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LotjaGi5g1v0259600.9

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi5g1v0259600
Transcript ID LotjaGi5g1v0259600.9
Related isoforms 8
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description piezo-type mechanosensitive ion channel component; TAIR: AT2G48060.2 piezo-type mechanosensitive ion channel component; Swiss-Prot: sp|F4IN58|PIEZO_ARATH Piezo-type mechanosensitive ion channel homolog; TrEMBL-Plants: tr|A0A072VYZ6|A0A072VYZ6_MEDTR DUF3595 family protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0259600
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr5:56801130..56819365) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

GTGATGCAGCTCTCTTTCACTAAATCTGATTTGGAGGAGATGAATTTTATTATTTCCAGGACAGATTGTAGCTTGACGGA GCAACTTCTACCCTCTAGGCATTCATTTTTCATCCGTGAATCAAGGTAATCAAATGAAAATATACTTTTCTGATTTTCTT TATGCCATAGATATAAAGTATATGTTCAAACACTTGAATTAAATGTGCAGGTCTGGTGTGAGGCACACAAATGTTTTACT CAGAGGAGCTGTTTTTCAGACTTTCAGTATCAACTTTTTCACGTATGGTTTCCCGGTATATATTTCTGAAACATTATAAT CTGCTTTCATTATCAGTGATGAATAATGATAAAGCCCTGGCTTGTTTGTTATAGTCCTTCCTTCATCGTTGTACATTGCA TGCGCGGACTATATTAGTTGTAGGAGAATATTTTTTTAAATAAGTTCTCTCGTAAAGTTTTTGGTTATTATAAGCTGTTT TAAACACAAAACACGTTAATCCAAACACATTCTGATCTCGTGGAGGATGGAACTTTGAGAAAACCCAGGTTTAGTTTTCG ACTTTTTCATGGATAATCGTAATCTATAATTCAAAATTTATAGAAAATATAAAAAAAATTAGGAGAAAGTATCTAGATGA ATGGTTAATTAACCCTCTTATCCATTCTTAGGACATTGCTTACCAGTTGTCCCATCAATTGTTTCTGAATTTGAAATATT TTGACAAGAAGTCAGCTGAGACATTAGAAATATTATTGATACACTGAGTGTACAAGGATTTCTCTTCTAATAGAGAGAAT TACAAAAGGTGATTGACTAAAAATCAGGAAACCAACATCCTAAGTTAGGAAACAATATATGGAAATAAAGAACTACCTAA AACAGTCCAAGCCAAGAAAGGAAACAAAATAACTATGTACAAACAATAATATTTATAGAAATTTAAGAGCTTTGATACTC 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CTTGTTTCTTCGTTCTAATATTTGTTGCTTGTGATTCTATATATATGGGAAAATAATTGCATACTGGCATTCCACCAGTA GAAGCTAATCGTCTTTGCTATCAACTGTTGTAATCTTTCCAATAACACAGCAATCTTTCCTTCAATCTTATTGGGTGATT GGATTTAAATTAGAAATTACTAAAATTTTGTAATCAAAGTGATAGTCACGAAGAAAGAGAGGTTGTGCTCACTTCTCAAG TTATTGTAATAAAATTATATTTGCTTTGCGTAATAATGCTTCTAAATTACAATTAGAAAATTCAAAATTTTATTTTTCAG