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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0063200 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0063200.1 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Embryo defective 2410 protein; TAIR: AT2G25660.2 embryo defective 2410; Swiss-Prot: sp|B8DC21|CCA_LISMH CCA-adding enzyme; TrEMBL-Plants: tr|A0A072VNV3|A0A072VNV3_MEDTR Embryo defective 2410 protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0063200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:10584475..10608187) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CTCGAAATACAGCCAAAACATTCACAAGCAACCAGAGAGAGAGTCCCACACCCAAAACCAACACATTCACAAATCTCATT CTTCATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCACAAACTCTTCAATTTCTCTGATTTCAATTCAACAACAACCGCCTCC GAATTCTCCATTCACCATTTCGATGCTTCTTCAAAACCACCGTTTCTTGACACCGCACAACGATGACGAGCCTGAAAAAC CACTCCACTTTTTTCGGGACTAAGCTTCATGCTTCTTTCGAAACCAACAGGAACAACCCTTTTCATTTCCAGAAAAGAAG GTTGCAAAAAAAGGGTCTTTTTTGCAGTTGCAGCACAAAACGTTGTCGTCTGGTAAGCCAAGCGTTACGGTTTTCGCATT TTTCTGGCCAAAATGTAGAATTCTTGAGGAAAGACCAAATTTTGAGAAGTGGGTCGAGGTTAAAATGTGCAAAGGAAAAG GAACCCATTTTTACAAGAGAGGCTTTGGTTAGTTATTTGACCCCTTTGTGGAAAGAGGGTCTTCTTTTGATAAGGGCTTC TGTTTACACTGCTGTTTTGTGTGGAGTTTGCATGTTAGTGTGGTATGGTCAGAATAAGGTTAAGGGTTATGTTGAAACCA ATTTGCTGCCTTCTGCTTGTGAAGCAATTAGTGAGTATATTCAGCGTGACCTTGTGTTTGGTAAGGTTCGACGAGTCTCG CCGTTGAGTATTACGTTGGAGTCCTGCTCGTTTGGGCCGCATAAGGAGGAGTTTTCGTGTGGGGAGGTTCCTACGGTTAA GCTTCGTCTTAGGCCTTTCGCGAGTTTGAGGACGGGGAAGTTGGTGATTGATGCGGTTTTGTCGAATCCGAGTGTTTTGG TTGTGCAGAAGAAGGATTATACTTGGTTGGGGATACCGTTCAATGAAGGCGGCAGAGAGAGGCACTATTCGACTGAGGAA 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CTTAATGGACACGCATCTTTCCACCGGGCATCTATTTCTTCACCAGTGCTCCGAAAGCCACTAACCAACTTTGGGGGAAC TGTTCATGTGAAATCAAACAGGTTGTCCATCACATCACTAGAAAGTAGGGTAAGCAGAAAAGGAAAGCTCCTTGTGAAAG GGAACCTACCACTCAGAACTAGTGAAGCAGCCCCTGATGACAAGATTGAATTGAAGTGTGAAGTTTTGGAAGTACGGGCC CAAAAGATATTAAGGTTTCTCTCTTAACTTCACTAGAGGGTTTCTTAGTCTTGACATAGATATGGATATAAAGCGGCTGA TTTGACCTTCAAACCATAAATGTCATGGATTTCTGGAAGTGTACTCTTTCCCCACACCTGATTCCTTTTAATTTTTTTTT