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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi4g1v0305100 |
Transcript ID | LotjaGi4g1v0305100.2 |
Related isoforms 4 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | Subtilisin-like protease; TAIR: AT4G30020.1 PA-domain containing subtilase family protein; Swiss-Prot: sp|Q9SZV5|SBT26_ARATH Subtilisin-like protease SBT2.6; TrEMBL-Plants: tr|A0A151SRS2|A0A151SRS2_CAJCA Subtilisin-like protease; Found in the gene: LotjaGi4g1v0305100 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:68058814..68088307) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CAAACAAAATGATTTGAATAATACTATTAATAATGATAAATAATAATGAATGTTCATTATTAAGAATACTTCATTGCATT GCATCAAGATTCAAGATCAGCCATCATCATGCTCTGACTTCACTTCACCCTCTCTGGAATTTAATCAAACAAACAAACCA ACCCTCACTCTCTCTCACTCTTCCTGTACTAACTCACTAGCATCTTCTAGTTCCATGGCATTCACCTTCAACAGTGACTA TTAGATTTTTTTTAGATCTCTCATCACCTTCACCATAATGTGAGTGAACTGTGAATACTTTAGCTTCAATGTCATGACTC ATGTGTATTTCCCTTCACTTTTCTCTTTGTTTGCTTTTTTTCCTCTCAATGATTCTTTACTTCCTGGCTTCTGTTTATTT ACTGCTTCACTTTTTATATATATATTTTTTAATTAATGTTTCTGCTGCTCCCTGTAGATGTGAGTGAGCAACAGCTTGCT ACTTGGATCGAAGTGAGTGGGCATTGGTAAAGTTTGCCACTTTTAGCTGAAAGTTTCAAAAGGGTTGTTTTATTTTCTAG ATATGGGACCAGCTTCTGCTTTGTTTTGTTGATTAGTATTTTTTACTTAACTTGATTGGATCATGAAACAGATCTTGTAA ACCATTGGAGTTATGGAACGGTCAACGAAGATGAGATTGGTGGAGTTTGGTTGTGTTTTGATTGTTCTGTCTCTTCTTCT GGTTTCTGGGAGCGCTGAGGTTTACATAGTAACTGTTGAAGGTGAGCCTATCATCAGTTACCGTGGAGGAATTGATGGGT TTGAAGCTACTGCTGTGGAATCTGATGAGAAGATTGACACCACAAGGTACTTGAAAGCAATGTTCCTTTCATTGGCAAGT GTTGTTGCTCACATTTTGGGTGTGTTTGGGTAAATAGCTTAATTAAGCGCTTATTGAACTAATAAGCGCGCTTATTCGAT 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GTAGAAGTCTATAGAATGACATTGATGAAAGAAGTTCAAGAGAGTTTTTTTTATTGAGTAACCTTTAACTTTTAAGGTTT ATTATTAATATTAATTATTAGTTAACTAATACTTCAACAAACCTAAACTAATAATATGTGTCTTATGGAATTCATAACTA TATCACATTTAATATTAATTTTGACCTATAATAAATTTATTTAAAATAATTTTGAGCTTAATAGTAGAAAGTTATATAAT AACATTGATGGAGGAAGTTCAAGAGGAATATCGAACGGCTTAGATTAAAAGTCTGTTGACTATCGAACGGTTCTGAAAAA TCACATATAAAATAATATGTATAATTACTTAAAAGCTCATAGGTAAAAATAAATATATGAAACATTTTTTATTGATAGAC TATATATTTTACCTTCGAGATTGCTAAACTTCTCCTTTATATTATATATAAATAAATATAAATAAATAAATAAAAATGCC TTTTTGAATTTCATAACTTATATGAAATAAAAAATAAAAAATTTATTTTCAATAATTTTAAATTAATAATAGAAGTCTAT AAAATGACATTAATGAAGGAAGTTCAAGAGGAAGGATAGATGGGGTTTTTTTTTTTATTGAGTGACCTTTAACTTTTAAG