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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0267500 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0267500.2 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | R3h domain containing protein, putative; TAIR: AT3G56680.1 Single-stranded nucleic acid binding R3H protein; Swiss-Prot: sp|Q80TM6|R3HD2_MOUSE R3H domain-containing protein 2; TrEMBL-Plants: tr|G7I367|G7I367_MEDTR Single-stranded nucleic acid-binding protein R3H; Found in the gene: LotjaGi5g1v0267500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:57920859..57933304) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GGGACACGTGGTTCGAATCCTCTACGTCAAACCCTATCTCTCTCCCTCTTCGTACCTTCTCCATCACTTTACCCCCAATT GTCAATATTCCAATTCCAAACCCTAACCCTAAAACCGATCCCTCCTCTGATGAATTTCACCACGCAAACCTCTCCGATTT CACAATCGCTTTCAATTCCCTGACCCTCGGAAAACCCATTGCTTCACTCGCAATTCTTCTTCTTCTTCGATGGAGGGCTC TGCGGAGGATCTCGGAGCCCCGGAGTCATGGGAGGTCGCCGATTTGGACGAGTCCATGAACCGCTTGAACCTCTTGCTCA AGGATTCCAAGCCGCCTCCTCGCGACCACACCGATGATTCTCCTCCTCCTTCGTCTAGTGGTGATAAGGTCTCTGATGAT GCCATCAACCAGGTTGATCAGTTCCTTGGTGAAGCGATTCAAAACCCTCGCGAACGCCTTTCAAGTAGGTTTACCTGTAT CTATGAAATGTGTTCCCAAATTGTGTGTATGTTCACTCAATTAGTGCTCTAGAATCTAATTAAGCTATTGATTTAGGTTC TGATTGCTTATAAATTATTCATGGATGATTGCGATTGATACAATGCTGGTATAATTATTCCCTTGTGTGGTCTGATTTGG AAAACAATTCCATTTCCAGTATATCAGATTGTGATATTGAGCATGATTAATTGATTATCCAACTGGAGATATCGAATGAT TATCTAACTGGAGTTGCTTTTGAGTGTGATTTTGAGCATGAATTAAAGCCTGTTTTTTTGGAAACAGTGATCTGTGGCAT AGGCTTTTTTCTGTTGCTTATTGATTTTGAATTTTGAGGTGATTTATAGATATGTTTCAAGGGTAGATTAATGTTTTTAT ATGCATGAATGAATTTGCCTCGCACATCCAAATGGGGAATGTGAGAATCGCATCTTTGAACAATGGACACTTAGCTGAAT GTTTCATAGTTCTCTTATACATGCTACTGATCTTATGACTTTGTTATGCACTTGATGCATAATTTGAATATATTATCTGT TTTATTTTAGATTAAATGCAGCTTTACAATCCTGGTGGTTTTTTTTTCCGTAGATTGATTTAGGTTTTTGGTTTGATTTG TTCAGTTTTGCGGATTGAGCAAGATGTTGAGAATTTTATTCGTGATCCTAATCAACAACAGCTTGAGTTTAAGGAGCTTC CAACATCCTATTTAAGGTTGGCTGCACACCGAGTGGCTCAGCATTATTCGTTGCAGTCAATGGTTTTACTGGATAATAGT