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LotjaGi4g1v0280400.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi4g1v0280400
Transcript ID LotjaGi4g1v0280400.1
Related isoforms 1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Leucine-rich repeat (LRR) family protein; TAIR: AT1G15740.1 Leucine-rich repeat family protein; Swiss-Prot: sp|Q17R01|FXL14_BOVIN F-box/LRR-repeat protein 14; TrEMBL-Plants: tr|A0A151SRH6|A0A151SRH6_CAJCA F-box/LRR-repeat protein 14; Found in the gene: LotjaGi4g1v0280400
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr4:65135492..65146578) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

AGACAAACAAAAACGACAGCGTATAGCAACAATGAAAGAGAAGCCATTTCCATAACGATCCAACAGAACAGAGAAAAGCG GAAGGGGCGAACGCGGGACCCGCATGGAAGAGAAGACCCCACACTTCTCTCTACTGTTGTTCTTATCCCAATTCCATTCC ATTGCATTCATCATCACTGCCACGTGTCACTCATCAGGTGGCTTCACTCTCCTTCTTCTTCTTCTTGTTTCTTCTTCTTC TTCCATCATCATCACTCTTCTCTCACACACCACCTTCATTCATTGCTTCTCTCTCCTCCACTTTCTCTCTCTAAAACTCA CAGTTTCCATTTCCATGGCGCCAGTTCCGATTCTCCTCCGCTCACGATCACGGTGAAGACATCACCGCCATTCATTTCAC TCACCAGTCACCACCTCCTTTCCATTTCTAGAATTTCAGAGAAAACTGTAAAGCTCTCTGATCATCAAACCTAACCAATC ACACGTTTCGTTTTTTGTTTGATTCATCTGCACTTTTTGTTCTTCTCTCACGCTTTTTGATTATTAAATAAATAAAGCTG AAAAATGAAAATATCTCATGAAAGAGAGTCTCACTCTCTGTTTAAGCTTCAAAAAAATCAATATAAATGAATCAAAAATG GAAAGTTTCATGGAAGGAATCATCGTTATCGTTTGCAGTAGTTTGATTAGAGGAGTGGTTATTCAGTTAGGGATTTGCAG GTTGCGTAGATTCTGCTTATGGTGTTTGAGTTTCTCTCTTGTAAGTGAACCTGCTATAGTGATTGTAGCGTGTAAATCAA GTGTGATGAAATCATAGTTGAATTTTTATGAGTTTCTCTTGTTCTATCTGTTTGATCAATATGATGTGATTAATATAGTT AGATTGACATATTTGTTTATTTTTGTTTAATTTAGTTATTATTACTTGATGCAGTTAAGTATAAAGGGATTTTGTTCTGA AATGGAAACTTGAATTTCTTTGGCACATTCCATGCATGCATTTGGTGATCATAAAAAATGGGGGGTATATGTTCTAGGAA GAGAAATCAGCAAGTTATCGAAGATGATTTTCGCAGAGGAGTCTCGGGTAGGTATTGTAGGAGTGGCAGCTCGAAATGGT TAGGAGCAAGAAGTTTGCGGTCTATGGCGAATCATTCTCCTGGAGGGGGTACCTGCCCCTCCCTCATGGATTTATGCATA AATAAGATACGTGAGGTACTTGTTTTCTTTGGACTGATTAATTGTTTTTTGTTGTTTGGGGTATTGTTGTCATTCGGTAC TTGATCCTTATGTTTTAAGTTGTAATAACAGGATTTTCATAAATATAATTCCTTTTCGATTCTTCCAAGAGATATAAGCC AGCAAATCTTCAATGAATTGGTGGATTCTCATTGCCTAACAGAGGCGTCTCTCAATGCATTTCGAGATTGTGCTCTTCAG GTACAGTATTAGTGGTTTTGTGGAATTGTAAGTGTTGATTAGGTTTAAGTACTTGCAAGTTCTAGTTACAAAGATGACTT TGCTTATGTTGTTTGTACTTTGATGGCAGGATGTTTACTTGGGTGAATATCCTGGGGTGAATGATGCTTGGATGGATGTC