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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0240700 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0240700.1 |
| Related isoforms 11 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Protein kinase, putative; TAIR: AT3G58640.1 Mitogen activated protein kinase kinase kinase-like protein; Swiss-Prot: sp|Q05609|CTR1_ARATH Serine/threonine-protein kinase CTR1; TrEMBL-Plants: tr|A0A072VME1|A0A072VME1_MEDTR MAP kinase kinase kinase-like protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0240700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:38950404..38972645) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TGACGCGTAAGAAGGTGTGGATGTTGGTGAGCCAACCCTTTTGCTAGCTGGCTGTCGGGGAGAGGTCCCCAGATCCCTCC TCTCGCACTGCACGTGACTCACCTCACCTCCTTCTCCCTCTCTCTCTCTTCACTCCCCCATCGCTTTCTTCTACTTCCAT CCATCCAAAACTCAAATTCCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTACCATCGTCTCCGCTCTCTCTCTCACTCTAACTCTGCGTGT AAATCATGATGATTCCACTTCCACGCTCTCCATAGCAAATTCAGATTCATTCATATATGCTTTTCAACAAACGCCAACTC TGATTCTCACTCAAATGCTTCGATCTGCTTCAGGTGAATCCATTCACTCTTCCTTTCATCTCTACGATCACTGTGATTTC GGTTTTGATCATTTTCATTGCTCGCGATTTCAATTCTGTTGCTGCGTTTGTTTCGGTTTTTTTCTCGCATAGCCTAGCGT TCTCAGTTCATCAGGCATTGTTCTCTCCGTCGGCATTGCCTGTTTGATACGCTTTCTTCGATTGAATCGATTATTATTTG TTTATAGTTTTTGTGATTTAGAGTAAATGGAGCTAGCTGTGTTGTTGAGTGATATATAAGTTATAAGTATATATACTCTT TGATCTGAATGTGATTTTCCTTGTTACTATGCAGCTCTCGGTTTTGAAAAAATAAATTAGAATTAGAATCCATGAATTGG CTTAATTAGGAGGAGTTTCTGATTTAGTGCTTGGCGGTTGAGTTGAATTGTACAGACACTGAAGAGGTATTTGCTTTTGA ACTTTTAGCTGATGCTGTGATATTGTATGCAAATCCAGGATTTATGGGAGCGAACATTCGTATTTGGCAGTTTCTTAGTT CGGTGAGTTGTATTATTAGTGTAGAAGTAACTAGTTCTGTCCTTATGCAGTGCGCGGTATTGTTCTTGTTATCCTTTTCT 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GTAGCTGGTTTATGACAATGATTCTAGTGTTAACATGGACTTGGTTTTCTGAAAGTTTGATTAGATATTGTTTTAAAGCA TGGAGTTCACATTTTCCCTTTCTTTTTGAGAGTTAGAGGGCTGATTTGCTTATTGGTTATATTTAGATATCTTTCATGTT CTACATATGATTCTCATTCTGCAATGGCAGGTGCCAAATTCTCATCCTGATGGTCATAATGAAAGGTTGGCCTTATATTC TCATCAGTGTGACCAAGGAACTTCGCAAAAAGCAATGTCGTTGCCGTCTTCGCCACAGAACTATAGAGGTCAAGCTTCTG AGAGAAGTGGGCCTTCAAGATATGGAGTGAATGATGAGACAGAATCGACTTGGAATAAAGTACTTGAATCCCCGATGTTC AATAATAGACCCCTACTAGCATATGAGGAATGGTATATTGATTTCTCAGAGATAACTGTTGGAACTCGTGTAGGGATTGG