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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0351900 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0351900.2 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Transcription factor jumonji (JmjC) domain protein; TAIR: AT1G62310.1 transcription factor jumonji (jmjC) domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q9SSE9|JMJ25_ARATH Lysine-specific demethylase JMJ25; TrEMBL-Plants: tr|K7LLZ6|K7LLZ6_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0351900 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:66784765..66799103) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GCTTTTGATAAACAGTTGTACATTCATCACACTGACTTCATGACTCTCCTCACCAAAGCTGTTAACCTACACGTTGTTTC TACTTTCTACCAAAATGTTCCACAGTTCACTCATCAACCCATGTCAGAATCAGAACACAAATAAGGAGCAGGAAATTTTC TTCATTCCTATAATTACCAGTACAACATCTAAATTTAGCAATTCAATCAGGGATCCTTTGTAATTTGTCATTTACTCTTA ACATTTGCATTGCTGGATTATAAAGACTCTAATCACATATGAGAACAATTGTTTTCCTTTTTTTAATAATAAAAATAAAA AAGGTAAATTAAATCACCTAAAAATTGTGAGCAATAATGAAATATATTAACCCAAGTGTGTGATTTTTTAATTTCTATGG ATTAGAATTAATTAGGGTAATCTTTCCCCAAATTTAGTGTTGGCGGTAGATTTGAAAACCTTCCCTCTTCTTCCGTTTAT TATTTATTTTCCCCAAAACCTTGTACTTGTTCGTGTTCTGTGATGTGTGGAGTGGTTTCGTAACATAACCATAACCTAGG TTTGTGTTTAAAACCAAATCCAAATGTTGCAGTTCAGTTAACTAGGGTTCGCTTCAACATTCCATTCTCCTGATTCAGAT TCTCGTTTCATATTCCCCTGTTTTCTGCGAACTTGTTCACAAACAAACAAACAATCCCTTGTTTCTTTGTCTTCGAACTT TCCACATGGCGCCGCGTGGAAGGCCGAAGCGGCAACCAACACATGTTCCGGCTGAGAATGTTGGTGGGGTAGCAGATTCT TCTGTTCCAGAGGAAGAGATGAAGGAAAAAATTGATGGGTCGGTGGTGGTTGACAAGGAGGAACAACCCGTTTCAAATCA TGACTTGGGTGTTCATGGGGGTGCTGGTGCTAAGAAAGTGAAGTTTGCAGAGGGTGTTGAGTTTTTGAATGGGGAAGGTT 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CDS sequence (LotjaGi5g1v0351900.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCGCCGCGTGGAAGGCCGAAGCGGCAACCAACACATGTTCCGGCTGAGAATGTTGGTGGGGTAGCAGATTCTTCTGT TCCAGAGGAAGAGATGAAGGAAAAAATTGATGGGTCGGTGGTGGTTGACAAGGAGGAACAACCCGTTTCAAATCATGACT TGGGTGTTCATGGGGGTGCTGGTGCTAAGAAAGTGAAGTTTGCAGAGGGTGTTGAGTTTTTGAATGGGGAAGGTTCTGGT AAAGATGGTGGTGTTGAAGAAGCAGGTCCTTCTTCTGCTCCTGTTGAAGTTGGTGAGAAAAAGAGGCGTGGCAGAAAGCC TAAAGTGAAACAACCCATTTCAAATCAAGACTTGGGTGTTGATGGTGGTGCTAAAGAAGTGAGCTCTGTAGAGGGAGTTG AGTTTTTGAACGGTGAAGGTTCAGGTAAAGATGGTGGTGGTGGAGAAGGAGGTCCTTCTTCTGTTTCTGTTAAGGTTGTT GTGGGAAAGAAGCGTGGCAGAAAGCCTAAAGGGAAAAGGGTGGCCAGGAAGAAGGTGGATGGGGGTGTTATGGAGCAGAG GGGGAGTAACAAGAAGGAACAACCCATTTCAAATCAAGACTTGGGTGTTGATGGAGGTGCTAAGAAAGTGAGCTTTGTAG