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LotjaGi3g1v0527900.8

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi3g1v0527900
Transcript ID LotjaGi3g1v0527900.8
Related isoforms 7
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Protein kinase; TAIR: AT3G13530.1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7; Swiss-Prot: sp|Q9LJD8|M3KE1_ARATH MAP3K epsilon protein kinase 1; TrEMBL-Plants: tr|K7LNY1|K7LNY1_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0527900
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr3:94463784..94484302) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ATGCTGGGAGATGAGATTGGGAAAGGAGCTTATGGTCGAGTGTACAAAGGTTTGGACCTGGAGAATGGAGATTTTGTTGC AATTAAGCAAGTTTCTTTGGAGAATATTGCTCAGGAGGATCTTAACATCATTATGGTATAGAATGTGTCTTAAAACCATC TGTTTTCATTTCCAATTTTCTATTTTATGTTCGCTAGTAATTATAAACGTGAAAGCTTGTTGCTTTGCTTTCATAATACA TTATATCTATCTATCTATCTATCTATCTACTGATGCTCTTTTACTTGTGGCTGTACTGTCATGTGATGCCTAAATGTTCC AGCAAGAGATTGATTTGTTAAAGGTATTTCTTTTCCTCAATGTTGGATTTGCACTATATTATCAATTGAAATCTCATCTG GTTAATATCTGTCGTGGTAGTAAGTCTGTAAGTGTTCCATTTTTGTAAGGCTATTGGTTAAAACTTTAGGAGGGGAGAGG GGGGGGGGATTAAGGGGGCCACAACCCTCCTAAGTCCTAACTTAATTTTGGCTTTCCTCCAATTTTGGGGGATTTAGAGG GGAGATGAATTGTGTGACTAAAAGATTAATCCTCATATTCTGAAATCAAAAATTCTATTTTGGAAGCAGGGGCAATGAAA GTAAATTTGTTTTGATATCCCTCCCCTCCCCTCATGAACTAAACAAGAAGAGAATCATGAATTTTCCCTTCCCTTCCCCT CCCCTCGTCTCCTACTATCCAATCATCATAAAAATTGAAATCACTCCCCTCTTCTCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTCTC CTCTCTCATTTGAACTAAATTAGCTTAAAAGCTTGAGATTTTTAACACCTGTATAATTGGTATTGACTTACTATACGATT CATCATTCATGTTTTTGAAATGATTAATATTTTACAGAATTTGAACCACAAAAACATTGTAAAGTATCTTGGATCCTTAA 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AAGACAACAGTATTGAAGTCTAGCATAAATATATTGGCTTCTGGACTGTTTTTTCCAATTTACAAGTGTGGTTATCTGCG ATTTTTTTGTCCTTTGTCATGTTGTGGCAGATATCCAAAGTTGGCGTGAATCTCACCTTTCAACTCTTGACAGGTTCTGA ACGCACTGTTCAATTTATGCAAGATAAATAAGAGAAGACAGGAACAAGCAGCTGAAAATGGAATCATTCCCCATTTGATG CAATTCATCACATCAAATTCTCCCCTGAAACAATATGCGTTGCCTCTGCTATGTGACATGGCTCATGCATCTCGCAACTC AAGGGAGCAGTTAAGGGCTCATGGTGGTTTGGATGTCTATTTGAACCTTCTTGAGGATGAACTTTGGTCTGTGACAGCAC TAGATTCAATTGCTGTTTGCTTAGCCCATGACAATGACAACAGGAAGGTTGAACAATCATTGCTGAAAAAGGACGCAGTT