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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0479600 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0479600.2 |
| Related isoforms 4 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | DNA polymerase epsilon catalytic subunit A; TAIR: AT1G08260.1 DNA polymerase epsilon catalytic subunit; Swiss-Prot: sp|F4HW04|DPOE1_ARATH DNA polymerase epsilon catalytic subunit A; TrEMBL-Plants: tr|G7JKW4|G7JKW4_MEDTR DNA polymerase epsilon catalytic subunit A; Found in the gene: LotjaGi3g1v0479600 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:89621046..89646866) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGAGCGGCGACGGCCGGAGATGGGACCGGAGAGACGCCGGCAACTCCAAGAAGCAGAAGCTGATCCGCAACGCCGAGGA AGAGCTCGAGGCGAAGTTAGGGTTCGATGTTTTCTCCGAGGGCAAAAAACGCCTCGGATGGTTGCTCACTTTTGCATCTG TAAGCACATTCATTCTTCCTCTTCAATTTCATCAATCGATTGAACTGTTGTATTACTCAATTTCTTGTTCTACTAGCTAC AGTTGCTGTTGTTATTGTTGCTTCCACTGTAATTGTTACTTGATTTGCTTCTGTAATTTTGATTCGAACTAATCTATTGT TTTCTACTACTGAAATTGCACATTATGCAGCATCTGTTCACTTTCCATGAGAAGTAGTAGAGTTTTTCGTTTCCAAACTA TGATTTGTGGTCATTTTCCTGTAGAATGTTATTCAAAAGGACTAATTCATGCTTTTTACCATATTTGCAGTCATCTTGGG AGGATAACGATACCAACAAAGTCTTCAGTTGCGTTGATCTTTACTTTGTTACACAGGTATTGTACAAGTTCAACTATAAT GCTTCTCTACAAATATATGAAAACCGGAATCCGGCACTTTTGTAATTGAAGTTGAAACAGAAAATTAAAATAGAATGAAA AAAAAGCCCCAAACAGGCGCTTCTCGCTAGTTTTTCCACGAGAAGGGGACCTGGTTCAGTTAATAGTTCAGTAATTGGAG TCTGCTTGTTGCAGGATGGGTCCACGTTCAAGTCAAAATACAGATTTCGTCCTTATTTTTATGCAGCTACAAAGGTGAGT GAACACCTTCTCAAGCATCAGTATACAATTGAATTGCAAGATACTTGGTTTTTTATGTATTTATTGTGATTTTGTGTTTA TTTTGTGATTGCCATCATGTTGGTGGTGTTAATTATGATTATATAATTTTGCTAGGATAAAATGGAGATGGATGTTGATG 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TTTTTATATCTTAATTTACTATAATGCTTGAAGAATTTTTTTTGTTAGGACATTCAAGAAAGGAGCACAATTAGGTTTCA TTTTAAAAATATGTAACTATGCTTCTCTGTTGTGTCTAGATTCCTTTAGCTGCTAAGTGCAAATAAAGTTAACCATATAC TTGATTACTTATTACTTTGTCTCTCTGGTGTGGTATATTATAATCATTACATGGGTAAGAATAATTATGGCCATGCGAAG GGGACTTCATAGCCTAAATGGGACTTACGAACTATATTGTAGCCCAAAGGAGACATGATACCAAAGAAAATCATTACATT TTGGGCTACACTGGCTTTCACTTGTCTACTTGTTTCCGAGAATCTAGTAACTTTAATATTGTATAAAACTAGAAGCTAAA GTCCATACCATGTTTTTCTATAATCTTTTAATATAAAATATCAAGAGACACCTATTGCTACTTTCCTTCTCAGTGTTATG CAGTAGTTTTTTTTAACAAATATAATTGTTTACATGATAATGACACAATGCAAGGTGATTTACTAAAGAAAGGCCATTCC TCACTGTAAAGTCTGTTCATGAATTGTATAAGATTGCCTATATGCTTTACAGATGGAGTCTCGCCTCCGGACCATAAACC