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LotjaGi4g1v0305100.2

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi4g1v0305100
Transcript ID LotjaGi4g1v0305100.2
Related isoforms 4
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Subtilisin-like protease; TAIR: AT4G30020.1 PA-domain containing subtilase family protein; Swiss-Prot: sp|Q9SZV5|SBT26_ARATH Subtilisin-like protease SBT2.6; TrEMBL-Plants: tr|A0A151SRS2|A0A151SRS2_CAJCA Subtilisin-like protease; Found in the gene: LotjaGi4g1v0305100
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr4:68058814..68088307) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CAAACAAAATGATTTGAATAATACTATTAATAATGATAAATAATAATGAATGTTCATTATTAAGAATACTTCATTGCATT GCATCAAGATTCAAGATCAGCCATCATCATGCTCTGACTTCACTTCACCCTCTCTGGAATTTAATCAAACAAACAAACCA ACCCTCACTCTCTCTCACTCTTCCTGTACTAACTCACTAGCATCTTCTAGTTCCATGGCATTCACCTTCAACAGTGACTA TTAGATTTTTTTTAGATCTCTCATCACCTTCACCATAATGTGAGTGAACTGTGAATACTTTAGCTTCAATGTCATGACTC ATGTGTATTTCCCTTCACTTTTCTCTTTGTTTGCTTTTTTTCCTCTCAATGATTCTTTACTTCCTGGCTTCTGTTTATTT ACTGCTTCACTTTTTATATATATATTTTTTAATTAATGTTTCTGCTGCTCCCTGTAGATGTGAGTGAGCAACAGCTTGCT ACTTGGATCGAAGTGAGTGGGCATTGGTAAAGTTTGCCACTTTTAGCTGAAAGTTTCAAAAGGGTTGTTTTATTTTCTAG ATATGGGACCAGCTTCTGCTTTGTTTTGTTGATTAGTATTTTTTACTTAACTTGATTGGATCATGAAACAGATCTTGTAA ACCATTGGAGTTATGGAACGGTCAACGAAGATGAGATTGGTGGAGTTTGGTTGTGTTTTGATTGTTCTGTCTCTTCTTCT GGTTTCTGGGAGCGCTGAGGTTTACATAGTAACTGTTGAAGGTGAGCCTATCATCAGTTACCGTGGAGGAATTGATGGGT TTGAAGCTACTGCTGTGGAATCTGATGAGAAGATTGACACCACAAGGTACTTGAAAGCAATGTTCCTTTCATTGGCAAGT GTTGTTGCTCACATTTTGGGTGTGTTTGGGTAAATAGCTTAATTAAGCGCTTATTGAACTAATAAGCGCGCTTATTCGAT 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TTGAATTAAGCTGAGCAGATGATCAAGTGTCACCAATCATACTTTTAGATAACATAAAGATATCACAAATTTAAAACTAC AACTTAAAACAAACACGTGCAACGCACGAGTTTAATTTCTAGTACTAAGAGTATTTGTCTGAAATCTCTTCCAAGAATGG TTGATGGCTTTTAGTGTCCTATCGAGGGTTTCAAATGCCAACCTTTTAGTCATAGGTGTCTCATCCCAAATAATCAAATC TATTTAAATCACTAATCGAGCAAGCTAAATATTTTACTTGATTGAGCTCGTACTATCTTCAAAAAGTTTTAATGGTATTC