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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0386800 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0386800.2 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Calpain, putative; TAIR: AT1G55350.1 calpain-type cysteine protease family; Swiss-Prot: sp|Q8RVL2|DEK1_ARATH Calpain-type cysteine protease DEK1; TrEMBL-Plants: tr|V7CN28|V7CN28_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0386800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:76528002..76556202) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GAAGAAGAAGGGGGTGACCATGGGGTTCTCCTGGCTTCTGCGATTTGCGGGACCCTCTTCTCGGGTTTGGCTGCGGCTTC TTTCTCCATACTCTGGGCTGTCAATTGGAGACCCTGGCGAATTTATAGGTAAAACTAAAACCCCTTTCCATTATTTTCTC AATTTCTGTTTATAATTCAGCTATGTTGTGTAGTTTTAAGGTTTAATTATCATGATACACTGCAAATGCTGTTGAATTGT TTGTTATGATTGGTAATTAAATTCATACTTGTTTTGAAATTAAATGAAATTTACTGGCATTGGCTGCTTTAGGGTACTCC TGTTGTTAGTGACAATTTAATTTGGGAAATAACTTAAATTGTCAGGGGGGACTCTCTGGATTTTTGGATATTCTATGGAT TATAACTGTTTGGCTCCGGTCTTGAATTATGAGCAGTTTGATTTTTGATAACTTGAAAGAGATTCTATACACTGGTATTT ACGGTCGTATCGCGATCTTGATCTTTATAATCTCGAGTGTTTTTCATTTTTGCTTCTTTTTAAATTATTTTGTGGGATTC CACGTGGAGATCGTTTGCTGATGTGACGGATGCCAAATGTAAGATGAGCAGCAAACCGGAAACGTTCAATTTTTGGTATA TTTATGGTTATTGTAGAAGACAACCTTATCTGTCGATGTCTTATACTAAAGCATCAAAATTATTAGAATTTGGTTTACAA TTTTACCATAGTTATATGTATTAGGCTTATAATTTTATGATGGATGCTTGAACTTTGAATATTAAGTAACAATTGACGAA AACCCAAAAGTGCTCATGAGATGTCAACATTAGGGTTTTTTTTTGGGTTTCTACATCTGAAACATAATGAAAAGGTCTGT TGTAGTAAAACCCCCGGCTTCTTTGCACTTTCCACGCCTTCTCTGTCCCAGACTCCGAGCTGATCTATTGTTGAGTGACC 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ATCTATCCATCCGAGATGCGTCATTCTGTTCATGGTCAATGGCGTGGCTATAGTGCTGGGGGTTGTCAGGATTATGACAC ATGGAATCAAAATCCACAGTTCAGACTGACTGCAACTGGTCAAGATGCATCACATCCAATTCATGTATTCATTACATTAA CTCAGGGTGTGGGATTTTCAAGAACTACTGCTGGTTTCAGAAACTACCAATCCAGTCACGACTCACTGATGTTCTACATT GGAATGAGGATACTCAAAACACGTGGCCGGCGTGCTGCGTACAATATATACCTACATGAATCAGTTGGTGGGACAGACTA TGTTAACTCTCGAGAAATATCCTGTGAAATGGTTCTGGAACCTGAGCCTAAGGGATACACTATAGTCCCTACTACTATAC ACCCTGGGGAAGAAGCACCCTTTGTACTTTCTGTTTTCACCAAGGCATCAATAAATCTGGAAGCTTTGTAG
Protein sequence (LotjaGi4g1v0386800.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MVLIIWGSWLIVILNRDLIGLAVIMAGTALLLAFYSIMLWWRTQWQSSRAVAILLLLAVALLCAYELCAVYVTTGSRASD RYSPSGFFFGVSAIALAINMLFICRMIFNGNGLDVDEYVRRAYKFAYSDCIEVGPVACLPEPPDPNELYPRQSRRASHLV LLYLGSVFVLVVYSILYGLTAKEKNWLGAITSVAVIVLDWNMGACLYGFQLLNKRVTVLFIAGTSRVFLICFGVQYWYLG HCISYAVMASVLLGAAVSRHLSVTNPLAARRDALQSTVVRLREGFRKKEQNSSSSFSEGCGSSLKRSSSVEAGNLGNGTE