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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0505600 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0505600.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | WD repeat-containing protein; TAIR: AT3G18860.1 transducin family protein / WD-40 repeat family protein; Swiss-Prot: sp|P27612|PLAP_MOUSE Phospholipase A-2-activating protein; TrEMBL-Plants: tr|I1LQ62|I1LQ62_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0505600 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:92304074..92316028) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TTATTATCAAAAAGAAACTAGGAAGTTGAAGAAGCAAAGTAGAAGAAACTTGTTTGAGTGTAAGCTGGGTTTTTCTTCTG AACTCTGCGTTCGTTCGTTCGTTCCTCTTCTCTTCCTCTCGCTCTCTTTCTCAATGGACATTGATTTCAAAGAGTACCAG TTACGCTGTGAACTTCACGGCCACGAAGACGATGTAAGATTTTCCCCTCAATTTCCCTTTTTCTTAAATTCGAATTCCTG TTGATTGATTTGAACATGAACACGATAAACCCCAGGTTCGTGGAATTTGCGTCTGCGGCAACGACGGCATAGCGACATCG TCAAGGGACAAAACGGTTAGGTTCTGGTCACCGGAAAATCGCAAGTTTGTGTCGTCCAAGGTTCTGGTCGGGCATTCGAG CTTTGTGGGACCCTTGGTGTGGATCCCTCCGAACCCTGAGTTGCCGCAAGGTGGGGTTGCGTCTGGCGGCATGGACACTC TCGTGTTGGTGTGGGACTTGAGCACTGGTGAGAAGGCTCACACGCTCAAGGGTCATCAGTTGCAGGTTACTAGCATTGCG TTTGATGATGGGGATGTTGTTTCCGCTTCGGTTGATTGGTGGGTTTTCTGATTCTGCTTTGACATCACCAATGCTTTTTG AGTCTAATTTCACTGCCCTTCAGTTTAGTTTTGTGTGAAATTTGGATGAGATTAGATATGATTTATGTACTGAACCTGCA ATTACTGTGATATTCTTTGTAAATTTTCAAGTGTGTGCTTCTTAACATGTTGATGTTAGGTTTCCTTTTCTACTTATCCC ATATGATATCACATTGTCAGTTATAATATTTTGATCCTGACTTTTGTTTCCAACCGACCAAATATTTCCATTTTGATCCA TATATTGTGAACTTTACTTATGGTCTACCTGAATTTCTTATGCAGTACATTGAGACGGTGGAAGAACGGGCAATGTACAG AGACGTGGGAGGCTCACAAGGCTCCAGTCCAAGCTGTTATCAAGCTACCCACAGGCGAGCTTGTTACAGGTATAGTTATT TGTATCTTTGTCAACAAGCTTTCTTTATCAGTTATTGTTTATATCATGTGCCTAAGGAAGTAATTTATACTTGGTGAACC ATATAGCATACTTGAGATCTCATATTGTTACCTACAAACAAAGACTGAAGTAAGTTTGCTGCATTCTGTGAATATTAGGT TCAAGTGATACTACTTTGAAGCTTTGGAGAGGAAAAACTTGTGTACATACTTTTGAAGGACATTCAGGTTTGTTTTCCTA TCGTTAGACATGCATTTTAATTTTTTATTTTGTCAGTAACAGAACACACACACACACTGTTAACTTATATTTTGTTTTTA