GACCGTGATGTTAGTGCTGATCTCATTATAAATCATGATCAATTTGACTGGTGGTCCTTCAAAGATATTAATCCATCAAA TCTAAGTGGGTTTTGTGGAGGTTTGACGGGACCTATGGCTATCATTGTATCCGAGGAAACACCACCACGTAAGTTGGCTG TGGATTTTTTCTTCTTGAAACTCTTCCCCTAGTACTATTATTGCCTGGACCTTGTACAACGCTTCTAAACTTTTAATACT GTTTCAGAGGGTATTCTTGGTGACACACTGAGCAAGTTCAGCATATGGGGGCTTTACATAACCTTTGTTCTAGCGGTTGG ACGCTTTATCAGACTCCAGTGCTCTGACTTAAGGATGAGAATTCCCTATGAGAACCTACCTTCCTGTGACAGGTACTACA GAATCCTTTCACTGAACTCGAGTCATTCTCCCATGTGATTGTTCTTTAAGATACATCCTGCAGTAACTTATGTTACTTCT TGCTGCATTTTCTCGTGTAGGTTGATAGCAATCTGCGAGGATATATATGCTGCAAGGGCTGAGGGTGAGCTTGGAGTTGA AGAGGTCCTTTATTGGACACTAGTGAAGATATATCGGTCCCCGCACATGCTGCTTGAGTACACCAACCCTGATTAA 

CDS sequence (LotjaGi5g1v0259600.9) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGCAGCTCTCTTTCACTAAATCTGATTTGGAGGAGATGAATTTTATTATTTCCAGGACAGATTGTAGCTTGACGGAGCA ACTTCTACCCTCTAGGCATTCATTTTTCATCCGTGAATCAAGGTCTGGTGTGAGGCACACAAATGTTTTACTCAGAGGAG CTGTTTTTCAGACTTTCAGTATCAACTTTTTCACGTATGGTTTCCCGGTTTCCTTGTTTGCACTTTCCTTTTGGAGCTTT CATTTTGCGAGTTTATGTGCATTTGGGTTACTTGCTTTTGTTGGCTACATTATCTATGCCTTCCCTTCCTTATTTCGTCT GCACCGATTGAATGGGCTACTTCTCGTCTTCATCCTCTTGTGGGCTGTTAGCACCTATATATTTAATGTGGCATTTACAT TTCTGAATTGGAAACTTGGACGGGACATGAAAATCTGGGAGATGGTCGGTCTGTGGCACTATCCAATACCTGGGTTTTTT CTTCTGGCACAATTTTGTCTTGGAATTTTGGTTGCATTGGGTAATCTTGTGAACAATTCTGTTTTCCTCTACTTGTCTGA TGAAGGTGGGCAATCTTCAAATGACAATGTATCAGTAAAAGCTGAGGGTGAGACTAAGGCATTGATCGTGGCAACAATAG CCTGGGGATTGCGCAAGAGCTCTCGAGCTATCATGCTGGCATTGATCTTTATCATTGCTATAAAACCCGGTTTCATTCAT GCAGTATATATGATCTTCTTCTTGATGTATCTTTTGAGCCACAATGTCAGCAGAAAAATGAGACAAGCACTGATTCTTCT ATGTGAGATTCATTTTTCCCTGTTGTATGTTCTTCAAATTGATTTGATCTCCGCAGCATTGGAGAAAAAAGGTTCTGTTA GCATGGAAGTTGTAATGCAATTAGGCCTCCTTGAAGAAGATAGTGCTTGGGATTTCTTGGAAGTAGCTTTACTTGCATGC TTTTGTGCAATTCATAACCATGGTTTTGAGGTGTTATTTTCATTTTCAGCAATCATACAGCATGCCCCCAGCCCTCCTAT TGGATTTGGCATCTTGAAAGCTGGTCTTAACAAATCTGTTCTTTTGTCTGTATATGCTTCCTCCTCTGTGAGAAACAGTG ATGAAAGTTTCTCTAATGAAAGAAGAATAGCATCTTACCTGAGTGCAATTGGGCAGAAGTTCCTTTCTATATACCGGTCT TGTGGCACCTACATTGCTTTTCTGACTATTCTTTTCACAGTGTACATGGTGAGACCTAATTACATATCATTTGGCTACAT