TAAGTACCACCTCTCATGGTTATCATAATCACATGAATTATTGTTTGCAGATACGGCGAGTAGACATCATTCATATGGCA TGAGATACAAATTGTGTAAAAGTTTAAGAGCTGCCATTGAATTGCAGAGATGATTTTCTAAATCATGCAACGTCTCTTTA TGGGACTCGGTTTCTACATTTCTGTGTTGGGTAGTGACAGATCTGTGTCAAGTTTGTGACAGATCAAATCCAGAGCTATC CTAGCCACTCGGGAAATCCCTAGTTTTACCGGTATTTGGTTTTTAATTGGAAAATTAGTCCGAGAGCCTTATGAAACAGT CTGTATTAAATAATTTCTCCTACTTTTTGATGTCGCCAATTTCCAGGCGTGGGGTAGTCTAGGAATGTGGACATCATTTA ATTGTAGTAATACTTAAAAGAATAAGAAGTTGGGCAGAAAAAGGAAGTGATGTTCAGTTTCAGACTTTCAGTCAAGGAAG TAGTGTAATGGGAAATTGGAAAGAAATAAAATAATAATGTTAATATAGAAATCAAAGTTAGAAAATCAGTTAATAAGGAA TCATACAACTAATCAAACATAATGATTAAAGAAATCCTGCCTATGGAATTCTTAGAGAAATAAATCCTAATTAAACGATC AATACACAAGGAAAAAAAAATTAAATTAGGTAATCATGTTATTACTACTACTACTACTACTACTACCATTTTTATCATTT TTTAATTTTTACGACCATTTTTAGCATTTTTAACTATCTCTTTCAATTCATAATTTAAACTGCTTGGAACAACCATGCTT CTCATCATTTACTGTTTAATTACTTTAGACCAATTTCATTCTTTATGCTGCTAAATGTTTGGCTTGTTCTTTTTCTGGAT AATGCAACTTTGACTGTTGTTTGTTTTATATTTATTTTATATATATTCAGTGTGCTTTTGTTGAGGATGATTGTTGAGAC ATTTGATTTTTAGTATCCTGACTCTAGTTTAAGATGGTGAATTTGTGAGAATGGGATTGATAGTGATGTGTTTTATAATG AATCATTAAAATACCGAATGATGTGTTTGCTAAGAAATTATAGGGGGTTACAGCTCGTGGTATAACTCAAAATTATTGAG GTACATGTAGTAGGACCATTGTTGTCAAATATCCGCCACGGCGGAATTCTGGCAAGCCGCCATGGCCAATATTCTGCCAT CCGCCATAAGTATTTGTCAAATATGGCCTGGGCATAAGTGATGAGGACACATCATAAATGCAAAGTGTTCCGTAAAGATA TACTTGCAAAAGAGATCAGGAATTCTGGATAATGAAATTTGAATCGGCCTAGATCAAAGAAAGAAGTTCTGTTGAATAAA CCAAAATGTTCTGTTTTTAACATGATAGAAGGATACTATAGCTTACGGATGTGCTTTTCTTCTTCCTTGCTTTATTTAAA CGTGGGGTAACAAGGCTATAAAACGGAGATATGTAAAACGGATTGTTGCAGCTTTCTCCGATTACGCCGACCAAACATAT GTCCGGGTTGTTGCAACTACATGTTCCTTATCAAGGTCATGTAAAACGGATTGTTGCAGCTTCCAAGGCTATAATCCCTT GCAACTACTTTAATGTGTGTTTCGTAATTTAGGGGCTGGTAATCATCTGTTTCTCAATGCTGTACTGTAAAACCTTTGGA ACAAGCTTTTTGTATGTATGATTGCCTTGGTGTTTAAGTTACCTTCAAACACTTGATTTTATGTTTCTGGAGGTACAAGA AAGGAATATCTGGAGGTGATATACGTTGTCAGAAAGTAGTTTGGTTTATTTAGTTGGCATATATGTTTGCGATGCAATTT TAGGCAGAACTGTTATTGGGCTTTAGAAAAATATATAGTCCATTTGGCATGTTTGTGGCTTGTAGTCTGTGGCATATTGC TATATCAAGCGATTGTGCTTGAGGGATGATTTATGATGAAATTTTTACTTGACCATTGATATATTATTCTTTTTCAGGCT TCTTTGGAGAAGTCTTCCGTGGTGTATGGAACGGCACAGATGTTGCTATCAAGGTTTTTCTGGAGCAAGATTTAACTGCT GAAAATATGGAAGATTTCTGCAATGAGATATCTATTCTGAGGTAGCTGGTTGTTTATATTCTGTTTGTCTGACTTCTTCT ATCCAACATTTTCTGACTCTTTTTTTGAATTTGGTATTTGTTTTCCTCCAGCCGACTCCGACATCCTAATGGTAATCTCC AACATTTTGACTATTTTTTTTTATAGTTATGGCTTTGCATTGATCTTGCATATTTTATTTCCTAGGTATGGTAATTAATT