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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi6g1v0016800 |
| Transcript ID | LotjaGi6g1v0016800.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | DNA-directed RNA polymerase subunit beta''; TAIR: AT2G06105.1 aspartyl protease gag-polyprotein; Swiss-Prot: sp|Q06FX1|RPOC2_PELHO DNA-directed RNA polymerase subunit beta''; TrEMBL-Plants: tr|I7AYD2|I7AYD2_PHAVU Retropepsin-like protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0016800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:2988091..3002552) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TGATCAGTGCATTTTGGCACATACTTTCTTGCTTTGTAAGATAACATGTTGAAAGCTTTTCTCACCTAAGATTAATTTTT TATCATGTTTCTTAACTTTGGTTCATAGTTGAGCTTTAAAATAATTTTTGCCTACACTACTTGTTCTTGCAGAATAAATT ATAAAAGCCAATGGTCCCCAAGAATTTTCAAGCACTTTTCCAGCAAACATGGCAACAAACATGGTAGGAATAATGGAAGG AATATTGGCTGGACAAGCACTTGAGATTCGAATAAATTAAGAAACCAATTCCAGCCAACATTCCATCAAGCACATGCACA ATTTCCTTTCATCATTCCATCCAGCACATGGGCCAATTCAAGCAATTTTTCCAACAAGCAAAGGCACTATTTCGGCTGGA ACTTAATGGAAACATGGAGTGGAATCCTTGGCTGGACAAGCACTACACTTAGTTGGACAATCAATTGAAACTTGGCTGAA CTTTGGAGCCTATAAGTAGTTTATCTTTGTATCAATTAAGGGCATCATTTCGAATCATATTTCCTTTCATTCTGAACCAG CTCCTCTCTCTCTTTGTACCACATTATGTTTATGTTCTTAGAACTCTTAGGAGTTAGGATGGAAGCCATGAAGAACTAAG TTTCATAGATTGATCTACTGTATTCAGGTTCCATCACAACTTTGAGATTGTTAATGTTCAGTTTAAATTCATTTCCTTTG CAATCTTTCGTATGTTTCTCATTTGCTTAATCTGAGTTGTTATAGGAAAGATTGTATTTATTTCAATTGATGCATGTTCT TAATATTTGGATTGCGTTTAACTTAGCTTATTTGTTAAAACGCATGTGCTGTAATCAGATAGTTTTGAGCCGCTTAGGTT TTCCAATTCAATACTTATCTGACAAACAAGAACATGAATCAGTTAGTGTTGAGCCACTTAGGTTGTTAAAATCAATGCTA TAGTTGAAAAGGAATTGAACCTGCTTAGGGAATTGCCATGTTAACAATCAATGATAAGTAGGAACCGAATCAGTAGATTG ATCTAGCTTCCATAACTGTTTCTAATCTGTTATACTTTGTTTTTATGCTCTCTGAACAATCATAAACCCCCCCCAAATTT GTTGTAACTCTTGATTCTAATAATAGTAAACATTGATAAGAGTCCTTGTGATACGATAACCGAGTGTCGCTTCCCTAAAC TACAGTTTTTACTCGTTTTTGACCCGTGTGCGACAGCGGACCAAATTGGCGCCGTTGCCGGGGACTCTTGTTATTGTTAA CTAAGTTTAGAGTCATAGGGTTAATGTTCCTAGCTTAGGCCATAGTTTCCTTCCACAAGTCAGTTTGCTGTCAGATTTTT GCTATTTTTATGTTAGCCGGTTTTTGGAAAAATTGTGTCCGATTGGAGATCTGTTTTAACCACCTCATGTGAAAAAATTC TCCGGTCATTAGTCCCTTGTTATGGAATAACTGCGGGACTTTGATCTCCATTTCCCAAATTCCATCGTTTACTATTTTTA ATGATTTATTTTCTGTTTTCATGGTCTCCAAAAACCTTCAAAAAATTCTCAAAAATCACATTTCCTCTTATTAGATCAAA