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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0240700 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0240700.2 |
| Related isoforms 11 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Protein kinase, putative; TAIR: AT3G58640.1 Mitogen activated protein kinase kinase kinase-like protein; Swiss-Prot: sp|Q05609|CTR1_ARATH Serine/threonine-protein kinase CTR1; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2RUK5|A0A0B2RUK5_GLYSO Serine/threonine-protein kinase CTR1; Found in the gene: LotjaGi3g1v0240700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:38950441..38972338) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CTTTTGCTAGCTGGCTGTCGGGGAGAGGTCCCCAGATCCCTCCTCTCGCACTGCACGTGACTCACCTCACCTCCTTCTCC CTCTCTCTCTCTTCACTCCCCCATCGCTTTCTTCTACTTCCATCCATCCAAAACTCAAATTCCTCTCCCTCTCTCTCTCT CTACCATCGTCTCCGCTCTCTCTCTCACTCTAACTCTGCGTGTAAATCATGATGATTCCACTTCCACGCTCTCCATAGCA AATTCAGATTCATTCATATATGCTTTTCAACAAACGCCAACTCTGATTCTCACTCAAATGCTTCGATCTGCTTCAGGTGA ATCCATTCACTCTTCCTTTCATCTCTACGATCACTGTGATTTCGGTTTTGATCATTTTCATTGCTCGCGATTTCAATTCT GTTGCTGCGTTTGTTTCGGTTTTTTTCTCGCATAGCCTAGCGTTCTCAGTTCATCAGGCATTGTTCTCTCCGTCGGCATT GCCTGTTTGATACGCTTTCTTCGATTGAATCGATTATTATTTGTTTATAGTTTTTGTGATTTAGAGTAAATGGAGCTAGC TGTGTTGTTGAGTGATATATAAGTTATAAGTATATATACTCTTTGATCTGAATGTGATTTTCCTTGTTACTATGCAGCTC TCGGTTTTGAAAAAATAAATTAGAATTAGAATCCATGAATTGGCTTAATTAGGAGGAGTTTCTGATTTAGTGCTTGGCGG TTGAGTTGAATTGTACAGACACTGAAGAGGTATTTGCTTTTGAACTTTTAGCTGATGCTGTGATATTGTATGCAAATCCA GGATTTATGGGAGCGAACATTCGTATTTGGCAGTTTCTTAGTTCGGTGAGTTGTATTATTAGTGTAGAAGTAACTAGTTC TGTCCTTATGCAGTGCGCGGTATTGTTCTTGTTATCCTTTTCTGTTTTTGATGTTTGCTGTGATGACTGATTGAATTATG 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GACTTGGTTTTCTGAAAGTTTGATTAGATATTGTTTTAAAGCATGGAGTTCACATTTTCCCTTTCTTTTTGAGAGTTAGA GGGCTGATTTGCTTATTGGTTATATTTAGATATCTTTCATGTTCTACATATGATTCTCATTCTGCAATGGCAGGTGCCAA ATTCTCATCCTGATGGTCATAATGAAAGGTTGGCCTTATATTCTCATCAGTGTGACCAAGGAACTTCGCAAAAAGCAATG TCGTTGCCGTCTTCGCCACAGAACTATAGAGGTCAAGCTTCTGAGAGAAGTGGGCCTTCAAGATATGGAGTGAATGATGA GACAGAATCGACTTGGAATAAAGTACTTGAATCCCCGATGTTCAATAATAGACCCCTACTAGCATATGAGGAATGGTATA TTGATTTCTCAGAGATAACTGTTGGAACTCGTGTAGGGATTGGTAAGTACCACCTCTCATGGTTATCATAATCACATGAA