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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0029400 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0029400.2 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein; TAIR: AT4G15570.1 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein; Swiss-Prot: sp|B6SFA4|MAA3_ARATH Probable helicase MAGATAMA 3; TrEMBL-Plants: tr|V7B556|V7B556_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0029400 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:3618716..3638927) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GGACTATATTAAAAAAAATTGTTCTCGCCGCTCCGTTTCTGGTCGCCGGCGCCGCGCGAGTCCGCTCCTTGCTCGAGTTC TTCTTCTTCTTCCGCCGCTCAAGTCCTTCTTCTCAGGTGAACCGTGTCAATCCTATGCTCTTATGCGAGTTTGATAATAC TCACTGTTAAAAGGGTTTTACGCTAAAACCCTCTCTCTGTTTTCTCTAGTTTGGCAGTTCCCTCTGTTCTTATGGCGGTT GACAAGGAAAAGATTGAAGAAGAATCTGTAATCCGCCGCTTCTACCGTATCATTCTGAGTTGGGATTACTTTTGTCTACA AAAAGGAACTGTATCAGCATCCAAACTCGTCAAAGTCAAGGAACGCTACAAAGACGTTGATGATTACATTGCTACCTTCG AACCCCTCATTTTCGAAGAAGCTAAATCCCAGATCATTAAAGATAAAGAGGACGACGAGGGTATTTTTTAATTTCAACTA ATTTTGTATCTTTAATTTTGCCATTTAAGTTTCAGTGGATTATGTTGAGGATTCAAGTGCGGAGTTGGAGTCCCACATTG GTTAAGTACGAGTGCGAGTGAGGAGAAGACTTTATAAAAGATATGACCCATAAACCTAATGCTTAAGGTTTTGGGTTAAG ATGTGGCGTCGATATCCCTTGGTGTCTTGCTCCTCCTCGGCCCATGGGCTCCATTGTCTCCCCCAACAGATTACTATTTC CATTGTAGTAGTAGTACTAATTATAATGAAAATTTGCATTTAGGCATACCCTAAGCATTAGGGCAAGCAAAGCTCTAGGC TCGCGAATTGATTATTAGTTTGAAAACTGTATTTACTTTTATGAAATAGACCTATCATAACAGAGTGTTGTTAGCATTCC TGTTTTAGCTTACAAAACCGGGAACGATACTTTCTTGTGTCTGAAGAATTTTCTATGTTGCTGACTGCAGTGACTGAATG 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ATGAAGATTCATTGCAAGATGGGGATGGCATTAAATTACATACAACACGCGCATGGCATATGTACCGCTGCTTTGGCCCA TTCTGCTTCTTTGACATACATGAGGGAAAAGAGGCTCGGCCTTCTGGGAGTGGCTCGTGGATAAACGTTGAGGAAGTCGA TTTTGTACTATTCTTATATCAAAAGCTGGTATCCCTTTATCCGCAACTGAAGTCTGGTAACCAAGTTGCTATTATATCAC CCTATAGTCATCAAGTAAAACTCTTCCAAAAACGTTTTGAAGAGACTTTTGGAGTGTCATCAGAGAAAGTAGTGGATATA TGTACTGTTGATGGTTGCCAGGTAAACTAGCTTAATGTTAATGACATGATATTCTTCATTCAGTTTTGCTTTTGATTTGA TTAAATAATCAATAATTGCAACTAGGATGGAAACAATCAAGGGAGAGTGCATTAATGAGTTGTTACTTGAAGGATTGTGA TATAACGAGTCTTCTTTTCTCTTATGCTGGTTAAACGCTTGGTACATTAGATTGGGACTTGAGAATAATCTCCTCTATCT TTCAGGGACGTGAAAAGGACGTTGCAATATTTTCATGTGTCAGGGCAAGCAAAGATAAAGGCATAGGGTTTGTGGCGGAC ATTCGACGAATGAACGTGGGGATCACCAGAGCAAAGTCTGCAGTATTGGTACTTTATCATTTAGTGTCAATTTGATGATT TCAACAATTTCATTTGGTAATTTTATTGCATTGATGTGATTCATTTTTTGTTGTTTTATATAGGTGGTTGGATCTGCTTC AACATTGAGGAGGAATGAACAATGGAATAAGCTAGTGGAAAGTGCTGAGACTAGGGACTGTTTATTCAAAGTAAATTTTC TGAAAAGTCATTTACATGTCTATTAATAGCAATGCTGTAAAATTCGATCCATTAAAATGAGAATTTAATCGAGCCTAACT