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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi5g1v0256900 |
Transcript ID | LotjaGi5g1v0256900.1 |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, putative; TAIR: AT3G11910.1 ubiquitin-specific protease 13; Swiss-Prot: sp|Q84WU2|UBP13_ARATH Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13; TrEMBL-Plants: tr|A0A067JU88|A0A067JU88_JATCU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0256900 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:56560174..56582996) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GGATACCATAACCTGATAAACTTTTTCTAGTGTTCCCAGAGTATCCTTCATCGTACTAGTAGTAGTAGAGTAGTAGTCAA AATGAGAATCATGACTTCATCTAACAACAAGTCCCTCTTTTAAACGCGGCACTCACTCAATCATCATCGTCGTTTGCTTA TTCACTCATTTCACTCACACACCCTTCTCCGCTCTCTCTCTCTCTCTCACTCTCTGCGTTCTCCGTCGTAACTGCCTCTA CTCGCGGCGGCTTCGTCAATCGTAACCGTCGTCGGAGCAATGTCTTCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGTTAGATGTGATCAC CAACACACTCACTCTCTCTACTGTCTACTGTCTTCTCTTCTGCTGCTTCGCTTTCTCAGTTTTTGTTTGATTTTTTGTTT CGTTGCTTCTTTCAATTCAACCGAAATCGCCGATACGATTTGCTTCTGAATTGATCTCAATTGTTTTTGTTTTTTGCCAT TTCTGATTGGAGTCAGTTGCTAGGGTTTTTGATCGTGAGATAGAGATGGATCGATTTGGTTGTTTCTGATTTTTGTTGTT GTGTGATGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGGAGGAGGAGGAGGAGCAGCAGCCGCTGGACGAGGAGATGGAGGTTCCT CCCTCTGATGTTCCTGAAGGTCCTCAGCCTATGGATGGTATAAATGTTTATGTAAATGCTGTTTGATTTTCTGAATTTCT TTCTTTGTTGAATGATGATGGCGTGATGCATGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGATGATGATGATG GTGTGCTCAGTGGATGAGGCATGAGTGTGAAACTGTGAATGTAGAATGGTGAGGATGAGAAGACTAAAACCTGTGTTTCA ATTACATTTATTTTATTTTATTTCATGTGTAATTGATGATGCATGCAGTTTCTTTAATATATATATAGAGAGAGAGAGAT 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TATATGTTAGATTACAGTTCTTGAATCTACATATGCCTTCATAGGTTTTTCTTATCATCAGATTGGATACATGTGCTTAT CTCCAGTCTTTCATGAGTATATAGAAGTTGATTTATCATTGTCTGAGAGAGGAGATTCTTTATGGCATTATCAAAACTTC TGTTATCTCCAAGTTTCACTTAACCCTTAAGGGGTCTGAGGATGCGTATGATCACAAATATGTTCCAAGCCGGATGTATA TGATCTATGTCCTCCAGCTTTAGGGGGAGTGTTGAGATATACAGACAATTCCTGTTATGATAGATTACTGCTATGATAGA TTAAGAGAAGATACATCGCTCAGTTATGATAAATTAGGATAAGATAGGATATATTGTTATGTCGTGGTAGATTAGGATAA GATAATATATATTGTTATGTCGTGGTAGATTAGGACAAGATAAAATTTTATTATTTTGACTTTGTAGTTGACTAGGAAAC CTAGTATATAAATATTGAACTTCTGAATCAAATAATTATCAATCAACTATTCAAAATATTTCAGTTTCAAAAACTATGAT CTGCCTTCTTTTTATTCTTGTGTTATGACAGTCTTTGTGAAGTTTTAAATTGGGCAGTTTCAATAATAATTTTATGTTTG