ATTCCTTCTCCTTCTATGGATTATCGGAAGACAACTTGTTGAGAGAACAAAAAGACAGCTTTGGTTTCCATTGAAAGTGT ATGCAATTTTGGTGTTTATCTTCATATATACTTTGAGCAGTTTCTCAAGCCTTGAGATGTATTTGTCCAAATTAATAGAT CTCTATTTTTATCTGGGATACGACTCTAAAGCATCTTCATTTCATAATGTTTGGGAGTCTTTGGCAGTCTTGGTTGTTAT GCAACTTTATAGCTATGAGAGAAGACAGAGCAAGCAGATCAGGCAGGAACAAAATCAACTGGATTCACCAGAGCCAGGGA TACTTGGGTTTATCAGGCGATTTCTTATCTGGCACAGCCAGAAGATCTTGTTTATTGCTCTGTTTTATGCATCTTTGTCC CCAATTAGTGCATTTGGCTTCTTGTATCTTCTTGGCTTAGTCTTCTGCTCCATTTTACCTAAAACTTCTAGTGTCCCGTC CAAATCATTCTCAGCATACACAGGTTTTCTGGTGACAGCTGAGTACCTTTTTCAGATGTGGGGCAAGCAAGCTGAAATGT TTCCTGGGCAGAAGTACTCTGATATATCTCTTTTTTTGGGTTTCCATGTATTCCAGCCAGGCTTTTGGGGTCTCGAATCA GGACTGAGGGGAAAAGTGTTGGTCATTGTGGCCTGTACCCTTCAATACAATGTCTTCCGTTGGTTGGAAAGGATGCCAAA TACAGTTCTATGCGAAGGAGAGTGGGAAGAGCCTTGTCCTCTATTTGTGTCCACAGAAGATGCATTTGATGATGCTACTC CATGCAATATGGAAAGTAAAACATCATGCAATTCATATCCCCCTTCTTCAATACAAGAAAATGTGTCTAGCAAGTCATTG AAAATTACAACTTCTGGTTTTTCTCAAGCACGTGATATTTCATCCTCTAAAACTGGAGGTTCTGACAGTAACAGCAGAAA ATATTCATTTGGGTTTATCTGGGGAAGCAACAAGGAGAGTCATAAGTGGAACAAGAAGCGGATTGTTGCTTTGAGAAAAG ATCGATTTGAAACACAAAAAACTGTCTTAAAAGTATATTTGAAATTTTGGATGGAGAATCTGTTTAATCTGTTCGGTCTA GAGATAAACATGATATCATTACTACTGGCAAGCTTTGCCTTATTGAATGCACTATCCATGCTGTATATTGCACTGCTTGC TGCTTGTATTCTACTTAATCGGCAAATTATACGGAAAGTCTGGCCCATATTTGTCTTTTTGTTTGCTTCCATTCTCATCC TGGAATATTTTGTCATCTGGAAGGACATGTCGCCTTTAAGTTCCCATGATCCAAGTGAGATTCATTGCCATGACTGCTGG GAAATTTCAACTCTGCATTTTGGTTTTTGTGAGAAATGTTGGATTGGACTTGTGGTCGATGATCCTCGGATGTTGATTAG CTACTTTTCAGTATTCATGCTGGCTTGCTTCAAACTTCGTGCTGATCGGCTGTCTAGCTTTTTAGGATCATCAACATATC GTCAGATTCTGTCTCAACGTAGAAACACATTTGTCTGGAGAGATCTCTCTTTTGAAACTAAAAGCATGTGGACATTTGTT GACTATTTGAGGCTTTACTGCTACTGCCATCTGTTAGATCTTGTGCTGGTATTAATATTGATTACTGGAACACTCGAGTA TGACATTTTGCATCTTGGTTATCTTGCCTTTGCTCTGGTATTTTTTCGCATGAGACTTGAAATACTGAAGAAGAAGAACA AAATATTCAAGTTCTTGCGCATATACAACTTCTCTGTTATTGTTCTTTCTCTTGCTTACCAATCTCCTTTTGTTGGGGGA CCAAGTTCTAAGACTGGGAAGTGCGAGACAGCAAATTACATCTTTGAGATGATTGGTTTTTATAAATATGATTACGGTTT TCGGATTACTGCAAGATCTGCAATTGTAGAGATTATCATTTTTGTGCTGGTATCACTTCAGTCATATATGTTTTCCTCGC