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LotjaGi4g1v0319600.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi4g1v0319600
Transcript ID LotjaGi4g1v0319600.1
Related isoforms 1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description 1-phosphatidylinositol-3-phosphate 5-kinase; TAIR: AT3G14270.1 phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase family protein; Swiss-Prot: sp|Q9LUM0|FAB1B_ARATH 1-phosphatidylinositol-3-phosphate 5-kinase FAB1B; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2Q844|A0A0B2Q844_GLYSO 1-phosphatidylinositol-3-phosphate 5-kinase FAB1; Found in the gene: LotjaGi4g1v0319600
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr4:69713858..69732276) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CAGAAAAATCAACTTTAAACAAATATAATTAATTAAATAAATTCATATTCACAAAATAAAATAAAAATAAAAATAAAAAT AAAATAAACATGTGGCGCCAAGTAAATAGACATTTTTTTTTCTATTTGTTTTTTTTTTTTGGTGTGACAGACTCTCTCTC TGTCTCTCACACACTGTGTTTCTCTTCTCAATTTCTCATCAATCATTCAAAATTTGTTAATCTCTCACTGTTTGTAATTA TTGCAGTGCCGTTTTCTGTAGATCTGGTTGCAGTTTTCTCAGCTCTCAATAAGTTGTTGAGGTTGTGGGTTGGTGTGTGA CGGAAAGGGGAACATTTCGGAACAAGCTTTTGTCTTGGTTCGTGTTTTTGCATCTGTTCATCGTTTTGAATTCAATTTGC TTTCTGGGTATGCTGGGAAATTCAGCCATTCAGCTGATTCATGGTTGATTCAGTTAGATTATGTTGTCTGAACTGGGAAG ATGGGTGGTTTTTTGGTACCATAGCTGTGCCCATTGGCCTTTGCCCTTAATCTGAAAAATACCATTTGGTGACTACATCA TGCTATTTGTTCCATTTTGCAATTTGTGAATTTAGAAGATGCAGGTTTATGTCAATTTTTTAAGTGATATTTCATATTTG GGGTTTGATGATTTGAGGGCTTTTGGGAACTAGCAATTGGAGTAGTTGACATAATTAGAAACATTACAAGCCAAGGTTTC CAGCTGTTAATAGCTTTTTAGGTTCAAATATTTTTGTCAGGGTTGATGTTTTTGGTTGTGGACAAGATTTTTTTAGCAGT ATTATGCTTATTAGTTATTACTATTCCATTATTATTTGATCAGCATTAGAACTTAAAAAGTTGATTTATTAATGTTATTG TAGCTATTGATTTACCTTTGATTTGATTCCCAGTTCTTAACTCTCAGAATTAATTGGTTTCCTCTCATACTAGTCTAGTA 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CDS sequence (LotjaGi4g1v0319600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGTTAACAAGGCTGGTCAATGAGGAACTCAATGAGTGGGCTCAGGTGGAATCACAGTCCATGGGCACCCCTGAAAAGAA AGTATCTGACTTCATTGATGTAGTTAGATCCTGGATCCCCAGACGGGCTGATTCACCAAATGTGTCCAGGGACTTCTGGA TGCCCGATCAGAGTTGTAGGGTATGCTATGAGTGTGATTCTCAGTTCACAATATTCAACCGCAGGCATCACTGTCGAATC TGTGGTCGAGTTTTCTGTGCAAAATGCACTGCCAATTCTATTCCTGTGCCATTGGATGGGACAAGTACTGGTCGTGAAGA TTGGGAAAGGATTAGGGTTTGTAACTTTTGCTTTAATCAATGGCAGCAGGCGGTAGCAACTGTTGATAATGGCACTCCTT CAGCCACCCCTTGTCTCAGCCCTTCACCATCTACAACAAGCTTGGTCAGCACTAAGTCTAGTTGCACCTGTCATAGTAGC