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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0314300 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0314300.2 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Cytosolic purine 5'-nucleotidase; TAIR: AT5G48960.1 HAD-superfamily hydrolase, subfamily IG, 5'-nucleotidase; Swiss-Prot: sp|Q54XC1|5NTC_DICDI Cytosolic purine 5'-nucleotidase; TrEMBL-Plants: tr|A0A151SSF2|A0A151SSF2_CAJCA Cytosolic purine 5'-nucleotidase; Found in the gene: LotjaGi4g1v0314300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:69084538..69094356) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AAATCCAAATCCAAAATCCAAAAAGAAAAAAAAAATACTAGATTCTGTGTCAGTGTTCTATCTTCCACGACCAAGTCTCA CTCACTCACACTTTCACTTTCACTTTCACTTTCAGTGTTCTCCGACACACATTCATTCTCCTTTTACTTTGCTCCATCCA ACACATGTATGCGGCGGAGCTTCTCAGCATCTTCGCCGTGCACGGCGGAGGAGATGCCACGCTCTCAGTTACCGCCGCCG CCGCCGCCAACAACAGATTTTTCAAAACCTCAGCTTTCACGACACCCACTTCCCACAACGCTGCGAATGTGAGGCTGGCC AAGGCATTGACGCGTTGTCGCTGCACCGTTGACTCCAAGCCCGTCGGCGGCGACGTTTTCTCTGTGACGCCGCCGAACAA GTATGACGTGGATTACCTCGGCGAGAGCACCAAAGGGGATTTGAATGTCAAGTTGGAGCATCTTGAGGCTTTTGGTAAAT TTTGAAACTTTTCAAAATTCCCAGTTTGGTCCTCAGTTTTATTCTCAATTCGGTTTTAGACTTTATTTGTTGCTTGTGGT TTTCGGTTTGTTGTTGTGTTGCTTAATAGCTTGATTGCTTACAGGAACAAGACATTGAACAATATTGCTGTTCATTTATG TGCTAAAAAACATAGCTTGGACCAGATTCATTTGTTTGTAGCACAACCAACTATACTATGCTACATTATTTTTACCTTTA TTTTAATATTTGCTTAAAAATGATGAATATAATACTTATGGTTACAAAAATATCAAATTGCTTTCATTTATTGTTTTTGA AGATTTTATTTTCATCCTTTCATGGACTAATTTTTGAAAACAGAAATAAAGTGAGAACAAGGTGATGTTTTTGTGTTAGT AAAAGCAGAAAATGTTTACTCAAACTAAATATGTACTTAATTTCTCTATGAATATTAATGTCCTTTGTAATATTTACAAA ATATCAGTCATAATTACGGATATGGCTTTCGTAATTTTGTGATAACAAGACAAATATTGGTCTCCACTCTCCTCCATTGT AGGAATTGATGGGCAGGCGATTGAGGAAGTGGCCAGAGCAGAGGCAAGAGAAGCAGAAGACTTGCTAAAAGACCTCGGTA TTCCGGTGCAGTAAACTCACTCCCTCTGCTTACTTGCTCCTTTTCTAGTTAGTTGATATTTTTGGTTTGGAATATAGTGG TCTACACTTGTGTCTTCTATGGTATTAGTTGGCGAACAATTATTAGTGTATGTAGTGGCTTCTGTGTACTACTCCCTCCG TTCCTATATATAAGTCACAAATAACTAATTCTCTTAGATTAAGAAAAGTAGTTACTAGTAATAAATTTGTAAAAAAAAAT GATTTACTTTCCTAGATTACCCTTATTTACTTTCCTATAATTTTCTCTCTCCAAGTTAATATTCTAAAGTTTATCATCTC TTTCATATTAAATATGAGGGTGAACTTGGAAAAAATTATTTAATGCTTCCTAGATATTAGAAAATGACTTATATTTTGTA