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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi3g1v0183500 |
Transcript ID | LotjaGi3g1v0183500.1 |
Related isoforms 6 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | Serine/threonine-protein phosphatase; TAIR: AT2G27210.1 BRI1 suppressor 1 (BSU1)-like 3; Swiss-Prot: sp|Q9SHS7|BSL3_ARATH Serine/threonine-protein phosphatase BSL3; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0H3J2|A0A0R0H3J2_SOYBN Serine/threonine-protein phosphatase; Found in the gene: LotjaGi3g1v0183500 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:25705011..25721213) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GTCCCATTGCCATTCTCCTGCGCCGCAACTTCTTCCTCCGTACCCTAACCGGTTCATGTTGGTCACTACCTTTTCTTCCC TAAACTGAAAAAAAAGAATTTAATTAATATGCATTAAAAAATATTTTTATCATACATAAATAATCAACTAAAAAAGCAAA AATGAAATCCAGAGAGAGAAAGACACAACACCTGGACTCAGACTCAGAGAAAGAGAGAGAAGGTGACAGGACAAAGAAAG TGATTGAATTTCTTTATTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTAATATAATACTGTAATATTTATTTTATA TAATTTTTTTTTTAATTTTTCCTGTGTTTTGTTGTGGGCTTGAGATTTTCTCCGTTCCCGTTTCGTTTCTGCGACCGCTT CTTTTCCTTTTCTCTGGGTTTCAACTTTCAACGACGCAGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAAGAAG AAGAAGAAGAGAGAGAAGAGAAAAACCTAGAGACTGAGGTTGAAGAATTTGCGTGTTCTGGAGTTTCTTCTGGTCTTCGA ATTGAAGAATCAGGGATCTGAGGTGTTTGGATTCCTCAAAATGTTGATTCGGAATACGAATTTACAGGAATTCTAGCTCG ATCTTCACGGAATTCCTCGAATCTTAGGGTTGAACCAATGGATGTTGATTCCTCGATGGTGCCGGACGCCGATCACGATC CAGCTACAGAGAATCACGCCGCGGCTGAGGAAGACGGAGAGAAGCTTCCAGAGCCTCCGTCATCCGAGGGTGGATCTCCG GCGCAGCCACAGAGCTCGGTGGTTGGGCCGAGGCTGGCGCCAACTTATACTGTGGTGAATGCGGTTATGGATAAGAAGGA GGACGGGCCGGGGTCGAGGTGCGGCCACACGTTGACGGCTGTGGCGGCGGTCGGAGAGGAGGGGACGCCGGGGTATATTG 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AGGCTCGCTCGCTTGGATGTAGTGATCATTAAGATTGTCCCATATATATGCCCTACTGGCTTGTGCTATCGCCTAGTTTT AGTGTTTTGTATATAGCACGATGCGATTTACGCGGGGGGAGCCTCCAAACCTGTGATCTTAATCCCTACAGAAAGCTTGG CTTTCTTAGTTTTGGTTCTGACCCCTCAATTGGCGGGCCTTTATAAGTTACAAGTTCAACATACAAGATTGGCAGCCACT GCTACTTGACCTTGCAAAGCTAGAAGTTGCTGTCTGGGTTCCACCCACCCTTTGTAAATTGAGCATAGGTTATGAAGTCA AGGTTATGGTTCTTTGTCATGGATTGTCTGTGATGGCTATTTTTGTCATTAAATTTTTCATTTTTTTTACATCTTGCCCC CTAGGTTGTTATTGGGCTTTTGTTAATCTAGAGGACAAGAGGGTTTTTTGCTTTTTTTTTAATGTGATGGTGAGATATAT