Your browser is unable to support new features implemented in HTML5 and CSS3 to render this site as intended. Your experience may suffer from functionality degradation but the site should remain usable. We strongly recommend the latest version of Google Chrome, OS X Safari or Mozilla Firefox. As Safari is bundled with OS X, if you are unable to upgrade to a newer version of OS X, we recommend using an open source browser. Dismiss message
| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0556600 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0556600.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Zinc finger, PHD-finger; TAIR: AT2G19260.1 RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q9P1Y6|PHRF1_HUMAN PHD and RING finger domain-containing protein 1; TrEMBL-Plants: tr|I1K6W5|I1K6W5_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0556600 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:108866412..108876146) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AATTGGAGGGGGAACATTTCATTAGATAAAAATACCCGTCTTGAGAGTAAGGATAATTAGAGTAATTTTGTTTTATAATC CTTCAACTCTTCATCTCCCCTCATAAATCAAACAAGAAAGTGATTATTTCGCGTGACCTTTCCTCTCCTCCGCTTAACCA AACATAATAAGAATTAAAATCCCTCCCTCCTCCTCCCCCTCAACCAAACACACCCTTCCTTCTCCCACTTATAAAACCAA TAGAAGTTCATTTTCATCACAAAATCCAACCCCCCAAAATCTTTTCATTTAAATTCCCTACAAACAAAAGAAGCGTACAT GTATTGAGGTCTCAAGTCCCAACTCTCTGTGCGTGGAAGCCATCCCTTCGTTCACGGTTGATCCGATTAGGTATTGATGT TGTTCTTCTTTTACAGTTCGCAATTTCTTTCCTGACATTGAAGGTTCAAATTACTGTCTACTTTATGGCCATAGGGGTTT AACTGTATATGTATTTTACCGTATTATAGATGCTGTTGCCATTAACTCTGCGTTCAATCCTGTATATTGCATAAATTTAG TTTTATGAGGAATGGAAACATTGGGATTTTTACCAAAGAAAGAGGATTTGGAATTGGAACCTGGTGAGATGCATAGGTTT TATCTTATATCTGGTAGGAAGCCATCATCAAGAACTTTCCGAAATCGCCTTCTATTTAAATAAAGAAGCTATTCTTTCCA TCTGCTTTGGGAAGTTTTGATGGATCATAAGAGTTCTGCCATGGTGGTTCATATTTGTGAATTGTGAATCTCCTTTTCCT TGCTTCAAATAGATTCTAATTGGTCATGCGATTTGAATGGCATTTCGCAAATCCTGAGATCAACCACATGTGCTTCGTGC TAGGATTGGGCGATTGGCATAATATGGAACAATTAGGTTTAGGGTTAGTTGGTAGTCTATCTTTATTTCTTCAGTAGGGT TAGTTTATTAGAAATAGGAGTACCCTCCTTAGATTAGAGTATGAATTGAATTGAATAATAGAGTTTGTAAAGAGATTTTC CCTTGGAAGTGGTTTCCCCTTCGAAAGAAGGTTTTCCTTGTTTGAATCCATTAGGATTGTTTTCGTCTATCATCTCTCTT CTTCTCTTCTCTCTTTTTTTATATTTGCTATTAGGTTATTTCCTAACCGAACAATTGGTCCGACCTGCCAGAGCATCCAA