TTACCGGATGGTTCTGGGTCAATAATTATTGTGCGTAAAACCTCTGAATGTAAGCTTCCTATTATTCGCCTTGCCGACAT CCCAGTAAAAGTAGCTTCAGAAAACAATGCTGTCATTAAGGTTGCAATCAAACAGAGGCCGCAGAAGCGGACACAGATTA TGAGCAATGCGAATTCAAGCTCAAGGAAGAATAGTGACTCTAATAAAAGTGTGGAGGAGAGGAAAGAGGAATATAATCGG GCTCGTGCTAGGATCTTCAACTCTAGCAATAATGGTGGTGCAGTGAGTGGGAAGCCAGAATATGAATCAAGGCAGCAGGA CAACTCATTGCATGGTTCCTTGGGGGTTGCTAAGGGGGAAGACAAATCTGCTTCTGTATCTGATGTTAATTCCAGTAGGG GGCTGGTTGATTCTTCTATGAATACCAGTAGGGGGCTGGCCGAGTCTTCTATTAGTGCCGGTAGGGGGCTGGTTGAGTCT TCAATAAATACCAGTAGGGCTAGAAGTAGGGCAGAGAAGGATTCAGTTGGTAGATACAGGCAAAATAATAGGGTTGCTAT ATTCCGAGACCGTGAGGTTGAGCGCAAAGATCCTGATTATGACAGGAACTATGAAAGGTATGTATGCCCTTCACCATATT ATTGATTCATGCACTTGTCTGCTAAAAATTGTGGCTTGTTGTGCTGTTCCCTTTTCTCAAAACGAATGTCTCGAGTTTTG AGACACGAATGATTTGTTGCTGTTACCATTAATGTGATTAGACATTTTTATATGCTTACTTCTAATCATATCACATTTCA TTAATATTTTAGTTATAAGATGCAGACATTTTTATTTATGCACATGTTTGTTTGCTTCTGAAAAAAGAAAATTATCAAAT TCGAACACCATCACTTCTCATTCCCTACTTTAACTATTCAAGGCATTTGGACATACAGTTGGCATACATTAAACTTCTCC CATGCACATTTACAGGATATTGGCTAGCACTTCTGTCATATTTTGAAGAATTAATCTTTTATATGTTTTCTTGTTTGAAG AATAATTGATGACTTTGGTTAGCAGATTATTTCAATTTTTTTTTTTGTCGTTTGCTAGTGCTTTTCAAACCTAGGATATT AAAACTTATGTTGTTGTTTTCATATTAATTCAGCAATGCTGTGTCAATTTTGCATATTTGTAAAGTAGTAATTACCGTTG TCGAAATTGAGATTTTACCTAGGATTGGGAGGGGGTGAAAGGTTGTGGATTTTGTGAAATAGAGATGGTAAAATTCTAAC AAAAATACATAAATGTATTTTAATAAAACTAGAATAGTATAAATCACTAATACCTATTATAATAGAGATTGTATTTCAAA TTAAGACCTGAAACAAGCTAACTCTTGGATCAGAATGTTAACAAATACTTAAGAATCATGAGTGTAAAACTAATGAAGTG TGATAGTTTGCGTTATTAGTTAACCTGGCCAGTGATCTTTTTCCTGTAACTTTCATGGCAGGTATATGCAAAGATTTGAT CCTGGGTTTGGGTTCAATGGAGGACCGTACACAATGCAGCCACTGTATGCACCGGTAGTGAATTACAATACTGAGTTTCC 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ATTTGCACTAGATAGTCTACAATAATGAGATTACCCACTATAATTACAAATCCTTAAATACTAACAGATAAACTTTCATT CACATTACAATTTAAACTTTTGAAGTGTCACTTCTGTCAAAGGCCAGTTCTGCTGAAGTCATGAAATAATGGGTTGTTTA TGATTTTTTTTGAGGTATGCTAACTAAACTCATACTAACCAAATAACTGCATGAACATTAAAAAAAGAAATCTAACAAAA