AGGGTGTTGAGTTTTTGAACGGTGAAGGTTCGGGTAAAGATGATGGTGGTGTGGGAGAAGGAGGTCCTTCTTCTGATTCT GTTCAAGATGGTGAGAAAAAGAGGCGTGGCAGAAAGCCTAAAGTGGAAAGGGAGGCCATGGAGAAGGTGGATGGGGGTGT TACAGTCCTTATGGAGCAGAGGCGTAGTAGCAGACAAAAGAGGAAGATCTTTGTGATGGATTATATCGACGAGGAAGAAG ATGTTGAGGGCAGAAAAATGAAGAAACGAGGTCGGAAGAAAGAAGCGAAGGCCATTTACGAAGTTGGGTCTAGTTCTAAG GTAAGTGGAGGAAATAAGAGAGGTCCTAAGCCGCGCAAAGCTGCAGTTAGTGAGGGAAAGGTTGAATCTAATGGGAGTGA AGTCAACAAACAGGAGTTGCCAAAAATCAACAAGTTTGATCCTAAGTGGATTGAAGAGGAGTCCTTAATGTGCCATCAAT GTCAAAGAAATGATAAAGGCCGGGTTGTGAGGTGCAAGAATTGTAAACGGAAAAGATTTTGCATTCCCTGTTTGAAGCAA TGGTACCCTAACTGGAACGAGGATGATATTGCTAAGGCATGTCCTGTGTGCCAAGGTAATTGCAACTGCAAAGCTTGCAT GCGTTCTGGTAATCTTCTTGAAAAAGTGAAGGATGAAGGAGCAACCAATGAAGGCAATAAGGTGGAGCTCAATAAGTATC TGCTGAAGCATCTTCTTCCGTATTTAAGACAGTTGGATGAAGAACAAAAGATGGAGAAGGAGATAGAAGCTAATAGACAA GGGCTCTCACTCTCAGAGCTGAAAATAGAAGATGCAGATATCGCTAATGAGCGCGTGTACTGTGACAACTGCAAAACATC AATATTTGATTACCACAGAAGCTGTACAAAATGCTCGTTTGACCTTTGTCTTATCTGCTGCCGTGAGCTACGCAGTGGGC AACTTCTTGGTGGTGCAGATCCAGTTCAGCTGGAGTTTGTCTTCCGTGGTCGTGGTTATTTGCATGGTAAAAAAGAGGAT AAAGAGGTAACTCAAAATATATCACTTACAGACGCGGTTCAATGGTCAAGATCTGAGTGGCATGCTCACAGTGATGGTAG CATTCCCTGTCCAAAAGCCAATCATGAGAGTAACCATGGTTTTCTTGAGCTGAGAAGCATATGTTCTCGTCCTGGCTTAT CAAAAAAAAAGAAATGTTCTCATCCTTATTCCATCTCTGAGTTAGTATGTAAAGCTGAAGAACTTGCAAAAGCATATAAG GTTCAAGATGATGGGGATACTCTTGATAACTGCTGTTCTTGCTTGAAGCTTGATAGAAACACAGATGGTGAATCTATTTA TATGAGGAAGGCAGCTTCTCGTGAAGATTCCAGTGACAACTGTTTATACTGTCCTAGCGCTGTTGACCTACAGCATGAGG ACTTTAGACATTTTCAATTGCATTGGAGCAAAGGCGAGCCTGTAATTGTTAGCAATGTTCTTGAACATGCATCTGGTTTA AGCTGGGAGCCTCTTGTCATGTGGCGTGCATTCCGTCAGATGTTTAAGACCAAGCACGATAGACATTTGGATGTGAAGGC AATTGATTGTTTAGATTGGTGTGAGGGAGAGATTAATATCCACCAGTTCTTTACTGGGTATACAAATGGTCGTGATGATT GGCTCGATTGGCCTCAGATATTGAAATTAAAAGATTGGCCACCTTCTAATTTATTTGAGGAACGTTTACCTCGTCACTGT GCTGAATTCATATCTTCCTTACCCTTTAAAGAATATACGAATCCATACAAAGGTGCTCTTAACCTGGCTGTGAAGTTGCC CAAGGGTTGTATAAAGCCAGACATGGGTCCAAAGACATATATTGCCTATGGATTTGCTCAGGAGCTTGGGCGTGGTGATT CTGTGACTAAGCTTCATTGTGATATGTCTGATGCTGTAAATGTGTTGACGCATGTTGCTGAAGTTCAATTGAAACCTAAT AACATCACTGCTATTGCTAAGCTGATGCGAAGCCACCTCGAGCAAGACAAAAAGGAGCTACTTACAGATAGTCAGGATGG AGAAACTAATGTTGACACGCCTGATAATTCATCCTCTACCATAAATCCCCCATACGAGCAAAATAATGTCGTAGTCTTGG AAAATAAAGGTGAACTATTTGATGGGAAAGTGACAATGAAAGACGAAAATGGTATAATGGTTGCTGGGGATGCTTTAGGA GGCGCTCTTTGGGATATTTTTAGGAGACAGGATGTACCTAAGTTGCAGGAGTACTTAAAAAAGCATTTCAGAGAGTTCAG GCATGTCCACTGCAGTCCTTTAACGAAGGTTGTTCATCCCATCCATGATCAGACCTTTTATTTGACTATGGAGCATAAGA GGAAGCTTAAGGAGGAGTATGGAATTGAGCCGTGGACTTTTGTACAGAAGCTAGGCGATGCTGTTTTTATTCCAGCTGGT TGTCCTCACCAAGTTAGAAACCTGAAGTCATGCATTAAGGTTGCTCTTGATTTTGTGTCGCCTGAAAATGTTGGTGAGTG CTTCCGTTTAGCAGAAGAGTTTCGCACGCTTCCCATAAATCACAGGTCGACTGAGGATAAATTGGAGGTGAAGAAAATGA CTTTGCATGCTATGATTGATGTGGTCCAAAACTTGGAGAAAGCAAGGTCCAGGGAGACCAAGGTTCCATCTTAA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0351900.