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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0330100 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0330100.2 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Peroxisomal targeting signal 1 receptor; TAIR: AT5G56290.1 peroxin 5; Swiss-Prot: sp|Q9FMA3|PEX5_ARATH Peroxisome biogenesis protein 5; TrEMBL-Plants: tr|K7KJI6|K7KJI6_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0330100 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:69759648..69774198) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GTGTTTTGTTTATATCTTTGTACATTTCAGCTGTGAGCTGACCTTTTATTTTATTAGTCAAACTTTTAGCATCATCACAT TTTAGGTTATAGGCTTATAGCTCTACCAAATTTTACTCAGGAACTACCGGATATGTTGCAAGATTGTCCTTAAATAAAAT GCCTTCATTCTATTTCTTTTGACTTGATTGTTTAACTCTTGAGTTATCACATATAATCACTTTTCAGGTAAATGCACTTC TATGCTCTCTAGATATTGACAGTAATGTCCGTGGTAAGGGACCTATGCCTGAAAGACTTCGGGAGCTTGAGGATTACTGG AATGAGTCTCAAGGCAACCAGAGACTTGGTGCTCATCCTGCAGACGGATGGATTACGGAATTCAGTCAAAATAGGGAAAG ACATGATAATCCTGATTCTTGGGCCAACTCATTTGAGCAACAGCACGGTGCGAATGGTTGGGCTTCTGAATTTGAACATG TGAGAAGTCTTTATTGTTCTATTTCTAGCTATAATTCAAAGTTTCTTAATCTTTTTAATCTTTAAATCAACCCAGTATTG AGTCACTCTGATAACGCATGATTCAAATCCCTGAGCTGCTGAATTGACTGCTGCGGTCCTGCTGCAAATATTATAGGATT GCTAACAAAATTGTGGTTAAAGTTTCTCAAATGCCGAATTTGATATAATTTTAGACCTGTGGTATACCCAGTTCTGGTCA ATCCATGAAGTCTCCCAAACAAGTTCATCTTATAATTATGTAGTGGAGATTACTTCCTCAATTTTGCTTTTTGTTGACTG GCAAGTTTAAATTTTAGGTTTTCATAGCCTTGGATGTTTCTTCAACAGCCTTTTCCACCATTGCACGACTTTTTCCTTTT AGTTTAAATTTCACAATCTATACAGGCTTCCCTTAAAAAGAACTCTCCATCTTGATGTTGGTATCCATCAACTGTGCATA GCACACATATCAGGAGAAAGGCTTGTGTAAGGAATGCCATGAGAATATATCTGGCAGTTTGATGTATTTTGTGTTTTGAG ATTATCATAATTTCAGTCAGGATATCCAAAATGGGTAGAACCCAAGTAATGAAGTCATGCAATAAAATTTTAACCAATAA TGGGAAAGAGGCATCCTTTTTCTCCACACAATGTGTCTTTGATGGAATGCACTCTTTTTTCAACGGTCTTGATGTTGGTA TCCATAGGCATGGATTATGTTGGTATTTGTGGATATTATATTAATCGATGTCTCAATATTACCTTGATATTATTAAATTA ATTAACTTTCTATATTTCTTAAAAAATAATTCTCTCTTGCAGTCTCAATTGTCGTCAGTAGATCAAATGCGAGGTATGAA CATGCCAAACTTTGCTGCAATGGAGCAGACTCGTATGCTCGCAAATACATTGGCCCAGAATGCTGACCCTAAATTCCAGG TTTATTCACTGTTCATATCTTTTATATTTCTATTTCGCAAGGGTGTAAATCATTGCAATCTAGTATCTTATTATGAGATT AAAGAAGATGCAAGTTCAACAGGTTTTGGGTTTTATTAATTTACTTTGCTCTCTGTTCACTATGTTTGTCTTTCTGTTCT AGCTAATGTATATTATTACACAGACACATATTTTTGGATCCGGTATCATTGGTCGAATATTTTTTCATATTTTTCCTTAG AAACTTTTCGCACATCCATATTAGGCCTGTCCACCGGTCGGGTTCGGTCGGATTCGGGCCCAAAAAGCTCCACCGACCGA ACCCGCATGAGACAAAACTGGGCCCATAACCGACCGTGGGTTGTGTCGGTTTGGGTCGGTTTCGGGTTGGTCGGGTAACG GGCGGGTCGGGCGGGTTCTACCGGGTTTGCAGAGAACATCAGAACAGAAAGATGAAGAGCATAGAACAAATTAACCAAGA 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GGTGGTCATCTAACCATCTATAAGCTAGGGAGTTTATAATGACTCTTCAAATACTAGTTTTAGCTATTTTTTAGAGTATA