CCACCACCGAGCACCACTATTGCAGGGTTCTAAATATTGGGCCTAGTTAAGTTGTGGGCAGGAGTTTAGTTTATTTGTAT CTGTTAGTTGGTAGTCTATCCCTATCTGAAATCTATCTTTATTTCTTAGTAGTTAAGTCTATCTTTATTTCTTTAGTAGT GTTAGTGTTGAGTAGTCTCACATTGACTAGAGATATGACCAAGATAACCCTTATATATGGGATGGCAATCCTCAACTCTT GAGCTAGCTTTTGGGTTGAGTTCAGCTTCTCAAATTCTAACATGGTATCGGAGCTTATCCTAGATCCGTTAAGCGGATAC CACCCGTATATGGCCACCCGCAAATGTTTATTCCTACATATTACACGCTCCAGATTCCAGAGGTTCTCCTTGTCTGAATA CATTAGAATTGTTTTCGTCTATCATCTCTCTTCTTCTGTTCTCTCTTTTTTATTTCTTCTGTAGGGTTATTTCCTAACCT ATAACCTAACAGACACATTGAAAGATTATTTCTTTTGGGAACCGGTTGAATTAGAATATTTGATATAAATTAGAATTTAA GCTTGTTGGGTTGGTTTTCATAGGAACTTGACCGTTGACATATGGGAAAACTATTGGCTCCATTTAATTGAGGAGTTGGA AGTAAAGAATTGTTGTGGGCTTATGCCACTAAATTGTTCTGTTAGAAAACTTGAAAATTAGTGGAGGTTTCTAATCGGTC GATTGAGCAAATTTAACATCCATTATTGGGTTTGTCTTCAAATGATCAATTCTTTGTGTGTGTACATGCACTTAGTCAGG TCTATGTAGAAGGTATTCGTTTAGTTTGCAGGGTGTTGTTAAGCCTCGATCCTGAAATTTTGAAGTTTTCAAATTATAGT AAATTAAAAATTTGAGTCATATGTTTTTTTTATGGCTAAAGATAGTGGTGTTGCTAGTTATTTATGAATGCAAATCTGTT TGCCCTTTTTATCGAGTTGTTTCTAATATTGTTTCCTACTTTTGTTTGTGATTTTCAGATCAGGTGAGCATTAGTGTGTT GACTGGGTGAGATTGGATATTCTTCCAACAGCTCAATAACCTTGAATTTGATACATGGAAACTCTGTTATCTGGGCTCTT TAACTTTGAGGCTCTGTAGCAATATGCAACATATTCTTTTTTGTGAATTTGATTCAGGTGACAATGTTAATACAACGTTC TGGTTTATGTTATGTATCTGATGATGGGGAAGATGTTCTTTGTGACCGGATGCCTAGTGGTAAAACTTGGCAGGTGTATT CGAAAGGAAATAAGCACCCTTTTGACTGGTGTAGAAAAGCTGAACCAACGGAAGAGGATAGAAGGAAAACTGGTGATTCT TACAACTCAAACTGTTTAAGTAGCTTTGGCCGGCCATCAACTGCTGGTATAATGACTGAAAATAGTGCACCTAATATGGT ATACAGGAGAAAGAAGCTACGCAAGGGCTCGGTTGCCTCTGCTTTTAATCTAGGATCAACTGATATGCGGACAAGTGCCA ATTGCCCTTCAGTCATAAGTTCCTCTGGGCATTTATCATCAGCTGAGGATCAGTCATCTGGCTTTCAAATCAAGCACAAA TTTGAAAAGGTTAAAAATCCTACTGTCCCTTCTGTCTTATTTGATGGAGTAGCCAAGGATACCACACAGAAAAACTTAGG TTTTGACAGTGTAAATGACAGTTGCTCATCTTCTAAGTCAAATATGGAACTTGTTTCAGATTCCTTAGAGATTGAAATGG ATGAAACTGGTGAATGCTCCTCCTCTGATGTAATAGTTATGGATGCTACAAGGGAGGAATTGACAGAAATGGATTTCTGC ATTAACATTTTAAAAAGCCATGGACTTCTTAAAGGAGATTCTGTTGCAAATAATGTGGCTTCCAGGGAAGGTGCTATTAC CCATGGTAATAGTTACTGTTCCAGGTCATGCAAAATATGCGGTCATTTGGACAGTTCATTGAACATGCTTTTATGTGATC ATTGTGAAGATTCATATCATCCATCTTGCTACAATCCTCGTTTGAAAAAATTGCCAATTGACGAGTGGTTTTGTCATTCA TGTCTCAAAAAAAGGCAGAAAGTTCTAAAGGAGACAATGATCAGATCACCAGGTATCGCAAGTAAAATGGCCAAATGTAG AACTGCCTCAGTTAAGGATGGATTGAATCCCATTCTATTGATGTTGAGAGACAATGAGCCATATAAGTCTGACGTGCGGG