GTTTATTATTAATATTAATTATTAGTTGATTAATACGTCAACATACCTAAACTACTAATATGTGTCTTATAGAATTCATA ACTAATATCATATTTAATATAATTTTTGACCTAAGACTCCATAACTCATATAAATTAAATAATAATAAATTTATTTAAAA TAATTTGAGCTTAATAGTTGAAAGTTATATACTAACATTGATGGAGGAAGTTCAAGGGGAATATCGAATGACTGAGATTA AAAGTCTGTTGAATATTGAACGGGTTCTGAAAATTCACATATGAGATAATATGTATAATTACTTAAAAGCTCATAGGTAA 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TGCTGTACTGTGCTGTTGATCAATGAATCATGAAATTTAATTCTACAGTTCATGATTTCCAGTTCTATTACTATGCCAAT ATTCAGAGTCTCTGACTAACTTTTTACTCAGAACAGTTTAATTACAATTATTGATTAAATTTTTTGGTTTTCATATCCCA AGGTTTCACTTGACCCTCCAGTATCTGCCCTCCATGCAACAGATGAGAAAGAAAACATTGAAATGATATGGTGCCAGCAA CCTATTCCAAAATTTAGAGGTATCTAACTTTTATCAGAAATCATAAGTAACTCAAATTCACAATGACTCATATATAATTC TTCCTCCACACCTAATTAAGCTACTAATTACAATTTGTCTCAACTAATGTTCTGGTTTTCAGTTTGCAACTTTGCATCAT CAGCAAATGTATGTGGTCTAAGAAGATTGTAAATGATAGAATTGATCTGTAATACAGGATCAATTAGTTGAACAGAGTAA CTGAATTAGTTACGTTCAGTTAGGGTAGTTAGGCTGGTTTAGGAGTTAGTTAGAATAGGAAGTTTCAAGTCATCGTGGAC CTGAACTACTTAGTAAGTTAGCATATAATCCATTCTCTAACACTGATGTAATACACTGATTCATTTTCTCATTCTATTCA ACACAATTCATCTTCTCAATAATCTGAATCAAGGAACTAGCTACATGTTATACAAGCTACACCATGTGCAACTAATCAAT CAGCTCAAAATAGAAAACTGATTTAGTTAACTAATTCCTAACAAAGTAACTAACTCCTAACCACATGAGTGATCCACTTA GACATAGGCTAGTTACTAGATGTGAACAGAGATTTAATTTCATGGACATGTTTTTCACATCATGGTTTTACAGTTTTGCC TGACTACTAATCTGGTGTTAATTAAGAGAATGTTCAGCTCAGCTTCTCTTTCTTCAGAATTGATTTTGAAAACCAGAAGT TACTCTCAAAAGCTTCTCTCTTTGATTATGACGTCTGAATCACTTCTAGAATGATATCCAAACACGCACTTAGTGAAGCC TGATCGCTTTTACTTTTGACAGCTTGTTGCAAAAGAACTACAATCGTCCATTCTATCAAGTGCTGCACTTCATAAAAGAA ATATTACAAATACTTATACAAGTCTGCACCTTTCATATGGATTAAATTGGGTGTGTGCACTTCGCTTGTTTCTCATGAGT TATGACCTTATGCCATGATTGAATACAAGCAAAACAATGCTTCTAAATAATGCAGCTAACTGTTAACACAATTTGGAGTC TTATATGCCTCCAGGTATCTAGAGTAATGGTGTGTTTGGATAACAAACTTAATTAAGCATTTATGTCATTAGCGTTTATC ACATAAACGCTTAATAAGATCAAATTAGGTTATAGGTAATAGGTATAAGAACTTATTCATAAGCTAATCTGAGCAGGTTA TAAAAATAAGTGGTAGGTCATGAGCTATTTATATAAAGTCTCCCATTCAATTGCATACACACTTATACTTTAAAATAAGT TCAAATAAGCTATTTGAAACGAGGCTAAGTCTTTTTAACCTGTTTCAAACAAATTTCAAGTTCTATATAATGGCCCTTTA CTAAGCAATCTTCTGTACATTCATCTAAATATCTCAATTAAAATAAATTTGTAGGTACATCTATTGAAGCACAAGTGCAT GGTAAAAGGGTGCTGAAGCTCCTAAATCATGGAGAAACATATGAAATGAATTCTCCTAATCTTTTGATTAGAATTCTTCC TGTTCCTGGGGTTGATTGGGTTGGCAATGTTAATATACGATGCATAGAGACAGGCCTGGAAGCTGAGTTATCCTACAAAA GCCATTCTTATGCAGGACTTGGGGGAAATAGAAGATTGATCAGAGGGAAGATCCTTGACTCATCATCATTGAAAGTTCTA