CTACTTGTCAGTGGTCAGGTTGATTCTCAGTTGCAAATAACTGGTTCGATATTGCAACCAAACATATCTGGGAATATCAA ACTAAGTCACGGAGAAGCATATTTGCCACACGATCGAGGTGGTGCTCATGCTTCTAATAGATTCCCATCAAATCAATCAG TGCTTCCTGCTGGTGGCATTAGTAAAATGTTTGCATCAAGATATGTTTCACGATTTTTCAGCTCAGAATCTGCTTCTTCA AGGGCCACAAATTCTCAATCCTCTGGCTCTGGTATTACTTTACATGTGTATCAGTTTAGCCTGCGATCTCTTTTTTCTTA TGATTAGATGCTAAATGCTCTACAATCAAAATGGACCCCCTTACAATTTAATGAAAACAATGTTATCAACAGTGGAATCC TGTTTATAATGAATTACTAATTCAAATACCGTTGTGGCCTGTGATGGAAGCATGGTCGCACTTATACACACACACACACA CACACACACACACACACACACACACACACTTGAAAAGCTCTGAATATAAACCAATGACATGTCAAAAAGAATAAATAAAC TACAAGCATTTTGTAGATAAGTTTTGGCAGCTAATAATCTCTTTAAATTATGAGGTAACTGTTTTAGACCATCTAAAGAT TTGGGCAATTTGCAAACAAAACTTGACTCCACTTGTGCAACAAAACCCTGTGATAGCTCCTGATAAATCTCCTCCTTCTA GTCACCATGTAGGAAGGCATTTATAATGTACAACTGATATAGAGGCTGATGTTTCATGGCAGCCATAGTTAATTAAAAAT GAACAAAAGCTATTTTAGCACTCGTTAAGAGGTATCACCATAATCCAAGAATCGAATATGATCAACATCCACGTTCTTCC TTTGATACACCGTGGTAATTTGTGGCTTAGGCGTGGGTTTACTGAGAATGCTCAATCTAATGTAAATCAAAGTGTGACTT GGAGATTAACCTTCATAAAAAGAATATATAAGTGCTGAATCATGTGAAAGGATAGCATCTCACAGTAAGAATATTTTATG CGATTTTTAGCATGCTCAATAGTTCATCATTAACCTTACGAGATGCTAGGATCAATTATTTGATTTCTTGATCTTCTACT TTTGCTTATGTTTATATATTTTACTTTAGTTAATTATGTTGTATTTATCACATTGGCTGTTAGTGCATATTATGATCTCT TCCTTGAAAACAACTGTGGCAGTTAATAATGCAACTCAGGTTGAAAAGCAGACAGAGGATGTGCAGATTAAACCAGATCT AGAAATCTGCCTTAGTGATTTGAAGCTTGTGCTTGGACCAGAGTTGAAGATAGTTTATCCTTTGATCCTTAATTTTGCTG TGAGTGGAGAGCTTGAGTTGAATGGTCTTGCCCATCCCAAATGGATAAAACCTAGAGGCATACTGGCATTTGAAAATGGT GAAGTTGATTTAGTTGCAACCCAGGTTTGTGTAATGTTTTACTCTGTTACTTTTTTAAATTGTATCCTGTGGTTTCTTCT AAGCTAGTTTCATTTTGGTTTGTCTCATAAATTTCTCAAGTCTTAACCCATTGTTTATTTTGGTACAATCCATTTCAAAT GCAGGTTCGGTTAAAACGAGAGCATTTGAATATTGCAAAATTTGAGCCTGAGTATGGACTAGATCCAATGCTAGATTTGG TTTTGGTTGGATCTGAGTGGCAATTTAGAATTCAAGGTAGAGCTAGCAATTGGCAGGACAAACTTGTAGTGACCTCAACT CGTTCTGTGGAACAGGATGCCCTTTCGCCTACTGAGGTAAAACATTGTTATCTTGTTTGATCTCCAAAGCTAACTATTTT AGACCTGTCTTCAACTGAACTCTATGCTGTTACTTTTAAACAAGAACAAATAAAAAGCCTAAAAGTCCAGTGGTAATTTT GATTAATTTGACTATTTAACAAAAAAAATCGTGGTGGGGGAAACTGATGAAATTATTTATATTTTATACTGACTATTGAG CCTCAAGCTTTTAACCATCAATGCAAAATATGAAGGACCTAGCGTTCAATGGCTTTATTCACTCCCATATGTTAGAAAAC