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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0330100 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0330100.3 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Peroxisomal targeting signal 1 receptor; TAIR: AT5G56290.1 peroxin 5; Swiss-Prot: sp|Q9FMA3|PEX5_ARATH Peroxisome biogenesis protein 5; TrEMBL-Plants: tr|K7KJI6|K7KJI6_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0330100 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:69759648..69775026) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TTATCAAATGTAAAAAAAGGTAATGGAAGTGCATGGGGGCTAAGGTCTTTGAGGTTGGTTGTTTTTTAGTTGGCCTGCTT TAGGTTCATTGGGAGTGACTTCTGATGCAGTGCTTATCTTTTAGAATTGCCATCCTGTTTGCATAATTTCCTTTGACGTG TCCCTTTGTTGAGCTTTAGTTGACGTGCTATAGTTTGTAGCATTTGTCCCATGGACTCAATGCTATTTTGATGCTTTGAG ATTGGTAAAATAAAATCAGAGATATCAAATTGATGTTTGTTCTTTTTGCTATATATCAGGGACACCACAAAGAGTTCTAT CTAGCTTTTTGCACTCATTTCTTGATAGCAGCCGTGGTGGAATACCTTTTCATCCTGCCCCTCTTCCAATGTTGGGTTTA TCTGAAGGTGATAAACAATGCATTCGTGACCGCAGCAGCATAATGGCGAGGCATCTCTTTGCAGATAAAAATGAAGAGTT TATCAATGCCCAAGTAAGGAAATTCATGAATAGGTTCATCTGGTTTCAGTTAACTTCTTTTTCACTTATTTAGGTTGCCA CACGCATATAAACATAATGATCTAAAAACTGAACTGATCATTGAGGGAAGTTGATGTTTTTTTAAATGGTTGTGGGTGGT TAGACTTCAATGTTTTCAATAGGTACAAGAGGGTTCACCTAATCTCTGATGTGAGTTGCGGAAGAGGTTCCTCCTTGTTA TCTGCTTTCAAGTTATATCAAAATGACTTTTAAAAACTTATTTTTTTTAATGCAAATTAACATGAGAATATGAGATTATG CTGGCTTGGAGTAACTTCAGTCTCATAGGTGTTTTGTTTATATCTTTGTACATTTCAGCTGTGAGCTGACCTTTTATTTT ATTAGTCAAACTTTTAGCATCATCACATTTTAGGTTATAGGCTTATAGCTCTACCAAATTTTACTCAGGAACTACCGGAT 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CTATTTTAATTAGCCCATGTGTCTTTTTAGAGGGTTTCCATAGAAAATGAGCGAAGTAATTGGTGGGTTCAAAAGAAGGG TAGAGAAGAGGGGAACACTCAAACATCAAGGGTACTAATCTAACTGATTACAGACTGTGTTTTGTATTATACACAAGTTA AGGGTTAATTAAATATTTTATTAACATATTATCCCAGCCCATTATCTTCACATTTCCATGAAGCTGGACTGCAGATTTTA CCATTCATGCTTATTACATATGCTATCAGTCCTCACCCGAGCAAGGGCCTTCGTAATTGAAGAAGTTTTTGTTCACACTT CTCCCACACTTACATCAAGTGAGAGAAAGGAAGAAAAGAGAGAGAATGAGAGATATGTTAGGTGATGTGATTGTAAGATA AGAGAGATAGGAAGAGAAAGTGAATGGAAATGAGATGGAAGAGAAAGAAGAGTTTGAATGAGTCAAAACTTTTTGTAATT ATATCTTTTCAGTTGTTTTTTTTTAATATACTACCAAATAGAAATAAGGGCTCGCAGAATTTTCCCTATAATATGACAAT CCATTCAGTATGTTTTGATGTTATGAAGTACTGGGTTAGATAAAATATGGGTGACAGTTTGATTATCGTACTAATCTTGT TAGAGTTGTTGGAAGAGGCTGATGCAACTTCACTGCACAAGTATTTAAGCCTCATAAGGTCATAAAAGTTGATCTGTGAC