ATCTCGTCGCAAGGGTCTTCTTTACTTTCAGTTGATATCTCTGGTTCTGACGTGACAGACAATGGATTGCGACTCTTAAA GGATTGCTCCAATCTTCAAGCATTGGCTCTCAATTATTGTGACCAGTTTTCAGAACATGGGCTGAAATACATTAGTGGTA GAGTACTAGAGTTACTCATTTTCTCTGTGATTTGAATTTTTAACCCGAATGCGTTAGTTATTTCGTGAACATGGTAAAAT CATACTAATTATTCAAATGAGATGAGACTTTGTCCTGAGATTGATGATATTGAATGCCTACCTGGCACTCTATGTGTATC 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CATTATAAAGTGCTTAAAGACAAACTATTCTAAAAGATATTGTAAGATGAATTATCATCACTATTGGTGCTGTAGTTAGT GCTTAATGGGAATGATGAGTTCTACTTTCCTTCAATGAACCTTGTGCAAAAATGTTAAGGGGGAAAAGGGTCCAAGATCA GGGCATGCCAATGAAGGATACAAAATAATGACTTACCAATGGAGGACCATGAATTAGAATTGATCCTCGGAAGGAGTCAA GGCCTTTCGATCCTACCAGTGGAGAAAACCTTCATTGGCTTTATGGTTTCTTCAAGGAAACTTATTATTTAGATATTATC AGATGCTGCCCTTCTTAGAGGGCCCTTTTATTAAAACTTGATTTCAGCGTTACTGTGCTATAGATTTAGTTTACTTTGAC TTCTGTTTGAATACAGCTCTGAAAAAGCTTGAGTCTCTTAATGTTGGATGCTGTAAATGTGTTATGGATTCAGACATGAA GGCTATTTCAGGTATTGATCACAAGGCTTAGTGTTTTTATGACTATATCTGCTTTAGATTGTTGTCAGTTCTTTCTGCTT TTACTTTAGAGGCTAAAAGCTAGGCCTTCTTCTGTTTGACTTGACTGTTAGCGTGTAATGTTTCAGGGCTTATGAATTTA AAGGAGTTACAAATTTCCAACAGCAGTATTACTGATATTGGGATCACGTATTTAAGAGGTATTTTCCATGATAATAATTG TCATAATCATAACGTGACTATAGTCCAGAGCTGTTTTTACTATTTCATGCACATCAGAACATGTCTAGTTGTGTTCAATG TCCACTCTCAAATGAAAATATGCTTTTCTTTTTTATAATCAAAATGGAGTTTTAGTTTATTGAATAAGTTGTAAAAGCAT TATAGCAGTTTGCTAATGCTTATATGTATTATGATTTCTGTTCTCAATGTGGTCTCTCTCTCTTTACAGGTTTGCAGAAG 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GAAAACATGGTTTAAATTCGGATCTATTAAATTTTAATCAGAATTTAAGCAAGAATTTGGCCTTGACCTTGTGTTTGCTA TACATTATGCTTGGTCTGACGGTTATAATTCAGCTTTTTCTTGTCAAAATTTCCCTTAATTGACTTAATTTGTCCTGTCA TAATGTTCTTTTAAAGGGGGAGAAGGTTCTTATTCTTCTGAATATTTCTTCTTTCAGGCCTCATTCTCTTGAAGAGCTTA GTATTGTCTGACACTGAAGTTGGAAACAGCGGGCTTCGTTATATATCAGGTTGAGGGATACAATCCTATGGTTATCTATT AAGAATTTGAACTCAATAATTAATATGAATTTGATGGCAGATGAGTTCAACATTAGTATGTGTCTAAAATTGTTGGTATA TGTTTCACTGCGACATAATCATTTAAGTGCCAGTACTATGTTGACTAGGTATTTTTTGCTTCACCATATTTTTCAGCACC TTGTTATTTTCACATTTTGTCAGCTTCTAGTTAGTAAATTGACATTGCATGCTTTAATCTACAGTTATTGCTTTAAACTT GAGACTCAATCTTGGAATGTGATAATAGACAGTTGTCTGATACGTTGAAAGATTTCTGTATTACCAATTTGCCCCTGCAG TGCTAAGATGCGGTTGCTACATGTGACCTTTTAATTTGATTCAAAACATCTTGTTGTTATGGCTTTACAATTTCTTTCCT CGAGCACTATCTATATATGAAACTTTTCTCACACACACATCTGATTATGTCATGTTAGCGATCCTTACAGCGAGTGCTCC