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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi6g1v0018000 |
| Transcript ID | LotjaGi6g1v0018000.1 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Protein kinase; TAIR: AT1G50240.2 kinase family with ARM repeat domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q2QAV0|TIO_ARATH Serine/threonine-protein kinase TIO; TrEMBL-Plants: tr|V7BHY5|V7BHY5_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0018000 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:3132202..3152648) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GTAAGTAGTGGAGCGGGAACACAAGTTTGAAATACCCTTTCTCATTTCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCTT CTCTCTCACCATTCAACTTCAACATCGATTTTCCATTTTCAAATCTCACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTG ATTCGAATCATCTGAATCAACAATGGGCTCCGTTGAGAATTACCATGTCATCGAGCTCGTCGGCGAGGGTTCCTTTGGCA AGGTCTACAAAGGGAGGCGCAAGCACACCGGAAAGGTACCGCTACTGCTACTACTACTCTTCCTCTTTACTTTTCATTTT CCATCATCATCGCTCGATCGCTCTCGTTTCAGACCGTTGCGATGAAGTTCATCATGAAGCATGGCAAAACCGACAAGGAC ATTCACAATTTGAGGCAAGAAATCGAGGTGATTCATTTTTCATCCATTCGCATCTCACACACTTTTTCTTTCTGAATAGT TTGTTTTTGGAGTTTTCGGTGCTGTTTGGGATGCAGTGATGGTTAGGGTTTCTCTTTCTAGGTTTTTGTGAGAAAAATTG GTGTGATCTGAGTGTGTTTCTGTTATTGTTTCTTGGTAATAGCTGGTTGCTTTGGTCACTGATGCCAAAAATAGTAGATT TATAGAGCAACAGTGTGGGGTTAGTGCATGTATTGAACTTCTTCTACAATTGATTCTATGATGAGTAGTTTTTCCGTGCC AGAATTGATTTTAAGGAGAAATAAGCTGATCCAATCATCCAAACATGCTAAAATAGTAATTTTATTTACCTACTTACTGC AGGTAATAACAGGTTCTTAGGTCACTGAGCCAAAAACAATAGACTTACAGAGCAATAATTTTGGGTTAGAGTTATGATTA TCACGATTCTCGGGTAATTGTTATCAAATAAATAATCAAGTAAACAAAAAGAATTATTTACCAACTCACTGTAGGAAATA 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TAAACACAAACTTAAACTGTCTATTTAGTGAGATGTATGTGCCTGGCATAAAATTGTCTTTCCTGTATTTAGAACAGATG GCATCATGGCTGGCTATGCTTTTCATACCGTGTATATGCTGCAAGTTATACTCTTCACATCTCTTCTAATCTGCTGTTCC ATGCCTGAGCTCAGATTGGAAATGCGGCCTATCACACTGACATGTTGTATGAAGAGTTGAGGAGGTCGATTCCTCATTTA TCAAATTTATTGCAAATGGCAGAGGAGGACAAGACTAAGGCAAATGCAGCAGGTGCGCTTAGCAATCTGGTTCGCAATTC GGAGAAACTTTGTGAAGATATTGTGTCCAAAGGCGCGATTCAGGTACGAGCACACTGCAATTTGATATATTCACACTCAT ACCTTCTTCCATCACAATTTCACCCACTTTCTTTTCCTATCTTTTTTTCCTATTACATCATTCATCCCATCTTTCACTTT