TAGAATGATTGAAAGAGACAGATAAATGATTGAGTGAAACTCAGAATTTGTGTGAAATGAATTCTTATTACAATAAGCCA CTTAAGTGAGGCTTTTATACAGAGAGTAGTTAGAAACAGTTACTATTGCTTAGCTGTTTATAACAGAAATCTTAAGAGCC TGAAAAATTAGGGTTTGTTGAACCGGGTCGTGAAATCCAACCCACCCCACAATGTCAATGAAGGACGTCATGGAGTGGCG ATCCCACGTTTCCATCATGAATATTGTCCACAGTCCGTCTTCTGAGACAGCCTCAGTGCTGTGTTACTTGCCCACAATCC GGTCATGCTTTTGACGGACCAAACAGTAACAGTAACAGCACGGACTGTTCAACATCTATGAGCAGAGCAGATCTTCAAGT AGTGAATACTCTGAAAAAATCACTCTGCCTCCTTGATTTACTGCCCTGCGCTGCGAGCTCATTTAAGGGTAGTATTGGAG TATATAAATTAAAATACACCCTACTGTATACGATATTATTCTTATAGAGTACTTCAGAGTTATTGCTACCAGCTGTAGTA AGTTATGACTTGCTGAGTTGGTTATGAAGTTAGTTACAGGTGGTTAAGGCTTGCTTAAAAATGAGCATTGTCTGTGTAAG TGTACCTGAACACATTAGTAATAAAAGTAAGTCACTCATAGAATCAGCCAAGAATGTAAAGAGAAAGAGTACTATTATGC AAGATGAACCTGTCTTAAATAGCAATTAGAGAGAATGTACACTGGTGTAGAGCATTCGAGATGCTCCACTCTCTCCCAAG TCCCATATGGTCCCAAGGATACCCTACTCTCACTAAACTCTTATTTATAATGCTCTCAATAACTAACTCCCTTAACTAAC CGAACTTGACTAATCCAAACTACTAACTAACTAACAATGTTATGTGGAACAGGATGCCCTTTCACCTGCTGAGGTAAAGT GAAAGTGGCTTCTATGATATGATGTTTGAGCAGAGTGGTCCTATTAATATTTTTTTTTTTTATCAATGCAGGCTGCCAGA AGATTTGAGAGTCAGTTGGCTGAATCCATTTTGGAAGGCAATGGGCAACTTGCATTTGAAAAACTTGCAACTGCAACTCT TGAAAAGTTGATGCCACGAATAGAAGGGAAGGGAGAGATTGGCCACGCAAGGTGGAGAGTCGTGTATGCACCTCAGATTC CTAGTTTGGTTTCTGTTGATCCTACGGCAGATCCTCTCAAGTCTCTAGCTAGTAATATATCGTTTGGTACAGAAGTTGAA GTCCAGCTTGGGAAACGACTTCAGGTAAGTATAATATAAGTAGTTAAATTTTCAGAACTTTCTTCCCGAGACCTATGATA CTGTTAATTTACGTTGCCATGAAAATATTAAATCTCTATCAATATAGCAAAAAGAATACCCATAGTATTGCTTTATAATG AAAGCAATAGATAATGCACAAAAAAAAAGGTTTTGTAGGTAAAAGTTTTCCTAGTTTAAGAATAGTAAGCAGTTCCTCAT CAAACTCTGTTTGAACAATTGTTAACTGGATAAATATCTCATTCACTAGTATTCCTACGCCAAATCCTTTTTTATCTTTT ATATTTTTCATAAATATTCCCTTGAAATAATCTTGTGGTGCTTGGTCTGTCACTTTTATTTTATTGCCAGTGGGTTTCGT TTTGATGATTTTATTGGGTAGATGTTTGCTATTCATTAAGCCAACATTCTGAAGTTGCCAGTGCACATTTCAAGGCAGCT TGAATGTACTGTTGGCCAATTCATGTCTCTTGTGAGTGAATGTGTTTTTGCCAACTTGAACGTAAATACAAACACACGTA GTTGTTGCTATATTCCTACATCATATAGAAGCATCAACCGATAGTTGGTTCAGGTGGCACATGCCTGATTCCCCTTTAAG CATGGTCCGAGTTTGAGTATTGTGAATGGAAAAAACCCAAGCCCCAGTATGATGTGGATGTTTCCAGCTTGAACAAGATT CTCTCTTGAAATACATAAAAAAAAAAACTTATATTATACAGTGAAATACCAAATCCTTTCTGTGGTTTTAACTGAGAACC