GATTATAATCTGTACTACAATAAACACTAGTATGACAAAGTTCCAAGCTTTAGAGAAATAAACAGTGGAATAGTGATTGG ACATGTTATGGAGGATTATACCGCTTTGATACATGATAAAATAGTAGGTTGTAGTATGTTTGGATGAACTTCTCTTTTCT CAGAATTAATTTTGACACCTAGAAGCTACTCATAAAAGTTTCTCCCCATAATTCATTTTAGCTTTAGAATCAGTTGTAGA AAGATTTCTAATCATGCACTTAGTCTTTAAATTATGGAAAGAGGAAAAATGAAAATTTCATTGATGTACAATATTGCGTT TTGCATTATATTTGGACAGCACTTTTGTATTTAGTTCTTGGTCAACCATGAATGTATCTGTGCATAATACATCCCTGGTT ATTTGATTATGGACCCAATTTCTTTTTGGACCTCATACTTGAAGCTGAAGATTAACTCAGCTATTTCCACATGCAGGTTT CTCAGCCATATTCCTCATTTTTCAGCGAAGAAAGTCTGGCATCTTTGGTAGCTAAGGTGGACGAATCATCCCAGAAGACG GAACCTGCTGACGGGGAAGATAATTATGTGCAGTTTGCCAATGATGCAGCACAACAAGATCAAGGTGAGGACCAGGACTA TGGAGATGATATGGATGATGGTGGTGGTTTTGATGAAGATTAGGGTTAGTTAGTTAAATAGTTGTGTAGTTGAGCGAGGC TGGTGCTATTTAAGTCATTTTACCTGGTGAGGACAAGGACTGCACTAGTCTGAAAATCCTAGCTATTCTTAGCATGATAT TAGGGAATCTCATTGCTATTACCCAAACAAGCATGAAACGTATGCTTGCGTATTCGTCCATAGGTCAAATCGGATATGTA ATTATTGGAATAATTGTTGGAGGCTCAAATGGTGGATGTGGAAGCATGATAGAAATAATAGCATGTGCATTGTTGATACA AAAAAAGAACATGCACTTATTCATGACTGTTGCTACTAGTGTGTATTTGGTG
CDS sequence (LotjaGi4g1v0029400.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCGGTTGACAAGGAAAAGATTGAAGAAGAATCTGTAATCCGCCGCTTCTACCGTATCATTCTGAGTTGGGATTACTT TTGTCTACAAAAAGGAACTGTATCAGCATCCAAACTCGTCAAAGTCAAGGAACGCTACAAAGACGTTGATGATTACATTG CTACCTTCGAACCCCTCATTTTCGAAGAAGCTAAATCCCAGATCATTAAAGATAAAGAGGACGACGAGGTGACTGAATGG AAGTTGGGGGTGGTAAATAGTTGGAATGAGGCAGATGACTTTCATTTTCTAGAATTTCCTTGCGAATTGATTGAGGGAGA GTCGATAAATAAGGATGATCTTTTACTTCTTTCAAAAGAAAAGTTTCTGGGTGGCAAAAAATTACCTACCGTGTATGCAT TTGCTTTGGTGGACCACTCACGAAAATATTCTGATACAAGAGTTCTGCGTGTTAGACTCTATCTAGCCGGTGAATTCTCA CATTATAATACAGATATTGTAAAGCCTTGCCCAAGACTGTTTAATATGCGCTCTCATATATGTGAGACTGGGAGACAGTT GTATTTTATGAAGCTATGCAGTTTATCTACCATTGCTCGTGAGTATTCGGCTGTACAAAAGATAAGCCTTCTCCCATTCA AGGATTTAATTTTAAATGCTGCTGGGGAGAATTTTGGCACAGAAGTTGAGGGTTGGAAAATCCCCATGCCTTTGAAGGAA TATATTGAAAGTACTTTCAATCAGTATCAACATGATGCCATAACAGCTGGTCTATCATCTAAATCATTTGTCCTGATACA GGGCCCCCCAGGGACTGGGAAGACTCAAACAATACTCGGGCTGTTAAGTGCCATTTTACATGCAACTCCACCGAGAGTAC ATTCAAAGAGCCGGACGTACGAGCTAAAGCAGGGGCCACAATTACCAATTGAGGAGAAACATAAACATTGGTCACTTGCG TCTCCGTGGTTAAATGGTAATAATCTAAGAGATAGTTTGATGCCAAAAGATGGTGACGATGGTTTTTTCCCAACTACTGG AAATGAATTAAAACCTGAAGCTGTAACTTCAAGTCGTAAGTATCGTGTAAGAGTGCTAGTATGCGCCCCATCAAATTCTG CCCTGGATGAGATTGTGTTGCGTGTTCGCAATGCAGGTGTCCATGATGAAAATGGCCGTGGTTATTGCCCAAACATTGTG AGAATTGGTCTCAAAGCACATCATTCTATCAAGGCTGTTTCCCTTGATGAACTTTTAAAACAAAAACGTTCTAGTGGCAA CAAATCATCCACAGATAAGCAGAGTACTGGTCCTGCAGGAAGCAATGACGACACTCTCAGGGCTGCAATTTTGGATGAAG CCACAATTGTCTTCTCCACTCTCAGCTTTAGTGGTTCAAACAGTTTAAGTAAACTCAGTCGCAGCTTTGATGTTGTGATT ATAGATGAGGCAGCACAAGCTGTGGAACCTGCAGTTCTTGTTCCCTTGGCCAATCAATGCAAAAAAGTTTTTCTGGTTGG