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LotjaGi6g1v0213600.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi6g1v0213600
Transcript ID LotjaGi6g1v0213600.1
Related isoforms 1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Vacuolar protein sorting-associated protein 54; TAIR: AT4G19490.1 VPS54; Swiss-Prot: sp|F4JT76|VPS54_ARATH Vacuolar protein sorting-associated protein 54, chloroplastic; TrEMBL-Plants: tr|A0A0S3RHH5|A0A0S3RHH5_PHAAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0213600
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr6:51208012..51231923) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

GTTTAATTTTCTTTCAATATTCTTTCTTTCTTTCCCCCACCCACTCCACTGTTTTCTCCCTTGATCGCCTTTCCATTTCA TTTCCTCTCCAAATCAACCAACCCAGTTCTTCTCCCCTCAGATCCCAACCCAACCCACTCCAATTCAAACTAAAATCCAC TTGTCAATCATCAAACCAATCACATTCTACATCACTAGCTACCACCATTCATTCATTCATTCACATTCTCAAATCTCATT CACTATAACTGAATGCACCGCCATTAACCCTCCATGGATTCCCCACCTTCCCAACAACCGTGGGGAAGGTCACCCACCTC CCCCTCCTTCTCCTTCTCCTCCAATTCAATCCAATCCCTCTCCTCCATCCTCAACAACCCTCTCTCCTCCACCACCATCT CCCCTCCCGAATTCGCCCTCATCTCCACCACCAAATCCACCTCCGACATCTCCCGATCCGACTTCCTCCCTTACCTCTCC GCCGTCGCCGATCCCCTCCACCGCTTCCACCACATCCGCAACCACGCCACCAACGAGATCATCGCCGATCTCCAACCCGC CGCCGGTGAGGCTCTCGTCGCCTGTCTCCGCGAGGTCCCCTCGCTCTACTTCAAGGAAGACTTCCGCCTCGAGGATGGCT CCACGTTCCGCGCCGCGTGCCCGTTCTCCGCCATCTCCGAGAACGCCGCGCTTCAGGAGAAGCTATCGCAGTATCTTGAT GTGGTCGAGCTGCACCTTGTTAAGGAGATCTCGTTGCGGTCTTCGTCGTTCTTTGAGGCTCAAGGGCAGTTGCAGGACCT TAATGCGAAGATCGTTGAAGGGTGTGCGCGGATTCGGGAGCTGAAGGATACGGTTCGGCTTATCGATTCCGATTTGGTTG AGTCGGCGAGGCAGATTCAGCAGCTCAATGCTACCAGGACGAACCTCTTGGCGCTTCTGCAGAAACTCAGGCTCATTTTG 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CGATCGGAGATCCTGTATCGTTTCGCGAGCACCTTGAAGCGATTTTTGATGGTCTTCCCGACGAGTATAGTCATCTCATG ACTATCATCTACAGTCGCGAGTTCCCTTGCACGATCTCGCAAGCTGAAGCTATGGTTATCGCGCATGAAGCGCGTCTTGA GCGTTCTCGCACGCGTCAGTTGAGTGCGAATCCTCCGTCAGCGCTCCTTTCTCAAGCTGCGTCACCGGCGACGCAACCTG CACCGGTGTCGTCGTCTTCTTCATCAACATCGTCGCCGACGACCTCTGAGGCTAACTATGCTTCAGGTTCCTCTGAAAAC TCCTACGATGATCGTTCCTACGATAATCGCGGCAGTTATGGCGGTTCTCGTGGCGGTTACGGTGGTCGCAACGGCAGTAA CAACTCTCGCGGTGGACGAGGAGGAAATCGAAGTGTTCAATGCCAGATTTGCAAGAAGTATGGGCATGATGCTAGTATTT GCTACCATCGTGGTTCATCATCTGGTTCTACTGGTTCTACTGGCATGTTTGGCTTGCAGCCAACTGGTTTTGGTATGCCA