CAGAAGCTTGTGAAGTTCTTCCAGAGCTGTCCTGAGCAACATTTTGTACACATATTGGAGCCATTTTTGAAAATCATCAC GTATAGTATTCTAAGTCCTTTTATTTCTTCCGTCCAGTTAATTAAGTATTTGGTTTTAGATCCTTTAATTATTTGATAAA GTAGTCTTTGGGTTGATGTTTGATAAGTTATAAACTAAGGATGTCTAGGTTGTTGCACCAAAGTTTCTTTTCTTATTGTG AAGTTGACTGGATGTAAGATGGACAAGTTTTCACTTTAGGTGCTAAATTTACGGATAGCAGAGAATGAATTAGGATTCCA CCAAATTGGCAGCCTTGTTATATCTAGGACCTGATGCCATTAGAAGTTAGATTTAGTAGCATATGATTAATAAGAAATAT AAGATATGGTGGGGCAAAATGAGAGTGTTGTTTATCTTTAGGCCAAATACTTATATAGTAAATGTAGTATAAGAGAACTG TTTGTTCAAGGTATGTGCACCAAACATTCTACAAGGATTGGGTCCCCGGTCGTTAGAGATATAGCCTAGTCTCTACTGTT AGTCTGTTGCACAATTAGCTTAGCCTACTGTTGTTAGCTTACTGTCAGGTAGTAAGGGATTTTTTTATAGTTTATACTAG AGATGATTTATACGTACTTCTAGCCCAGAGAATTATAAGTACTTAGAAAATCATTTTATATGTTTTTTCTCCAAATGTTA TCATTCTTACTTTCTTTTCTTCATATAATTATATTGCAGAAAATCTTCCCGGATCAATACCACATTGGCTGTTAACGGAT TAACACCATTGCTCATTGCAAGGCTTGATCATCAGGATGCTATAGCTCGTCTTAATTTACTCAGGCTAATAAAGGTATGC ATATATGATATTTGTTATACATTTGAGAATTCTGGTGCGCCCTACCACACGTTAACCAACCTTAAGCATTGCTTTAGTCT AAGACGCTTTAAATTCAGTCATGAAACAAGGTAAAAAACTAAGGTGGCCAAACTTTGGTGCAGGATTTTACTTCTAGAAC TATAAACCTTTTAAGTATGATGTTCATGTATGTGTGGCTTCACATACTGAAGAAAGTCTTAAACTACATCCATATTATGC ATATTTCTTTAGATAGTAATAATGTAGTGATTCCATAAGAGCTTCATTTGAGAAATTGGTTTCTCTGCAGTTGTATTTAA CTTGATAAGTTTTAATAATTGAATGAGCGTATTAAGTTTCGAACGTGAGAAAGTAAACTCCTGATGCAGATATCTCAGGT TTCCAACATATGGTTTCAAATAACATGCTCCTATTTTGTTCCTTTTTTTTCTAGTGTCATTATATAAATTCGAAGGTGCT ATCATTTCATTTATAATAAACACCAGTGTCTTTTGATCCTGATAGATGATTTGTGGATAGATTAGATAAGCCTTCTCCAA AATGTGGAATATTAAAATTGAATGAGCGTATTAATAATTCAAATATATCTAACCATATGGGCTTAAAAGACAATCATATC TTGATATCCTCTCAAGATAGAGTGAAACATGGTTATTTTGTTTTCCCCTAGACATTACTTGGTATAAAATATGTATGAAT GTGACATCCAATGGATCTCTGCACATTGTTTTTGCAGGCTGTTTATGAGCATCATCCGCAGCCCAAGAAGCTGATTGTGG AGAACGATCTTCCTGAGAAACTTCAAAACTTAATAGGGGAACGGAGAGATGGACAAGTGTTGGTGAAACAGATGGCTACT TCATTGCTTAAAGCTCTACACATCAACACCGTATTGTAA 

CDS sequence (LotjaGi3g1v0527900.8) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGCTGGGAGATGAGATTGGGAAAGGAGCTTATGGTCGAGTGTACAAAGGTTTGGACCTGGAGAATGGAGATTTTGTTGC AATTAAGCAAGTTTCTTTGGAGAATATTGCTCAGGAGGATCTTAACATCATTATGCAAGAGATTGATTTGTTAAAGAATT TGAACCACAAAAACATTGTAAAGTATCTTGGATCCTTAAAGACAAAGAGTCACCTGCACATAATTCTTGAGTATGTGGAG AATGGCTCACTTGCAAATATTATCAAGCCAAATAAATTTGGACCCTTTCCAGAATCATTGGTTGCTGTTTATATTGCCCA