AAATGCATGTGTTGATTTTATGATTCTTGCTTTTTCCAGGTTTGAACAAACTGGAAGATTTAAATCTGTCATTTACCTCA GTAACAGATAATGGCCTGAAAAGGCTGGCAGGATTGACTAATCTAAAATCACTTAATCTGGATGCCCGACAGATTACGGA TGCTGGACTTGCAAATCTTACTAGTAAGCACTTCCTTGTGTACTCATATACCAGCCATGTGTTTCTTATATTTGATTTCA CCTGTAATGTCAATGCTTTTGTTGCATGAACGATTTTGTATGTGTTTGTTATGGAGGGCAGTGCCTAGTGTTGAGGAAAC ATCAATATTAATCAATAATTCATTAAACATGGCCCAAACTTCTTTGACTGAATATTATGGTTTGTTATTTTTCTTTGTAA AATGTTAGGTACCAGAGAATTGTAATGGGAAAGAAAAAAACTGAATGCTATTAAGGCACTGAATCCTCTGGTATGAACCC AGAAGCAGTGTTTAGGGAAATACAAGAAGGAAAATAACAAGATAACTTGAGCAATTCGAGAGTGCTCAATCTCTCCCAAT CCAGACTAATTTCTGCCTACCTCACTCTCTCTCCAAAACTAACATATATTCCCTAGGTTGATACCCTATGGTCCCCCCCT TCACCCATGTGGGTGTTGCCACCTCATTAGTCGGTTATCTTGGGATCCAAGCTTCTAGAAGGTGGATCTTCAGGTACAGC TGTCCCTTGCTTGGGCCTCCTCTCATATACTTTGCCAAATCTGGGCCTTGAGTGTGGGTTTGCAACATAAAATATTTTGC AAAATTGAGTTTTGAGATTGGAAATCTTTAGTAAAAGGTTTAAGATAGTTGAGAGAACCACTGCTAGAACATTTTCCTAT CGTGTCTTTTCTGAATGATTTCATCTATATTGAGTCACCTTACCAAACCTTAACCTCTCCCACTTTTGTATCACTTGTGA TTTGCACATTTATTTTCTTGTCTTTCTCTCATTTTCCCTCTTTTCTCCATATGCTCCATATTTTCTGGGTGGGATCATCT AATATATTCTGCTAATGGTTGAATATTTTTTCTATTATGCTTTTCTTTTTATTAATCGATGTAAGAAAATCAGCAAAAAA CCTATGTACGCAAGATGTGCTAAAATATGACATTTGTATTACCTACGGAATATTTGTCACACTCGATAGAAAATAAATAA GCTATTGTATTGTGTTGGATCAAGTCCTTTCCACCAAACTAACGGTTATATCTGTTAGTAAGGTCACAACTCTTTCTACT TAAGCCCATCCAAAAGCGCCGTGGTTGAATCCAGCTCTGACCATAAGCCTTGGCTAGGCAGGCTGGTATGCCGGTACCCA ACAACCCCCTTTCGAGAACCTAGCGTGGAGAGTTTATAGTATACCTTCAGCGTGCCCCCCAGTATGATTCAACTCTGACC CACTTGGCCTACAACTATGAAACCCCCTTCCAGAACTTGCAGCCAGTAGTTTGAGCCTTGCCTTTTGGGAATCTACTCAC GACCTTGGCTCTGATATTAATTGTTGGACTGAGCATTTACCATCAGGCCAAAAGCTATAGTAGTTAGCTAAAGCATAACA CTTCTACTTAAACCTATCGCTAGCTCTACACTTTGATTTGATTCCGGTCCTTCCAGACCTTGCCATGGCAGTACGCCAAC CACAACATATTGCCAGTTGCAACCATTAGATTTTTTGTTTGGATTTGTTTGGTTGAAATTAAATTTTATATTTTGGCACT ATGTACAGCCGTGGACATAGTAAACTTCATACAAAACTGTACTAAACTGGTATACTGCTTCGAGCTGACCAATATCATGT CCCTTTTATGAGGTGCCGGCTCTAAGATATATTGTATTTTCTCCTCTTTCATTGCCCATATTAATATTTTATTAACTTCC GTGGGAACTGTAACTAATTTTGCTTCTGTTAATAGCTTCAATTCTAGCTGTCTGATGGCTCTTATCTTGTGTAGGTCTGA GTGGATTGATAACACTTGATCTCTTTGGAGCACGTATTTCAGACTCTGGAACTGCATATTTACGATGTATGTATATCCCA ATTTTAGCATTGTTGATTTCCTTCATTCGTTTTGGCATAACCATAGATTACTTGAGATTTAGGATGCCTGATTGCAAATT