AGCACTGCTGGTTCAGTTCCTTACTCAACCGGGCCTTATCAACGTGTACCATATAGTCCACATCAGTCTTCCGAAATGAA TACAGTAACAGATGAGCAAGAAAATTTAAATTCTGGGAGCACAAATCCCTCTGCGGATGTAGAGAATTTGTCTTCTAACC AATTTAGTTATTGCTTCAACAGGAGCGATGATGAGGATGATGATTATGATGTTGATACTGATACAGAATCAAGGCATTTC TCTCATGCCAATCACTATGACGGTCCAGTTAACATCCATGAGATAGACCGTGTCTATGGACCACATATAAATCATTCTGA TGGTGATAACTTTCAGGAAACAAGTTCGAGTTGCCTAACAGCAACACCGAATCTTGATCAAGAAGGCGTAGATGGAGTTC AAGCTCCTGGAAAAGAAGCTGATGAGCATGATCATGATGGATGTGAAACATCTCCCTATCATGAGGAGAGTAGTAATGCG GAGCCTGTGGACTTTGAGAATAATGGACTTCTGTGGCTACCTCCTGAACCAGAAGATGAAGAGGATGATAGAGAAGCTGC TCCTTTTGACGATGAAGATGAAGATGAAGGTAGTACTGGAGAATGGGGATATCTACGATCCTCCAATAGCTTTGGCTCTG GAGAATCCCGTAACAGAGATAAATCAATTGAGGATAGTAGGAAGGCCATGAAGAATGTAGTGGAAGGGCATTTTAGAGCT CTGATAGCTCAGCTTTTACAGTCGGAGGAACTAAGTATTTGTGATGAAGAGAATAAAGAGAGATGGTTGGATATAATTAC CACTTTGTCTTGGGAAGCTGCTACACTTCTGAAGCCTGATATGAGCGGGGCTGGAGGTATGGACCCTGGTGGATATGTAA AGGTTAAATGCATAGCGTGTGGGCATCCAAAAGAAAGTGTGGTGGTTAAAGGAATTGTTTGTAAGAAGAATGTGGCTCAT CGGCGGATGACATCAAAAATTGATAAACCACGTTTTCTAATACTTGGAGGTGCTTTGGAGTATCAGCGTGTTTCTAACCA GTTATCGAGTGTTGACACTTTGTTACAGCAGGAGATGGACCATTTGAAGATGGCGGTTGCAAGGATTGCTGCTCACCACC CCAATGTTCTTTTGGTAGAGAAGTCAGTATCTCGTTATGCTCAAGAATATCTTCTCGCTAAAGACATATCGCTTGTTCTG AATATTAAAAGGCCGCTTTTAGAGCGTATTGCTCGTTGTACTGGGGCACAGATTGTCCCTTCAATTGATCATCTGACCTC CCAAAAGCAGGGTTATTGTGAAACCTTCCATGTGGACAAATTTTTTGAGGAGCATGGTACTGCTGGGCAAGGTGGGAAAA AATCAACGAAGACTTTGATGTTCTTTGAGGGTTGTCCAAAACCTTTAGGTTGCACTATCTTGCTCAAAGGTGCCAATGGG GATGAGTTGAAGAAGCTGAAACATGTGGTCCAGTATGGAATCTTTGCAGCCTATCATCTGGCGCTGGAGACATCTTTTCT GGCTGATGAAGGTGCCTCACCTCTAGAGTTTCCCTTGAAATCTCCCATAACCGTTGCATTACCTGATAATCGATCTAGTA TTGTGAGATCAATTTCAACTATCCCTGGATTTACTGTTACCACTCCTCGAGAACATCAAGGATCTGAAACTATTAAAGAG GTACCAAAATCTAATGATCGCCACAACACAGAAAGAACCCCATCTAGATGCAGTGGGTCCTTCGAAAGATCACAGGTTGG TGACTCCATCCACATGCATGAAGTCTTTGGAGAAGTCACCCGGCCAGTTCAGGATATGACATCTACCCACTGCAATAGTT TCCTCGCAGATACTGATTCTAAGGAGGATGTTAAGAAATGTCCCAAGGAATTTTTTCAATACAGACAAGATGAGAGCGGG GAAATGATGTTGAACAATGATCATATTTCAGATTCTTTTGGCACCTTTGAACCTTCAGTGCAAGAAGGCAATAACCACAT CAAAGCTGTAGCATTGGCTTCACATCAAGGAGCTAACCCTGAGCCACCTATTGTAAAAATTGACAATTATAATAATGATG ATGATGACATGCTACATTCGAAAGAAGATTTTCCTGCCTCAACTTCTGACCATCAGAGTATTTTGGTCTTTTTATCAACA CGTTGTGTGTGGAAAGGAACTGTTTGTGAAAGGTCCCATCTTGTTAGAATTAAATACTATGCAACTTCTGATAAGCCTTT GGGACGGTTTTTGAGAGATCGACTATTTGATCAGAGTTACACTTGCTGCTCATGCGAGATGCCTCCAGAAGCTCATGTTC