TTGGCCTACGTTAAACTGCATTTTCTACCTTTATTCTTTTTTTAATATCTTATAATTATCTAAGGTGATTGTTTCTTTCA GGCCACAGTCGTGCGGCAAATGAAGGAATCCGAGATGGCAATGCAGTGGACCTTGAGCTATCTTCTTACAAGTCGTTTGC GGGTGCTCTTACAATCTGCTCCATCCAAACGCATTCTTTTTGAATATTCTGCTACATCCCAGGATTGAGTTACATCCAAA 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CDS sequence (LotjaGi5g1v0063200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGACGAGCCTGAAAAACCACTCCACTTTTTTCGGGACTAAGCTTCATGCTTCTTTCGAAACCAACAGGAACAACCCTTT TCATTTCCAGAAAAGAAGGTTGCAAAAAAAGGGTCTTTTTTGCAGTTGCAGCACAAAACGTTGTCGTCTGGTAAGCCAAG CGTTACGGTTTTCGCATTTTTCTGGCCAAAATGTAGAATTCTTGAGGAAAGACCAAATTTTGAGAAGTGGGTCGAGGTTA AAATGTGCAAAGGAAAAGGAACCCATTTTTACAAGAGAGGCTTTGGTTAGTTATTTGACCCCTTTGTGGAAAGAGGGTCT TCTTTTGATAAGGGCTTCTGTTTACACTGCTGTTTTGTGTGGAGTTTGCATGTTAGTGTGGTATGGTCAGAATAAGGTTA AGGGTTATGTTGAAACCAATTTGCTGCCTTCTGCTTGTGAAGCAATTAGTGAGTATATTCAGCGTGACCTTGTGTTTGGT AAGGTTCGACGAGTCTCGCCGTTGAGTATTACGTTGGAGTCCTGCTCGTTTGGGCCGCATAAGGAGGAGTTTTCGTGTGG GGAGGTTCCTACGGTTAAGCTTCGTCTTAGGCCTTTCGCGAGTTTGAGGACGGGGAAGTTGGTGATTGATGCGGTTTTGT CGAATCCGAGTGTTTTGGTTGTGCAGAAGAAGGATTATACTTGGTTGGGGATACCGTTCAATGAAGGCGGCAGAGAGAGG CACTATTCGACTGAGGAAGGGATAGATCATCGTACTAGAACGCGGAGGCTTGCGCGAGAGGAAGGTGTTGGGCGGTGGGA AAGAGCAAGGGATGATGAAGCTCGGGAAGCTGCTGAGGCGGGTTTCTTTGTTTCTGAGCGGAGTTGTTGTCCATCCGGAG GTGAGGGTTTAAAGGAGGTCGAAAGTTGTTCAGCCGAGTTAACTGATACCACACCCTTTTTCTGCACGAATGGTGGGAAG CATGATCATCGGTTTATGGACACAGGTGTTGATTATGATGTGAAACATTCCTATTTGGAAAAATCATTTGGAGTGAGATT TCCTGTTTCTGGACTTCGATTTTGGTCCAGAGTAATATCAGGGCGTAAGAGACACAAATTTAAGAGGAAAGCTAATGGGA GTGACATCTATGCATCTGGTGTTGCTATGAAAAAAAGAATATTTGATCGTAGTGCTTCAGCAGCTCGCACATACTTTGAT GATCAATCAAATGGAAAGTTTGGAGAGCCTGCATCACCTTCTCAATGTTTTCATTTTATGAATCATGACATGCATGTGGT GAAAAGTGAGTTTGACAAAAATGCAAATTCTGTTACGGTTGGTGATGAAAATAGAAGTGATGATAACCAAATTGCTGCAC AAATTAGAGATATGAGAATCTGGCCCTCCTTGGTAAATGAAAATGACAGAGCTCATTCAGGTTATGGCAAATTTGTCTCT GATCCTACTTTACAGACAAGAGAGAGTGAACTTGAAAATTTGCAATCCAGTGAGGAAGTTGCAGAACCTGCCAATGGTAA TAGTAGTACAGAGAAAAATGAAGAGTTGGTACCTCCTGTTGAAGACAATCATTTTGAGGATGAAGATTTTTCTGGGGGCC AACCAGGTTTAACATCTGAAGATTTTGATTTTGTGAAGCCTAAGCCTCGATTGGCAGCTGATTTTAAAATTCCATTTGAG