTTCTAGATTTCTGGTCTTTTTGGAAATATTGCTGAGGAGTTGTATTGAAAAATGGTCTTGCACATTTATGTCATTGA AAAATGGTCTTACTAGGTGGGAAGTTTTTGGAATGTTGTCGTAAACCAATCTTTGCATGAATGCTTAATTTTTTTCCTAT AGGTGCTCAATAGTTATGAGTGCATTATGCTTTTCTTAATTCGCTAATAAATTTATTCCTTTTATAAATGTTAATGATTG GTAGTTTCTGGTTCTTTAAAACTCACACATGAATTTATTCCTATTTGCTATGTGAGCATCATTGTTCCTTTAATTGGCTA AATCTTCAGTTAACTGCTCTTTATAGACCCCATAAATTTTCGATTCTACGAAATCTTTGTATGTTAACTTCATTTCTATC 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CTACTCTCGCAGTCATTTTGTTAAAGGAATTGAGTTGGTGATTCTGCTTGTGGTCTACCATATATTTGGTCATGTATACA GAGGAGTTGTTGCCTATATTCTTATTACCATAACCATGTGGTTCATGGCAGGGACTTGGCTTTTTGCTCCCTTCCTTTTC AATCCATCAGGCTTTGAGTGGCAGAAGATTCTTGAGGACTGGACAGATTGGCATAAATGGATAAGCAACCGTGGCGGTAT CGGTGTGTCTCCTGAAAGAAGTTGGGAATCCTGGTGGGAAAAGGAACATGAGCATCTCCAGCACTCCGGAATACGTGGTA CTGCTACTGAGATAATACTAGCCCTCCGCTTCTTCATATATCAATATGGACTTGTGTATCACCTTTCAATCACTGATTCG AGTCAAAGTGTTCTGGTAAGTACTTCTCTCATATCTCTGTCCCTAGGAGTGCTCCTTTGGCTGTTCATGATCCTAGCAAA TAGGATAGCAATTTAATTGCAGTTACTGTTGGCTTTCAGGTTTATGGTGTTTCATGGATGATCATCTTTCTAATTTTGGG TTTAATGAAGGTGAGCATTCAAATTACTATATTTTGTATCTTTAAAATATTGGTGTAATTCTTTGTCCAAGGAAAATTCT GATGACTGCTTCCACATGCATAACCAGCAGATTTATTTATATGAACATCATTTATGTGTTTCAAGCACTATGTTGCTTAC AAAAATAATAAATACACAAATGAATGATAAAATAAAACCAAAATTCACCGTGTAGAAGTTTTAACTGCCATACAATTACA AATTGAGACATTTCACTGTTGTATCTTAGCAGTTGGTTGACTTGGTTCACTTAAGTATTATTTGGAAATTTTCACCTTGT AGAAGTAATTCTAGTCATACACTCCCTTTCTTTCTCTTACACCCCTCACACATACCTTTCTATACTTCTTGAATTGTTAT TAACCCTTTCTTTACTATTATGCTGCATTTTTTTGCAGGGTGTATCTGCTGGAAGGCGCCGCCTCAGTGCAGACTTCCAG CTCTTTTTTCGGTTGATTAAGGGTTCTATTTTCATAACATTCCTTACCATCTTCATTGTGTTAATAGCAGTGGCTAAGAT GACCATAAAAGACATAATAGTTTGCATCCTAGCAGTCATGCCAACAGGCTGGGGGTTGCTGCTGGTCAGTAATTATTCCT TTTCCCAAACTTTCTTTGCATGTAATTTTCTTTAGGTATTACTTTTTGTTCATAATCCTGTTTGAGCATTTACTGATCAC TGTCTTTTCTGTTTTCTTATTTCTTTTTGGCTCTTCAAAAGATTGCACAAGCTTGCAAGCCTGTCATTAAAAAGGGAGGG TTTTGGGGGTCTGTTCGCGCACTTGCACGGGGATATGAAATCATAATGGGCTTGCTTCTCTTCACACCAATTGCTTTCTT GGCATGGTTCCCATTTGTTTCAGAATTTCAAACAAGAATGCTTTTCAACCAAGCTTTCAGTAGAGGTTTGCAGATTTCTC GTATTCTTGGTGGACAAAAAAGAGACCGCGCCTCCAACAACAAGGAGTGA