GTGGGAAATATATCATTAGAGCCCTCGAGACAATTCCGAATAATTTTAAACTGTAAGTGTTTATTTGATTTTTTTTTTGA ACTAATGATCTTTATGCAGCAATTTGACCTATTTTATCATGTTATTTGAAAATTGTTTGACTGTTTCTTTGAATACACTT GAATTTTTTTTTGTTCTAGTTGATGATATTTTATCTGGATGTATATATGTGTATAGTCTTCTAAGTTTTTGGCACCACTT TTGCACTTAATGTTGTCAAGTTTTCCTCAGCTGTATTGTTAATTCACTTTATAGTTTCCCATCTATGCTGCTCATGCAGC AATACCATATTTCCAAAGAAAATGCTTTACTTTTTGGGAGCTGGTGGAGATGTATTCGTGTCTTACATGCATCTTATCAT TTAGTTTTCATTTTTCCTTTGGATCTAATTGCACGCTTTTGTACTTGATACTGCAGTCACATCAGCAACCACCTGATGCA AGTTTTGGATTGGCCCGGCCCCGGTGAGGGGCGTGGGCCATGCCTGCACTCAATCAGCTTCAGCCATGCAATTAAGATGA TGGGCTGCTGCCTGCAGCTCCAAATTTCTTTTAGCTGATTAGAGTGCAGGCCATATAGGCCGAGTTTGGCTGGGATGGAT TTGTTTCTGAAAAATCAACTTACCAACATTGTTCCGTTCCTCCCATCTCGGTTTTGCGAGGGTGCTTCTTGCATTTTCCC TCGGTCCATGATCGCTCTTGTGCACATTCAAATTTTTTATGAGGAGCTTTTTAGAGCACATATGCTGCTGTTCATGAAGA AGAGTGAATTGAGCACTTCTTCAGAGCTGAAGAAGCTTGTTCTTGACTTGGATGAAGGTATGCTTTATCTAACCTGCACT GTGAGATTAAATTGTTTTAGTTTGAGTAATTGTTTCTTCCTTATGCTAGAAATTTATCAATTTATTTCTTGAAATTGGGT AAATGAATAAAGTGAAATCATCATCAGGAGCACTTACATATTTCCTCACTACGTTCCTTTTAAAGTAAATTTGTCTTGGG CCTCATCACTTGAATTGTAGTGAAAACTGATTTTATAGCGTTCAGGATGACCTTCAGGATGAATACATGTAATGCTGATG CTACATTTGTTTTAGCTGCCCTTTAATAGATGAAATATCAATTGATATTTTTTTGCACGTGTTTTAATTTTTTTAGCTAT AGCTTCCTGAAGAGCTTAAGGAGTTTCCGATCTTGCTTCATTTGCCTTCAGATTGCAGGAATTTAGTATACTGATGTTAC TTGTCGTTGTTGTTCGTTCAATATGATTGTCATCCTTAATCTTATGTATAATACATGACAAACTTCTATGGACTTGAGAT TGTATATTTAACTACATTCTTACAATCTTTTTCTGCATTTACTTATTATTGTATGGGTTATGTGCTTTCATGTTTTGCCC ATTTCTTTTCATAAAGATTGATGGCGCAGAGCCATACATAAAAGAAAGCTGTTATTTTTACGAGTTTAATTTTCATGTGT AAAGTTTTACCTTTACATTCAATTGTTTCATGTCAAACCACCTCCAAAGGACTTGATTTACTATTTTAACTGAAATCAAA ACTTACTTTTTGATGTGCAAGCAATCATTTGGTGTCACTGTAAGTGTTACAGTCACAATGTATGTACATTAAATCCTATT TTATTGTTATTCTATTTGATGTCTATATTAATCATATCAGGTATTGGTATGAGTAAACATTTTGCTAGATTTTTCTGCCC TTTTTAGAATATATGGTCAAGTAGTATCATATATAATATAAACATTATTGATATATAATCCAAATTAAATTTATAGTAAA TTATTTCTTTTATAACTTATACTTTGAATTTGAAACGAATAAATAAATTATGATGTGTGTATGCAGTACAATTGTTTTGA