CCCTTGATTGAGAAATTTGGCTTAACCTCCTCTTTAAGAAATTTTGAGCAGCTGATATCTTCCTTTCTTTCTGGTCCCAT TGAAAAGTTGAAGTTGGATGTGGGTCTGAAAGTTGAAGATCTTGTAGCAGAACATGTTGATGGGGTTGATTTTGTGCAGT CTGAAGGCATTAATAAGATGCTTCCTGTAACATTGGATTCTGTTCATTTCAGAGGTGCAACGGTGATGCTACTTGCATAT GGTGACAGGGAAGTTAGGGAGATGGAGAATGTAAATGGGCATGTAAAGTTCCAAAATCACTATAGTCGCATACATGTGCA TCTTAGTGGAAATTGTAATACTTGGAGATCGGATATTATATCTGAAGATGGGGGCTGGTTGTCTGCTAATATTTTTGTTG ATACTCTTGAGCAGAATTGGCATGCTAATTTAAAAGTTGACAATCTTTTTGTCCCGCTGTTTGAAAGGATCTTAGAAATT CCAATTACGTGGTCTAAAGGGAGGGCTAGTGGCGAGGTCCACTTGTGCATGTCAAAGGGGGAAACTTTTCCAAATTTTCA TGGACAGCTTGATGTGACAGGGTTGGATTTTCAACTATTGGATGCGCCATCATGTTTTTCTAAAATATCAGTGAGTTTAT GTTTTCGTGGGCAAAGAATATTTTTACACAATGCAAATGGCTGGTTTGGCAGTGTTCCTCTTGAAGCATCAGGAGACTTC GGCATTAATCCTGAAGAAGGAGAGTTTCATCTTATGTGTCAGGTTCCAGCGGTCGAAGTGAATGCTTTGATGAGAACTTT TAAGATGAGACCGCTCTTATTTCCGCTAGCTGGATCAGTAACTGCTCTATTCAATTGTCAAGGCCCGCTTGATGCTCCTG TCTTTGTAGGAACTGGAATGGTTTCTAGGACGTTCTCTTATTTACCAATTGACACCGCTGCATCTGTATCATCTGAAGCA GTTTCTGCAAGTAAGGAGGCTGGTGCGCTGGCAGCATTTGATCGCGTTCCATTTTCTTATGTATCTGCCAATTTCACTTT CAACACTGATAACTGTGTTGCTGATTTATATGGAATTAGGGCGTGTCTTGTAGATGGTGGTGAAATTCGAGGGGCTGGGA ATGCATGGATATGCCCCGAGGGGGAGGAGGATGAGACAGCAATAGACGTGAATTTATCTGGAAGTTTGGCCATCGATAAC ATCTTGCCTCGTTACATTCCAAGTAATTTTCATCAGATGCCACTCAAGTTAGGGGTATTAAATGGAGAAACGAAACTTTC AGGATCTCTTCTAAAACCAAGGTTTGATATAAAGTGGACTGCACCTATAGCAGAAGGATCTTTCAATGATGCTCGAGGAG ATATCATAATCTCACATGATTTTATTACTGTGAATTCTTCCTCAGCTGCATTTGATCTGTATACGAGGATTCAAACATCT TATCCTGGTGATTTCTATCTTAAAAATGAAGAGTTTTATGCACCAAGAGCCATTCCATTTACAATTGATGGAGTTGAGTT GGATTTACGTATGCGTGGGTTTGAATTCTTCAGTTTGGTTTCTGCGTATACTATGGATTCTCCAAAGCCTTTGCATTTGA AAGCAACTGGAAGGATCAAGTTTCAGGGAAAGGTTTTAAAGCCTAGTGGCAGTATCAGTGAACAAAATTTTGAGATGAAT AGGCAGCATGTGCAAATGTTGGAGAAAGGAATCACAGATAGTCTTGATGGAGAGATTTCAATCTCTGGTCTGAAATTGAA CCAATTGATGCTTGCACCCCAGTTGTCTGGGTTGTTGAGAATTTCTCCTGAGCGTATCAAGCTGGATGCTTCGGGTAGGC CTGATGAAAGTCTTGTAGTGGAGTTTGTTGGGCCACTGCAACCCAGTAATGAAGATGGTCTGCAAACTGGAAAACTGTTG TCCATTTCCCTACAGAAAGGGCAATTGAGGGCTAACATTTGTTTTCAACCATTTCATTCTGCTAACTTGGAGGTGCGGCA