GGTGTTGGAAGGCTTGGTTTATCTGCACGAGCAAGGTGTTATCCATCGGGATATTAAGGGTGCAAACATATTGACAACTA AAGAGGGTCTTGTCAAACTTGCTGATTTTGGTGTGGCAACAAAATTAACAGAGGCTGATATTAATACCCATTCAGTTGTT GGAACACCATACTGGATGGCCCCAGAGGTTATAGAAATGTCCGGGGTTTGCGCAGCTTCTGACATTTGGAGTGTTGGCTG TACGGTTATTGAACTTCTTACATGTGTTCCTCCTTACTATGACTTGCAGCCTATGCCAGCTCTTTTCCGAATTGTACAGG ATGAGCAACCTCCAATTCCTGATAGCCTTTCACCTAACATTACTGACTTTCTGCATCAGTGCTTTAAGAAGGATGCAAGA CAAAGGCCTGATGCGAAAACGCTGCTGTCTCACCCCTGGATCCTAAACTGTAGACGTGTCCTGCAGTCTTCTCTTCGTCA TAGCGGAACATTAAGAACTATAAAGGATGATGGTTCTGCAGTTGCAGAAGTTTCTGGTGGCGACCATAAGAGCACTGGTG AAGGATCTTCTGTGGAGAAAGAGAATAGCAGGAAATCTCATGAAGACAACGCTTCAGATTCTAATTTTTCCAACGAGAGA ACAGAGAAGGAAGATGATATTCCATCAGATCAGGTTCTTACTTTAGCCATTCGTGAGAAGTCATTTCTACGAACTGGTTC TGGCAATCTCTCTTCTAGTATAGAAGTGGTTAGTGCTGAGCCAACTGGCACTGAAACTTCAAATGCTAAAGACCTTCATG AAGTCATAATGAATGGAGAAGTTGAATCTCCACAATCAAGAGGAAAGGCTAATATGGCTGTAGGAAAAGACAGTTCTATC AATAATCGCACTAAACCATTTGCTTTTGAACCAAGAGGACAAGATAGTGGTTCCCTAAAGGCAATGAAGATACCGCCCCC TGTGGAAGGAAATGAGCTGAGTAGATTTAGTGACCCTCCAGGAGATGCCTACTTAGATGACTTATTTCATCCATCAGATA AGCAATCTGGGGAGGTTGTGGCTGAGGCATCCACATCTACATCTACTTCACATATAGCTAAAGGTAATGTATCTATGAAT GATGGTGGGAAGAATGACCTTGCCAAAGAGTTGAGGGCTACAATTGCTCGAAAGCAATGGGAGAAGGAGAGTGAAATTGG GCAGGAAAACAATGGTGGGAACCTTTTACACCGAGTGATGATAGGTGTTCTAAAAGACGATGTTATTGATATAGATGGTT TGGTCTTTGATGACAAACTTCCTGGAGAAAACCTTTTTCCTCTACAGGCCGTTGAGTTCAGCAAATTAGTTGGTTCTTTA AGAACAGAAGAATCAGAAGACGTGATTGTCTCTGCTTGTCAGAAACTTATTGGTATATTTCATCAACGCCCAGAGCAGAA GATTGTATTTGTTACCCAGCATGGTTTACTTCCTTTGACTGACTTGCTAGAAGTTCCTAAAACGCGCGTCATATGTTCTG TGCTTCAGCTTATAAATCAAATAGTTAAAGACAACACTGATTTTCAAGAAAATGCATGTCTTGTTGGATTGATTCCGGCA GTCATGAGCTTTGCAGTATCTGATCGTCCTCGAGAGATTCGTATGGAAGCGGCTTATTTTTTACAGCAGCTTTGTCAGTC AAGTTCTTTGACATTACAAATGTTTATAGCTTGCCGTGGGATACCTGTTTTGGTGGGATTTCTTGAGGCTGATTATGCCA AGTACAGGGAGATGGTTCATCTGGCTATTGATGGCATGTGGCAGGTGTTTAAACTTCAGCAGACAACGCCTAGAAATGAT TTTTGTCGGATAGCTGCAAAAAATGGGATACTCCTTAGGCTTATAAATACCCTTTATAGCTTAAATGAGTCAACTCGATT AGCTTCTATGTCTGCTGGGGGTGGATTTCTGGCTGATGGTTCGGCTCAACGGCCACGTTCTGGTATCTTGGATCCTGCAC ACCCTTTTATGAATCAGAACGATGCACAGCTATCTTCAGCAGATCAGCAAGATCTCTCTAAAGTGAGGCGTGGTGTGCTG GATCATCACTTAGAGCCTATGCATGCTTCGTCTTCCCATCCTCGAAGATCAGATGCTAACTACCCAACGGATGTTGATAG