TATTCTCTCCTAAGGTTGAGGAAAATTTGAGGTGTAAATGATTTTTTTTTCCGGTTTTTTGAGGGCAACATCACATTACG TTTACACGGTCAAATGCAATTTTTATCTTTTCTTCAATTGTTGAAGATAGTTTGCGAATTCCATCCATTGAGGATGACAT AAAAGAAATTAGTTTTATTAGTTTCAATTCAAGCTCGGTTGTGTTTGCAACAACTGATTATCAAATATTTTGGTCCTCAT GACAACTATGACTGTTTGATTTAATGTATTCATTCGGTGGTCTTTCGCTTTTGCAGTCTCTCCTGAAGTTAATTTCTGAT TGTGCGGTAGTAGCACTAAATCCAAGCAGAAATGATTCAGCAAGTGAATCTCCTTTAAAGATAGCCCTCTTTTCCCTAGC AAAGATGTGTGCACATCCACTCTGCAGACAGTTCATACGTTCATCACCTTTGTCGCCTGTGATTAGTAGGCTTCAGCAGT CTCCAGAATCATCTATTGCCAAATATGCTTCTATAATCATTGGCAAAGTTTCTTAACCTTGACATTCAAAGTTCCACCCA CTGTTTGGTTGATTTCCCTTAAGTCATTCTACAATGCTTCCTAGAGCACAAGGGCATTGTAACACTGCAAATAAGTGATT TTGTCAAGTCATGCTTTGTAGTGGCCCCTAGAAAGTTAAGAACTTAGGACGTCAGATGGAATTTTCTATTGTAAACTATG TTCATAATAATGCATTGTTATGCGTTTTTTTACCGCTTTAGTTTTGCATTTTGTCAGTAACTTAACTCTCATTTAGTACA ACATTGGTTTAGGAAAGAATTTATTGACAAAAATTTATCACAAACTAAACTACCTAAAACTTCTTTGTGCCTAGGTGACT AATCCATACAGTGACATTTATTGAGAGACACAATTAGTGCCTTAGAAGAGAAAACAACTAGAGAACCACCACGCTAGTAT TTTTGTTGATCTAGCTAGATCTTGAGGATGTCAATGAAGTTCTTCCCTTCAGCAATGTCATTGTTTGCCAGAAAGTTAAG AAAATCCCTAAAGCTGCTTTCCCTATACTTCTGAGGATGCTGATCATCCACAAGCTCTATAGCGGACTCCATCTTATCAT CTATCCCCAAACTGAACAAGCAAGTAATGGAGATCCTGGTTCTGACACTGTTAAGTGTAGCCCTGTGCACCACACTCTTG TACAAACCATTGCTGAGGACCTCAAAGTGGTCACCCACATGCACTTGAAGGGCACCAGGAATGTGTGGGATTGCCTTCCA AGTTCCATCCTCAAAGTCCATTATCTCAAGGCCAGGGCAGCTTTGGTAGAGAATGGTGAGGCAGCTGTAGTCAGAATGCG GTGGGAGGCCAAGTGCAATCTCTGGCTCTGGGCAGGGTGGGTAGCAGTTCACTGCCATCACTTGCATCCCATCTTCAATC TTTTTGGTCAGGTTTGTTGGGTTTTTTAGTCCAAGACTCTCAATCACTGCTTCCATCACCTCTAACCCCACTTTCTTCAC TTCTTCACAATATCTCCCCATCTTTTCCCTATCAAATTTAAAACATTTAATTTAGTTCACTTTACAATATAATCATTTCA TCTTCAATTAAACTTGTATCTATACTGTGGATACGTTCAGGGATCAATCCCTGGAGGGTGCAATTTATCTTTTTGATGTT AAAAAATAAAACAGTACAAACTCCCATCATAGACAATATTTTTCTCT
CDS sequence (LotjaGi6g1v0018000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGGCTCCGTTGAGAATTACCATGTCATCGAGCTCGTCGGCGAGGGTTCCTTTGGCAAGGTCTACAAAGGGAGGCGCAA GCACACCGGAAAGACCGTTGCGATGAAGTTCATCATGAAGCATGGCAAAACCGACAAGGACATTCACAATTTGAGGCAAG AAATCGAGATCTTAAGGAAGTTGAAGCATGAAAATATTATTCAAATGCTTGATTCCTTTGAAAGCCCGCAAGAGTTTTGT GTTGTCACCGAATTTGCACAGGGTGAGTTATTTGAGATTCTTGAGGATGATAAGTGCCTTCCTGAAGAACAAGTTCAAGC