GAAATCGAATATGATGAGTTGTTCTACTGTAGTGATACAATCCCTGGAATTTTTTTAAAAATAAAGAAGATCAGAGTACA AATTTTTTGTGATGATTGTAAATATTCAATAAATTTAATATATATTAATATGTTGTGATTATTTAGTTTGTAAAAATGGA TTTTAAGTTAAATGATCATTAATAAAAAAAAAGCTAAATATTTGTCAAATATTTTTGTGTAAGAATAATTCAAATATTTA TGATCAATAATAAAAGTAAATATTTTTAAATTACGTTTTGGTTTTATAAATAGAAGAAAAAAATTAAGAATTTTAAAATA TGAATCCGTGATAAATTAATAGTATGGCTAATTTTTTTTTTTAAAAGGGAAGCCACACAAATAGGAGTAAAAAATAAGCT TACAGGTCCACATTGAATTAAAAAAAAGGAGTAAAGGGAGAGTGATCCCATTTTTTGTCTCCTCATCTTCTGCCCAAACA AAAACCCTAGCCACCACACCTAGCCTTTCCTCTTCTCCTCCTCCTCCTTCCCTTACGACCACGAAACCACCGACCATGCC TCCGACAGCTTTTGTTGGACGTGCGACCCACACTACTGCCCCAGTCCCACCCAATTTGGTTTTTTTGTCAAACTTGTGCA 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GTAGAAGTCTATAGAATGACATTGATGAAAGAAGTTCAAGAGAGTTTTTTTTATTGAGTAACCTTTAACTTTTAAGGTTT ATTATTAATATTAATTATTAGTTAACTAATACTTCAACAAACCTAAACTAATAATATGTGTCTTATGGAATTCATAACTA TATCACATTTAATATTAATTTTGACCTATAATAAATTTATTTAAAATAATTTTGAGCTTAATAGTAGAAAGTTATATAAT AACATTGATGGAGGAAGTTCAAGAGGAATATCGAACGGCTTAGATTAAAAGTCTGTTGACTATCGAACGGTTCTGAAAAA TCACATATAAAATAATATGTATAATTACTTAAAAGCTCATAGGTAAAAATAAATATATGAAACATTTTTTATTGATAGAC TATATATTTTACCTTCGAGATTGCTAAACTTCTCCTTTATATTATATATAAATAAATATAAATAAATAAATAAAAATGCC TTTTTGAATTTCATAACTTATATGAAATAAAAAATAAAAAATTTATTTTCAATAATTTTAAATTAATAATAGAAGTCTAT AAAATGACATTAATGAAGGAAGTTCAAGAGGAAGGATAGATGGGGTTTTTTTTTTTATTGAGTGACCTTTAACTTTTAAG GTTTATTATTAATATTAATTATTAGTTGATTAATACGTCAACATACCTAAACTACTAATATGTGTCTTATAGAATTCATA ACTAATATCATATTTAATATAATTTTTGACCTAAGACTCCATAACTCATATAAATTAAATAATAATAAATTTATTTAAAA TAATTTGAGCTTAATAGTTGAAAGTTATATACTAACATTGATGGAGGAAGTTCAAGGGGAATATCGAATGACTGAGATTA AAAGTCTGTTGAATATTGAACGGGTTCTGAAAATTCACATATGAGATAATATGTATAATTACTTAAAAGCTCATAGGTAA 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ACTTTCAAATTTACGTATATGACCATGGTAAAATATTCATTCATGAGTCATAGTCTATTGCATGACTATTTTACCCTCCT TGTTGCCAAACTTTGCTTTTATATAATATATAGATATAGATATAGATATAGATATAGATATAGATAGATATAGATATAGA TATAGATATAGATATAGATATAGATAGATAGATAGATAGATGTGTATGTGAAGAAATGAGAAAAATGCATGTGTTACATC ATTATTGGGGCTGGGATGATGCAGGTGACCGATGGAAAGAAGCAATCTAAGATTTTTCTCACGAAGCCTTTCACATTGGA