AAGAGTTTGATTATGTATGTCGCTACCTGGAAGCAGAGCAAATTGGTGCAATTGTACATGAGCAAGAGAAAAAAGCTGCA TGGAAAACTGATCAACTACAACAAATTCGTGAAAATGAGGAGAAAAAAAGACAGCGAAACATGCAGGTGGAGAAGATGAA ATCTGAAATGCTCAACCTGCAAATACAACTCCACAGCATGAACACATCCACTAATTGCATTGATGGATTTTCTCACCCTG GTGAGGGTCTAAGAAGGAGGAGGAGTACTTCTATTACATCAAATATTGGCTTTGGAATTCCTGATAAAGAAGACCAGGGT CTGGGAAGACTAGATTATGCAATAAGAGAGGATTCTGTTTTTCCAATTGAACGGCATGAATCGTCTACTTGCCCAAATGT GGAAACTCCATTAACAGAGGAGTACATGAAGTATTCAGTGGATTCTCCGTGTTGTGAAATTACTGAAATAGATATTGATA CTTCTTCTAGTGATTCAGGAAAAAAGGAGAAAGTTATAGGGCAAGCAAAAGAAAACCCACTGAAGTCTGCTGTACAACTA ATAGGTGATGGTGTTTCCCAGGTGCAGTCCATTGGAAATCAGGCAGTCAATAACCTAGTGAGCTTTCTGAATATTTCACA AGAAGATTCTGATTCAAATGAGCACACAAACATTGAGGACCAGATATATGACGAGATGGAGAGTCAGAAAACGCAGCATA TATTCGTGGAGCGTTCTTCATCTTTGCAGTCTGATAAGAGTTCTGATGCTGCGAGTCTGCAGTTAGGAAGGATCTTTCGT TATATATGGTACCTAATGCGTTCCAATAATGATGTAGTATGTTACTGTTGCTTTGTTCTGGTCTTCTTATGGAACTTCAG TTTGCTATCAATGGTGTATCTTGGGGCTCTCTTCTTGTATGCTCTATGTGTAAATACGGGCCCAAGTTACATCTTCTGGA TTATTATGTTGATCTATACAGAAGTTTATATTTTACTTCAGTATCTGTATCAAATTATCATCCAGCACTGTGGACTGAAT ATTGATCCCTCTCTGCTGAGAGAATTAGGTTTTACAACCCACAAAATCACGTCTTCATTTGTTGTCAGTTCATTACCTCT CTTTCTGGTGTATTTGTTTACCCTCATTCAAAGCTCTATAACACCTAAAGATGGTGAGTGGATGTCTTCTACTGACTTCA AATTTAAGAGGAATGGTCTCCACACAAAAGATAACCCCACTCGATACAATTGGCAAGAGAGAGCATGGGCTTTGCTAAAT CAGATGACTAATATGGTAATGTGGATAATCAGATGCTTTTATAGGTACTGGAAATCACTCACACAAGAAGCAGAGTCTCC TCCTTATTTTGTTCAGGTGTCTATGGATGTCAACTTCTGGCCTGAGGATGGGATTCAGCCAGAGAGGATTGAATCAGGAG TTAATCAGTTTCTCAGAGTTGTCCATAGTGATAAGTGCAAGGAAAAGAACCCAAATGTTTGCTCTTCTTCTAGTAGGGTT AATGTTCAAAGGATTGAAAGAAGCCAAGAGAACCCCAATGTTGCTCTAGTTGTTTTGGAGGTTGTGTATGCATCACCCGT TCTTGATTGTTCTTCAGCAGAATGGAATAAGTCCTTAACTCCAGCAGCTGACGTAGCCAAGGAAATCCTCAAAGCTCAGC ATGCAGGTTTTGTGGAAGAAGTGGGATTCCCTTACCGTATTCTTTCTGTAATTGGTGGAGGCAAGAGAGAAATTGATCTG TATGCCTACATATTTTGTGCAGATCTAATTGTATTCTTTCTTGTTGCCATCTTCTACCAGTCTGTCCTAAAAAATAAAAG TGAGTTCCTAGAAGTTTATCAGCTTGTAGACCAGTTTCCGAAAGAATATGTCTTTGTTTTGATGGCTATCTTCTTCTTGA TTGTTCTTGATCGTATAATATACCTCTGCTCATTTGCCACGGGGAAAGTGATTTATTATATTTCCAACCTCATTATCTTC