TATGAAGTTGATGGTCATTGGGATAGGTACTGTATCTTTCACTTTAATTTTTTTTTTTAGTGAAAAAATTTCAGTAAAAT ATTAAAGTAAAATCTTGAAATGTGTTTTTCCAAGTCGAAGAGACTCGGGTCTCTTAAACATATGGTCACGGGCTCGATCT CTAGGTTATCAAAAAACGCAGTTGGGAGACATCTCACTTCGGTGCGCGACAGTAGGATCCAGAGAGATTAGTCTCTCACC TATCGTGTGTGAGGATAGTAGGATATTCTAAAAAAGCAAAAAAAAGTAAAATCTTGAACACTCTCAATTTATAAACCACC CAACAATAACGATATCTTCCATACACCTCATTTTTTCTCTATATCTTTTTGTATCACATCTATCGCTTATAGTTATATTT CTTCCTATCACATCTATTAAAATCTTGAAAGTGCAACTCAATTTAAGACATTGAACTGGCTGACACATTAAATTAATGAT GACAAATGACTTAACAAGTTTTTCCTCTTGTAAAAAAAAATACTAACCGAGTCTCATACATGCGACGTGCTTAAATTAGG GTGGTATGGCTTGTCTATTCAAGAATTAACTATTCTACATGGTAGTGACAAACTTCTTATGAAATTTCATTATTCAGAAC TGTGAAAGTAAAGGACACAAATAATGGGGAAGCAAGAGTGATATATGATGCAAAACAAGTCATTTCAGGGCTCAAAGCTC CTATTGTAAAGGACAAAGAGGTAATTAACTTCTGTGCTCTATCTCTGTCATTAATAGATATGAAATTCAGAGGTAACCAA ATGTATTTTTGCACTGAATGCGTTCATAGTACATAAATAGTGACATAATAAAGTGCTCAACCAAATTAAAAAGACAGTTG AGGTTGTACTAACTGTTTAGTATTTTTCTTCATTTATATATATTTTATGAATCATGCTCTCGTAGAATCTTTTTCAAATA AGGAAAATATCTGGATGTGCTTAAAAGATTGTTCACTTATAAAAATGACAGGACTAGTATCAATTTAATTTCTGATAGAT TAAAATTGGTAAATAATTTGTCAATCAAATCATTTCATGCGTCTCCATCCTACACAGTTTAGGTTTTTGGGATAGTTGAA CCATGATATAGTATCATAGTCTGTGACTAAGGGTTATCTACTTATCTAGAGTTTGATATTATTACCGCGTGAATATTTGT GCATTTCTTCGCTCCTTATATTCATGTCAAATTAACTACCACATCTTACTAACTAAAAGAACAAGCTTCTAGTCTCTCAT GGACATTAATCTTGCAAACTTTATCCCTAAAAGTATCATCGATCTCTATAATTTGAAGATTTTAATTAATATGCATGTTT TGAATGTGACTTGAGAAATATGTTTTTGTTGTTCAGAGTGTGTGGGCAACAGAATCAGCCCTTGTGTGGAGTGAGTTGAG CCAAGCCATCATCAACAAAGAGTGGGAGAAAGCCAAGGAAGCAAAGCAAGATGTGGAAGAAAGGCAGAGGAAGATGTCAA TGGAAAGGGACACAAAAGGAGAAAGTTGGGTTCCTAAGAATTTCAGGGTGTCTTGCAGCAGTAAAGAAGGTAAGTGGGAG TGGAACTGTTCACCCATTCATAAATGGGTCCCTGATGCTCCCATTATAGCCCGA
CDS sequence (LotjaGi4g1v0305100.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAACGGTCAACGAAGATGAGATTGGTGGAGTTTGGTTGTGTTTTGATTGTTCTGTCTCTTCTTCTGGTTTCTGGGAG CGCTGAGGTTTACATAGTAACTGTTGAAGGTGAGCCTATCATCAGTTACCGTGGAGGAATTGATGGGTTTGAAGCTACTG CTGTGGAATCTGATGAGAAGATTGACACCACAAGTGAATTGGTTACTTCTTATGCTCGTCATCTTGAAAAGAGACATGAC ATGATTCTGGGGATGCTGTTTGAGCAAGAGACATACAAGAAGCTCTACAGCTATAAACATCTTATAAATGGGTTTGCTGT TCATATTTCCCCAGAACAGGCAGAAACTCTAAGACGTGCTCCTGGAGTGAAATCTGTTGAGAGGGACTGGAAAGTGAGAA AACTGACGACACATACCCCGCAATTTTTAGGCCTTCCAACCGGGGTATGGCCGACAGGAGGCGGCTTTGATCGGGCTGGA GAAGACATTGTGATAGGATTTGTGGACTCAGGGATCTATCCCCACCACCCCAGCTTTGCGACTCATAATACCGAACCGTA