GCCTTCTGCAGATTTTCTCTCTCGGTGAAAAGATTGAAAATATTAATGATCAATATTGGACGTTAAGAGCAGAGGAGGTA ACGATTTATTGAGCATTGCCATATGAATTGCTTATAAACTTGCTTAGTCGTTGTCATGAATTCTTTATAAGTAGTGTAGA AATACAAGCTTCACCAGACAGTTTTATTTTAGACATCAGAGACATCGCTTAAGTCTCTGACATCCTTCATCTGTATGCTA TAATGGGTTGATATAATTTTATTTCCTGCTTTTGAAGATTCCTCAAGAGGAGAAAAATCTTGGCCCTGAAGATCGATTGA TTCATGTTTATCATTTCATGAAAGACACTGCACACGATCAGGTGGTAACATCAAATTTCATTGCTATAAACATATGTTGG GTTTCAAGTAATTGAATCATACTACTATCTCCAATATAATCATATTACTATCTCCAATATAATCATATTAATATTTCTAA TACGATTATAATATTTTTTGACGATTGCATTTTTTTATTCTCCCTTTTGTTCGGAATAAGCAGCAAATTCAGAATTTCGG AGATCCTTTTTTCATGGTTATCCATGAGGGTGAGACATTGGCTGATGTCAAATTGCGAATACAGAAAAAGTTGAACGTTC CAGATGAAGAGTTTTCAAAGGTATATACAAGCAAATTAATTCAATCATCTGCACTATTCAGGCATTTTCACGCATGGTTA ACTTTTTGTGCACCAACATATTGCTAATGAGCTTCAAAAAAGAAATTTATTGGATTTTCAGCTTCCATTTGTAAATTTTC TTCATATATTATTTCCGTCTATGCTTCAATCACTTTTTGTTAGAATTTGAGATACATGGAAATGAGATAGAATGAGAAAA TGTTTTACAGGATTTTCTAAGAAAATTGATATAACTGTACCACTTTGTTCATCTACTCAAAAAAATTCCTTTTCTATTTC TTTTTGGATACCATATTAAAATTTGAGTTAAATCTAACTCAACCCAAATCCCAAAAGCTGGCTCCAGGTTGTGAGAATTG CCTAAGCCATATAAGAACTATTTTAGTCAATATCTCTAGTCTATTAGGGATCTGAACACACCTCAAACCAAGCATGTGGA GCATAAAGTTTGCATGGCTATACATCTGTGCATAGCCCAATACCAAATCCAGGATAGGATTGGATTCCATGTCATTTACC AACTATCCAAAAGCTAATGTTAGTGAGTAAAGACACTTTATATTATATTTCTACAAGAGGGTTTTGTGAAAAACAAAATT GATATTAGTGTGGAGAGTGAATATAATTTGATGTAAACTACAAAGACTATTCTTAATGAGCTTTAAGTACATTGTACAAT GGGTTTCACCATGGGATCACCACACACACGACAAGCTTTTGGTGCGAACTACATTAGAGCCACTTAAGTCTTAACAAAGA GTTGCACACTAAAACTATTGATATAATTTTCCATGTGTTGGTTTTTCCAGTGGAAGTTTGCATTTATTTCTCTTGGTCAT CCTGAGTACCTACAAGATTCAGATATTGTTTCCGCCCAATTTCAGGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTGTGTATGT GTGACTTTTCATTTTGGGTTTGATTTCATTTAGGTTTAGTTTGATTTTTACACGCTTAAGTTATTAAAATTTTACACTGT TTGAATGTTTAGAGAAGAGATATATATGGTGCTTGGGAGCAATATCTTGGACTGGAACACACTGACAATGCTCCAAAAAG GTCCTACATAGTCAACCAGGTAAATGATTTTCAGGAAACTATTGCTCCTTTCTTTGTCTTGGATGACCTGTCTCAAGATT GAAATGTAGTTGTCACTAACATTGAAAATTCAGCATAGACTAAATTGATATATAGATTAAGATGAAAGCTCAGTATTACT TTCTTTACATGGTTCTTTTCTGTTGTTTCTAAGAAAACTTGGCAACCTATAGAATTAATGATCAGCTTGATTTCGAAAAC TAATTTCAACCATAATTCTGAATGTGATTAATGCAGCATGTTGTGAACTTTTTATCCAGTGCTCTAGGTTGAAGTTCTAC AAACTATTTTTCTTTGGGTATAGGTCCAAATTGCATTTGAGGGATCATATAACTCAGACAATCATTTATAAGGAATTCTG ATTGGCATACATGCGTGCGTGCGCATGTGACTAGTGATAACTTTCAAAAACTAAATAACCATAAATCTACCATGTGAACA ATTTTCTCGCTTGTTGAAGACTTTTTTGTGCATTGCATACATACATTCAAGTTGAATAATTGTTAAATGTTTCTGTTATA