ACATATTCAGTTACAGTGTATGATTGGCAATTGGAGCCATCCCAGCAACATGCAGCTCGGTTAGCTCTCCGTGCCATATA TCTTGCAAAAGCAGTTTCTCTTGGACTGCAGGCTGTTCAAATCCATTATGGCATTCCTCACAAGAGCACATTGTATCGGC AGTTTTTGACCAGTGAAGTTTCACGAATCAATTACTTAGGGTACAGAGCTTATCGTGCTGTGCCATTCCTTTATGAATTA CGATGTGTACTTGACTGGTCATGCACAACTACATCCCTCACCATGTATGACTGGCTAAAGCTTGAGGACATAAATGCAAG TTTGTACCTTGTCAAATGTGATTCAGTCTTGAATAGAGCTACACACAAACCAGGAGAGAAGCAAACAAAATGCACCAAAT GCTTCAATGGAATATTGCTGTTCTTTGTATTAATTTGTGTTATATGGGCTCCAATGCTGATGTACAGCAGCGGTAACCCC ACAAATATTGCAAACCCAATTAAAGATGCTAGCTTTCATGTTGATATCAAGACAGAGGGTGGAAGGTTGAATTTGTATGA AACTACTCTATGTGAAAGAATCCGGTGGGACTCACTAAATTCTGATGTAAATCCTGACCCCTATGGCTATTTGGATGCAT ATAACAAGAATGATATCCAGTTAATATGCTGTCAAGCTGATGCTAGTACATTGTGGCTTGTTCCGCATGTTGTTCGGACC AGATTGATTCAGTCCCTTGAATGGTATACTGACATGGAAATTTTTTTCACTTGGATGCTTTCAAGGGACAGACCAAAAGG AAAAGAAGCTGTGAAATATGAAAAGGCTGTTGATCCTCAATATCTTCCAGCAAAGTCTGATGTTCAAAAGGTTCTTAATG GATCTATGAACAGCTTTAGGATTTATAATGTTTATCCAAGATATTTCCGTGTCACTGGTTCAGGTGATGTTAGACCATTG GACGAGGACCGTGATGTTAGTGCTGATCTCATTATAAATCATGATCAATTTGACTGGTGGTCCTTCAAAGATATTAATCC ATCAAATCTAAGTGGGTTTTGTGGAGGTTTGACGGGACCTATGGCTATCATTGTATCCGAGGAAACACCACCACAGGGTA TTCTTGGTGACACACTGAGCAAGTTCAGCATATGGGGGCTTTACATAACCTTTGTTCTAGCGGTTGGACGCTTTATCAGA CTCCAGTGCTCTGACTTAAGGATGAGAATTCCCTATGAGAACCTACCTTCCTGTGACAGGTTGATAGCAATCTGCGAGGA TATATATGCTGCAAGGGCTGAGGGTGAGCTTGGAGTTGAAGAGGTCCTTTATTGGACACTAGTGAAGATATATCGGTCCC CGCACATGCTGCTTGAGTACACCAACCCTGATTAA 

Protein sequence (LotjaGi5g1v0259600.9) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MQLSFTKSDLEEMNFIISRTDCSLTEQLLPSRHSFFIRESRSGVRHTNVLLRGAVFQTFSINFFTYGFPVSLFALSFWSF HFASLCAFGLLAFVGYIIYAFPSLFRLHRLNGLLLVFILLWAVSTYIFNVAFTFLNWKLGRDMKIWEMVGLWHYPIPGFF LLAQFCLGILVALGNLVNNSVFLYLSDEGGQSSNDNVSVKAEGETKALIVATIAWGLRKSSRAIMLALIFIIAIKPGFIH AVYMIFFLMYLLSHNVSRKMRQALILLCEIHFSLLYVLQIDLISAALEKKGSVSMEVVMQLGLLEEDSAWDFLEVALLAC FCAIHNHGFEVLFSFSAIIQHAPSPPIGFGILKAGLNKSVLLSVYASSSVRNSDESFSNERRIASYLSAIGQKFLSIYRS CGTYIAFLTILFTVYMVRPNYISFGYIFLLLLWIIGRQLVERTKRQLWFPLKVYAILVFIFIYTLSSFSSLEMYLSKLID