TGAGCCGGTTTTGAAGTATAGAGGAAAATGCGAAGTTGATCCGGATACTAAAAGAAATTACTGTAATGGGAAGATTGTCG GAGCACAACACTTTGCTCAAGCTGCAATAGCTGCTGGGGCATTTAACCCTTCAATTGATTTTGCATCTCCTTTGGATGGG GATGGACACGGAAGTCACACAGCCTCTATTGCAGCTGGAAATAATGGAATCCCTGTAAGATTTCATGGCCATGAATTTGG GAAAGCAAGTGGGATGGCTCCTCGTGCCAGGATTGCTGTGTACAAGGCCCTCTATAGACTGTTTGGAGGGTTTATTGCCG ATGTAGTTGCTGCAATTGATCAGGCTGTATATGATGGAGTGGATATACTCAGCCTTTCAGTTGGACCCAACAGTCCTCCA ACAGCCACAAAAACTACATTTTTGAACCCTTTTGATGCTACACTTCTTGGAGCTGTGAAAGCTGGTGTATTTGTTGCACA GGCTGCTGGAAATGGCGGTCCATTTCCTAAGACAATGGTTTCATATAGTCCATGGATAACATCTGTAGCAGCTGCAATTG ATGATCGTAGATATAAAAACCATTTGACCCTTGGGAATGGAAAAATCTTAGCTGGAATCGGGTTATCACCTTCTACACAT TTAAACCAAACATACAAGTTGGTTGCTGCAAATGATGTGCTGCTAGATTCTTCACTTATTAAGTACAGCCCCACAGATTG CCAGAGACCAGAAGTTTTAAACAAGAAATTGATAGAGGGAAATATTCTTCTCTGTGGATATTCTTTCAACTTTGTTGTTG GTACTGCATCAATCAAGAAAGTCTCAGAAACAGCAAAGACCCTTGGGGCTGCTGGATTTGTTCTCTGTGTTGAAAACGTT TCCCCGGGAACTAAATTTGATCCTGTTCCTGTTGGCCTTCCCGGAATTCTTATCATAGATGTCAGCAATTCGCAGGAACT TGTAGATTATTATAATATCTCTACACCAAGAGACTGGACTGGACGGGTGAAGAGTTTCATAGGTACAGGTAAAATTGGCG ACGGCTTGATGCCTATCCTTCATAAATCTGCACCACAGGTGGCATTGTTCTCCGCTAGAGGGCCAAATATAAAGGACTTC AGCTTCCAAGAGGCAGATCTTCTCAAACCCGATATATTAGCTCCTGGTTCATTGATTTGGGGTGCTTGGTCTCTAAATGG AACTGATGAGCCAAATTATGTTGGTGAGGGTTTTGCCATGATATCTGGAACTAGCATGTCCGCACCACATATAGCTGGAA TTGCTGCTCTTATAAAGCAGAAACATCCACAATGGAGCCCTGCCGCCATTAAATCAGCCTTGATGACAACATCAACAACT CTAGACAGAGCAGGGAATCCTCTTCTAGCCCAGAAAACTTCTGAAACAGAAGCTATGAAGCTGGTCAAAGCCACTCCTTT TGATTATGGGAGTGGGCATGTTGATCCAAGAGCTGCCTTGGATCCTGGTCTCATCTTTGATGCAGGATACGAGGATTATC TCGGCTTCTTATGCACAACACCAGGCATTGACGTTCATGAGATAAAGAACTACACTCATGTGCCATGCAACACTACCATG GGTAAACCATCAAATTTAAACACCCCTTCTATCACAATTTCCCATCTTGCGGAACCTCAAGTTGTCACCCGCACGGTCAC GAATGTTGCTGAGGAAGAAACCTACGTGATCACAGCCAGAATGGAACCAGCTGTTGCCATTGAAGTCAACCCTCCTGCAA TGACTATCAGAGCAGGTGCATCGCGTAAGTTTTCTGTGACACTCACGGCTCGATCAGTTACAGGAAGCTATAGTTTTGGC GAGGTTGTAATGAAAGGGAGTAGAGGGCATAAGTCATCTGCAATGGAGGATAGATCACTGAAGAATTTTCAAAAGCTGTT GCTTCTCTCATTAAAACACAATTTCTTACTAATGTGA
Protein sequence (LotjaGi4g1v0305100.