ATTTGAATCAAAATTAAGGCTCGAGATTGAAATAGGGGAAAATAGAAAATTAGAATTTAAATGTACGAGCAGATGAAGTT TAGAAATTTAATAAATTATAAAATAAAAAACTAAGAAAGAGTAGAAAATAAGTTTAGAAGTAGAATAGGAATTATCTGTT TCAGCAATTTATGATAATAATTATATGTTAATTTTTTCAATTTATGGATCAAAATAAATTAAATTATCACAATTAGAATT TTGAGTATATATATTAAAAATAAGGTCTAGATTAGAAAAGAAATCGAAAACCATCATCTTGTTCCTTCCACCTTGATGCC CAGTCCATTTAGATGTCGCCCATCACTTTGCTCCATTCCATGCCATCAAACTCAACCTCCATTGAGATGTATCGCTCCAA CCATTGCATTAGAATCATTCAACGCCAAACAATCGCAAGCCCTAGCAAATCACCTTGCGTCTTGCACCACCTAATCAAAC TCCCATCTTTGCTTTGCACCCAAACCAACCCAGAAAGCCACCAGCAGCCTCAAATTCATAATTGACTCAAGCCTTGTGAG CCATGGGTTCGAGCAATGACCCCATCCAAACCACCTCCCTCATTTGTGTTGATTTGGCAATGTCGTAGTCACCCCAAAGG TCGACTCCTTCATCCACGACTTCTTCCTCGAGCTCGACACTGTCTTGCCAAGGAGATCGAACCACCATTACCATAATAGA AACCCGACCTAAGAAGCTATGGTCATGGTAGCACGAGTTTGCAAGACAAAGGGTGACAATGTGGGTAAGTGAAAGGTGTC TTTGTCTGACCTAGGAATGAGAAAGCTTGGCATGGGTGGTACGTGGCGGTTGTGTATGTGTGGATGTTACGATGAACCCA TGCTGCTTTAGGTGAGAGTTGCGGTGAGTGATTGGAGGAAAAGAAACTTTATATGACTAGACCCACTACTTGATCCTTGG ACTCTCCCCGTTCATGTCCGTAACCTCAACTCTTATCACTTGAGCTATTATCTGTAAATATTATGCAAGCACTTTACGTC ACTTGATATTATTTAAAAAAAAATCCAGAATCTTTGATGAAAAATTTCAGGGATTAATTTATTTTAAATTTTATATGTTA GAGAGGTGAAAATATTGAACCCAATAAAAAACTGATTTTAGGACATGCAATTAGCATACGTGACACTTTGGAGATAAATT CTCGAATCCGAATGTCATCAAATCAAAATCTATCCCCAATCCCCATAGCATTCTCTCACTCTGCTCCCAATTTCAAATCC CCGTTTCTGAACCCTAACCCTAGCTCATGAAATCGTCTCCACAAACTTCACCTTCGGTCCCAATTGGTCTTCTCTGATGA ACCCTTCACCTCCCTAACCCTAGTAAATCCCCTTTCTCTACAGCAATTCTTCTTCCATGGAGGGCTCTGCAGAGGATTCC AGAGCAGCACCGGAGTCATGGGAGGTCGCCGATTTGGACAACCGCTTCAAATTGATGCTCTCATCCGACAATCACCACGC TGACGGTGCTACTCCTTCTGCTCCGCCTAGTGCCGGTGCCGGCGACAGCGTCTCCGATGACATCATCAACCAGGTTGACC AATTCCTCCGCGACGCGATTCAGAACCCTCGCGAACGCCTTTCAAGTGAGTTTTACTTTTCCCCATTGTAACTAACTGTC TCTGCTTCAATTGATGTTAAAGTAGTCAAATTATCGATGCTTGAATGATTCGCAGTTTTTCGATTGTACTAATTAGGGTT TCTTATTTAATTTACAGTTTTGCGAATGGAGCAAGATATCGAGAAGTTCGTTCGTGATCCGAATCGACAGCAGCTGGAGT TTCAGCAGCTGCCGACGTCCTATTTGCGGTTGGCTGCGCACCGGTTGGCTCAGCATTACTCGTTGCAGTCTATGGTTTTA