ACAATTTTTTTTCAAAAAATGTGACTTATAATAGGGAACGGAGGGAGTACTATATGGACTTTTGTACTAATCTTCCTCCT TATCAAAGCAGCCTCTTAAAATAGGCATTGAGGGATAATGGAGAATGGATATTAGTATTACATATACCATAAGTTCTCAT TTTGTGAAGATGCATGCTTTATATTTAAGCTAAGCCTCTGAGTGTCAAGTTATAAAGGAAATTTCACCATCCTGAACCTA GGTTTACAAAACCTGCGTAAACAACCTATCTAGTTTGAGAAATTGCGTTGCCATTTCCTCTTTTAAATATCTGTTGGAGT CCTTCATTTACAATGAACATAGATTGTGTTTGCAAAGGTTTCATAAACGTCTTCAAAGGTTGATACTTTATGTAATCCGC 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CTGGTAACGTGTTCTCTCTAGCAAGCTGAAGGCACTTGGCAATCCATATCATCTCATGTTTGGTGAAATGATCTTTGCAT TCCATTATAAATTGTTCAGGTAATTAGAGGCCTTGTCATAGACAAAGAGAAAGGCAATTTGGTTAAAGCTGATCGATTTG GTTATATAAAAAGAGCCATGCACGGCACCAAAATGTTATCTACTCGAGCTGTTAGGTAAGTGTCTGGCATTGTAATTTTG ATTGCTGATAGAAATCTATGCAGAACCCTCTTGCTCACTCATTATATCAACACAACACACTCTGCACTAACTCATAGAAA CACATCACTTTAGGCTACCAAGAAAGTGCATTCAAGATAAATATGTTGTTCTACACTGGTTAGTAATGAAGTATGGAAAT TGACACTTTATTCAAATAGCCAGACCAACACAATCAAGTTTTCACCTTAGGTTTCTGTTTAACACAGAAAGTCTTCTGAA ATAACCCTAGATTGGTGCAGTATACGTTTGCACATGGATCATTTCATTGAGTCATTGCCTTGCAGCACAGCCTTCACATT GATATATGTATACACAATTACACACCTGTGTGCGTGTGCGCACAGTAATAGCTCTGTAGATGTCATTTATCAAAAATTGG AGTTAAAGTTTCTGTAGTGCTACTTAATTTTATATGCAATGGAAGTGAGATGTACGGGAGAGAACTGGTGGACCTGCGAA AGGAGAGTAGATGGGAGTTTCTCAATACACTGTTCTCTGTGTCTGAAGCTGTAGCCTACATGCAGGTATGTCATCGCGTT GAAGATCACTCAGCTTTCAGTGATGTAGATATATTCAGCTATAATAGTCTTTTTAAAGTAGCATTCAAGTCTTAGTTCAT GTGATGAGACTTCACTGATGATGTATAATTTCTATCAGATGGTTGACAGATTGGATGATGGGACAATACCATCGGATCTT 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AATGTGCTGACATTGATTTAAAAAAAATTAAAAAATAATAACACATCAGAAATTTAAATTTAATTAATAAAAATAAAACA AATTAAAAAATCTAACCCTAAATTAGTAATAAACAAAATCAAATTCCTCCCAAATAAAAAACTAATCCTGTAATCCACCA TCTTCATCCCCAATTTCCCCAAATTAGGGTTTCTTCTTCTTCTTCTACAATTTCCTCTCCATTCTCTCTTTTTCTTCACC ACCCCAACCCCAACAGCCACCACCACCAACCACTAGCCAACGCCCACCACCACCTACCAAGATTCCAACCTCCACCCCGA CCCCATCCCCTACCACGAAGATCTGTCTGAGTGCGACGGAAAGAAGAAATTGAGAGGGAAAGAGCAAGACGGCTGGGTGC GATGGAGGACGGATCTTCTTCCCTAGATCCGGTGCCGCCACGCCACCACTGTCTTCTCTTCTCTGCGACTGCTCTTCTTC ATCTTCTGGCCGAGAGGACCAGACTCGACAAGGGCTTGAAGAGAAGGTTGTGGACCTAATTAAATTCAGGTCTTGGAAAT GGCTTAAATAAATGTAAGGATAAAGGATTCAATTTCTCGTCCTAGTGAATGCTTAGGGAAAAACACAAACTGGAAGAACA ACTAATTCTCCTCTTGATGGCAACTTACCAAACTCTGTTTTGAGCTCTTCGTGTGCTCTGTTTCGGTTCGCCAGGAGCTT