CAAAATCCTCTAATTAAAATAGTCACAACCTTAGCTGACTTAGATAAATTTAGTGAAATACAGGTGCAGAAGCAAAAGCG AAGCAACATTCTGAATCTTTTTAGTAGAACTTAAGTTTATATCTATCTGAACATGATTTTGACCAGTAAATTCTGTTTTT AATACCATCAAGTATTGGAGAACTCTGGGTCTACTCACTACATTTTACATTAGGTAATGTTCAAAAGAAGATAAAGTGTA GTAACTGCTTAAATTTTTAACCATGGTTAGTCTCTGATATTTATAAAATTATAAGACTGTAGGTTTTCCAACTCTTCATT TCCGAAGTTCTGTAAGCTCCAAAAGTTCTAAAATATCAAAATTCATTTTCTATTTACATCCTTGGGCTTGAATTAATTTG CTATTCTCTGACAATCATGGTCATAGGAGTGAGCATCATGGGCCTATGGTTGCTGTAATTGAGTGCCCAAATGTCCAACT AGTAAAATTGGGCATTCGAGCTTTAGATGATTTTCCATGCCTGAGTATTCCTTCTAATGCGCGTGATAGTCAGTATCAGG TACAACTGGTCCATAACAAGCATGTTTGTTCTTGAATATTTTTATGCTTTTTAGTTATACTTAATTTTGGCTCTCTTTAG ATTCTTGGATGGCAACAAGTTGCTGCTAAAATTGGAATGCAACGTTGTGCTGCATCAGTACAGTGGCTAAATGAGAGAAT TGCTCTATCAAGATATGCCCATGTAAGCACCCCATATCCTTAGCAGCATATCTTTTGGAAAACTACAAAAAAACGATATA TTGGTAAAAGAAATTTCCAATTGAGAAACGCTTCACCAAACAAAGTTGGTTAATTAAGCCAATAATTACAGACCTATAAT AGAGCGTTGTTTGCAGAAATTGTTCTTTAAGTGGAAATTTGTTTCATTCAGAAGTTTCATTTTGTAATCTTCCTAACTTG TTTCCATATAAATTTTGAATATCTTTTGCAGGTACCAGTGGGAAACTTTGAACTTGACTGGCTTATATTTACAGCGGATA CCTTTTTTTCAAGAGCTTTGCGTGATAATCAACAGGTTCTGAGTTTGATATGATTTTAAGTTGTTAGATCTGAATGGTAT CAACAGATACTTACTACCTTGCATTCATTCATAATGCTTTACACCCTCACCTGAACCAGATGATTTTTTTTTTGATAAGC AAACCAGATGATTATATCTAACATGTTCAATGTCTAAGCAAGAGTGGGTGTGTATTTTTCTTAAAGTACAATGTCAAGCT CAAAAATCTTATAGCCCATTTCAAATTGTATTATCCCCTCCCCTAAATAATAATTCATTACGTCCCTATTTTTTTTATAC TGAGCTATTCATACATACAGGTACTTTGGATATCTGATGATGGTCTTCCAGATTTGGGTGGCATTACTGGTGAAGAGAAC TGTTTTATTGACGAGGTTGGGCACACACACATATTTAGATTTTTCCTTAATTGTTATCATTAGATGGGTGAGCATGCTCA TAGTCGTATCTGGTCCTCTGAAATTGACTTCTGTGCTATTTGGAAATAGGTCCATCAACCTGTTCTCACGTATCCTGGAG CTTATAGAAAAGTTACTGTGGAGCTAAAGGTTCAATAATCTAAGTTATTTTCACTAGTTGAGCCATGCTTTTATAACTTG ATAGGGGGTTTTATTGTATTTTTTTGTTTATTTGCAGCTACACCACCTGGCTGTAGATGCTCTGCTAAAATGCAACCAAG TCAATGAAATGGAAGGAGGCGCTTTGTTAGGATTTGATCATGAATTTGATTCCGAAGCATTTTCCGTGGATGGTCAGAAC AGCTTTGACGAGTCTACTTCATGTGCACATGCGTTTCGGGTCCTAAAACAGTTGATTCAGCGGTGCCTTGCAGATGCAGT TACATCTGGAAATGTTTTTGCTGATGCAATGTTGCAACATCTGTATCGATGGCTCTGCAGGTTTTTACTATCTTCTATTG CTTACCATCTTCTTTGTGATTCATATAATTACTGCATCCTTCCCACATTGCAGCCCTCAATCAAAACTTCACGATCCAGC TCTTCACCGGCTACTCCACAAGGTAAACAATTTTTCGTTGAAAGTTCTTGTATGATACTTGTAATGAAATTCATTTCATA TTTACACTATTTACTATAAGTTTTCATTTAGGCTTAATTGCACTTTTGGTCCTGTGTAACGGAAGGCCTAAAGTTTAAAA TTGCACTTTTGGTCCTCTGTGTAACACAATGCTGAGCAGACTCATATCATGCACTAACATATGATCATAACAATTTTTTG AACTTTTTAAAAATGAAATACTCAAATAACAATTGAGAAGCAAAAGACAACCAAATTGAGAAGAATAAGATGGTCAAAAT