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LotjaGi5g1v0259600.8

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi5g1v0259600
Transcript ID LotjaGi5g1v0259600.8
Related isoforms 8
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description piezo-type mechanosensitive ion channel component; TAIR: AT2G48060.2 piezo-type mechanosensitive ion channel component; Swiss-Prot: sp|F4IN58|PIEZO_ARATH Piezo-type mechanosensitive ion channel homolog; TrEMBL-Plants: tr|A0A072VYZ6|A0A072VYZ6_MEDTR DUF3595 family protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0259600
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr5:56799638..56819365) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

GTGGAACAGCCAAGTGTGATTCATCGGATGGCTGATTTAATTGGTCTTTACAAAATATCCTCAAATTCTCAGTGGCCCGA AATTTGTTCTTGCCTTTCTCTCGTATTTTACTATATAATGGTATGTATCTGTTTTATAAAATTTTGTTTCATATTGAATA TGATTGGAAGAGACTTGTTAAGAACATTATGGGCTTGCTGTTTTTAATATTTAGGTGGTATATTTGATTCTTATACAGCA TAGCTACTCTCCACTTTTGTAATTGTGTATCACTGTAATTGTATTCATGTCATTGTAAGTCTATAGATTAGAGAAAATGG GTATGCTGGTGTGCCATGTGGCACATACTAGCTGTAGTCAGTTAAAAGTTAATAGCTTTTGTTAAGTGTTAGTTATCCTA GCTCAGCTCGCTATGCAAGCCTCTCACATTAAAATTAATTGTATCCATACTATAGTAACACAGAATGGGATCTTTCTTCC ACTTAGAACAAACTCTCTTATTCTTTGTTTTCTCTCAGCCATGAACTTCTTCATGATATGTAGAGCTTAAAGCCCCGTAG TGGCTTCTAAGAGTCTTAAGGGAGGCAACACCCGAAAAAGATTGATCAAATTGCTTTGCAGCCTCCACCGTTGCATCCAA TGTCATCTCCAATGCCTTTCTCTCCTTCGCCGTCGTCTGTTCCGACCTCTAACGTGACAACCCATGCTATCACAAGCAGA TGTTCACATAGTGTTTGAGAAACTCAACGCCTCCAATTTTGGGCTCCTTTCTACATAAAAAAGGGAGCACTTGCCCTCCT TTCTTTTTGGGCTCTTTGATGCCTCCAATTTTCTTCTCTGGAAGTAATAAATGAAGCCTATGTGGTCAATGACTTAACCA GATTCTTGTGAATCCGAGTATTCCGCTCTTCGAGGAAGATTGCAATGTCGGCAGAGTTAGTGATGGCTAAGTAGCTTGTT 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CTTTTACAATTTGTGCTGTTTTTTCTGCTTCTAGGGTATGTTTAGTTTGGAAACTCACACCTGCATCTTTTTTCCCCATT TTGATAGCTTGAGGACATAAATGCAAGTTTGTACCTTGTCAAATGTGATTCAGTCTTGAATAGAGCTACACACAAACCAG GAGAGAAGCAAACAAAATGCACCAAATGCTTCAATGGAATATTGCTGTTCTTTGTATTAATTTGTGTTATATGGGCTCCA