AATGTTATACTCACCGCCAAGGGAGCCTGACAATTGCTGTTAAGAAACTACCAGAGTTTCCATTACCAGGGGAAAGGGAT GGTAAAATCTGGATGTGGCACAGATGCTTGAAATGTCCTCGTGTAAATGGTTTTCCTCCTGCTACACGAAGAATAGTTAT GTCTGATGCAGCTTGGGGCTTATCCTTTGGGAAATTTTTGGAGCTGAGTTTTTCAAATCATGCAGCAGCAAGCAGGGTTG CAAGTTGCGGTCATTCTCTCCACAGAGATTGTTTAAGATTCTACGGTTTCGGGAAGATGGTTGCCTGCTTTAGCTATGCT TCAATTCACCTACATTCTGTTTTTCTTCCCCCACCTAAACTTGAATTCAACCATGATACTCAAGACTGGCTACAGAAAGA AGCGCTTGAGGTACATGACAAGGCTGAAATACTTTTTAGTGAAGTGTGCAATGGTCTACATCAAATTTCAGAGAAGATTT CAGGTCCTATGCTGCAGGAGGGTGGAAATATTGTGGCAAAATTTAAGCTCCTAGTAGCTGAACTTAAAGGAATTCTGCAG AAAGAGAAAGAAGAATTTGAGGACTTGTTACAAAAGTTGCTGCATAAAGAGCCCAAAGCTGGCCAGTCTATGGTTGATAT TCTAGAGCTCAATAAATTGCGCAGGCATATCCTTACTCATTCTTATGTTTGGGACCGGCGCCTTATATATGCTTCCAATC TAAGTAAAACTACTCTCCAAGAAGATTCAAGGAATTCCTATCTGAAAGAGAAGTCAATTAGTTCTAAGGAAAAGGTTGCT GAGAAAGATGCGGCTTCTAGGTTCACAAGAGGCCATAGCAGTTGTGACTCTCTTCATTTGGAAACAAAGCCTGATGGAAA CCTTAATTTAGAAAACACTAGCCGCCTTAACCAGTCTGGTGAAGTGATTAAAGGCGAGGACAAAGGTAAAGACAAAAGTC ATGATAAGGTTGATCTTTCTCTCTCTGGTGGTGCAAATGTCAATGATAAATCTAACTCTCTGGAGTTTGGAGGAGCTGGA AGGAGGGCTTCGCCAGAGGGGGGATCTCCTACTGTTGCTAATTTATCCGATACCCTTGATGCTGCATGGACGGGTGAAAG TCACCCTACAAGTTTATCATTCAAAGAAAATGGTTGTCTTCCTCCTGATTCAGCAGTTGTGACAGTTCATTCACCTGTGG CAAATATAGTTTCAACAACATCAAATTCTGATAATTATACTGCTGATATAGGTGGGACTGAGACAGGGCACATTAAGTTG CTTCCCAAAGGACTTGATGCTAGATGGAGTGGGATGCCTTTTGCAAATTTGTATTCGTTCAACAAAACATCTACCGTCAA TACACAGAAGCTTGTTGAGTACAACCCAGTCCACATTCCATCATTTCGAGAGTTGGAGCGCCAGATTGGTGCTAGACTGC TTCTGCCTGCTGGTATTAATGACACCATAGTACCTGTCTATGATGATGAACCCACTAGTGTTATAGCACATGTACTCGTG TCAATAGATTATCACATACAAATGTCAGAATCTGATAGACCTAAAGACAGTTTAGACAGTTCAGTCTCATTGCCTCTCTT TGATTCAACAAGTCTACTTTCTCTTGGCTCTTTTGATGAGACACTTACTAATACTTACAGAAGTTTTGGCTCTTCTGATG AGAGCATGCTATCCACTTCTGGGTCTCGGAGTTCGCTGGCTGGGGATCCACTCTTATACACAAAGGATTTTCATGCAAGG GTTTCTTTTGCTGATGATAGCTCCCTTGGAAAGGTGAAATATACTGTAACTTGCTACTATGCAAAGAGATTTGAGGCTCT AAGAAAAATCTGTTGCCCTTCTGAGCTAGATTTTGTGCGGTCCCTTAGTCGTTGTAAGAAGTGGGGGGCTCAAGGAGGAA AGAGCAATGTTTTCTTTGCGAAAACCCTGGACGATAGATTTATTATCAAACAGGTTACAAAGACGGAGCTTGAGTCATTT ATAAAGTTTGCTCAGGCTTATTTTAAATATTTATCTGAGTCAATCAGCACAGGAAGCCCAACTTGCCTAGCAAAGATTTT GGGAATTTATCAGGTAACATCAAAACATGTCAAAGGAGGGAAGGAAACAAAAATGGATGTTTTGGTTATGGAGAATCTTC TTTATAGGCGTAACATTAGACGGCTTTATGACCTTAAAGGTTCTTCTCGATCAAGGTACAATCCAGATACAAGTGGGAGC AATAAAGTTCTGCTGGATCAGAATCTCATCGAAGCTATGCCAACCTCTCCAATATTTGTGGGGAACAAGGCAAAGCGGTT GCTCGAGAGGGCCGTGTGGAATGATACAGCATTCCTTGCATCAATATATGTGATGGACTACTCATTGCTGGTTGGAGTGG ATGAGGAAAAACATGAGCTGGTTTTAGGAATTATTGATTTTATGAGACAATATACATGGGACAAGCATCTTGAATCTTGG GTGAAGACCACAGGCATCCTTGGAGGACCCAAGAATGCTTCTCCAACTGTTATATCACCACAGCAGTACAAGAAACGGTT CAGGAAAGCCATGAGTTTATATTTTCTCATGGTGCCAGATCAATGGTCTCCTCCAGGTTTAAACCCCACTGGCTCCCAAT CTGATCACTGTGATGAAAATTCCTGA