TTTTCCACTTGATGAATTGGAGCTTGCTTCTCTTCGGGGGACAATACAGAGAGCAGAATTCCAACTTAATCTTCACAAAA GAAGAGGACAAGGTGTCCTATCTGTACTTCGGCCAAAATTCAGTGGTGTGCTTGGTGAAGCCCTAGATGTTGCAGCTAGG TGGAGTGGAGATGTTATCACTATTGAAAAAACTGTGTTGCAACAAAACTACAGTTGCTATGAACTTCAAGGTGAATACAT TTTGCCAGGCACCCGAGATCGTAATCCTGTTGAAAAAGAAGGAGGTGGCCTTATGAAAAGGCTAATGTCTGGGCATATTG GCAGTGCTATTTCCTCAATGGGCAGGTGGAGAATGAAACTTGAAGTTTGTAAAGCCGACGTTGCTGAGATGCTTCCTCTT GCAAGGCTTCTTTCCAGAAGCATGGATCCTGCTGTTCATTCAAGATCTAAGGATTTCTTCGTTCAAAGTTTACACTCAGT GGGATTATATACTGAAAGCCTTCAACAACTGCTTGAGAAAATGAGAGGGCTTCATGCTCCATCAGATGATGTTGTTCTTG AAGATGTAACGCTGCCTGGTTTATCTGAACTGAAAGGTCACTGGCGTGGATCTCTTGATGCTAGCGGTGGAGGAAACGGG GACACCCTGGCAGAATTTGACTTTCATGGGGAGGACTGGGAGTGGGGAGACTACAAAACTCAGCGTGTGGTGGCAGTGGG TGCTTACAGTAATGATGATGGGTTGCACCTGGAGAAGATTTTTATCCAGAAGGATAATGCGACCATCCATGCAGATGGAA CATTGTTAGGACCTAAAACAAACCTCCACTTTGCTGTCTTAAATTTTCCCATCAGTCTGGTCCCCACTGTAGTTCAGGTC ATTGAATCTACCGCAACAGATATTGTTCATTCTCTGCGGCAATTGTTAGCGCCCATTAAGGGTATATTGCATATGGAAGG AGATCTCAGAGGAAGTTTAGCAAAACCAGAATGTGATGTGCAAGTAAGGCTCTTGGATGGTGCCATTGGTGGTATTGATC TTGGGCGAGCAGAAGTTGTTGCTTCTCTAACCTCAACCAGTCGATTTCTATTCAATGCAAAACTTGAACCTATAATCCAA AATGGCCATGTACTCATTCAAGGTAGCATTCCTGTTGCTTTTGTGCAAAATAACACCTTACAAGAAGATGCAGAATTGGA TACGAGTCGAACTACCTGGGTACCTGATTGGGTGAAGGAGAAGAATAGAGGGACTGCTGATGATGCAAGTGATAAAAAAG TTTCTAGAGATAGAAATGAAGAAAGTTGGAATACTCAATTAGCAGAAAGTCTTAAAGGTTTAAATTGGCAAATTTTAGAT GTTGGAGAGGTCAGGATTGATGCTGACATAAAAGATGGGGGAATGACATTGGTAACAGCCTTATCTCCTCATGCCAATTG GCTTCAGGGCAATGCTGATGTCATGCTTGAGGTCAGAGGCACAGTTGATCAACCGGTACTTAATGGACACGCATCTTTCC ACCGGGCATCTATTTCTTCACCAGTGCTCCGAAAGCCACTAACCAACTTTGGGGGAACTGTTCATGTGAAATCAAACAGG TTGTCCATCACATCACTAGAAAGTAGGGTAAGCAGAAAAGGAAAGCTCCTTGTGAAAGGGAACCTACCACTCAGAACTAG TGAAGCAGCCCCTGATGACAAGATTGAATTGAAGTGTGAAGTTTTGGAAGTACGGGCCCAAAAGATATTAAGTGGTCAGG TTGATTCTCAGTTGCAAATAACTGGTTCGATATTGCAACCAAACATATCTGGGAATATCAAACTAAGTCACGGAGAAGCA TATTTGCCACACGATCGAGGTGGTGCTCATGCTTCTAATAGATTCCCATCAAATCAATCAGTGCTTCCTGCTGGTGGCAT TAGTAAAATGTTTGCATCAAGATATGTTTCACGATTTTTCAGCTCAGAATCTGCTTCTTCAAGGGCCACAAATTCTCAAT CCTCTGGCTCTGTTAATAATGCAACTCAGGTTGAAAAGCAGACAGAGGATGTGCAGATTAAACCAGATCTAGAAATCTGC