ATGCTGGTAAGAAAATTATAAAAGCGTTGATTTCATAACTTACTAATAGCAGCAAGTTCTCTTTTTTCTTTTTTCATTTT GACACTTTTGCTTTATCAGTATGTTAGCATATGAACCTTGGTAACTGAATGGAATTTCAGTATGCATAGTTGTTGGCTTT AGAGCTTAAGTTAAAGTGTTACTTATCGGCTTGTACATAGCTGGTCTATTAGTTCTGTTGGTTTTCTGTTAACAGTCAAC AGATTCCGTCAGTGACTGTAACATTTACCCACTATCACTAGTGTATAAATACTCATGTATCTCTTCGGTACACAAGTTAA TAGAATCATATTTACACAAACATTTCCCCACTATCTGTTGGATTTGATAATTTGATGTAAAATAAAAAAGGTTGCCAGTT AATTTTTATAATATCTTTAGTAGACTCATATGTCCTCAATTACTTGCTAACATGCCTATTTTAAGGTACCTACAAAACCA TCAAGTTTGGTAAAAGCATAATAATAATTTTAATAGAAAATGTTTATAAGTGGTTTTATTAATTTTAGTTAAGTGTTTTT TCTTTTCAAATATAATTTGATAACAAGGCTTACTTCTCAATAACTCCTTCTGAGAATGTTGATGTTGGGCATTGTTCCTG GTTATGTTGGCCATTGCAACAGATAAACTTATAAAGTATGTATTTTCTAATTTTTTCCTTACAGATGTACAGCAGCGGTA ACCCCACAAATATTGCAAACCCAATTAAAGATGCTAGCTTTCATGTTGATATCAAGACAGAGGGTGGAAGGTTGAATTTG TATGAAACTACTCTATGTGAAAGAATCCGGTGGGACTCACTAAATTCTGATGTAAATCCTGACCCCTATGGCTATTTGGA TGCATATAACAAGAATGATATCCAGTTAATATGCTGTCAAGCTGATGCTAGTACATTGTGGCTTGTTCCGCATGTTGTTC GGACCAGATTGATTCAGTCCCTTGAATGGTATACTGACATGGAAATTTTTTTCACTTGGATGCTTTCAAGGGACAGACCA AAAGGAAAAGAAGCTGTGAAATATGAAAAGGCTGTTGATCCTCAATATCTTCCAGCAAAGTCTGATGTTCAAAAGGTTCT TAATGGATCTATGAACAGCTTTAGGATTTATAATGTTTATCCAAGATATTTCCGTGTCACTGGTTCAGGTGATGTTAGAC CATTGGACGAGGTAATCATATTCCGAATACTTAACTCTCTTTATTAACTTTTCTTGTTTCTTCGTTCTAATATTTGTTGC TTGTGATTCTATATATATGGGAAAATAATTGCATACTGGCATTCCACCAGTAGAAGCTAATCGTCTTTGCTATCAACTGT TGTAATCTTTCCAATAACACAGCAATCTTTCCTTCAATCTTATTGGGTGATTGGATTTAAATTAGAAATTACTAAAATTT TGTAATCAAAGTGATAGTCACGAAGAAAGAGAGGTTGTGCTCACTTCTCAAGTTATTGTAATAAAATTATATTTGCTTTG CGTAATAATGCTTCTAAATTACAATTAGAAAATTCAAAATTTTATTTTTCAGGACCGTGATGTTAGTGCTGATCTCATTA TAAATCATGATCAATTTGACTGGTGGTCCTTCAAAGATATTAATCCATCAAATCTAAGTGGGTTTTGTGGAGGTTTGACG GGACCTATGGCTATCATTGTATCCGAGGAAACACCACCACGTAAGTTGGCTGTGGATTTTTTCTTCTTGAAACTCTTCCC CTAGTACTATTATTGCCTGGACCTTGTACAACGCTTCTAAACTTTTAATACTGTTTCAGAGGGTATTCTTGGTGACACAC TGAGCAAGTTCAGCATATGGGGGCTTTACATAACCTTTGTTCTAGCGGTTGGACGCTTTATCAGACTCCAGTGCTCTGAC TTAAGGATGAGAATTCCCTATGAGAACCTACCTTCCTGTGACAGGTACTACAGAATCCTTTCACTGAACTCGAGTCATTC TCCCATGTGATTGTTCTTTAAGATACATCCTGCAGTAACTTATGTTACTTCTTGCTGCATTTTCTCGTGTAGGTTGATAG CAATCTGCGAGGATATATATGCTGCAAGGGCTGAGGGTGAGCTTGGAGTTGAAGAGGTCCTTTATTGGACACTAGTGAAG ATATATCGGTCCCCGCACATGCTGCTTGAGTACACCAACCCTGATTAA 

