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LotjaGi1g1v0570200.2

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0570200
Transcript ID LotjaGi1g1v0570200.2
Related isoforms 1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Phosphatidylinositol 4-kinase family protein; TAIR: AT1G49340.1 Phosphatidylinositol 3- and 4-kinase family protein; Swiss-Prot: sp|Q9SXA1|P4KA1_ARATH Phosphatidylinositol 4-kinase alpha 1; TrEMBL-Plants: tr|I1JSQ3|I1JSQ3_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0570200
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:110312717..110330358) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ATGGAAGCTTTGATCGAGTTATGCGACCTGATTTCGCAGAACCCTTCGCAACTCTCCGATAAGCTTTCATGGATATGCGA CAAATGCCCTCCGCCGGAGCACCTCTCCGCCGGATCGCCTAGGGTTTCGCGGTCTCACCTCAATGCCGTCATCGCCGTCG CTCGCTTCCTCTCCAATTGCCCCGATTCTTCCGATCTGCGGCCTAAATCAGTCGCGCTTGAGTTCCTCCGCTCAATTCCA TATTCCTTCACTCAATCCTTCTGGCCTCAGCCGTTCAACGCTGATTCCGTTTCCTCTTTCTTCCTCGATTTCCTCGCCTA TGTTTCCAAGGCCGCTCAGTCGTCGCCGGATTTCGCCGACGAGGTGGCTTCGTTCTCCGGTGAGGTAGTCATATCCGCGA TTGGTGAACAGCACTCCGGCATTGCTAGGTCTTTCTTGGTTGCTCTGTCGCAGAGCTTTCTGCCGATTTCTGCTTCGGAT GCTGACAGAGTGGTGACTTGTTTGATCGATCAATTTGCGTTCCCTGCCCCTGGCACGCCCAGGGAACCCAATGCCGCCGG AAATTGCGACAATTCTTCGTCGGCTCAGAGCTCGCCGCTCAGTGTGAACCTGAACCACCGGTCGCAGGCCAATTACAATG GCAGCCCAGGGAATGAAGTCTCCGGTACTTCTTCGAGCGGTGGCGCGGCTTCTAAGGCAGCGGATGATGCCAGCACTGCC TCGTCGAGAGGTTCGGCCATGATGAATGGGGGAAGCCACGTGTGGAGGAGTAATGCCGATCAGTTGGCACAGACCTTGGG TTTGAATGATGGTGGAGCCTCGTCTGGCCAACAAGTTGCTTCGTTTGAGGAAGAGACAGTGGAGTTCTTGGAGAGGCAGG AAATAGCTTTTAAGCTGATTGCTCATGTGTTGGAAAAGGCCCCCATTGATCCTGCCCTTTTGGAGCAGCTTAGGTTAATT 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TCTCGCTCGATTGCAAACAAGTCCCTACTTAAATCTTCTCCTTTTCTCTTCCATTTCATTTATTAGAAATTGATTGTTCT TCCACTGTTTATTGTTCATCTAGTTTATGCGTGAAAGGGTACCTTTGCGCGCGTCGACACATGGATGGGATCATCACTAC GGTGGCGTTAATGCTAGATAGCGGGTTACCTTGCTTCAGCAGGGGCGACCCGATTGGCAACCTTCGAAAGAGATTTCATC CAGAAATGAGTGAGCGTGAAGCAGCCAACTTCATGACCCATGTGTGTAAAGATGCTTACAATAAGTGGACCACTGCTGGC TATGACTTGATACAATACCTGCAGCAAGGAATCGAAAAGTGA 