AAACTTATGAAATAATAGTAGTGGGATATGGTTCAAACAAAAGAGAAGCAAACTGAGAAGTTGATGAAAGTAAATATATT GATGAATAACTGTATGACCTGATAACAAAATTCCTCTCACACTTATATTGTCTTGTCAAATTTTATAATCATGTAACGAG TTAATTTAAAATAATGAAAAGGTGATCTTTATTACTTCCATCACTAAGCACCCCCGCAAAGCTTGGGCTTGAATATAGTC ATATTTGTTTTTTTTTTGTTCATTTTTTGTTTCATTTATTTGTAATTTGTATATTTGAGTTAAAACCTCTATCAATTGTA TCTCTTGTTTTTTGATTGCATTGATATTTATAGGTCATGCAAAAGGTCTTCGCATTGTTGTTGGCAGAGTTCCGCAAGTT GGGTGCAACAATTGTATTTGCAAACTTCTCCAAGATTATTATAGACACAGGGAAATATGATCTGTCTACAGCCAAAGCTT ACTGTCATAGTTTGTTAAGAACTGTACAATCCAGGTCTGTCTTGCAAAAGCCATGAAAAAGTATACCCATTTTATATTTA CAAAAATTATTTTGATTTTTGGGATAACTAGACTTAAAGATAACAGAAGTTGCAAAGCTTTGTCAAAAACCTTAAGAATG AAAAATCTACAATTTTTAATTGAATGTCGTAAAGTTGTGAAAGACTTACTAATGCAAATTCATCTTTAATTGACCTTATA CTTGTCCATTCTCCTTTGTTTGACTCCATTTATTGCTTATTTTGTAGAGACCTATTTGAATGGATTGAGCTTGAACCACT TCAATTTTGGCTCTCATTGTTATTCATGGACCAGGTTTGCTCATCATGATTTTTTCATTGCCCATTTGTCTATCCCTCAC TGTATTGGTTGTTGGTTGCAAGATAATATTTAAGTTTCTTTAAATTATTTATCTTTTCTAAAGCAATTGTGAATGGTTAG TGGATTTTTTGTTAAACTGAATAGAGAGAATCTCACACTACAGAATTTCGAGGGTCTGTACTTCCCAATGCCAAAGGCCC CAATACTCTCCAAATGTCTAACACTTCCTTCTCAGTTCCTATTTATAGGAAACAAGTCTTATTTCCTGATTTCCTCTATC TGTACCCAACTAACTAATTAACTGTCTCTGATCATTATCTGTCAGAATGGCTTGGGAATCTTTTTGTCACCAAATATAAT TATAAATTAGAACAGGTCTGCCAGGCACATTCTATAATTATAATTCTGGATGGTTAGATAGAATGATAATTGAACAATGC AAATTTAAGAATGTGAGGAGAAGACATAAGTTTGCTTATAATATTATTTTTATGAAAGTCGTTGATTCAATATATAATCT GATTTTTTTTTTGTAAAATATCAAGGTTTTAAAGTCTGATGCCTAAATGGTTAATGGAGATTTTCTTGACTGATGATGAT TTGATAATGGTTTCATACATAATATATACAATTGACTCTGCTTGTACTTGTTAGTGGTCAGGATATACCGTTTTCATATT AAATGCATTATGATGCCAAGTGCCAAATGCTTCTAATTACACTTAGATATTGTATTTTGATGCACACCTGTGAAAATTTA ATGTAGTTTCTTCAGCTTTTGCAGTCTTTCAGCCATTTCAGTTTCCCATTTTTTTTCTCCAAACCAGCATGTAGTCATTT ATTGCCTAGTTATTGTGCTTTCCTTGTTGTAGTATAACTACGGTGGAATACCAGCAAAATCTGATGAAGCCATAAATGAT GAGTCTCAAGTTGACATTATATCGAGCTGGAATATTGCCGAATACTTACCAAAGAAAGTCCAAGTAAGTTCACTAGTATG ATTTTTAGCTTCTATCGGAAGTTCTAAAGGCAAGGAATCTTTATCGAATGAAGATTAATTCAATGGATTTTAAATGGCTT GTCATTTATTACTGGAACTATTTTGCTTTCTTCATGTCTAATTTTTTTTTGTCATATCATGATTTTCTACAGGACCATTT TATTTTCATCGTTTCTCAATTCATGTACATTCCTTGGAATTATGCACAAAAACAAGCAGCAATCAGGGCTTCATTGCAGA ATGACGACTCCTGCACCCCATCAATTAACATTGGAGCTGCAGAGGCGGTTGAATCAGAAATAACAGAGTATATTAAAGGG CAGGTATAACAATCGCAGCACGAAGAATTGAATTTGCACGGTTTCTTGATTTGAAATATTAATTGATTCTTACATTTTGC ATTTTACTCCACAGATTAGCTCTTACTTCACAGACAAACTGTTAGGAGTTGTTCGTGATATGAAGAGGATGACCAGCTCA