AAATCAGAAATCTTAGCGGTCCTTGTATCATAGGTGTGCTCTGTGTAATTTTCATCTTTGTACAATTAATTTTTGTGTGA TTTAATCTGATGAAGAGTTCGTGAATTTTGATATAAGATTTCATGTTTTGCATTATGCTGCAAAGAGCTTGGGGATTGAT TTTACTTGCTATTGACTACTGCAGTGCATAGTAGTGAAAATCAAATATGAAGTTTCAACTTTCAAAGCATGGCAAACCAT CCCTATATGAGGATATGACCCAAATAAAAAAGAAGGAAGAGAACTCATGGATCTATTAAAATTGTACATTCACGCGGATG ATAATAAAAAAGATTTGATGAAAAAATATAAATTGAAAATTAT
CDS sequence (LotjaGi3g1v0183500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGATGTTGATTCCTCGATGGTGCCGGACGCCGATCACGATCCAGCTACAGAGAATCACGCCGCGGCTGAGGAAGACGG AGAGAAGCTTCCAGAGCCTCCGTCATCCGAGGGTGGATCTCCGGCGCAGCCACAGAGCTCGGTGGTTGGGCCGAGGCTGG CGCCAACTTATACTGTGGTGAATGCGGTTATGGATAAGAAGGAGGACGGGCCGGGGTCGAGGTGCGGCCACACGTTGACG GCTGTGGCGGCGGTCGGAGAGGAGGGGACGCCGGGGTATATTGGTCCGAGGCTGATTTTGTTCGGTGGTGCCACTGCGCT TGAAGGCAATTCTGCGGCTTCAGGGACTCCTTCTTCTGCTGGAAATGCTGGCATACGTTTGGCTGGTGCCACGGCTGATG TCCACTGTTATGATGTCTTGACTAATAAATGGTCTAGGTTAACTCCCTATGGAGAACCTCCAACACCAAGGGCTGCACAT GTGGCAACTGCTGTTGGTACCATGGTTGTTATTCAGGGTGGCATTGGTCCTGCTGGTTTGTCAGCAGAGGACCTTCATGT TCTTGATCTCACGCAACAATGGCCCCGCTGGCATAGAGTATCTGTTCAGGGCCCTGGACCAGGGCCACGCTATGGACATG TAATGGCTTTGGTGGGGCAGAGGTATCTTATGGCAATTGGAGGCAATGATGGAAAAAGACCTTTGGCTGATGTGTGGGCC TTGGACACAGCTGCCAAGCCTTATGAGTGGCGCAAGTTAGAGCCTGAAGGAGAGGGACCACCTCCATGCATGTATGCAAC TGCAAGTGCACGCTCGGATGGGCTTCTTCTGCTTTGTGGAGGGAGGGATGCCAATAGTGTTCCATTGGCTAGTGCATATG GACTTGCTAAGCATAGAGATGGTCGTTGGGAATGGGCTATTGCTCCAGGTGTCTCACCATCTCCAAGATATCAACATGCA GCGGTATTTGTGAATGCAAGACTCCATGTGTCTGGTGGGGCTCTTGGTGGAGGACGGATGGTCGAGGACTCATCAAGTGT TGCAGTATTGGACACTGCTGCTGGTGTTTGGTGTGATGCAAAATCTGTTGTAACCAGTCCAAGGACTGGTAGATACAGCG CTGATGCAGCTGGAGGAGACGCTGCAGTTGAGTTGACTCGGCGTTGTAGGCATGCTGCGGCTGCTGTTGGTGATCTAATT TTTATTTATGGTGGTTTACGTGGGGGAATCTTGCTTGATGACCTACTTGTTGCTGAAGATCTTGCTGCTGCTGAAACAAC ATCTGCTGCTTCACATGCTGCTGCTGCAGCAGCTGCATCTAATGTACAAGCAGGACACTTGCCTGGACGAAATGGCTTTG TTGATGATAGAACGAGACAAGCGATGCCTGAAGCGGCTGCTGATGGTTCTGTTGTATTAGGCAATCCAGTTGCTCCCCCA ATGAATGGTGACATTTATACGGATATCAGCACTGAAAATGCCATGCTTCAGGGACCTCGGCAAACTGCCAAAGGAGTTGA GTATCTGGTTGAAGCATCTGCAGCAGAAGCTGAAGCTATCAGTGCCGCACTGGCTGCTGCAAAGGCACGACAAGAGAATG GACTCAATGGAGAAGTTGAATTGCCTGACAGAGACCGTGGGGCGGAGGCTACCCCAAGTGGGAAACACACATCTTCCTTG