CDS sequence (LotjaGi5g1v0259600.8) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGCTGATTTAATTGGTCTTTACAAAATATCCTCAAATTCTCAGTGGCCCGAAATTTGTTCTTGCCTTTCTCTCGTATT TTACTATATAATGCTCTCTTTCACTAAATCTGATTTGGAGGAGATGAATTTTATTATTTCCAGGACAGATTGTAGCTTGA CGGAGCAACTTCTACCCTCTAGGCATTCATTTTTCATCCGTGAATCAAGGTCTGGTGTGAGGCACACAAATGTTTTACTC AGAGGAGCTGTTTTTCAGACTTTCAGTATCAACTTTTTCACGTATGGTTTCCCGGTTTCCTTGTTTGCACTTTCCTTTTG GAGCTTTCATTTTGCGAGTTTATGTGCATTTGGGTTACTTGCTTTTGTTGGCTACATTATCTATGCCTTCCCTTCCTTAT TTCGTCTGCACCGATTGAATGGGCTACTTCTCGTCTTCATCCTCTTGTGGGCTGTTAGCACCTATATATTTAATGTGGCA TTTACATTTCTGAATTGGAAACTTGGACGGGACATGAAAATCTGGGAGATGGTCGGTCTGTGGCACTATCCAATACCTGG GTTTTTTCTTCTGGCACAATTTTGTCTTGGAATTTTGGTTGCATTGGGTAATCTTGTGAACAATTCTGTTTTCCTCTACT TGTCTGATGAAGGTGGGCAATCTTCAAATGACAATGTATCAGTAAAAGCTGAGGGTGAGACTAAGGCATTGATCGTGGCA ACAATAGCCTGGGGATTGCGCAAGAGCTCTCGAGCTATCATGCTGGCATTGATCTTTATCATTGCTATAAAACCCGGTTT CATTCATGCAGTATATATGATCTTCTTCTTGATGTATCTTTTGAGCCACAATGTCAGCAGAAAAATGAGACAAGCACTGA TTCTTCTATGTGAGATTCATTTTTCCCTGTTGTATGTTCTTCAAATTGATTTGATCTCCGCAGCATTGGAGAAAAAAGGT TCTGTTAGCATGGAAGTTGTAATGCAATTAGGCCTCCTTGAAGAAGATAGTGCTTGGGATTTCTTGGAAGTAGCTTTACT TGCATGCTTTTGTGCAATTCATAACCATGGTTTTGAGGTGTTATTTTCATTTTCAGCAATCATACAGCATGCCCCCAGCC CTCCTATTGGATTTGGCATCTTGAAAGCTGGTCTTAACAAATCTGTTCTTTTGTCTGTATATGCTTCCTCCTCTGTGAGA AACAGTGATGAAAGTTTCTCTAATGAAAGAAGAATAGCATCTTACCTGAGTGCAATTGGGCAGAAGTTCCTTTCTATATA CCGGTCTTGTGGCACCTACATTGCTTTTCTGACTATTCTTTTCACAGTGTACATGGTGAGACCTAATTACATATCATTTG GCTACATATTCCTTCTCCTTCTATGGATTATCGGAAGACAACTTGTTGAGAGAACAAAAAGACAGCTTTGGTTTCCATTG AAAGTGTATGCAATTTTGGTGTTTATCTTCATATATACTTTGAGCAGTTTCTCAAGCCTTGAGATGTATTTGTCCAAATT AATAGATCTCTATTTTTATCTGGGATACGACTCTAAAGCATCTTCATTTCATAATGTTTGGGAGTCTTTGGCAGTCTTGG