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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0275500 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0275500.1 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | ABC1-like kinase; TAIR: AT2G39190.2 Protein kinase superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q55680|Y005_SYNY3 Uncharacterized protein sll0005; TrEMBL-Plants: tr|I1NHF2|I1NHF2_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0275500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:58979262..58996819) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TACATGGTTTTTTTATTTTATTTCCATTTATACATGAATGGAACTGTTAGGTAAACATATATTGAAGGGTACGGGTTTAT ATTCGGTTGAGTCTAGTCAATTGCAGGGCACAGAGATAACAGATATGAAGTTTGTTCCTTTTGATTCGTGATGTGCCCAA AAGGGAAGTAGTGGGCATAGTTTCAACCCAAATCCATGATCCTCCCTCAAGGCATATGCTACCTGCCATATTAAAGTGCA CAGGTGAGGGGGGCCAATGTCCCTGACTTTTTTTTGCCAGTCTCATCTCACATTTCATCCTTTCAATTCATCTTTCTTGG ATATTGATCTATTTATCACTGTAATGGTGTTATCATCATTCTCTGCATTCAATTCGTGTGTCAGTCAATAATTTTATTTT ATTTTTCACAGACTCATACTGCACATGCACCTCCAATCATAATAATTATTGGTGTTGAGAATCAAAAGACAGTGAGGACG AGAGACCAAAGGTGGTAATTGAGACATGCGTGGGTCAATGAGAATATGGTCATGAAAATATATAGCTTTATCCTTTTCTA ACAAAAAACTTAAAGCTTGTTTGCAGAGTTTCAAACTGTGGTCCCTAATTATTGTAAGTGCGGCCTAAATTAACGGGTTT TGGAGTCCTCACATCAACATCACAACCGCAATCACAGTCGCATCGCTCCACATTCGTCCACAATTCTGCAATATAACGGT AACTACAATCAGAACTGCAATTTAAAACCCTACTTGTTTGAATCAGCTTCATAACTATTTGCTGAAGTGGTTTTAAACAT GAAATTACTTATATATGGCTCTTTCTTGATTTAATTAGTTTATTTTTCAAGAATACTGGTTAATTTATTTTAACAGGATA AATCTCTCCATTAATCCACACTTTGCTTTTTCTTGCATATGCATGTCTATTGTGACGTGACACAAGTCTTCTAGCAAGTT 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GCAAAGGTGACACAACAAATGTGAAAGATATAAAGAAAGATCTTAAGAAATGAAAAGATTATTATGCATCACTCTGATAA CAGTTTTGTTAAAAATTGTATCATAATCAACTCAAATATGATTGTAGCACATGATAGCATAAAAAATCATATGAAATGAG AAGATTAATATAAAGTGCATTACTCCAACAAATGCTGTTACTCATAAATCATAATAGCCAATAGGGTTGTCTCATGTGCC TGGTAATCCCAAACAAAATTACTTAAAAAGCTTCCAAG
CDS sequence (LotjaGi5g1v0275500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCGACGGTGATAGCACCACCGCCCACACTCTTCTCCGTGCGCGCTGCAACGGCGTCGTCGTCGCGGAACAAGAAGAA GCAGAAGAAGCCGCGAGCTCTGGGTAACTTCGACCACATGGCTCATGTGGTTAGCAAGGACATGGAGTTTCTCAAGAGAG GGATTTATAAAGGAGTTGCGTGGGCTAATGATGCTTTTCGCATTCCCCAGATTGCTAAGAAAGTTGATGACCTTGTTTGG CTTCGTAATCTCGAAGACCCTCTTGCTGCTTCTGTTTCTGCGCCTTCTTGGCCTCAGCCTTGGTACCCAGGACTTACTGG AGTGGATTTGCTCATGTATGATCTCAAAGCCTTGGAAGCATATGCTGCATACTTCTATTATTCGTCTAAGATTTGGTCTA AGCCTCTCCCTGAAGCTTATGATCCTGAGGATGTTGCTCACTATTTTAATGCCAGGCCCCATGTGGTGGCTCTTCGTGTT CTTGAGGTATTTTCCTCCTTTGCCTCTGCTGTGATCAGTATTCGAACTTCAAGGTTTAGAAAGTTTCTAGGGAGAAGTCC AGAAGAAGATGTAGATGATAAAACATCTCAATATAATTTTGGGATGGTGTTAAAGGAAACAATGCTCAATCTTGGCCCCA CCTTCATAAAAGTTGGTCAGTCCCTTTCCACAAGGCCAGATATCATTGGTGTTGAGATGTCCAAGGCATTGTCAGAACTG CATGATCAAATCCCTCCTTTTCCCAGGAATGTTGCTATGAAGATCATTGAGGAAGAACTGGGAGCTCCTCTGGAATCATT CTTCAGTTACATTTCTGAGGAACCTATAGCTGCAGCATCATTCGGTCAGGTTTATTTTGCCCGTACTACTGATGGTGTTA ATGTTGCGGTAAAAGTTCAGCGCCCTGATTTGCATCATGTGGTGGTGCGGGATATCTACATCCTTCGCCTTGGGTTGGGG CTTCTGCAAAAGATTGCGAAGAGAAAGAGTGACCCTCGCGTGTATGCTGATGAGCTTGGGAAAGGTTTTGTTGGTGAATT GGATTACACTTTAGAGGCTGCAAATGCTTTGAAGTTTCGGGAAGTTCACTCATCATTTGCTTTCATGCATGTGCCAAAAA TATTTCGACATTTAAGTCGAAAGAGAGTTCTGACCATGGAGTGGGTGGTTGGTGAAAGTCCAACAGATTTGGTCTCTGTA