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Protein sequence (LotjaGi4g1v0319600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MLTRLVNEELNEWAQVESQSMGTPEKKVSDFIDVVRSWIPRRADSPNVSRDFWMPDQSCRVCYECDSQFTIFNRRHHCRI CGRVFCAKCTANSIPVPLDGTSTGREDWERIRVCNFCFNQWQQAVATVDNGTPSATPCLSPSPSTTSLVSTKSSCTCHSS STAGSVPYSTGPYQRVPYSPHQSSEMNTVTDEQENLNSGSTNPSADVENLSSNQFSYCFNRSDDEDDDYDVDTDTESRHF SHANHYDGPVNIHEIDRVYGPHINHSDGDNFQETSSSCLTATPNLDQEGVDGVQAPGKEADEHDHDGCETSPYHEESSNA EPVDFENNGLLWLPPEPEDEEDDREAAPFDDEDEDEGSTGEWGYLRSSNSFGSGESRNRDKSIEDSRKAMKNVVEGHFRA LIAQLLQSEELSICDEENKERWLDIITTLSWEAATLLKPDMSGAGGMDPGGYVKVKCIACGHPKESVVVKGIVCKKNVAH RRMTSKIDKPRFLILGGALEYQRVSNQLSSVDTLLQQEMDHLKMAVARIAAHHPNVLLVEKSVSRYAQEYLLAKDISLVL NIKRPLLERIARCTGAQIVPSIDHLTSQKQGYCETFHVDKFFEEHGTAGQGGKKSTKTLMFFEGCPKPLGCTILLKGANG DELKKLKHVVQYGIFAAYHLALETSFLADEGASPLEFPLKSPITVALPDNRSSIVRSISTIPGFTVTTPREHQGSETIKE VPKSNDRHNTERTPSRCSGSFERSQVGDSIHMHEVFGEVTRPVQDMTSTHCNSFLADTDSKEDVKKCPKEFFQYRQDESG EMMLNNDHISDSFGTFEPSVQEGNNHIKAVALASHQGANPEPPIVKIDNYNNDDDDMLHSKEDFPASTSDHQSILVFLST RCVWKGTVCERSHLVRIKYYATSDKPLGRFLRDRLFDQSYTCCSCEMPPEAHVQCYTHRQGSLTIAVKKLPEFPLPGERD GKIWMWHRCLKCPRVNGFPPATRRIVMSDAAWGLSFGKFLELSFSNHAAASRVASCGHSLHRDCLRFYGFGKMVACFSYA SIHLHSVFLPPPKLEFNHDTQDWLQKEALEVHDKAEILFSEVCNGLHQISEKISGPMLQEGGNIVAKFKLLVAELKGILQ KEKEEFEDLLQKLLHKEPKAGQSMVDILELNKLRRHILTHSYVWDRRLIYASNLSKTTLQEDSRNSYLKEKSISSKEKVA EKDAASRFTRGHSSCDSLHLETKPDGNLNLENTSRLNQSGEVIKGEDKGKDKSHDKVDLSLSGGANVNDKSNSLEFGGAG RRASPEGGSPTVANLSDTLDAAWTGESHPTSLSFKENGCLPPDSAVVTVHSPVANIVSTTSNSDNYTADIGGTETGHIKL LPKGLDARWSGMPFANLYSFNKTSTVNTQKLVEYNPVHIPSFRELERQIGARLLLPAGINDTIVPVYDDEPTSVIAHVLV SIDYHIQMSESDRPKDSLDSSVSLPLFDSTSLLSLGSFDETLTNTYRSFGSSDESMLSTSGSRSSLAGDPLLYTKDFHAR VSFADDSSLGKVKYTVTCYYAKRFEALRKICCPSELDFVRSLSRCKKWGAQGGKSNVFFAKTLDDRFIIKQVTKTELESF IKFAQAYFKYLSESISTGSPTCLAKILGIYQVTSKHVKGGKETKMDVLVMENLLYRRNIRRLYDLKGSSRSRYNPDTSGS NKVLLDQNLIEAMPTSPIFVGNKAKRLLERAVWNDTAFLASIYVMDYSLLVGVDEEKHELVLGIIDFMRQYTWDKHLESW VKTTGILGGPKNASPTVISPQQYKKRFRKAMSLYFLMVPDQWSPPGLNPTGSQSDHCDENS