TGATCCAGCTCAACTTCCAGCAACTGTGATTTCAGACATTGCTAAGAATCATGGATATGGTACAAGCTTATTTGAAAGAT TGAAGCTTGCTGGTTATCCAGTTAAAATGTTGAAGACTCAATACCGAATGCATCCCGAGATAAGAAGCTTTCCCTCTAGG GAGTTTTATGAAGATTCATTGCAAGATGGGGATGGCATTAAATTACATACAACACGCGCATGGCATATGTACCGCTGCTT TGGCCCATTCTGCTTCTTTGACATACATGAGGGAAAAGAGGCTCGGCCTTCTGGGAGTGGCTCGTGGATAAACGTTGAGG AAGTCGATTTTGTACTATTCTTATATCAAAAGCTGGTATCCCTTTATCCGCAACTGAAGTCTGGTAACCAAGTTGCTATT ATATCACCCTATAGTCATCAAGTAAAACTCTTCCAAAAACGTTTTGAAGAGACTTTTGGAGTGTCATCAGAGAAAGTAGT GGATATATGTACTGTTGATGGTTGCCAGGGACGTGAAAAGGACGTTGCAATATTTTCATGTGTCAGGGCAAGCAAAGATA AAGGCATAGGGTTTGTGGCGGACATTCGACGAATGAACGTGGGGATCACCAGAGCAAAGTCTGCAGTATTGGTGGTTGGA TCTGCTTCAACATTGAGGAGGAATGAACAATGGAATAAGCTAGTGGAAAGTGCTGAGACTAGGGACTGTTTATTCAAAGT TTCTCAGCCATATTCCTCATTTTTCAGCGAAGAAAGTCTGGCATCTTTGGTAGCTAAGGTGGACGAATCATCCCAGAAGA CGGAACCTGCTGACGGGGAAGATAATTATGTGCAGTTTGCCAATGATGCAGCACAACAAGATCAAGGTGAGGACCAGGAC TATGGAGATGATATGGATGATGGTGGTGGTTTTGATGAAGATTAG
Protein sequence (LotjaGi4g1v0029400.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAVDKEKIEEESVIRRFYRIILSWDYFCLQKGTVSASKLVKVKERYKDVDDYIATFEPLIFEEAKSQIIKDKEDDEVTEW KLGVVNSWNEADDFHFLEFPCELIEGESINKDDLLLLSKEKFLGGKKLPTVYAFALVDHSRKYSDTRVLRVRLYLAGEFS HYNTDIVKPCPRLFNMRSHICETGRQLYFMKLCSLSTIAREYSAVQKISLLPFKDLILNAAGENFGTEVEGWKIPMPLKE YIESTFNQYQHDAITAGLSSKSFVLIQGPPGTGKTQTILGLLSAILHATPPRVHSKSRTYELKQGPQLPIEEKHKHWSLA SPWLNGNNLRDSLMPKDGDDGFFPTTGNELKPEAVTSSRKYRVRVLVCAPSNSALDEIVLRVRNAGVHDENGRGYCPNIV RIGLKAHHSIKAVSLDELLKQKRSSGNKSSTDKQSTGPAGSNDDTLRAAILDEATIVFSTLSFSGSNSLSKLSRSFDVVI IDEAAQAVEPAVLVPLANQCKKVFLVGDPAQLPATVISDIAKNHGYGTSLFERLKLAGYPVKMLKTQYRMHPEIRSFPSR EFYEDSLQDGDGIKLHTTRAWHMYRCFGPFCFFDIHEGKEARPSGSGSWINVEEVDFVLFLYQKLVSLYPQLKSGNQVAI ISPYSHQVKLFQKRFEETFGVSSEKVVDICTVDGCQGREKDVAIFSCVRASKDKGIGFVADIRRMNVGITRAKSAVLVVG SASTLRRNEQWNKLVESAETRDCLFKVSQPYSSFFSEESLASLVAKVDESSQKTEPADGEDNYVQFANDAAQQDQGEDQD YGDDMDDGGGFDED
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 32 | 798 | 767 | 9.3E-138 | – | |
| PANTHER | 32 | 798 | 767 | 9.3E-138 | – | |
| SUPERFAMILY | 242 | 772 | 531 | 1.35E-61 | ||
| SMART | 242 | 542 | 301 | 0.0059 | ||
| Pfam | 246 | 430 | 185 | 1.5E-28 | ||
| CDD | 246 | 549 | 304 | 3.9774E-87 | – | |
| MobiDBLite | 421 | 444 | 24 | - | – | |
| MobiDBLite | 428 | 442 | 15 | - | – | |
| Pfam | 443 | 518 | 76 | 3.5E-31 | ||
| Pfam | 526 | 722 | 197 | 1.4E-60 | ||
| Gene3D | 548 | 753 | 206 | 1.3E-53 | – | |
| CDD | 550 | 739 | 190 | 1.48996E-58 | ||
| MobiDBLite | 767 | 814 | 48 | - | – | |
| MobiDBLite | 796 | 814 | 19 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi4g1v0029400.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…