ACAACTTAGTAACTTGTAAAATATGGGAGATTATAGGGTGGGGCATTTTTTTAGTGTTCCACCGGTGATTCACTGATTGT AGCCGTTGTAATGATTTTTTAATTGAAGATCCTGAGGTAGTAACAGTGTAACACCGGTGGACCACTTAAAAACTGGTCCA TCCTATAACTTCGTGTAAAATATAATTAAGTTATTTAAGTAGTCTACATTTGAAATGGGAATGTATGAGTATTCGAAATT CATAAGTTACATCCACACACCACCACAAAACCCGAAGCCTAAGGTAATGGATGTGTGTGTTCTTTTAGCTTATATACACA ATGTGGGACTTCTTTGAGTCACACTTGGTATTCTCTAATAATGAGTAACAATCAGATTCTCAGCATTTTCCCATGGCCTT ATTCGGGGATATTTGATGTTTATAATACGGGTTTGGGGCTGCGTATGATATGCTATGAAAATGGTATAATTGTTCAAGAG AATAATACATCCACATGCGGTGTTATGCTTCTGATCCTTATTATATATTTATTTTAAATGCATTTATCGTATATGAGAAA TCTAGAAGTGCTGAACTGGTCAAACCAGTCTTTATTAAAGGTTAACCAAACAAGTGGTGCCAAGCTAAAGTATCTTCTAC ATGTGGTTTCTGTTTCAATGCTTATATTGGAATTTTTTCTGCTTGTTGACAATAATGATCATCTTATCTTACACGCTCCT TTCTGGAATTGATGTATAAATCTAATGGAAACTCTTGTGAGTTTATCTAGTTTCATTAACTTTCCTTTTAGCCATCACAA TGTTATCATTTAACTTAATGAAATCAGCAACAAACTCTGGTTCTTTTATACTTATGGACTGAATGAATCCATGTTTCTTT TATTTTTGTATGCCTATACTTCGAGAGTAAACAATATAATGGCCCGAACCAAAAGCAATAATAAATGGAGGTAGTACTAC ATGTGGTTTCTGTTTCAATGCTTATATTGGAATTTTTTCTGCTTGTTGACAATAATGATCATCTTATCTTACACGCTCCT TTCTGGAATTGATGTATAAATCTAATGGAAACTCTTGTGAGTTTATCAAGTTTCATTAACTTTCCTTTTAGCCATCACAA TGTTATCATTTAACTTAATGAAATCAGCAACAAACTCTGGTTCTTTTATACTTATGGACTGAATGAATCCATGTTTCTTT TATTTTTGTATGCCTATACTTCGAGAGTAAACAATATAATGGCCCGAACCAAAAGCAATAATAAATGGAGGTAGTACTAC TGAGAAATCCCATTACACACCAGCTTTTTTTTCTCATTTCATTTAGAATATTAAACAAAACTAAAGCTGATTGAAATAAT TGCAAAATAGGGGTCTGCATTGGCTCAAGTCTTATTTCCTTTTTTTTCCTTCTTATCATACAGCCTTCAAGAAACTGCAA TCCCTTGAAATATGCGGTGGAGGAATAAGTGATGCAGGTGTTAAAAACATAAGAGAAATTGTCTCCCTGACCCAGCTAAA CCTGTCCCAGAATGGCAACTTGACAGATAGAACTTTGGAATTGATATCTGGTATTTTCTGCTAGTCTTCATTACATCATA TCTTCCTTGCGGCTACTTCTCTTCAACATCAATGAACTCTGTTTATCTTTATCTGAATACAGGCATGACTGCACTGAGGT CGCTGAATGTTTCAAATTGTCGCATAACCAACGAGGGACTGCGCCATTTGAAGCCATTAAAGAACTTACGCTCTCTTACC TTGGAATCGTGCAAGGTTACTGCTTCTGAAATTAAGAAGCTTCAGTCAGCTGAGCTTCCAAATTTGCTAAGCTTTCGGCC AGAATAGACCAGGAGAACAAGAGAGTTCTGATCTTTTGCCTAGTGAACAATTCTCTGTACATATTAGCTACTGTTTTGGA TAATTATAATAATAAGTAATATAAGATATGGGGTGATTCTAGAAAATGTAGACATAATATTAGGCATGGTAGAATGTAAA TATGCTTTATGCTTTATTTTGCATGGTTGTGATTGTATCCCCCTGTCTGAGAATAATTGTACATAAATCTTTTTTTACTT TCTCTCTTAGATGTAGATGTCTAGTGGGGCTATCTATGTTGTCCGTGCATTATGGAATAACTTTACATTCTGATGCATGT AATTCAGACGTTTAAACTTTAAATCAGAGTGACGGCGTCATTGTGGTAGTATCATGAAGTAAATTTTCAGTTGTATTAGA