TTGGTAAGGGTTTTCAAGCAGAAGTATTTGACTGGTCAGGCCCAATAAGAAGGTATGTTTCGTTTTAATCACAGATGTTT GGAACTACACATTTGTATGATATCGTACTAGGTTTTTCTTAAATTTCTTTCAATATAAGATTTTATTAATTTTAGTTTTT GTGAATTGCTTGGTGTATAATTATGTTCATATTCTACAGGGAGCTGCATTCTGCATTTCCATTATGTTAAGGTCCTATAT TGACTAAAGATATGACTGAATAAATCCTTGGCACTCCTCACTGTTGAACCACTTTTGGGGTCGAGTTAGGCCTAGCTCGA ATTTAAGATGATATATGAGCCTATACTATTTATATTTTTTGGGCCCACTTGTAGATCAGTAGATGTCTAATCCTGCAACC TTCACGCTCCAGGTGTCTAGTTCTGAGTGTGAGGGGTGTGTGTGTTAAAGTCACACATTGACTAGAGGTATAACTAAATA AATCTTTATAAATGGTAAGACAATCCTCACCCTTGAGCTAGCTTTTGGGGTTTAAGTTAGCCCAAATTTTACGTCTAGTC TTGGGCGTGAGTGAGTGTCTTAAGGTCCCACACTGACTAGAGATATAGCTATTTAAATCCTTATGAATGGTAAGGCAATC CTCACATGTGAACTAGCTTTTGGGTTGAGCTTGGCCTAGCTCAAATTCGTGATGGTATAAAAGTGAATTCTAGATCCGCA ATTAGGCCACTCACTGGTGTCCAAAAATATACCAGACCCCGTGGATTTCCGGGACAATGAAAAAAAAATAATCCTATAAT CTCCATGCTCCAAATGTCCTGTCCAGGGCATGAGAGATGTGTGTTAGATCCCACATAGACTACAGATAAGGCCCAAAAAA TCTTAAAAAAAGGCTTGGCTAATCCTCACAATGTGAGCTAGCTTGGAGTAGAGTTATAAGACATTGCTATTCTTCATTTA TTTTTGAAACGTAGACATTGCTATTCATATATACACTAAAATTTGCTTTTAGTCCATGTAAAATGTTCAATGTTGGTTTT AGTCATTTTAGTCCCTGAACTTTTGAAAGTCTCGCTTTTATTTAGCCTTTGACATGTGGTGTTAGAAGTCCCACATTGGC TAGAGATATGCCATAGATAGCCTTTATAATGGGTAGAGTAACCGTCAACTCTAGAGCTAGCTTTTGGGTTGAGTTAGTCC TCCCAAATTCTAATATTTGTTTTTTTTTTGTATCTTGTTTTGGTTTTATGCAAACTGATGAATGTTATCCATCTATAATA GACAAGTGCTGCAGTGGCACGGTAATTGTTGTTTTGTATTGGTACAACCTTTTTTATGCATGGTATGGTCCACATTTTGT TAATGACAAGGGCTAAAGTGATGCTATTTCAAAAAATGAGGGACACAAATGGGTTGTTTTAAAAATCAGGGACAAAAACC ATATGTTGATCATTTTATAGGGACTCAAAACCAATAAGTTTGGCTAGAGACATTTTATTTCCACATATCTTTGTTTTTAC TGCACTCCACGAACCTTACTGATTACCTCTATCTTTGTAAATGTCTGGAAATGGATTGGAATAGAGCGGAGGCACTTAAG CTTATACTTCGCCTATAACTTTTAAGCAAATCTTCTGATACAGACTGAGTGAGACAAAATTAGCACATGGACAGCTCATA AGATTTCTGTCCCCTTTAGTTGATGGGAGCATTCCTGTATATTTAGTAACCTATGTTTTCTTTGCTTGGGTGAAGTAAGA TTTTCTTATTGTGCATATTTAGTATGTCTCTATCTTTATGCATTGTCATTAGGAATCTATATTAGCCCTTTTTGGGTATT ATTACTTTGTTACCAACATTATTTTGTTGTTTCTGGCAGTGATGAAGATGACCTTCCTGAACCTTTAGAAATTAAACCTT CAGAATTTTCTAGACTACAGGTAAAAGTTTTGGTTATTTGCTTTTCTGATCTGCATTTTATTTGAGTCTCAAAGTGGTGG ACAATGCTTTTCTGTTCTGCAGGAAGAGGATATGAGAAATCCAACTAAACTCAGTTCCATTGGTAATTGGCTTCAATGTC AGGAGGTTGTAGATAGAGCCAATGGAACTATATGTGGAAAGTGGCGCAGGCAAGTCATCTCGGGTTGTTCTAGTCTTGAA