TCGCTGGTCTATAGTTGTGTTCATGTACCTGATGTTTCCTAGTGGTTTTATGGTTAAGTATTCTATATATTTCTGTGTTA AGCAGGAAAAAATGTAGGGACTAGGTAGCCTACGAAGAACAGTCATGCTTTTTTTTGTTCGATATAAATTAACAGTCTTT TCTGAAGTTTTGAAGTTATGGACTTTTTAAGGAAACATGGATTTTTAAGGACGTATATGAAAAAGATATGGTTTTAAGAA ATTTTTGGAGTTGTTATTAGGCTTAGGATGTTGTTAGTACTTAGAATGAACTGTGCAGCCTGGACATATGCATGTACTAC ACTTGTGCAAGTAGGAAAAAAATGGTATTTGTGATGTAAGGTTCGCAGGCAGATCACTAATTCTAGCTTAGAGGTGAAAA TTGGACACTTTATGTTAGGATGTATTATGTATCAATAGGTCCAAATGAGGACAGCCTGTTCTGTTATGAGTTAGTTCATT AGTGGTAGGTAACTCTTAGAGACAGTTAGAGAATTATTAAGTTTTTGTCCTTTATTTGTATCATGGTTAACACATTTTAA TCTGTAGCACCCTAATGTGGAAAAGATGGTTGAATCCTTTCTTAGGTGGTTTGAGCACGTGTGAGCATGACATAGAAATC CTAGTAAGGAAATTAGTTTTGATGGATGGAATTCCTTTTACAAAAGGGAAAAGGAGACAAAGAAGACTATAAGTCAACCC ATTGGAGATTTAGGTTTAAATGGTTAGTCATGATTGAATATTATGGTCTCATTTGGTCCATATGGCCGACTCATCTAGTG GGAAAAGAATGTTGTTGTTGTGTTTCATCTCCAAAAACATTTTTGAGTTAAACTGCTCCGCGGTGTTGTGAGATACTACT 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AATATAGGTCGAAATTTGTCACTCTCAAAGTTTAATCTTTTTCTCTATGTTTGTTTTTTTTATATATTTTTTAGTATAAA TATTCAGTTTGTCATATTTTTCTAGGACTAATTTTTCTAAAAGCTTAAGCTATGAAGGTAAGCTCTAGATTTTTGTTTGG TCTGACATGCTCCCTTACCCTTACATGATAACACTGGGGTTTGAAGCATGGACAATATACAAATCTGTTTTACCCTGTAT TGAACTTTTAACTTTATTTAGAAGAAAGGAGATAGAAAGGATCAAACTTATGATTTATGACCACTAGGTGATAAAAATTA TAATAGGTCAATGACCTATTTTAAATACTTATTTTGATTCAGCATCAACAAAGTGTTATTGGCCTAAAAAAGCCGAAGTG TTTCTATTTGGTATATAAAATTAAACCTTCATTATCAAAATAGTGACTTCTAATTAGCCCATTGTTAGTTTTTGGCATCG AATTGGTCCTTCAAAAGACTAATTTGAGGTCAAAATTTTACATCATTGGACCAGAGGACCAAATTGATAATGCTTGGGCA TTTAGAAGACTAAAATGAGTGTTTACTTTTCATTTAGGGGGAGGGGAAGACTTATTTTTCCTTTTCAAATAAATAGTATT TAATTTTTTAAAATATAAGTATGAAATGGTAAATTAGTATAAATATAATATCCTTGTAATTCATTTATGATCATAAATAT TATATAATTCCCTTAATTTAAAATAGTGAGTTGTATCTTAATTGTTTTATGAATATACTAATTTGCTTTACCTTTCACAT TTCCTCACAGGGCATGTACGATGAGTCTATTCGTTATTATGTTCGGGCACTTGCCATGAATCCAAAAGCAGAGAACGCAT GGCAATATTTGAGAATTTCATTGAGGTACTGCTTTAAACTTTAGAAAGTAACGGCGAAAAGTTGACTGGGGGAAATGGAG 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CDS sequence (LotjaGi3g1v0330100.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCCTGAAAGACTTCGGGAGCTTGAGGATTACTGGAATGAGTCTCAAGGCAACCAGAGACTTGGTGCTCATCCTGCAGA CGGATGGATTACGGAATTCAGTCAAAATAGGGAAAGACATGATAATCCTGATTCTTGGGCCAACTCATTTGAGCAACAGC ACGGTGCGAATGGTTGGGCTTCTGAATTTGAACATTCTCAATTGTCGTCAGTAGATCAAATGCGAGGTATGAACATGCCA AACTTTGCTGCAATGGAGCAGACTCGTATGCTCGCAAATACATTGGCCCAGAATGCTGACCCTAAATTCCAGAACTCTAA ATTCCTTCAATTTGTCTCAAAGATGAGCCGTGGTGAGTTGATTATTGATGACAATCAAGTTAAAGAAACTGCATTACCTG CATCTGGAGATTGGGCCGGAGAATACCAACAGCAATATAATAATGATCATGGATGGGCTGGTGAATATTTAAATAATAAG GTTTATAATGGACCTGATCAGTGGGTGAATGAATTTACGACCGAAGGACAGCAGCATGGAGCAGTTAATGATCAGTGGGT