CDS sequence (LotjaGi1g1v0570200.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGAAGCTTTGATCGAGTTATGCGACCTGATTTCGCAGAACCCTTCGCAACTCTCCGATAAGCTTTCATGGATATGCGA CAAATGCCCTCCGCCGGAGCACCTCTCCGCCGGATCGCCTAGGGTTTCGCGGTCTCACCTCAATGCCGTCATCGCCGTCG CTCGCTTCCTCTCCAATTGCCCCGATTCTTCCGATCTGCGGCCTAAATCAGTCGCGCTTGAGTTCCTCCGCTCAATTCCA TATTCCTTCACTCAATCCTTCTGGCCTCAGCCGTTCAACGCTGATTCCGTTTCCTCTTTCTTCCTCGATTTCCTCGCCTA TGTTTCCAAGGCCGCTCAGTCGTCGCCGGATTTCGCCGACGAGGTGGCTTCGTTCTCCGGTGAGGTAGTCATATCCGCGA TTGGTGAACAGCACTCCGGCATTGCTAGGTCTTTCTTGGTTGCTCTGTCGCAGAGCTTTCTGCCGATTTCTGCTTCGGAT GCTGACAGAGTGGTGACTTGTTTGATCGATCAATTTGCGTTCCCTGCCCCTGGCACCCCAGGGAATGAAGTCTCCGGTAC TTCTTCGAGCGGTGGCGCGGCTTCTAAGGCAGCGGATGATGCCAGCACTGCCTCGTCGAGAGGTTCGGCCATGATGAATG GGGGAAGCCACGTGTGGAGGAGTAATGCCGATCAGTTGGCACAGACCTTGGGTTTGAATGATGGTGGAGCCTCGTCTGGC CAACAAGTTGCTTCGTTTGAGGAAGAGACAGTGGAGTTCTTGGAGAGGCAGGAAATAGCTTTTAAGCTGATTGCTCATGT GTTGGAAAAGGCCCCCATTGATCCTGCCCTTTTGGAGCAGCTTAGGTTAATTGGGAAGAAGCAGATTCAGTCCATGTCTG CATTTCTGAAGATACGGAAGAGGGATTGGCATGAGCAGGGGTCACTTCTAAAAACTAGAATTAACACCAAACTGTCAGTC TATAAAGCTGCAGTGAGGCTAAAAATCAGGAGCCTCTCCGCATTGGATTCTGATTCGAGATCTGTCAAGAGATTGGTTTA CGAGGCAGTTGCAATATTGATAGATGCTGCCGAGGCATGCTTACTATCAGGATGGCGGAAGATGAAAACGTGTGAAGAGC TCTTCAGTTCTTTGCTTCTTGGGGTAGCACAAATTGCTATCGCCCGAGGAGGTCAGCCACTGCGTATTTTGCTCATTCGC CTAAAACCAATTGTTCTCAATGTTTGCGCTCAGCCCTATACATGGAGTAACACCCAAGGGACCATGTTTGAGAGCGTCAC AAAGGTCAGCTGTCAAATTATTGAATCCTGCTGGGCTAAGGAACGGGCCCCTGTAGACACGTACATCATGGGGTTAGCCA CAAGCATACGTGAACGAAATGATTCTGAGGAACAGGACAACCAAGAGAAACCTGCAGTTCCTTTTGTACAGCTCAATGTT ATACGCCTGTTTGCTGACCTGAGTGTTGCAGTCAACAAGTCTGAGCTGGTAGATGTGATATTACCTCTTTTTATTGAAAG CTTAGAAGAGGGTGATGCTTCAACTCCTAGTTTACTGAGACTTCGACTTCTTGATGCTGTGTCTCAAATGGCCAGTTTAG GTTTCGAAAAATCTTACCGTGAGACAGTGGTTTTGATGACTAGAAGTTACTTGAATAAACTCTCCAGCGTTGGATCAGCT GAAAGCAAAACAGAGGCACCTGAAGCCACGACGGAGAGAGTTGAAACTCTACCTGCAGGATTTCTTAATATTGCCAGTGG