GTAAATGACCAGAGTTCATCATCTGTCCTTCCTCAACCGACGGGTGATCTCCATAGAGGGGATGCAGCCTTGGAATTTAT CAAGCACGTCTGCGCTGTCCTGGCCCTCGATCACAGTGTGCAACATGATATTTTGGTAATACTCATTTTCCCAAATTGTG CTGGCATTGATAAATAGCTGGTATTTGTATTCGACTAGAACAAGCATGCCAAGAGTATCTTGGCTGGATACTCCCATGAT GAATCTAAAGCACTCTTTCCGGTGCAAAGTGCTCCTCTGACGGGAAGTCATGAACTCTCCATGGAAGAAGCTAAATATCA TATAATCTTCGAAAGCATGTAATTTACTCTGATGGCCTGTTTATAGACCCAACAAATTAAACAACCTTATAAACATACCT ATTGTAAACTAGAAAAAGATAACCCAAAAAATTATAATAAATTCCCTATAAACTAAATAACATAAAATAAACCTGAATCT ATACTTAAATTGAAACCCTAAGTAAAATTTAATGTCACTATTATTAATAATTTAATGTAGTATATACTTGTGGTGCAATA TGGTCTCACATAGGAATGCTTTCAATTAATCTCTGAGGCTATAAAATATTTGTCTGGGAAATGCATGTAGTTTTTACAGC AGAGATTCATCTTACTTGTAATCAGACTTGAAGAGATTATTCTGTTTGGTTTCTTAAATGCTAACTGATTCTTGCTTTGG CATTTGTCAATGTATAGTAAGTAGTCACATAGTTTGTAAATTTTCATATTTTCAGAATTCTGCGCATGCTTTGTTGAATT TTTAACATGGAGCCTGTGTGCCCTTATATACCTTTTCCGGGCTAAGTCACTTTAAATCAACGTCTGTAACATCTTGGCTG TATTTATTATTTATGATCCAGCCCTTAATGGAAAAGTACTGGGTTATTTTGGGTTTGCAGTGCCTCATTTTTGCGATAGA TTGTGCTAATGGGATTACAAGGAAATAAAGTACTGCATACTGCTGATTGTATGCTTGACTTCTGAATTTCTAGAACAGAT TTCTACCCAAATACAAAATAAGAAGTTATAAGAGATTATGACATGTTGATTAGGATATAGAGAACAAATTTGAATTTGAT CATGGTTCTGTATTTATCCTAACCCAAAGAAGAAACAAGAACGAATTGTTCTGTTCTTATTCCTGAATAATTTATATATG GAATGGTTTCTTCTTCCATTGACTGTTGATCTTCTGGTTTCTACATTTCTGCATGGTCAGCAAACTGATACTTCTGAGTT CTGATTGTGTCCTTCACTTGTCAGGTTATGAGAAAGAATTTGTTAAAATATGTTAAAGTCAGGGAGTTTGCTCCAGAAGC CGAGTTCCGTGATCCTTGCCATTCTTTCATCTTATCCAATGTCATATGCAGGTAAAAAAAATTAGGTTTCCATTATCAAT TGAATATAAACAATAAAATAGTTTGGCTGAAAATTTTCTGAATATCAATAGCATTAGGAGTAAATAGGTTTCCATCCATG AAAGGCAAAAGATTTCTTGCTCGAGTTTACCTAGAACTACCTCTCAGGGTATTCAATGGTTACCAAACTAATGAATTTTG TTTAATGTAAAAACCATTTCTCATAACTCAATGCAAATTGCATATGGTCTTTGTCTATATTGTCTTATATGAAGTATCTT TTCATGTGCAAACGAATTTGCAATCTCCTGCATTGAAAGCCAGTCATTAACTTTGACAATTTTACCATAGTTTGACAATT TCATCGTCTTTGTATGTTGGCTCCAGCAATGTCTCAAAACATACGAACATGTAAACCTTCCCATATTCACATGTATTAAT TTTTTCTTTTCCGTGGACAGCTATTGTAATGACTGCAGAGACATGGATTTGTGCCGTGACTCAGCTTTAATGACGGAGGA GTGGCGTTGTGCCGTACCTCAGTGTGGCCAACCTTATGATCGTGAGGTGATGGAGAATGCTCTCCTTCAAATCGTACGAC AAAGGGAGCGACTATACCACCTGCAAGATTTGGTTTGTCTCAGGTGCAGCCAGGTGAAAGCTGCACATTTGGCTGAGCAA TGTGCATGTGCTGGCTCATTTAGGTGCAAGGAAGATGTAAGTGAATTTCGCACAAAGATGCAGGTTTTCTTGAGTATAGC TTCTCGTCAAAAGTTCCAACTTCTCCAAGAATGTACCTCCTGGATTTTAGAACTTAGATAG