AGGTGAATCAGATTTAGACCCATCTTATAGAGCTCCTAATCTCCTTCAACGCTTGTTAAGTTTACTTAAGAATATACGGC CAGGATCAGATCTCACACACTTCCAGGCAAGCTCTCTCATTCACTTTTACCTCTCCACATCTGGAGTCCAAGTTATTTAT GTGTTTGGATTTCCATTTAACTCAACGTGTTAAAAATCTTGTTTTTGAGTTTTTCTGTTATGATAAATTATAAATTCTTC GTTAATAGTTAGTATAGTGAAACAAATGAAATTGTTGAACTCTAACGTCTAATCAAACCTGCACTATATTGAGGGCATGT TTGGGGTGTTTTAGAATCAATTTTCATTCTCATGGTTCAGAAATTCATAATAACTTTTAAGTGGTTATACAGATGTTTGT TTGACAATCGATGATAATTAATTCTTCCAGAAGCTATTTAGAGAGTAGTTTTTGGGCTGAACATAATCATATGAGATTTC ACAATATTACCCTATATAAATCATTTTTACTATAATCAATTTTACCAAAATCAAATTTTCACAATGCTGATTAAATATTA AAGCATTTTATCTTGTGTGCAGCTTCCACCTGCGTTTAACTTCCCAAAATCTCAACTTCAGTGCTATGGTGAATCAGTGT ACTGCACAAATTCAAACTTGCTGAGCAGGTGCAACAGTGGGGAGAATCCAGTGGATAGGTTCACATCTGTTGTAGCATGG AGCATATCTACCACACGCCCTACATCTTTTGGGGTTGCGCCCTACAATCCCACTCTTGGAGAGACACACCATGTTTCCAA TGGCAACCTTAATGTCTTACTGGAACAGGTTTTGGTTTCTCTTTATTTAGTATTTACCTTACTCATTTTGAACTCAACTT TTTCATGCTCAGTTTGGCCACATACAGTATTGCAGGTTTGGATTGCTGTTGTCAGAATTGATTTTAGATAGAATTGATTT TACTAAAATTGATTATGGTAAAAAGTGAGTTGAAAGTGAAGTGATTCGTGTTTGAATACATTTATGACGAAATCTCAATT GATTATGTCAATCACAGAAGCTTAGGATGTGTAGTTTCATTCAAGAGTTGGTTACTTGGTTTTAGGGTTAGGATCAATTT TGAAAGGAAACATTCAAAAAAGGAGAATCAATTCTAACACTGCAAATGTGATAGAACCCTGATATTATTGAGAGATGAAA TGTACAAGATTGCTGAGATATTTGAGAATCTCAGCCACTCTCCCCAAGTCCCAAACACCAAATGATCCAAAGGATACCTA AACCCTCCTCACACCTCCCTTATTTATAGGCTAAGCCCCTACTAACTTACTCTCTAAGTACCTATCAAAATGCAAAACCA TACATGCTCTATGTATTGGGGAATAAGGGCACAAGTCCTGCATCGATCACATGATGCTTTTGATCAGCAGTTATTTAGTT AACTGAACCAATTACTTAACCTAGTTAGTAATCGAAGCTTATTGAAGCTTATCAACTAGAAAATGCACTTAAGAAGTTTC AATAAGTGCTCTTTGGTTTTTATTCAAACAGGTTACATTACTTCTATTTCACATTTTCATTTGTGTATTAAGAGAGAATA TGCTGTACTGTGCTGTTGATCAATGAATCATGAAATTTAATTCTACAGTTCATGATTTCCAGTTCTATTACTATGCCAAT ATTCAGAGTCTCTGACTAACTTTTTACTCAGAACAGTTTAATTACAATTATTGATTAAATTTTTTGGTTTTCATATCCCA AGGTTTCACTTGACCCTCCAGTATCTGCCCTCCATGCAACAGATGAGAAAGAAAACATTGAAATGATATGGTGCCAGCAA CCTATTCCAAAATTTAGAGGTATCTAACTTTTATCAGAAATCATAAGTAACTCAAATTCACAATGACTCATATATAATTC TTCCTCCACACCTAATTAAGCTACTAATTACAATTTGTCTCAACTAATGTTCTGGTTTTCAGTTTGCAACTTTGCATCAT