ATATATGCTATTAAAATGCCTATTGAACTATTGGAAACTTCTATCAGGACATCAGGTTACATTGAGATCAGCTCTTAGTG GGGAAATTTAGATGATGGTGATGATGTTTACAATGTGATGCATAAATAGAAAAAGGTGTAGCGGAAATGATAGTGTTTTG GTGGGTGAGCATATAGTACAATTAAAAAGAGACTTGGAAGTTGGAACAGTTGTATCTGAGACAAAAGTTAGGAGCACCTA TTGACAAGACGAGATGACAGAAGCTCGTTTAAGGTGTTATGTTAGAATAACATGAGAGGCTTAGGTGAAGAGGTGAATAA AAAGTCAGATAGTTCGATTAAATTGGGTAAAGGATGACATTAAATCTGGCCTTGTAGTGTACGAATTGATTTTTCTGACA ATTTGGGTTTTGATAGAGCTGAGTGGCATCAATTAATCTATTTAGCCAACTCAGTACATAATAAGAAAAAGCTTGTTGTG GCTAGTGGAAAATTTTCATTATTGCTGTATCTTCAGGTCTTGTGCTAAAGATGACTGCTATGTAATGAGGAAGAAAGAAG ACTTAGAATAAGTCATGTTCTGGATTAGTTGAACAATAAAAGCTAATCTGAACCCATACAGACATGAATTATGCTGTATT ATGCTCTCATGTCCTATAATTTCGTAGTATAATTTTGCTCTTTTTTTCAACTACTGTACCCTACCTCCCTCACTGGAATC ATAGAGATCAATTTTATTTAACACTCCAAACTAAAGTTGTTTTCAGCTTGATAAAATTATTGGAATGGTGCTTTACTATA TGCACATGAGATTTGATAATGTCTACCAAATGCAATAATTGCTAGAATGCAAGTCACTGTAAATAATTTCATTTGCAGAT TTCAGAAGCCTACAATGACCATTTTGCAATTTTGCAGAACCGGCATGCATTTGATAAGCCAGTAAAAATCTACAACTAGA TGAGGTCTATATCATGCCTTATGCCAGTGGCAGCTGCAGCTTTCTGAAGGTGGCAAGCTGGCATTAGAAATGTAGAGTTG CTGTCAATCACCTCATGCGAATTCATCTGTTAATCTTTTTGACTTCATACCTCTGGGAATAGGTATAGAGCCTTGAACAG TGCTTCCTGATGGTTAAAACTCTCTCTCTCAAGCACTCATCTCTATGGCTGTTTGGAGATTGATTTTTATTTCCTTTACA TAAGATTTTGGGTTGAATTTTGTGTATAGAAGCTATAGGTATACCGTATACATAGCCGATGTCTATGTCTGGTCCTTCCA TTCTGGGCTTTTCGTTGGCTTTCCTTGGAGATATAGGAAGATCAGGATTGTGCATATGTTTTTGAAGGGCCCTCATTGTA ATTTGGTTTGTATGCCTTTGTCTGACTTTAAATTTTTCTTAAAGGCACATAGATTTGCATTGAAGAAACAGAAATTTTCC CTTCAATTTGTTTATCATCTTTGATAGCTGTTTCTCTATTTTATTCTACATTTGCCAAAAGGGCCCCTGTTCAAACTGAT CTGCACCAGTTCCTTCTATTGTCGTCCTTATTTCTTGAATGGTGTCATGATTCAGGGTGATCAACTTCACAAACGAGGGC CAGCTATGCTTACAAATTTGGATGTAGGTTCCCCGAAAATATAACTGATCACAATATTGCCGACAATTTCATCCAGATTT GAAGATGTATTCCTTCTATCTATAGGGACACATATCTCATAGTATCGATTCCTTGTTTGTTGTGTCAATTTTGATGTTGG TCGTGCATGTCTAGTCACAACGTAGTCTTGTGACTTCTTCAAATAGTCATGTGAACTTCAAAAAATGTGTGATTCCAAGT TTAAGACTTGTTCTGGGCATTTGCCGCCGTTTAATCTCTTTCCTTGATCTGAATGATCATATAAATTGATTGATGGGTCA GAGTTTACTAGAATTTTAGTTATAGGTGTTGTCTTTAAAGATTTGGACACCCGCTCTCATTGCATGTCATTGGAGCTCCA CCTTCGACCTACCATTTTCTCTTTTTGTTCCCTTTCGTACAAGCCCCCACCTCTCCCCTTTCAAGAAGTCTCCTCCCTGA GGGTTCCTTTCCGTGGGTCATTGTAAATTTCTCCCCTCTATGATAAACTTTGTTGTTATCATCTTCCCTTGCTTTAAATG TCATAGAATTTTCTTTACTGTAGTAAATAATATTAAAAATATTATTTAACTATTACGGGTTTGGCTACAGTTCAACCATC AAATTTTGATGTTGTGTCTTGATTGGTTCAGTGGTCGATTAGGTTTTCAGAACATTGCTTGCTTCTCGTCGATTGCTTGC TTTCCTTCAATCCTGATGCTTTGTCAATGGATGGCAACAAAGATTGATTGGAGATCGTGTCATAGTAAAGGGGTTTCGTA GGAGATCGGAGAGTAAGGGGTTCACGAACAAGCTTTTCTAATGGAGAGGGTTCATTTAGAAATCACAATAGATGGATTAC TGTGATTGATGTGGTGTTAGAAATAATTAGCAATATTTGTTTGCAATTGTCAACTTGATTAAAATTATCATTATTTAATA TGGATCTATAAATTTAATAAAAG
