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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi6g1v0242900 |
| Transcript ID | LotjaGi6g1v0242900.2 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Histone-lysine N-methyltransferase; TAIR: AT5G42400.1 SET domain protein 25; Swiss-Prot: sp|F4K1J4|ATXR7_ARATH Histone-lysine N-methyltransferase ATXR7; TrEMBL-Plants: tr|K7LBW1|K7LBW1_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0242900 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:55529648..55545521) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AATTAATCTCTCATCCACTGGAATCGTATTAAACGATAAGAGACTAACAAAATGTTTTTTCATTCAAAGAAGTTTGGAAT ATATGCATGTTGCTAGATAACAACTGCAAAACAATTTCATAAATCATTTTACGCAATCGAGAAATCTCATCTTTGAAATA CATGTGGGCACAAGCAAATTACAAGAATAGCATGGTTCGATCAATTGATAGGTTTAATTAGATTGATGTGTTTTATTATG ATATTTAATCATCATCTAAAGCCATTCTTGTTTTATTTTTGGCAGAATCCAACTTGGGCCAAATCCAAAGTAAGGGTTTG ATATTACTCAACACAACCCACCGCACATCTCAGTCGATTATACAGCAAGCTTCATCCATCCATCCATCCATCCATCCTGA TCCTGCTCTCAGACCCGCTCTCCCCTCCCTCAGGCTTCATCGCCAGATCGGAGCGAACCAGATCGAATCTGAGCGAATTC ATCACAGATTGAAGCAAGAAGACCACGGTTTTCATCTTTAATTGAATTTTTGATTCACCTATTTCCTCTTCTAGTTTAAC TGGAATCGATTGAGTGTTGCAGGGAATTGAATTGGGGGAGAAGGTCTAACAGTAAAAAGCAAGTCTTAAACTAAAAAAAT AATAATATGTAGTGGATTCACATCTCGTCAATTTGCTTGTTTGTTTGTGTGTTTCGCTTGCATGTGTTATGAATTTCAAG TGTCAGCATTATCATTACATTCCAAAACATGATGATTGTACAGTAACACGCGCATTAAAATCCTTCGTGATTGCCACATT TTGAAGCTCAATCCTTTTCCTGTCGTCAAATTTTGGTCGATCCACGCGTGCTGACCTAATCGTGTAATTCCAATTTACCA TTCTTAATCTTATGGTTTTGATATCATGTTCATTAAGGATAATACAAATTAGCCTAATTTTCATTTTTCAGTTAGGTTTG 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CDS sequence (LotjaGi6g1v0242900.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGTCTTCTCAACTCCCTTTCTTCATGAAGGTGTCCCCTTCTTTTCTAGAAAGAGGTTCAAAGTGTCAGGTCTTGCACA TCCAGATATAGATGCAGGAATTTCCGGTGATATACCCTTGCGAGATGTAGAAAGATGTACTGGTGACATTCCCTCTTGCT GCAATTTTGATGATAAAGTTGATCCTGATTCTGAAATGGAGATGACCTGTCCATCAAATGTTAACAGTGGTGATGTTCCT GTTTGTTCTACTCCTACCACTACAGGTAGTATTTCACATCTGGACCAGAGTTTCACTGGCTATGTGCAACCACCTGCTTT TGTGAGTGGATGGATGTATGTGAATGAACAAGGGCAAATGTGCGGTCCTTATATTAAGGAGCAGTTATATGAGGGCCTAA CTTCTGGTTTCTTGCCATTAGAACTTCCTGTGTATCCTATGATCAATGGCACGATAATGAACCCTGTACCATTGAATTAT TTCAAGCAGTTTCCTGACCATGTTTCCACCGGGTTTGCATATCTTTCTATGAGTACCTTAAGCACAAGGATGCCTACGCA TTGCCCCTCCTCTTCTTGTAAGGATATGGCAGTTTACGGGCACGACAGATCTTCTGAACATGCTGCTCCTCTGGCTGCGA ACACCGATTCACATACACTTGTCAATTACAGCATTAAGGAATCCAATCAATCGGATTCAAACTCTGAGTCCTTCAACAGT ATAATATCTTGTCAGATGTTACGTGAAGATTCTTGTTGGCTTTATGAGGATGAAAAGGGAATGAAACATGGGCCACATTC