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LotjaGi3g1v0183500.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi3g1v0183500
Transcript ID LotjaGi3g1v0183500.1
Related isoforms 6
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Serine/threonine-protein phosphatase; TAIR: AT2G27210.1 BRI1 suppressor 1 (BSU1)-like 3; Swiss-Prot: sp|Q9SHS7|BSL3_ARATH Serine/threonine-protein phosphatase BSL3; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0H3J2|A0A0R0H3J2_SOYBN Serine/threonine-protein phosphatase; Found in the gene: LotjaGi3g1v0183500
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr3:25705011..25721213) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

GTCCCATTGCCATTCTCCTGCGCCGCAACTTCTTCCTCCGTACCCTAACCGGTTCATGTTGGTCACTACCTTTTCTTCCC TAAACTGAAAAAAAAGAATTTAATTAATATGCATTAAAAAATATTTTTATCATACATAAATAATCAACTAAAAAAGCAAA AATGAAATCCAGAGAGAGAAAGACACAACACCTGGACTCAGACTCAGAGAAAGAGAGAGAAGGTGACAGGACAAAGAAAG TGATTGAATTTCTTTATTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTAATATAATACTGTAATATTTATTTTATA TAATTTTTTTTTTAATTTTTCCTGTGTTTTGTTGTGGGCTTGAGATTTTCTCCGTTCCCGTTTCGTTTCTGCGACCGCTT CTTTTCCTTTTCTCTGGGTTTCAACTTTCAACGACGCAGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAAGAAG AAGAAGAAGAGAGAGAAGAGAAAAACCTAGAGACTGAGGTTGAAGAATTTGCGTGTTCTGGAGTTTCTTCTGGTCTTCGA ATTGAAGAATCAGGGATCTGAGGTGTTTGGATTCCTCAAAATGTTGATTCGGAATACGAATTTACAGGAATTCTAGCTCG ATCTTCACGGAATTCCTCGAATCTTAGGGTTGAACCAATGGATGTTGATTCCTCGATGGTGCCGGACGCCGATCACGATC CAGCTACAGAGAATCACGCCGCGGCTGAGGAAGACGGAGAGAAGCTTCCAGAGCCTCCGTCATCCGAGGGTGGATCTCCG GCGCAGCCACAGAGCTCGGTGGTTGGGCCGAGGCTGGCGCCAACTTATACTGTGGTGAATGCGGTTATGGATAAGAAGGA GGACGGGCCGGGGTCGAGGTGCGGCCACACGTTGACGGCTGTGGCGGCGGTCGGAGAGGAGGGGACGCCGGGGTATATTG 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CDS sequence (LotjaGi3g1v0183500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGATGTTGATTCCTCGATGGTGCCGGACGCCGATCACGATCCAGCTACAGAGAATCACGCCGCGGCTGAGGAAGACGG AGAGAAGCTTCCAGAGCCTCCGTCATCCGAGGGTGGATCTCCGGCGCAGCCACAGAGCTCGGTGGTTGGGCCGAGGCTGG CGCCAACTTATACTGTGGTGAATGCGGTTATGGATAAGAAGGAGGACGGGCCGGGGTCGAGGTGCGGCCACACGTTGACG GCTGTGGCGGCGGTCGGAGAGGAGGGGACGCCGGGGTATATTGGTCCGAGGCTGATTTTGTTCGGTGGTGCCACTGCGCT TGAAGGCAATTCTGCGGCTTCAGGGACTCCTTCTTCTGCTGGAAATGCTGGCATACGTTTGGCTGGTGCCACGGCTGATG TCCACTGTTATGATGTCTTGACTAATAAATGGTCTAGGTTAACTCCCTATGGAGAACCTCCAACACCAAGGGCTGCACAT GTGGCAACTGCTGTTGGTACCATGGTTGTTATTCAGGGTGGCATTGGTCCTGCTGGTTTGTCAGCAGAGGACCTTCATGT TCTTGATCTCACGCAACAATGGCCCCGCTGGCATAGAGTATCTGTTCAGGGCCCTGGACCAGGGCCACGCTATGGACATG