TAAGTTTCTCTTGTATATTTCCTTGGTTGGTGAGGATGGCAGTTTTAGGTTTTGAATTTCAATATATTTTAATGCATGGC ATATTTGTGAATTGATTTTACTTTTCATCTAATCATTTTATTAAATTGGTTGCTTTCTTTCGATTTGACTTGTGTCTTCC AATTTAAAGAAGGTCAAAGAGGTCTTAGCAATTATGTATCTTGAAAACATATCTTTGTAGTCATATTATATCCTTTTATG CTGTTATGGGCTACATTTTTTGTTGATTCAATGTCTTAATATAAACTAATATCATTGTGCTAATGCTGATGACCTTTGAG GAGTGCAGATACAGTTAGAGGCTTGGCTGTGATGTCTGGTCTTGGAATCCTGTCTGCATCCCATGATGGGTAGGTTCATG CTCTTCTAGATTTTATTAGGTTCCTAGTTTTGCATCAGAAAATTTATATACCCTGCTTGATTTGTTTCCGTTACTACAGT TCTCTCAGATTATGGGCAGTCAGTGGTCAAGTGTTGATGGAGATGGTTGGCCATACTGCAATTGTTTATTCAGTTGATTC ACATTCATCCGGACTTATTGTGAGTGGTAGCGAGGACCGTTTTGCAAAAATATGGAAAGGTGATTGATTACCTCTTTCTT GCTTCATGCTATAGAGGTCACATGTCATTGCAATATCATCTGCATGTATTGCTTTGCTGACAATACTCAATTATTTTGAT TTCATGGCTCTGGTTTACATTTTAGTGTGCTTAGAGAGCTACATGATTGATGTTGGTTACCTGTCCACACAAAATTTAAC TGGATTTTTTTTGGTGCGGGCGGGGGTTGGTCTTCCTTATGCTAGCCAACAATTGTCTGAAACCGCTTGATATTCTGCTC TCTTAAGTCAGCTTAAGCTTTCACAATGCTTTGGGTTATGTCATATCTTACATTATTGTAACTTTCTTTTTTAAATTCAG GCATAACCTAGTTTTTTTTTTGGGTAACAAAATGGGTACAAGTTTTGTTTGAAGAGGCCCTTCTTTTCAATTTTCACTGT TCAAGTTACTATTTACATGAGGCATCCGAAGTATTAAGCTGCTCAAAGGCATACATTACTTCACATGATCTATTGCCTAT GGTTTTTGTCTCAGCTTATGTAACGTGGCTTGGAATTATGAACTATTTTCTCATAAATATTTTACAGATGGAGTTTGTGT TCAGAGCATAGAGCATCCTGGTTGTGTTTGGGATGCAAAATTTATGGAAAATGGAGATATCGTGACAGCATGTTCAGATG GAATTGTACGCATTTGGACCGTAAATCAAGATTATTTTGCTGACCAGCTAGAGCTTGATTTATACACTTCACAACTTTCT CAATACAAGTCTAGTAGGTATGATTTTTTTATTGGTGCCTTGACGTACTTGCTACTGCCCTGTCGTGCTAGCTTCTCCTT TGCTTATTTGTTCATATTGTGAATTTCTTAACCGTGGCCTTCAGTTGAAAATTTACAATTCACCTTTCCTTGGTGAATAT ATGGTTTTATTTTCTTGGGATTTTTTTTCTCCCTATAAATCCTAATGTATATTCCTGTTTTTATTTTTTAAATTTTATCG TGTCATATTTGGATTAATTATGTCTTGCTATTACTAATGAAGTTAGATTAATCTGTTAATTTTTGCTAGAAAGAGGGTTG GAGGATTGAAATTGGAAGAGTTACCAGGGTTGGAGGCACTGAAGATCCCAGGTATGATTTTAACTGTTTCCTTTTCAAAA GGGTCATTTGGCATAAACTTTGCCCTCTAACCTACCATTTGTTTCTTCTTTTAAACGATGGGGATGTGGGGGGGGGGGGA TCAGGAGATACAATTTGCTTGTGATGGCGTGACATTGGGCTGAGTGTCTACATTTGCAAATCAGATGCTAAATTCAGTTT AAAATGTCCTTTCAAATAGCTTGCTTGAATGAAAATGTAGCCTCAAATGATTCTAGATAAATGTTCAACAGTTGTGTGGG