CTGCCTATGCATTCTCAGATGTTGCCTCAGTTTGGCTTCTCTCCATTTTGTGGTGTTCCACAATTTGGTGTACCTTCTCA GTTTGGTACATCACAGTATGGAGGCTTTCCAAACATGTTTGGTCAATTTCCTCAAGGTTTAGGCATGGGAAATTTTGCTC AGCAGTTTGGTTTCCAACCATCTGGAGGATCACAGTGGAACTCTTCTCAGTTTTCTGGTGGATCAAGACCTGGAAATCCT CCAGTTAGAGCTCCACAGGCTATGCTTACTGGACCTACTTCATCTACTACTGGTACTAACACTCCTGCTGCAGCAAATCT TAGCTCATGGTTTCCAGATTCTGGAGCTACACATCATGTTACCAATGATGCCTCAGTTGTTTCTGACAGTGTTTCCCTAA ATGGTAATGATCATATCTACATGGGAAATGGACAAGGTTTGCCTATTATTTCTGTTGGACATGCCTCTTTTCCATCTCCT TATCATAAACACACTACACTCACTATGAATAATCTGCTTCTAGTTCCTAACATCACCAAGAACTTAGTTAGTGTAAGCAA GTTTGCTCGTGATAATCATGTCTTTTTTGAGTTTCACTCATCCTATTGTGTTGTCAAATGTCAGGAAACTTCTTGGGTTT TGCTCAAAGGAACTGTTGGTCCTGATGGTTTATACAATTTTGAAGGGATGCATGTTCCAACCCTTCCTCCAGCTTCATCT GTTTCATCTACATCTGTTTCACCAGTAGCTGCTCCATCTGTCTTTTCTGCTTCAGTTCCTTTGTCCAATGTACCTAGTGC TAGCTCATCTTCAAGTGTACCTAGTGCTAGTTCATTTTCTCTTGTGTCTTCTGTTAATAATGTAGATCCTACTGCCTATG ACTTGTGGCATTGTAGGCTAGGTCATCCTCATCATGAGGCTTTACATTCTGCTTTGTCCAAATGTAATATATCATTGTCT AATAAAGCAAAATTTTCTAAATGTTCAGCTTGTTGTGTAGCAAAGTCTCACAAGTTACCCTCTTCCTCTTCTACTACTGT TTATGCTACACCTTTAGAGCTTGTTTTTGCTGACTTATGGGGTCCTTCCTCCATTGAGTCTTCTTGTGGTTACTCTTATC TTTTGACTTGTGTTGATGCTTACTCTCGTTTCACATGGATTTATCCACTTAGGCACAAATCTGAAACTTCCTCTGTTTTT CTTAAGTTCCAAGCTATGGTAGAGTTAAGGTTTAATCTGAAAATAAAGGCTGTCCAAACAGATAATGGCACTGAATTTAA ACCTTTACAATCTCATTTTGCTAAGCTTGGCATAGTGCATCGATTGACATGCCCCTACACACACCATCAAAATGGTAGTG TTGAAAGGAAGCATCGCCATATCATAGAAACTGGCCTTTCATTACTTGCATTTGCTAAAATGCCTTCTCAATACTGGGAT CATGCATTCCTGGCTGCAGTTTTTCTTATTAACCGTCTTCCTACTGTTGTTTTGGCCAATGAGACTCCTTATTTCAAGTT GTTCAAGACTCTTCCTGATTACAAGATACTTAGGGTGTTTGGTTGTGCTTGTTATCCTCACTTGAGGCCTTATACACACT CTAAGCTGTCACTCAGGTCCAAGGAGTGTGTGTTTGTTGGTTACTCATCATCTCATCAAGGGTACAAATGCATGGATGGT GATGGTAGGATTTTTGTGTCAAGGGATGTTATTTTTGATGAAGTTAAATTTCCCTATCCTACCCTGTTTTTCTCTGCTGG GTCTGATTCATCTGCACAAGGAATCCCTTCAGAAATTCCTGTTTTAGCTCCTCAAGTTCCTGTTCAGCAACAGCAGCCTT TTCAAGGTCAAGACTCAGTTGCAGCCTCTTCTTCTGGGAATTTTTCTCAGGGTGAAGCTTCTGTTCAGCAACAATCTCCA CCTACACCAGCAGCTACTGCCACTGAAGTAGCTGAAGTAGCTTCGCCTGGTTCTTCCTCTTCTGCTCCTATTCCTCAGCC AGTGGGAAATACTCACCCTATGCAGACAAGAGCAAAATCTGGCATAGTCATGCCCAGATTATTTCCAACTTTACTGCTCA CTCAAGCTGAGCCAGCTACCACCAAGCAAGCTCTCAAAGATCCTAAGTGGTTAGCTGCAATGAAGGCTGAATATGATGCA