TTATTGTTTGCAGATACGGCGAGTAGACATCATTCATATGGCATGAGATACAAATTGTGTAAAAGTTTAAGAGCTGCCAT TGAATTGCAGAGATGATTTTCTAAATCATGCAACGTCTCTTTATGGGACTCGGTTTCTACATTTCTGTGTTGGGTAGTGA CAGATCTGTGTCAAGTTTGTGACAGATCAAATCCAGAGCTATCCTAGCCACTCGGGAAATCCCTAGTTTTACCGGTATTT GGTTTTTAATTGGAAAATTAGTCCGAGAGCCTTATGAAACAGTCTGTATTAAATAATTTCTCCTACTTTTTGATGTCGCC AATTTCCAGGCGTGGGGTAGTCTAGGAATGTGGACATCATTTAATTGTAGTAATACTTAAAAGAATAAGAAGTTGGGCAG AAAAAGGAAGTGATGTTCAGTTTCAGACTTTCAGTCAAGGAAGTAGTGTAATGGGAAATTGGAAAGAAATAAAATAATAA TGTTAATATAGAAATCAAAGTTAGAAAATCAGTTAATAAGGAATCATACAACTAATCAAACATAATGATTAAAGAAATCC TGCCTATGGAATTCTTAGAGAAATAAATCCTAATTAAACGATCAATACACAAGGAAAAAAAAATTAAATTAGGTAATCAT GTTATTACTACTACTACTACTACTACTACCATTTTTATCATTTTTTAATTTTTACGACCATTTTTAGCATTTTTAACTAT CTCTTTCAATTCATAATTTAAACTGCTTGGAACAACCATGCTTCTCATCATTTACTGTTTAATTACTTTAGACCAATTTC ATTCTTTATGCTGCTAAATGTTTGGCTTGTTCTTTTTCTGGATAATGCAACTTTGACTGTTGTTTGTTTTATATTTATTT TATATATATTCAGTGTGCTTTTGTTGAGGATGATTGTTGAGACATTTGATTTTTAGTATCCTGACTCTAGTTTAAGATGG TGAATTTGTGAGAATGGGATTGATAGTGATGTGTTTTATAATGAATCATTAAAATACCGAATGATGTGTTTGCTAAGAAA TTATAGGGGGTTACAGCTCGTGGTATAACTCAAAATTATTGAGGTACATGTAGTAGGACCATTGTTGTCAAATATCCGCC ACGGCGGAATTCTGGCAAGCCGCCATGGCCAATATTCTGCCATCCGCCATAAGTATTTGTCAAATATGGCCTGGGCATAA GTGATGAGGACACATCATAAATGCAAAGTGTTCCGTAAAGATATACTTGCAAAAGAGATCAGGAATTCTGGATAATGAAA TTTGAATCGGCCTAGATCAAAGAAAGAAGTTCTGTTGAATAAACCAAAATGTTCTGTTTTTAACATGATAGAAGGATACT ATAGCTTACGGATGTGCTTTTCTTCTTCCTTGCTTTATTTAAACGTGGGGTAACAAGGCTATAAAACGGAGATATGTAAA ACGGATTGTTGCAGCTTTCTCCGATTACGCCGACCAAACATATGTCCGGGTTGTTGCAACTACATGTTCCTTATCAAGGT CATGTAAAACGGATTGTTGCAGCTTCCAAGGCTATAATCCCTTGCAACTACTTTAATGTGTGTTTCGTAATTTAGGGGCT GGTAATCATCTGTTTCTCAATGCTGTACTGTAAAACCTTTGGAACAAGCTTTTTGTATGTATGATTGCCTTGGTGTTTAA GTTACCTTCAAACACTTGATTTTATGTTTCTGGAGGTACAAGAAAGGAATATCTGGAGGTGATATACGTTGTCAGAAAGT AGTTTGGTTTATTTAGTTGGCATATATGTTTGCGATGCAATTTTAGGCAGAACTGTTATTGGGCTTTAGAAAAATATATA GTCCATTTGGCATGTTTGTGGCTTGTAGTCTGTGGCATATTGCTATATCAAGCGATTGTGCTTGAGGGATGATTTATGAT GAAATTTTTACTTGACCATTGATATATTATTCTTTTTCAGGCTTCTTTGGAGAAGTCTTCCGTGGTGTATGGAACGGCAC AGATGTTGCTATCAAGGTTTTTCTGGAGCAAGATTTAACTGCTGAAAATATGGAAGATTTCTGCAATGAGATATCTATTC TGAGGTAGCTGGTTGTTTATATTCTGTTTGTCTGACTTCTTCTATCCAACATTTTCTGACTCTTTTTTTGAATTTGGTAT TTGTTTTCCTCCAGCCGACTCCGACATCCTAATGGTAATCTCCAACATTTTGACTATTTTTTTTTATAGTTATGGCTTTG