ACTGTGGGTCTTCTGTTTTAAGATATAATACCTGACCTGGCTCTCTGTAATTTATATTTGTGCACATTACAATGTGTGGT TACAGTATTTTTTTTCCCTTCTTGAATTTTGTGGATAATTGCCTTCATAATCCAGCAAACCCAGGGTTTGTCATAGTAAT TTTTTAAGCCTTTTCTGGTTCTGAACAGGAACTAGTGATGGCCAGACAAAAGTAGTCAGAGAAGGGGATAACGGGGTTGC ATATGCATGGAACATGGCAGAACAGAAGTGGGATAAAGTAATTCCCTTACTTCTTTCTATATGAACTTTTAACTATATGT TTCTATTTCCCTTAGCCTGTGTAATTTTGTTGCCTAAGTCAAATTCCAAGCCACAGTGCCAAATGTAAATGATATTACAA AGTTATTTTTTATTGACAATTTATGTTTACGTAAAAGATTGGTGAAGTTGTTGATGGACCAGAGGAATCAAATCGTCCTT TTATGGATGGCATTCAGTATGATTATGGTCAGTTTCCTATTTCTCCCTTGATCACCTGATTGAGTTAACCTACTTCACAT GCCTTTCTTATAACCTTTACCTGTTTGTTCAGTGTTCGATGTTGATATTGGAGATGGTATGCCTATCCGTAAGTTGCCAT ACAACCGATCAGGTACACGTTTTACCATGGGGTTGTATCTTTGTTTCTGGCTTAATTATGTAGGGGTTGACTTTCTTGTG CGGTTGTGCCTTTGCAAGTGATGTTATTGTCTGTTTGTTCTCCAAGTGTTTTGGGACTTTAATTTCTTTGGATTTTGGAA AGTCTGTAGAAAAATAGTATTAATTGTTTATTTCAATGGTTTCTTTGATATATTGTATACTTTCATTCTGAGACCTTAGC GTAGTAGATTGAATTTTTTACTCCCTCCGTTCCTCATTATTTGTTCAAAAATAGAAGAAACACACAAATTAAGGAGTGCA ATTAATTTTGTTAATTTGCAGGAAAGTATTATTTGTTTTGCTATTTTACCCTTTGGAATGTATTTTATCTTTCCTCATTT AGTGTTCCCACAAGGGCATTACTTGGAAAAACATCAATTAATGTTCTCTTGAAATTCTATGTGGATAGATATAGGAACAT ATTTTTTTCTTCCTAGTGGACGGTTAATAAAGAACGGAGGGAGTAAGGAATAAGGACTCTAAAATCTAAAACATGAACCA CTGGGCCACGTCAACCAACAACTGGTATATTAGGTTGTGTTAGTTTCCAGAAGGAAAATTGCATGATTGCTTGTTTATGT TCAATGTGCATGCCTGCTAAATGGTTTTCTTTTCTATGCATTTGTTTTTTCCTTATGCTCTGAAACTTGAGTAACAATAC TACTAAGATAGTGGAGAGAGATTTGTGAAAAAGAGAATAGTTTTCTTGTCACTTGCAATTGTGTAATATATATTATAACC 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CTATTGTCAAATTCATAGGAAAAGCAGAACTTGTCCTTGACGGAGCTCGATGTTTCCAGACTGGGTGCCATTGTTAAAAT TCTCAAAGATACTTCACATTATCATTCTAGTAAATTTGCAGATGCTGATATCGCCCTATTACTGAATTTGCTTCGGTCAT GGCCAAGCTCAATGATATTTCCTGGTTAGTTGGTGTAGTTCCTGAAATTTGTCTCATGTGCTCTGTTTTATTGTACCTAA AGAAATTTTCATTTTACCTTGACAAAACCATGGATTTTTTTTTTATCGCATGCTCACTTCTTAATCAGTAAACTTCTCTA GTCTTTTGGAAAATGGTTTTCTTACTTCTTCATATTGTGTTCTCTATGCAGTCATTGATATTGTAAGGATGATAGTTCTT CATCCAGAAGGGGCTCTTGTACTTCACAAGCATTTTGGAGCTGAAAATGGTATCAACATTGTATCATTCTTTCTGTCATT AAATTATTACAATAATCAGTTTAGTTCCATTGTCGCAATGTGAAACACTCCTTGAATTTCTGGCCTTATCTTTATTCCTA