CDS sequence (LotjaGi3g1v0126900.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTCTTATAGAAGGGGGTCTGATCAGCCGCCGCGGAGGCAGATACTGCGGACACAGACTGCTGGGCATTTAGGATCAGA CCCGGTCTTGGACAGTGAAGTGGTGCCTTCCTCACTAGTTGAGATAGCTCCCATTCTCCGTGTTGCTAATGAAGTTGAAG CTAGCAATAAAAGAGTTGCTTATCTATGTCGGTTTTATGCCTTTGAAAAAGCTCACAGACTAGATCCAACATCTAGTGGG CGTGGTGTACGTCAATTCAAAACTGCTCTTCTTCAACGTCTAGAAAGGGAAAATGACACAACATTGGAGGGAAGAGCAAA GAGTGATGCTCGTGAAATGCAGAGTTTTTATCGGCACTACTACCAAAAGTATATTGAAGCGCTAAGCAGTGCTGCTGATA AGGATCGTGCCCAGCTCACAAAAGCATATCAAACTGCTGCTGTTTTATTTGAGGTTTTGAAGGCAGTCAATCAAACAGAG GCTGTTGACTTAACTGCAGAGATTGAAGCTCATACCAAGGTTGAGGAAAAAAAGCAATTATATGCCCCTTATAATATTTT GCCCCTCGATCCTGAGAGTGGGAAAGAGGCTATTATGAGATATCCTGAGATTCAATCTGCTGCCTCTGCACTCCGTACAA CCAGGGGTTTGCCTTGGCCAAAGGATCATGGTAACAAAGTAAATGAAGACATTCTAGATTGGCTTCAGCTGATGTTTGGT TTCCAGAAGGGCAACGTGGAAAATCAAAGGGAGCACTTGATTCTTTTGCTTGCAAATGTACATATACGACAAGTTCCGAA ACTTGATCAGCAACCCAAGTTGGATGATCGTGCTTTAAATGAAGTGATGAAGAAACTCTTTAGAAACTACAAAAAGTGGT GCAAGTATTTGGGTCGCAAAAGTAGCCTTTGGTTGCCTACTATTCAGCAGGAAATGCAACAACGCAAACTATTGTACATG GGCTTATATCTTCTTATATGGGGAGAAGCTGCAAATTTGAGATTTATGCCAGAATGCCTCTGTTATATCTACCATCATAT GGCATTTGAGTTGTATGGGATGTTAGCTGGGAATGTCAGTCCATTGACGGGTGAACCTGTAAAGCCTGCCTATGGTGGTG AAACTGAGGCTTTTCTGATGAAAGTAGTAAAACCAATATATGATACAATAGCAAAGGAAGCTAAGAGGAGTAAATCAGGA AAAGCAAAGCACTCTCAGTGGAGAAACTATGATGATTTGAATGAATATTTTTGGTCAGTTGATTGTTTCCGGCTAGGTTG GCCTATGCGTATGGACTCCGGGTTCTTTTCTGTACCTCTGCCTCATGAGCAACGTTCAGGTGACAAAGATGAGGAAAACA GAGCTAATGATGAAGATCGGTGGCCTGGAAAAGTTAATTTTGTTGAGATACGCACATTTTGGCACATATTTAGAAGTTTT GATAGAATGTGGAACTTTTATATACTAAGTTTACAGGCAATGATAATAATAGCTTGGAATGGCTCTGGCAATTTAAGCTC AATATTTGATGGCGAGGTTTTTAAGAAAGTTCTCAGCATCTTCATAACTGCTGCAATATTGAAGCTTGCCCAAGCCATTC TTGACATAGTCCTGAATTGGAAAGCAAGAAAAGTCATGTCATTTCATGTGAAGCTGCGATATATATTTAAAGCCATTTCA GCTGCAGCATGGGTCATAGTTTTACCAGTCACTTATGCTTTTAGTTTGAAAAATCCATCTGGTTTTGGACAAACCATAAA GAATTGGTTTGGCAACGGCACTCGTTCTCCTTCTATGTTCATTTTGGCTGTCATCATCTATTTATCTCCAAATATTCTCT CTGGATTGTTATTTGTGTTCCCATTCATGCGACGGTATCTTGAGAGGTCCAACAGTGGCATTGTGAAATTCATGATGTGG TGGTCCCAGCCTCGGCTCTTTGTTGGTAGAGGAATGCAAGAGGGCCCAATTTCACTGTTGATGTACACTTCTTACTGGGT TTTACTAATTCTATCTAAATTAGCATTCAGTTACTTCTTGGAGATTAAGCCTCTTGTGGGTCCAACAAAAGCCATCATGC AAACTCATATATCAGTTTACCGGTGGCATGAATTCTTCCCGCGTGCCAAAAAAAATATCGGGGTAGTGATTTCTATATGG GCTCCTATCATACTTGTGTACTTTATGGATACACAGATTTGGTATGCTATTTTCTCTACAATTGTAGGAGGCATATATGG TGCATTCCGTCGTCTGGGAGAGATTCGAACATTGGATTTATTAAGGTCTCGCTTTGATTCGATTCCTGGTGCTTTTAATG