TTGTTATGCAACTTTATAGCTATGAGAGAAGACAGAGCAAGCAGATCAGGCAGGAACAAAATCAACTGGATTCACCAGAG CCAGGGATACTTGGGTTTATCAGGCGATTTCTTATCTGGCACAGCCAGAAGATCTTGTTTATTGCTCTGTTTTATGCATC TTTGTCCCCAATTAGTGCATTTGGCTTCTTGTATCTTCTTGGCTTAGTCTTCTGCTCCATTTTACCTAAAACTTCTAGTG TCCCGTCCAAATCATTCTCAGCATACACAGGTTTTCTGGTGACAGCTGAGTACCTTTTTCAGATGTGGGGCAAGCAAGCT GAAATGTTTCCTGGGCAGAAGTACTCTGATATATCTCTTTTTTTGGGTTTCCATGTATTCCAGCCAGGCTTTTGGGGTCT CGAATCAGGACTGAGGGGAAAAGTGTTGGTCATTGTGGCCTGTACCCTTCAATACAATGTCTTCCGTTGGTTGGAAAGGA TGCCAAATACAGTTCTATGCGAAGGAGAGTGGGAAGAGCCTTGTCCTCTATTTGTGTCCACAGAAGATGCATTTGATGAT GCTACTCCATGCAATATGGAAAGTAAAACATCATGCAATTCATATCCCCCTTCTTCAATACAAGAAAATGTGTCTAGCAA GTCATTGAAAATTACAACTTCTGGTTTTTCTCAAGCACGTGATATTTCATCCTCTAAAACTGGAGGTTCTGACAGTAACA GCAGAAAATATTCATTTGGGTTTATCTGGGGAAGCAACAAGGAGAGTCATAAGTGGAACAAGAAGCGGATTGTTGCTTTG AGAAAAGATCGATTTGAAACACAAAAAACTGTCTTAAAAGTATATTTGAAATTTTGGATGGAGAATCTGTTTAATCTGTT CGGTCTAGAGATAAACATGATATCATTACTACTGGCAAGCTTTGCCTTATTGAATGCACTATCCATGCTGTATATTGCAC TGCTTGCTGCTTGTATTCTACTTAATCGGCAAATTATACGGAAAGTCTGGCCCATATTTGTCTTTTTGTTTGCTTCCATT CTCATCCTGGAATATTTTGTCATCTGGAAGGACATGTCGCCTTTAAGTTCCCATGATCCAAGTGAGATTCATTGCCATGA CTGCTGGGAAATTTCAACTCTGCATTTTGGTTTTTGTGAGAAATGTTGGATTGGACTTGTGGTCGATGATCCTCGGATGT TGATTAGCTACTTTTCAGTATTCATGCTGGCTTGCTTCAAACTTCGTGCTGATCGGCTGTCTAGCTTTTTAGGATCATCA ACATATCGTCAGATTCTGTCTCAACGTAGAAACACATTTGTCTGGAGAGATCTCTCTTTTGAAACTAAAAGCATGTGGAC ATTTGTTGACTATTTGAGGCTTTACTGCTACTGCCATCTGTTAGATCTTGTGCTGGTATTAATATTGATTACTGGAACAC TCGAGTATGACATTTTGCATCTTGGTTATCTTGCCTTTGCTCTGGTATTTTTTCGCATGAGACTTGAAATACTGAAGAAG AAGAACAAAATATTCAAGTTCTTGCGCATATACAACTTCTCTGTTATTGTTCTTTCTCTTGCTTACCAATCTCCTTTTGT TGGGGGACCAAGTTCTAAGACTGGGAAGTGCGAGACAGCAAATTACATCTTTGAGATGATTGGTTTTTATAAATATGATT ACGGTTTTCGGATTACTGCAAGATCTGCAATTGTAGAGATTATCATTTTTGTGCTGGTATCACTTCAGTCATATATGTTT TCCTCGCAAGAGTTTGATTATGTATGTCGCTACCTGGAAGCAGAGCAAATTGGTGCAATTGTACATGAGCAAGAGAAAAA AGCTGCATGGAAAACTGATCAACTACAACAAATTCGTGAAAATGAGGAGAAAAAAAGACAGCGAAACATGCAGGTGGAGA AGATGAAATCTGAAATGCTCAACCTGCAAATACAACTCCACAGCATGAACACATCCACTAATTGCATTGATGGATTTTCT