TATCTTTATGTTGAGGTATAATGTTTCATTGATTTTCTCCCGTTATATGCAGACATTCTAATGGAATTGATTAAGAAAGT CACCATAAACCCGACAATTCCTGCGAATCTGTTGACCAGCATTCGAGCTGTGACTAATCTCTTTAAGAATTCATGCTATT ACAACTGGTTGCAAAAACATCGTAGTGAGGTTGGCATCATTATTGCATTACTTTTACTTAGATATCTGAAGCATGGTAGT AAGTGTCGTACGATACACCGATACGATACGTTTTTGAGGTCTGGCGATACGAATCGCATGTGTGTATCGATTTTCCCCTG AATCGCACTTGGATCGTTTGTATCGTATCATGAATCAGAATCGCTGAATTGCGATTTCTCCCCTGATTATTTTGAACTTT GTAGTTTATTAAGTTGTAGGATCAAAGCATAGTTTAGCAAGTATGGAAGTACTTTGCTTTTGCCTAATCCAATAGAATAT TTCCAAAACTCTTGAATCTACCAACATTGTCCAACACAGTTTGCAGATAGTTGTGCTCATGGTAGTTGAATCGTGAATCG TATCGTGAATCAGAAGACCTGTTTTTTGACTCATGAATCGTATCGTCTTATGTATCGTACGATACAAACACATACAAAAA ATAAGTCATAAATGAAAAATGTATGGTATATATCATATATTTAATAAAAAGATGAACACTTGCACTTTATCATCTTTTCA TTAAATATATGATATATTACCATATATTTTTTGTTCATGACTTATTTTTGTATGTGTTTGTATCGTAGGATACATAAGAC GATACGGTTCATGAGTCAAAAAAACAGGTCTTCTGATTCACGAAACGATTCGCGATTCAACTACCATGATCTGAAGTACA TTGATATGAATTGCTTGGAAAACTAACATTATTATATAAATTTCCTTGGTAATATTTTTGTTAAGAAAAAAATTCTTGAA CTAATAATATCTTCACTGATTAACATATAGTTTTTTTATTGATCTGCTTTCAAGTATCAATGGTATTTATTGATTTGATT ATATATACATTTGCTTTTCATAATGCACTTCGATTCTCGTAATTCAACTCTCCTTTACATCACTGGCACATTCAATTCAT TAGTTCATTGACCTCGGCCTTTTTATCCTCCTTTTCTCATTAAAAGTTTTATTTCTGTAGGATTATGTGAATTTATGTAT TTATTTCTGTTATTCTGGGGGCACATGTCCTTTTCTCATCAAAAGTTTTATTTCTGTAGGATTATGTTAATTTATCCATT TATTTCTGTTAATCTGGGGGTACATGGATGTTGGTCATTTATTTGAGTTGTGTCTGAGTTGCAGGTTCTTGATGCTTTCT CAAATTGTAGTTCATCTACAAACAAAAATTTGCAGCTATCCTACTCTACCTTGATTCTCAAGTAAGTCCTTTTCTGGCGC AAAATAAGTCCTTATTGATAGTAAATAAGTGCAACATTGTTTTGGAAAAAAAACCAAAGTTTAATCAATTATTGGTATTT TGCTTCAAAATTTCACAAGTAAAAAAATAGTCTCTCTGTCAACTGTGTCAACTGTCAAGTGTTGAAGTGCTCCAGTGCTT TCTGGTTTTTTTATTAAACTCCATTTTCTTGAATGAAAAATTCAAGGGAGGGCAATTCTTGAAGCATATGAAATTTTCTT CTTTGCTCTGTGTGCCACTCTACCTAACTTCACCACTCTGCTGCTAATTATTAATTACAGACATAGAAGCAGCGGTGGTG GAGTTTACTTATTTAGATCTCAGTTCATGGTTCATTATTTTTCACCATTGCAGTGGTTTACTTTTTGAAGTGCAATATTA AGGGTCCACAATGTATGTATGCAGTAACCTTTACTTTTCATGTGATTCTCAGTTATGCTGTGCTATTGATTGAATCAAAA GATCAAGAAGGTCAATCTCAAGTTCTATCAGCAGCTCTTGAGGTATGTCTTATGCTCTGTTTTTACTTGGCTACAACCAC