CTTGCTTAATTCCCATGGATCAGAGCAAGGAGAAAAAGAGAAAGGGACTAAAGGCCACTTTCTCTCGTAAATTTGATCAG GTCTCTTCTAATAAAGAGAAGGAAGCTGCAAGGTTTGCGCAGTTATGGAACAAAATAATTACTAGTTTGAGGGAGGAGGA CCTAATTGATAACAGGGAAATGGACCTCATGCTTGTACCATATTGGGCTGACCGTTCCTTGAACCTCATCCAGTGGCCTC CTTTCTTACTTGCCAGCAAGATCCCAATAGCAGTGTCTATGGCCAAAGACAGCCTTGGAAAAGGACAGGAACTGGAAAAA AGGTTGTCAAGGGACAAGTACATGAAATCTGCTATTCTTGAATGCTATGCTTCTTTCAGAAATATTATTAACTTCTTGGT TCTAGGAGAACGTGAGAACACGGTTATACAGAACATTTTTCAACGAGTTGATGAGCATATAGAAAAAGAAGATCTGCTTA CTGAATTGAATCTGAGTGCTCTCCCTAATCTATATGACCGTTTTGTTAAACTGATTGAATGTTTGATGGATAACAAAAAG GAGGTCAAGGATCAAATTGTCATTCTCTTGCTTGACATGCTAGAGATTGTGACCAGAGATATAATGGAAGGAGATGTTGA GGGTTTGCTAGATTCAAGCCATGGTGGATCTTATGGAAAAGATGAAAGGATGACACCACTTGATCAACATGATCAGATTT TTGGTAGACTTCAGTTTCCTGTCACAACAGATACTGAGGCTTGGTCAGAGAAAATAAAAAGGCTTCATTTACTGTTAACT GTCAAGGAGTCTGCTATGGATGTACCATCCAACTTGGATGCTAGGAGGCGTATATCTTTCTTCTCCAATTCTTTATTTAT GGATATGCCACCTCCTCCAAAAGTTCGCAATATGCTGTCCTTCTCTGTCTTGACACCATACTTTGATGAGCTTGTTCTTT TCTCCCTAGAACATCTGGAAGAGCCAAATGAAGATGGAGTGTCTATTCTCTTTTACTTGCAAAAGATATTTCCAGAAGAA TGGAAAAACTTTCTTCAACGTTTTGATTGTAAGGATGAAGAAAAACTCAGAGGAGAGTTAGAGGAAGAACTCCGTTTATG GGCATCATACAGGGGCCAGACATTGACTAAAACTGTTCGAGGAATGATGTATATCCGACAAGCATTGGAGCTACTGGCTT TTCTTGACATGGCAAAGGATGAAGATCTAATGAAAGGTTACAAGGCTGCAGAACTTGAGAGTAAGGAAAATCCAACCAGT GAGCGGTCACTGTGGACACAATGTCAATCATTAGCTGACATAAAGTTTACATATGTGGTATCGTGTCAACAATACGGTAT TCACAAGCGATCTGGTGATTCTAGGGCCAAAGAAATTTTAAAGCTCATGGCCAAGTACCCATCTCTTCGAGTTGCTTATA TTGATGAGGTTGAAGAGCCTCGGAAAGGTTCATCTCGAAAAACAGATAAGGTTTATTATTCAGTTCTAGCCAAAGCTTCT TTACCGGCAAAATCAATGGATTCATCTGAAACAATTCAAAATTTAGACCAGGATATTTACAGAATAAAGCTTCCAGGGCC TGCAATATTGGGTGAGGGGAAGCCAGAAAATCAAAACCATGCCATCATTTTCACACGTGGGGAAGGCTTGCAAACAATTG ATATGAATCAGGATAACTACATGGAAGAAGCTTTCAAAATGAGAAATTTGCTGCAAGAATTTCTCAAAAAACATGATAGT CCAACATTCCCAACAATACTTGGACTCAGAGAGCATATATTTACTGGCAGTGTTTCTTCCCTTGCATGGTTTATGTCCAA TCAGGAGAACAGTTTTGTGACAATTGGACAAAGATTGTTGGCTAACCCCTTGAAAGTGCGTTTCCATTATGGCCACCCTG ATGTATTTGATAGACTTTTCCATCTGACAAGAGGGGGCGTAAGCAAAGCTTCAAAGGTTGTCAACTTGAGTGAGGATATA TTTGCAGGCATGTTTCTATATCTCTTTATGTGTTTCAATTCTACACTGCGTGAAGGCAATGTCACACATCACGAGTACAT ACAAGTCGGTAAAGGAAGGGACGTGGGTCTTAACCAGATATCAATGTTTGAGGCAAAGATAGCTAATGGGAACGGTGAGC