CATTGATCTTGCATATTTTATTTCCTAGGTATGGTAATTAATTAAAGTGAATCTGCATGGGTTCCTTTTACTGATTCATA GTAAAATCTTCGATTCTCATGAGTATGAAAATAATACTATGCAGGCTTGAATGCTTGATTGCAAGAATATATCTTCCAGC ACTTACCCTTCCAGTTGATCTGTTAGTTATTTATTAAGTGATGAAACTGTATGCAGTTATCTTATTTCTTGGTGCATGCA CGAAGCCTCCACGTTTGTCAATGGTCACAGAATATATGGAGATGGGATCATTGTATTACTTGATACATTTGAGTGGTCAA AAGAAAAAGCTCAGTTGGCGGAGGAGACTAAGGATGCTGCGTGACATATGCAAGTAAGATTAAGGTTATGCATAATTATC ACAATGTCTGGCGTTTATGCTAAACAGATGTTACATATTAAATCTTTTCCTCTTCCAATAAATCATAAAGTCCCTGTCCA TTCAATTTGTCAGTGTTTCATGACCTATTTTTTTTCTTTTCCAATTGGATGAAGAGGGTGATAAAAGTTTTTTTTTTTTC ATCAGTCCTTTATTGAGACAGGTGTGATCCATAGTGAACAATGAAAAATGACTGACTTTCCCCATCATGAAAGATAACTG AGACTTACTATTAAATAGAAGGTTTAGGCTTTACTACTGCATGTTATCAAATGCCAGATAACCTACCATTTCAGTGAAGC CATTATACGTTGAATCGAAATTGTGTTTTGTAAGACCACTGCCGGTGTAGACAAATTTCTAGCGCTACCTCTTATTTTTA CTATTAAATAATTTGGGTGGGGTTGTTTTACTTCATTTCGATGTAAATTTGTCTCCCCATATTGAAATGATTTCGTTTGA TCTATGAAAACTGATGAGAACACCTTTGTTGTGTATAGGGGATTGATGTGCATACACCGCATGAAGATTGTTCACCGTGA TGTGAAAAGTGCAAATTGTCTGGTGAATAAGCATTGGACAGTGAAAATCTGTGACTTTGGGCTTTCAAGAATAATGACAG ATTCTAACATGAGAGATTGTTCGTCAGCTGGAACTCCAGAATGGATGGCTCCTGAACTCATCCGAAATGAACCTTTCTCT GAAAAATGTGATATCTTTAGCTTTGGGGTGATAATGTGGGAGCTCTGTACCCTGAACAGACCATGGGAAGGTGTACCACC TGAAAGGGTATAATATATTCAACAGATTTGTGCATTTTCCTTGATGACTTTTACTTCTGTTGTGCAAGGCATTGAAAAAT TTTCATTTTTTCTCTGCTGATGATCAGGTGGTCTATTCTGTTGCTAATGAAGGTTCCAGATTAGAGATTCCTGAAGGCCC GCTAGGCAGGCTGATTTCAGGTTCTACTTCTTTCCCTGTATCACATTTTGATGGCAGAACTTAGACCCATCCGGTTTAAC TTAATTACTTCTGTTTATGTATATTTTTTTGTGCGCAGACTGTTGGGTAGAATCACATGAGCGGCCGAGTTGTGATGAGA TTCTTTCTCGTTTGGTGGACATCGAACACTCCTTGTGCTGATGCAATCCATCTCTTTTGTACATAGAAATCTTTGGGTAG AGTTGTTACATTGTGTTATCGGCTGATGTTGTAGACTCCTGTGAATTTTGTTCTTTTACTCAGGACATGCCAAAAAATGA AACATGCTCTTGTTGTGTTACCCTTGTGCTGCAAAACTCATCTCTATTTGAGGGCAAGGAGAGAATGATGATTCATTCCA TGTCGAATATTTTCTTTGCAATGAAAAAAAAGAATTCTAGTGGAGTACAGCTCTGACTCGACGAGTCCCATGTTGTTATT CCAGATAGGAAGGTAACTGGTTATGCTATGAAAAACTTAAGGGCTTATATAAGTTTTA