CACAGCACCACCAAACTCATCTCACTTGCTGAGGTTGACTCAATCAATTTCATCAGGCTCTACCAAAAACCAAAATTTGA ATAACATCATTATGGTCAAGGTTTTTTTAAATGGTTCCTCATTAAGTTTTCTTCAGTATTCCTTCTCCTTTTTAATTAGA TTATCCTATATTTGTTCCCTTTTATTTTTGTTTGTCACTGAAGCCTCTATTGGTCTTCTCACATGACTAAACCACCATGG GATAATTTTTATCTCCTCCTCAATAGGCACTATTGCTACTCAAACTTTCTTCCAAACAGTCTTTTTTAAATATCATATTT TCTTGTATGTCTACTTGTCCACCTGGACATGTTGATCTTCATAAATGTTGCCCTCGTGGTGGGTACTATAGTTATTATTG GCATTCACTAGCATAGAGCATTATTAGTCTTATTATTGTCTCATAGAATTTAAGTTTGAATTTTGATACACACTTTGTAA CTACAACTCATGCTTAAAGCATTTCTTCATGTTTCCATCTAGCTTGAACCCTATGTCTGACGTCTCCATCAATTTGATAC CTAAACCTTGCATCTTATGATATGTAATATCCAATTTTCACTGCTAAACATCGCTATCCCGTGTTTTACTAAACCTAAAT TTCATCGTATTCTCTCTAAATGAATAGCCTTTAAATCCAAAGCTTCTCCTCCCTTAAAAATGAAATAAGGAGCAAGGCAG AGGTGCATAGTATTTGCAATTTCTAGATTATTCAAAATATCAAATTCCCTACTTTTAGATTTTATTATTTCTTAATTATA CTAATAAATGTTTTGTTTTTGTGTAGATTGTCGAGGATGAAAATGTAGAAGTTGATTCCAAATTTCGTGCTTTTGTTGCT GTTGGATCACTGGTATGTTAAAGTTTTTGCCTCTTTTCTTAAGTTTTCTACATTTATTTTATTTTGTCTTTATGTAAATG AATCTGGTCTGTATGTCAGCATCGCAATTTAATTACATATTTTTCTCTTATTAGTTATTTGCTACAATCTGCATTTGCGT TTCATTTATTTCCGTTGTCAACTCTTGTTATTCAACCTATTTTCAAATTGTTTTGGTGGTTGGATTAAGTTTCATATCCT AGACAGTGAAACACATTTGTCTTTGGTAACACAGAATTTACTTGACATAAGAAATGATAATGTTTTAGACACCAAGTTGC AAGTATGAAATAACATTTTGTTTATCCAAAAAGAATAAAAAACCTCCACCAGAAGAACTAGCCCCACCAGGATGTGGATG TTCTCGGCTTGAGCAATATTACCTTCGGTGGAGGATATCTGTCCTGAACCAAAAAATTGCGTCTTGTTTTTGTTATCATC GTAGGAGAGCTAATGAAGATTAATTATTCAACAAAGTGTGACATTAGACTGATTTTGTTTTTGTTTATGATATCGTATGC ATAAAGGCATATCTGTACCTGTGAAATGCCTCACTCAAATTTTTATTTGTCAAATCCTCTTTAAACAGATGCTCGAGGGT CTTGTGAAAAAAATAGCACTGGACTTTGATGTTTTGAACATTGCAAAAGCAGCTAAGGGTTCTAAGGAAGCCAAGATTGC TGAAGTTGGAGCTGACATAGAGTTGCTAACAAAGAGCTGAATCCAATTCCTTCTGGGTGATTAATCTCTTCCTTTCCCCC AAATAAAATGATGGACAAAATAGGAATGCCCATGCTCATGTTACTGACCCACAATCGAACACATGCACACGGGTTCCATT TTTGTTATTCTGTGCATTTTGTATCTGTGGGGAAAGGTCAAAGCACCTTATGCAGAGTTCCTTGGAAATGGAATTTTTTT ATGCAGTGTACAGCATCATGATCTTCAGATCCTTGTGCCAAATTCTCTCATATATCGAATTTTCATTTCTATTTGAAATT CTATTTGATACGATTATTTTTTGGGTCCAAGGACGACTATGTATATGCTCGCATATACACTATCATCAGGTTTGAGTTAA