AATTGCAAAGCAATTGGTAAAAGCCTTACATTATCTGCACTCCAACCGGATCATTCATCGTGATATGAAGCCCCAAAATA TTCTCATTGGTTCTGGATCTGTTGTCAAGCTTTGTGATTTTGGGTTTGCACGTGCAATGTCCACAAATACAGTTGTTTTG CGATCCATAAAAGGCACTCCATTATATATGGCCCCAGAGCTTGTACGGGAACAGCCTTACACCCACACTGTAGATTTATG GTCTCTTGGCGTTATATTGTACGAGTTATTTGTTGGCCAACCACCATTTTACACAAATTCTGTATATGCTCTCATCAGGC ACATTGTGAAGGATCCGGTTAAATATCCAGATAGCATGAGCCCAAATTTCAAGAGCTTTTTAAAGGGTTTACTTAACAAG GCACCAGAAAGTCGACTAACTTGGCCAGCTCTTCTTGAACACCCATTTGTTAAAGAAACGTCTGATGATCCTGAAGCCAG GGTGTTGCATGAGATAACTGGTTCAGCTGGAAATAGTGATACAGCACAGAGGGTCGAAGGAAAAACCATTCAAATTGCAA CAGTCAAAAACAATCATACAAAACGTTTGGAGGAGCATATTGCGTCACCACTCCACGCTGAAGCTCAGTTAAATGGTTCT AACATAAAGAAAACCAATTCTTCATTGCTTGATGAGTCCCCAGGATTTTCTAATGAAAATGCTACTGGAGAATCAGGTTG CCAAAGATTGGACAGACTTGAAAACAACTCTCGCACAGTCAAAGGTGCAAAAACAATTGGTCAAGATAATGAAGCATTGG GACATATTCTGGTACCACTGAAGAAGTGGTCAAAGGGATCACAAAATACTTGCAGTGATCAAGATATTCCTGATTCGAAC CAGTCATTGAGGATTCTCTTAAACCTAGTTGCGGCTGGGGCTATCAATTCTAGTGGATGTGTAGACGAACTAATAAGTGA ACTCCTCTTCTTTACTAAATCTGTTATAACCATGAAATCCGTTGAAGTTATTGACTTGATAACCAAGAGTTTCTCTATCA CTAAAGTTTTACTAGATAATGGAGGGAATTGTACTTCAAGCTCTTATCTAAATCACTGGGTCGAATTTCTTGAAATCTAT TCTCAGGTTGTAAATTCAACAAATGATGCATCTGGAAGAGTTCTGTTTGAGTCTAGTGCTTGCATTACAGTCATGCTCTC TAAAGTTGCTCAGGTGCTTAGATCTTGTCCTCAAAGTACAAGCCCAGGGACACTAAATGAAACAGCTAACAGAATTATGG AGCATGCGAAAACATCTGGTTTAGTGGACCATTTGTGTCTGTGTTTAGCCACTTCTGGTTCGAGTCTTATTTCAGGTTCT TCCAATATGCTACGGGCTGCTTCTGAAGCATGCAGAGCTGTCTGGTCTTTGATTAATGCACTGGATATCCTTTTTATGAA GACAAGTGCCATTTTGTTTCCCATAAATGCTTTGCGGACTCATTCCAATGAGCAAGATCCCTTGTTTGGAGCAGAATCTA CAAAAATTGTTGATGCAATGACAAGAGCATTCCTGAAATCCAAAGCTGTTCAGGTTGCTGTTTACTATTGTTTTCACCAA CGTCTTGAGTCTGCAATGGGTTGTTGTCTTCAGCTTTTGTCAAGGTGCTGCCTCCATAGTGGAATTGTTCCAGCTCTTCT TTGTGGTCTGCCGAGTTCGCTTCCTGTGACTACTGTTGTTAGTGGTGGTGGTGATGGAACTATTGTTTCAGAGATTTTCT CTGTTTTGTCATTATGCAGTTCGTCTCTTAATAAAGATTCACAGAGTGTAGAACCAAGTAATGCTAAATGCAAATTAACA AATCCTTCTTCTGTGGTTCGTCATTCATGTCTAATTCTTGCAACAATTGCACAATGTTTGAAGTCAACCGGAAGAAATTC AGCAATTTTCATTCTCACTACCTCTCCAAAGAAGCAGCTTGCTCGACTTTCATTGCTTGCACATTATATTTCTTCTGACG ATAAATCGAAAGCCTGTTTCCAACCTCAAAGTGCATCTGCCATGTTGGCTTTGGCGTCCATTCTATGCCTCGAATCTGGG