CCGAGAACAGAGTTGTGTATGTTGACTGGTTTTATTGTGCATATACAGAAGTCTCCGCACAGATATAATTTCAACTGAAA TGACCCTTCTCAAGAAATTATTCCTCATGTTCAATTTTCCTACACTTCTTTTTTTTTTGACAGCAAAATAAACTTTATTG GATAAGAGATTGAAAAGCACCATGAGAACAAGCCTCTCATGAGAGCTAAAAATCAAACCACATAAAAAACTACTTTTGGG GAAGCACACTTGGGACAGAGCCTCATTAAAACCTTTATTAGGAAAACCCAGTGGGAAAAAACCTAGTAAAGGAAAAAGAG TACTCAAATCATCAAGTGAATAAAACCCCCTAAAAAAACCATTACACCCACCATTGAACTGACACAAAGACAAACCCTTA TCTACCAAAAAACAATTACGTGGCCCAATCTGTTATAAAGCTTAAGACAATCCTTCAACATACAGTAGAAGCAAACCAGC TCCCCATTAGTCACCAATTCAATAAGTTTCAACGAACCCTCGAAACCAAACCACACCAACCAAGCATATAACAAGTTCAT AGGTGAAAACCCACAGAGAACAAAATCACATGTCCGCAACCCCCATCCACCACAAATAAATCTCGAGGAAACAAACCAAG TGACCTTCATCAGTCACAAAAACACAACCTTCCCCATAAACATCATTGCAACTCAGGATGATTTAATTTGATCTGATTCT TAAGTCTTTGAATCATCATCTCTTCATCACCATTGTAAACCACCCCCACCTGTTTCCCAACCTTCCATGTCTGTCGAGCC CTTGAATCCAGGTCCATAAAATCAAACTCATCGTCAGAACACATTAAATCCACTGCCGCCTGTTGTTTTGACTTGTTCTT GCTTCCCCTCGGTCTTCCTCTCTTTGCTTTAGGCTTGACCACTTTTCGACCTCCCCCAGCAGCACCGGGCCCTCCTACCC TTTTTCGCCCTCTTCGTTGTTTTATTTTAGCCAAAATTTCATCATCTGAATACACACTCTCCACCACATCGGGTGCCACG AATGTTGCTTTATCTTTCTCGCCCTCTTCAACATCCACACATGTGAT 

CDS sequence (LotjaGi4g1v0280400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGGGGGTATATGTTCTAGGAAGAGAAATCAGCAAGTTATCGAAGATGATTTTCGCAGAGGAGTCTCGGGTAGGTATTG TAGGAGTGGCAGCTCGAAATGGTTAGGAGCAAGAAGTTTGCGGTCTATGGCGAATCATTCTCCTGGAGGGGGTACCTGCC CCTCCCTCATGGATTTATGCATAAATAAGATACGTGAGGATTTTCATAAATATAATTCCTTTTCGATTCTTCCAAGAGAT ATAAGCCAGCAAATCTTCAATGAATTGGTGGATTCTCATTGCCTAACAGAGGCGTCTCTCAATGCATTTCGAGATTGTGC TCTTCAGGATGTTTACTTGGGTGAATATCCTGGGGTGAATGATGCTTGGATGGATGTCATCTCGTCGCAAGGGTCTTCTT TACTTTCAGTTGATATCTCTGGTTCTGACGTGACAGACAATGGATTGCGACTCTTAAAGGATTGCTCCAATCTTCAAGCA TTGGCTCTCAATTATTGTGACCAGTTTTCAGAACATGGGCTGAAATACATTAGTGGTCTTTCAAACTTAACTTCATTGAG CATCAGGAAGAGCAGCGCTGTCACACCTGATGGAATGCGTGCTTTCTCTAACTTACTTAATTTGGAGAAGTTGGACCTTG AGAGGTGTTCAGAGATCCATGGTGGATTTGTTCATCTTAAAGCTCTGAAAAAGCTTGAGTCTCTTAATGTTGGATGCTGT AAATGTGTTATGGATTCAGACATGAAGGCTATTTCAGGGCTTATGAATTTAAAGGAGTTACAAATTTCCAACAGCAGTAT TACTGATATTGGGATCACGTATTTAAGAGGTTTGCAGAAGCTTTCCACATTAAATGTTGAAGGATGCAATATTACTGCTG CATGTTTAGAGTCTATTTCTGCCTTAGCTGCCTTGGCATGCTTAAATCTCAACAGATGTGGTCTCTCTGATGATGGATTT GAGAAATTTTCTGGTCTTACAAGCTTGAAGAGATTAAGTCTGGCGTTTAACAAGATCACAGATGAATGCTTAGTTCATCT