LYFYLGYDSKASSFHNVWESLAVLVVMQLYSYERRQSKQIRQEQNQLDSPEPGILGFIRRFLIWHSQKILFIALFYASLS PISAFGFLYLLGLVFCSILPKTSSVPSKSFSAYTGFLVTAEYLFQMWGKQAEMFPGQKYSDISLFLGFHVFQPGFWGLES GLRGKVLVIVACTLQYNVFRWLERMPNTVLCEGEWEEPCPLFVSTEDAFDDATPCNMESKTSCNSYPPSSIQENVSSKSL KITTSGFSQARDISSSKTGGSDSNSRKYSFGFIWGSNKESHKWNKKRIVALRKDRFETQKTVLKVYLKFWMENLFNLFGL EINMISLLLASFALLNALSMLYIALLAACILLNRQIIRKVWPIFVFLFASILILEYFVIWKDMSPLSSHDPSEIHCHDCW EISTLHFGFCEKCWIGLVVDDPRMLISYFSVFMLACFKLRADRLSSFLGSSTYRQILSQRRNTFVWRDLSFETKSMWTFV DYLRLYCYCHLLDLVLVLILITGTLEYDILHLGYLAFALVFFRMRLEILKKKNKIFKFLRIYNFSVIVLSLAYQSPFVGG PSSKTGKCETANYIFEMIGFYKYDYGFRITARSAIVEIIIFVLVSLQSYMFSSQEFDYVCRYLEAEQIGAIVHEQEKKAA WKTDQLQQIRENEEKKRQRNMQVEKMKSEMLNLQIQLHSMNTSTNCIDGFSHPGEGLRRRRSTSITSNIGFGIPDKEDQG LGRLDYAIREDSVFPIERHESSTCPNVETPLTEEYMKYSVDSPCCEITEIDIDTSSSDSGKKEKVIGQAKENPLKSAVQL IGDGVSQVQSIGNQAVNNLVSFLNISQEDSDSNEHTNIEDQIYDEMESQKTQHIFVERSSSLQSDKSSDAASLQLGRIFR YIWYLMRSNNDVVCYCCFVLVFLWNFSLLSMVYLGALFLYALCVNTGPSYIFWIIMLIYTEVYILLQYLYQIIIQHCGLN IDPSLLRELGFTTHKITSSFVVSSLPLFLVYLFTLIQSSITPKDGEWMSSTDFKFKRNGLHTKDNPTRYNWQERAWALLN QMTNMVMWIIRCFYRYWKSLTQEAESPPYFVQVSMDVNFWPEDGIQPERIESGVNQFLRVVHSDKCKEKNPNVCSSSSRV NVQRIERSQENPNVALVVLEVVYASPVLDCSSAEWNKSLTPAADVAKEILKAQHAGFVEEVGFPYRILSVIGGGKREIDL YAYIFCADLIVFFLVAIFYQSVLKNKSEFLEVYQLVDQFPKEYVFVLMAIFFLIVLDRIIYLCSFATGKVIYYISNLIIF TYSVTVYDWQLEPSQQHAARLALRAIYLAKAVSLGLQAVQIHYGIPHKSTLYRQFLTSEVSRINYLGYRAYRAVPFLYEL RCVLDWSCTTTSLTMYDWLKLEDINASLYLVKCDSVLNRATHKPGEKQTKCTKCFNGILLFFVLICVIWAPMLMYSSGNP TNIANPIKDASFHVDIKTEGGRLNLYETTLCERIRWDSLNSDVNPDPYGYLDAYNKNDIQLICCQADASTLWLVPHVVRT RLIQSLEWYTDMEIFFTWMLSRDRPKGKEAVKYEKAVDPQYLPAKSDVQKVLNGSMNSFRIYNVYPRYFRVTGSGDVRPL DEDRDVSADLIINHDQFDWWSFKDINPSNLSGFCGGLTGPMAIIVSEETPPQGILGDTLSKFSIWGLYITFVLAVGRFIR LQCSDLRMRIPYENLPSCDRLIAICEDIYAARAEGELGVEEVLYWTLVKIYRSPHMLLEYTNPD 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 48 48 -
PANTHER 2 2224 2223 0.0
Phobius 49 68 20 -
TMHMM 49 68 20 -
Phobius 69 79 11 -
TMHMM 78 100 23 -
Phobius 80 101 22 -
Phobius 102 112 11 -
Phobius 113 134 22 -
TMHMM 113 135 23 -
Phobius 135 153 19 -
Phobius 154 177 24 -