GTTCAATCTTTATATTGATGGTGAAGGTTTTTTTAGTAAAATAAATCTTGCAATCTATATGATTTGAAATGGTTAATACT TAATATTAAGGCTTAATAGTTCTATAGGCCCCTGAAATTGTACCCCGTATGAAAATAAGTCCCTGAATTTTTTTTTCCGA TTCCAGGTCCCTAGAAAGTTTTTTTTTATCAAAATAAGTCCCTGAGCGTGTTTTAAACTGAGGTGGCTATATTTAATCCT ACTCACTTTTTCCACGTCTGCATTAATAATTTTTTTAATTATTTAATGAAAAATTAAAATTAAAAAACACTAAAATTAAT CCCTAATCCTAATTCCCCTTTAACCCTAATCCTAAATCAAAATCAAAACTAAACCTAAGATAGAATAAAGGGGGATTGTG GAAGAAAGGGAAGGAGATGGAGAACCAAAGGTAGAAGGAGATGGAGAATAAAGGGGGATTGCCGACTGCGGATGATGAAT GATGGTGGCGTGAGTAGTAGTAAGGAGGAGGGAGATGTGGAGGTGAGTGAGGGTAACTGTTTCTTCTTTTGTTGCTGATG TTGTTGCTCCATGAAAAACCCATCTTCTTCTTCTTCTGCTTCTTGTTCAGGTTCTGGTTCAATCTCAGTTGCCAAATTAA GAAGAAGAAGAAGAACCGGAAACTTCAACTCAAGG
CDS sequence (LotjaGi3g1v0505600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGACATTGATTTCAAAGAGTACCAGTTACGCTGTGAACTTCACGGCCACGAAGACGATGTTCGTGGAATTTGCGTCTG CGGCAACGACGGCATAGCGACATCGTCAAGGGACAAAACGGTTAGGTTCTGGTCACCGGAAAATCGCAAGTTTGTGTCGT CCAAGGTTCTGGTCGGGCATTCGAGCTTTGTGGGACCCTTGGTGTGGATCCCTCCGAACCCTGAGTTGCCGCAAGGTGGG GTTGCGTCTGGCGGCATGGACACTCTCGTGTTGGTGTGGGACTTGAGCACTGGTGAGAAGGCTCACACGCTCAAGGGTCA TCAGTTGCAGGTTACTAGCATTGCGTTTGATGATGGGGATGTTGTTTCCGCTTCGGTTGATTGTACATTGAGACGGTGGA AGAACGGGCAATGTACAGAGACGTGGGAGGCTCACAAGGCTCCAGTCCAAGCTGTTATCAAGCTACCCACAGGCGAGCTT GTTACAGGTTCAAGTGATACTACTTTGAAGCTTTGGAGAGGAAAAACTTGTGTACATACTTTTGAAGGACATTCAGATAC AGTTAGAGGCTTGGCTGTGATGTCTGGTCTTGGAATCCTGTCTGCATCCCATGATGGTTCTCTCAGATTATGGGCAGTCA GTGGTCAAGTGTTGATGGAGATGGTTGGCCATACTGCAATTGTTTATTCAGTTGATTCACATTCATCCGGACTTATTGTG AGTGGTAGCGAGGACCGTTTTGCAAAAATATGGAAAGATGGAGTTTGTGTTCAGAGCATAGAGCATCCTGGTTGTGTTTG GGATGCAAAATTTATGGAAAATGGAGATATCGTGACAGCATGTTCAGATGGAATTGTACGCATTTGGACCGTAAATCAAG ATTATTTTGCTGACCAGCTAGAGCTTGATTTATACACTTCACAACTTTCTCAATACAAGTCTAGTAGAAAGAGGGTTGGA GGATTGAAATTGGAAGAGTTACCAGGGTTGGAGGCACTGAAGATCCCAGGAACTAGTGATGGCCAGACAAAAGTAGTCAG AGAAGGGGATAACGGGGTTGCATATGCATGGAACATGGCAGAACAGAAGTGGGATAAAATTGGTGAAGTTGTTGATGGAC CAGAGGAATCAAATCGTCCTTTTATGGATGGCATTCAGTATGATTATGTGTTCGATGTTGATATTGGAGATGGTATGCCT ATCCGTAAGTTGCCATACAACCGATCAGATAATCCATATGATGTTGCTGATAAATGGCTACTCAAGGAGAATCTTCCTCT