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LotjaGi3g1v0538500.2

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi3g1v0538500
Transcript ID LotjaGi3g1v0538500.2
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Exportin-1; TAIR: AT5G17020.1 exportin 1A; Swiss-Prot: sp|Q9SMV6|XPO1A_ARATH Protein EXPORTIN 1A; TrEMBL-Plants: tr|K7LSJ2|K7LSJ2_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0538500
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr3:95486208..95497439) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ATGGCCGCCGAGAAACTCAGAGATTTGACCCAACCCATGGACGTCCCTCTCCTCGACGCCACCGTCTCCGCCTTCTACGG CACCGGATCTAAGGAAGAGGTTCAATTCCACTTCTCTACTTTTCGAATTTCTGTCACCAACTTGGACGGGTTTGAGACAC CAAAACATTTTCGAATTTCTCTTCACTGGTTCTCATGTTTTCGATGAATGTAGTTAATCACTGACGCTAGGGCGTTCTGG TTTTTCCTTTTTGTGAGAATGTACTTCTGATTAGGGCTCTTTTTTATGATTTTTTGTGCGTTTGAATCATGCAGAGAAGT GCTGCTGATCAGATTCTGCGGGAGTTGCAGAATAATCCTGACATGTGGCTCCAAGTCATGCATATTCTGCAGAACACTCA GAGTCTCAATACCAAGTTCTTCGCCTTGCAGGTTGGTTTGTTTATTAGGTGTTTCTGTTGCGACTGATTATGAGTTGTGG TGAAGATAAAAAAAAATCTGTGCTAGGTTGACCATGTTAGCAATGTACCGTGTTTAAAAGCATGCTTACTTTAAAGTACT TTAACTGAGGTGCTTTAATTTGAATGTAATTATGTGAGATTTGAGTAGGACTTGTAGGAAAGCTTGCTTTGTCGAAGAGT GTGCCTATATTTGCTGAAATCTTAATAGGATCCTATAGAGAGGCTTAGGTAAAAAATGATCGTTCTGCATCAATTCGTTG GATAGAGCTATTGGCTTATTTGCTTGTTTTATCTTTTAATATTTGTGTTATATGCAATGTTGTTAATGTCGGATGGAGGA GAGCCGAAAACCTGCCATATTTCATATTTGACAAATAATGATGGCGGGATATCGGCCATGGTGGATAGCCAAAAACCCGC CATGAGTTTATGCCATGTCGGATAATTGATAGCACTAGTTCTATGGACTACTTAATTTTGACATCTTCTTCCAATTGATT GTCCCATCTTCTTTAGGGCCAAACAAGTGTTCATTTTCTTAGTGTTATTTTAGCTGCCTTTTTCAGTGAATTTTATTTTA TGCTTGTGCATTCAGGTTCTAGAAGGTGTAATTAAATACAGATGGAATGCACTACCTGCTGAGCAGCGAGATGGGATGAA GAACTTCATCTCTGATGTTATTGTTCAGGTATCAGCCATATCAGGAGAAAGCAGAAATCTGAGCTAGTCAGACTTTAATC TTCTTTTGTTAATTTATAGTTTTTTCTGCTTTATTGGTCTCATATTTGGTTTTTCTTGGTTAGCTTTCTAGCAACGAGGC GTCATTTCGAATGGAAAAGTTGTATGTCAACAAACTCAATATTATATTAGTTCAGGTAAAAATTGCAGTTTCCTAGTATT ATTTTGTCTGATTATTCCTGTTAGTCTTGCAACCCATTGTCTAGTGCATATGTTTAATCCCTTATTTTAATGTTATAATA TAAATTCAAACACTATTTTTTCCCTTTTCCCATATAATTTATATTTGGGGTGCATAGTGCTGACAAATGGATGTCTTGAA ATCAGTGATTTGGTGCATATAGCTTATCCTTTTCTTTTCCATTTGTAAATTCAATCGGCTTAGTGTTTTAATTACCCTTT