CACCCTGGTGAGGGTCTAAGAAGGAGGAGGAGTACTTCTATTACATCAAATATTGGCTTTGGAATTCCTGATAAAGAAGA CCAGGGTCTGGGAAGACTAGATTATGCAATAAGAGAGGATTCTGTTTTTCCAATTGAACGGCATGAATCGTCTACTTGCC CAAATGTGGAAACTCCATTAACAGAGGAGTACATGAAGTATTCAGTGGATTCTCCGTGTTGTGAAATTACTGAAATAGAT ATTGATACTTCTTCTAGTGATTCAGGAAAAAAGGAGAAAGTTATAGGGCAAGCAAAAGAAAACCCACTGAAGTCTGCTGT ACAACTAATAGGTGATGGTGTTTCCCAGGTGCAGTCCATTGGAAATCAGGCAGTCAATAACCTAGTGAGCTTTCTGAATA TTTCACAAGAAGATTCTGATTCAAATGAGCACACAAACATTGAGGACCAGATATATGACGAGATGGAGAGTCAGAAAACG CAGCATATATTCGTGGAGCGTTCTTCATCTTTGCAGTCTGATAAGAGTTCTGATGCTGCGAGTCTGCAGTTAGGAAGGAT CTTTCGTTATATATGGTACCTAATGCGTTCCAATAATGATGTAGTATGTTACTGTTGCTTTGTTCTGGTCTTCTTATGGA ACTTCAGTTTGCTATCAATGGTGTATCTTGGGGCTCTCTTCTTGTATGCTCTATGTGTAAATACGGGCCCAAGTTACATC TTCTGGATTATTATGTTGATCTATACAGAAGTTTATATTTTACTTCAGTATCTGTATCAAATTATCATCCAGCACTGTGG ACTGAATATTGATCCCTCTCTGCTGAGAGAATTAGGTTTTACAACCCACAAAATCACGTCTTCATTTGTTGTCAGTTCAT TACCTCTCTTTCTGGTGTATTTGTTTACCCTCATTCAAAGCTCTATAACACCTAAAGATGGTGAGTGGATGTCTTCTACT GACTTCAAATTTAAGAGGAATGGTCTCCACACAAAAGATAACCCCACTCGATACAATTGGCAAGAGAGAGCATGGGCTTT GCTAAATCAGATGACTAATATGGTAATGTGGATAATCAGATGCTTTTATAGGTACTGGAAATCACTCACACAAGAAGCAG AGTCTCCTCCTTATTTTGTTCAGGTGTCTATGGATGTCAACTTCTGGCCTGAGGATGGGATTCAGCCAGAGAGGATTGAA TCAGGAGTTAATCAGTTTCTCAGAGTTGTCCATAGTGATAAGTGCAAGGAAAAGAACCCAAATGTTTGCTCTTCTTCTAG TAGGGTTAATGTTCAAAGGATTGAAAGAAGCCAAGAGAACCCCAATGTTGCTCTAGTTGTTTTGGAGGTTGTGTATGCAT CACCCGTTCTTGATTGTTCTTCAGCAGAATGGAATAAGTCCTTAACTCCAGCAGCTGACGTAGCCAAGGAAATCCTCAAA GCTCAGCATGCAGGTTTTGTGGAAGAAGTGGGATTCCCTTACCGTATTCTTTCTGTAATTGGTGGAGGCAAGAGAGAAAT TGATCTGTATGCCTACATATTTTGTGCAGATCTAATTGTATTCTTTCTTGTTGCCATCTTCTACCAGTCTGTCCTAAAAA ATAAAAGTGAGTTCCTAGAAGTTTATCAGCTTGTAGACCAGTTTCCGAAAGAATATGTCTTTGTTTTGATGGCTATCTTC TTCTTGATTGTTCTTGATCGTATAATATACCTCTGCTCATTTGCCACGGGGAAAGTGATTTATTATATTTCCAACCTCAT TATCTTCACATATTCAGTTACAGTGTATGATTGGCAATTGGAGCCATCCCAGCAACATGCAGCTCGGTTAGCTCTCCGTG CCATATATCTTGCAAAAGCAGTTTCTCTTGGACTGCAGGCTGTTCAAATCCATTATGGCATTCCTCACAAGAGCACATTG TATCGGCAGTTTTTGACCAGTGAAGTTTCACGAATCAATTACTTAGGGTACAGAGCTTATCGTGCTGTGCCATTCCTTTA