CDS sequence (LotjaGi3g1v0240700.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAGGAGACACGAGAAGATGCAGGGCCGGCAGAGCAAGGGCCATCTAATGCTAATAAATCATGGTGGCCTTCAGATTT CATTGAAAAATTTGGATCAGTTTCTTTGGATTGTCAAGATGAAACCTTAAATGATAAAGAATCTCCTAGACATTCTGACA AATATGTTTTATCACCTCAGAAAGCCTCACAAATTCTCTGGCTCACTGGAATGCTTTCAGAACCAATACCCAATGGTTTT TATTCAGTCCTTCCGGAGACAAGACTCAAGGAACGTTTTGATAGTATTCCTACCTTGGATGAGCTTCATGCTCTGGGTGG AGAGGGTTTAAGGGCTGATGTCATTCTTGTGGATTTAGAGAAAGATAAGAAGCTATCCATGGTGAAGCAACTGATTGTGA CATTAGTCAAAGGATTAAACTCAAACCCAGCTGCAATAATTAAGAAGATAGCTGGATTAGTTTCTGATTTTTATAAGCGA CCCAATGTGGAAAGTCCAGCAAAAGCTGCACTAGATGAAACGCCTCACATGTTTGAGAATCGACTTGTCCAGATGTTGGG GCAAATAAAGCATGGTTCATGCCGTCCTCGGGCTATCTTATTCAAAGTATTAGCTGATACTGTAGGGCTTGAAAGTAGGC TCATGGTGGGCTTGCCAAATGAAGGGGCTATTGGATGTGGAGATTCACACAAGCATATGTCTGTGACAGTTGTGTTAAAT TCGGTGGAAATGCTGGTTGACTTAATGCGATTTCCGGGCCAATTGTTACCAAGATCAACCAAGGCAGTTCTTATGACTCA TATTTCCGCAGCAGGAGAGAGTGATTCAGCAGAAAATGATTCCTGTGATTCACCATTAGAACCAAACAGTCCTTTATTTG GAGTTCCGGAGAGTGCTGAGAAGGAGGAAAACCTCCAATTCCATAAAAAATTTGAAATGTCTTCAAATGCGTCAGGCCTT TCCTTGAGAAACATGATGTTACGATCAAATAGTTGTTTGAGTTTATCTCATAGTGAACCCAACATTGCAACTGCATTTGG TCGGCGTAATCGGAGAAAGGTCATTGCTGAACAGAGGACAGCTAGTTCAAGTCCAGAACATCCCTCATATCGAGCCCGTG CACGGTCCTTACTTAGTGGTGATAGGAAAGCTTTCAGAGAATTTGCTGATGACCAGGCCACATCAAGATCCAGCTATAGG TCAGATGGTGCGTCCTCATTAGAACCTCGTAGGATACGAAGAAGAAGCATCAGCATTACACCAGAGATTGGTGATGATAT CGTAAGGGCTGTACGGGCAATGAATGAAACACTAAAGCAAAATCGTCTTCTGAGAGAACAAGGGGATGATAACTCATTCT CCCATTCTCCAAACAACAGAAGTACTGATGCAAATCTTCAGAAAAATGTGCCAAATTCTCATCCTGATGGTCATAATGAA AGGTTGGCCTTATATTCTCATCAGTGTGACCAAGGAACTTCGCAAAAAGCAATGTCGTTGCCGTCTTCGCCACAGAACTA TAGAGGTCAAGCTTCTGAGAGAAGTGGGCCTTCAAGATATGGAGTGAATGATGAGACAGAATCGACTTGGAATAAAGTAC TTGAATCCCCGATGTTCAATAATAGACCCCTACTAGCATATGAGGAATGGTATATTGATTTCTCAGAGATAACTGTTGGA ACTCGTGTAGGGATTGGCTTCTTTGGAGAAGTCTTCCGTGGTGTATGGAACGGCACAGATGTTGCTATCAAGGTTTTTCT GGAGCAAGATTTAACTGCTGAAAATATGGAAGATTTCTGCAATGAGATATCTATTCTGAGCCGACTCCGACATCCTAATG TTATCTTATTTCTTGGTGCATGCACGAAGCCTCCACGTTTGTCAATGGTCACAGAATATATGGAGATGGGATCATTGTAT TACTTGATACATTTGAGTGGTCAAAAGAAAAAGCTCAGTTGGCGGAGGAGACTAAGGATGCTGCGTGACATATGCAAGGG ATTGATGTGCATACACCGCATGAAGATTGTTCACCGTGATGTGAAAAGTGCAAATTGTCTGGTGAATAAGCATTGGACAG TGAAAATCTGTGACTTTGGGCTTTCAAGAATAATGACAGATTCTAACATGAGAGATTGTTCGTCAGCTGGAACTCCAGAA TGGATGGCTCCTGAACTCATCCGAAATGAACCTTTCTCTGAAAAATGTGATATCTTTAGCTTTGGGGTGATAATGTGGGA GCTCTGTACCCTGAACAGACCATGGGAAGGTGTACCACCTGAAAGGGTGGTCTATTCTGTTGCTAATGAAGGTTCCAGAT TAGAGATTCCTGAAGGCCCGCTAGGCAGGCTGATTTCAGACTGTTGGGTAGAATCACATGAGCGGCCGAGTTGTGATGAG ATTCTTTCTCGTTTGGTGGACATCGAACACTCCTTGTGCTGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0240700.