ATTTTGATAAATAACTCTTTTTGGGTGGGATTCTAAACACATTTACTGATGAAGATTCAAGATAAAAACATATCTTTTCT GCAGATTCCTTGAAACTTTTGTGATAAAGATGCAGATTTCTTATCACTTCTAAAAATCCACAATCTCCTTAGCTCTGCAT TGTTGTTTCTTTCTTTTGTTTTTGGTATCTATGCATGAATTTCCGTGTGACTAAAGGCTGTATATTATGGTGTGGTTATG TCTCATATGCAGATTCTGAAGCATGAATGGCCAGCAAGATGGAGAAGCTTTATCCCTGATCTTGTTTCAGCAGCTAAAAC 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TAGCTAGCTATGTGTTCAGTGATTGAATGTGATGTATGTACATTTATTTTCTCTGAAGTGTCTATCTATGTTGCTAAAAA TTATACTTTGGTTCTTTGCAGTGAATTTCAACTCATACATGAGCTATGCTTATACGTGCTATCAGCATCCCAAAGGACAG AGCTCATGCGTGCAACACTGTCTACATTGCATGCCTTCTTATCATGGATTCCCTTGGGTTATATATTTGAATCGCCATTG GTAAGAGCAAACTTCTGCTTGATTTAATCTTGTCATGGAGGAATTCACCAACTGAAATATTTGATACTTGTGTAATCACA GCTTGAGACACTCCTGAAGTTTTTCCCTGTTCCAGCGTATAGGAACCTGACATTGCAATGTTTAACAGAGGTATGTTCCA TCCTATAAGTTCTGTTGTTTTTACTTTTTACCTTAAATTTTCATCATAAATACTCACCTTTTATGTTTGCAGGTGGCAGG CCTTCAATTTGGGAATTATTATGATGTGCAGTATGTCAAGATGTATAATATATTCATGGTCCAATTGCAGGTGTGTTTTG GATTAATCTCATTTCTTTAACTAATTCTATCTTAAGTTATACTATAATTTCTTCGTTTGACTCTGCATATGGTATGTTAA ATGTAGGGTGTACTCCCACCTACTACAAATATACCTGAGGCATATGCACATGGCTCAAGTGAGGAACAAGTGAGTCTCTG CTGGAACAAGGTGCCCAATTTGCTTAAATAATTGTTTAGTATTGGTCTGACCCTGGGTTTTCCTTTGTCCTCTGTCTAGG CATTTATTCAGAACCTGGCGCTGTTCTTCACCTCATTTTACAAGGTAAGGTTCATTTTGAGTTTTTGTCTATTTTTAATT TTATTCTGTGAATATATAGTTATTAAATAGCATGATTGAAGCGTGTTGAAGAATGTAACCTTGTTGAGGCTGGTGTCTTT AAGCTTGATTTTAGACTATATCAGTCAGTATTATACTTGTGGCTTATTCAAGATCACATAAACCTTTATGGGTCTTGAAA CAAAATCCTTTCTCTTCCATCTCAGCTCCTATTACTTCACTTTCGGGTTGTTTGTTGGATGTTCTGCTTTCTATTAACAG TATTCTGGTACACCCTTCTATATATGCAGGTTCACATTCGCATCCTGGAATCCACTCAAGAGAATATATCTGCTTTGCTA TTGGGCCTTGAATATCTTATCAACATTTCATATGTGGACGATACAGAGGTTTTTAAGGTATTGAAACATGTTTCTTCATT GTGGGCATGCTACTTTTCTTCTGAATTCTCAATCTTACATTTACATGTTATATTTCTTCTGCATACCCTCCCAACAATGT GTTTGTCTGCTTATCCATACTGCTTAACTTTGTGTGTCACTGCCTCCTGTTCTAAAAACCCAAGTTTATACTGTACCTTG TTTGCTTTAAATAACAGGTCTGCTTGGACTACTGGAATTCCTTGGTGTCGGAGCTATATGAGCCAAACCGGAGTTTGGAT AATCCTGCATCCGCTGCAACCATGATGGGACTTCAGGTGGTGTCTCTAAATGATCAACTCTTCTTTACCAAAGCACTTGT CTAACAAAATGTGATATACTATCTTAATATTTGGATTAAAAACTCTGATTATTTTTTTTGATGATTACTCAATGAGATAC TAGGTGTTTTGTGCACATTTCTATGATTTAATTAATAAAATATTCAAACTTATGATTTCAATGCTGGTCTTTTTGTCCTC AATAGTCACTAGAGGCCATAATATGAGCTTATTTCTTATTAGACTGGATAAGATACATTGCTTTTAAAGTGATTAATTAA