TGAATTACGATGTGTACTTGACTGGTCATGCACAACTACATCCCTCACCATGTATGACTGGCTAAAGCTTGAGGACATAA ATGCAAGTTTGTACCTTGTCAAATGTGATTCAGTCTTGAATAGAGCTACACACAAACCAGGAGAGAAGCAAACAAAATGC ACCAAATGCTTCAATGGAATATTGCTGTTCTTTGTATTAATTTGTGTTATATGGGCTCCAATGCTGATGTACAGCAGCGG TAACCCCACAAATATTGCAAACCCAATTAAAGATGCTAGCTTTCATGTTGATATCAAGACAGAGGGTGGAAGGTTGAATT TGTATGAAACTACTCTATGTGAAAGAATCCGGTGGGACTCACTAAATTCTGATGTAAATCCTGACCCCTATGGCTATTTG GATGCATATAACAAGAATGATATCCAGTTAATATGCTGTCAAGCTGATGCTAGTACATTGTGGCTTGTTCCGCATGTTGT TCGGACCAGATTGATTCAGTCCCTTGAATGGTATACTGACATGGAAATTTTTTTCACTTGGATGCTTTCAAGGGACAGAC CAAAAGGAAAAGAAGCTGTGAAATATGAAAAGGCTGTTGATCCTCAATATCTTCCAGCAAAGTCTGATGTTCAAAAGGTT CTTAATGGATCTATGAACAGCTTTAGGATTTATAATGTTTATCCAAGATATTTCCGTGTCACTGGTTCAGGTGATGTTAG ACCATTGGACGAGGACCGTGATGTTAGTGCTGATCTCATTATAAATCATGATCAATTTGACTGGTGGTCCTTCAAAGATA TTAATCCATCAAATCTAAGTGGGTTTTGTGGAGGTTTGACGGGACCTATGGCTATCATTGTATCCGAGGAAACACCACCA CAGGGTATTCTTGGTGACACACTGAGCAAGTTCAGCATATGGGGGCTTTACATAACCTTTGTTCTAGCGGTTGGACGCTT TATCAGACTCCAGTGCTCTGACTTAAGGATGAGAATTCCCTATGAGAACCTACCTTCCTGTGACAGGTTGATAGCAATCT GCGAGGATATATATGCTGCAAGGGCTGAGGGTGAGCTTGGAGTTGAAGAGGTCCTTTATTGGACACTAGTGAAGATATAT CGGTCCCCGCACATGCTGCTTGAGTACACCAACCCTGATTAA 

Protein sequence (LotjaGi5g1v0259600.8) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MADLIGLYKISSNSQWPEICSCLSLVFYYIMLSFTKSDLEEMNFIISRTDCSLTEQLLPSRHSFFIRESRSGVRHTNVLL RGAVFQTFSINFFTYGFPVSLFALSFWSFHFASLCAFGLLAFVGYIIYAFPSLFRLHRLNGLLLVFILLWAVSTYIFNVA FTFLNWKLGRDMKIWEMVGLWHYPIPGFFLLAQFCLGILVALGNLVNNSVFLYLSDEGGQSSNDNVSVKAEGETKALIVA TIAWGLRKSSRAIMLALIFIIAIKPGFIHAVYMIFFLMYLLSHNVSRKMRQALILLCEIHFSLLYVLQIDLISAALEKKG SVSMEVVMQLGLLEEDSAWDFLEVALLACFCAIHNHGFEVLFSFSAIIQHAPSPPIGFGILKAGLNKSVLLSVYASSSVR NSDESFSNERRIASYLSAIGQKFLSIYRSCGTYIAFLTILFTVYMVRPNYISFGYIFLLLLWIIGRQLVERTKRQLWFPL KVYAILVFIFIYTLSSFSSLEMYLSKLIDLYFYLGYDSKASSFHNVWESLAVLVVMQLYSYERRQSKQIRQEQNQLDSPE PGILGFIRRFLIWHSQKILFIALFYASLSPISAFGFLYLLGLVFCSILPKTSSVPSKSFSAYTGFLVTAEYLFQMWGKQA