CTGGACAATAGCTTACCGGATGGTTCCGGGTCAAGAATTATTGTCCACAAGACTCCTGGATGTAGTAAGCTTCCTTGTAT TCGACTCGCTGACATTCCGGTGAAATTGCCGTCGGAAGACAATGAAGTCAGGAAGGTTGCTATTAAACAGAGACCGAAGA AGCAGTCCCAAAGTTTTAGCAATGCAAACTCAAACTCGGAAAAAAATAGGAACTCGAAAAGTGTGGAAGAGAGAAAAGAG GAGTATAATAGGGCCCGTGCTAGGATCTTTAGCTCGAGCAGTAGTAACGGCAGTACTGCGGGCGGGAAGCCTGAACATGA ATCTAGGAAGCAGGATAACACCTTAATTGGTTCGTCGAGGGTTTCGGTTTCTAGGGTGGAAGGAAAATCTGCTTCTGTGT CTGATGTCAGTTCTGGTAAGGAGTCGGTCGAGTCTTCAACAGATTACAGTAGGGCTAGAAGTAGGACAGAGAAAGATTCG ATTGGTAGGTACAGGGAAAGTAGTAAGGTGGCTGTATTTCGGGACCGTGAAGTTGATCGCAATGATCCTGATTATGACAG GAACTATGACAGGTATGTGTGCCTTTTACCATTGTACCATTGTATTTAGTTTTGCATTTTGTCACTTGTCCGTCAGAGGT TGTGGTATTTTTTTCTTGTTCATCAGCCTTATGAAATAAAAGGGTTTGAGAGTCACTGTTGGAGCTGTTAGATGGCTTGG ATATTTTAATAGATTCATTTTTTTATCTGGCGTGTCATTTTCGTGAATATATGAGTTGTGGGGTGCGGACATGATGCATC TGTGTAGCTGTATATTTAGTGTTGATTCACTATGGTAGGAGACCAGGAGCTAACCAGCTTTATGCAGTGAAGATTTCTTC AGTATTTAGATTTGCTTCTGAATAAAAACACTCAAATTCTATTTCTTATCTAACATCACCTGCTATTTCTGGTTCCAACA CTTAAAGAATTTGGAAATTAGATGAGCATCTATTAAACATCTCATGTGCACATTTTCAAGGATATAGGCTTGGCGCCCAT ATTGAAGCTTTATTTTGATATACATTTTATTTTTCAAATATATAATTGATAATAAGTTGTCTTTGGTAAACAGAACATTT CAGATTTCCTCTTCTTTTCCGCAACTCCTTCAAAATGAGGATATTAATTTTTTTGTTATCTTGTTATTTTAATATTTTAA TATCAACATGCAATTTTATATTAACAACAGCTATATATTCTACTGAAATATGTTTTGGGGTTATTATATAATATGTATTG TAACTGATTGTAAGGTGAACGTTTTTGCATATTTGCTGAAATGCCACGGTACCTAAACACCTAGTTTTATTTTCAGTTTG AAAATATCACAGTGGTGTGTGCATTTTTTTTCTGCTCGTACATATGCTAGAAAAAGCCCCTGAAACATCTTGGTGTTACC AATCAGTTGATACTTCAATAATAAACCTGTTTTCAATCAAACAAAATAGAAATAAGAGTATTCTCATTTCTCAGTGTTGG TCCCCAATCCCCATATCCTAACTCCTAAAAACTCTTGAAATAAAGTATGTACTTTAATGCTGCACAATAGATATTCAAGA TTCTAGAGATTTTGATACTTAATATGTACTTCATTCTTGCAACTGTTCTGCTGTAGGTCTCTGCATCCGAATGAAATGCT ATTTAATCTTTTAATGTGCTGACATGTTTGTATGTTACTATGTTCCATAAAAAATTGCAAGTTTAATAATATAAATGTTG AGATGAGGTTAGAGTATGCTGGATTAATCTGATCAATTATTTTTTCCTAACTTCCATTACAGGTATATGCAAAGATTTGA CCCCGGGTTTGGGTTCAATGGTGGTTCATACACCATGCAGCCAATGTATACACCAGTAGTGAATTACAACACTGAGTTCC