TAATGGCTTTGGTGGGGCAGAGGTATCTTATGGCAATTGGAGGCAATGATGGAAAAAGACCTTTGGCTGATGTGTGGGCC TTGGACACAGCTGCCAAGCCTTATGAGTGGCGCAAGTTAGAGCCTGAAGGAGAGGGACCACCTCCATGCATGTATGCAAC TGCAAGTGCACGCTCGGATGGGCTTCTTCTGCTTTGTGGAGGGAGGGATGCCAATAGTGTTCCATTGGCTAGTGCATATG GACTTGCTAAGCATAGAGATGGTCGTTGGGAATGGGCTATTGCTCCAGGTGTCTCACCATCTCCAAGATATCAACATGCA GCGGTATTTGTGAATGCAAGACTCCATGTGTCTGGTGGGGCTCTTGGTGGAGGACGGATGGTCGAGGACTCATCAAGTGT TGCAGTATTGGACACTGCTGCTGGTGTTTGGTGTGATGCAAAATCTGTTGTAACCAGTCCAAGGACTGGTAGATACAGCG CTGATGCAGCTGGAGGAGACGCTGCAGTTGAGTTGACTCGGCGTTGTAGGCATGCTGCGGCTGCTGTTGGTGATCTAATT TTTATTTATGGTGGTTTACGTGGGGGAATCTTGCTTGATGACCTACTTGTTGCTGAAGATCTTGCTGCTGCTGAAACAAC ATCTGCTGCTTCACATGCTGCTGCTGCAGCAGCTGCATCTAATGTACAAGCAGGACACTTGCCTGGACGAAATGGCTTTG TTGATGATAGAACGAGACAAGCGATGCCTGAAGCGGCTGCTGATGGTTCTGTTGTATTAGGCAATCCAGTTGCTCCCCCA ATGAATGGTGACATTTATACGGATATCAGCACTGAAAATGCCATGCTTCAGGGACCTCGGCAAACTGCCAAAGGAGTTGA GTATCTGGTTGAAGCATCTGCAGCAGAAGCTGAAGCTATCAGTGCCGCACTGGCTGCTGCAAAGGCACGACAAGAGAATG GACTCAATGGAGAAGTTGAATTGCCTGACAGAGACCGTGGGGCGGAGGCTACCCCAAGTGGGAAACACACATCTTCCTTG ATTAAGCCTGATTCTGTTGGGTCAAATAACATTGCTTCTGGTGGAGTTCGGCTGCATCACAGAGCTGTAGTTGTTGCTGC CGAGACTGGTGGAGCCTTAGGTGGTATGGTTAGACAACTTTCAATTGATCAATTTGAAAATGAAGGCAGGCGTGTCAGTT ATGGGACTCCGGAAAATGCAACTGCTGCTAGAAAATTGTTAGATCGGCAGATGTCAATCAATAGTGTGCCCAAAAAGGTC ATAGCACACCTCTTAAAGCCTCGTGGATGGAAACCACCAGTACGCCGACAGTTTTTCTTAGATTGTAATGAAATTGCTGA TCTCTGTGATAGTGCTGAGCGGATATTTTCAACAGAACCAAGTGTCTTACAACTTAGTGCTCCGATTAAAATATTTGGTG ATTTACATGGGCAGTTTGGGGATCTCATGCGCCTTTTTGACGAGTATGGTGCACCGTCCACTGCCGGTGATATTGCATAT ATCGATTATCTATTCCTAGGAGATTATGTTGATAGGGGACAGCACAGCCTGGAAACTATATCCCTTCTTCTTTCTCTGAA GGTTGAGTATCCCAACAATGTACATTTAATACGTGGAAATCATGAAGCTGCAGATATTAATGCTCTTTTTGGTTTTCGAA TTGAGTGCATTGAGAGGATGGGTGAGAGAGATGGAATTTGGACATGGCATCGAATGAACCGGTTATTTAATTGGCTTCCT CTGGCGGCTTTAATTGAAAAAAAAATTATTTGCATGCATGGTGGGATCGGTCGTTCAATAAGTCATGTGGAGCAGATTGA GAATATTCAGCGTCCAATTCCGATGGAAGCAGGGTCAATTGTGCTCATGGATCTATTATGGTCTGATCCTACAGAGAATG ACAGTGTGGAAGGACTGCGGCCAAATGCTAGAGGTCCTGGATTAGTTACTTTTGGTCCTGATCGGGTTGTGGAATTTTGC AACAACAATGATCTTCAGCTAATTGTTCGTGCACATGAATGTGTGATGGATGGATTTGAGCGTTTTGCCCAGGGACATCT TATCACGCTTTTCTCAGCTACAAATTATTGTGGTACCGCAAATAATGCTGGGGCAATATTAGTTTTGGGCAGAGACCTTG TTGTGGTTCCTAAGCTGATTCATCCATTACCACCTGCAATTTCTTCACCAGAAACGTCACCTGAACGTCATATTGAAGAT ACATGGATGCAGGAGTTGAATGCTAACAGACCGGCGACACCAACTAGAGGCCGTCCCCAAGTAACAAATGACCGAGGCTC GCTCGCTTGGATGTAG 