TTGCTTGCTAACAATACATGGACATTGGTTCCACTTCCCAAGGATAGGAAGCCAATTGGTTGTAAATGGGTTTTTAGGGT GAAGGAAAATGCAGATGGCACCATCAATAGGTATAAGGCCAGACTTGTGGCCAAAGGTTACCATCAAGTCAAGGGGTTTG ATTATTCAGAAACCTTTTCCCCTGTGGTGAAGCCTATAACTATTAGGCTCATTCTTTCCCTTGCCATTACTAAGAGGTGG CATATTCATCAACTTGATGTGAATAATGCCTTTTTAAATGGAGCTCTTCAAGAGGAGGTATACATGCAGCAACCAAGTGG ATTTCAGCATGAAGACAAATCTCTTGTTTGCAGACTTAACAAAGCTCTTTATGGCCTTAAACAGGCCCCAAGAGCTTGGT TTGACAGATTGAAGTCAGCCCTTGTGAAGTATGGTTTTAAACCAAGTAGATGTGATCCATCTCTCTTCACTTTCTACACT CCAACTTGCTGCATCTACATACTAGTCTATGTAGATGATATTATCATTACAGGCAATTCCTTGCCTCTGGTTCAGAAAGT AGTGCAGAACCTCAACTCTGAATTTTCCTTGAAGCAATTAGGCCAACTTGACTACTTTCTTGGTGTTCAAGTGCATCATC TTCAGGACAGGTCCTTGCTTTTGACACAAACTAAATATATAACTGACCTTCTTGAAAGGGCAGAAATGGGAGAGGCCAAG GGGATCTCTACTCCCATGGTTAGTGGAGCAAAACTCAGCAAATATGGAGCAGATTACTTTGCTGACCCAACTCTCTATAG ATCAATAGTTGGTGCTCTCCAATATGCAACTTTAACAAGACCTGAGATTAGCTTTGCAGTTAACAAAGTCTGTCAGTTTC TAAGTCAGCCTCTAGAAGAGCATTGGAAGGCTGTTAAAAGGATCCTAAGATACCTTAAGGGTACTCTCTTTCATGGCCTG CACCTCAAGCCTTGTAGTTTGCACACTCCAGTCCCTCTTGTGGCCTTTTGTGATGCAGATTGGGGATCAGATCCTGATGA CAGGAGATCCACCTCAGGCTCTTGTGTCTTTTTTGGTCCCAACCTTGTCTCTTGGAGCTCAAAGAAGCAAACCCTGGTGG CTAGATCGAGTACTGAAGCCGAATACAGGAGCCTAGCTAATACCTCTGCTGAACTGTTGTGGGTTCAGTCTCTTTTGCAG GAGTTGCAGATTCCTTTTTCTCCTCCTAGGGTGTTTTGTGATAACATGGGTGCAGTGGCTTTGACTCATAACCCAGTTCT TCACACTCGCACTAAACATATGGAGCTTGACATCTTCTTTGTGAGGGAAAAAGTTCTCAACAAGTCTCTTTTTGTGCATC ACATTCCTTCTGTTGATCAGCTGGCAGATTTGTTTACCAAGGCTCTATCACCACTTCGTTTTGAAACTCTTCGTGGCAAA CTCAATGTGATTGAGAAATCACTTTCTCCCCCACCTTGAGTTTGAGGGGGCCTATTAGAGTAGAGTACACATTACTCTGA TTAAGAAGTTAGTTACTGTTAGTAGTATAGTTAATATTTGAGTTAGTTACATTCTGTTAGAATGAGCTGTCAATACAGCT GTCATGTGAGCTGTCATTACAGCTGTCACATAACTGATTCTGTTAGAGTTGGTAGCTTGCTTAGCAAGCCTTGTATTCTC TATAAATACTGAGATCACTCATTGTAATCTTTACCTTTTCAATCAATGAAATTCAGTTGAAGATTTTCAACATCATTACA GCAAATTATTGAGTGAACATGCTTGAATGATGACTCATCAAAATGGGCAAAAATAGAAGTTTTGTAGACATGCATAGTGC AGGCAGCATGCAAAGTAAACTTTAGAGCTGAATACTAATACAAACGTTTCTTTCCCCCCACATGGATAAAAGTAGATAAA CAGGTATTAATTCCAATTCCCACAAGATGAAGAAAAGTAAAATTTCTCGATAAGAAAATGGTTCTGTTTCATCGCTATAC ATTGCTAACATCAGGAATTAGAATAATTGCTATTCTTAAGTAATCGGCTGACCAGCTAAAGTAACTTTACGTGGTGATAA ATCCCATCAGTAAAATGAGTCAGACACCCAGAAAATTACATATGGAATTTGCACACTGCAATGGCTATATATTCATGCAG GTTGGTTGACAGTTATTGATGTTGCTTGTATAGGGCCAACTGGCCAACATAGTTGGCTAGGTGGGACTTTTGACTGGTAT