TTTTTCGGAATTGGTTTCCTGGCACCACCATGGATATCTTAAAGATTCAACCGCGATCTCCCATTCTGACAATAAGTATG GCACATTTGTGTTACTATCTGTTGTAGATGCATTGAAAGGAGATATATCTGGAACCATGTGTAGATCAGGTTCCACAAGC AATGAAGTTGGTAATGTGGTGAACTTAACTTGTGAAATATCTGAAAATATTTCGTCCCAGTTGTACATGGGCGTCATGAA AGCTGCCCGCAGAGTTGTGCTAGATGGGATTATTGGTGATATCATTGCAGAATTTTTTACTGAAAAGAAACACCAGAGGC TTAAGCTTGAATCAACTGATCGTAATTCTGAGACTTGCAAGTTAGACAAAAAAATGTGTAAGTTTTCCGTGGAGATTAGT CAAGATACTGCCATTCCAAGTGAGCTTGCATCTTCCCATATTTTGGATGATCAGTCCTGTCATGAAATTTCGGGACCATC TTCAACAAGTGTTAAGTCAGTTGGAAGTGTTGAAAATTTTTGGTGGTCATATGCTGTTGTTCGTAAAGTACTTTTTAATT ATTGCTTACAAGTCATGTGGAATGCAGTGTTTTTTGACCCTTTAACAGAGTACTTATTTTCCTGGAGGAAGAGGAAACTT TGGTCTCAACCTAAGCCTCAGCCATCTGTTAATGGATGCAAAGATTATGGTGAAAAGATTGAACAGTATGAAGTTCCAGA GAGAGATTATCATCCTCAGTTAGATTCGTCTCCTAGTAGTCTCAAAAGTGGAAACATACTCGAAGGTCAAATGATTTCAC ACACTTACAACTCTAAAGATTTGACATGCATTATCGAAGGTGTGGAGAATGAGCTTCACTTCTCTTCAAAGATGTCTTTA GCTGATTACATTCGAAGTTTTGTTGAAAAGGAAGTGAACACATTAATTCCTTCCCCAGAGGAAGACAAATTGAGTCAGGT TGTTATTAGTGACAGTGGCACTTGTAAAACATCTGTGAAGGATATTCTTAATGACAAGTCTATGGATCCTGTAAGAGATG GGCATTCCTTTTGCATGTCCGCATCTGGAAACCATATGTCTAATATATTCTCAAAAGCATTTAAAGAATTGTGTGGACAT TTGGATGATGTGGTTGATGAAGAGGAGATTGGTAACCTACCACTACCACCTGGATTTGAAAAGAAATGTCCTACAATTTT CCCACAATTCAATTCAAAATTTCGACCTTCAAGGTTATTTGAATGTAATCCTAAGATTACAGAATATGTTGCCACTGCGC TGTGCCGTCAGAAGCTGCACGATGAAGTTCTAGAAGACTGCAAGTCTTCACTTCTTGATTCTGCATTGAATCAAATTTTT ATATCATTGTGTCCCAAGAAGAAGCAATTCCGTTCTTATGGTCGTAACAAGAAAGAGAAAGCATTATGTGCAAGCAAGGA ACATTCAAATGATGCTACTTCTGGACTAGGAAGAGTGAAGGAAGGAACAAAAAATTCTTCTGGAGTTCCTATGGTGATTG AAAAATATACATCCTACAGCAAGAAGCGGTCAAAGAAAGAGTTGCATTCCTCCCAATGTGTAACAGATGATTATTTGAGG CCAGGAAAGCCGCCTGTGGCTAAGTTAAGGAAATCTAGAGATGTGGATGAGACTGCAGAAGTCAAAATAACGTCTCTTAA ACCTGGAAAGGCTAGGATGATTAAAGGGAAAAAGGATACACATTCTAATGGCAGGTCTTCTTCTGTCAATGTCAACAGTA ACTCCCACAGTGATCAGTTGTCCTCGAAGAATAAAACTAGTCAGAAAGTATTGAAGTTTTCAAGTACAGTTCAAAATGAT GTTATGGATGTTGTAAAGTCTAAAGAAAAGAAGCTTTCAACGTCAACAGATAATAGCGTTAGCACAAAGAAGGTGATTAG AAGTGATGGTTGTGATGGAGCAACCATTCAAGGGAAGACCACTGGTTCCAGAGAGATACTTAATGCATCAAAGAAAGTTT CAAAATTAAAAAGGAAGCATCAAATAGATGGTATGACATCCTCACATCCTGCTAAGGTTTTGAAAATTTCAAATAGTGCG AATGTGGGAGCTAGCAAACAGGTTACTGTGGCAAGGGGGAATTCTGCTAAATCGAAGCAATTGAATTTATGTCCTCGATC TGATGGATGTGCTAGGGCTTCTATTGATGGATGGGAATGGCATAAATGGTCTCGAAGTGCCAGTCCTGCATATAGAGCAC GTGTCAGGGGTCTTCCGCGTGTACAAAACAAGTGCATGGATACTGAAAATAATTTATCTCAGTTGTCAAATGGTAAGGGT ATTTCTGCAAGAACTAATAGGGTGAAATTGCGTAACCTTGTTGCTGCTGCTGAGGGTGCAGATCTTTTGAAAGTGGCTCA ATTGAAGGCACGGAAAAAGCGATTACGTTTTCAAAGGAGCAAGATTCATGACTGGGGTCTTATTGCCATGGAGCCAATAG AGGCAGAGGACTTTGTCATTGAATATATTGGAGAACTAATTCGTCCTCAGATATCTGATATACGAGAGCGTCAGTATGAG AAGATGGGAATTGGAAGCAGTTACCTTTTTAGACTTGATGATGGTTACGTGGTTGATGCTACAAAGAGAGGTGGGATTGC AAGATTTATTAACCATTCTTGTGAGCCCAACTGCTATACAAAGGTTATATCTGTTGAGGGTCAAAAGAAGATTTTTTTAT ATGCAAAACGGCATATAGCTTCTGGAGAAGAAATTACATACAATTATAAGTTTCCCTTGGAGGAGAAAAAGATTCCCTGC AACTGTGGTTCCAAAAAGTGCCGTGGATCACTTAATTAG