TCTACTGGTAACTCTCGTGGAAATGTCCCTGAATATTCAGAAAGGCAGAAAGTAGATGCAAAAAGGCGTCTTCTGGATCT GGTCAACAAAGGTGTTGAAGCAACATTGGTGCAACTTCTTGAAACTGGCTTAATACATGCTGATCCCCATTCTGGCAACT TGCGCTATACTTCCTCAGGACAATTGGGGTTTCTGGATTTTGGTTTGCTCTGTCAAATGGAAAAAAGGCATCAGTTTGCT ATGCTGGCTTCAATAGTTCATATAGTAAATGGTGACTGGGCATCCCTTGTACGTGCTCTGATTGACATGGATGTTGTGAG GCCAGGGACAAATATCCGACTTGTTACCCGGGAACTGGAACAGGCCTTGGGAGAAGTAGAATTTAAAGAAGGAATTCCTG ATGTAAAGTTCAGCAGGGTTCTGGGAAAGATTTGGTCTGTAGCACTCAAGTATCATTTCCGTATGCCACCATATTATACC CTTGTCTTAAGATCCCTAGCTTCATTCGAAGGTTTGGCTATAGCTGCAGATCCAAATTTTAAGACCTTTGAAGCTGCATA CCCTTATGTTGTTCGGAAACTTCTCACAGAAAATTCCGCTTCAACCAGGCAGATATTGCATTCGGTCCTTCTAAACCGAA AGAGGGAGTTCCAGTGGCAAAGGCTTTCCATGTTCTTGAGGGTAGGGTCAACCAGGAAAGCCTTGCAACTAGTGGCATCA AATAATGAGACTTCCCTTGACCATTTACCAAATAAGGCCACTGGTAAATTTGATGTTGCGTACTTGGTCTTGAGGCTCTT ACCATCCAAAGACGGTGTTGCTCTCAGAAGACTTCTCATGACTGCTGATGGAGCTTCATTAATCAAAGCCATGGTCTCAA ATGAGGGAAAGTTTTACCGCCAACAACTTTGCAAGCTCATTACTGATGCACTGTACCAATGGATGATCAAATTACTTGGA CAAGGAATTTCAGCTACTCAGTATTCTGGGGCGATATTGGTTGATCGACCTTACAACAAAGAACCAGGTCTATCCCCTGG ATCATCCTTGCCTGCATATGATTATGACTCCATCTTTAGAGATCGACGGCTTAGGGTGATATTTTCTAAGGTTCTAAAAT CTGCCAGTAGTGATAAAATATTGATGCTGCGCTTCTGCTGGGCCTCCATTCTTATAACTATTACAGCTTCAACTTTGGCT TTGCACCGGGTTGTCATGTCTCTGTCTGAAGTTTACTTGGGTTCTATATTCGATGCTCCTAAAAGATATGCAGTCAGTGC ATGA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0275500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MATVIAPPPTLFSVRAATASSSRNKKKQKKPRALGNFDHMAHVVSKDMEFLKRGIYKGVAWANDAFRIPQIAKKVDDLVW LRNLEDPLAASVSAPSWPQPWYPGLTGVDLLMYDLKALEAYAAYFYYSSKIWSKPLPEAYDPEDVAHYFNARPHVVALRV LEVFSSFASAVISIRTSRFRKFLGRSPEEDVDDKTSQYNFGMVLKETMLNLGPTFIKVGQSLSTRPDIIGVEMSKALSEL HDQIPPFPRNVAMKIIEEELGAPLESFFSYISEEPIAAASFGQVYFARTTDGVNVAVKVQRPDLHHVVVRDIYILRLGLG LLQKIAKRKSDPRVYADELGKGFVGELDYTLEAANALKFREVHSSFAFMHVPKIFRHLSRKRVLTMEWVVGESPTDLVSV STGNSRGNVPEYSERQKVDAKRRLLDLVNKGVEATLVQLLETGLIHADPHSGNLRYTSSGQLGFLDFGLLCQMEKRHQFA MLASIVHIVNGDWASLVRALIDMDVVRPGTNIRLVTRELEQALGEVEFKEGIPDVKFSRVLGKIWSVALKYHFRMPPYYT LVLRSLASFEGLAIAADPNFKTFEAAYPYVVRKLLTENSASTRQILHSVLLNRKREFQWQRLSMFLRVGSTRKALQLVAS NNETSLDHLPNKATGKFDVAYLVLRLLPSKDGVALRRLLMTADGASLIKAMVSNEGKFYRQQLCKLITDALYQWMIKLLG QGISATQYSGAILVDRPYNKEPGLSPGSSLPAYDYDSIFRDRRLRVIFSKVLKSASSDKILMLRFCWASILITITASTLA LHRVVMSLSEVYLGSIFDAPKRYAVSA
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 16 | 16 | - | – | |
| Phobius | 1 | 1 | 1 | - | – | |
| Phobius | 2 | 12 | 11 | - | – | |
| Phobius | 13 | 16 | 4 | - | – | |
| Phobius | 17 | 780 | 764 | - | – | |
| PANTHER | 19 | 822 | 804 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 19 | 822 | 804 | 0.0 | – | |
| CDD | 240 | 500 | 261 | 1.66392E-85 | – | |
| SUPERFAMILY | 242 | 471 | 230 | 8.45E-25 | ||
| Pfam | 258 | 374 | 117 | 2.3E-29 | ||
| ProSiteProfiles | 270 | 626 | 357 | 9.305 | ||
| Pfam | 414 | 496 | 83 | 1.2E-5 | ||
| Phobius | 781 | 801 | 21 | - | – | |
| Phobius | 802 | 827 | 26 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein kinase activity | Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP. | ||
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. | ||
| Biological process | Protein phosphorylation | The process of introducing a phosphate group on to a protein. |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0275500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…