TCTTAGTAGTGAAAGATTGCGTTCAGATTATCGCCATCGATTGCTCTCCCTATGCTCAGATGTTGGTTTAGCTGCTGAGT CTAAAAGTGGAAGGAGTGGAGCAGATTTCCTGGGTCCTCTGCTTCCTGCAGTTGCTGCAATTTGTTCTGATTTTGATCCT ACTGTAAATGTGGAACCGTCACTTTTAAAACTGTTTCGCAACCTATGGTTCTACGTTGCGCTTTTTGGCCTAGCACCTCC AATACAGAAGACTCAGGTAACTACGAAGTCAGTTTCCAGTACACTGAACAGTGTGGGAAGCAATGGTGCTATTGCTCTTC AAGCAGTAAATGGACCATATATGTGGAATACGGAGTGGTCTTCTGCTGTTAAGAGAATTGCTCAAGGGACCCCTCCACTA GTTGTTAGCTCAGTGAAATGGCTTGAGGATGAGTTAGAACTAAATGCTCTGCACAACCCAGGCAGTCGCCGGGGCAGCGG CAATGAAAAGGCTGCTCTTGCACAAAGAGCTGCTCTTTCTGCAGCTTTAGGAGGGAGGGTTGATGTCGCAGCCATGAGCA CCATATCAGGAGTAAAGGCTACTTATCTTCTTGCTGTAGCTTTTCTTGAGATCATCCGCTTTATCAGCAATGGGGGAATC CTAAATGGTGGCACCACTAGGGATGCTGCTAGAAGTGCATTTACTTGTGTCTTTGAATATCTCAAGACTCCAAATCTAAT GCCAGCTGTCTTCCAGTGTTTAACTGCAATTGTTCACAGGGCCTATGAAACAGCTGTGTCATGGCTGGAAGATCGAGTAT CTGAAATAGGCCATGAAGCCGAGGCTCGAGATTCAATACTTACGATGCATACCTGTTTTCTAATCAAAAGTCTTTCCCAA AGGGAGGATCACATACGAGATATTGCAGAAAACTTATTGACCCAACTTAGAGATAGGTTTCCACAGGTTTTATGGGATTC CTCCTGCTTAGAGTCATTGCTATTTTCATTGCATGATGACTCTTCCGCTGTCATCAATGATCCTGCTTGGACAGTTACAG TCCGATCCTTGTATCAGAGAATTGTTCGGGAATGGATAATTAAATCGCTTTCAAGTGCTCCATGCACTAGCCAGGGCCTT CTTCAGGATAAACTTTGTAAAGCTAACAACTGGCAAAGAGCGCAGCCCACAATCGATGTTGTTTTACTTTTATCTGAGAT AAGAATTGGCACTGGGAAAAGTGACAACTGGTCATCTCAAACAGCAAATATTCCCGCAGTCATGGCTGCTGCGGCTGCTG CATCAGGAGCAAACTTAAAAGCATCAGAGTCTTTTAATTTAGAAGTTATGAGTTCTGGTAAGTGCAACCAAGCTGCAGCG ACAGTTAAATGCAACCATGCTGGAGAAATTGCTGGCATGAGAAGGTTGTATAACAGTATTGGTGGATTTCAGTCCAGTAC TACACCAACTGGTTTTGGGCTTGGAGCTGGGCTGCAAAGAATTATATCTGGAGCTTTTCCCCAACAGCCACAAGCTGAGG ATGATTCATTCAATGCAATGTTGCTAAATAAGTTTGTACGTTTACTTCAACAGTTTGTCAACATAGCAGAGAAAGGTGGG GAAGTGGTCAGGTCTGAATTTCGTGACACTTGCTCTCAGGCTACAGTGCTGCTTTTGTCAAATTTGAGTTCTGGATCCAA ATCAAATGTGGAGGGCTTCTCACAACTTCTTCGTCTTCTTTGCTGGTGTCCTGCTTATATTTCCACATATGATGCAATGG AAACAGGTGTTTTCATATGGACGTGGTTGGTTTCGGCTGCACCTCAGCTTGGAGCACTTGTCCTTGCTGAGCTTGTTGAT GCTTGGTTATGGACAATTGACACCAAACGTGGTCTTTTTGCATCTGGAACAAGGTACTGTGGGCCTGCTGCAAAACTGAG