CACAACTTGGAGTTGGATCCATTCACGGACCCCAGTTTTCTACTGAACACCAACCAGGACCTCTACCACATCATATGCCT GGGTCATGGGCTCCATCATCATCACCTGCTGGAATGGGATACGGACATCCAGAGACCATTTTGTCACCATTTAATCCTAG TCAAGTTGCTTTACGCTCCCCGTCAACTTTGTATTTGCATTCATCTCAATATTCTTCTCAGGGTCCTGGAATGCCTTTTA TCCCTCATGAACACCAACCCTTTTCACAGGTATAACTCCCCCTAAATCTTCAATATTTGGTTGGTCAAATCATATACAAT AAATCAACAAGGTTTATATTTTTCCTTTTCTGTGATTTTATATACCGTTCAGCATACTTGTTGCACTGCATTCATGAGTC GAATTGAAGCAACTTAAAGTACTATTGTTAAGCTTTAGTTTTATGAGAACCTTCAGAGGACAAAGCCATAAAAGGAATGT TAACTATTTTTCCTTTTCTCGTATGCAACTGATTCTAGTGGTGCACTTGCACATACATGCGATGCATACAGAGAGAGAAC CATAATATCATTTCATGAAAACTGTAGGGATGTGTTTCCGTGGCTTTGAATGAGGATATTCCTATTTTTAGATAATTGTG CTTTGTGCATGTGAATTGTGAATTCGTTATGTGCTTGAACAATTTCTAAAATTGACCTGGGGGGTACTTCTTTCTTCAAT GCTAAAAAATTAATTTGGAAATGAAAAGTGAGTTGGAAAATGTCTTTTTTACTTTGCATCTGTGGAAATTAAATATTTGG CATCAGTTGTATAGATGCAGGTCACCTGTCTGATAGAGTAGATGGGTATATATACAAGCGAGGCAGTTGCATCTGCAAAT CTGCTAGCTCATTTGGTTTATCCTATTACTATCCTGTTTCTTGGAAATTCTTCTTCTTTTACCTTTTCTTAAAAAATATT TTTGTTTTCAGTAATGTGTGATAGTCTTGGTCTTGGAGGTGTGGTGTGCATCCCTTCTTTTTCTTGAGGATGTCAGTTTT TCCGCATCTGTTCTGTACCTTGTGTTTTTTTTTGTTCAAGGATAGTGATGTGGGAAAATCTATTGATGCCATCCCCACAC CTACTCTCACCATATTTTAGGTTTATTTTCTGCTTCATTTTGGTCATTGAGGTTTCACATATTTAGAATTTTGCCTTCCA TTTGGATCTGATTTTACTCTTAAATGTCCTTGATGCTGCAGTCTCATCAACCTCCGCCTGATGCAAGTTATGGATTCGCC CGGCCCTGGTGAAGGGGTTGGGCCATGCCTGCACCTGATCAGCCAGTGACATATAGCTGATGGGCTGCTGCAGCTCCAAA TTTCTTTTCGCTGATTGGAGTGCAGGCATACAGGCTGAGGTGGTCTGGAATGGCTCAGAAAGACCAACATTGATCCATTC CTCCATTCTCAGTCTGGCAAAGGATGCTTCTTGCATCTTCCATTACTGTGGCCCTTGTGGACATTTGCATTTTCTGTCAG GAGCTTCTAGAGCGAGCATATTGCTCCTGAAGATTAACAAGGGTGTATTGGGGATTTACCCAGAGCTGATTAAGTTTGTG GCTGACTTGGACGAAGGTATGCTTTGCTTGACCTATGCTGTGGAATACAGTTCTTTTATCTTGGCTGCGCAATTAATTCC TATATCTATTGAAAGTTCATCATTTCCATTTCTTGAAATGGGGTAAATAGATTAGAAAGTGTTGAATCATCAGGGAGACA GGGAGACAGTGACACATTCAAATATTCCTTTACTAAAGTTGTTTGACAAGTTAATTCGCACTTGAAACTTGCCATCTGAA