TTGTTTGCTTTGGTGGATAAGAAGTGACCTTACAAAAGGCTTAAACTTAATTGATTTCATAAATATGAATAGTCAAGGGG GAACTTAGTTAAATTTGCCTACCCCAATTATGTTATTTATGATCTCTTATTTTTGAGTTGTGATAAACATTACACAAAGT AGTTCCTTGACTTTCTGAGACGAAATCTGAATCCCTTTATCACATTTTTTTCAGGCTTTTGGTTGGTCTGTGGTAGATAT ACAAGGTAATGTATAATTTCTGAGCTTTGTGCGGCTGTGATTGGCCATTTTACAAAGGTTTTGTAGCAGTCAGTGTTTAT ATTCATTTCTTGGTTGCTGTCTCCATAATTGTGATGTTAAGCTGAGAATAGATATGAAATTAGTGAATGAATGATTTTTT TGGGTTACTTATCCTCCTCCCCATCACTTCAGCCATGGCTATTGATTGATCAATATATACATGATTCGAGAAATGTAGTG ATTAGCAAAATATATGTTCTGTTCAAGTAAATGCTTCGGGTTCTCTGATGGAATGCAGCTTTAATAGAGAGAAATCTGTT TTTCATTTTCCCATTGAGCGACAAAGCCCTTGCAACAGCATAATGCTAAGTATACATACACTTGAAATGGTTTATGGACA CAACCCGTGCAAGAACTGAGGAAAGTGTTGATACGACATTTGCAAGGTGTGTCGTAAAGGAATGCCATTTGGCTTTGGTT TCTTGCCATTATTGATAATGTTGTACACTCTTAAGATTCTTCGAAAATTAGTTGCATTTTTAATAGTTTAAATTTGATCT ATTGAGTGAACAAGTTGCATCTTTTATTTTATGTATACATGTTTTGCCACATCAAATATAATTTGAGGTATCATTTCATT ATTCTACCTCATCTACCATCGTAGTTACTGACTTTTTAGGCAGATGAATTTATTTATGTAATATTAAATTCAAATTTTAT TATTAAAATGGTTCTTCATTAGAAGTTATAGGGATACATATTATTCACTAAATGAATTATTTAAATAACCTAAAGGAGCT ATTCTAATATGTTAATAATTAAAAAGGAATATAATTTTCAACAATTGTTTTTTCTTAATATTTTCTACAACTCCGTTACT CGACAGTTAATACCCAGTTATTTCGTTCGAAGTTATTTTGTCTTTACTAGTTAGTCTAGGAGAGCACATGGGTCGGACCA ACCCATCACGATTACAAAACAATGAGTTGGTTCGGATTAACGTGTTGGATTAGCATGTAAACCAGTAAACCCGATGAGTT TGATTTCAGTTGAATTTGTTGTTTGGACACCTGTTGGACCTAACCTAAACTAAGCAGCAAGGCACGCATAGACCTTACTA TACTTGTTTTTTTTTTTTTTATGAAATAGACCTAACTATACTGTGTAACTAGAACTCGTCGATTGAGTTTTTTTTTAGCA TAAACGGGTTTTTTTTTTATACATCGGAAAATGTAAATGTGTTCTATTATTTTACTTATTTTATGCATAATCTTGTAGCA TATTAAAATAGTGTCATAATACCCGACATTTAAGTATGCCAATAAATATATCTGTGAATATGCTTACAAGTTTAGGGAGA ACCTAATATGCACCATTTTTAGGTGGTGTAATTTTACACCACCTACTTTGACTGAGTATAGGAGGTTAACAC 

CDS sequence (LotjaGi6g1v0213600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGATTCCCCACCTTCCCAACAACCGTGGGGAAGGTCACCCACCTCCCCCTCCTTCTCCTTCTCCTCCAATTCAATCCA ATCCCTCTCCTCCATCCTCAACAACCCTCTCTCCTCCACCACCATCTCCCCTCCCGAATTCGCCCTCATCTCCACCACCA AATCCACCTCCGACATCTCCCGATCCGACTTCCTCCCTTACCTCTCCGCCGTCGCCGATCCCCTCCACCGCTTCCACCAC ATCCGCAACCACGCCACCAACGAGATCATCGCCGATCTCCAACCCGCCGCCGGTGAGGCTCTCGTCGCCTGTCTCCGCGA GGTCCCCTCGCTCTACTTCAAGGAAGACTTCCGCCTCGAGGATGGCTCCACGTTCCGCGCCGCGTGCCCGTTCTCCGCCA