Protein sequence (LotjaGi6g1v0242900.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MVFSTPFLHEGVPFFSRKRFKVSGLAHPDIDAGISGDIPLRDVERCTGDIPSCCNFDDKVDPDSEMEMTCPSNVNSGDVP VCSTPTTTGSISHLDQSFTGYVQPPAFVSGWMYVNEQGQMCGPYIKEQLYEGLTSGFLPLELPVYPMINGTIMNPVPLNY FKQFPDHVSTGFAYLSMSTLSTRMPTHCPSSSCKDMAVYGHDRSSEHAAPLAANTDSHTLVNYSIKESNQSDSNSESFNS IISCQMLREDSCWLYEDEKGMKHGPHSFSELVSWHHHGYLKDSTAISHSDNKYGTFVLLSVVDALKGDISGTMCRSGSTS NEVGNVVNLTCEISENISSQLYMGVMKAARRVVLDGIIGDIIAEFFTEKKHQRLKLESTDRNSETCKLDKKMCKFSVEIS QDTAIPSELASSHILDDQSCHEISGPSSTSVKSVGSVENFWWSYAVVRKVLFNYCLQVMWNAVFFDPLTEYLFSWRKRKL WSQPKPQPSVNGCKDYGEKIEQYEVPERDYHPQLDSSPSSLKSGNILEGQMISHTYNSKDLTCIIEGVENELHFSSKMSL ADYIRSFVEKEVNTLIPSPEEDKLSQVVISDSGTCKTSVKDILNDKSMDPVRDGHSFCMSASGNHMSNIFSKAFKELCGH LDDVVDEEEIGNLPLPPGFEKKCPTIFPQFNSKFRPSRLFECNPKITEYVATALCRQKLHDEVLEDCKSSLLDSALNQIF ISLCPKKKQFRSYGRNKKEKALCASKEHSNDATSGLGRVKEGTKNSSGVPMVIEKYTSYSKKRSKKELHSSQCVTDDYLR PGKPPVAKLRKSRDVDETAEVKITSLKPGKARMIKGKKDTHSNGRSSSVNVNSNSHSDQLSSKNKTSQKVLKFSSTVQND VMDVVKSKEKKLSTSTDNSVSTKKVIRSDGCDGATIQGKTTGSREILNASKKVSKLKRKHQIDGMTSSHPAKVLKISNSA NVGASKQVTVARGNSAKSKQLNLCPRSDGCARASIDGWEWHKWSRSASPAYRARVRGLPRVQNKCMDTENNLSQLSNGKG ISARTNRVKLRNLVAAAEGADLLKVAQLKARKKRLRFQRSKIHDWGLIAMEPIEAEDFVIEYIGELIRPQISDIRERQYE KMGIGSSYLFRLDDGYVVDATKRGGIARFINHSCEPNCYTKVISVEGQKKIFLYAKRHIASGEEITYNYKFPLEEKKIPC NCGSKKCRGSLN
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 55 | 1212 | 1158 | 2.0E-280 | – | |
| PANTHER | 55 | 1212 | 1158 | 2.0E-280 | – | |
| Gene3D | 98 | 179 | 82 | 1.4E-5 | ||
| Gene3D | 242 | 314 | 73 | 9.6E-11 | ||
| SUPERFAMILY | 246 | 300 | 55 | 3.92E-12 | ||
| ProSiteProfiles | 250 | 306 | 57 | 10.632 | ||
| MobiDBLite | 741 | 767 | 27 | - | – | |
| MobiDBLite | 780 | 868 | 89 | - | – | |
| MobiDBLite | 803 | 823 | 21 | - | – | |
| MobiDBLite | 843 | 868 | 26 | - | – | |
| Gene3D | 1012 | 1211 | 200 | 4.5E-55 | – | |
| SUPERFAMILY | 1069 | 1209 | 141 | 8.37E-50 | – | |
| SMART | 1073 | 1196 | 124 | 9.9E-40 | ||
| ProSiteProfiles | 1073 | 1190 | 118 | 18.633 | ||
| Pfam | 1085 | 1189 | 105 | 2.6E-20 | ||
| ProSiteProfiles | 1196 | 1212 | 17 | 10.314 | ||
| SMART | 1196 | 1212 | 17 | 1.9E-4 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi6g1v0242900.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…