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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0365400 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0365400.2 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Importin-like protein; TAIR: AT2G31660.1 ARM repeat superfamily protein; Swiss-Prot: sp|F4IRR2|SAD2_ARATH Importin beta-like SAD2; TrEMBL-Plants: tr|I1KWS2|I1KWS2_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0365400 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:67998755..68016226) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AAAGGAAAGAAAAAGAGTGGAAAGCGAGATGAGTTTGTGACCTGGTCTATTATTTCCATTTATTAGGATTAGGATGTATA GGATGTATAAGAAGAGTCCTGACTAAACCCTATACACTAGACTAGAGTGAGTCTGCAAGCTGCTCGGAGATGGATGTTGG TGTTGTCCTGCAAGCTGCTCTGAGTCCAAACCAGGATGAACGGAAGGCTGCTGAGCAACGCTTGGAACAAATCCAATACG CCCCTCAGCATCTTCTCAAGCTCTTACAAATCATCGTCGAGGCCAACTCTGACATCGCCCTCCGACAAGTAGCCGCCATT CATTTCAAAAACTTCATCGCTAAGAACTGGTCTTCTTCTCACCATCACCAGATCTCTCTCCCTGATAAAGACCTTGTCAG GAACCACACTCTCCTCTTTCTTCCTCAACTTCCTCCTTTGCTCAGGGTGCAAATTGGCGAGTGTCTCAAAACAATTATAC ACTCTGACTATCCTGACCACTGGCCTCATCTCCTTCACTGGATCAACCATAATTTACAGGATGATCAACACCTCTTCGCT GCTTTGTTTCTGCTGCGAATCCTTTCTAGTAAATATGAGTTAGTTCTTCTTCATTCGGTTACTTATTGCTTATACTTGAA TTGCATTTCGTCTATCTTTTTCAACAAATTGATTCTTCCCAGGTTCAAGTCAGACGAGGAGAGGACGCCCGTCACTCACA TTGTTGAGGAGACATTTCCTCACCTTCTCAACATATTGACCAGGCTTGTCCACATTGCTAATCCATCACTTGAAGTAGCA GACTTCATCAAGCTTATCTGTAAAATATTCTGGTCCTCCATATATGTATGTCTTCTCTTTTTCTAACTTCCAATCTTTTT TTGTTTGTTTGGGTGGGGGTTGGTGTTTGAACTTGCTATTGCTTTATCATTTGCAGCTGGCTCACTTAATTTTATACTTT 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AAACAACCTAAAAAAATCAGGTACTTTTACGGCGGGCCATGTAAAATAGTGGTCCACCAATGCAAAAAAAAAATACCATC AATCCCTCCCACTCAATTCCCGTCTTTTAACCTCAAAATGTCATTCGAATTATTGCAGTCATGACATGACCCTAGCGGCA AAGGGTTGATGCATTCTTGGGTTTTCTTTTGC
CDS sequence (LotjaGi5g1v0365400.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGATGTTGGTGTTGTCCTGCAAGCTGCTCTGAGTCCAAACCAGGATGAACGGAAGGCTGCTGAGCAACGCTTGGAACA AATCCAATACGCCCCTCAGCATCTTCTCAAGCTCTTACAAATCATCGTCGAGGCCAACTCTGACATCGCCCTCCGACAAG TAGCCGCCATTCATTTCAAAAACTTCATCGCTAAGAACTGGTCTTCTTCTCACCATCACCAGATCTCTCTCCCTGATAAA GACCTTGTCAGGAACCACACTCTCCTCTTTCTTCCTCAACTTCCTCCTTTGCTCAGGGTGCAAATTGGCGAGTGTCTCAA AACAATTATACACTCTGACTATCCTGACCACTGGCCTCATCTCCTTCACTGGATCAACCATAATTTACAGGATGATCAAC ACCTCTTCGCTGCTTTGTTTCTGCTGCGAATCCTTTCTAGTAAATATGAGTTCAAGTCAGACGAGGAGAGGACGCCCGTC ACTCACATTGTTGAGGAGACATTTCCTCACCTTCTCAACATATTGACCAGGCTTGTCCACATTGCTAATCCATCACTTGA