GAAAATTGCTAGTCCGGTGCGTGTATTGCAGGTGTAGGAAGGGACTGTAAGCTGCTTTGTTTTATTGCTTTTCTCTTTGG TGTTTCAATTTACTCTTATTGTATCTGGCTTGTGGAGCCACTGGATAGATATTTCGTTGGTATTAAGGCACACACTTGTA AAGATGAAGAATTGTATTATTATGATTTTGAAGAGTGGAGAGATTAATTGATGAATTGAAGAAGAATGTGGATGGGTGGG 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GCTAATTTTACTACTTATGATCATGGTACTTTATGTATCATCTTCTGCAGGTGGTTTATACTCAGGGGGAAGTGCACAGA TGGTTGAAAATTCTCTTGATATCCATGGAGATGAGATATTATATGTTGGTGACCATATTTACACAGATGTCAGTCAATCC AAGGTTAATTTGCGATGGCGAACAGCATTGGTTTGTCGTGAACTGGAAGAAGAGGTTGGTACAATCAGTTTATATTTGAC TCGTAATTTTTAGTAAAAAATCTTGAAAACTTCCTCTTATGAAAAGAATATTCCTTGTTATGAAAAGAGTGTTTGACTCC TATTGGACTTGTTATGAAAAGAATACTCCTTGTTTTGAGTAAAAAATGATTGTATTTCTTGTTAACTCAGCTGAGATGCA AATCATTTTCGGTAACTTTTAATGTTGAACTTACGTACTGTTTAAAGCAAAAGTAATGCCTTGACTGGATCCTAAACTGC AGTACAGTGCCTTGATTCATAGCCGGAGTCAGAGAGAATCATTAGTGGAGCTTATAAATCAAAAGGAGGTTCTAGGGGAT CTCTTTAACCAACTTCGGCTGGCTCTGCAAAGGCGAAGCAAAGACCGTCCTGCTCAAGTAAATATTGGTTTTATAATCCT ATTTTATATTCTGTTTTTTATGCTTTATTTGTACTGACATCACACCTCATACCATTGTTAAAGTATTAGCCACTAAAGAA TTTTCTTTTGCATTCTTATGATAGTATGTGGTCAACCTTTGCTGCTACTGCTATTATGTTCTTGCCTCATTCAGTTCCCT TTAACCTTCCTAATCTAAAATCTAAATATTAATGCAGTAATTAATCTTCCCAAACATCTCAATAATTAATCCTGGTTTAG TAGCGTGTTATTCACTTATGGATCATTAGCCTAATTAGTAACTTTCTTGGATTTTGGAAGCCTTTTCCTTCCATATATTG AAACCTTCTTAACTTTTTAACTACCCCTAGGTTGACCTTATCTGACTACTTGGTTCCCTGTTTAGAGGTATCAAGAATAC CTTTTCTTTATATTTATTTTGAAGCTGTGTTGTGTGTGTACACACGCATATAGACCTAATAATTAAATACTAACTGTAAG CAAGGTTGCCGTCTTGCCGATAGTACGCTACAGGGCTGTCAGTGCGTAGCAAAACTGGCCACTCCTCAATCCTAATTGCT GTGCAGTGTCACGGTTTAATGTAGCAGTCATTGTGGCCTCTAATGTGAAAACCCTCACTCCTTCACACATTTCTTCCTTT AACTCTCTGAGCTAAACTATCGAGTGACCGAGCTGTGATAGTAGTTTTTTTTCAATAAGCAAGCTGTGATAGTAGTGGAA ATGATAAAGAGGAAGACTTGGATCTAGTAGAAGATGATTGATGATTATTATATAAGAAACTTTTATTTGAACTTTCATGC TTTTAGACAGTTTGGTTTAAGCCCTAGAGGCTTAAACTTATTGGTTACCTTGACTTTTCTTGGTATTTACTTGATGTTTT GTTTAATAGACCTATGGCTTTTTATTGTTAATTATGAGTGTTATGAATTTTGAGTTGTTTTAAATAATTTTTTTAGCATT TGTATATGCATTTATTATAAATCATAACTGAATTAAAATTGAAGTATAGAACCGCTATAGCATTTTTGGGTCAGCGACAC TATGTTCCACTATTCATGATTGACAACTAATTGTAAGATTTTTCATTGTACTTGAAAGACACTTGCAGCAACCAACATGA AAGATGAAGACCTCACTGAAAGCATGCAAAAGCTACTTATTGTTATGCAAAGACTGGATGAGAAAATTGCTCCAATGCTG GAGGAAGATGGGGAGCTCTTCAATTCAAGGTAAGCTCAGAGAATAGAACTCTCGATTTTTTTATGTCTGCCCACATGGCT