GTGAACAAAATAAATATGCGGATTAGCAGTGATCACAAGTTCCCAATCATCCTACTTAATGTCTCCACTTATGCCCGTTT CATTTGTTTTTTCTGTGCATCCTTTTTTTCTTTCTCTAAACTATTTAAAACTTTCACATGTTTGATGGCATTCATCTTAC TAAACTTCATGTTATGATAAGGATCTTTCTCAAATTTAAGTGTGTTCAACAAAACAGAGTTTGGCCTAGTAGGTCTTAAA CTGAACATCATTACTTTGGGACAAAGAATGAATGGGCCGCATTTTTTTTTGTATTATTTTCATCTCAGGACCTCTTGTGC TTTTGATTTACTATTTCCTTCTTTCTAAGAATAGTGGCTATGTACTGTGCATAAATGTTATTGATGTTATTTTCTCAATG GCAGGTACCAGGAATGCTCCCTGGTATGGTTGATGGGCATGGTTCGCAGCATCTTCAGCGCCGACAGCTTTATGCTGGTC CCATGTCAAAATTGAGAATGCTCATGATCTCCCGAATGGCTAAGCCTGAAGAGGTTCTAATTGTGGAGGATGAAAATGGA AATATTGTCCGTGAGACCTTGAAGGACAACGATGTTCTTGTTCAATATAAGGTTATAAGCTGGTATCTTAGCACTGTCAG AATTTAGTGTCATATATAAAAATCTGTCTCAAAAGTTATTTTCCTCTGAATTTCATTTTAATAGATTGCTTATTCAAAAT ATCCATAAATTTTGGACTTAACAATGTTTAATTCAACAGATTATGAGGGAAACTCTTATTTACTTGTCACACCTTGATCA TGATGATACTGAAAAGCAGGTATGTGAATCGGAAAGCGCTGGTCCCTTTGTTTTTTTTCCTGGAAACCCAATCATATTAT TTGGTGGTTCTTTCTTACCTGTTTGAATTGTTATTGTAGTGAAGTTTATATTGTTTCAAACATGATCTAGTTTTCTATTT GTCATTGTGAAGCCAGCATATCAAATTTCTTGCATTTCAATATCAATGACATAAGATTCAACAGAGTAACCTAAAAGTCA AATGTTATATTAAAATATTGTTTTGATTTATAGTGATATGATATCAAAGGTACCTATTTTAATGTTGCATGTTTGTTGCA CCTTCATATTATCGTGTAATATGCAGATGCTGAGGAAGTTAAATAAACAACTCAGTGGTGAGGACTGGACATGGAACAAT TTAAACACACTCTGCTGGGCAATAGGGTCTATATCTGGTTCCATGATGGAAGAACAGGTACTGTGAGCTTCGCATTATTG TTCAATCAGTGTTATGTCCCAATATGCGTGGGTCAATTTCAAAATTAACAACTAGTCAAGTTATGGTGATCTTTGAGGTG TTTCTGTTTTTTGGCATCATGCTGGTTTTAGGATTTGTAATTTAAATTTAGGAGACAACCATGTAGACTTTGTTGATATC TTGAAGGGACTGGAGTGTACCATGGATGGCATAGAGTATCTTAATGCATCAAATATAACTTTTGATAGAATCTTAACTAC TCTTTCATAAACTCTCTCTCTCTCTCTCTGGTGTATGTTTCTGTTTCTGTCTCTTTTATGCATTCCTGCTTTTTGTTCAT TTACTTTTCTAAGACTGATACATGTTTAACCTCAACTGATTAAATTTATTATCTATCTCTATTTCTTGTACGTATTCTTT TCTCAGTTTTCCTCCCTATTTATTGTTAAGTTTCTTGGATTTGTGGCAGGAAAACAGATTTTTGGTTATGGTCATTCGTG ATTTATTAAACCTATGTGAAATCACAAAGGGCAAAGATAACAAAGCAGTTATTGCAAGTAATATCATGTAAGAACATGAG CCTTTTTGCTTGTTCTATGCATTTTTTTGAGATATAGTATTTAATTGCTTCTGTTTGCAGGTATGTTGTTGGGCAGTATC CACGGTTTTTAAGAGCTCATTGGAAGTTTCTAAAAACTGTTGTGAATAAGTTGTTCGAATTTATGCATGAGATACATCCT GGAGTTCAGGTTATTTTTTTCTCTTTTGAAGCTACAGTCAATTTCTACATGTCTATTCCATGTAATGGTAGTACAACTTA TTAAACAAATCCAGGCTATGATTTATTTTTCTTTATAGCCGACAGCTTTAGTTAGCTGAAATGGTTCAAATATCAGTAAT