ATTAAGCCTGATTCTGTTGGGTCAAATAACATTGCTTCTGGTGGAGTTCGGCTGCATCACAGAGCTGTAGTTGTTGCTGC CGAGACTGGTGGAGCCTTAGGTGGTATGGTTAGACAACTTTCAATTGATCAATTTGAAAATGAAGGCAGGCGTGTCAGTT ATGGGACTCCGGAAAATGCAACTGCTGCTAGAAAATTGTTAGATCGGCAGATGTCAATCAATAGTGTGCCCAAAAAGGTC ATAGCACACCTCTTAAAGCCTCGTGGATGGAAACCACCAGTACGCCGACAGTTTTTCTTAGATTGTAATGAAATTGCTGA TCTCTGTGATAGTGCTGAGCGGATATTTTCAACAGAACCAAGTGTCTTACAACTTAGTGCTCCGATTAAAATATTTGGTG ATTTACATGGGCAGTTTGGGGATCTCATGCGCCTTTTTGACGAGTATGGTGCACCGTCCACTGCCGGTGATATTGCATAT ATCGATTATCTATTCCTAGGAGATTATGTTGATAGGGGACAGCACAGCCTGGAAACTATATCCCTTCTTCTTTCTCTGAA GGTTGAGTATCCCAACAATGTACATTTAATACGTGGAAATCATGAAGCTGCAGATATTAATGCTCTTTTTGGTTTTCGAA TTGAGTGCATTGAGAGGATGGGTGAGAGAGATGGAATTTGGACATGGCATCGAATGAACCGGTTATTTAATTGGCTTCCT CTGGCGGCTTTAATTGAAAAAAAAATTATTTGCATGCATGGTGGGATCGGTCGTTCAATAAGTCATGTGGAGCAGATTGA GAATATTCAGCGTCCAATTCCGATGGAAGCAGGGTCAATTGTGCTCATGGATCTATTATGGTCTGATCCTACAGAGAATG ACAGTGTGGAAGGACTGCGGCCAAATGCTAGAGGTCCTGGATTAGTTACTTTTGGTCCTGATCGGGTTGTGGAATTTTGC AACAACAATGATCTTCAGCTAATTGTTCGTGCACATGAATGTGTGATGGATGGATTTGAGCGTTTTGCCCAGGGACATCT TATCACGCTTTTCTCAGCTACAAATTATTGTGGTACCGCAAATAATGCTGGGGCAATATTAGTTTTGGGCAGAGACCTTG TTGTGGTTCCTAAGCTGATTCATCCATTACCACCTGCAATTTCTTCACCAGAAACGTCACCTGAACGTCATATTGAAGAT ACATGGATGCAGGAGTTGAATGCTAACAGACCGGCGACACCAACTAGAGGCCGTCCCCAAGTAACAAATGACCGAGGCTC GCTCGCTTGGATGTAG
Protein sequence (LotjaGi3g1v0183500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MDVDSSMVPDADHDPATENHAAAEEDGEKLPEPPSSEGGSPAQPQSSVVGPRLAPTYTVVNAVMDKKEDGPGSRCGHTLT AVAAVGEEGTPGYIGPRLILFGGATALEGNSAASGTPSSAGNAGIRLAGATADVHCYDVLTNKWSRLTPYGEPPTPRAAH VATAVGTMVVIQGGIGPAGLSAEDLHVLDLTQQWPRWHRVSVQGPGPGPRYGHVMALVGQRYLMAIGGNDGKRPLADVWA LDTAAKPYEWRKLEPEGEGPPPCMYATASARSDGLLLLCGGRDANSVPLASAYGLAKHRDGRWEWAIAPGVSPSPRYQHA AVFVNARLHVSGGALGGGRMVEDSSSVAVLDTAAGVWCDAKSVVTSPRTGRYSADAAGGDAAVELTRRCRHAAAAVGDLI FIYGGLRGGILLDDLLVAEDLAAAETTSAASHAAAAAAASNVQAGHLPGRNGFVDDRTRQAMPEAAADGSVVLGNPVAPP MNGDIYTDISTENAMLQGPRQTAKGVEYLVEASAAEAEAISAALAAAKARQENGLNGEVELPDRDRGAEATPSGKHTSSL IKPDSVGSNNIASGGVRLHHRAVVVAAETGGALGGMVRQLSIDQFENEGRRVSYGTPENATAARKLLDRQMSINSVPKKV IAHLLKPRGWKPPVRRQFFLDCNEIADLCDSAERIFSTEPSVLQLSAPIKIFGDLHGQFGDLMRLFDEYGAPSTAGDIAY IDYLFLGDYVDRGQHSLETISLLLSLKVEYPNNVHLIRGNHEAADINALFGFRIECIERMGERDGIWTWHRMNRLFNWLP LAALIEKKIICMHGGIGRSISHVEQIENIQRPIPMEAGSIVLMDLLWSDPTENDSVEGLRPNARGPGLVTFGPDRVVEFC NNNDLQLIVRAHECVMDGFERFAQGHLITLFSATNYCGTANNAGAILVLGRDLVVVPKLIHPLPPAISSPETSPERHIED TWMQELNANRPATPTRGRPQVTNDRGSLAWM