GCCTCACCTGGCTCCTGGGGAGCCTGAACTGCAGCCCGAGATGGATCCTGTTGAGCAAATAATTGCACATCGACTTTGGC TTGGATTTTTTATTGATCGTTTTGAGGCGGTTCGGCACCAAAGTGTGGAACAACTCTTGCTTCTTGGAAGGATGCTGCAG GGGACAACAAAGCTTTCCTGGAACTTTTCTCACCATCCTGCTGCCAATGGTACTTTTTTCACTCTCATGCTTCTAGGGCT CAAGTATTGCACTTGCCAGTTTCAGGGAAATCTGCAAAAATTTCAATTAGGGCTTCAGCTGCTGGAAGATCGGATTTATC GGGCGTCTTTGGGTTGGTTTGCTTATGAGCCGGAATGGTATGACACAAACTATACAAATTTTGCTCAATGTGAGGCTCAG TCTGTTTCTCTATTTGTTCATTACCTTTCAAATATGAAAGGAGATGCTGTTCAATTAGGCTCAAAAGGAAATGGACAAGA AAATGGGAGTGATCTCTATCATCCTGTCTGGGGTCAAATGGAGAACTATGCTGTAGGCAGAGAAAAGCGGAAGCAGCTAC TTTTAATGCTATGCCAACATGAGGCCGATAGGCTTGACGTCTGGGCGCAGCCAACTAACACAAAAGAAAGTAGTTCCCGA CCCAAGGTTAGTTCAGACAAATGGATAGAGTATACTAGGACTGCCTTCTCAGTGGATCCTAGGATTGCTTTATCCTTGGC CTCAAGGTTCCCAGCCAATGTATTTGTGAAGACCGAAGTAACTCAGCTGGTTCAGGCACATATAGTGGATGTGCGCAACA TACCAGAAGCATTACCGTACTTCATTACCCCAAAGGCTGTTGATGATAATTCAGTACTATTGCAACAATTGCCTCATTGG GCTCCTTGTTCCATTACACAAGCTCTAGAGTTCCTTACTCCTGCATACAAGGGTCATCCACGGGTGATGGCATATATTCT CAGGGTTCTGGAGTCCTATCCTCCTGAACGTGTGACTTTTTTCATGCCCCAGCTGGTTCAGTCTTTGCGACATGATGAAG GGAGATTAGTAGAAGGTTATTTACTTAGAGCTGCTCAAAGAAGTGACATATTTGCCCATATTCTTATCTGGCATCTGCAG GGTGAGACTGTACCCGAGACAGGAAAAGAACCAAACAGTGGGAAGAATGGTTCTTTTCTAGAACTGCTGCCAGCTGTAAG GCAGCGTATAATTGATGGTTTTAACCCAAAGGCGCTTGACATATTTAGAAGAGAGTTTGATTTCTTTGACAAAGTTACAT CCATCTCTGGTGTATTATATCCACTCCCTAAGGAAGAACGCAGAGCTGGTATTCGAAGGGAGTTGGAGAAAATTGAGCTG GAGGGCGAAGATCTTTATCTACCGACAGCTACAAATAAGCTTGTTAAGGGCATTCGAGTAGATAGTGGTATTCCCTTACA GTCAGCCGCAAAAGTCCCAATCATGATAACATTTAATGTAGCTGATCGAGACGGGGACCAAAATGATATAAAGCCACAAG CTTGCATTTTCAAGGTTGGAGATGACTGTAGACAAGATGTTCTTGCCCTTCAAGTAATATCACTTCTTCGAGATATATTT GAAGCTGTCGGAATAAATCTTTATCTATTTCCGTATGGTGTTCTGCCTACTGGTCCTGAGAGAGGTATAATAGAGGTTGT GCCGAATACACGTAGTAGAAGTCAGATGGGAGAAACAACTGATGGAGGTTTGTTTGAGATATTTCAGCAAGACTATGGAC CGGTAGGGTCTGCCAGTTTTGAGGCTGCACGCCAGAATTTCATCATTAGCAGTGCTGGTTATGCCGTTGCTAGTCTTTTG CTTCAACCAAAGGATAGGCACAATGGGAACCTTCTCTTTGATAATGTTGGGAGGCTTGTGCATATTGATTTTGGTTTCAT