ACCTCAATCGAGCAATGCAGCAGCTGAAGCTGTGTCACTGGGGAAGAGTTTGAATCTCACTTCGAGGGAATCTTCAGTAG TTGCATTGAAAGAGCGAGAGAATGTGGATCGTTGGAAAACTGATCCTTCTCGGGCTGAAGTTGAACCCAGACAGCAGCGT AGTAGTATTTCTGCTAACAGGACATCAACAGATAGGCCTCCAAAATTGGCAGAACCTTCTTCGAATGGGCTATCAATGAC AGGAGCTACACAGCAAGAACAAGTTAGGCCTCTTCTTAGCTTGTTGGAGAAAGAGCCTCCATCTGGACGCTTTTCAGGAC AGCTTGAGTATGTCCGTCAGTTTTCAGGATTAGAGAGACATGAAAGTGTACTCCCTTTGTTACATGCCACTGAAAAGAAA ACAAATGGTGAACTAGACTTTTTGATGGCAGAATTTGCAGATGTTTCTCAACGTGGGAGGGAAAATGGAAATCTTGACTC CAGTGCTAGAGTGTCTCACAAAGTTGCTCCCAAGAAATTAGGGACTTTTGGTTCTAGTGAAGGAGCTGCTTCTACATCTG GGATTGTATCTCAGACAGCATCAGGTGTACTGTCTGGTTCAGGTGTTCTAAATGCTAGACCAGGTAGTGCTACTTCATCT GGGCTACTTTCCCACATGGTTTCATCATTGAATGCAGATGTTGCAAGAGAGTACCTGGAAAAAGTGGCAGATCTTCTGCT TGAATTTGCACAAGCTGACACAACAGTGAAGTCGTACATGTGTAGCCAAAGTTTGCTTAGTCGTCTTTTCCAGATGTTCA ATAGGGTGGAGCCTCCTATTTTGTTGAAGATACTGAAGTGTATCAATCATCTGTCAACTGATCCAAATTGCTTAGAAAAT CTTCAGCGTGCTGAAGCCATTAAACACTTGATACCAAATCTTGAACTCAAAGAAGGGACTCTTGTATCAGAGATACATCA TGAAGTTCTGAACGCACTGTTCAATTTATGCAAGATAAATAAGAGAAGACAGGAACAAGCAGCTGAAAATGGAATCATTC CCCATTTGATGCAATTCATCACATCAAATTCTCCCCTGAAACAATATGCGTTGCCTCTGCTATGTGACATGGCTCATGCA TCTCGCAACTCAAGGGAGCAGTTAAGGGCTCATGGTGGTTTGGATGTCTATTTGAACCTTCTTGAGGATGAACTTTGGTC TGTGACAGCACTAGATTCAATTGCTGTTTGCTTAGCCCATGACAATGACAACAGGAAGGTTGAACAATCATTGCTGAAAA AGGACGCAGTTCAGAAGCTTGTGAAGTTCTTCCAGAGCTGTCCTGAGCAACATTTTGTACACATATTGGAGCCATTTTTG AAAATCATCACAAAATCTTCCCGGATCAATACCACATTGGCTGTTAACGGATTAACACCATTGCTCATTGCAAGGCTTGA TCATCAGGATGCTATAGCTCGTCTTAATTTACTCAGGCTAATAAAGGCTGTTTATGAGCATCATCCGCAGCCCAAGAAGC TGATTGTGGAGAACGATCTTCCTGAGAAACTTCAAAACTTAATAGGGGAACGGAGAGATGGACAAGTGTTGGTGAAACAG ATGGCTACTTCATTGCTTAAAGCTCTACACATCAACACCGTATTGTAA 

Protein sequence (LotjaGi3g1v0527900.8) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MLGDEIGKGAYGRVYKGLDLENGDFVAIKQVSLENIAQEDLNIIMQEIDLLKNLNHKNIVKYLGSLKTKSHLHIILEYVE NGSLANIIKPNKFGPFPESLVAVYIAQVLEGLVYLHEQGVIHRDIKGANILTTKEGLVKLADFGVATKLTEADINTHSVV GTPYWMAPEVIEMSGVCAASDIWSVGCTVIELLTCVPPYYDLQPMPALFRIVQDEQPPIPDSLSPNITDFLHQCFKKDAR QRPDAKTLLSHPWILNCRRVLQSSLRHSGTLRTIKDDGSAVAEVSGGDHKSTGEGSSVEKENSRKSHEDNASDSNFSNER TEKEDDIPSDQVLTLAIREKSFLRTGSGNLSSSIEVVSAEPTGTETSNAKDLHEVIMNGEVESPQSRGKANMAVGKDSSI NNRTKPFAFEPRGQDSGSLKAMKIPPPVEGNELSRFSDPPGDAYLDDLFHPSDKQSGEVVAEASTSTSTSHIAKGNVSMN