AGACAATGAGTAGGGACATATATAGGCTTGGACACCGATTTGATTTCTTCCGAATGTTATCTTGCTATTTCACCACAATC GGCTTCTATTTCAGCACAATGCTGACTGTCCTCACAGTTTATGTATTCCTTTACGGTCGCCTCTATCTCGCCCTGAGCGG ACTTGAAGAAGGGCTGAACAACAAGAAGGCCATAAGAGAGAACAAAGCTCTTCAAGTAGCTCTTGCTTCTCAATCTGTTG TGCAAATTGGATTTTTGTTGTCCTTGCCTATGCTGATGGAAATTGGCTTGGAGAGGGGATTTCGTGAGGCGTTGAGTGAA TTTGTACTAATGCAAATACAGTTGGCTCCTGTATTTTTCACGTTTTCTCTTGGAACAAAAACACACTATTATGGAAGGAC ACTACTTCATGGAGGTGCACAGTACCGAGGCACTGGTCGTGGTTTTGTGGTGTTTCATGCCAAGTTTGCTGATAATTATA GGCTCTACTCTCGCAGTCATTTTGTTAAAGGAATTGAGTTGGTGATTCTGCTTGTGGTCTACCATATATTTGGTCATGTA TACAGAGGAGTTGTTGCCTATATTCTTATTACCATAACCATGTGGTTCATGGCAGGGACTTGGCTTTTTGCTCCCTTCCT TTTCAATCCATCAGGCTTTGAGTGGCAGAAGATTCTTGAGGACTGGACAGATTGGCATAAATGGATAAGCAACCGTGGCG GTATCGGTGTGTCTCCTGAAAGAAGTTGGGAATCCTGGTGGGAAAAGGAACATGAGCATCTCCAGCACTCCGGAATACGT GGTACTGCTACTGAGATAATACTAGCCCTCCGCTTCTTCATATATCAATATGGACTTGTGTATCACCTTTCAATCACTGA TTCGAGTCAAAGTGTTCTGGTTTATGGTGTTTCATGGATGATCATCTTTCTAATTTTGGGTTTAATGAAGGGTGTATCTG CTGGAAGGCGCCGCCTCAGTGCAGACTTCCAGCTCTTTTTTCGGTTGATTAAGGGTTCTATTTTCATAACATTCCTTACC ATCTTCATTGTGTTAATAGCAGTGGCTAAGATGACCATAAAAGACATAATAGTTTGCATCCTAGCAGTCATGCCAACAGG CTGGGGGTTGCTGCTGATTGCACAAGCTTGCAAGCCTGTCATTAAAAAGGGAGGGTTTTGGGGGTCTGTTCGCGCACTTG CACGGGGATATGAAATCATAATGGGCTTGCTTCTCTTCACACCAATTGCTTTCTTGGCATGGTTCCCATTTGTTTCAGAA TTTCAAACAAGAATGCTTTTCAACCAAGCTTTCAGTAGAGGTTTGCAGATTTCTCGTATTCTTGGTGGACAAAAAAGAGA CCGCGCCTCCAACAACAAGGAGTGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0126900.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSYRRGSDQPPRRQILRTQTAGHLGSDPVLDSEVVPSSLVEIAPILRVANEVEASNKRVAYLCRFYAFEKAHRLDPTSSG RGVRQFKTALLQRLERENDTTLEGRAKSDAREMQSFYRHYYQKYIEALSSAADKDRAQLTKAYQTAAVLFEVLKAVNQTE AVDLTAEIEAHTKVEEKKQLYAPYNILPLDPESGKEAIMRYPEIQSAASALRTTRGLPWPKDHGNKVNEDILDWLQLMFG FQKGNVENQREHLILLLANVHIRQVPKLDQQPKLDDRALNEVMKKLFRNYKKWCKYLGRKSSLWLPTIQQEMQQRKLLYM GLYLLIWGEAANLRFMPECLCYIYHHMAFELYGMLAGNVSPLTGEPVKPAYGGETEAFLMKVVKPIYDTIAKEAKRSKSG KAKHSQWRNYDDLNEYFWSVDCFRLGWPMRMDSGFFSVPLPHEQRSGDKDEENRANDEDRWPGKVNFVEIRTFWHIFRSF DRMWNFYILSLQAMIIIAWNGSGNLSSIFDGEVFKKVLSIFITAAILKLAQAILDIVLNWKARKVMSFHVKLRYIFKAIS AAAWVIVLPVTYAFSLKNPSGFGQTIKNWFGNGTRSPSMFILAVIIYLSPNILSGLLFVFPFMRRYLERSNSGIVKFMMW WSQPRLFVGRGMQEGPISLLMYTSYWVLLILSKLAFSYFLEIKPLVGPTKAIMQTHISVYRWHEFFPRAKKNIGVVISIW