GCTTTGGTTGAGTCTCCGATATCTGAAATTGCTATGCCCTTAATTCCTCGAACTTCTACACTTAGTGACCATGTTAAATT TTCATCTGGAAATGAAAATGATTTGGACTCTGACAATTTCAGTGGGAAGCTTTCATATTGGCAAGGGGTAAGAGATGGCT GTGTTGGGCTTTTAGATTCCAAACTCAAGTTGGGAGGACCATTAGCTGTTCAGCAGTTGTGTGCAAGTGGTATACCCCTT CTTCTTATGGGCTTATTAAGCAATGACTTCTTAAATGCTTCTGAAGGAAACGAGCACCTAAATGATAGAGTTGGATTATC TCCTATTGGTGTTGTATGGACAATTTCATCACTATGCCATAGTCTTTCTGGTGGTGCTGTGACTTTTCGTCAGGTTTTGA TTAGGAATGAACATGTTAAGCTCATCTCCAAATTAATATGTGATGTTCATCTAAAGTTGATAAACTGCTGGACCGGACCT GGTGGAGGGAGGGCAGGAGTCAGAGATCTAATAAATGCAGTAATAGATCTCTTAGCTTTTCCTTTTTTTGCTCTGCAAAA TGCACCTGGCATTCCATCAGCTACTGCTTCTGTCAGCAGCGGGTTTCTTCTTAATGCTGGTTCCCCCGGTCAGAGAGTAT GCGTGGAAGACAAGGATATAGTTAAGGCAATAGAAGAAGATATGGGCAAGTACACTAAGATCCTTGTGGAGGTGGGTGTG CCTGGTATTATACTTCGATGCCTAGATCATATGGAATTGAACGATTTGGGAAGGCCTGTGGCCTTTCTTGCTAAAATGGT ATTGCATCGGCCTTTAGCAGTACAACTTGCGGATAAAGGTCTTCTGGATTCAAATAGGATGAGAAGATTGTTTGATCATT CAGCCCCAAAAGAGGTCACACTAGATGCTCTTATGATAATTTCTGATTTTGCTCGCATGGACAAGAGATTCTACGAGTAC ATCAAAGCTGCTTCTATTTTGGAGTTCTTAAAGGCCTTTCTTTCGCATGAGGATCCCAACATACGTGCCAAATCTTGCAG TGCTCTTGGAAACATGTGTCGCCACAGCGCCTACTTTTATAGTTCACTTGCAAGACATCAAATTGTTAGTATCCTTATCG ATCGGTGTTCTGATCCGGACAAACGCACACGCAAGTTTGCTTGTTTTGCTATTGGAAATGCGGCCTATCACACTGACATG TTGTATGAAGAGTTGAGGAGGTCGATTCCTCATTTATCAAATTTATTGCAAATGGCAGAGGAGGACAAGACTAAGGCAAA TGCAGCAGGTGCGCTTAGCAATCTGGTTCGCAATTCGGAGAAACTTTGTGAAGATATTGTGTCCAAAGGCGCGATTCAGT CTCTCCTGAAGTTAATTTCTGATTGTGCGGTAGTAGCACTAAATCCAAGCAGAAATGATTCAGCAAGTGAATCTCCTTTA AAGATAGCCCTCTTTTCCCTAGCAAAGATGTGTGCACATCCACTCTGCAGACAGTTCATACGTTCATCACCTTTGTCGCC TGTGATTAGTAGGCTTCAGCAGTCTCCAGAATCATCTATTGCCAAATATGCTTCTATAATCATTGGCAAAGTTTCTTAA
Protein sequence (LotjaGi6g1v0018000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MGSVENYHVIELVGEGSFGKVYKGRRKHTGKTVAMKFIMKHGKTDKDIHNLRQEIEILRKLKHENIIQMLDSFESPQEFC VVTEFAQGELFEILEDDKCLPEEQVQAIAKQLVKALHYLHSNRIIHRDMKPQNILIGSGSVVKLCDFGFARAMSTNTVVL RSIKGTPLYMAPELVREQPYTHTVDLWSLGVILYELFVGQPPFYTNSVYALIRHIVKDPVKYPDSMSPNFKSFLKGLLNK APESRLTWPALLEHPFVKETSDDPEARVLHEITGSAGNSDTAQRVEGKTIQIATVKNNHTKRLEEHIASPLHAEAQLNGS NIKKTNSSLLDESPGFSNENATGESGCQRLDRLENNSRTVKGAKTIGQDNEALGHILVPLKKWSKGSQNTCSDQDIPDSN QSLRILLNLVAAGAINSSGCVDELISELLFFTKSVITMKSVEVIDLITKSFSITKVLLDNGGNCTSSSYLNHWVEFLEIY