EMFPGQKYSDISLFLGFHVFQPGFWGLESGLRGKVLVIVACTLQYNVFRWLERMPNTVLCEGEWEEPCPLFVSTEDAFDD ATPCNMESKTSCNSYPPSSIQENVSSKSLKITTSGFSQARDISSSKTGGSDSNSRKYSFGFIWGSNKESHKWNKKRIVAL RKDRFETQKTVLKVYLKFWMENLFNLFGLEINMISLLLASFALLNALSMLYIALLAACILLNRQIIRKVWPIFVFLFASI LILEYFVIWKDMSPLSSHDPSEIHCHDCWEISTLHFGFCEKCWIGLVVDDPRMLISYFSVFMLACFKLRADRLSSFLGSS TYRQILSQRRNTFVWRDLSFETKSMWTFVDYLRLYCYCHLLDLVLVLILITGTLEYDILHLGYLAFALVFFRMRLEILKK KNKIFKFLRIYNFSVIVLSLAYQSPFVGGPSSKTGKCETANYIFEMIGFYKYDYGFRITARSAIVEIIIFVLVSLQSYMF SSQEFDYVCRYLEAEQIGAIVHEQEKKAAWKTDQLQQIRENEEKKRQRNMQVEKMKSEMLNLQIQLHSMNTSTNCIDGFS HPGEGLRRRRSTSITSNIGFGIPDKEDQGLGRLDYAIREDSVFPIERHESSTCPNVETPLTEEYMKYSVDSPCCEITEID IDTSSSDSGKKEKVIGQAKENPLKSAVQLIGDGVSQVQSIGNQAVNNLVSFLNISQEDSDSNEHTNIEDQIYDEMESQKT QHIFVERSSSLQSDKSSDAASLQLGRIFRYIWYLMRSNNDVVCYCCFVLVFLWNFSLLSMVYLGALFLYALCVNTGPSYI FWIIMLIYTEVYILLQYLYQIIIQHCGLNIDPSLLRELGFTTHKITSSFVVSSLPLFLVYLFTLIQSSITPKDGEWMSST DFKFKRNGLHTKDNPTRYNWQERAWALLNQMTNMVMWIIRCFYRYWKSLTQEAESPPYFVQVSMDVNFWPEDGIQPERIE SGVNQFLRVVHSDKCKEKNPNVCSSSSRVNVQRIERSQENPNVALVVLEVVYASPVLDCSSAEWNKSLTPAADVAKEILK AQHAGFVEEVGFPYRILSVIGGGKREIDLYAYIFCADLIVFFLVAIFYQSVLKNKSEFLEVYQLVDQFPKEYVFVLMAIF FLIVLDRIIYLCSFATGKVIYYISNLIIFTYSVTVYDWQLEPSQQHAARLALRAIYLAKAVSLGLQAVQIHYGIPHKSTL YRQFLTSEVSRINYLGYRAYRAVPFLYELRCVLDWSCTTTSLTMYDWLKLEDINASLYLVKCDSVLNRATHKPGEKQTKC TKCFNGILLFFVLICVIWAPMLMYSSGNPTNIANPIKDASFHVDIKTEGGRLNLYETTLCERIRWDSLNSDVNPDPYGYL DAYNKNDIQLICCQADASTLWLVPHVVRTRLIQSLEWYTDMEIFFTWMLSRDRPKGKEAVKYEKAVDPQYLPAKSDVQKV LNGSMNSFRIYNVYPRYFRVTGSGDVRPLDEDRDVSADLIINHDQFDWWSFKDINPSNLSGFCGGLTGPMAIIVSEETPP QGILGDTLSKFSIWGLYITFVLAVGRFIRLQCSDLRMRIPYENLPSCDRLIAICEDIYAARAEGELGVEEVLYWTLVKIY RSPHMLLEYTNPD 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 1 2253 2253 0.0
Phobius 1 15 15 -
TMHMM 15 34 20 -
Phobius 16 34 19 -
Phobius 35 77 43 -
Phobius 78 97 20 -
TMHMM 78 97 20 -
Phobius 98 108 11 -
TMHMM 107 129 23 -
Phobius 109 130 22 -
Phobius 131 141 11 -
TMHMM 142 164 23 -
Phobius 142 163 22 -
Phobius 164 182 19 -
Phobius 183 206 24 -
TMHMM 184 206 23 -
Phobius 207 251 45 -
Phobius 252 281 30 -