ATGAAGATCAGCATGTATGCTGGACCTTCCCACCTCTTTCTGCTTCTTACTCTTTTTGAAGCTGAGATTCATAAGACAAA CATTCTGACATTGTTAGGGTGGGATTAACCCAAACAGAACAAACAAAAGAATTGGGATAAAAGGGTAATTCTCTGAATAA AATCAGTGTTATCATATATCTGCCATGACGGTGCCAAGGTGGTTTCTCATGGTGGTTTTTTGGCTTACCGCCATATGGCC 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TGAAGGTAAGCTCTAGATTTTTGTTTGGTCTGACATGCTCCCTTACCCTTACATGATAACACTGGGGTTTGAAGCATGGA CAATATACAAATCTGTTTTACCCTGTATTGAACTTTTAACTTTATTTAGAAGAAAGGAGATAGAAAGGATCAAACTTATG ATTTATGACCACTAGGTGATAAAAATTATAATAGGTCAATGACCTATTTTAAATACTTATTTTGATTCAGCATCAACAAA GTGTTATTGGCCTAAAAAAGCCGAAGTGTTTCTATTTGGTATATAAAATTAAACCTTCATTATCAAAATAGTGACTTCTA ATTAGCCCATTGTTAGTTTTTGGCATCGAATTGGTCCTTCAAAAGACTAATTTGAGGTCAAAATTTTACATCATTGGACC AGAGGACCAAATTGATAATGCTTGGGCATTTAGAAGACTAAAATGAGTGTTTACTTTTCATTTAGGGGGAGGGGAAGACT TATTTTTCCTTTTCAAATAAATAGTATTTAATTTTTTAAAATATAAGTATGAAATGGTAAATTAGTATAAATATAATATC CTTGTAATTCATTTATGATCATAAATATTATATAATTCCCTTAATTTAAAATAGTGAGTTGTATCTTAATTGTTTTATGA ATATACTAATTTGCTTTACCTTTCACATTTCCTCACAGGGCATGTACGATGAGTCTATTCGTTATTATGTTCGGGCACTT GCCATGAATCCAAAAGCAGAGAACGCATGGCAATATTTGAGAATTTCATTGAGGTACTGCTTTAAACTTTAGAAAGTAAC GGCGAAAAGTTGACTGGGGGAAATGGAGGATGAATTTTCAAATTATTTGTTAATTTAAATTCCTGGGACTTGACTCCTTG TACCTTCTATTATCCAGCTGTGCTTCCAGGAATGACTTGTTGGAAGCTTGTGATAGTCGTAATCTAGACCTTCTCCAGAA GGAGTTTCCCCTACAGTAA
CDS sequence (LotjaGi3g1v0330100.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTTGGGTTTATCTGAAGGTGATAAACAATGCATTCGTGACCGCAGCAGCATAATGGCGAGGCATCTCTTTGCAGATAA AAATGAAGAGTTTATCAATGCCCAAGTAAATGCACTTCTATGCTCTCTAGATATTGACAGTAATGTCCGTGGTAAGGGAC CTATGCCTGAAAGACTTCGGGAGCTTGAGGATTACTGGAATGAGTCTCAAGGCAACCAGAGACTTGGTGCTCATCCTGCA GACGGATGGATTACGGAATTCAGTCAAAATAGGGAAAGACATGATAATCCTGATTCTTGGGCCAACTCATTTGAGCAACA GCACGGTGCGAATGGTTGGGCTTCTGAATTTGAACATTCTCAATTGTCGTCAGTAGATCAAATGCGAGGTATGAACATGC CAAACTTTGCTGCAATGGAGCAGACTCGTATGCTCGCAAATACATTGGCCCAGAATGCTGACCCTAAATTCCAGAACTCT AAATTCCTTCAATTTGTCTCAAAGATGAGCCGTGGTGAGTTGATTATTGATGACAATCAAGTTAAAGAAACTGCATTACC TGCATCTGGAGATTGGGCCGGAGAATACCAACAGCAATATAATAATGATCATGGATGGGCTGGTGAATATTTAAATAATA AGGTTTATAATGGACCTGATCAGTGGGTGAATGAATTTACGACCGAAGGACAGCAGCATGGAGCAGTTAATGATCAGTGG GTTGATGAATTCTCAAAGTTGCATGTTAATGACTGGGCTGAGGAATTTGGTGATCAGGTTGGTGAAGGAGCTTTAGGGGA ATCTGATAATTGGGCACAGGCATATGATGAGTTCCTAAACGAGCAAGTTGTTGCCAAGCAGCGGTTAGATAGTTCAAGCG GTGTGTATGTCTTCTCAGATTTAAATCCTTATGTTGGTCATCCAAATCCACTAAAAGAAGGCCAAGATCTCTTCAGAAAA