AGTAGCAGACTTCATCAAGCTTATCTGTAAAATATTCTGGTCCTCCATATATCTGGAGATTCCAAAGCTTTTGTTTGATC AAAATGTATTCAATGCTTGGATGGTGCTGTTTTTAAATTTATTGGAGAGGCCTGTTCCCTTGGAAGGTCAGCCTGTTGAT CCTGATCTTCGAAAATCATGGGGTTGGTGGAAGGTCAAAAAATGGACAGTTCACATTCTAAATAGGCTCTACACTCGATT TGGTGACTTGAAGCTACAAAACCCTGAAAACAGAGCGTTTGCTCAAATGTTTCAAAAGCATTATGCAGGGAAGATTTTGG ATTGCCACTTAAATCTGTTGAATGCCATTCGAGTTGGTGGGTATTTACCTGACAGAGTCCTCAACCTGGTTCTTCAATAT CTGAGCAACAGTATTTCAAAGAATAGCATGTACACTGTGCTGCAACCTCGGCTTGATGTTCTTCTTTTTGAAATAGTTTT CCCTCTCATGTGCTTCAATGATAATGATCAAAAGCTTTGGGATGAAGATCCACATGAATATGTAAGGAAAGGCTATGACA TTATTGAAGACTTGTATAGTCCTAGGACTGCCTCCATGGATTTTGTTAGTGAGTTGGTTCGAAAACGTGGGAAAGATAAT CTTCACAAGTTTATTCAATTCATAGTTGAAATTTTAAAAAGGTACAATGAAGCGCCATCAGAATACAAGCCTTACAGACA GAAAGACGGTGCTCTTCTTGCTATTGGGGCACTTTGTGATAGATTGAAGCAAAATGAGCCTTACAAATCTGAACTTGAGC GTATGTTAGTGCAACATGTCTTTCCTGAGTTCAGCAGTCCTGTTGGCCATCTTAGGGCCAAGGCAGCATGGGTAGCAGGA CAATATGCCCACATTAGCTTTGCAGATCAGAACAATTTCCGGAAGGCATTGCAGTGTGTTGTATGTGGAATGCGAGATCC TGAACTTCCTGTCCGCATTGATTCCGTTTTTGCTTTACGTTCTTTCGTTGAGGCTTGCAAAGATTTGGATGAAATTCGTC CTATTCTTCCTCAACTCCTTGATGAATTTTTCAAACTTATGGATGAGATTGAGAATGAAGACCTTGTATATACTTTGGAG ACTATTGTGGACAAGTTTGGGGAAGAAATGGCACCTTATGCTTTGGGGCTGTGCCAAAGTTTGGCAGCTGCATTTTGGAG GTGTATGAACACTGCCGAAGCTGATGATGAAGATGATGATCCAGGTGCTCTGGCTGCAGTTGGTTGTTTGCGTGCTATTA GCACAATACTTGAATCAGTGAGCAGTCTTCCTCAACTTTTTGTTCAAATTGAGCCAACTTTGCTTCCCATAATGCGTAGA ATGTTAACTACCGACGGTGAAGAGGTTTTTGAAGAAGTTTTAGAGATTGCATCATATATCACCTTTTTCTCTCCATCAAT ATCATTGGACATGTGGAGTCTTTGGCCATTGATGATGGAAGCGCTGGCAGATTGGGCAATTGATTTCTTTCCTAATATTC TGGTTCCTTTGGATAATTATATTTCAAGGGGAACAGCCCATTTCCTTACTTGCAAAGAACCTAACTATCAACATAGTTTG TGGAATATGATTTCATCTATTATGGCGGACAAAAATATACAGGACAGTGATACTGTGTCAGCTCCGAAGCTTATCGAAGC TGTCTTCCTAAACTGCAGAGGGCAGGTGGATCATTGGGTTGAGCCATATCTCAGGATTACAATCGAACGCTTGAATCGAA CTGAAAAATCTAACTTGAAATGTCTTCTCATGCAAGTGGTTGCAGATGCTCTATACTACAATGCAGCACTGACTCTCAGC ATATTGCAAAGATTAGGTGTAGCATCAGAAATCTTCAATCTTTGGTTTCATATGCTGCAAGAAGTCAAAAAGAGTGGCGT GCATGCTCATTTTAAGAGGGAACATAACAAAAAAATTTGCTGCCTTGGCTTAACATCGTTACTGGCACTTCCAGCTGATC AATTGCCAGGAGAGGCTTTAGGTCGGGTGTTCCGTGCCACTCTTAATCTTCTGGTTGCATACAAGGATCAAGTTGCAGAA GCTGCAAAAGCGGAAGAAGAGGAAGAAGCTGAAAATGATGATATGGATGGTTTTCAAACTGATGATGAAGATGAGGATGG CACTGATTCTGACAAGGAAATTGGAATTGATATTGAGGATGGGGAAGAAGCTGACAGTACTAAGCTTACAAAGTTGGCTG AACAGGCAAGGTCCTTCATGCCCGACGATGAGGATGATGATGACTTCAGTGATGATGAAGAGTTTGAGTCCCCAGTTGAT GAGGTGGATCCTTTTATTTTCTTTGTGGATACAATGAAAGTAATGCAATCGTTAGACCCACTGAGGTTTCAGAACCTCAC CCAGACACTAGAGTTCTCTTATCAAGCTCTTGCAAATGGTGTTGCCCAGCATGCTGAGCTGAGAAGAGCAGAGATTGAAA AGGAAAAATTAGAGAAGTCATCATCAGCTACCACAGATTCTTAA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0365400.