CDS sequence (LotjaGi5g1v0256900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTCTTCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGTTAGATCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGGAGGAGGAGGAGGAGCAGCAGCCGCT GGACGAGGAGATGGAGGTTCCTCCCTCTGATGTTCCTGAAGGTCCTCAGCCTATGGATGCCCAACCAGAAACCACAAATT TGTTTGGTGCTCCGATAGTGGACGAGTCACCATCTGGGCGGTTCACATGGACCATCAGGAATTTTTCAAGGTCTACAAAA AAACTATATTCTGAAGATTTCTATGTTGGGGGCTACAGATGGCGGATACTTATATTTCCAAAGGGGAACAATGTTGATCA GTTGTCATTGTATCTAGATGCTACTGATTCAGCAACTTTGCCTTATGGATGGAGTAGATATGCACAGTTTAGCTTGACTG TTGTCAATCAAATTCGCCATAATTTCTCAATCAGAAAAGAAACACATCACCAATTCAATGCTCGTGAGGGTGATTGGGGT TTCACAAGTTTCATGCCTCTTGCTGAATTGTATGATCCCGGTAGAGGTTATATTGTGAATGATACATGCATAGTTGAGGC TGATGTTGCTGTACGCAAGGTTATTGATTACTGGTCACATGACTCTAAAAAGGAAACTGGTTATGTCGGACTAAAAAACC AAGGGGCGACATGTTACATGAATTCTCTCCTTCAGACATTGTATCACATTCCTTATTTTAGAAAGGCTGTGTACCATATG CCTACAACTGAGAATGATTTGCCATCGGGAAGCATTCCTTTGGCATTGCAAAGTTTATTCTACAAGCTGCAGTATTATGA CAGTAGCGTAGCAACGAAAGAGTTAACAAAATCTTTTGGATGGGACACACAGGATTCATTCCTGCAGCATGACGTCCAAG AGCTTAATAGAGTTCTTTGTGAAAAGCTAGAAGACAAAATGAAGGGAACTGTTGTGGAAGGCACCATACAGAAGTTGTTT GAAGGCCACCATATGAACTATATTGAATGCATCAATGTGGACTATAAATCAACCAGAAAAGAATCATTTTATGATCTTCA GCTTGACGTCAAAGGATGTCGGGATGTGTATGATTCTTTTGACAAGTATGTTGAAGTGGAAAGACTTGAGGGTGATAACA AGTATCATGCTGAGCAGTACGGTTTGCAGGAGGCTAAGAAGGGTGTCTTGTTCATTGATTTCCCTCCTGTTCTTCAGCTT CAGTTAAAACGATTTGAATATGATTTCATGCGAGACACTATGGTAAAGATCAATGATCGCTATGAGTTCCCGTTAGAGCT AGATCTTGATAGGGGCAATGGCAAGTATCTATCTCCTGAAGCAGATAAAAGCATTCGCAACCTTTATGTACTTCACAGTG TTTTAGTTCACAGCGGTGGGGTTCATGGTGGACACTATTTTGCTTATATCAGGCCAACTCTATCAAATGAATGGTTTAAA TTTGACGACGCACGAGTGACGAAAGAAGATGCAGATAGGGCCTTAGAAGAGCAGTATGGTGGTGAAGAAGAGTTACCTCA TGCCAATCCCGGGTTCAACAACTCTCCCTTCAAATTTACAAAGTACTCAAATGCATATATGCTTGTTTATATACGTGCCA GTGACAAGGATAAGATAATTTGTAGTGTGAATGAGAAGGACATTGCCGAACACCTTAAAGCAAGATTGAAGAAAGAACAA GAAGAAAAAGAGCTGAAGAAGAAGGAGAAGGCAGAGGCTCACTTATATACCATCATAAAGGTTGCACGCGACGAAGATCT GTTTGAACAGATTGGAAAGGATATATTCTTTGATCTAGTGGATCATAACAAAGTGCGAAGTTTTCGTATCCAAAAACAAA