ATTTCAATAACTGAGTTGCCATGGGAAAGAGTTATTGGTGATCTTGTTCTGTCAATATGCTCCAGGACGAACAAAGCTTA GACACAGTTCTATACATTGTATTTTTATTGTTGTCCAATTACAACATGACACTTGTGTTGGAAAATGAGAAGTTGATAGA AGTTATAACATTATTAAAAATATTTAAAAAGTGGGTACCCGATTTTGTCATTGCTGCTGGTCTTGCTTTTTGGTCATTTT ACCGCATGCATTTGTTATTCACTTGGATTATTTGTCTGCATTAGGTGGGGCTATCTATCTCGTGCTGGACTGTGGGATAA AAGTCACTTGATGAGACAAATTGAAAAGTAAGTGCTTTCTTTTTTATGCCACTGATCTCTATTTTAGCGTGATTACTCTC TGAATTCTGAATTAATTGAGTTTAAATTTATTATGGCAGATATGCTGATATTTATACATCTAGAGTGTCAAACTTTTTAT ATTACACCCCCTTCATGTATTTCCGCTCTCAGGAACAGGTATCCAGATAACCTTCTCTTTACCTTGTCATTTATAGCCAT GAACGATTAAGTTATTATTGTGTTGTTTGAATTGACTTTGATTTGTTTCTGTAGAATCTTGCGCATGACTCATACTCACA CTACTGTTCAGCACTCAATGATGACTTTTCTTCTTAGGGAAAAATTGCGGGAAGAAAAACGGATTAGTATAAGAAATAAA GAATCTGTTGTTGACATTGTTAGCAGATGTATCATTGTAACAGTATCCAATGCTGTGATGATGATGATACCTTGTATTAT TTGAAACTCATATAATATCCACGGAAGACTCATGTAGCATTTTTACCTTGGCCAAGTGGTGCTAAGTGGCCCCTGGTTAT AGGAGAGCAAAGCCCCACCAGGCAAAGAAGGGAAACACAAATGGCTAGAGATTTTGTTTCCAACTGATTGTGAATTTGGT GTTGATTTCAGCAATTTACATGATGTAATCAGATTGACAATTTGGCAATGCATTGTTAGAAATCATTGAACAAGTTCGTA TTCCCATATGTTTGGTTTAAATTCAAAGTTGATGTTAACCAATTTCTATTTGATTATTTTATGTTTTTTCTCCTATGAGA GTGTGAACAACAAAAAAACCTAGGACTAGCAATTAATTCATGAAATGTAAAAATTGAAT
CDS sequence (LotjaGi4g1v0314300.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTATGCGGCGGAGCTTCTCAGCATCTTCGCCGTGCACGGCGGAGGAGATGCCACGCTCTCAGTTACCGCCGCCGCCGC CGCCAACAACAGATTTTTCAAAACCTCAGCTTTCACGACACCCACTTCCCACAACGCTGCGAATGTGAGGCTGGCCAAGG CATTGACGCGTTGTCGCTGCACCGTTGACTCCAAGCCCGTCGGCGGCGACGTTTTCTCTGTGACGCCGCCGAACAAGTAT GACGTGGATTACCTCGGCGAGAGCACCAAAGGGGATTTGAATGTCAAGTTGGAGCATCTTGAGGCTTTTGGAATTGATGG GCAGGCGATTGAGGAAGTGGCCAGAGCAGAGGCAAGAGAAGCAGAAGACTTGCTAAAAGACCTCGGTATTCCGAGCCCTT CTTCGTCCAGAAATTCACCTCGTGGAATATTCTGCACCCGTACATTGAATCTGCGGTCGATCAGTGTAATTGGATATGAC ATGGACTATACTTTGGTCCAGTATAATGTGAGGGCTTGGGAAGGGCGGGCTTATGACTACTGTATGGAAAACCTTAAGAA TATGGGCTTCCCTGTTGATGGGCTTGAATTTGATCCTGACCTGGTAATTAGAGGCCTTGTCATAGACAAAGAGAAAGGCA ATTTGGTTAAAGCTGATCGATTTGGTTATATAAAAAGAGCCATGCACGGCACCAAAATGTTATCTACTCGAGCTGTTAGT GAGATGTACGGGAGAGAACTGGTGGACCTGCGAAAGGAGAGTAGATGGGAGTTTCTCAATACACTGTTCTCTGTGTCTGA AGCTGTAGCCTACATGCAGATGGTTGACAGATTGGATGATGGGACAATACCATCGGATCTTGGCCCCTTGGATTATAAAG GACTTTATAAGGCTGTTGGAAAAGCTCTCTTTTGGGCACATGTAGAAGGTCGTCTTAAGAGTGAGATCATGTCTAAGCCT