TTCCTTCCGTGAGCAAATTGTACAGTTCATACTTCAAAATACTGGACAGAAGGATATTACTTTTGATGCTTCATTTCGTG ACCCCTACACCGGCTCCAATGCTTACATACCAGGACAACCTTCCGGCATGTCTGATATTTCTGCGAAACCTACCTTCAAG CATATCCCTAAGAAAGGGATGCTTGTTTTTGATACAGCTCAGTTTGATGGGATCCTTAAAAAGATTACCGAGTTCAATAA TACTCTACTATCCAATCAGGAAAAGCAGAACTTGTCCTTGACGGAGCTCGATGTTTCCAGACTGGGTGCCATTGTTAAAA TTCTCAAAGATACTTCACATTATCATTCTAGTAAATTTGCAGATGCTGATATCGCCCTATTACTGAATTTGCTTCGGTCA TGGCCAAGCTCAATGATATTTCCTGTCATTGATATTGTAAGGATGATAGTTCTTCATCCAGAAGGGGCTCTTGTACTTCA CAAGCATTTTGGAGCTGAAAATGACATTCTAATGGAATTGATTAAGAAAGTCACCATAAACCCGACAATTCCTGCGAATC TGTTGACCAGCATTCGAGCTGTGACTAATCTCTTTAAGAATTCATGCTATTACAACTGGTTGCAAAAACATCGTAGTGAG GTTCTTGATGCTTTCTCAAATTGTAGTTCATCTACAAACAAAAATTTGCAGCTATCCTACTCTACCTTGATTCTCAATTA TGCTGTGCTATTGATTGAATCAAAAGATCAAGAAGGTCAATCTCAAGTTCTATCAGCAGCTCTTGAGATTGTCGAGGATG AAAATGTAGAAGTTGATTCCAAATTTCGTGCTTTTGTTGCTGTTGGATCACTGATGCTCGAGGGTCTTGTGAAAAAAATA GCACTGGACTTTGATGTTTTGAACATTGCAAAAGCAGCTAAGGGTTCTAAGGAAGCCAAGATTGCTGAAGTTGGAGCTGA CATAGAGTTGCTAACAAAGAGCTGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0505600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MDIDFKEYQLRCELHGHEDDVRGICVCGNDGIATSSRDKTVRFWSPENRKFVSSKVLVGHSSFVGPLVWIPPNPELPQGG VASGGMDTLVLVWDLSTGEKAHTLKGHQLQVTSIAFDDGDVVSASVDCTLRRWKNGQCTETWEAHKAPVQAVIKLPTGEL VTGSSDTTLKLWRGKTCVHTFEGHSDTVRGLAVMSGLGILSASHDGSLRLWAVSGQVLMEMVGHTAIVYSVDSHSSGLIV SGSEDRFAKIWKDGVCVQSIEHPGCVWDAKFMENGDIVTACSDGIVRIWTVNQDYFADQLELDLYTSQLSQYKSSRKRVG GLKLEELPGLEALKIPGTSDGQTKVVREGDNGVAYAWNMAEQKWDKIGEVVDGPEESNRPFMDGIQYDYVFDVDIGDGMP IRKLPYNRSDNPYDVADKWLLKENLPLSFREQIVQFILQNTGQKDITFDASFRDPYTGSNAYIPGQPSGMSDISAKPTFK HIPKKGMLVFDTAQFDGILKKITEFNNTLLSNQEKQNLSLTELDVSRLGAIVKILKDTSHYHSSKFADADIALLLNLLRS WPSSMIFPVIDIVRMIVLHPEGALVLHKHFGAENDILMELIKKVTINPTIPANLLTSIRAVTNLFKNSCYYNWLQKHRSE VLDAFSNCSSSTNKNLQLSYSTLILNYAVLLIESKDQEGQSQVLSAALEIVEDENVEVDSKFRAFVAVGSLMLEGLVKKI ALDFDVLNIAKAAKGSKEAKIAEVGADIELLTKS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 4 | 751 | 748 | 0.0 | – | |
| Gene3D | 4 | 307 | 304 | 5.4E-77 | ||