ATAAAACTGCACGTTTTCCCCCAAAAATATTTGTGGATAAACATTGGTATGTCATATCTTGTAATTTTCTTCTATGTATA ATAGCTTGGATCCTCCTGAAATTATCTTCCTGTTCCTTTAGATATCTGACAGTTTTTTCGTAAATTTATAATAATTTGAC AAGATATGTAACTTTCTTCATTGTATCACTGTAACCTATATAAACATTGTAATTAGAAAACTATTAATCTGCTAAAAATG AGCTTCCAATTATTTAATTTTTTATTCCCCATTGAGACTCCAATTCTCTTTTTACTTTTTTGAATCCGTTGTTTGCAGTT TGTATAGTGTAAACACTTGAAGTCTATATTATACAACCTTGTAATACTTTCATGTTTTTTGGTGTCTACTATTACCAAAA TCATCTTTGATAAACTTCAAATAATTTGATATTGTTTGATGATCTGTATATTTGCTACTAGAAATGCATGAATATGTGAA TATAATCTTGTTTCACGTGTTTCAGGATATGGCCTGTGACACATTTCTGAAAATAGTCCAAAAGTGCAAGCGTAAATTTG TGATCACCCAGGTACATACGCTATAAATCCCTTCATTTCCCATCCTCTTGACATCGGAAGAGAAGTGACTAGTGTCTCTT GCAGATCTTCCATTTGTTCAGTATTTGATATAATCCATAACAATCATAGTAATTGCTATTTCAGCTTGGGGAAAATGAGC CATTTGTATCTGAACTTCTATCAGGCCTTCCAATCACCATTGCGGATCTTGAACCCCATCAGATACACTCATTCTATGAA TCTGTATGGCTTTTAGTCTAGAGATGTTTATACTCAAGTTTTCGATTGTAGTTTTCTTTTCCATGTTCTATAAATATGAT TCTCATTTAAGTAAGATTCTTATATTGTAGGTTGCTCACATGATTCAAGCTGAGTCTGATGCACAGAAGAGAGATGAATA TCTTCAGCGATTGATGCAGCTCCCAAATCAGGTCCTTTGCTTGCTTTAAAAGCCATGTTTATTACTATATCTTTTATATT ATGCAAATGGATTTGTGATTGGTAATGCCTTTCATTCTCTCTTTACTTGCAGAAATGGATGGAAATTATAGGGCAGGCAC ATCAAAATGTTGAGTTTTTGAAGGATCAAGATGTAATCCGGACTGTACTTAATATATTGCAGGTATAGCTTTGTAATTTT TCATGTCATTTTAGTGACCTGCCATATGTTGTTTAGTATTTTACTATCTGAATGCTAGGAGGCCATTTGAATTTAGTAAT TCCATTTATTATTTTATGGCATGATCATTCGGTGGTGAAAGCTGTTGATTAATTAGTTGCTGATGTTGTTTAGCATTTTA CTGTCTGAATGCTAGGAGGCCATTTGAATTTAGAAATTTCATTTAATATTTTATGGCATGATCATTCAGTAGTGAAAGCT CATTAATCAACTAGTTGGTGATGTTCAACCAGCTAAAGGTCAAATTTTTTCTTTTTAATTATCTTGTCCAGGTAGTCGTG TCATGCTATGTTATTCCAGTTAGAACTCTGCCTCTTCCATACCTGCAGAAAGAATCAAATCATCTTGACATGTATATGTT GTTTACTTGGTCGTAATGAGCAAAATAGAAACGATTCAGGCACTTTTCTTCATATTTTTTATTTGATGTTAACTTTTGCC AAATCACTCCTTGAGTTTTGATCTGTAATTTAATCCTTGTAATCGATCTCAAGTCTTTTATTTTTATTTTGGTTATTTTT TCACTTTAATTGCAGACAAATACAAGTGTTGCATCTTCATTAGGGACATATTTCCTGCCCCAAATCACATTGATCTTTTT GGACATGTTGAATGTGTACAGGTATGTTCGGTACACTCAATAAATAGTTTGATTTGGTTCTTTATTATTGATAAATGCTA AACCAGGCTTTTCTTTTTGCAACAGAATGTACAGTGAGCTTATTTCAAAAAGTATTTCAGAAGGGGGTCCTTTCACATCA AGAACATCCTATGTGAAACTTCTACGGTAAGATTACATAAGGTTACATTGGTTTTGTACGAATAAGATTACCATCCAATA TCTTTTTGAACATGTTCTTCTTGATGCAGTTCTGTTAAGAGGGAGACACTTAAACTAATTGAGACATTCCTGGATAAGGC