TMHMM 155 177 23 -
Phobius 178 222 45 -
Phobius 223 252 30 -
TMHMM 226 248 23 -
Phobius 253 263 11 -
TMHMM 263 285 23 -
Phobius 264 287 24 -
Phobius 288 396 109 -
TMHMM 395 417 23 -
Phobius 397 415 19 -
Phobius 416 420 5 -
Phobius 421 440 20 -
TMHMM 421 440 20 -
Phobius 441 451 11 -
Phobius 452 475 24 -
TMHMM 453 475 23 -
Phobius 476 494 19 -
TMHMM 495 512 18 -
Phobius 495 512 18 -
Phobius 513 548 36 -
Phobius 549 570 22 -
TMHMM 549 571 23 -
Phobius 571 589 19 -
Phobius 590 607 18 -
Phobius 608 618 11 -
Phobius 619 636 18 -
Phobius 637 641 5 -
Phobius 642 659 18 -
Phobius 660 780 121 -
Phobius 781 799 19 -
Phobius 800 804 5 -
TMHMM 805 827 23 -
Phobius 805 833 29 -
Phobius 834 839 6 -
Phobius 840 859 20 -
TMHMM 840 859 20 -
Phobius 860 903 44 -
TMHMM 904 921 18 -
Phobius 904 921 18 -
Phobius 922 964 43 -
TMHMM 963 985 23 -
Phobius 965 983 19 -
Phobius 984 988 5 -
TMHMM 989 1006 18 -
Phobius 989 1006 18 -
Phobius 1007 1017 11 -
Phobius 1018 1035 18 -
TMHMM 1018 1037 20 -
Phobius 1036 1064 29 -
Phobius 1065 1086 22 -
TMHMM 1069 1091 23 -
Phobius 1087 1371 285 -
Coils 1126 1149 24 -
TMHMM 1372 1394 23 -
Phobius 1372 1398 27 -
Phobius 1399 1409 11 -
TMHMM 1409 1426 18 -
Phobius 1410 1430 21 -
Phobius 1431 1459 29 -
TMHMM 1459 1481 23 -
Phobius 1460 1480 21 -
Phobius 1481 1514 34 -
TMHMM 1515 1534 20 -
Phobius 1515 1534 20 -
Phobius 1535 1679 145 -
Phobius 1680 1703 24 -
TMHMM 1681 1703 23 -
Phobius 1704 1722 19 -
TMHMM 1723 1745 23 -
Phobius 1723 1743 21 -
Phobius 1744 1749 6 -
Phobius 1750 1769 20 -
TMHMM 1750 1767 18 -
Phobius 1770 1780 11 -
Phobius 1781 1805 25 -
TMHMM 1782 1804 23 -
Phobius 1806 1893 88 -
Pfam 1833 2222 390 3.7E-112
Phobius 1894 1915 22 -
TMHMM 1895 1917 23 -
Phobius 1916 2141 226 -
Phobius 2142 2159 18 -
TMHMM 2142 2159 18 -
Phobius 2160 2224 65 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

Unable to find any GO terms for the transcript with the identifier.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi5g1v0259600.9, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…