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MDVGVVLQAALSPNQDERKAAEQRLEQIQYAPQHLLKLLQIIVEANSDIALRQVAAIHFKNFIAKNWSSSHHHQISLPDK DLVRNHTLLFLPQLPPLLRVQIGECLKTIIHSDYPDHWPHLLHWINHNLQDDQHLFAALFLLRILSSKYEFKSDEERTPV THIVEETFPHLLNILTRLVHIANPSLEVADFIKLICKIFWSSIYLEIPKLLFDQNVFNAWMVLFLNLLERPVPLEGQPVD PDLRKSWGWWKVKKWTVHILNRLYTRFGDLKLQNPENRAFAQMFQKHYAGKILDCHLNLLNAIRVGGYLPDRVLNLVLQY LSNSISKNSMYTVLQPRLDVLLFEIVFPLMCFNDNDQKLWDEDPHEYVRKGYDIIEDLYSPRTASMDFVSELVRKRGKDN LHKFIQFIVEILKRYNEAPSEYKPYRQKDGALLAIGALCDRLKQNEPYKSELERMLVQHVFPEFSSPVGHLRAKAAWVAG QYAHISFADQNNFRKALQCVVCGMRDPELPVRIDSVFALRSFVEACKDLDEIRPILPQLLDEFFKLMDEIENEDLVYTLE TIVDKFGEEMAPYALGLCQSLAAAFWRCMNTAEADDEDDDPGALAAVGCLRAISTILESVSSLPQLFVQIEPTLLPIMRR MLTTDGEEVFEEVLEIASYITFFSPSISLDMWSLWPLMMEALADWAIDFFPNILVPLDNYISRGTAHFLTCKEPNYQHSL WNMISSIMADKNIQDSDTVSAPKLIEAVFLNCRGQVDHWVEPYLRITIERLNRTEKSNLKCLLMQVVADALYYNAALTLS ILQRLGVASEIFNLWFHMLQEVKKSGVHAHFKREHNKKICCLGLTSLLALPADQLPGEALGRVFRATLNLLVAYKDQVAE AAKAEEEEEAENDDMDGFQTDDEDEDGTDSDKEIGIDIEDGEEADSTKLTKLAEQARSFMPDDEDDDDFSDDEEFESPVD EVDPFIFFVDTMKVMQSLDPLRFQNLTQTLEFSYQALANGVAQHAELRRAEIEKEKLEKSSSATTDS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 3 | 1010 | 1008 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 3 | 1010 | 1008 | 0.0 | – | |
| Gene3D | 4 | 944 | 941 | 1.2E-211 | ||
| SUPERFAMILY | 7 | 1000 | 994 | 8.64E-137 | ||
| SMART | 21 | 93 | 73 | 1.2E-7 | ||
| ProSiteProfiles | 21 | 93 | 73 | 17.808 | ||
| Pfam | 21 | 86 | 66 | 4.4E-14 | ||
| Pfam | 148 | 437 | 290 | 2.1E-8 | ||
| Coils | 871 | 901 | 31 | - | – | |
| MobiDBLite | 882 | 957 | 76 | - | – | |
| MobiDBLite | 883 | 920 | 38 | - | – | |
| MobiDBLite | 940 | 957 | 18 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Biological process | Intracellular protein transport | The directed movement of proteins in a cell, including the movement of proteins between specific compartments or structures within a cell, such as organelles of a eukaryotic cell. | ||
| Molecular function | Ran GTPase binding | Interacting selectively and non-covalently with Ran, a conserved Ras-like GTP-binding protein, implicated in nucleocytoplasmic transport, cell cycle progression, spindle assembly, nuclear organization and nuclear envelope (NE) assembly. |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0365400.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…