CAGCAAATGTATGTGGTCTAAGAAGATTGTAAATGATAGAATTGATCTGTAATACAGGATCAATTAGTTGAACAGAGTAA CTGAATTAGTTACGTTCAGTTAGGGTAGTTAGGCTGGTTTAGGAGTTAGTTAGAATAGGAAGTTTCAAGTCATCGTGGAC CTGAACTACTTAGTAAGTTAGCATATAATCCATTCTCTAACACTGATGTAATACACTGATTCATTTTCTCATTCTATTCA ACACAATTCATCTTCTCAATAATCTGAATCAAGGAACTAGCTACATGTTATACAAGCTACACCATGTGCAACTAATCAAT CAGCTCAAAATAGAAAACTGATTTAGTTAACTAATTCCTAACAAAGTAACTAACTCCTAACCACATGAGTGATCCACTTA GACATAGGCTAGTTACTAGATGTGAACAGAGATTTAATTTCATGGACATGTTTTTCACATCATGGTTTTACAGTTTTGCC TGACTACTAATCTGGTGTTAATTAAGAGAATGTTCAGCTCAGCTTCTCTTTCTTCAGAATTGATTTTGAAAACCAGAAGT TACTCTCAAAAGCTTCTCTCTTTGATTATGACGTCTGAATCACTTCTAGAATGATATCCAAACACGCACTTAGTGAAGCC TGATCGCTTTTACTTTTGACAGCTTGTTGCAAAAGAACTACAATCGTCCATTCTATCAAGTGCTGCACTTCATAAAAGAA ATATTACAAATACTTATACAAGTCTGCACCTTTCATATGGATTAAATTGGGTGTGTGCACTTCGCTTGTTTCTCATGAGT TATGACCTTATGCCATGATTGAATACAAGCAAAACAATGCTTCTAAATAATGCAGCTAACTGTTAACACAATTTGGAGTC TTATATGCCTCCAGGTATCTAGAGTAATGGTGTGTTTGGATAACAAACTTAATTAAGCATTTATGTCATTAGCGTTTATC ACATAAACGCTTAATAAGATCAAATTAGGTTATAGGTAATAGGTATAAGAACTTATTCATAAGCTAATCTGAGCAGGTTA TAAAAATAAGTGGTAGGTCATGAGCTATTTATATAAAGTCTCCCATTCAATTGCATACACACTTATACTTTAAAATAAGT TCAAATAAGCTATTTGAAACGAGGCTAAGTCTTTTTAACCTGTTTCAAACAAATTTCAAGTTCTATATAATGGCCCTTTA CTAAGCAATCTTCTGTACATTCATCTAAATATCTCAATTAAAATAAATTTGTAGGTACATCTATTGAAGCACAAGTGCAT GGTAAAAGGGTGCTGAAGCTCCTAAATCATGGAGAAACATATGAAATGAATTCTCCTAATCTTTTGATTAGAATTCTTCC TGTTCCTGGGGTTGATTGGGTTGGCAATGTTAATATACGATGCATAGAGACAGGCCTGGAAGCTGAGTTATCCTACAAAA GCCATTCTTATGCAGGACTTGGGGGAAATAGAAGATTGATCAGAGGGAAGATCCTTGACTCATCATCATTGAAAGTTCTA TATGAAGTTGATGGTCATTGGGATAGGTACTGTATCTTTCACTTTAATTTTTTTTTTTAGTGAAAAAATTTCAGTAAAAT ATTAAAGTAAAATCTTGAAATGTGTTTTTCCAAGTCGAAGAGACTCGGGTCTCTTAAACATATGGTCACGGGCTCGATCT CTAGGTTATCAAAAAACGCAGTTGGGAGACATCTCACTTCGGTGCGCGACAGTAGGATCCAGAGAGATTAGTCTCTCACC TATCGTGTGTGAGGATAGTAGGATATTCTAAAAAAGCAAAAAAAAGTAAAATCTTGAACACTCTCAATTTATAAACCACC CAACAATAACGATATCTTCCATACACCTCATTTTTTCTCTATATCTTTTTGTATCACATCTATCGCTTATAGTTATATTT CTTCCTATCACATCTATTAAAATCTTGAAAGTGCAACTCAATTTAAGACATTGAACTGGCTGACACATTAAATTAATGAT