DGGKNDLAKELRATIARKQWEKESEIGQENNGGNLLHRVMIGVLKDDVIDIDGLVFDDKLPGENLFPLQAVEFSKLVGSL RTEESEDVIVSACQKLIGIFHQRPEQKIVFVTQHGLLPLTDLLEVPKTRVICSVLQLINQIVKDNTDFQENACLVGLIPA VMSFAVSDRPREIRMEAAYFLQQLCQSSSLTLQMFIACRGIPVLVGFLEADYAKYREMVHLAIDGMWQVFKLQQTTPRND FCRIAAKNGILLRLINTLYSLNESTRLASMSAGGGFLADGSAQRPRSGILDPAHPFMNQNDAQLSSADQQDLSKVRRGVL DHHLEPMHASSSHPRRSDANYPTDVDRPQSSNAAAEAVSLGKSLNLTSRESSVVALKERENVDRWKTDPSRAEVEPRQQR SSISANRTSTDRPPKLAEPSSNGLSMTGATQQEQVRPLLSLLEKEPPSGRFSGQLEYVRQFSGLERHESVLPLLHATEKK TNGELDFLMAEFADVSQRGRENGNLDSSARVSHKVAPKKLGTFGSSEGAASTSGIVSQTASGVLSGSGVLNARPGSATSS GLLSHMVSSLNADVAREYLEKVADLLLEFAQADTTVKSYMCSQSLLSRLFQMFNRVEPPILLKILKCINHLSTDPNCLEN LQRAEAIKHLIPNLELKEGTLVSEIHHEVLNALFNLCKINKRRQEQAAENGIIPHLMQFITSNSPLKQYALPLLCDMAHA SRNSREQLRAHGGLDVYLNLLEDELWSVTALDSIAVCLAHDNDNRKVEQSLLKKDAVQKLVKFFQSCPEQHFVHILEPFL KIITKSSRINTTLAVNGLTPLLIARLDHQDAIARLNLLRLIKAVYEHHPQPKKLIVENDLPEKLQNLIGERRDGQVLVKQ MATSLLKALHINTVL 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
ProSiteProfiles 1 254 254 51.453
Gene3D 1 284 284 4.0E-89
SMART 1 254 254 1.2E-94
CDD 1 254 254 6.43783E-177
SUPERFAMILY 2 255 254 1.75E-88
PANTHER 4 1370 1367 0.0
Pfam 4 254 251 8.9E-73
PANTHER 4 1370 1367 0.0
ProSitePatterns 6 29 24 -
PRINTS 76 89 14 5.7E-9
PRINTS 114 132 19 5.7E-9
ProSitePatterns 120 132 13 -
PRINTS 180 202 23 5.7E-9
PRINTS 223 245 23 5.7E-9
MobiDBLite 278 327 50 -
MobiDBLite 293 327 35 -
MobiDBLite 382 420 39 -
MobiDBLite 464 484 21 -
Gene3D 552 754 203 3.5E-16
SUPERFAMILY 554 750 197 2.64E-21
SMART 583 623 41 6.2
MobiDBLite 767 790 24 -
MobiDBLite 804 837 34 -
MobiDBLite 813 837 25 -
MobiDBLite 862 911 50 -
MobiDBLite 876 911 36 -
Gene3D 1031 1372 342 5.6E-24
SUPERFAMILY 1041 1368 328 3.03E-28
SMART 1114 1158 45 110.0
SMART 1160 1199 40 7.9

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein kinase activity Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP.
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Biological process Protein phosphorylation The process of introducing a phosphate group on to a protein.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi3g1v0527900.8, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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