CTTAGTGATTTGAAGCTTGTGCTTGGACCAGAGTTGAAGATAGTTTATCCTTTGATCCTTAATTTTGCTGTGAGTGGAGA GCTTGAGTTGAATGGTCTTGCCCATCCCAAATGGATAAAACCTAGAGGCATACTGGCATTTGAAAATGGTGAAGTTGATT TAGTTGCAACCCAGGTTCGGTTAAAACGAGAGCATTTGAATATTGCAAAATTTGAGCCTGAGTATGGACTAGATCCAATG CTAGATTTGGTTTTGGTTGGATCTGAGTGGCAATTTAGAATTCAAGGTAGAGCTAGCAATTGGCAGGACAAACTTGTAGT GACCTCAACTCGTTCTGTGGAACAGGATGCCCTTTCGCCTACTGAGGCTGCCAGAAGATTTGAGAGTCAGTTGGCTGAAT CCATTTTGGAAGGCAATGGGCAACTTGCATTTGAAAAACTTGCAACTGCAACTCTTGAAAAGTTGATGCCACGAATAGAA GGGAAGGGAGAGATTGGCCACGCAAGGTGGAGAGTCGTGTATGCACCTCAGATTCCTAGTTTGGTTTCTGTTGATCCTAC GGCAGATCCTCTCAAGTCTCTAGCTAGTAATATATCGTTTGGTACAGAAGTTGAAGTCCAGCTTGGGAAACGACTTCAGG CCACAGTCGTGCGGCAAATGAAGGAATCCGAGATGGCAATGCAGTGGACCTTGAGCTATCTTCTTACAAGTCGTTTGCGG GTGCTCTTACAATCTGCTCCATCCAAACGCATTCTTTTTGAATATTCTGCTACATCCCAGGATTGA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0063200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MTSLKNHSTFFGTKLHASFETNRNNPFHFQKRRLQKKGLFCSCSTKRCRLVSQALRFSHFSGQNVEFLRKDQILRSGSRL KCAKEKEPIFTREALVSYLTPLWKEGLLLIRASVYTAVLCGVCMLVWYGQNKVKGYVETNLLPSACEAISEYIQRDLVFG KVRRVSPLSITLESCSFGPHKEEFSCGEVPTVKLRLRPFASLRTGKLVIDAVLSNPSVLVVQKKDYTWLGIPFNEGGRER HYSTEEGIDHRTRTRRLAREEGVGRWERARDDEAREAAEAGFFVSERSCCPSGGEGLKEVESCSAELTDTTPFFCTNGGK HDHRFMDTGVDYDVKHSYLEKSFGVRFPVSGLRFWSRVISGRKRHKFKRKANGSDIYASGVAMKKRIFDRSASAARTYFD DQSNGKFGEPASPSQCFHFMNHDMHVVKSEFDKNANSVTVGDENRSDDNQIAAQIRDMRIWPSLVNENDRAHSGYGKFVS DPTLQTRESELENLQSSEEVAEPANGNSSTEKNEELVPPVEDNHFEDEDFSGGQPGLTSEDFDFVKPKPRLAADFKIPFE PLIEKFGLTSSLRNFEQLISSFLSGPIEKLKLDVGLKVEDLVAEHVDGVDFVQSEGINKMLPVTLDSVHFRGATVMLLAY GDREVREMENVNGHVKFQNHYSRIHVHLSGNCNTWRSDIISEDGGWLSANIFVDTLEQNWHANLKVDNLFVPLFERILEI PITWSKGRASGEVHLCMSKGETFPNFHGQLDVTGLDFQLLDAPSCFSKISVSLCFRGQRIFLHNANGWFGSVPLEASGDF GINPEEGEFHLMCQVPAVEVNALMRTFKMRPLLFPLAGSVTALFNCQGPLDAPVFVGTGMVSRTFSYLPIDTAASVSSEA VSASKEAGALAAFDRVPFSYVSANFTFNTDNCVADLYGIRACLVDGGEIRGAGNAWICPEGEEDETAIDVNLSGSLAIDN ILPRYIPSNFHQMPLKLGVLNGETKLSGSLLKPRFDIKWTAPIAEGSFNDARGDIIISHDFITVNSSSAAFDLYTRIQTS YPGDFYLKNEEFYAPRAIPFTIDGVELDLRMRGFEFFSLVSAYTMDSPKPLHLKATGRIKFQGKVLKPSGSISEQNFEMN RQHVQMLEKGITDSLDGEISISGLKLNQLMLAPQLSGLLRISPERIKLDASGRPDESLVVEFVGPLQPSNEDGLQTGKLL