AAAGTGAATCTGCATGGGTTCCTTTTACTGATTCATAGTAAAATCTTCGATTCTCATGAGTATGAAAATAATACTATGCA GGCTTGAATGCTTGATTGCAAGAATATATCTTCCAGCACTTACCCTTCCAGTTGATCTGTTAGTTATTTATTAAGTGATG AAACTGTATGCAGTTATCTTATTTCTTGGTGCATGCACGAAGCCTCCACGTTTGTCAATGGTCACAGAATATATGGAGAT GGGATCATTGTATTACTTGATACATTTGAGTGGTCAAAAGAAAAAGCTCAGTTGGCGGAGGAGACTAAGGATGCTGCGTG ACATATGCAAGTAAGATTAAGGTTATGCATAATTATCACAATGTCTGGCGTTTATGCTAAACAGATGTTACATATTAAAT CTTTTCCTCTTCCAATAAATCATAAAGTCCCTGTCCATTCAATTTGTCAGTGTTTCATGACCTATTTTTTTTCTTTTCCA ATTGGATGAAGAGGGTGATAAAAGTTTTTTTTTTTTCATCAGTCCTTTATTGAGACAGGTGTGATCCATAGTGAACAATG AAAAATGACTGACTTTCCCCATCATGAAAGATAACTGAGACTTACTATTAAATAGAAGGTTTAGGCTTTACTACTGCATG TTATCAAATGCCAGATAACCTACCATTTCAGTGAAGCCATTATACGTTGAATCGAAATTGTGTTTTGTAAGACCACTGCC GGTGTAGACAAATTTCTAGCGCTACCTCTTATTTTTACTATTAAATAATTTGGGTGGGGTTGTTTTACTTCATTTCGATG TAAATTTGTCTCCCCATATTGAAATGATTTCGTTTGATCTATGAAAACTGATGAGAACACCTTTGTTGTGTATAGGGGAT TGATGTGCATACACCGCATGAAGATTGTTCACCGTGATGTGAAAAGTGCAAATTGTCTGGTGAATAAGCATTGGACAGTG AAAATCTGTGACTTTGGGCTTTCAAGAATAATGACAGATTCTAACATGAGAGATTGTTCGTCAGCTGGAACTCCAGAATG GATGGCTCCTGAACTCATCCGAAATGAACCTTTCTCTGAAAAATGTGATATCTTTAGCTTTGGGGTGATAATGTGGGAGC TCTGTACCCTGAACAGACCATGGGAAGGTGTACCACCTGAAAGGGTATAATATATTCAACAGATTTGTGCATTTTCCTTG ATGACTTTTACTTCTGTTGTGCAAGGCATTGAAAAATTTTCATTTTTTCTCTGCTGATGATCAGGTGGTCTATTCTGTTG CTAATGAAGGTTCCAGATTAGAGATTCCTGAAGGCCCGCTAGGCAGGCTGATTTCAGGTTCTACTTCTTTCCCTGTATCA CATTTTGATGGCAGAACTTAGACCCATCCGGTTTAACTTAATTACTTCTGTTTATGTATATTTTTTTGTGCGCAGACTGT TGGGTAGAATCACATGAGCGGCCGAGTTGTGATGAGATTCTTTCTCGTTTGGTGGACATCGAACACTCCTTGTGCTGATG CAATCCATCTCTTTTGTACATAGAAATCTTTGGGTAGAGTTGTTACATTGTGTTATCGGCTGATGTTGTAGACTCCTGTG AATTTTGTTCTTTTACTCAGGACATGCCAAAAAATGAAACATGCTCTTGTTGTGTTACCCTTGTGCTGCAAAACTCATCT CTATTTGAGGGCAAGGAGAGAATGATGATTCATTCCATGTCGAATATTTTCTTTGCAATGAAAAAAAAGAATTCTAGTGG AGTACAGCTCTGACTCGACGAGTCCCATGTTGTTATTCCAGATAGGAAGGTAACTGGTTATGCTATGAAAAACTTAAGGG CTTATATAAGTTTTACTTAAGTCTTCATTTTTTACTCAAATTTAATTTTGTTCACCATATATTTTTATTGTTTTGGAACC TATTTTTTTCAAACCTAATTTTTGAATTTTTTTATGAATAATTTTAGAGTAATTTTACCTGACCTACTTTACTTCAGACC TAATCGCTTTCGCAATTAATTAACAAGTAACACTTTCTAGAGGGTGTTTATTACAAATACATCTCAAATCGTTTCGGGGA ATATGTGATTTGAATTGCAACATTATGTATTTTGGCACAAATTTTGAAAATATGATTTTCAGGCATCCAAATTATACATG AT