GACAAATGACTTAACAAGTTTTTCCTCTTGTAAAAAAAAATACTAACCGAGTCTCATACATGCGACGTGCTTAAATTAGG GTGGTATGGCTTGTCTATTCAAGAATTAACTATTCTACATGGTAGTGACAAACTTCTTATGAAATTTCATTATTCAGAAC TGTGAAAGTAAAGGACACAAATAATGGGGAAGCAAGAGTGATATATGATGCAAAACAAGTCATTTCAGGGCTCAAAGCTC CTATTGTAAAGGACAAAGAGGTAATTAACTTCTGTGCTCTATCTCTGTCATTAATAGATATGAAATTCAGAGGTAACCAA ATGTATTTTTGCACTGAATGCGTTCATAGTACATAAATAGTGACATAATAAAGTGCTCAACCAAATTAAAAAGACAGTTG AGGTTGTACTAACTGTTTAGTATTTTTCTTCATTTATATATATTTTATGAATCATGCTCTCGTAGAATCTTTTTCAAATA AGGAAAATATCTGGATGTGCTTAAAAGATTGTTCACTTATAAAAATGACAGGACTAGTATCAATTTAATTTCTGATAGAT TAAAATTGGTAAATAATTTGTCAATCAAATCATTTCATGCGTCTCCATCCTACACAGTTTAGGTTTTTGGGATAGTTGAA CCATGATATAGTATCATAGTCTGTGACTAAGGGTTATCTACTTATCTAGAGTTTGATATTATTACCGCGTGAATATTTGT GCATTTCTTCGCTCCTTATATTCATGTCAAATTAACTACCACATCTTACTAACTAAAAGAACAAGCTTCTAGTCTCTCAT GGACATTAATCTTGCAAACTTTATCCCTAAAAGTATCATCGATCTCTATAATTTGAAGATTTTAATTAATATGCATGTTT TGAATGTGACTTGAGAAATATGTTTTTGTTGTTCAGAGTGTGTGGGCAACAGAATCAGCCCTTGTGTGGAGTGAGTTGAG CCAAGCCATCATCAACAAAGAGTGGGAGAAAGCCAAGGAAGCAAAGCAAGATGTGGAAGAAAGGCAGAGGAAGATGTCAA TGGAAAGGGACACAAAAGGAGAAAGTTGGGTTCCTAAGAATTTCAGGGTGTCTTGCAGCAGTAAAGAAGGTAAGTGGGAG TGGAACTGTTCACCCATTCATAAATGGGTCCCTGATGCTCCCATTATAGCCCGA 

CDS sequence (LotjaGi4g1v0305100.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGAACGGTCAACGAAGATGAGATTGGTGGAGTTTGGTTGTGTTTTGATTGTTCTGTCTCTTCTTCTGGTTTCTGGGAG CGCTGAGGTTTACATAGTAACTGTTGAAGGTGAGCCTATCATCAGTTACCGTGGAGGAATTGATGGGTTTGAAGCTACTG CTGTGGAATCTGATGAGAAGATTGACACCACAAGTGAATTGGTTACTTCTTATGCTCGTCATCTTGAAAAGAGACATGAC ATGATTCTGGGGATGCTGTTTGAGCAAGAGACATACAAGAAGCTCTACAGCTATAAACATCTTATAAATGGGTTTGCTGT TCATATTTCCCCAGAACAGGCAGAAACTCTAAGACGTGCTCCTGGAGTGAAATCTGTTGAGAGGGACTGGAAAGTGAGAA AACTGACGACACATACCCCGCAATTTTTAGGCCTTCCAACCGGGGTATGGCCGACAGGAGGCGGCTTTGATCGGGCTGGA GAAGACATTGTGATAGGATTTGTGGACTCAGGGATCTATCCCCACCACCCCAGCTTTGCGACTCATAATACCGAACCGTA TGAGCCGGTTTTGAAGTATAGAGGAAAATGCGAAGTTGATCCGGATACTAAAAGAAATTACTGTAATGGGAAGATTGTCG GAGCACAACACTTTGCTCAAGCTGCAATAGCTGCTGGGGCATTTAACCCTTCAATTGATTTTGCATCTCCTTTGGATGGG GATGGACACGGAAGTCACACAGCCTCTATTGCAGCTGGAAATAATGGAATCCCTGTAAGATTTCATGGCCATGAATTTGG