APIILVYFMDTQIWYAIFSTIVGGIYGAFRRLGEIRTLDLLRSRFDSIPGAFNACLIPMDQSKEKKRKGLKATFSRKFDQ VSSNKEKEAARFAQLWNKIITSLREEDLIDNREMDLMLVPYWADRSLNLIQWPPFLLASKIPIAVSMAKDSLGKGQELEK RLSRDKYMKSAILECYASFRNIINFLVLGERENTVIQNIFQRVDEHIEKEDLLTELNLSALPNLYDRFVKLIECLMDNKK EVKDQIVILLLDMLEIVTRDIMEGDVEGLLDSSHGGSYGKDERMTPLDQHDQIFGRLQFPVTTDTEAWSEKIKRLHLLLT VKESAMDVPSNLDARRRISFFSNSLFMDMPPPPKVRNMLSFSVLTPYFDELVLFSLEHLEEPNEDGVSILFYLQKIFPEE WKNFLQRFDCKDEEKLRGELEEELRLWASYRGQTLTKTVRGMMYIRQALELLAFLDMAKDEDLMKGYKAAELESKENPTS ERSLWTQCQSLADIKFTYVVSCQQYGIHKRSGDSRAKEILKLMAKYPSLRVAYIDEVEEPRKGSSRKTDKVYYSVLAKAS LPAKSMDSSETIQNLDQDIYRIKLPGPAILGEGKPENQNHAIIFTRGEGLQTIDMNQDNYMEEAFKMRNLLQEFLKKHDS PTFPTILGLREHIFTGSVSSLAWFMSNQENSFVTIGQRLLANPLKVRFHYGHPDVFDRLFHLTRGGVSKASKVVNLSEDI FAGMFLYLFMCFNSTLREGNVTHHEYIQVGKGRDVGLNQISMFEAKIANGNGEQTMSRDIYRLGHRFDFFRMLSCYFTTI GFYFSTMLTVLTVYVFLYGRLYLALSGLEEGLNNKKAIRENKALQVALASQSVVQIGFLLSLPMLMEIGLERGFREALSE FVLMQIQLAPVFFTFSLGTKTHYYGRTLLHGGAQYRGTGRGFVVFHAKFADNYRLYSRSHFVKGIELVILLVVYHIFGHV YRGVVAYILITITMWFMAGTWLFAPFLFNPSGFEWQKILEDWTDWHKWISNRGGIGVSPERSWESWWEKEHEHLQHSGIR GTATEIILALRFFIYQYGLVYHLSITDSSQSVLVYGVSWMIIFLILGLMKGVSAGRRRLSADFQLFFRLIKGSIFITFLT IFIVLIAVAKMTIKDIIVCILAVMPTGWGLLLIAQACKPVIKKGGFWGSVRALARGYEIIMGLLLFTPIAFLAWFPFVSE FQTRMLFNQAFSRGLQISRILGGQKRDRASNNKE
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
MobiDBLite | 1 | 28 | 28 | - | – | |
PANTHER | 1 | 1950 | 1950 | 0.0 | – | |
Phobius | 1 | 483 | 483 | - | – | |
PANTHER | 1 | 1950 | 1950 | 0.0 | – | |
Gene3D | 28 | 188 | 161 | 4.1E-16 | ||
Pfam | 42 | 182 | 141 | 2.4E-17 | ||
SMART | 314 | 430 | 117 | 9.8E-74 | ||
Pfam | 316 | 428 | 113 | 2.1E-36 | ||
Phobius | 484 | 501 | 18 | - | – | |
TMHMM | 484 | 503 | 20 | - | – | |
Phobius | 502 | 512 | 11 | - | – | |
Phobius | 513 | 534 | 22 | - | – | |
TMHMM | 518 | 540 | 23 | - | – | |
Phobius | 535 | 553 | 19 | - | – | |
TMHMM | 552 | 574 | 23 | - | – | |
Phobius | 554 | 574 | 21 | - | – | |
Phobius | 575 | 598 | 24 | - | – | |
Phobius | 599 | 620 | 22 | - | – | |
TMHMM | 600 | 622 | 23 | - | – | |
Phobius | 621 | 658 | 38 | - | – | |
TMHMM | 658 | 680 | 23 | - | – | |
Phobius | 659 | 680 | 22 | - | – | |
Phobius | 681 | 711 | 31 | - | – | |
Phobius | 712 | 728 | 17 | - | – | |
TMHMM | 712 | 729 | 18 | - | – | |