TCTCCGAGAACGCCGCGCTTCAGGAGAAGCTATCGCAGTATCTTGATGTGGTCGAGCTGCACCTTGTTAAGGAGATCTCG TTGCGGTCTTCGTCGTTCTTTGAGGCTCAAGGGCAGTTGCAGGACCTTAATGCGAAGATCGTTGAAGGGTGTGCGCGGAT TCGGGAGCTGAAGGATACGGTTCGGCTTATCGATTCCGATTTGGTTGAGTCGGCGAGGCAGATTCAGCAGCTCAATGCTA CCAGGACGAACCTCTTGGCGCTTCTGCAGAAACTCAGGCTCATTTTGTACGTCAATCAAGCCCTCTCTGCTCTCAAATTG CTTGTTGCGTCTGCAGATTGTGCTGGAGCGCTGGATGTAACCGATGATTTGCAACAGTTGCTGGATGGAGATGAGCTCAC TGGTCTACACTGCTTTCGTCATCTTAGAGATCATGTAATAGGCTTTATAGAATCCATAAACAGCATTCTTTCCGCAGAGT TTATTCGGGCTTCTTTACATGATGCTACAGAAACGGATGTGATTATTTTATCCAAAGCTAAAGCAAGGGCTTCCCTTCCC ATGAATGGAAAGGATGATGAAGTAAAGTTAGAAGAAGAAGAAACCACTAATTTCAAAGATCGTCTTCTTCCTACTGTAAT TGGGTTGCTTAGAACAGCTAAACTCCCCTCTGTTCTGAGGTTCTATCGAGATACACTGACTGCTGATATGAAGAGTGCTA TTAAGACTGCTGTTGCTGAGTTACTTCCAGTTCTTGCTGCTCGGGGCTCGGAATCAGAATTCTTTTCTGGAGACAGAGCT GCAGATGCAGATGGTGGAGGTGCATCACTTGCTAGCAAGTTAAGGAGCCTATCATCTGATTGCTTTGTGCATCTTCTGAG TGCTATTTTCATGATAGTGCAGGCACATTTAGTGCGGGCTGCTGAAGTGAAAAAGGCCATTGAATGGATTTTGAGCAACC GTGATGGTCATTATGCTGCTGACTCAGTTGCTGCTGCAATTGCTCATGGTGCTGTAGCCGCCGAAATATCTCAAGAAAGT GAGATTCATGGTACTACTTTGTTGCCATATTCACCACAAAGAAGTGTTGCCAAGGGTCCTTTCCAGGGAAAAACAATTGA TGCAGTGAGCTCCTCAAACATGTCAAAAAATTTCAGAGCTGATGTATTGCGAGAAAACGCAGAAGCTGTCTTTGCAGCGT GCGATGCTGCTCATGGAAGATGGGCAAAGCTTCTCGGGGTCCGTGCTGTTCTCCATCCTAGGTTGAAATTGCAGGAGTTT CTAACTATATACAACATCACCCAGGAGTTCATTACTGCTACTGAAAAAATTGGTGGAAGATTGGGATACAGCATTCGTGG GACACTGCAGTCACAGGCCAAGGCTTTTGTTGATTTTCAGCATGAATCTCGGATGGCGAAAATTAAGGCATTGCTTGACC AGGAAACATGGGTGGAGATAGATGTTCCTGAAGAATTTCAATCCATCATTAATATACTTTTTTCATCTGATGTATTGACT TCTGGGAACCTTAATGGCACTGAGGAAGATAATGCACACAGTTACAGTGATAACAATGCGGACGCTGTACATTCAAATGC TGAACATCAGGTTGAGCAGACTAATTCCATCGAAACATCCAGGAAAAGTGCAGGATCGGATGGATCCAAACCCCTTGTTG ATTCTGTGGAACCAAATAGAGGGAATAATAGGATTTCATCAGCCCAGAACAACAATGTCGAGAAAGACCATAAAAAATCT GTGTCTCAGGCCCTTTTGTACAAAGGTGTTGGTTATCACATGGTAAACTGTGGCTTAATATTGCTGAAGATGTTGTCAGA ATACATCGATATGAACAACGTTTTGCCAACACTGTCTTCAGAAGTTGTTCACCGTGTAGCGGAAATCTTGAAGTTTTTCA ACACACGAACATGTCAACTTGTGCTTGGGGCTGGTGCTATGCAGGTGTCTGGTTTGAAGTCCATCACCTCTAAACACCTG GCCTTGGCAAGTCAAGTCATTAGTTTTATACATGCTATTATTCCTGAAATTCGGCAGATTCTTTTTCTCAAAGTACCGGA GACTAGAAAATCATTATTGCTTTCAGAAATTGATCGAGTTGCACAGGATTATAAAGTTCACAGAGATGAAATACATTCAA AATTAGTTCAGATAATGCGAGAAAGATTACTGGTCCATTTACGTGGGTTGCCTCAAATTGTTGAAAGTTGGAATAGACCT