GAAAGCAAGTGGGATGGCTCCTCGTGCCAGGATTGCTGTGTACAAGGCCCTCTATAGACTGTTTGGAGGGTTTATTGCCG ATGTAGTTGCTGCAATTGATCAGGCTGTATATGATGGAGTGGATATACTCAGCCTTTCAGTTGGACCCAACAGTCCTCCA ACAGCCACAAAAACTACATTTTTGAACCCTTTTGATGCTACACTTCTTGGAGCTGTGAAAGCTGGTGTATTTGTTGCACA GGCTGCTGGAAATGGCGGTCCATTTCCTAAGACAATGGTTTCATATAGTCCATGGATAACATCTGTAGCAGCTGCAATTG ATGATCGTAGATATAAAAACCATTTGACCCTTGGGAATGGAAAAATCTTAGCTGGAATCGGGTTATCACCTTCTACACAT TTAAACCAAACATACAAGTTGGTTGCTGCAAATGATGTGCTGCTAGATTCTTCACTTATTAAGTACAGCCCCACAGATTG CCAGAGACCAGAAGTTTTAAACAAGAAATTGATAGAGGGAAATATTCTTCTCTGTGGATATTCTTTCAACTTTGTTGTTG GTACTGCATCAATCAAGAAAGTCTCAGAAACAGCAAAGACCCTTGGGGCTGCTGGATTTGTTCTCTGTGTTGAAAACGTT TCCCCGGGAACTAAATTTGATCCTGTTCCTGTTGGCCTTCCCGGAATTCTTATCATAGATGTCAGCAATTCGCAGGAACT TGTAGATTATTATAATATCTCTACACCAAGAGACTGGACTGGACGGGTGAAGAGTTTCATAGGTACAGGTAAAATTGGCG ACGGCTTGATGCCTATCCTTCATAAATCTGCACCACAGGTGGCATTGTTCTCCGCTAGAGGGCCAAATATAAAGGACTTC AGCTTCCAAGAGGCAGATCTTCTCAAACCCGATATATTAGCTCCTGGTTCATTGATTTGGGGTGCTTGGTCTCTAAATGG AACTGATGAGCCAAATTATGTTGGTGAGGGTTTTGCCATGATATCTGGAACTAGCATGTCCGCACCACATATAGCTGGAA TTGCTGCTCTTATAAAGCAGAAACATCCACAATGGAGCCCTGCCGCCATTAAATCAGCCTTGATGACAACATCAACAACT CTAGACAGAGCAGGGAATCCTCTTCTAGCCCAGAAAACTTCTGAAACAGAAGCTATGAAGCTGGTCAAAGCCACTCCTTT TGATTATGGGAGTGGGCATGTTGATCCAAGAGCTGCCTTGGATCCTGGTCTCATCTTTGATGCAGGATACGAGGATTATC TCGGCTTCTTATGCACAACACCAGGCATTGACGTTCATGAGATAAAGAACTACACTCATGTGCCATGCAACACTACCATG GGTAAACCATCAAATTTAAACACCCCTTCTATCACAATTTCCCATCTTGCGGAACCTCAAGTTGTCACCCGCACGGTCAC GAATGTTGCTGAGGAAGAAACCTACGTGATCACAGCCAGAATGGAACCAGCTGTTGCCATTGAAGTCAACCCTCCTGCAA TGACTATCAGAGCAGGTGCATCGCGTAAGTTTTCTGTGACACTCACGGCTCGATCAGTTACAGGAAGCTATAGTTTTGGC GAGGTTGTAATGAAAGGGAGTAGAGGGCATAAGTCATCTGCAATGGAGGATAGATCACTGAAGAATTTTCAAAAGCTGTT GCTTCTCTCATTAAAACACAATTTCTTACTAATGTGA 