TTTGAGTTTTTAGATTTTTATGATTTTGTTTGAATCGTTTTCCCTCATTGTGTTTATCTCTGTCTGTTAAGGACATTGTT GGCATTTTTGTAATTGTTTCTGTATTATTGTGTAGTGCTGCTGAAGTGCTGCTGAATTGTTGCTGTATTACTACATTGCT GTACATTAGCCCTGGCTACTAGGTCTTCTTGTTCCAAACTCTTTGATTTTGATCCTGAGATAGAAAGAACATTGCACAAA CAACATAGAACAGTCCAGGGTAGCAATAGTTCACCACACTTAATTGATTCTAATCCTGAAAATTTGATTGATATGGCTGA 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CCACCAACAGAATCCACAACGAGTGGCTACTCCTGCACCCTCTGGATCTGGACCTTCCTTAGAGGACATTGTCAAACAAA TGGCTGTCAACAATCTCCAGTTCCAACAGAGAACAGACTCTAGCATCCAGATCATCAATACACAGATTGGACAGCTTGCT ACTCAAATAAATACCATGCAGTCCAGAGGATCAAGCCAACTTCCTGCACAAACAGTTGTCAATCCAACTGGTCCTGCTAA TGTGAGTGCAATTACCCTGAGATCCGGTAAAGTTGCAGAAACAGCCACCAAAAAAATTCCTGAGGTAACATCTGAACCTT CTTCATCTGTGGTAGAAACTGATGATGTTCCTGAGAAATATGCACCACCAGTTCCCTTTCCAAACAGAATTCAGAAAAAT AAAAGGTTTGACGAAGGGGATAAAGAAAAAGAAATTCTAGATGTATTCAGGAAAGTTGCGGTTAACATTCCGCTTCTTGA TGTCATTAAGCAGATTCCAAAGTATGCAAAGTTTCTGAAAGATTTGTGTACAAACAAGAGGAAATTGAAGGGAAGTGATA GAATAAGCTTGGGAAGAAATATCTCTGCCTTTATTCAGCCCAAACCTTCATCTGAAAAGGTTACAAGTGAGCAGAATGTT TCATCCCTCACTCAGATCCTGCCACAGAAACAGAAAGATCCAGGAACTTTTGCTATCCCTTGTACCATCGGGGATAATAA ATATGAGAACTGCATGCTTGATTTGGGAGCTGGCATTAACGTTATGCCTACTTCTATTTATAACATCCTTCATCCTGGCC CTTTGCAGCATACAGGTTTAATTGTCCAGCTGGCAAACAGGAGTAATGCTCGGCCTAAAGGAGTGGTGGAAGATGTTCTT GTTCAAGTTAATGAATTAACCTTTCCTGCAGATTTTTACATTCTAGACATGGAAGGAGAAACTAAATCCAGCAGGGCTCC CATCATTTTAGGCAGACCATTCATGAAAACAGCAAAAACAAAAAATTGATGTTGACAATGGAACCATGTCCATGGAGTTT GGTGACATTATTGCAAAATTCAACATTGATGATGCCATGAAACATCCCTTGGAAGATCATTCTGTCTTTCATATTGGAGT GATCTCTGAATTGGTTGATGACACTTTTTCTGAATTATTTTCAGCTGAATGGCCATCCTTATCTGGTTTTGATGATACTT ACTCATGTGTTGATTGTACTGACACTAACATTTGTGTTGTTTGTGCTGAGATTGATACTGTTTTGCAGCGTGATATGTTA CCTACAGGTGAAGTTCTTGATAGTGAAGATGTTTATGCGGTTGAAGCTCTTGACATCCCAGTTTCCCCAAACACTCCATC CATCGAGCTGCCCCCATCCTTAGAGCTGAAGCAGCTCCCGGATAATCTGAAATATGCTTATTTGGAGAGTGATGAGAAAC TCCCTGTTATTATTTCTTCTAACCTTGATTTAGAGCAGGAAAATAAACTTTTGCAGGTTTTGAAGAAACACAGAAAGGCA ATTGGTTGGACGTTAGCCGACATCCCAGGAATTAGCCCTTCTATGTGCATGCACCGGATTTTACTTGAAGATGGTGCGAA AACAGTGAGGCAGCCCCAAAGGAGGCTTAATCCTTTGATTCTTGATGTTGTGAAGAAAGAGGTAACCAAACTACTGCAAG CAGGTATCATATACCCTATCTCTGATAGCAAATGGGTAAGCCCAGTACAGGTTGTACCTAAGAAATCCGGACTCACAGTG