CDS sequence (LotjaGi3g1v0479600.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCGTGAAAATCCATTCTATGTGGACACTGTTCGCAGTTTCCGTGATAGAAGATATGAATATAAAGGCCTCAATAAGGT TTGGAAGGGAAAACTATCAGAGGCCAAGGCCAGTGGAAATTCTATAAAGATCCAGGAAGCACAAGATATGGTAGTGCTAT ATGATTCATTGCAACTTGCTCACAAGTGTATACTTAATTCCTTTTATGGATATGTCATGCGCAAGGGTGCAAGATGGTAC TCCATGGAAATGGCTGGAGTGGTCACATATACGGGTGCAAAAATCATTCAGAATGCCCGGTTGCTGGTAGAGAAAATAGG AAAACCGCTTGAACTAGACACAGATGGTATCTGGTGTGCACTTCCTGGATCTTTTCCAGAAAATTTCACCTTTAAAACAG AAGACTCAAAGAGGAAGTTGACAATCTCATACCCCTGTGTTATGCTTAACGTTGATGTGGCAAAAAATAATACAAATGAT CAGTACCAGACACTCACAGATCCAATTAGGAAATCTTATAAAACTCATAGTGAATGCTCTATTGAATTTGAGGTGGATGG ACCATACAAGGCAATGATTATTCCTGCTTCTAAGGAGGAAGGAATTTTAATTAAGAAGCGTTATGCTGTATTTAATGACG ATGGAACCCTCGCAGAGCTGAAAGGTTTTGAGATCAAGCGCAGAGGTGAATTGAAGCTAATCAAAGTTTTCCAGGCTGAA CTTTTTGACAAGTTTCTGCATGGCTCAACCTTAGAGGAATGCTATTCAGTCGTCGCTTCAGTTGCAAACCGCTGGCTTGA TCTTCTTGATAACCAAGGAATGGATATTGCAGATAGTGAGTTGCTTGATTATATATCAGAATCAAGTACCATGAGCAAGT CTTTAGCTGATTATGGTGAGCAGAAGTCTTGTGCTGTTACCACTGCTAGACGTCTTGCTGACTTTCTTGGTGATACAATG GTCAGAGATAAAGGTCTTAAATGTCAGTACATAGTAGCAAGTGAACCTCAGGGAGCACCTGTAAGCGAGCGAGCTGTTCC TGTGGCAATATTTGAAACTGATGCTGAAGTAATGAAGTTCTATGTCCGGAAATGGTGCAAGGTCTCATCAGATGCTGGCA TTCGATCCATTATTGACTGGTCTTATTACAAGCAGCGGCTTAGTTCCACAATTCAGAAAATTATCACTATTCCTGCTGCA ATGCAAAAGGTTGCAAATCCTGTCCCTAGGGTAGCTCATCCTGATTGGTTGCATAAGAAGGTCCGTGAGAAAGATGACAA GTTTCGCCAACGGAAATTGGATGATATGTTTAATTCTATGAACAGAAAGGAGAGCTCAAAAAAGCATGATGATTCTAATG GTGTCCGCCTTGTGATGGATGATGAGACTGTTAATGACTTGGAGGACTTCGGAAGCAACGGCAGGAGTTCTACAGGCAGA CCTAGGCCAATTATACGGCATTACGAAACTAATAATGAACGGCATTCAGTGAATCGCAATGGTCAAGAAGATTCAGAGCA ACAATGTAACGACAGTGAAAATATTGACAAAAACGTAGACTATCAAGGATGGCTTCAATTGAAGAAGAGGAAGTGGAAAG ATATGCTGGAAAAGAGAAAGAAGCGAAGATTGGACAATTCAGAGAAATCTGACCGCTTAAATGGCATTCTCGGACAAATA AATGGTAAGATAGATCAGGGCAGAAGTAATGTCAGTTCATATTTTAAAAGGCATGAGGTAGTCCTAACACGGTGCCACTG GCAGATTATACAGCTAATTCACAGTCCACAGATTGGCCAATTTTTTGCTTGGGTTGTTGTTGATGGCATTATGCTCAAGA TACCTGTTTCTGTTCCTAGAGTCTTTTACCTCAATTCTAGATCACCAATTAGTGATGAATTTCTTGGCAAACGTGTCAAC AAGACTCTTCCTCATGGAAGACAGAGTAATAACCTGTATGAGGTCACAATTAATGAAGTTCAATTTAGGGAAGCAAGCAA AAAACTTGAAGCTCTCTTAGCAGATCCTGATGTTGAGGGAATATATGAAACCAAGGTGCCACTGGAGTTTAACGCTATAG TCCAGCTTGGTTGTGTGTGTAAGGTGGACAAATCTGCTAAAAGACGTAATCTACAAGAGCCATGGAATGTGAGTGAATTG CACATGAAGACCACGACCGAGTGTGGTTATTTTGAACAATCTATATCCTTCTTCTACTTGTACCATAGCATCTCTGAGGG ACGGGCTATATATGTTGGATATTTTCCTGTATCCAAAGCAGTAACTGTTGTGGTAGTCAATCCCTATCAAAACAAAGATT TATCACCGATTTTTCTTGAAAGACAATATCACAGTGCTTGCCAAGCTTTGTCTATTGAGTCACCTCCGAGGAATGACATT CACTTTAAGGTGGACTATGTTGCTCAAGTCAAGGATGCTGAAACAGCAATGCAAAGAACAATAAATGATCACAGTCATAG