Protein sequence (LotjaGi4g1v0305100.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MERSTKMRLVEFGCVLIVLSLLLVSGSAEVYIVTVEGEPIISYRGGIDGFEATAVESDEKIDTTSELVTSYARHLEKRHD MILGMLFEQETYKKLYSYKHLINGFAVHISPEQAETLRRAPGVKSVERDWKVRKLTTHTPQFLGLPTGVWPTGGGFDRAG EDIVIGFVDSGIYPHHPSFATHNTEPYEPVLKYRGKCEVDPDTKRNYCNGKIVGAQHFAQAAIAAGAFNPSIDFASPLDG DGHGSHTASIAAGNNGIPVRFHGHEFGKASGMAPRARIAVYKALYRLFGGFIADVVAAIDQAVYDGVDILSLSVGPNSPP TATKTTFLNPFDATLLGAVKAGVFVAQAAGNGGPFPKTMVSYSPWITSVAAAIDDRRYKNHLTLGNGKILAGIGLSPSTH LNQTYKLVAANDVLLDSSLIKYSPTDCQRPEVLNKKLIEGNILLCGYSFNFVVGTASIKKVSETAKTLGAAGFVLCVENV SPGTKFDPVPVGLPGILIIDVSNSQELVDYYNISTPRDWTGRVKSFIGTGKIGDGLMPILHKSAPQVALFSARGPNIKDF SFQEADLLKPDILAPGSLIWGAWSLNGTDEPNYVGEGFAMISGTSMSAPHIAGIAALIKQKHPQWSPAAIKSALMTTSTT LDRAGNPLLAQKTSETEAMKLVKATPFDYGSGHVDPRAALDPGLIFDAGYEDYLGFLCTTPGIDVHEIKNYTHVPCNTTM GKPSNLNTPSITISHLAEPQVVTRTVTNVAEEETYVITARMEPAVAIEVNPPAMTIRAGASRKFSVTLTARSVTGSYSFG EVVMKGSRGHKSSAMEDRSLKNFQKLLLLSLKHNFLLM 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 11 11 -
Phobius 1 28 28 -
SignalP_EUK 1 28 28 -
TMHMM 12 34 23 -
PANTHER 12 799 788 0.0
PANTHER 12 799 788 0.0
Phobius 12 23 12 -
Phobius 24 28 5 -
Phobius 29 838 810 -
Pfam 30 133 104 4.2E-20
Gene3D 61 135 75 1.2E-7
SUPERFAMILY 92 133 42 3.29E-6
ProSiteProfiles 129 680 552 27.409
SUPERFAMILY 135 684 550 1.57E-73
CDD 136 639 504 3.80388E-123
Pfam 160 670 511 4.2E-47
PRINTS 160 179 20 1.4E-16
Gene3D 162 694 533 7.0E-143
ProSitePatterns 165 176 12 -
PRINTS 239 252 14 1.4E-16
Gene3D 375 540 166 7.0E-143
CDD 382 520 139 3.0979E-13
PRINTS 602 618 17 1.4E-16
ProSitePatterns 603 613 11 -
Gene3D 697 814 118 1.2E-12
Pfam 725 806 82 2.4E-13

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Serine-type endopeptidase activity Catalysis of the hydrolysis of internal, alpha-peptide bonds in a polypeptide chain by a catalytic mechanism that involves a catalytic triad consisting of a serine nucleophile that is activated by a proton relay involving an acidic residue (e.g. aspartate or glutamate) and a basic residue (usually histidine).
Biological process Proteolysis The hydrolysis of proteins into smaller polypeptides and/or amino acids by cleavage of their peptide bonds.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi4g1v0305100.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…