GTGAAAAATGAAAAGAATGAACTTGTTCCCACTAGAGTTCAGAACAGTTGGAGAGTTTGTATTGATTACAGGAGATTGAA TCAGGCTACTAGAAAGGATCACTTTCCTTTACCATTCATTGACCAAATGCTTGAAAGGCTTGCAGGGAAATCACATTACT GTTTTCTTGACGGTTTCTCAGGTTACTTTCAGATTCATATTGCACCGGAAGATCAAGAGAAGACCACTTTTACTTGTCCA TTTGGTACTTTTGCTTACAGGAGGATGCCTTTTGGTCTCTGCAATGCTCCTGGCACCTTCCAGAGGTGCATGATTAGCAT TTTTGCTGATTTTATTGAAAAGTGCATGGAAGTTTTTATGGATGATTTCACTGTTTATGGTTCTTCTTTTGATGATTGTT TGAAGAGTCTGAGCTTGGTTTTACAGAGATGCATTGAAACTGACCTTGTTTTAAATTATGAAAAATGTCATTTTATGGTT GAGCAGGGAATTGTTCTTGGTCACATTATTTCTGAAAAAGGAATTTCTGTTGATCCTGCTAAGCTTGATGTGATTTCTAC ATTACCTTACCCTTCTTGCATTCGCGAGATTCGTTCTTTTCTTGGTCATGCAGGTTTTTACAGGCGGTTCATTAAGGATT TCAGCAAGATAGCCCTTCCGCTGTCAAACTTGTTGAAAAATGACGTCCCTTTCAACTTTGATGACAAATGCAAGCAAGCG TTTGACTTCTTGAAGAAAGCATTGACCTCCTCTCCCATCATTCAGCCCCCTGACTGGACCCTACCCTTTGAACTCATGTG TGATGCTTCTAATTATGCTGTTGGGGCTATTCTTGCACAAAGAGTTGCCAAATCTGCCCATGTTATTTCCTATGCTTCTA GGACTTTAGATTCTGCACAGTCAAACTACACCACCACTGAAAAGGAACTTCTAGCCATTGTTTTTGCTCTTGATAAATTC AAATCATATTTGCTAGGTTCCAAGGTTGTTGTTTTTACTGACCATGCAGCTTTAAAGTACTTGTTGAAGAAGCCTGATGC AAAACCGCGATTGATTCGGTGGATGTTGTTGCTCCAAGAGTTCAATGTCGAGATTAAAGACAAAAGTGGAGCTGAGAACT TAGTAGCTGATCATTTAAGCAGGATAGAGAAAGATGAAGATCATTTTCCTATTCAGGATGACTTTCCTGATGAACAGCTT TTACTTGTGCATGGAATTACTCCCTGGTTTGCTGACATTGTTAATTATCTTGTTGCTGGTGTTTTTCCTACAGGTGCATC TAGATCACAGATTAACAAACTCAAGAGTGATTCCAAGTACTATGTTTGGGATGATCCATATCTTTGGAAATTTTGTAGTG ATCAGGTGATAAGGAGATGTGTCCCTGACTACGAGATTGAATCTATTTTGAATTTTTCTCATGCATCTGAAGTGGGGGGA CATTTTGGTCCTCAAAGGACTGCCAGGAAAGTCCTAGATTCTGGTTTCTATTGGCCTACTATTTTTAAAGATGCTTATGA GACCTACCGCACTTGTAAAGAGTGCCAGATAGCAGGTACAGCCATCACTCGTAAGAGTGAAATGCCTCAGCAACCTATGC TCTTTTGTGAGGTCTTTGATGTTTGGGGAATTGACTTCATGGGTCCCTTTCCTGTGTCCTTTGGGTTCCTCTACATTTTA CTTGCTGTTGATTATGTGTCAAAGTGGGTGGAAGCTATCCCCACTAGGACTAATGATTCTAGAGTTGTTGCAGATTTTGT CCGGTCTAATATTTTTTGCAGGTTTGGAATACCGCGAGCTATCATAAGTGACCAAGGCACTCATTTCTGTAACCGCACCA TGGAATCTCTGCTCCGGAAGTATGGAGTTGTGCACCGAGTCTCTACTGCATATCACCCCCAAAGTAATGGGCAAGCTGAG ATCTCAAACAGAGAGATCAAACAGGTGTTAGAGAAAATGGTGCAACCAAACAGGAAGGACTGGAGCCGCCGTCTAGAAGA CGCACTTTGGGCTCAAAGAACAGCTTTCAAGACACCCATTGGGATGTCTCCTTATCGACTTGTTTTTGGTAAAGCTTGTC ACCTTCCTGTAGAGATAGAACATCGTGCTTATTGGGCGGTGAAAAGTTGTAATTTGGAGATGCAACAAGCAGGTACCGAA CGAAAACTCCAATTACAACAGCTTGAAGAGTTGAGACTAGAGGCTTATGAAAGCTCCAGGATTTATAAAGAGAAAACTAA