TGATTTTATAACTCATTATTTGTAGGATGATCTTCCTATTCAAGAATTATTTCCTTGCCAAACATGAACAAAAAATATTG TAGGATGGTGCAGTACAAACTTCACTCAAGTTTGTTTCTCATGGGTTTAGGTTTGAGTAGGCAATGAATGTAGCAGTTAC ATAAAGCCCAAGCAACATTCTTGGCTGATGGATAATCTCAGCCCATTAATTTAAGGGTTGGATCCGTGCCCTTCTTTAGG TGAGGCTAATTAGCTGTTGCAGAGGAGACTAAAAGAGCCATTTAGAGTGGATTTAAAGGATAAAACGCCTAAACTAGATG GTTTTACTACTGTTGAATGCTGATTTTTAGGGATGTTAGGACTTAGGATATGTTAATAGTTGAATCAGAGAGTGTGAGAA AGAGTGAGAGAGAGAGAAAGTAACAGAATTCTTTTACTATTCTTATTGAATGAATTGTTACTGAAGATACAATGGATGCT ACATTTATAGACTAGCTAAGCAGTCTCTGTTCGAAACTAACACTAACTAAGGTAACTAGTCTAGCTAAGTACAATAAATA CATTATAGATGTTTACTCTATTAGTTAAGGATAGGATTTGAGTTCTCTCCTGTTTTGAAGAACATAATATTTGTGTTTTG AGAGAGACAATTTTTTTCCGGTAGATCAACCCAACATCATAGCTCAGAATTAGTTTTATGTTTTCTCTCTTATAGCATAG TACTCACATTCTCCTAATTAGTTGTTTAAAATGTATTCAGTTAGGAATAACTAGATGTTTAGAATTCCCAACTTAGGTTG TGCTAATTAGGAACTAGTATTAATTATTAGAGATAATATGTACACAAATAGCTGAGTCTAGTTAAGTCTCTTTATAATAA GTTGTTGTTCAGCTTCCAGCTGTGTGGCTTATGTAATAGTGTTAAGAAAGCTTCTTAGAGAAGCTTTCCCAGCTCGATAT AAAGAGCTCACTGTACTTTCTGTTATGCAGTTTTCTAATAGCAGTACAATTTCATATCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCTAG TTCTTCTTGTTTCCAGTAATTTGTCATTAATACATGTAAATGTATTTGTAGTTTTGTTCTATTTATCATAAAGGAGAATA CAATGAAAGAAGGCATCAAGCCAGAAATCCTTGACAATAGATGCTATCACCAACACTAATATTGGAGAAACTGTGTATCT ACTAGCATTATATTATTATGAAGTCTAAAAATGCAACTGTTATTTGGGGCTTATGGTTGGTGAGGATGTTGAGAATAACA GAAATTAGGTAGAGAGAGAACAGAGAAACAGAAAACCAAAATTCTGAAAATTCTGTTATTATTAGTTAACTTCAGAAAGT ACATCAAGGGCTCTTATATAGAGCTCAACAGGACAAGCTTCTACACGAAGCTTAAACTAGTTGTACTACACATAATGGCT AACTCGATACACCAAAGTACAATCAGAGTACTCTAATAGAGGATTGCATGAACTTTCAAGGGTAATTTCTTATACTACCT CTGCTATGGATAAAGGATACTTTCACTTGCCAATGGTTATTTTAGAGGGGTTTCTTTGTTCAGTTTGTTGGATATACAGT GAAATTTGCAAGCTTTGCTTAGCTAATTATCTTGTCTCGGTTGTTTCTGTTCTTACTTTTTCCAGTTCTCTTTCAGAAGG ATATCTTATCCTCTTTTTCTATCTGAAATAAGAAAAGATGTGTACCCCTTAAACTGATAAAACATTCTTTGGTTTTGTAT CATAGTAAAACCCAAGCTTTGTCTTGTAGAGTAGCGCTAAGGATAAGTAAACGTACTTAATCTTTTTCTTTCCATAAACT CTGAATGTTTATATTGTCTTTTCTTCATCATGACATACTTTTTCTGCTCATTTCCTTACGATGATTTTGCTACTTTCTTT GTGAAGATGATTCATATACAAAAGGGAAAAATGGGTGTAGTGTGAGAATGAATATCTTGTTGATTGTGCTCAAAACGCCT CAATGTAGCAACTATTTTTGTTTGGCAGGGCTCCACTTTTTGAGGTTCAAACTGATGAGTGGGAGTGCTTCTGTGCTATT CATTGGGATCCATCTCATGCTGATTGTGCTGTACCTCAGGTGAAATGAGTTTAACTCTCTAGCTTTCTTGTTTCTGTGTT