Phobius | 729 | 732 | 4 | - | – | |
Phobius | 733 | 749 | 17 | - | – | |
TMHMM | 734 | 753 | 20 | - | – | |
Phobius | 750 | 1519 | 770 | - | – | |
Pfam | 1048 | 1764 | 717 | 8.8E-230 | ||
TMHMM | 1516 | 1538 | 23 | - | – | |
Phobius | 1520 | 1543 | 24 | - | – | |
Phobius | 1544 | 1563 | 20 | - | – | |
TMHMM | 1564 | 1586 | 23 | - | – | |
Phobius | 1564 | 1585 | 22 | - | – | |
Phobius | 1586 | 1596 | 11 | - | – | |
Phobius | 1597 | 1618 | 22 | - | – | |
TMHMM | 1601 | 1618 | 18 | - | – | |
Phobius | 1619 | 1660 | 42 | - | – | |
Phobius | 1661 | 1678 | 18 | - | – | |
Phobius | 1679 | 1683 | 5 | - | – | |
TMHMM | 1683 | 1705 | 23 | - | – | |
Phobius | 1684 | 1708 | 25 | - | – | |
Phobius | 1709 | 1765 | 57 | - | – | |
TMHMM | 1763 | 1785 | 23 | - | – | |
Phobius | 1766 | 1786 | 21 | - | – | |
Phobius | 1787 | 1791 | 5 | - | – | |
TMHMM | 1792 | 1814 | 23 | - | – | |
Phobius | 1792 | 1813 | 22 | - | – | |
Phobius | 1814 | 1824 | 11 | - | – | |
Phobius | 1825 | 1849 | 25 | - | – | |
TMHMM | 1827 | 1849 | 23 | - | – | |
Phobius | 1850 | 1854 | 5 | - | – | |
Phobius | 1855 | 1876 | 22 | - | – | |
TMHMM | 1856 | 1876 | 21 | - | – | |
Phobius | 1877 | 1896 | 20 | - | – | |
TMHMM | 1896 | 1918 | 23 | - | – | |
Phobius | 1897 | 1917 | 21 | - | – | |
Phobius | 1918 | 1954 | 37 | - | – | |
Coils | 1946 | 1954 | 9 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
---|---|---|---|---|
Cellular component | 1,3-beta-D-glucan synthase complex | A protein complex that catalyzes the transfer of a glucose group from UDP-glucose to a (1->3)-beta-D-glucan chain. | ||
Molecular function | 1,3-beta-D-glucan synthase activity | Catalysis of the reaction: UDP-glucose + [(1->3)-beta-D-glucosyl](n) = UDP + [(1->3)-beta-D-glucosyl](n+1). | ||
Biological process | (1->3)-beta-D-glucan biosynthetic process | The chemical reactions and pathways resulting in the formation of (1->3)-beta-D-glucans, compounds composed of glucose residues linked by (1->3)-beta-D-glucosidic bonds. | ||
Cellular component | Membrane | A lipid bilayer along with all the proteins and protein complexes embedded in it an attached to it. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0126900.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…