AAATAATGTGAAACAATATTTCAATTCTTCACTTCTAGCCAAGTTTATGCAAACATGTAAAGTAAATGGAGCTATTGTTC AAGTTACCTTTACAGAATGAGTATCAATTACTTATTTTCTGCTTTCGTCGTTTGGCTACAGCTCCCTTAAGAGCTTAAGG GCTCACTGCAAAAGAGTTTGGCGTGCTCATATTGCTGGAATTCTTGATGCTGAGATTCAAGTGGAATTTCTGAAGATCTA ATCGCGTGTCGCAATGCTACAGTATGGTCTGATGAAATTACATGTTGTACATGACCTTTTGTGGACTGTGATTGTATATT AAACTATTTAACTTTCCCTTTTTTAGTTTGGATTTCATTGCTATTTATCTTTTAGCTTTTCGTGCAAACCATGAGGTGCT CATTGAGTTATTTGCTTACAATTTCCCCCTCCTGTTTTTATGTAAATCACTTAATCGAAATACGTAATCTTATTCTGCGT GGATACATTTTAGTGGTAGTATGTGAGATGGTTTCTGCAGAGGATTTGAGCCGAAAAGAGTTTGTTTGGATTGACAATTT TGCCATTTTTGAAAAATCAAGTGTGTTAGCATGCATGCATGCGCTATTTTATTCGAGAGTTATCCATAAGTAAAATGTGT TTTCAAAGGTTAAAAGTGGTTTGACGAAGATAAAAGTTCAAAAAATGGTGACCAGCAGATGATTTATTTTTGTAACAAGT TATTTCTTTTGCATATAATCCTGATTTGATGTGGATTGTTAAATTT
CDS sequence (LotjaGi5g1v0267500.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAGGGCTCTGCGGAGGATCTCGGAGCCCCGGAGTCATGGGAGGTCGCCGATTTGGACGAGTCCATGAACCGCTTGAA CCTCTTGCTCAAGGATTCCAAGCCGCCTCCTCGCGACCACACCGATGATTCTCCTCCTCCTTCGTCTAGTGGTGATAAGG TCTCTGATGATGCCATCAACCAGGTTGATCAGTTCCTTGGTGAAGCGATTCAAAACCCTCGCGAACGCCTTTCAATTTTG CGGATTGAGCAAGATGTTGAGAATTTTATTCGTGATCCTAATCAACAACAGCTTGAGTTTAAGGAGCTTCCAACATCCTA TTTAAGGTTGGCTGCACACCGAGTGGCTCAGCATTATTCGTTGCAGTCAATGGTTTTACTGGATAATAGTTTACCGGATG GTTCTGGGTCAATAATTATTGTGCGTAAAACCTCTGAATGTAAGCTTCCTATTATTCGCCTTGCCGACATCCCAGTAAAA GTAGCTTCAGAAAACAATGCTGTCATTAAGGTTGCAATCAAACAGAGGCCGCAGAAGCGGACACAGATTATGAGCAATGC GAATTCAAGCTCAAGGAAGAATAGTGACTCTAATAAAAGTGTGGAGGAGAGGAAAGAGGAATATAATCGGGCTCGTGCTA GGATCTTCAACTCTAGCAATAATGGTGGTGCAGTGAGTGGGAAGCCAGAATATGAATCAAGGCAGCAGGACAACTCATTG CATGGTTCCTTGGGGGTTGCTAAGGGGGAAGACAAATCTGCTTCTGTATCTGATGTTAATTCCAGTAGGGGGCTGGTTGA TTCTTCTATGAATACCAGTAGGGGGCTGGCCGAGTCTTCTATTAGTGCCGGTAGGGGGCTGGTTGAGTCTTCAATAAATA CCAGTAGGGCTAGAAGTAGGGCAGAGAAGGATTCAGTTGGTAGATACAGGCAAAATAATAGGGTTGCTATATTCCGAGAC CGTGAGGTTGAGCGCAAAGATCCTGATTATGACAGGAACTATGAAAGGTATATGCAAAGATTTGACCCCGGGTTTGGGTT CAATGGTGGTTCATACACCATGCAGCCAATGTATACACCAGTAGTGAATTACAACACTGAGTTCCCACAACTTGGAGTTG