TARGMTAGDGSNGNNAMSQTANLPDGINSDKSIDSGRSSLALHSSSCRSAVHEPEVATSSNDRNLDHNNSLVVCSSSGID SQGNDSSASNSANQQTLDFNLALAFQERLKDPKIATMLKRRTRHGDIELSSLLQDKGLDPNFAMMLKEKSLELDPTILAL LQRSSLDADRDHQQNTDNTSVDNAIPHQISLSEELRLHGLEKWLQLCRLVLHHITGTPERAWVLFSFIFVLETVTVAIFR PKTIKIINATHQQFEFGLAVLLLSPVICSIMAFLRSLTAEETTMTSRPRKYGFIAWLLSTCVGLLLSFLSKSSVLLGLSL TVPLMVACLSVAVPIWICNGYQFWVPRVNCTGSAGNDRIPRTKGIVLIFCMSVFVGSVLALGAIVSAKPLDDLRYKGWNG DQKSLVSPYTSSVFLGWAMASAIGLVVTSALPIISWFATYRFSLSSAILVGISAVILVAFCGVSYLEVIKSREDQVPTKG DFLAALLPLICIPAVLSLCCGLLKWKDDDWKLSRGVYIFVIIGLMLLLSAISALIVVVKPWTIGVAFLLVLLLMVLAIGA IHYWASNNFYLSRKQMVFVCLLAFLLALAAFLVGWFEDKPFFGASVGYFIFLFLLAGRALTVLLSNPIVVYSPRVLPVYV YDAHADCGKNVSVSFLMLYGIALATEGWGVVASLKIYPPFAGAAVSAITLVVSFGFAVSRPCLTLKMMEDAVHFLSKETV VQTIARSATKTRNALSGTYSAPQRSASSAALLIGDPTAMLDRAGNFVLPRADVMKLRDRLRNEELVAGSFFSRLRYGRTF RHDPTSDVDHRRVMCAHARILALEEAIDTEWVYMWDKFGGYLLLLLGLTSKAEQAQDEVRLRLFLDSIGFSDLSAKKIKK WMPEDRRQFEIIQESYIREKEMEEEILMQRREEEGRGKERRKVLLEKEERKWKEIEASLLSSIPNASSREAAAMAAAVRA VGGDSVLDDSFARERVSSIARRIRASQLARRALQTGVTGAICVLDDEPTASGRHCGPIDSSLCQSQKISFSIALMIQPES GPICLLGTEFQKKVCWEILVAGSEQGIEAGQVGLRLITKGDRHTTVAKEWSIGATSIADGRWHIVTMTIDADIGEATCYL DGGFDGYQNGLPLCVGSSIWEQGTEVWIGARPPTDIDAFGRSDSEGVESKMHIMDAFLWGRCLTDDEVSALYTSVASADI SALDFPEDNWQWAESPSRADGYDSDPADVDLYDRDDVDWDGQYSSGRKRRSERDGVVLDVDSFSRKYRKPRIETQEEINQ RMLSVELAVKEALLARGEICFTDQEFPPNDHSLFLDPENPPAKLQVVSKWLRPGEIARQNNLDCHPCLFSGSPNPSDVCQ GRLGDCWFLSAVAVLTEVSRISEVIITPEYNEEGIYTVRFCVQGDWIPVVVDDWIPCESPGKPAFATSKKGYELWVSILE KAYAKLHGSYEALEGGLVQDALVDLTGGAGEEIDMRSGEAQIDLASGRLWSQLLRFKQEGFLLGAGSPSGSDVHISSSGI VQGHAYSILQVREVDGHKLVQIRNPWANEVEWNGPWSDSSPEWTDRIKHKLKHVSQSKDGIFWMSWQDFQIHFRSIYICR IYPSEMRHSVHGQWRGYSAGGCQDYDTWNQNPQFRLTATGQDASHPIHVFITLTQGVGFSRTTAGFRNYQSSHDSLMFYI GMRILKTRGRRAAYNIYLHESVGGTDYVNSREISCEMVLEPEPKGYTIVPTTIHPGEEAPFVLSVFTKASINLEAL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 17 | 17 | - | – | |
| TMHMM | 18 | 40 | 23 | - | – | |
| Phobius | 18 | 41 | 24 | - | – | |
| Phobius | 42 | 52 | 11 | - | – | |
| Phobius | 53 | 74 | 22 | - | – | |
| TMHMM | 53 | 75 | 23 | - | – | |
| Phobius | 75 | 85 | 11 | - | – | |
| TMHMM | 85 | 104 | 20 | - | – | |
| Phobius | 86 | 108 | 23 | - | – | |
| Phobius | 109 | 159 | 51 | - | – | |
| TMHMM | 159 | 181 | 23 | - | – | |
| Phobius | 160 | 180 | 21 | - | – | |
| Phobius | 181 | 185 | 5 | - | – | |
| Phobius | 186 | 209 | 24 | - | – | |
| TMHMM | 187 | 209 | 23 | - | – | |
| Phobius | 210 | 215 | 6 | - | – | |
| Phobius | 216 | 237 | 22 | - | – | |
| TMHMM | 216 | 238 | 23 | - | – | |
| Phobius | 238 | 242 | 5 | - | – | |
| TMHMM | 243 | 262 | 20 | - | – | |