GCACTTCCATGATAAAATGATTTCTAGGAAGGAATTCTCTGTGGGCCAACAAGTTTTACTGTTTAATTCCCGCCTTAAGC TTATGGCGGGGAAACTTCGATCCAAATGGATCGGCCCTTTTGTTGTTACTAATGTTTTCCCTCATGGTGCAGTAGAAATT AAAAGTGCAGGTACTGACAAAGTTTTTAAGGTCAATGGGCAGCGGCTGAAGCTGTTTCATGCAAATCTACCACCAGAAGT GGAAACTGTTGAAGAGCTCTCCCTGGAAGAGCCTTCCTATCTTCAAGCTGCTACGCCTTGACTCCTCGGGTGCACTCCTT CCTTATTCTCACTTTATGCTTATTGATCCATTGCGGACAATGTCTGATTTAAGTGTGGGGGGAGAACATGCTGAGCTTGT TTATTTTGATTTGTTTTGTTGTTTGTTTTTGTTTTGGTATGCATGCAACTGTTATGAGTAGTTTTTTGTGTTCTAAGTCT AGAGATGTATGGCATAATTTTGACAACTTGTTGTTCCTTTTTAAAGAGTATTGTGATAAGTTGGTTTGATACTGAATTGT GCATCTTTATGATTAAACAGGAAACCTTGTGAGCTTTTGAACCTTCAACAAATTCATTGTTTCTTGTGTGATTCACTCAT TTTGTTGGTTACTTCTAGAACTTGACTTGACTCTTGAAGCACTTGTTCACATGCATGTACATGAAATGATCTAGGCATTT GTTTTTTTTTTAAGCTACTTTTAGCCAAATGAGCCTACCATGATGATTTAACCTTTGATAAAGCCCCTTTGAGCCTTTTT ACCCCATTCTTTGTTTATAAACTCATTACAAGCCTAATAAGCTTTTGTTTTATCCACCCTTTGAATGAGCTTGAATTATA AATTTTGGATAAGTGTGGGGGTGCTCAATTGAATGATCTGTGAAAGGGAATTTCTGGTTATGTTACTATGCTAAATTCAA AAAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATGAAAAAAAATGTGTTGTTTGTGTGAAGATTTGTTGAGATAATTTAACCTTCATG CTTATCTTAACATGAATTTCATGCTTCTTTTGCCCTCCCTCGGTTAGCCTAGTACCCTTAGGATCATCCCACCTACACCT TGGCCCCATTACAACCTTAATAAAGACCTTTTGATCTGTGCGTGCATGTGCTTCGTTGTGTTGAATTCCTCTATCTTTGT GGATGTTAGAGTCTTGTCAAGCCTATGGCAGTGCTAATTTGATGATGTGCTTTGAGTGCAAACACAAACCCTCATGAGTG ATTGAGTGTACCTTATATATATTTTCCGTGAAGTTCTATCACTTTTGATGCACTTTTCAGTCGGATTACCATCTTGTCCA TTACAATTTTTATTAGATGTTGTCCATAATTGCTATACTCCTTGAATCTTAGAATATGTAAAAATTGCTTGTGACTTTGC ATCATGCTTTATTTCCTTTTATTAATCTTTGATTCTGGGTTTTGCTCGGAGTGCAAAAGTTCAAGTGTGGGGGAATTTGA TCAGTGCATTTTGGCACATACTTTCTTGCTTTGTAAGATAACATGTTGAAAGCTTTTCTCACCTAAGATTAACTTTTTAT CATGTTTCTTAACTTTGGTTCATAGTTGAGCTTTAAAATAATTTTTGCCTACACTACTTGTTCTTGCAGAATAAATTATA AAAGCCAATGGTCCCCAAGAATTTTCAAGCACTTTTCCAGCAAACATGGCAACAAACATGGTAGGAATAATGGAAGGAAT ATTGGCTGGACAAGCACTTGAGATTCGAATAAATTAAGAAACCAATTCCAGCCAACATTCCATCAAGCACATGCACAATT TCCTTTCATCATTCCATCCAGCACATGGGCCAATTCAAGCAATTTTTCCAACAAGCAAAGGCACTATTTCGGCTGGAACT TAATGGAAACATGGAGTGGAATCCTTGGCTGGACAAGCACTACACTTAGTTGGACAATCAATTGAAACTTGGCTGAACTT TGGAGCCTATAAGTAGTTTATCTTTGTATCAATTAAGGGCATCATTTCGAATCATATTTCCTTTCATTCTGAACCAGCTC CTCTCTCTCTTTGTACCACATTATGTTTATGTTCTTAGAACTCTTAGGAGTTAGGATGGAAGCCATGAAGAACTAAGTTT