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MEETREDAGPAEQGPSNANKSWWPSDFIEKFGSVSLDCQDETLNDKESPRHSDKYVLSPQKASQILWLTGMLSEPIPNGF YSVLPETRLKERFDSIPTLDELHALGGEGLRADVILVDLEKDKKLSMVKQLIVTLVKGLNSNPAAIIKKIAGLVSDFYKR PNVESPAKAALDETPHMFENRLVQMLGQIKHGSCRPRAILFKVLADTVGLESRLMVGLPNEGAIGCGDSHKHMSVTVVLN SVEMLVDLMRFPGQLLPRSTKAVLMTHISAAGESDSAENDSCDSPLEPNSPLFGVPESAEKEENLQFHKKFEMSSNASGL SLRNMMLRSNSCLSLSHSEPNIATAFGRRNRRKVIAEQRTASSSPEHPSYRARARSLLSGDRKAFREFADDQATSRSSYR SDGASSLEPRRIRRRSISITPEIGDDIVRAVRAMNETLKQNRLLREQGDDNSFSHSPNNRSTDANLQKNVPNSHPDGHNE RLALYSHQCDQGTSQKAMSLPSSPQNYRGQASERSGPSRYGVNDETESTWNKVLESPMFNNRPLLAYEEWYIDFSEITVG TRVGIGFFGEVFRGVWNGTDVAIKVFLEQDLTAENMEDFCNEISILSRLRHPNVILFLGACTKPPRLSMVTEYMEMGSLY YLIHLSGQKKKLSWRRRLRMLRDICKGLMCIHRMKIVHRDVKSANCLVNKHWTVKICDFGLSRIMTDSNMRDCSSAGTPE WMAPELIRNEPFSEKCDIFSFGVIMWELCTLNRPWEGVPPERVVYSVANEGSRLEIPEGPLGRLISDCWVESHERPSCDE ILSRLVDIEHSLC
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 812 | 812 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1 | 812 | 812 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 1 | 23 | 23 | - | – | |
| Pfam | 59 | 256 | 198 | 1.0E-53 | – | |
| MobiDBLite | 274 | 295 | 22 | - | – | |
| MobiDBLite | 388 | 409 | 22 | - | – | |
| MobiDBLite | 442 | 480 | 39 | - | – | |
| MobiDBLite | 450 | 473 | 24 | - | – | |
| MobiDBLite | 493 | 524 | 32 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 532 | 805 | 274 | 9.84E-78 | ||
| Gene3D | 551 | 635 | 85 | 2.4E-30 | – | |
| ProSiteProfiles | 557 | 813 | 257 | 40.16 | ||
| SMART | 557 | 806 | 250 | 7.1E-60 | ||
| Pfam | 558 | 805 | 248 | 5.7E-61 | ||
| CDD | 563 | 805 | 243 | 9.92738E-119 | – | |
| ProSitePatterns | 563 | 584 | 22 | - | ||
| Gene3D | 636 | 811 | 176 | 1.5E-53 | – | |
| ProSitePatterns | 676 | 688 | 13 | - |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein kinase activity | Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP. | ||
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. | ||
| Biological process | Protein phosphorylation | The process of introducing a phosphate group on to a protein. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0240700.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…