GGACTTTTAAGTGAAGCAGTTCTAGCACTGGAAGCTGAAGTCTTGAAAAACCCAGAAAATGCTGAAGGGTGGAGACTACT TGGAATAGCACATGCAGAGAATGATGATGATCAACAGGCTATTGCAGCAATGATGCGTGCACAGGAGGCTGATCCTACAA ACTTGGAAGTGCTTCTTGCTCTTGGTGTCAGTCATACAAATGAACTGGAGCAATCGGCTGCTCTGAAATATCTTTCTGGA TGGCTACGTCATCACCCGAAATACGGAACACTTGCCCCGCCTGAGATGTCTGATTCCTCTTTGTACTATGCTGATGTTGC TAGATTATATAATGAAGCAGCTGAGGTCTCACCTGATGATGTAGATGTCCACATAGTTCTTGGGGTCCTGTATAACTTAT CCAGGGAATATGACAAAGCCATTGCATCTTTTGAAAGGGCATTGAAACTTAAGCCACAGGATTACTCTCTCTGGAACAAG CTTGGCGCAACACAAGCAAACAGTGTTCAAAGTGCTGATGCAATAATGGCTTACCAGCAGGCACTAGATTTAAAGCCTAA TTATGTTCGTGCTTGGGCAAATATGGGTATCAGTTATGCAAACCAGGGCATGTACGATGAGTCTATTCGTTATTATGTTC GGGCACTTGCCATGAATCCAAAAGCAGAGAACGCATGGCAATATTTGAGAATTTCATTGAGCTGTGCTTCCAGGAATGAC TTGTTGGAAGCTTGTGATAGTCGTAATCTAGACCTTCTCCAGAAGGAGTTTCCCCTACAGTAA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0330100.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MLGLSEGDKQCIRDRSSIMARHLFADKNEEFINAQVNALLCSLDIDSNVRGKGPMPERLRELEDYWNESQGNQRLGAHPA DGWITEFSQNRERHDNPDSWANSFEQQHGANGWASEFEHSQLSSVDQMRGMNMPNFAAMEQTRMLANTLAQNADPKFQNS KFLQFVSKMSRGELIIDDNQVKETALPASGDWAGEYQQQYNNDHGWAGEYLNNKVYNGPDQWVNEFTTEGQQHGAVNDQW VDEFSKLHVNDWAEEFGDQVGEGALGESDNWAQAYDEFLNEQVVAKQRLDSSSGVYVFSDLNPYVGHPNPLKEGQDLFRK GLLSEAVLALEAEVLKNPENAEGWRLLGIAHAENDDDQQAIAAMMRAQEADPTNLEVLLALGVSHTNELEQSAALKYLSG WLRHHPKYGTLAPPEMSDSSLYYADVARLYNEAAEVSPDDVDVHIVLGVLYNLSREYDKAIASFERALKLKPQDYSLWNK LGATQANSVQSADAIMAYQQALDLKPNYVRAWANMGISYANQGMYDESIRYYVRALAMNPKAENAWQYLRISLSCASRND LLEACDSRNLDLLQKEFPLQ
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
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| SUPERFAMILY | 292 | 579 | 288 | 1.48E-95 | ||
| ProSiteProfiles | 307 | 542 | 236 | 36.883 | ||
| Pfam | 311 | 373 | 63 | 6.6E-5 | – | |
| ProSiteProfiles | 341 | 374 | 34 | 9.263 | ||
| SMART | 341 | 374 | 34 | 1.2 | ||
| ProSiteProfiles | 375 | 408 | 34 | 5.487 | ||
| ProSiteProfiles | 441 | 474 | 34 | 12.744 | ||
| SMART | 441 | 474 | 34 | 2.5E-5 | ||
| Pfam | 442 | 474 | 33 | 1.2E-6 | ||
| SMART | 475 | 508 | 34 | 0.071 | ||
| ProSiteProfiles | 475 | 508 | 34 | 8.88 | ||
| SMART | 509 | 542 | 34 | 2.5E-6 | ||
| ProSiteProfiles | 509 | 542 | 34 | 12.213 | ||
| Pfam | 510 | 541 | 32 | 1.3E-8 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0330100.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…