CATAGATTGATCTACTGTATTCAGGTTCCATCACAACTTTGAGATTGTTAATGTTCAGTTTAAATTCATTTCCTTTGCAA TCTTTCGTATGTTTCTCATTTGCTTAATCTGAGTTGTTATAGGAAAGATTGTATTTATTTCAATTGATGCATGTTCTTAA TATTTGGATTGCGTTTAACTTAGCTTATTTGTTAAAACGCATGTGCTGTAATCAGATAGTTTTGAGCCGCTTAGGTTTTC CAATTCAATACTTATCTGACAAACAAGAACATGAATCAGTTAGTGTTGAGCCACTTAGGTTGTTAAAATCAATGCTATAG TTGAAAAGGAATTGAACCTGCTTAGGGAATTGCCATGTTAACAATCAATGATAAGTAGGAACCGAATCAGTAGATTGATC TAGCTTCCATAACTGTTTCTAATCTGTTATACTTTGTTTTTATGCTCTCTGAACAATCATAAACCCCCCCCAAATTTGTT GTAACTCTTGATTCTAATAATAGTAAACATTGATAAGAGTCCTTGTGATACGATAACCGAGTGTCGCTTCCCTAAACTAC AGTTTTTACTCGTTTTTGACCCGTGTGCGACAGCGGACCAATTAAAAAAAAAAATTAAGGACCCAATTTGATGAAAAAAA ATTTCAAGGACCTAATTAGATTCCCTTACAATTTCAAGGACCCCAAACATATTTAAGCCTTTTTAACTTCTTTTAAATGT TTCTCTTAATTTATATGTTACAATTGGGGTTGTCTAAATGACCCTTGATAAGAATTGGGTTAAATCACCCTTGATGAGGT GTCTCCAATAATATTGTAACATGTGGTTTTATAAATTTCAACTCATTTCATTTTTTTTAATTTCATATTTTCATAATATT CATGTTAAGAAACAATCAATTTGCACAATAAACCAATCAATTAGGATAATAACACATAACTCCTTTTTCCCAAAAGAAAC AATTTAGAACCCTAATCCTCAATTCTTCCATGATTTCTGATTTTTTTTGTTCGCTCTTCTTCTTGGCCTCCTTGTTAAAT TCATTCGCAAGATCTGGCGAAAACAATCAATGAGGTATTGTTGGGATTAATCTCATATGCGAAGTGTAAGCATCAAGGAT GATACCGGATTCAATTATTGATGCAGTGCTTGAACAATTGGAAAACGGTGATCATGGTGAGATGAGAACTCACAGGCATA ACCCAATTGAAGTACTACTATTATTTTCTTAAACTTAAAAATAATTGATTAATTGTTGTTCCATGACAATTATTCTTATA TTTTATGATGCGGCTATGGCAGATTAACAAAAAATGGCAGAGCTTGGATAGCTTCCAAAATATCGCAAGGGTTCTGAGGT TTGTAAAGAAAAAGGAGTTTTGTGTTATTATTCAAATTGATTGGTTTATTTTGTAAATAGATTATTTAATAAAATGAATA ATATGAAAATATAAAATAAAAAGAATAGTGAAATGAGCTGGAATTTATAACACCACATGTGACAATATTATTGGAGACAC CTCATCAAGGGTGATTTAATCCAATTTTTGGCATGGGTCATTTAGACAACCCCGTTACAATTTGTATGGAGTTGTAGAAG TGGAATGGTTTTTTATTTTTTATGTAATAATGCAAAGCATAGGAGAATATGATTATAGAATATGAAAGGTTGTTGTATCC CAAAAAATTAATAATAGATTATTTTGGTCCCACATATAAAGAAAATTAAATTAAGGGGGTTTTAAAATTATCCATTGAAT AAACTTGATAATTGTAATGGAACAGAAAATTAAATTCCTAGAAAAAGACCACCGGCGTTGAACGTTGATGTGGATTAATT GATCATGTCAGTCACAGTTTTATTTTTAAATGTGGTTTAACATGTGATTTTCCATGTCCATATATTTTTTTTTTGAAAAA TAAAGGATTGTATATTATTATCCACAAAAAAATCCATAAGGACAAACCCTTATGGAGCAAGGAAAAGCCCAATAAAAAGC GAGGTACCGCGACAAGCACACAAAAAACCCCATAAAGCCGGAAAACCCCCATCCAAGACAAAAGCAAGGACACCCTAGGA CTACCCAACAACACCCGAGAGGCACAAACAAAAAATCACGTTTTGAAGTGTTCTTCATAAACCTTCTCCAACCCTCTAAT