TGAAGATCAACCTCAAATTGGAAAACAATTTGTACCACCAATGATGGATCCTGTTTTGGGAGATTATGCTCGGAATGTCC CTGATGCGAGGGAGTCAGAGGTTTTATCACTTTTTGCCACAATTGTAAACAAGTATGTTTCTTTCTTCTTTTCCCTGTTT CCTTTATTTTATTGATTGGTGTATGGTGTTTTGGCATTCTAATTCTGCATGTATCTTCTGTTCTTTACTGAGTTGAGTGC GCTACTCTGCTATTTAATTACATGGAATACTTCTCATTCATTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACCTCTCTTACGCCAGG TATAAAGCTGCAATGATTGAAGATGTACCTCGTATATTTGAAGCTGTTTTTCAGTGCACTCTAGAGGTAGTTTTGGAGGA TATTCTGATATTATGTATATGGTCCAGTTTATAGTTATTCTATGATTGTGGCTCTTGTGCCTGACTGATATCCATCCTGC CACCTGTCTTCTCTTTTATTTTGAAGATTTTTACTTTTGCAATGAAGTATTTCAGTCTTATATCATGTTCAACATTATTT TTATCATCACTTGAAATGTCAGTTTACTGAGATGCCGATAGAAGTTTTGCTAATGGTGCTCTGTATAAGTTTTAATTTTT AATAACTGGTAGCAAATAATTATTGGGTATTCTCAGATAATATCTACTGATTTATATTTTTCCTTTTATTCTGCCTCGCA GATGATTACAAAAAATTTTGAAGACTACCCAGAGCATAGGCTGAAGTTCTTTTCCCTACTTCGTGCCATAGCTACTCATT GTTTTCCTGCATTAATCTGCTTGTCAAGCCAGGTTGTGTTTCTTGTTCCCTCTCTTTCCACAACGAATCAGTGTTGACTA AGAATGCTTGTCAAATTTTGTGATCTCTGTAGTCTCTGCCTGATTCTTTTTTGTTATGTGATGTATCAGCAACTGAAGCT TGTTATGGATTCAATCATTTGGGCATTTCGCCATACAGAAAGAAATATTGCTGAAACTGGCTTAAACCTATTGTTGGAGA TGCTGAAGAAGTTTCAGGTGCGATCTTTGTATATTTGTTCATTTTTTTATGAACCTAGTTTTATTGTATTATTGTATATA GGTTTTCCTGCCTTGGAGGATTTTATTCCTTCCCCGTAGTTGCTTTTCGTTCTTTACTCTACAATTATATTTATCTTTCC ATCCATAACAAAGCTCTTCTTGCCACTCTCATTCTTACTATACTGGTGCATATCTTCAGTTATATATTTTTTTAAATGAA TGTTTGTTTATTGCAGGGCTCAGAGTTCTGTAATCAGTTTTATCGGACATATTTCTTGACAATTGAGCAAGAGATCTTCG CAGTTCTGACTGACACTTTTCATAAGCCTGGGTTCAAATTGCACGTCTTGGTGCTTCAGCATTTGTTCTGTCTGGTACTT TGTCATAATCATGCTTTTGTCTCCCCCATTTTACTTGCTAGAAATAGCAAAAATAATGTGTTGGACCTTTTCAGCTGGAA ACTGGCGCCTTAACTGAACCTCTCTGGGATGCTGCTACAAATCCATATCCTTACCCAAGTAATGCTGCTTTTGTACGCGA GTTTACCATAAAACTTCTAAGCACTTCTTTTCCCAACATGACAACAGCTGAGGTAATTTGGGTCAAATAAATAATGTTTA TTCCTCTCCCTTGCCAGAACAAATGACTAATTTTCAATAATTTTGCAGGTTACCCAATTTGTGAATGGACTATTTGAATC CACAACTGATCTCTCCACATTCAAAACTCACATACGAGATTTTCTTATACAGTCAAAAGAATTTTCTGCGCAGGTAATTG CTGCTTAAAATTTCTTATACTTAAGTAAGGAGCTTTTTTTGACTGAACTTAGAAAGGGGAAAGTTTGTACTCGTGCACCT AGAATGTTGACCACTAAATCCTGCTGTTTAAGTTGGTTCATATAATAACTGTTTTTAGCATTTTTCTAGCTCATGCCGAA ATTGTTACTGTTTTATTTGATTTATGTTCACTCGGTAAATTGTTTCTCAATTGCCCCTCTCTGCTGTAGGATAACAAAGA TCTGTATGCTGAAGAGGCTGCTGCTCAGAGAGAGAGAGAACGACAAAGAATGCTTGCTATTCCTGGGCTTATTGCTCCGA ATGAGTTGCAAGACGAAATGGTGGACTCATAG 