Protein sequence (LotjaGi3g1v0183500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MDVDSSMVPDADHDPATENHAAAEEDGEKLPEPPSSEGGSPAQPQSSVVGPRLAPTYTVVNAVMDKKEDGPGSRCGHTLT AVAAVGEEGTPGYIGPRLILFGGATALEGNSAASGTPSSAGNAGIRLAGATADVHCYDVLTNKWSRLTPYGEPPTPRAAH VATAVGTMVVIQGGIGPAGLSAEDLHVLDLTQQWPRWHRVSVQGPGPGPRYGHVMALVGQRYLMAIGGNDGKRPLADVWA LDTAAKPYEWRKLEPEGEGPPPCMYATASARSDGLLLLCGGRDANSVPLASAYGLAKHRDGRWEWAIAPGVSPSPRYQHA AVFVNARLHVSGGALGGGRMVEDSSSVAVLDTAAGVWCDAKSVVTSPRTGRYSADAAGGDAAVELTRRCRHAAAAVGDLI FIYGGLRGGILLDDLLVAEDLAAAETTSAASHAAAAAAASNVQAGHLPGRNGFVDDRTRQAMPEAAADGSVVLGNPVAPP MNGDIYTDISTENAMLQGPRQTAKGVEYLVEASAAEAEAISAALAAAKARQENGLNGEVELPDRDRGAEATPSGKHTSSL IKPDSVGSNNIASGGVRLHHRAVVVAAETGGALGGMVRQLSIDQFENEGRRVSYGTPENATAARKLLDRQMSINSVPKKV IAHLLKPRGWKPPVRRQFFLDCNEIADLCDSAERIFSTEPSVLQLSAPIKIFGDLHGQFGDLMRLFDEYGAPSTAGDIAY IDYLFLGDYVDRGQHSLETISLLLSLKVEYPNNVHLIRGNHEAADINALFGFRIECIERMGERDGIWTWHRMNRLFNWLP LAALIEKKIICMHGGIGRSISHVEQIENIQRPIPMEAGSIVLMDLLWSDPTENDSVEGLRPNARGPGLVTFGPDRVVEFC NNNDLQLIVRAHECVMDGFERFAQGHLITLFSATNYCGTANNAGAILVLGRDLVVVPKLIHPLPPAISSPETSPERHIED TWMQELNANRPATPTRGRPQVTNDRGSLAWM 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 1 991 991 0.0
MobiDBLite 1 32 32 -
MobiDBLite 1 52 52 -
PANTHER 1 991 991 0.0
PIRSF 27 991 965 0.0
Gene3D 92 253 162 2.8E-15
SUPERFAMILY 128 418 291 4.97E-40
Pfam 226 270 45 1.0E-4
Gene3D 254 444 191 5.7E-12
Pfam 315 360 46 2.8E-5
MobiDBLite 535 566 32 -
MobiDBLite 537 551 15 -
MobiDBLite 552 566 15 -
Gene3D 621 966 346 2.5E-109
CDD 640 942 303 0.0
SUPERFAMILY 645 951 307 1.48E-94
SMART 660 944 285 2.0E-104
PRINTS 688 715 28 2.0E-59
Pfam 688 895 208 8.1E-33
PRINTS 723 750 28 2.0E-59
PRINTS 756 780 25 2.0E-59
ProSitePatterns 757 762 6 -
PRINTS 794 820 27 2.0E-59
PRINTS 884 904 21 2.0E-59
PRINTS 906 922 17 2.0E-59
MobiDBLite 968 991 24 -
MobiDBLite 968 982 15 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Phosphoprotein phosphatase activity Catalysis of the reaction: a phosphoprotein + H2O = a protein + phosphate. Together with protein kinases, these enzymes control the state of phosphorylation of cell proteins and thereby provide an important mechanism for regulating cellular activity.
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).
Biological process Brassinosteroid mediated signaling pathway A series of molecular signals mediated by the detection of brassinosteroid.
Molecular function Hydrolase activity Catalysis of the hydrolysis of various bonds, e.g. C-O, C-N, C-C, phosphoric anhydride bonds, etc. Hydrolase is the systematic name for any enzyme of EC class 3.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi3g1v0183500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…