SQVVNSTNDASGRVLFESSACITVMLSKVAQVLRSCPQSTSPGTLNETANRIMEHAKTSGLVDHLCLCLATSGSSLISGS SNMLRAASEACRAVWSLINALDILFMKTSAILFPINALRTHSNEQDPLFGAESTKIVDAMTRAFLKSKAVQVAVYYCFHQ RLESAMGCCLQLLSRCCLHSGIVPALLCGLPSSLPVTTVVSGGGDGTIVSEIFSVLSLCSSSLNKDSQSVEPSNAKCKLT NPSSVVRHSCLILATIAQCLKSTGRNSAIFILTTSPKKQLARLSLLAHYISSDDKSKACFQPQSASAMLALASILCLESG ALVESPISEIAMPLIPRTSTLSDHVKFSSGNENDLDSDNFSGKLSYWQGVRDGCVGLLDSKLKLGGPLAVQQLCASGIPL LLMGLLSNDFLNASEGNEHLNDRVGLSPIGVVWTISSLCHSLSGGAVTFRQVLIRNEHVKLISKLICDVHLKLINCWTGP GGGRAGVRDLINAVIDLLAFPFFALQNAPGIPSATASVSSGFLLNAGSPGQRVCVEDKDIVKAIEEDMGKYTKILVEVGV PGIILRCLDHMELNDLGRPVAFLAKMVLHRPLAVQLADKGLLDSNRMRRLFDHSAPKEVTLDALMIISDFARMDKRFYEY IKAASILEFLKAFLSHEDPNIRAKSCSALGNMCRHSAYFYSSLARHQIVSILIDRCSDPDKRTRKFACFAIGNAAYHTDM LYEELRRSIPHLSNLLQMAEEDKTKANAAGALSNLVRNSEKLCEDIVSKGAIQSLLKLISDCAVVALNPSRNDSASESPL KIALFSLAKMCAHPLCRQFIRSSPLSPVISRLQQSPESSIAKYASIIIGKVS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Gene3D | 2 | 329 | 328 | 6.3E-96 | – | |
| PANTHER | 4 | 1331 | 1328 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 4 | 1331 | 1328 | 0.0 | – | |
| CDD | 5 | 257 | 253 | 0.0 | – | |
| SUPERFAMILY | 5 | 258 | 254 | 2.43E-92 | ||
| SMART | 7 | 257 | 251 | 6.5E-106 | ||
| ProSiteProfiles | 7 | 257 | 251 | 53.643 | ||
| Pfam | 7 | 257 | 251 | 1.3E-79 | ||
| ProSitePatterns | 13 | 40 | 28 | - | ||
| ProSitePatterns | 124 | 136 | 13 | - | ||
| Gene3D | 1018 | 1332 | 315 | 5.3E-34 | ||
| SUPERFAMILY | 1027 | 1331 | 305 | 2.1E-36 | ||
| SMART | 1114 | 1154 | 41 | 57.0 | ||
| Pfam | 1128 | 1232 | 105 | 9.0E-8 | – | |
| SMART | 1198 | 1237 | 40 | 0.68 | ||
| Coils | 1202 | 1222 | 21 | - | – | |
| SMART | 1238 | 1292 | 55 | 330.0 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein kinase activity | Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP. | ||
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). | ||
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. | ||
| Biological process | Protein phosphorylation | The process of introducing a phosphate group on to a protein. |
Expression pattern of LotjaGi6g1v0018000.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…