CDS sequence (LotjaGi3g1v0538500.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGCCGCCGAGAAACTCAGAGATTTGACCCAACCCATGGACGTCCCTCTCCTCGACGCCACCGTCTCCGCCTTCTACGG CACCGGATCTAAGGAAGAGAGAAGTGCTGCTGATCAGATTCTGCGGGAGTTGCAGAATAATCCTGACATGTGGCTCCAAG TCATGCATATTCTGCAGAACACTCAGAGTCTCAATACCAAGTTCTTCGCCTTGCAGGTTCTAGAAGGTGTAATTAAATAC AGATGGAATGCACTACCTGCTGAGCAGCGAGATGGGATGAAGAACTTCATCTCTGATGTTATTGTTCAGCTTTCTAGCAA CGAGGCGTCATTTCGAATGGAAAAGTTGTATGTCAACAAACTCAATATTATATTAGTTCAGATTCTGAAGCATGAATGGC CAGCAAGATGGAGAAGCTTTATCCCTGATCTTGTTTCAGCAGCTAAAACTAATGAAACCATTTGTGAGAATTGCATGGCT ATATTGAAACTTTTGAGTGAAGAGGTTTTTGATTTTTCAAGAGGAGAGATGACTCAGCAGAAGATAAAAGAGCTTAAACA ATCTTTGAACAGTGAATTTCAACTCATACATGAGCTATGCTTATACGTGCTATCAGCATCCCAAAGGACAGAGCTCATGC GTGCAACACTGTCTACATTGCATGCCTTCTTATCATGGATTCCCTTGGGTTATATATTTGAATCGCCATTGGTAAGAGCA AACTTCTGCTTGATTTAA 

Protein sequence (LotjaGi3g1v0538500.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MAAEKLRDLTQPMDVPLLDATVSAFYGTGSKEERSAADQILRELQNNPDMWLQVMHILQNTQSLNTKFFALQVLEGVIKY RWNALPAEQRDGMKNFISDVIVQLSSNEASFRMEKLYVNKLNIILVQILKHEWPARWRSFIPDLVSAAKTNETICENCMA ILKLLSEEVFDFSRGEMTQQKIKELKQSLNSEFQLIHELCLYVLSASQRTELMRATLSTLHAFLSWIPLGYIFESPLVRA NFCLI 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Gene3D 1 245 245 9.6E-87
PANTHER 2 239 238 2.7E-144
PANTHER 2 239 238 2.7E-144
SUPERFAMILY 13 235 223 1.47E-46
ProSiteProfiles 37 103 67 15.796
Pfam 37 103 67 4.5E-15
SMART 37 103 67 1.4E-10
Pfam 115 241 127 1.9E-37

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Biological process Intracellular protein transport The directed movement of proteins in a cell, including the movement of proteins between specific compartments or structures within a cell, such as organelles of a eukaryotic cell.
Molecular function Ran GTPase binding Interacting selectively and non-covalently with Ran, a conserved Ras-like GTP-binding protein, implicated in nucleocytoplasmic transport, cell cycle progression, spindle assembly, nuclear organization and nuclear envelope (NE) assembly.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi3g1v0538500.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…