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
PANTHER | 1 | 991 | 991 | 0.0 | – | |
MobiDBLite | 1 | 32 | 32 | - | – | |
MobiDBLite | 1 | 52 | 52 | - | – | |
PANTHER | 1 | 991 | 991 | 0.0 | – | |
PIRSF | 27 | 991 | 965 | 0.0 | ||
Gene3D | 92 | 253 | 162 | 2.8E-15 | ||
SUPERFAMILY | 128 | 418 | 291 | 4.97E-40 | ||
Pfam | 226 | 270 | 45 | 1.0E-4 | – | |
Gene3D | 254 | 444 | 191 | 5.7E-12 | ||
Pfam | 315 | 360 | 46 | 2.8E-5 | ||
MobiDBLite | 535 | 566 | 32 | - | – | |
MobiDBLite | 537 | 551 | 15 | - | – | |
MobiDBLite | 552 | 566 | 15 | - | – | |
Gene3D | 621 | 966 | 346 | 2.5E-109 | ||
CDD | 640 | 942 | 303 | 0.0 | ||
SUPERFAMILY | 645 | 951 | 307 | 1.48E-94 | – | |
SMART | 660 | 944 | 285 | 2.0E-104 | ||
PRINTS | 688 | 715 | 28 | 2.0E-59 | ||
Pfam | 688 | 895 | 208 | 8.1E-33 | ||
PRINTS | 723 | 750 | 28 | 2.0E-59 | ||
PRINTS | 756 | 780 | 25 | 2.0E-59 | ||
ProSitePatterns | 757 | 762 | 6 | - | ||
PRINTS | 794 | 820 | 27 | 2.0E-59 | ||
PRINTS | 884 | 904 | 21 | 2.0E-59 | ||
PRINTS | 906 | 922 | 17 | 2.0E-59 | ||
MobiDBLite | 968 | 991 | 24 | - | – | |
MobiDBLite | 968 | 982 | 15 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
---|---|---|---|---|
Molecular function | Phosphoprotein phosphatase activity | Catalysis of the reaction: a phosphoprotein + H2O = a protein + phosphate. Together with protein kinases, these enzymes control the state of phosphorylation of cell proteins and thereby provide an important mechanism for regulating cellular activity. | ||
Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). | ||
Biological process | Brassinosteroid mediated signaling pathway | A series of molecular signals mediated by the detection of brassinosteroid. | ||
Molecular function | Hydrolase activity | Catalysis of the hydrolysis of various bonds, e.g. C-O, C-N, C-C, phosphoric anhydride bonds, etc. Hydrolase is the systematic name for any enzyme of EC class 3. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0183500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…