TGATGAATTCTCAAAGTTGCATGTTAATGACTGGGCTGAGGAATTTGGTGATCAGGTTGGTGAAGGAGCTTTAGGGGAAT CTGATAATTGGGCACAGGCATATGATGAGTTCCTAAACGAGCAAGTTGTTGCCAAGCAGCGGTTAGATAGTTCAAGCGGT GTGTATGTCTTCTCAGATTTAAATCCTTATGTTGGTCATCCAAATCCACTAAAAGAAGGCCAAGATCTCTTCAGAAAAGG ACTTTTAAGTGAAGCAGTTCTAGCACTGGAAGCTGAAGTCTTGAAAAACCCAGAAAATGCTGAAGGGTGGAGACTACTTG GAATAGCACATGCAGAGAATGATGATGATCAACAGGCTATTGCAGCAATGATGCGTGCACAGGAGGCTGATCCTACAAAC TTGGAAGTGCTTCTTGCTCTTGGTGTCAGTCATACAAATGAACTGGAGCAATCGGCTGCTCTGAAATATCTTTCTGGATG GCTACGTCATCACCCGAAATACGGAACACTTGCCCCGCCTGAGATGTCTGATTCCTCTTTGTACTATGCTGATGTTGCTA GATTATATAATGAAGCAGCTGAGGTCTCACCTGATGATGTAGATGTCCACATAGTTCTTGGGGTCCTGTATAACTTATCC AGGGAATATGACAAAGCCATTGCATCTTTTGAAAGGGCATTGAAACTTAAGCCACAGGATTACTCTCTCTGGAACAAGCT TGGCGCAACACAAGCAAACAGTGTTCAAAGTGCTGATGCAATAATGGCTTACCAGCAGGCACTAGATTTAAAGCCTAATT ATGTTCGTGCTTGGGCAAATATGGGTATCAGTTATGCAAACCAGGGCATGTACGATGAGTCTATTCGTTATTATGTTCGG GCACTTGCCATGAATCCAAAAGCAGAGAACGCATGGCAATATTTGAGAATTTCATTGAGCTGTGCTTCCAGGAATGACTT GTTGGAAGCTTGTGATAGTCGTAATCTAGACCTTCTCCAGAAGGAGTTTCCCCTACAGTAA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0330100.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MPERLRELEDYWNESQGNQRLGAHPADGWITEFSQNRERHDNPDSWANSFEQQHGANGWASEFEHSQLSSVDQMRGMNMP NFAAMEQTRMLANTLAQNADPKFQNSKFLQFVSKMSRGELIIDDNQVKETALPASGDWAGEYQQQYNNDHGWAGEYLNNK VYNGPDQWVNEFTTEGQQHGAVNDQWVDEFSKLHVNDWAEEFGDQVGEGALGESDNWAQAYDEFLNEQVVAKQRLDSSSG VYVFSDLNPYVGHPNPLKEGQDLFRKGLLSEAVLALEAEVLKNPENAEGWRLLGIAHAENDDDQQAIAAMMRAQEADPTN LEVLLALGVSHTNELEQSAALKYLSGWLRHHPKYGTLAPPEMSDSSLYYADVARLYNEAAEVSPDDVDVHIVLGVLYNLS REYDKAIASFERALKLKPQDYSLWNKLGATQANSVQSADAIMAYQQALDLKPNYVRAWANMGISYANQGMYDESIRYYVR ALAMNPKAENAWQYLRISLSCASRNDLLEACDSRNLDLLQKEFPLQ
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 525 | 525 | 7.1E-210 | – | |
| PANTHER | 1 | 525 | 525 | 7.1E-210 | ||
| Gene3D | 235 | 526 | 292 | 1.2E-98 | ||
| SUPERFAMILY | 238 | 525 | 288 | 1.14E-95 | ||
| ProSiteProfiles | 253 | 488 | 236 | 36.883 | ||
| Pfam | 257 | 319 | 63 | 5.7E-5 | – | |
| ProSiteProfiles | 287 | 320 | 34 | 9.263 | ||
| SMART | 287 | 320 | 34 | 1.2 | ||
| ProSiteProfiles | 321 | 354 | 34 | 5.487 | ||
| SMART | 387 | 420 | 34 | 2.5E-5 | ||
| ProSiteProfiles | 387 | 420 | 34 | 12.744 | ||
| Pfam | 388 | 420 | 33 | 1.0E-6 | ||
| ProSiteProfiles | 421 | 454 | 34 | 8.88 | ||
| SMART | 421 | 454 | 34 | 0.071 | ||
| ProSiteProfiles | 455 | 488 | 34 | 12.213 | ||
| SMART | 455 | 488 | 34 | 2.5E-6 | ||
| Pfam | 456 | 487 | 32 | 1.2E-8 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0330100.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
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