CCTAGAAACTTCTCCAGGTGGGAATATGCGTTTTGAAAGTGCACATTTTAAGCTGAGCCATGAGATGACACAATTACTAG ATCCATCCGGTGTTATGAAGAGTGATACGTGGAGCCAATTTTTAAGTTTATGCGTGAAAGGGTACCTTTGCGCGCGTCGA CACATGGATGGGATCATCACTACGGTGGCGTTAATGCTAGATAGCGGGTTACCTTGCTTCAGCAGGGGCGACCCGATTGG CAACCTTCGAAAGAGATTTCATCCAGAAATGAGTGAGCGTGAAGCAGCCAACTTCATGACCCATGTGTGTAAAGATGCTT ACAATAAGTGGACCACTGCTGGCTATGACTTGATACAATACCTGCAGCAAGGAATCGAAAAGTGA 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0570200.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MEALIELCDLISQNPSQLSDKLSWICDKCPPPEHLSAGSPRVSRSHLNAVIAVARFLSNCPDSSDLRPKSVALEFLRSIP YSFTQSFWPQPFNADSVSSFFLDFLAYVSKAAQSSPDFADEVASFSGEVVISAIGEQHSGIARSFLVALSQSFLPISASD ADRVVTCLIDQFAFPAPGTPGNEVSGTSSSGGAASKAADDASTASSRGSAMMNGGSHVWRSNADQLAQTLGLNDGGASSG QQVASFEEETVEFLERQEIAFKLIAHVLEKAPIDPALLEQLRLIGKKQIQSMSAFLKIRKRDWHEQGSLLKTRINTKLSV YKAAVRLKIRSLSALDSDSRSVKRLVYEAVAILIDAAEACLLSGWRKMKTCEELFSSLLLGVAQIAIARGGQPLRILLIR LKPIVLNVCAQPYTWSNTQGTMFESVTKVSCQIIESCWAKERAPVDTYIMGLATSIRERNDSEEQDNQEKPAVPFVQLNV IRLFADLSVAVNKSELVDVILPLFIESLEEGDASTPSLLRLRLLDAVSQMASLGFEKSYRETVVLMTRSYLNKLSSVGSA ESKTEAPEATTERVETLPAGFLNIASGLSSERLRSDYRHRLLSLCSDVGLAAESKSGRSGADFLGPLLPAVAAICSDFDP TVNVEPSLLKLFRNLWFYVALFGLAPPIQKTQVTTKSVSSTLNSVGSNGAIALQAVNGPYMWNTEWSSAVKRIAQGTPPL VVSSVKWLEDELELNALHNPGSRRGSGNEKAALAQRAALSAALGGRVDVAAMSTISGVKATYLLAVAFLEIIRFISNGGI LNGGTTRDAARSAFTCVFEYLKTPNLMPAVFQCLTAIVHRAYETAVSWLEDRVSEIGHEAEARDSILTMHTCFLIKSLSQ REDHIRDIAENLLTQLRDRFPQVLWDSSCLESLLFSLHDDSSAVINDPAWTVTVRSLYQRIVREWIIKSLSSAPCTSQGL LQDKLCKANNWQRAQPTIDVVLLLSEIRIGTGKSDNWSSQTANIPAVMAAAAAASGANLKASESFNLEVMSSGKCNQAAA TVKCNHAGEIAGMRRLYNSIGGFQSSTTPTGFGLGAGLQRIISGAFPQQPQAEDDSFNAMLLNKFVRLLQQFVNIAEKGG EVVRSEFRDTCSQATVLLLSNLSSGSKSNVEGFSQLLRLLCWCPAYISTYDAMETGVFIWTWLVSAAPQLGALVLAELVD AWLWTIDTKRGLFASGTRYCGPAAKLRPHLAPGEPELQPEMDPVEQIIAHRLWLGFFIDRFEAVRHQSVEQLLLLGRMLQ GTTKLSWNFSHHPAANGTFFTLMLLGLKYCTCQFQGNLQKFQLGLQLLEDRIYRASLGWFAYEPEWYDTNYTNFAQCEAQ SVSLFVHYLSNMKGDAVQLGSKGNGQENGSDLYHPVWGQMENYAVGREKRKQLLLMLCQHEADRLDVWAQPTNTKESSSR