AGCTTCAAAATCGCTTCCCTCAAACTCTAACCCCAAGACTTTTCCATGTCCATATATGTAAACGACATAATTGAGGGTTC TCTTTTTCTGAAGAGGCAGTATTGATGGTGCAGCTGATGATGGTTGTTTAGCATTGCAAACAAACAAAATACTATGAGAG CATCTCCAATGGTAGTATCTAATCCTAAATACATACTCATATGAGTATCTATTACCATTGGAGTACATATTCAATTCCAA CATGACAAAGATGGGTATGTGGGAATAGATACTCTACACTAGACTTGAAAAGTGAGCTTGTATTTATTACAAACACTTAT AATTAATTAAAATATTGATAAATAATAAAATAAAATATACAAATGTGATGTTGATGGTGAGATCCACTATAGAAACTTTT AAGAGTTGTTGGGTTTTCTATTTCTTACAATTAATTAAAATAGAGATAAATAATAAAATATACAAATGTGATGATGGTTG TTTAGCATTGCAAACAAAGTGGAATGGTTTTCCATTTCTTATCCAATTGAAAGTTTTACTAAAATCCCCTTGGGATTCCA TCCTTTTGCTAACACCCCCTACGAAGAACGTGAAATGCGTTTATAAGGAATAGAATTGAAAGTGTGAAATAGTGTGAAAC TGATGCAACTAAAATAACAAATTTGTGAATCAACGGCTGAGATTCAATCTAAGTGAAAAAATTGCAATTTTACAATTATA ACCTTGCCCAACTTCCATGTTCTTGAAATTAATAGTTGTGCCTTTCCTATTTGCTGTCAAAAAAATATATATCTATATAA TAGTAATAATATGTGAATGGAATCGTAGAAGTTTAAAAGTCTGTGGATTAAATTCTGTATTTTTGTGTTATCATTAGACA CTTTGAAGTAATATTTAAATTCAATCTATAAAGTTTATATTTTCTAATTTCTATATCACACCTAAAGTATATTAATGAGT TTTCTTTATATTCACCTGTGTTTTTCTCCGCTATGCTTAAGATTTTACTTTTTGAGTGTTTTATTGGATAATAGTTGCCT ATAGTGACTAAGCATGTCAATGGAATATTTTTCAATAGTAAAAACAATAATCTTATTGTAATTTTATTGGTATTCGTCAG ACAGAGTGTCCGGCGGCCTCTGAGGAGCGCCCGACACTCTTCTTTCTTCAAAGTCAGTTTTCCTTGACCGCCAGGAGTGC CCGGCAGCCTCTAAGAAGCGCCCGACACTCTGGAACCTCAAATTTGTATTTCCTACACAAAGCTTGCAATTTCTTCAATC TTCAATCCTACAACACTTTTTGATATTAGAATCAATTCTTGTGCATATTCTAACTAAATTTCACATATCAAGAAATTCTA ATCAAAAGAGGGTGAAGTTGTCAAATATAACTCATTAATCACAAAGATAAGTGCCTAAATTGCACATCAAAACTAGGTAA ATATGACACTTATCACATATACCAAAATTTTCAAGATGATAAATAAGCAATGGAAAGAATATCAAACTAAGATGAATGAT ATAAAGAAACTATATAAAAAGATGAAAGTTCATAAAGTATAATTAGTTGGCTACCTTGAGATGTACAATGGCTAACACTA AGCCTAGCATGAGGAACTTCACATTGGTTACATTATACCTTGGAGAGTAGATCGACATCAAGAATTGACCTCAGATAAGA AGATATTGACGTCACATCTTGGATTGGTTTTTTAACCAAGAAGAATGCATATTAGCAACATATTGTCAAGAAGATAGAAA AATAAATCACACAAAAATGAAATAAATAAACATGAACTTCTCCTATTCTCTATGGTCGTAACATTAAATATTTCAAGGTT TCAACCAAATTTAAGTCATTGTTCAGGAGATCCTGACATCTTACATCCTTATAGAAAAATCTAGAAAAAATAAAGAACAA AACGGAACATGAACACTATCTGAAAACCAAATTGATTTTCTGTGCAGGATTTACAAAACTTGAAACCTAAAACATAAGCT AGTAGCTCACCAATTTCACAGCAGCAAAACAAACCTTGCATTGAGTAATGATTTGTCGTCACTGACAACTCTGAAGCTAA AAAATGTAGATGAAGTTAAAGGAAAGATGCAGACAAATCAAACAGATAAAGAGTATTTATACCTAGAGACTAAACCATCA