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAPRGRPKRQPTHVPAENVGGVADSSVPEEEMKEKIDGSVVVDKEEQPVSNHDLGVHGGAGAKKVKFAEGVEFLNGEGSG KDGGVEEAGPSSAPVEVGEKKRRGRKPKVKQPISNQDLGVDGGAKEVSSVEGVEFLNGEGSGKDGGGGEGGPSSVSVKVV VGKKRGRKPKGKRVARKKVDGGVMEQRGSNKKEQPISNQDLGVDGGAKKVSFVEGVEFLNGEGSGKDDGGVGEGGPSSDS VQDGEKKRRGRKPKVEREAMEKVDGGVTVLMEQRRSSRQKRKIFVMDYIDEEEDVEGRKMKKRGRKKEAKAIYEVGSSSK VSGGNKRGPKPRKAAVSEGKVESNGSEVNKQELPKINKFDPKWIEEESLMCHQCQRNDKGRVVRCKNCKRKRFCIPCLKQ WYPNWNEDDIAKACPVCQGNCNCKACMRSGNLLEKVKDEGATNEGNKVELNKYLLKHLLPYLRQLDEEQKMEKEIEANRQ GLSLSELKIEDADIANERVYCDNCKTSIFDYHRSCTKCSFDLCLICCRELRSGQLLGGADPVQLEFVFRGRGYLHGKKED KEVTQNISLTDAVQWSRSEWHAHSDGSIPCPKANHESNHGFLELRSICSRPGLSKKKKCSHPYSISELVCKAEELAKAYK VQDDGDTLDNCCSCLKLDRNTDGESIYMRKAASREDSSDNCLYCPSAVDLQHEDFRHFQLHWSKGEPVIVSNVLEHASGL SWEPLVMWRAFRQMFKTKHDRHLDVKAIDCLDWCEGEINIHQFFTGYTNGRDDWLDWPQILKLKDWPPSNLFEERLPRHC AEFISSLPFKEYTNPYKGALNLAVKLPKGCIKPDMGPKTYIAYGFAQELGRGDSVTKLHCDMSDAVNVLTHVAEVQLKPN NITAIAKLMRSHLEQDKKELLTDSQDGETNVDTPDNSSSTINPPYEQNNVVVLENKGELFDGKVTMKDENGIMVAGDALG GALWDIFRRQDVPKLQEYLKKHFREFRHVHCSPLTKVVHPIHDQTFYLTMEHKRKLKEEYGIEPWTFVQKLGDAVFIPAG CPHQVRNLKSCIKVALDFVSPENVGECFRLAEEFRTLPINHRSTEDKLEVKKMTLHAMIDVVQNLEKARSRETKVPS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 1 | 35 | 35 | - | – | |
| MobiDBLite | 74 | 204 | 131 | - | – | |
| PANTHER | 117 | 1113 | 997 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 117 | 1113 | 997 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 161 | 175 | 15 | - | – | |
| MobiDBLite | 218 | 260 | 43 | - | – | |
| MobiDBLite | 240 | 260 | 21 | - | – | |
| MobiDBLite | 317 | 348 | 32 | - | – | |
| Pfam | 366 | 431 | 66 | 1.7E-6 | ||
| ProSiteProfiles | 371 | 418 | 48 | 9.199 | ||
| SUPERFAMILY | 692 | 1100 | 409 | 8.65E-36 | – | |
| SMART | 796 | 1075 | 280 | 2.7E-73 | ||
| ProSiteProfiles | 815 | 1075 | 261 | 27.686 | ||
| MobiDBLite | 901 | 924 | 24 | - | – | |
| MobiDBLite | 906 | 924 | 19 | - | – | |
| Pfam | 960 | 1058 | 99 | 1.8E-15 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi5g1v0351900.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…