PKVSSDKWIEYTRTAFSVDPRIALSLASRFPANVFVKTEVTQLVQAHIVDVRNIPEALPYFITPKAVDDNSVLLQQLPHW APCSITQALEFLTPAYKGHPRVMAYILRVLESYPPERVTFFMPQLVQSLRHDEGRLVEGYLLRAAQRSDIFAHILIWHLQ GETVPETGKEPNSGKNGSFLELLPAVRQRIIDGFNPKALDIFRREFDFFDKVTSISGVLYPLPKEERRAGIRRELEKIEL EGEDLYLPTATNKLVKGIRVDSGIPLQSAAKVPIMITFNVADRDGDQNDIKPQACIFKVGDDCRQDVLALQVISLLRDIF EAVGINLYLFPYGVLPTGPERGIIEVVPNTRSRSQMGETTDGGLFEIFQQDYGPVGSASFEAARQNFIISSAGYAVASLL LQPKDRHNGNLLFDNVGRLVHIDFGFILETSPGGNMRFESAHFKLSHEMTQLLDPSGVMKSDTWSQFLSLCVKGYLCARR HMDGIITTVALMLDSGLPCFSRGDPIGNLRKRFHPEMSEREAANFMTHVCKDAYNKWTTAGYDLIQYLQQGIEK 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
SUPERFAMILY 50 922 873 8.35E-8
PANTHER 88 1993 1906 0.0
PANTHER 88 1993 1906 0.0
MobiDBLite 179 214 36 -
MobiDBLite 181 214 34 -
SUPERFAMILY 1442 1603 162 3.26E-39
ProSiteProfiles 1449 1626 178 15.606
SMART 1451 1644 194 6.6E-6
Gene3D 1464 1633 170 7.2E-17
Pfam 1489 1603 115 1.7E-19
Gene3D 1637 1785 149 1.3E-29
SUPERFAMILY 1640 1987 348 4.59E-78
CDD 1694 1993 300 4.87394E-173
ProSiteProfiles 1733 1975 243 53.3
SMART 1734 1991 258 1.6E-70
Pfam 1734 1793 60 2.0E-7
ProSitePatterns 1737 1751 15 -
Gene3D 1786 1992 207 1.2E-54
Pfam 1794 1941 148 1.2E-17

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Kinase activity Catalysis of the transfer of a phosphate group, usually from ATP, to a substrate molecule.
Biological process Phosphatidylinositol phosphorylation The process of introducing one or more phosphate groups into a phosphatidylinositol, any glycerophosphoinositol having one phosphatidyl group esterified to one of the hydroxy groups of inositol.
Biological process Phosphatidylinositol-mediated signaling A series of molecular signals in which a cell uses a phosphatidylinositol-mediated signaling to convert a signal into a response. Phosphatidylinositols include phosphatidylinositol (PtdIns) and its phosphorylated derivatives.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0570200.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…