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Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER
PTHR45748:SF11
21 1820 1800 0.0 –
PANTHER
PTHR45748
21 1820 1800 0.0 –
Gene3D
G3DSA:3.30.40.10
44 136 93 2.0E-22
IPR013083
SMART
SM00064
48 123 76 4.7E-21
IPR000306
SUPERFAMILY
SSF57903
51 126 76 9.59E-21
IPR011011
Pfam
PF01363
53 122 70 1.6E-17
IPR000306
ProSiteProfiles
PS50178
56 122 67 12.868
IPR017455
MobiDBLite
mobidb-lite
160 209 50 - –
MobiDBLite
mobidb-lite
175 209 35 - –
MobiDBLite
mobidb-lite
260 384 125 - –
MobiDBLite
mobidb-lite
267 284 18 - –
MobiDBLite
mobidb-lite
295 312 18 - –
MobiDBLite
mobidb-lite
335 358 24 - –
MobiDBLite
mobidb-lite
362 376 15 - –
CDD
cd03334
399 671 273 1.68833E-133 –
Pfam
PF00118
418 666 249 1.1E-32
IPR002423
Gene3D
G3DSA:3.50.7.10
464 637 174 1.3E-55
IPR027409
SUPERFAMILY
SSF52029
465 637 173 9.16E-43
IPR027409
MobiDBLite
mobidb-lite
708 743 36 - –
MobiDBLite
mobidb-lite
713 733 21 - –
Coils
Coil
1112 1136 25 - –
MobiDBLite
mobidb-lite
1198 1219 22 - –
MobiDBLite
mobidb-lite
1198 1294 97 - –
MobiDBLite
mobidb-lite
1226 1240 15 - –
MobiDBLite
mobidb-lite
1241 1258 18 - –
ProSiteProfiles
PS51455
1470 1795 326 57.677
IPR002498
Gene3D
G3DSA:3.30.800.10
1494 1652 159 2.1E-19
IPR027484
SMART
SM00330
1505 1796 292 1.9E-129
IPR002498
SUPERFAMILY
SSF56104
1530 1795 266 1.44E-79 –
CDD
cd17300
1532 1795 264 3.58464E-149 –
Pfam
PF01504
1571 1737 167 1.7E-34
IPR002498
Gene3D
G3DSA:1.20.58.1870
1654 1796 143 2.0E-41 –

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
GO:0005524
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Subterm of
GO:0016307
Molecular function Phosphatidylinositol phosphate kinase activity Catalysis of the reaction: ATP + a phosphatidylinositol phosphate = ADP + a phosphatidylinositol bisphosphate.
Subterm of
GO:0046488
Biological process Phosphatidylinositol metabolic process The chemical reactions and pathways involving phosphatidylinositol, any glycophospholipid in which a sn-glycerol 3-phosphate residue is esterified to the 1-hydroxyl group of 1D-myo-inositol.
Subterm of
GO:0046872
Molecular function Metal ion binding Interacting selectively and non-covalently with any metal ion.
Subterm of

Genome browser

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi4g1v0319600.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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