TAAAGGTTTGACAAATCTGGAGTATTTGAATCTGGATTCTTGTAAGATAGGTGATGAAGGGCTTGCTAAATTGACAGGCC TCATTCTCTTGAAGAGCTTAGTATTGTCTGACACTGAAGTTGGAAACAGCGGGCTTCGTTATATATCAGGTTTGAACAAA CTGGAAGATTTAAATCTGTCATTTACCTCAGTAACAGATAATGGCCTGAAAAGGCTGGCAGGATTGACTAATCTAAAATC ACTTAATCTGGATGCCCGACAGATTACGGATGCTGGACTTGCAAATCTTACTAGTCTGAGTGGATTGATAACACTTGATC TCTTTGGAGCACGTATTTCAGACTCTGGAACTGCATATTTACGATCCTTCAAGAAACTGCAATCCCTTGAAATATGCGGT GGAGGAATAAGTGATGCAGGTGTTAAAAACATAAGAGAAATTGTCTCCCTGACCCAGCTAAACCTGTCCCAGAATGGCAA CTTGACAGATAGAACTTTGGAATTGATATCTGGCATGACTGCACTGAGGTCGCTGAATGTTTCAAATTGTCGCATAACCA ACGAGGGACTGCGCCATTTGAAGCCATTAAAGAACTTACGCTCTCTTACCTTGGAATCGTGCAAGGTTACTGCTTCTGAA ATTAAGAAGCTTCAGTCAGCTGAGCTTCCAAATTTGCTAAGCTTTCGGCCAGAATAG 

Protein sequence (LotjaGi4g1v0280400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MGGICSRKRNQQVIEDDFRRGVSGRYCRSGSSKWLGARSLRSMANHSPGGGTCPSLMDLCINKIREDFHKYNSFSILPRD ISQQIFNELVDSHCLTEASLNAFRDCALQDVYLGEYPGVNDAWMDVISSQGSSLLSVDISGSDVTDNGLRLLKDCSNLQA LALNYCDQFSEHGLKYISGLSNLTSLSIRKSSAVTPDGMRAFSNLLNLEKLDLERCSEIHGGFVHLKALKKLESLNVGCC KCVMDSDMKAISGLMNLKELQISNSSITDIGITYLRGLQKLSTLNVEGCNITAACLESISALAALACLNLNRCGLSDDGF EKFSGLTSLKRLSLAFNKITDECLVHLKGLTNLEYLNLDSCKIGDEGLAKLTGLILLKSLVLSDTEVGNSGLRYISGLNK LEDLNLSFTSVTDNGLKRLAGLTNLKSLNLDARQITDAGLANLTSLSGLITLDLFGARISDSGTAYLRSFKKLQSLEICG GGISDAGVKNIREIVSLTQLNLSQNGNLTDRTLELISGMTALRSLNVSNCRITNEGLRHLKPLKNLRSLTLESCKVTASE IKKLQSAELPNLLSFRPE 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 36 577 542 3.5E-243
PANTHER 36 577 542 3.5E-243
Gene3D 87 170 84 2.3E-10
SUPERFAMILY 132 437 306 1.68E-45
Pfam 132 152 21 1.5
SMART 155 180 26 5.6
Gene3D 171 247 77 9.9E-15
SMART 181 205 25 58.0
SMART 229 254 26 25.0
Gene3D 248 373 126 7.0E-26
SMART 254 280 27 110.0
SMART 256 278 23 300.0
Pfam 305 363 59 1.9E-7
SMART 350 374 25 5.4
SMART 350 383 34 14.0
Gene3D 374 479 106 1.6E-17
SUPERFAMILY 378 558 181 1.34E-22
SMART 398 422 25 19.0
Pfam 399 420 22 0.34
SMART 423 446 24 120.0
Gene3D 480 573 94 2.6E-18
SMART 494 518 25 240.0
SMART 519 543 25 0.38
SMART 519 548 30 2.2
Pfam 522 540 19 0.016

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi4g1v0280400.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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