| PANTHER | 4 | 751 | 748 | 0.0 | ||
| SUPERFAMILY | 5 | 304 | 300 | 1.81E-62 | ||
| SMART | 7 | 45 | 39 | 4.2E-6 | ||
| CDD | 10 | 289 | 280 | 3.72833E-62 | – | |
| Pfam | 12 | 45 | 34 | 0.0025 | ||
| ProSiteProfiles | 14 | 252 | 239 | 23.862 | ||
| ProSiteProfiles | 14 | 54 | 41 | 9.94 | ||
| SMART | 50 | 94 | 45 | 16.0 | ||
| ProSiteProfiles | 57 | 103 | 47 | 9.506 | ||
| ProSitePatterns | 81 | 95 | 15 | - | ||
| PRINTS | 81 | 95 | 15 | 6.8E-5 | ||
| SMART | 97 | 134 | 38 | 2.2E-4 | ||
| Pfam | 99 | 133 | 35 | 0.026 | ||
| ProSiteProfiles | 104 | 134 | 31 | 9.005 | ||
| SMART | 135 | 173 | 39 | 5.4E-5 | ||
| Pfam | 136 | 172 | 37 | 0.0057 | ||
| ProSiteProfiles | 142 | 172 | 31 | 8.67 | ||
| PRINTS | 160 | 174 | 15 | 6.8E-5 | ||
| SMART | 174 | 212 | 39 | 2.1E-5 | ||
| Pfam | 176 | 211 | 36 | 3.1E-4 | ||
| ProSiteProfiles | 181 | 211 | 31 | 9.539 | ||
| PRINTS | 199 | 213 | 15 | 6.8E-5 | ||
| SMART | 214 | 252 | 39 | 4.4E-6 | ||
| Pfam | 216 | 252 | 37 | 0.0093 | ||
| ProSiteProfiles | 221 | 252 | 32 | 9.406 | ||
| SMART | 253 | 290 | 38 | 1.6E-4 | ||
| Pfam | 255 | 289 | 35 | 0.0012 | ||
| Pfam | 336 | 444 | 109 | 9.8E-38 | ||
| ProSiteProfiles | 356 | 451 | 96 | 37.202 | ||
| Gene3D | 379 | 460 | 82 | 4.7E-27 | ||
| ProSiteProfiles | 480 | 751 | 272 | 28.516 | ||
| Gene3D | 480 | 751 | 272 | 3.2E-61 | ||
| Pfam | 482 | 747 | 266 | 2.6E-57 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). | ||
| Molecular function | Ubiquitin binding | Interacting selectively and non-covalently with ubiquitin, a protein that when covalently bound to other cellular proteins marks them for proteolytic degradation. | ||
| Biological process | Proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process | The chemical reactions and pathways resulting in the breakdown of a protein or peptide by hydrolysis of its peptide bonds, initiated by the covalent attachment of ubiquitin, and mediated by the proteasome. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0505600.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…