GAGGAAGCTGACCCCCAGCCTAGTCAATTTGCTCGGTCCCTTACAAAGGAAGTTGGATACCTGCAACGTGTCTTGTCTCG AACTTTGAATGATGAAGATGTTCATGCAATTTTCAGGCAAGTGGTCATTATATTTCACTCACAAATTTCCGAAGCATTTT CAAGATTTGATATAAGCACTTCCCAAGCACAGAATAGACTATCTCGGGACATCAAACACATTCTTCAATGCATACGGTCA TTGCCATCGGGTGATTTAGGTAAATCTGATACCCCAAACTGGGGTCAGCTGGATGAATTCTTGGTGCAAAGATTTGGGTC TGATGCTGTTCAGTAG 

Protein sequence (LotjaGi6g1v0213600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MDSPPSQQPWGRSPTSPSFSFSSNSIQSLSSILNNPLSSTTISPPEFALISTTKSTSDISRSDFLPYLSAVADPLHRFHH IRNHATNEIIADLQPAAGEALVACLREVPSLYFKEDFRLEDGSTFRAACPFSAISENAALQEKLSQYLDVVELHLVKEIS LRSSSFFEAQGQLQDLNAKIVEGCARIRELKDTVRLIDSDLVESARQIQQLNATRTNLLALLQKLRLILYVNQALSALKL LVASADCAGALDVTDDLQQLLDGDELTGLHCFRHLRDHVIGFIESINSILSAEFIRASLHDATETDVIILSKAKARASLP MNGKDDEVKLEEEETTNFKDRLLPTVIGLLRTAKLPSVLRFYRDTLTADMKSAIKTAVAELLPVLAARGSESEFFSGDRA ADADGGGASLASKLRSLSSDCFVHLLSAIFMIVQAHLVRAAEVKKAIEWILSNRDGHYAADSVAAAIAHGAVAAEISQES EIHGTTLLPYSPQRSVAKGPFQGKTIDAVSSSNMSKNFRADVLRENAEAVFAACDAAHGRWAKLLGVRAVLHPRLKLQEF LTIYNITQEFITATEKIGGRLGYSIRGTLQSQAKAFVDFQHESRMAKIKALLDQETWVEIDVPEEFQSIINILFSSDVLT SGNLNGTEEDNAHSYSDNNADAVHSNAEHQVEQTNSIETSRKSAGSDGSKPLVDSVEPNRGNNRISSAQNNNVEKDHKKS VSQALLYKGVGYHMVNCGLILLKMLSEYIDMNNVLPTLSSEVVHRVAEILKFFNTRTCQLVLGAGAMQVSGLKSITSKHL ALASQVISFIHAIIPEIRQILFLKVPETRKSLLLSEIDRVAQDYKVHRDEIHSKLVQIMRERLLVHLRGLPQIVESWNRP EEADPQPSQFARSLTKEVGYLQRVLSRTLNDEDVHAIFRQVVIIFHSQISEAFSRFDISTSQAQNRLSRDIKHILQCIRS LPSGDLGKSDTPNWGQLDEFLVQRFGSDAVQ 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
MobiDBLite 1 23 23 -
PANTHER 20 989 970 0.0
PANTHER 20 989 970 0.0
MobiDBLite 645 686 42 -
MobiDBLite 645 716 72 -
Pfam 732 862 131 3.1E-46

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Cellular component GARP complex A quatrefoil tethering complex required for retrograde traffic from the early endosome back to the late Golgi and biogenesis of cytoplasmic vesicles.
Biological process Retrograde transport, endosome to Golgi The directed movement of membrane-bounded vesicles from endosomes back to the trans-Golgi network where they are recycled for further rounds of transport.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi6g1v0213600.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…