GAACAGTTTGTGGAGCCAGATCCAGAATTACCTCTGGCACTTTTGGATCAGAAGGAGGCTGGTAAAAAACTATTGCTCAT TACCAACTCGGATTATCATTACACAGACAAAATGATGCGGCATTCTTTTAATCGATTCCTTCCAAATGATATGGATTGGC GAGATCTATTTGACATAGTAATTGTGTCAGCGAGAAAACCAGAGTTCTTCCAAACGTCACATCCCATGTATGAAGTGGTC ACAGGCGAGGGTCTGATGCGTCCATGCTTCAAGGCTAAATTTGGTGGTTTATACTCAGGGGGAAGTGCACAGATGGTTGA AAATTCTCTTGATATCCATGGAGATGAGATATTATATGTTGGTGACCATATTTACACAGATGTCAGTCAATCCAAGGTTA ATTTGCGATGGCGAACAGCATTGGTTTGTCGTGAACTGGAAGAAGAGTACAGTGCCTTGATTCATAGCCGGAGTCAGAGA GAATCATTAGTGGAGCTTATAAATCAAAAGGAGGTTCTAGGGGATCTCTTTAACCAACTTCGGCTGGCTCTGCAAAGGCG AAGCAAAGACCGTCCTGCTCAAACACTTGCAGCAACCAACATGAAAGATGAAGACCTCACTGAAAGCATGCAAAAGCTAC TTATTGTTATGCAAAGACTGGATGAGAAAATTGCTCCAATGCTGGAGGAAGATGGGGAGCTCTTCAATTCAAGGTGGGGC TATCTATCTCGTGCTGGACTGTGGGATAAAAGTCACTTGATGAGACAAATTGAAAAATATGCTGATATTTATACATCTAG AGTGTCAAACTTTTTATATTACACCCCCTTCATGTATTTCCGCTCTCAGGAACAGAATCTTGCGCATGACTCATACTCAC ACTACTGTTCAGCACTCAATGATGACTTTTCTTCTTAG
Protein sequence (LotjaGi4g1v0314300.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MYAAELLSIFAVHGGGDATLSVTAAAAANNRFFKTSAFTTPTSHNAANVRLAKALTRCRCTVDSKPVGGDVFSVTPPNKY DVDYLGESTKGDLNVKLEHLEAFGIDGQAIEEVARAEAREAEDLLKDLGIPSPSSSRNSPRGIFCTRTLNLRSISVIGYD MDYTLVQYNVRAWEGRAYDYCMENLKNMGFPVDGLEFDPDLVIRGLVIDKEKGNLVKADRFGYIKRAMHGTKMLSTRAVS EMYGRELVDLRKESRWEFLNTLFSVSEAVAYMQMVDRLDDGTIPSDLGPLDYKGLYKAVGKALFWAHVEGRLKSEIMSKP EQFVEPDPELPLALLDQKEAGKKLLLITNSDYHYTDKMMRHSFNRFLPNDMDWRDLFDIVIVSARKPEFFQTSHPMYEVV TGEGLMRPCFKAKFGGLYSGGSAQMVENSLDIHGDEILYVGDHIYTDVSQSKVNLRWRTALVCRELEEEYSALIHSRSQR ESLVELINQKEVLGDLFNQLRLALQRRSKDRPAQTLAATNMKDEDLTESMQKLLIVMQRLDEKIAPMLEEDGELFNSRWG YLSRAGLWDKSHLMRQIEKYADIYTSRVSNFLYYTPFMYFRSQEQNLAHDSYSHYCSALNDDFSS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 41 | 619 | 579 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 41 | 619 | 579 | 0.0 | ||
| Gene3D | 139 | 189 | 51 | 5.7E-6 | ||
| SUPERFAMILY | 140 | 612 | 473 | 1.14E-138 | ||
| Pfam | 143 | 611 | 469 | 6.3E-150 | ||
| TIGRFAM | 143 | 482 | 340 | 1.1E-119 | ||
| CDD | 144 | 466 | 323 | 6.24575E-147 | – | |
| Gene3D | 308 | 492 | 185 | 1.2E-49 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi4g1v0314300.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…