CDS sequence (LotjaGi3g1v0240700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAGGAGACACGAGAAGATGCAGGGCCGGCAGAGCAAGGGCCATCTAATGCTAATAAATCATGGTGGCCTTCAGATTT CATTGAAAAATTTGGATCAGTTTCTTTGGATTGTCAAGATGAAACCTTAAATGATAAAGAATCTCCTAGACATTCTGACA AATATGTTTTATCACCTCAGAAAGCCTCACAAATTCTCTGGCTCACTGGAATGCTTTCAGAACCAATACCCAATGGTTTT TATTCAGTCCTTCCGGAGACAAGACTCAAGGAACGTTTTGATAGTATTCCTACCTTGGATGAGCTTCATGCTCTGGGTGG AGAGGGTTTAAGGGCTGATGTCATTCTTGTGGATTTAGAGAAAGATAAGAAGCTATCCATGGTGAAGCAACTGATTGTGA CATTAGTCAAAGGATTAAACTCAAACCCAGCTGCAATAATTAAGAAGATAGCTGGATTAGTTTCTGATTTTTATAAGCGA CCCAATGTGGAAAGTCCAGCAAAAGCTGCACTAGATGAAACGCCTCACATGTTTGAGAATCGACTTGTCCAGATGTTGGG GCAAATAAAGCATGGTTCATGCCGTCCTCGGGCTATCTTATTCAAAGTATTAGCTGATACTGTAGGGCTTGAAAGTAGGC TCATGGTGGGCTTGCCAAATGAAGGGGCTATTGGATGTGGAGATTCACACAAGCATATGTCTGTGACAGTTGTGTTAAAT TCGGTGGAAATGCTGGTTGACTTAATGCGATTTCCGGGCCAATTGTTACCAAGATCAACCAAGGCAGTTCTTATGACTCA TATTTCCGCAGCAGGAGAGAGTGATTCAGCAGAAAATGATTCCTGTGATTCACCATTAGAACCAAACAGTCCTTTATTTG GAGTTCCGGAGAGTCCAGAACATCCCTCATATCGAGCCCGTGCACGGTCCTTACTTAGTGGTGATAGGAAAGCTTTCAGA GAATTTGCTGATGACCAGGCCACATCAAGATCCAGCTATAGGTCAGATGGTGCGTCCTCATTAGAACCTCGTAGGATACG AAGAAGAAGCATCAGCATTACACCAGAGATTGGTGATGATATCGTAAGGGCTGTACGGGCAATGAATGAAACACTAAAGC AAAATCGTCTTCTGAGAGAACAAGGGGATGATAACTCATTCTCCCATTCTCCAAACAACAGAAGTACTGATGCAAATCTT CAGAAAAATGTGCCAAATTCTCATCCTGATGGTCATAATGAAAGGTTGGCCTTATATTCTCATCAGTGTGACCAAGGAAC TTCGCAAAAAGCAATGTCGTTGCCGTCTTCGCCACAGAACTATAGAGGTCAAGCTTCTGAGAGAAGTGGGCCTTCAAGAT ATGGAGTGAATGATGAGACAGAATCGACTTGGAATAAAGTACTTGAATCCCCGATGTTCAATAATAGACCCCTACTAGCA TATGAGGAATGGTATATTGATTTCTCAGAGATAACTGTTGGAACTCGTGTAGGGATTGGCTTCTTTGGAGAAGTCTTCCG TGGTGTATGGAACGGCACAGATGTTGCTATCAAGGTTTTTCTGGAGCAAGATTTAACTGCTGAAAATATGGAAGATTTCT GCAATGAGATATCTATTCTGAGCCGACTCCGACATCCTAATGTTATCTTATTTCTTGGTGCATGCACGAAGCCTCCACGT TTGTCAATGGTCACAGAATATATGGAGATGGGATCATTGTATTACTTGATACATTTGAGTGGTCAAAAGAAAAAGCTCAG TTGGCGGAGGAGACTAAGGATGCTGCGTGACATATGCAAGGGATTGATGTGCATACACCGCATGAAGATTGTTCACCGTG ATGTGAAAAGTGCAAATTGTCTGGTGAATAAGCATTGGACAGTGAAAATCTGTGACTTTGGGCTTTCAAGAATAATGACA GATTCTAACATGAGAGATTGTTCGTCAGCTGGAACTCCAGAATGGATGGCTCCTGAACTCATCCGAAATGAACCTTTCTC TGAAAAATGTGATATCTTTAGCTTTGGGGTGATAATGTGGGAGCTCTGTACCCTGAACAGACCATGGGAAGGTGTACCAC CTGAAAGGGTGGTCTATTCTGTTGCTAATGAAGGTTCCAGATTAGAGATTCCTGAAGGCCCGCTAGGCAGGCTGATTTCA GACTGTTGGGTAGAATCACATGAGCGGCCGAGTTGTGATGAGATTCTTTCTCGTTTGGTGGACATCGAACACTCCTTGTG CTGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0240700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MEETREDAGPAEQGPSNANKSWWPSDFIEKFGSVSLDCQDETLNDKESPRHSDKYVLSPQKASQILWLTGMLSEPIPNGF YSVLPETRLKERFDSIPTLDELHALGGEGLRADVILVDLEKDKKLSMVKQLIVTLVKGLNSNPAAIIKKIAGLVSDFYKR PNVESPAKAALDETPHMFENRLVQMLGQIKHGSCRPRAILFKVLADTVGLESRLMVGLPNEGAIGCGDSHKHMSVTVVLN SVEMLVDLMRFPGQLLPRSTKAVLMTHISAAGESDSAENDSCDSPLEPNSPLFGVPESPEHPSYRARARSLLSGDRKAFR EFADDQATSRSSYRSDGASSLEPRRIRRRSISITPEIGDDIVRAVRAMNETLKQNRLLREQGDDNSFSHSPNNRSTDANL QKNVPNSHPDGHNERLALYSHQCDQGTSQKAMSLPSSPQNYRGQASERSGPSRYGVNDETESTWNKVLESPMFNNRPLLA YEEWYIDFSEITVGTRVGIGFFGEVFRGVWNGTDVAIKVFLEQDLTAENMEDFCNEISILSRLRHPNVILFLGACTKPPR LSMVTEYMEMGSLYYLIHLSGQKKKLSWRRRLRMLRDICKGLMCIHRMKIVHRDVKSANCLVNKHWTVKICDFGLSRIMT DSNMRDCSSAGTPEWMAPELIRNEPFSEKCDIFSFGVIMWELCTLNRPWEGVPPERVVYSVANEGSRLEIPEGPLGRLIS DCWVESHERPSCDEILSRLVDIEHSLC
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 300 | 300 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1 | 300 | 300 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 1 | 23 | 23 | - | – | |
| Pfam | 59 | 256 | 198 | 9.0E-54 | – | |
| MobiDBLite | 273 | 303 | 31 | - | – | |
| MobiDBLite | 322 | 343 | 22 | - | – | |
| MobiDBLite | 376 | 414 | 39 | - | – | |
| MobiDBLite | 384 | 407 | 24 | - | – | |
| MobiDBLite | 427 | 458 | 32 | - | – | |
| PANTHER | 439 | 746 | 308 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 439 | 746 | 308 | 0.0 | – | |
| SUPERFAMILY | 466 | 739 | 274 | 8.34E-78 | ||
| Gene3D | 485 | 569 | 85 | 2.2E-30 | – | |
| SMART | 491 | 740 | 250 | 7.1E-60 | ||
| ProSiteProfiles | 491 | 747 | 257 | 40.16 | ||
| Pfam | 492 | 739 | 248 | 4.8E-61 | ||
| CDD | 497 | 739 | 243 | 2.48874E-119 | – | |
| ProSitePatterns | 497 | 518 | 22 | - | ||
| Gene3D | 570 | 745 | 176 | 1.3E-53 | – | |
| ProSitePatterns | 610 | 622 | 13 | - |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein kinase activity | Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP. | ||
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. | ||
| Biological process | Protein phosphorylation | The process of introducing a phosphate group on to a protein. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0240700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…