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MERSTKMRLVEFGCVLIVLSLLLVSGSAEVYIVTVEGEPIISYRGGIDGFEATAVESDEKIDTTSELVTSYARHLEKRHD MILGMLFEQETYKKLYSYKHLINGFAVHISPEQAETLRRAPGVKSVERDWKVRKLTTHTPQFLGLPTGVWPTGGGFDRAG EDIVIGFVDSGIYPHHPSFATHNTEPYEPVLKYRGKCEVDPDTKRNYCNGKIVGAQHFAQAAIAAGAFNPSIDFASPLDG DGHGSHTASIAAGNNGIPVRFHGHEFGKASGMAPRARIAVYKALYRLFGGFIADVVAAIDQAVYDGVDILSLSVGPNSPP TATKTTFLNPFDATLLGAVKAGVFVAQAAGNGGPFPKTMVSYSPWITSVAAAIDDRRYKNHLTLGNGKILAGIGLSPSTH LNQTYKLVAANDVLLDSSLIKYSPTDCQRPEVLNKKLIEGNILLCGYSFNFVVGTASIKKVSETAKTLGAAGFVLCVENV SPGTKFDPVPVGLPGILIIDVSNSQELVDYYNISTPRDWTGRVKSFIGTGKIGDGLMPILHKSAPQVALFSARGPNIKDF SFQEADLLKPDILAPGSLIWGAWSLNGTDEPNYVGEGFAMISGTSMSAPHIAGIAALIKQKHPQWSPAAIKSALMTTSTT LDRAGNPLLAQKTSETEAMKLVKATPFDYGSGHVDPRAALDPGLIFDAGYEDYLGFLCTTPGIDVHEIKNYTHVPCNTTM GKPSNLNTPSITISHLAEPQVVTRTVTNVAEEETYVITARMEPAVAIEVNPPAMTIRAGASRKFSVTLTARSVTGSYSFG EVVMKGSRGHKSSAMEDRSLKNFQKLLLLSLKHNFLLM
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
Phobius | 1 | 11 | 11 | - | – | |
Phobius | 1 | 28 | 28 | - | – | |
SignalP_EUK | 1 | 28 | 28 | - | – | |
TMHMM | 12 | 34 | 23 | - | – | |
PANTHER | 12 | 799 | 788 | 0.0 | – | |
PANTHER | 12 | 799 | 788 | 0.0 | – | |
Phobius | 12 | 23 | 12 | - | – | |
Phobius | 24 | 28 | 5 | - | – | |
Phobius | 29 | 838 | 810 | - | – | |
Pfam | 30 | 133 | 104 | 4.2E-20 | ||
Gene3D | 61 | 135 | 75 | 1.2E-7 | ||
SUPERFAMILY | 92 | 133 | 42 | 3.29E-6 | – | |
ProSiteProfiles | 129 | 680 | 552 | 27.409 | – | |
SUPERFAMILY | 135 | 684 | 550 | 1.57E-73 | ||
CDD | 136 | 639 | 504 | 3.80388E-123 | ||
Pfam | 160 | 670 | 511 | 4.2E-47 | ||
PRINTS | 160 | 179 | 20 | 1.4E-16 | ||
Gene3D | 162 | 694 | 533 | 7.0E-143 | ||
ProSitePatterns | 165 | 176 | 12 | - | ||
PRINTS | 239 | 252 | 14 | 1.4E-16 | ||
Gene3D | 375 | 540 | 166 | 7.0E-143 | – | |
CDD | 382 | 520 | 139 | 3.0979E-13 | – | |
PRINTS | 602 | 618 | 17 | 1.4E-16 | ||
ProSitePatterns | 603 | 613 | 11 | - | ||
Gene3D | 697 | 814 | 118 | 1.2E-12 | – | |
Pfam | 725 | 806 | 82 | 2.4E-13 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
---|---|---|---|---|
Molecular function | Serine-type endopeptidase activity | Catalysis of the hydrolysis of internal, alpha-peptide bonds in a polypeptide chain by a catalytic mechanism that involves a catalytic triad consisting of a serine nucleophile that is activated by a proton relay involving an acidic residue (e.g. aspartate or glutamate) and a basic residue (usually histidine). | ||
Biological process | Proteolysis | The hydrolysis of proteins into smaller polypeptides and/or amino acids by cleavage of their peptide bonds. |
Expression pattern of LotjaGi4g1v0305100.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…