SISLQKGQLRANICFQPFHSANLEVRHFPLDELELASLRGTIQRAEFQLNLHKRRGQGVLSVLRPKFSGVLGEALDVAAR WSGDVITIEKTVLQQNYSCYELQGEYILPGTRDRNPVEKEGGGLMKRLMSGHIGSAISSMGRWRMKLEVCKADVAEMLPL ARLLSRSMDPAVHSRSKDFFVQSLHSVGLYTESLQQLLEKMRGLHAPSDDVVLEDVTLPGLSELKGHWRGSLDASGGGNG DTLAEFDFHGEDWEWGDYKTQRVVAVGAYSNDDGLHLEKIFIQKDNATIHADGTLLGPKTNLHFAVLNFPISLVPTVVQV IESTATDIVHSLRQLLAPIKGILHMEGDLRGSLAKPECDVQVRLLDGAIGGIDLGRAEVVASLTSTSRFLFNAKLEPIIQ NGHVLIQGSIPVAFVQNNTLQEDAELDTSRTTWVPDWVKEKNRGTADDASDKKVSRDRNEESWNTQLAESLKGLNWQILD VGEVRIDADIKDGGMTLVTALSPHANWLQGNADVMLEVRGTVDQPVLNGHASFHRASISSPVLRKPLTNFGGTVHVKSNR LSITSLESRVSRKGKLLVKGNLPLRTSEAAPDDKIELKCEVLEVRAQKILSGQVDSQLQITGSILQPNISGNIKLSHGEA YLPHDRGGAHASNRFPSNQSVLPAGGISKMFASRYVSRFFSSESASSRATNSQSSGSVNNATQVEKQTEDVQIKPDLEIC LSDLKLVLGPELKIVYPLILNFAVSGELELNGLAHPKWIKPRGILAFENGEVDLVATQVRLKREHLNIAKFEPEYGLDPM LDLVLVGSEWQFRIQGRASNWQDKLVVTSTRSVEQDALSPTEAARRFESQLAESILEGNGQLAFEKLATATLEKLMPRIE GKGEIGHARWRVVYAPQIPSLVSVDPTADPLKSLASNISFGTEVEVQLGKRLQATVVRQMKESEMAMQWTLSYLLTSRLR VLLQSAPSKRILFEYSATSQD
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 107 | 107 | - | – | |
| PANTHER | 8 | 2181 | 2174 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 8 | 2181 | 2174 | 0.0 | – | |
| TMHMM | 107 | 129 | 23 | - | – | |
| Phobius | 108 | 128 | 21 | - | – | |
| Phobius | 129 | 2181 | 2053 | - | – | |
| MobiDBLite | 475 | 541 | 67 | - | – | |
| MobiDBLite | 479 | 514 | 36 | - | – | |
| MobiDBLite | 515 | 529 | 15 | - | – | |
| MobiDBLite | 1642 | 1662 | 21 | - | – | |
| Pfam | 1766 | 2165 | 400 | 4.7E-15 | ||
| MobiDBLite | 1887 | 1907 | 21 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Cellular component | Integral component of plasma membrane | The component of the plasma membrane consisting of the gene products and protein complexes having at least some part of their peptide sequence embedded in the hydrophobic region of the membrane. | ||
| Biological process | Protein secretion | The controlled release of proteins from a cell. |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0063200.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…