TGCCATTCTTGTGTTTTAAGGAAGAAGTTGCTAGAGAGTTCGGTATACCTGTCCAATATCAACGTTTTTGGGTGTGGGCA AAGCGCCAAAACCACACTTTCCGGCCAAATAGACCTCTGACACAGCTGGAAGAAGAACGACCAGTGGGACATTTACGGGA AGGTATAACTAAGGCAAATATTGCAGATCTGAAGTTATTTTTGGAAGTGAAAGTAGGGCAGGATCTACAGCCTATTCCCC CTCTCGAGAGGACAAAAGAAGATTTGTTACTGTTCTTTAAGCTTTATGACCCTTTGAATGAAACACTGCGGTACGTTGGG AGCTTTTATGTGAAAGCTAATGAGAAGCCTTTGGATATATTGACAAGATTAAATCAAATGGCTGACTTTGCTATTGATGA AGAAATTGACCTATTTGAGGAAATCAAATTTGAACCCCATGTCATGTGCGAACCTGTTGACAAGGGGTCCACATTCCGAT TCAATCAGCTTGAGGATGGTGATATTATTTGCTACCAGAAGCCATCCAAAGTTGTAAGTGGTGAGCAATTTCGGTATCCT GATATTCCTTCCTTCTTGGAATATGTGCATAACCGTCAGGTTGTACGCTTCAGGTACTTGGAGAAACCAAAAGAGGACCA TTTCAGTCTCGAGTTGTCAAGGATCAACACATATGATTATGTTGTTACAAGAGTTGCTCAACATCTTGGTTTGAATGATC CTTCTAAAATCAGACTCACATCTCATAACTGTTACTCCCAGCTACCTAAACCCCAGCCTATCAAGTACCGAGGAGTTGAA CATTTATCTGACATGCTGGTTCACTACAATCAGACTTCTGATATACTATACTATGAAGTACTGGATATCCCTCTCCCAGA ATTGCAATGCCTAAAAACACTTAAAATTGCTTTCCATCATGCTGCCAAGGATGAAGTGGCGATTTATACTACTAGATTAC CGAGACAGAGTATTGTGGAAGATGTAATCAATGATCTTAAATCGAAGGTGCATTTATCTCATCCTGATGCAGATCTAAGA TTGCTTGAGGTTTTCTATCACAAGATCTATAAGATTTTCTCTCTCGGTGAAAAGATTGAAAATATTAATGATCAATATTG GACGTTAAGAGCAGAGGAGATTCCTCAAGAGGAGAAAAATCTTGGCCCTGAAGATCGATTGATTCATGTTTATCATTTCA TGAAAGACACTGCACACGATCAGCAAATTCAGAATTTCGGAGATCCTTTTTTCATGGTTATCCATGAGGGTGAGACATTG GCTGATGTCAAATTGCGAATACAGAAAAAGTTGAACGTTCCAGATGAAGAGTTTTCAAAGTGGAAGTTTGCATTTATTTC TCTTGGTCATCCTGAGTACCTACAAGATTCAGATATTGTTTCCGCCCAATTTCAGAGAAGAGATATATATGGTGCTTGGG AGCAATATCTTGGACTGGAACACACTGACAATGCTCCAAAAAGGTCCTACATAGTCAACCAGAACCGGCATGCATTTGAT AAGCCAGTAAAAATCTACAACTAG
Protein sequence (LotjaGi5g1v0256900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSSPPPPPPLDQQQQQQQEEEEEQQPLDEEMEVPPSDVPEGPQPMDAQPETTNLFGAPIVDESPSGRFTWTIRNFSRSTK KLYSEDFYVGGYRWRILIFPKGNNVDQLSLYLDATDSATLPYGWSRYAQFSLTVVNQIRHNFSIRKETHHQFNAREGDWG FTSFMPLAELYDPGRGYIVNDTCIVEADVAVRKVIDYWSHDSKKETGYVGLKNQGATCYMNSLLQTLYHIPYFRKAVYHM PTTENDLPSGSIPLALQSLFYKLQYYDSSVATKELTKSFGWDTQDSFLQHDVQELNRVLCEKLEDKMKGTVVEGTIQKLF EGHHMNYIECINVDYKSTRKESFYDLQLDVKGCRDVYDSFDKYVEVERLEGDNKYHAEQYGLQEAKKGVLFIDFPPVLQL QLKRFEYDFMRDTMVKINDRYEFPLELDLDRGNGKYLSPEADKSIRNLYVLHSVLVHSGGVHGGHYFAYIRPTLSNEWFK FDDARVTKEDADRALEEQYGGEEELPHANPGFNNSPFKFTKYSNAYMLVYIRASDKDKIICSVNEKDIAEHLKARLKKEQ EEKELKKKEKAEAHLYTIIKVARDEDLFEQIGKDIFFDLVDHNKVRSFRIQKQMPFLCFKEEVAREFGIPVQYQRFWVWA KRQNHTFRPNRPLTQLEEERPVGHLREGITKANIADLKLFLEVKVGQDLQPIPPLERTKEDLLLFFKLYDPLNETLRYVG