TMHMM 255 277 23 -
Phobius 282 292 11 -
TMHMM 292 314 23 -
Phobius 293 316 24 -
Phobius 317 425 109 -
TMHMM 424 446 23 -
Phobius 426 444 19 -
Phobius 445 449 5 -
TMHMM 450 469 20 -
Phobius 450 469 20 -
Phobius 470 480 11 -
Phobius 481 504 24 -
TMHMM 482 504 23 -
Phobius 505 523 19 -
TMHMM 524 541 18 -
Phobius 524 541 18 -
Phobius 542 577 36 -
TMHMM 578 600 23 -
Phobius 578 599 22 -
Phobius 600 618 19 -
Phobius 619 636 18 -
Phobius 637 647 11 -
Phobius 648 665 18 -
Phobius 666 670 5 -
Phobius 671 688 18 -
Phobius 689 809 121 -
Phobius 810 828 19 -
Phobius 829 833 5 -
Phobius 834 862 29 -
TMHMM 834 856 23 -
Phobius 863 868 6 -
TMHMM 869 888 20 -
Phobius 869 888 20 -
Phobius 889 932 44 -
TMHMM 933 950 18 -
Phobius 933 950 18 -
Phobius 951 993 43 -
TMHMM 992 1014 23 -
Phobius 994 1012 19 -
Phobius 1013 1017 5 -
TMHMM 1018 1035 18 -
Phobius 1018 1035 18 -
Phobius 1036 1046 11 -
TMHMM 1047 1066 20 -
Phobius 1047 1064 18 -
Phobius 1065 1093 29 -
Phobius 1094 1115 22 -
TMHMM 1098 1120 23 -
Phobius 1116 1400 285 -
Coils 1155 1178 24 -
Phobius 1401 1427 27 -
TMHMM 1401 1423 23 -
Phobius 1428 1438 11 -
TMHMM 1438 1455 18 -
Phobius 1439 1459 21 -
Phobius 1460 1488 29 -
TMHMM 1488 1510 23 -
Phobius 1489 1509 21 -
Phobius 1510 1543 34 -
Phobius 1544 1563 20 -
TMHMM 1544 1563 20 -
Phobius 1564 1708 145 -
Phobius 1709 1732 24 -
TMHMM 1710 1732 23 -
Phobius 1733 1751 19 -
Phobius 1752 1772 21 -
TMHMM 1752 1774 23 -
Phobius 1773 1778 6 -
Phobius 1779 1798 20 -
TMHMM 1779 1796 18 -
Phobius 1799 1809 11 -
Phobius 1810 1834 25 -
TMHMM 1811 1833 23 -
Phobius 1835 1922 88 -
Pfam 1862 2251 390 3.8E-112
Phobius 1923 1944 22 -
TMHMM 1924 1946 23 -
Phobius 1945 2170 226 -
Phobius 2171 2188 18 -
TMHMM 2171 2188 18 -
Phobius 2189 2253 65 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

Unable to find any GO terms for the transcript with the identifier.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi5g1v0259600.8, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…