GAGTGAGCATCATGGGCCTATGGTTGCTGTAATTGAGTGCCCAAATGTCCAACTAGTAAAATTGGGCATTCGAGCTTTAG ATGATTTTCCATGCCTGAGTATTCCTTCTAATGCGCGTGATAGTCAGTATCAGATTCTTGGATGGCAACAAGTTGCTGCT AAAATTGGAATGCAACGTTGTGCTGCATCAGTACAGTGGCTAAATGAGAGAATTGCTCTATCAAGATATGCCCATGTACC AGTGGGAAACTTTGAACTTGACTGGCTTATATTTACAGCGGATACCTTTTTTTCAAGAGCTTTGCGTGATAATCAACAGG TACTTTGGATATCTGATGATGGTCTTCCAGATTTGGGTGGCATTACTGGTGAAGAGAACTGTTTTATTGACGAGGTCCAT CAACCTGTTCTCACGTATCCTGGAGCTTATAGAAAAGTTACTGTGGAGCTAAAGCTACACCACCTGGCTGTAGATGCTCT GCTAAAATGCAACCAAGTCAATGAAATGGAAGGAGGCGCTTTGTTAGGATTTGATCATGAATTTGATTCCGAAGCATTTT CCGTGGATGGTCAGAACAGCTTTGACGAGTCTACTTCATGTGCACATGCGTTTCGGGTCCTAAAACAGTTGATTCAGCGG TGCCTTGCAGATGCAGTTACATCTGGAAATGTTTTTGCTGATGCAATGTTGCAACATCTGTATCGATGGCTCTGCAGCCC TCAATCAAAACTTCACGATCCAGCTCTTCACCGGCTACTCCACAAGGTCATGCAAAAGGTCTTCGCATTGTTGTTGGCAG AGTTCCGCAAGTTGGGTGCAACAATTGTATTTGCAAACTTCTCCAAGATTATTATAGACACAGGGAAATATGATCTGTCT ACAGCCAAAGCTTACTGTCATAGTTTGTTAAGAACTGTACAATCCAGAGACCTATTTGAATGGATTGAGCTTGAACCACT TCAATTTTGGCTCTCATTGTTATTCATGGACCAGTATAACTACGGTGGAATACCAGCAAAATCTGATGAAGCCATAAATG ATGAGTCTCAAGTTGACATTATATCGAGCTGGAATATTGCCGAATACTTACCAAAGAAAGTCCAAGACCATTTTATTTTC ATCGTTTCTCAATTCATGTACATTCCTTGGAATTATGCACAAAAACAAGCAGCAATCAGGGCTTCATTGCAGAATGACGA CTCCTGCACCCCATCAATTAACATTGGAGCTGCAGAGGCGGTTGAATCAGAAATAACAGAGTATATTAAAGGGCAGATTA GCTCTTACTTCACAGACAAACTGTTAGGAGTTGTTCGTGATATGAAGAGGATGACCAGCTCAGTAAATGACCAGAGTTCA TCATCTGTCCTTCCTCAACCGACGGGTGATCTCCATAGAGGGGATGCAGCCTTGGAATTTATCAAGCACGTCTGCGCTGT CCTGGCCCTCGATCACAGTGTGCAACATGATATTTTGGTTATGAGAAAGAATTTGTTAAAATATGTTAAAGTCAGGGAGT TTGCTCCAGAAGCCGAGTTCCGTGATCCTTGCCATTCTTTCATCTTATCCAATGTCATATGCAGCTATTGTAATGACTGC AGAGACATGGATTTGTGCCGTGACTCAGCTTTAATGACGGAGGAGTGGCGTTGTGCCGTACCTCAGTGTGGCCAACCTTA TGATCGTGAGGTGATGGAGAATGCTCTCCTTCAAATCGTACGACAAAGGGAGCGACTATACCACCTGCAAGATTTGGTTT GTCTCAGGTGCAGCCAGGTGAAAGCTGCACATTTGGCTGAGCAATGTGCATGTGCTGGCTCATTTAGGTGCAAGGAAGAT GTAAGTGAATTTCGCACAAAGATGCAGGTTTTCTTGAGTATAGCTTCTCGTCAAAAGTTCCAACTTCTCCAAGAATGTAC CTCCTGGATTTTAGAACTTAGATAG
Protein sequence (LotjaGi3g1v0479600.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MRENPFYVDTVRSFRDRRYEYKGLNKVWKGKLSEAKASGNSIKIQEAQDMVVLYDSLQLAHKCILNSFYGYVMRKGARWY SMEMAGVVTYTGAKIIQNARLLVEKIGKPLELDTDGIWCALPGSFPENFTFKTEDSKRKLTISYPCVMLNVDVAKNNTND QYQTLTDPIRKSYKTHSECSIEFEVDGPYKAMIIPASKEEGILIKKRYAVFNDDGTLAELKGFEIKRRGELKLIKVFQAE LFDKFLHGSTLEECYSVVASVANRWLDLLDNQGMDIADSELLDYISESSTMSKSLADYGEQKSCAVTTARRLADFLGDTM