AGATATGAAAAGCCTCAATAATTCTCTTCCTCATTTCATTCATTGAATATTATTCATTTTAAAATCAATTGAAATTGGGA ATATGAGTTATGGATAATGAAAAGTCATGAATCATTAATTTAGAAAAGTTGAAAAAATTAGAATATTAAAAGATGAAGAA TTTTTTAAAGTCATAAAATCATTAAAGTGTTCTCAAATTTTAAAATCAATTTCATAAGAGATGAATCAAAAATATGTTTT TTTTTATTTTTTGGAAAATGCATAAAAATATAAATATTTGATTGGACAAATAGCGAAATTGGAAGGAAAACAAAAATATA TATCGAGGCATTTGGCAGAATTTTGGATGGTGGAGCCTGAAATTGCATTTGCAGACTTAGCGGATGATATGAAGTGTGCC GAGGCATATGTGAAATTTATGTGTCAGTGGCTACTTGATAACTGCCTTGAAGATATGGAATTTATGGCGGACAAGTTTGA TAAAGGTTGCATCGATCGTTTGAAAATGGTGGCTTCCACCCCCTTTGTTCGACTTTCATATACAGAAGCAGTAGAAATAC TAGAGGAAGCTGTCAAGAATGGTAAGAAATTTGAGAATGAAGTAAAATGGGGGATCGACTTAGCATCTGAGCATGAAAGA TACCTAACAGAGGTAAAATATCAGAAACCTGTCATTGTCTATAACTATCCAAAAGATATCAAAGCCTTCTACATGCGCCT CAATGATGACTCAAAGACAGTGGCTGCTATGGATGTGCTTGTCCCAAAGGTTGGAGAGTTAATTGGTGGAAGTCAAAGGG AAGAGCGGTATGATGTCATTGTAGAAAGAATATAGGAGATGGGTCTGCCTCTTGAGCCATACATGCTTTGAAAGGATGAT TCTTTTCGCAACCGGTCTCGAAAATATTAGAGATGTGATTCCCTTCCCGCGATATCCTGGCAGAGCTGATCTATGATTTT TTTTTTTTGTTACTGATTACAAACTGATATTACAATTTTCTTGCTGGAGTAGTTTAGTTCACATATGTATGTTTGGATTT CCATTGAACTATTTTTGGGTTTGACAAACGCACTTTGCTTATCTATGATAATGTATTTTGCG
CDS sequence (LotjaGi6g1v0016800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCTGAGCAAACTTTAAGGCAACTTGCAGCCCCTGATGTGAATTATAATGGCTTATGCATTGAATATCCTGGTACTGA GGCACCTTTTGAACTAAAATCTGGTTTGATACACTTGTTGCCAAAGTTTAATGGTCTTGCAGGTGAGGATCCTCATAAGC ATCTGAAGGAATTCCAGGTCGTGTGCTCTACACCATCAAGGCCTGAAGGAATCACTGAAGACCACATCAAGCTCAGAGCC TTTCCATTCTCATTACAAGGTGCAGCAAAAGACTGGATATATTACCTTGAGCCAAACTCCATCACAAGCTGGAATGCCCT CAAAAGAGTGTTCCTTGAAAGATATTTCCCTGCCTCCAGAGTATCCTCAATCAGAAAAGATATATGTGGTATTAGGCAGG AAAATGAGTCATTAGCTGAATACTGGGAGAGATTTAAGAAGTTAGTTGCAAGCTGCCCTCAACACCAGATCAGTGAACAA TTACTCATCCAGTATTTTTATGAGGGATTGTTACCAATGGATAGAAGCATTCTTGATGCTGCTAGTGGTGGAGCACTTGT TGATAAAACCCCAGCTGCTGCCAAGGCCTTGATTGAAAAGGTGTCTCTCAACTCCCAACAGTTCACCACTCGAAGCAGTT CTGTCCAAACCAAGGGTGTGAATGAAATTCAGGTTTCTTCCAACAAAGCTGTAGAAACCAGAATTGATGAGCTTACCTCT CTGGTGAAGAAACTGGTAGCAGGCACATCTCAGCCAGCTGGAACAGCTCAGACAAAATGGGTATGTGGTATTTGTACTTC TCCTGAGCATCCAACTGACATTTGTCCTGTCTTACAAAATGAATCAGGTGCTGAGATCCCCCAGGCCTATGCAGCAAATC TTTACAACAATCCTGACCTGTCAACAAACAGATACCATCCCAGTTGGAAGAACCATTCAAACCTGAGATATGGAAACCAA CAGTCCAACCACCAACAGAATCCACAACGAGTGGCTACTCCTGCACCCTCTGGATCTGGACCTTCCTTAGAGGACATTGT