GATCCATTCACGGACCCCAGTTTTCTACTGAACACCAACCAGGACCTCTACCACATCATATGCCTGGGTCATGGGCTCCA TCATCATCACCTGCTGGAATGGGATACGGACATCCAGAGACCATTTTGTCACCATTTAATCCTAGTCAAGTTGCTTTACG CTCCCCGTCAACTTTGTATTTGCATTCATCTCAATATTCTTCTCAGGGTCCTGGAATGCCTTTTATCCCTCATGAACACC AACCCTTTTCACAGTCTCATCAACCTCCGCCTGATGCAAGTTATGGATTCGCCCGGCCCTGGTGA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0267500.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MEGSAEDLGAPESWEVADLDESMNRLNLLLKDSKPPPRDHTDDSPPPSSSGDKVSDDAINQVDQFLGEAIQNPRERLSIL RIEQDVENFIRDPNQQQLEFKELPTSYLRLAAHRVAQHYSLQSMVLLDNSLPDGSGSIIIVRKTSECKLPIIRLADIPVK VASENNAVIKVAIKQRPQKRTQIMSNANSSSRKNSDSNKSVEERKEEYNRARARIFNSSNNGGAVSGKPEYESRQQDNSL HGSLGVAKGEDKSASVSDVNSSRGLVDSSMNTSRGLAESSISAGRGLVESSINTSRARSRAEKDSVGRYRQNNRVAIFRD REVERKDPDYDRNYERYMQRFDPGFGFNGGSYTMQPMYTPVVNYNTEFPQLGVGSIHGPQFSTEHQPGPLPHHMPGSWAP SSSPAGMGYGHPETILSPFNPSQVALRSPSTLYLHSSQYSSQGPGMPFIPHEHQPFSQSHQPPPDASYGFARPW
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 25 | 55 | 31 | - | – | |
| PANTHER | 27 | 468 | 442 | 3.1E-120 | – | |
| PANTHER | 27 | 468 | 442 | 3.1E-120 | – | |
| Gene3D | 48 | 179 | 132 | 7.6E-35 | ||
| SUPERFAMILY | 54 | 178 | 125 | 9.81E-25 | ||
| SMART | 59 | 144 | 86 | 0.001 | ||
| CDD | 75 | 144 | 70 | 2.1685E-19 | – | |
| ProSiteProfiles | 76 | 145 | 70 | 11.27 | ||
| Pfam | 79 | 124 | 46 | 1.5E-10 | ||
| ProSiteProfiles | 148 | 220 | 73 | 12.798 | ||
| Pfam | 170 | 219 | 50 | 9.9E-12 | ||
| MobiDBLite | 178 | 282 | 105 | - | – | |
| MobiDBLite | 178 | 195 | 18 | - | – | |
| MobiDBLite | 196 | 212 | 17 | - | – | |
| MobiDBLite | 213 | 242 | 30 | - | – | |
| MobiDBLite | 254 | 282 | 29 | - | – | |
| MobiDBLite | 453 | 474 | 22 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Nucleic acid binding | Interacting selectively and non-covalently with any nucleic acid. |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0267500.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…