VRDKGLKCQYIVASEPQGAPVSERAVPVAIFETDAEVMKFYVRKWCKVSSDAGIRSIIDWSYYKQRLSSTIQKIITIPAA MQKVANPVPRVAHPDWLHKKVREKDDKFRQRKLDDMFNSMNRKESSKKHDDSNGVRLVMDDETVNDLEDFGSNGRSSTGR PRPIIRHYETNNERHSVNRNGQEDSEQQCNDSENIDKNVDYQGWLQLKKRKWKDMLEKRKKRRLDNSEKSDRLNGILGQI NGKIDQGRSNVSSYFKRHEVVLTRCHWQIIQLIHSPQIGQFFAWVVVDGIMLKIPVSVPRVFYLNSRSPISDEFLGKRVN KTLPHGRQSNNLYEVTINEVQFREASKKLEALLADPDVEGIYETKVPLEFNAIVQLGCVCKVDKSAKRRNLQEPWNVSEL HMKTTTECGYFEQSISFFYLYHSISEGRAIYVGYFPVSKAVTVVVVNPYQNKDLSPIFLERQYHSACQALSIESPPRNDI HFKVDYVAQVKDAETAMQRTINDHSHRSEHHGPMVAVIECPNVQLVKLGIRALDDFPCLSIPSNARDSQYQILGWQQVAA KIGMQRCAASVQWLNERIALSRYAHVPVGNFELDWLIFTADTFFSRALRDNQQVLWISDDGLPDLGGITGEENCFIDEVH QPVLTYPGAYRKVTVELKLHHLAVDALLKCNQVNEMEGGALLGFDHEFDSEAFSVDGQNSFDESTSCAHAFRVLKQLIQR CLADAVTSGNVFADAMLQHLYRWLCSPQSKLHDPALHRLLHKVMQKVFALLLAEFRKLGATIVFANFSKIIIDTGKYDLS TAKAYCHSLLRTVQSRDLFEWIELEPLQFWLSLLFMDQYNYGGIPAKSDEAINDESQVDIISSWNIAEYLPKKVQDHFIF IVSQFMYIPWNYAQKQAAIRASLQNDDSCTPSINIGAAEAVESEITEYIKGQISSYFTDKLLGVVRDMKRMTSSVNDQSS SSVLPQPTGDLHRGDAALEFIKHVCAVLALDHSVQHDILVMRKNLLKYVKVREFAPEAEFRDPCHSFILSNVICSYCNDC RDMDLCRDSALMTEEWRCAVPQCGQPYDREVMENALLQIVRQRERLYHLQDLVCLRCSQVKAAHLAEQCACAGSFRCKED VSEFRTKMQVFLSIASRQKFQLLQECTSWILELR
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SUPERFAMILY | 1 | 395 | 395 | 6.67E-68 | ||
| PANTHER | 1 | 1471 | 1471 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1 | 1471 | 1471 | 0.0 | ||
| Gene3D | 2 | 95 | 94 | 4.4E-14 | ||
| Pfam | 39 | 339 | 301 | 2.6E-16 | ||
| Gene3D | 202 | 326 | 125 | 3.2E-8 | ||
| MobiDBLite | 436 | 463 | 28 | - | – | |
| MobiDBLite | 436 | 513 | 78 | - | – | |
| MobiDBLite | 486 | 501 | 16 | - | – | |
| SMART | 778 | 1164 | 387 | 3.6E-177 | ||
| Pfam | 793 | 1164 | 372 | 7.1E-119 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Nucleotide binding | Interacting selectively and non-covalently with a nucleotide, any compound consisting of a nucleoside that is esterified with (ortho)phosphate or an oligophosphate at any hydroxyl group on the ribose or deoxyribose. | ||
| Molecular function | DNA binding | Any molecular function by which a gene product interacts selectively and non-covalently with DNA (deoxyribonucleic acid). | ||
| Molecular function | DNA-directed DNA polymerase activity | Catalysis of the reaction: deoxynucleoside triphosphate + DNA(n) = diphosphate + DNA(n+1); the synthesis of DNA from deoxyribonucleotide triphosphates in the presence of a DNA template and a 3'hydroxyl group. | ||