GATCATCTAATCATAAGGTGTTAGTACTTTTTGATCTTGTGGGAAGACTACTGTATTGTTCCTACCCTGCTAGGCAAGGC AAATCTTCTCTAACATAATATAATATCAGACCAAGTATTATATAATTCTGTAACCTCACTAAAGTCTGTATTATTTCCTT TGAAATTATTAATGATTCAAGTACTTTTTGACCTGAATTAAATATGGCTTAATATGTATGTCCTTGCGTATAGCAGGAGT ATAACACAGAGTTATGTATTCAGGGCATTGAACACAACATAACAGAGTGATGATGGCAACACTGGAAAGAAAAAAAAAAG GAATAGGGACTCAACACCACACAACTTATATTCTAATGAATATTAATTTTTTTGTATGAAACATTAATATTGATATGTAT GAAACGTCTAGGATTTATTGGGATGTTCAAATACATGGAAATATATTTAAAATGTTTTGTACCGAAATTTAATATATATT AGTTGTCACTGTTGTGTCTTGCATGTACTAGATGTGGACCAATTGTCAGTATCATAAAGTAGAGCGATCTTGAGTTTACT AATACTACTATATAGAGGGGGTAGGTTGATGTGTTGTAAAAGTTATTCGAAGTCTCATTGGTGAATATATCTTTTAATGT CTCCTTTGCATGCCATTTTCCTTTGTTCTTGTTACTTATTTCTAACGTTTTTCATATGTAAATTCGAACTTGTGTTTCTG AGAAATATTGGTTGTTATAAAATATAAATTCTGCAAACTAGACATTATGAAACTGCATTGAACTTAGTCAGCCCAACCAA ATCAGTCTCATTTGAAGGTATAATTTGGTGAATCTTTATTTTTTTTGGAGCTTGCATATTTTTTAGTTTCTGTTTTCTAG TTTAATGTTGCTTTCAACTATATCTTGCTAACCTGCATTGTGGTTGTCATTCTAAATTCCCATCTCATATTGAACACTAG CCGTGTCCCTTTTTATGTGCTGCAGGAGGTGGAAACAGATCAAGTTTTGAAGCAACTTAAGTACATAGAAATGGTATGCG TAAACTGCATAATTTTGATTGTTGCATTTCTGTCAACGGAATCTGTACTATAAATTAGTAGTTTGTGTTTCTTGGTTTAT ACTTCTATTTGTGTGCTATGTGTAAATGATGATTTTTCATGACACTAGTTAACCTTTCTTGATGATTTAAAGGGTATGAG AGCAATTAAATGACATGGTTCATCGATGGGATTTTCTTATTGGGTCCACTTTGAATGACAAGTTAAATATTTTCTAGGAA TATTGGAATGTGGGGCTTTGTGTCCACCTTCAAAGACACCGAGTCTTGTCTTATCTTTTTCTATTTTTCATCATTATTGC ATAGCTTATGTGTTTAACAACATGTATGATATGTTTACATTCTTGCTTTACAGCTGAGGCCACGACTTGCTTCTAAACAG AGAAAATCAGATAGCACAGCATAAAGGTGATTGAAGAATCTATAGTGGTGATAAAGCATGATGTTTTGTTCTTGCATATT GTAATTGTACAATATGTTCATACATACCAGATTTAGGATGTGTTCCTAGTCATTTGGTGCCAATGGATTCACAACAATTT TTCATGATCCGAAGTTCTATATTTTTCTGCTTTAATTCCTTCATTCTTTTTTTGTCATTACTAGTTCCCTCATTATATGT GGTTATAGTACGACTTCTATTTGCTAACGGGTTAAAATGAAACAGAACATTCATTAACTTAGGTGTTTGTTTCAACTTTC AAGTAATGAAAATGCATTCTCAAGAATATGGAGGTTGGGAATGAATGTTCTCAAGTTAATTACAACTCTGAAACACATTC ATTAACTTAGGGGTATTTGAAGCTCGATCATCAGAGCTTAAATTATTGTGGTTGTTCTATAGCTTCTATTTACGTGGTTT ACTCGTTATGAATTATTGTATTTAAGTTGTCATTTTGGAAATAAGAATGAGAATG