SFYVKANEKPLDILTRLNQMADFAIDEEIDLFEEIKFEPHVMCEPVDKGSTFRFNQLEDGDIICYQKPSKVVSGEQFRYP DIPSFLEYVHNRQVVRFRYLEKPKEDHFSLELSRINTYDYVVTRVAQHLGLNDPSKIRLTSHNCYSQLPKPQPIKYRGVE HLSDMLVHYNQTSDILYYEVLDIPLPELQCLKTLKIAFHHAAKDEVAIYTTRLPRQSIVEDVINDLKSKVHLSHPDADLR LLEVFYHKIYKIFSLGEKIENINDQYWTLRAEEIPQEEKNLGPEDRLIHVYHFMKDTAHDQQIQNFGDPFFMVIHEGETL ADVKLRIQKKLNVPDEEFSKWKFAFISLGHPEYLQDSDIVSAQFQRRDIYGAWEQYLGLEHTDNAPKRSYIVNQNRHAFD KPVKIYN
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
MobiDBLite | 1 | 52 | 52 | - | – | |
Coils | 10 | 30 | 21 | - | – | |
MobiDBLite | 16 | 35 | 20 | - | – | |
PANTHER | 21 | 1033 | 1013 | 0.0 | – | |
PANTHER | 21 | 1033 | 1013 | 0.0 | – | |
Gene3D | 62 | 205 | 144 | 4.3E-49 | ||
SUPERFAMILY | 64 | 198 | 135 | 5.89E-39 | ||
ProSiteProfiles | 65 | 189 | 125 | 36.628 | ||
CDD | 66 | 189 | 124 | 9.93483E-37 | ||
SMART | 67 | 170 | 104 | 4.6E-21 | ||
Pfam | 72 | 190 | 119 | 8.3E-17 | ||
SUPERFAMILY | 204 | 559 | 356 | 2.94E-96 | ||
Gene3D | 206 | 535 | 330 | 1.3E-87 | – | |
CDD | 207 | 535 | 329 | 1.88321E-165 | – | |
Pfam | 209 | 530 | 322 | 2.2E-45 | ||
ProSiteProfiles | 209 | 533 | 325 | 40.389 | ||
ProSitePatterns | 210 | 225 | 16 | - | ||
ProSitePatterns | 449 | 466 | 18 | - | ||
Coils | 542 | 573 | 32 | - | – | |
Gene3D | 549 | 682 | 134 | 5.8E-37 | – | |
Pfam | 634 | 886 | 253 | 1.7E-70 | ||
Gene3D | 694 | 812 | 119 | 1.2E-30 | – | |
Gene3D | 813 | 909 | 97 | 1.9E-8 | – | |
Pfam | 896 | 1105 | 210 | 3.9E-55 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
---|---|---|---|---|
Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). | ||
Biological process | Ubiquitin-dependent protein catabolic process | The chemical reactions and pathways resulting in the breakdown of a protein or peptide by hydrolysis of its peptide bonds, initiated by the covalent attachment of a ubiquitin group, or multiple ubiquitin groups, to the protein. | ||
Biological process | Protein deubiquitination | The removal of one or more ubiquitin groups from a protein. | ||
Molecular function | Thiol-dependent ubiquitinyl hydrolase activity | Catalysis of the thiol-dependent hydrolysis of an ester, thioester, amide, peptide or isopeptide bond formed by the C-terminal glycine of ubiquitin. |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0256900.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…