| Cellular component | Nucleus | A membrane-bounded organelle of eukaryotic cells in which chromosomes are housed and replicated. In most cells, the nucleus contains all of the cell's chromosomes except the organellar chromosomes, and is the site of RNA synthesis and processing. In some species, or in specialized cell types, RNA metabolism or DNA replication may be absent. | ||
| Biological process | DNA replication | The cellular metabolic process in which a cell duplicates one or more molecules of DNA. DNA replication begins when specific sequences, known as origins of replication, are recognized and bound by initiation proteins, and ends when the original DNA molecule has been completely duplicated and the copies topologically separated. The unit of replication usually corresponds to the genome of the cell, an organelle, or a virus. The template for replication can either be an existing DNA molecule or RNA. | ||
| Biological process | DNA repair | The process of restoring DNA after damage. Genomes are subject to damage by chemical and physical agents in the environment (e.g. UV and ionizing radiations, chemical mutagens, fungal and bacterial toxins, etc.) and by free radicals or alkylating agents endogenously generated in metabolism. DNA is also damaged because of errors during its replication. A variety of different DNA repair pathways have been reported that include direct reversal, base excision repair, nucleotide excision repair, photoreactivation, bypass, double-strand break repair pathway, and mismatch repair pathway. | ||
| Molecular function | Zinc ion binding | Interacting selectively and non-covalently with zinc (Zn) ions. | ||
| Cellular component | Epsilon DNA polymerase complex | A heterotetrameric DNA polymerase complex that catalyzes processive DNA synthesis in the absence of PCNA, but is further stimulated in the presence of PCNA. The complex contains a large catalytic subunit and three small subunits, and is best characterized in Saccharomyces, in which the subunits are named Pol2p, Dpb2p, Dpb3p, and Dpb4p. Some evidence suggests that DNA polymerase epsilon is the leading strand polymerase; it is also involved in nucleotide-excision repair and mismatch repair. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0479600.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…