CDS sequence (LotjaGi1g1v0556600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTTAATACAACGTTCTGGTTTATGTTATGTATCTGATGATGGGGAAGATGTTCTTTGTGACCGGATGCCTAGTGGTAA AACTTGGCAGGTGTATTCGAAAGGAAATAAGCACCCTTTTGACTGGTGTAGAAAAGCTGAACCAACGGAAGAGGATAGAA GGAAAACTGGTGATTCTTACAACTCAAACTGTTTAAGTAGCTTTGGCCGGCCATCAACTGCTGGTATAATGACTGAAAAT AGTGCACCTAATATGGTATACAGGAGAAAGAAGCTACGCAAGGGCTCGGTTGCCTCTGCTTTTAATCTAGGATCAACTGA TATGCGGACAAGTGCCAATTGCCCTTCAGTCATAAGTTCCTCTGGGCATTTATCATCAGCTGAGGATCAGTCATCTGGCT TTCAAATCAAGCACAAATTTGAAAAGGTTAAAAATCCTACTGTCCCTTCTGTCTTATTTGATGGAGTAGCCAAGGATACC ACACAGAAAAACTTAGGTTTTGACAGTGTAAATGACAGTTGCTCATCTTCTAAGTCAAATATGGAACTTGTTTCAGATTC CTTAGAGATTGAAATGGATGAAACTGGTGAATGCTCCTCCTCTGATGTAATAGTTATGGATGCTACAAGGGAGGAATTGA CAGAAATGGATTTCTGCATTAACATTTTAAAAAGCCATGGACTTCTTAAAGGAGATTCTGTTGCAAATAATGTGGCTTCC AGGGAAGGTGCTATTACCCATGGTAATAGTTACTGTTCCAGGTCATGCAAAATATGCGGTCATTTGGACAGTTCATTGAA CATGCTTTTATGTGATCATTGTGAAGATTCATATCATCCATCTTGCTACAATCCTCGTTTGAAAAAATTGCCAATTGACG AGTGGTTTTGTCATTCATGTCTCAAAAAAAGGCAGAAAGTTCTAAAGGAGACAATGATCAGATCACCAGGTATCGCAAGT AAAATGGCCAAATGTAGAACTGCCTCAGTTAAGGATGGATTGAATCCCATTCTATTGATGTTGAGAGACAATGAGCCATA TAAGTCTGACGTGCGGGTTGGTAAGGGTTTTCAAGCAGAAGTATTTGACTGGTCAGGCCCAATAAGAAGTGATGAAGATG ACCTTCCTGAACCTTTAGAAATTAAACCTTCAGAATTTTCTAGACTACAGGAAGAGGATATGAGAAATCCAACTAAACTC AGTTCCATTGGTAATTGGCTTCAATGTCAGGAGGTTGTAGATAGAGCCAATGGAACTATATGTGGAAAGTGGCGCAGGCA AGTCATCTCGGGTTGTTCTAGTCTTGAATGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0556600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MLIQRSGLCYVSDDGEDVLCDRMPSGKTWQVYSKGNKHPFDWCRKAEPTEEDRRKTGDSYNSNCLSSFGRPSTAGIMTEN SAPNMVYRRKKLRKGSVASAFNLGSTDMRTSANCPSVISSSGHLSSAEDQSSGFQIKHKFEKVKNPTVPSVLFDGVAKDT TQKNLGFDSVNDSCSSSKSNMELVSDSLEIEMDETGECSSSDVIVMDATREELTEMDFCINILKSHGLLKGDSVANNVAS REGAITHGNSYCSRSCKICGHLDSSLNMLLCDHCEDSYHPSCYNPRLKKLPIDEWFCHSCLKKRQKVLKETMIRSPGIAS KMAKCRTASVKDGLNPILLMLRDNEPYKSDVRVGKGFQAEVFDWSGPIRSDEDDLPEPLEIKPSEFSRLQEEDMRNPTKL SSIGNWLQCQEVVDRANGTICGKWRRQVISGCSSLE
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 19 | 427 | 409 | 4.2E-124 | – | |
| PANTHER | 19 | 427 | 409 | 4.2E-124 | – | |
| Gene3D | 168 | 312 | 145 | 1.3E-14 | ||
| SUPERFAMILY | 239 | 306 | 68 | 9.97E-15 | ||
| ProSiteProfiles | 253 | 303 | 51 | 9.499 | ||
| SMART | 255 | 301 | 47 | 3.4E-10 | ||
| ProSitePatterns | 256 | 300 | 45 | - | ||
| Pfam | 256 | 302 | 47 | 6.6E-11 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0556600.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…