CAAACAAATGGCTGTCAACAATCTCCAGTTCCAACAGAGAACAGACTCTAGCATCCAGATCATCAATACACAGATTGGAC AGCTTGCTACTCAAATAAATACCATGCAGTCCAGAGGATCAAGCCAACTTCCTGCACAAACAGTTGTCAATCCAACTGGT CCTGCTAATGTGAGTGCAATTACCCTGAGATCCGGTAAAGTTGCAGAAACAGCCACCAAAAAAATTCCTGAGGTAACATC TGAACCTTCTTCATCTGTGGTAGAAACTGATGATGTTCCTGAGAAATATGCACCACCAGTTCCCTTTCCAAACAGAATTC AGAAAAATAAAAGGTTTGACGAAGGGGATAAAGAAAAAGAAATTCTAGATGTATTCAGGAAAGTTGCGGTTAACATTCCG CTTCTTGATGTCATTAAGCAGATTCCAAAGTATGCAAAGTTTCTGAAAGATTTGTGTACAAACAAGAGGAAATTGAAGGG AAGTGATAGAATAAGCTTGGGAAGAAATATCTCTGCCTTTATTCAGCCCAAACCTTCATCTGAAAAGGTTACAAGTGAGC AGAATGTTTCATCCCTCACTCAGATCCTGCCACAGAAACAGAAAGATCCAGGAACTTTTGCTATCCCTTGTACCATCGGG GATAATAAATATGAGAACTGCATGCTTGATTTGGGAGCTGGCATTAACGTTATGCCTACTTCTATTTATAACATCCTTCA TCCTGGCCCTTTGCAGCATACAGGTTTAATTGTCCAGCTGGCAAACAGGAGTAATGCTCGGCCTAAAGGAGTGGTGGAAG ATGTTCTTGTTCAAGTTAATGAATTAACCTTTCCTGCAGATTTTTACATTCTAGACATGGAAGGAGAAACTAAATCCAGC AGGGCTCCCATCATTTTAGGCAGACCATTCATGAAAACAGCAAAAACAAAAAATTGA
Protein sequence (LotjaGi6g1v0016800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAEQTLRQLAAPDVNYNGLCIEYPGTEAPFELKSGLIHLLPKFNGLAGEDPHKHLKEFQVVCSTPSRPEGITEDHIKLRA FPFSLQGAAKDWIYYLEPNSITSWNALKRVFLERYFPASRVSSIRKDICGIRQENESLAEYWERFKKLVASCPQHQISEQ LLIQYFYEGLLPMDRSILDAASGGALVDKTPAAAKALIEKVSLNSQQFTTRSSSVQTKGVNEIQVSSNKAVETRIDELTS LVKKLVAGTSQPAGTAQTKWVCGICTSPEHPTDICPVLQNESGAEIPQAYAANLYNNPDLSTNRYHPSWKNHSNLRYGNQ QSNHQQNPQRVATPAPSGSGPSLEDIVKQMAVNNLQFQQRTDSSIQIINTQIGQLATQINTMQSRGSSQLPAQTVVNPTG PANVSAITLRSGKVAETATKKIPEVTSEPSSSVVETDDVPEKYAPPVPFPNRIQKNKRFDEGDKEKEILDVFRKVAVNIP LLDVIKQIPKYAKFLKDLCTNKRKLKGSDRISLGRNISAFIQPKPSSEKVTSEQNVSSLTQILPQKQKDPGTFAIPCTIG DNKYENCMLDLGAGINVMPTSIYNILHPGPLQHTGLIVQLANRSNARPKGVVEDVLVQVNELTFPADFYILDMEGETKSS RAPIILGRPFMKTAKTKN
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 2 | 608 | 607 | 3.9E-68 | – | |
| PANTHER | 2 | 608 | 607 | 3.9E-68 | – | |
| Pfam | 80 | 170 | 91 | 2.5E-21 | ||
| MobiDBLite | 303 | 342 | 40 | - | – | |
| MobiDBLite | 303 | 336 | 34 | - | – | |
| MobiDBLite | 423 | 454 | 32 | - | – | |
| Gene3D | 530 | 657 | 128 | 2.2E-16 | ||
| CDD | 555 | 652 | 98 | 2.19759E-13 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi6g1v0016800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…