| Phobius | 243 | 261 | 19 | - | – | |
| Phobius | 262 | 540 | 279 | - | – | |
| MobiDBLite | 290 | 359 | 70 | - | – | |
| Phobius | 541 | 559 | 19 | - | – | |
| TMHMM | 542 | 561 | 20 | - | – | |
| Phobius | 560 | 578 | 19 | - | – | |
| TMHMM | 576 | 598 | 23 | - | – | |
| Phobius | 579 | 599 | 21 | - | – | |
| Phobius | 600 | 610 | 11 | - | – | |
| TMHMM | 611 | 628 | 18 | - | – | |
| Phobius | 611 | 629 | 19 | - | – | |
| Phobius | 630 | 634 | 5 | - | – | |
| Phobius | 635 | 657 | 23 | - | – | |
| TMHMM | 643 | 665 | 23 | - | – | |
| Phobius | 658 | 684 | 27 | - | – | |
| Phobius | 685 | 705 | 21 | - | – | |
| TMHMM | 685 | 707 | 23 | - | – | |
| Phobius | 706 | 733 | 28 | - | – | |
| Phobius | 734 | 757 | 24 | - | – | |
| TMHMM | 735 | 757 | 23 | - | – | |
| Phobius | 758 | 763 | 6 | - | – | |
| Phobius | 764 | 786 | 23 | - | – | |
| TMHMM | 764 | 786 | 23 | - | – | |
| Phobius | 787 | 801 | 15 | - | – | |
| TMHMM | 801 | 823 | 23 | - | – | |
| Phobius | 802 | 823 | 22 | - | – | |
| Phobius | 824 | 834 | 11 | - | – | |
| Phobius | 835 | 857 | 23 | - | – | |
| TMHMM | 836 | 858 | 23 | - | – | |
| Phobius | 858 | 862 | 5 | - | – | |
| TMHMM | 863 | 885 | 23 | - | – | |
| Phobius | 863 | 884 | 22 | - | – | |
| Phobius | 885 | 895 | 11 | - | – | |
| Phobius | 896 | 916 | 21 | - | – | |
| TMHMM | 897 | 916 | 20 | - | – | |
| Phobius | 917 | 927 | 11 | - | – | |
| TMHMM | 920 | 942 | 23 | - | – | |
| PANTHER | 921 | 2072 | 1152 | 4.1E-215 | – | |
| PANTHER | 921 | 2072 | 1152 | 4.1E-215 | – | |
| Phobius | 928 | 950 | 23 | - | – | |
| Phobius | 951 | 970 | 20 | - | – | |
| Phobius | 971 | 990 | 20 | - | – | |
| Phobius | 991 | 995 | 5 | - | – | |
| TMHMM | 996 | 1018 | 23 | - | – | |
| Phobius | 996 | 1018 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1019 | 2076 | 1058 | - | – | |
| Gene3D | 1339 | 1519 | 181 | 1.0E-10 | – | |
| SUPERFAMILY | 1349 | 1514 | 166 | 3.7E-13 | ||
| SMART | 1605 | 1928 | 324 | 4.5E-89 | ||
| SUPERFAMILY | 1613 | 1929 | 317 | 1.26E-104 | ||
| ProSiteProfiles | 1620 | 1922 | 303 | 62.494 | ||
| CDD | 1621 | 1920 | 300 | 3.14136E-113 | ||
| Pfam | 1621 | 1920 | 300 | 9.9E-87 | ||
| PRINTS | 1680 | 1696 | 17 | 8.0E-35 | ||
| ProSitePatterns | 1680 | 1691 | 12 | - | ||
| PRINTS | 1743 | 1766 | 24 | 8.0E-35 | ||
| PRINTS | 1768 | 1795 | 28 | 8.0E-35 | ||
| Gene3D | 1799 | 1928 | 130 | 1.2E-35 | – | |
| PRINTS | 1898 | 1919 | 22 | 8.0E-35 | ||
| SMART | 1924 | 2074 | 151 | 4.4E-40 | ||
| CDD | 1926 | 2076 | 151 | 8.27338E-37 | ||
| SUPERFAMILY | 1928 | 2074 | 147 | 6.8E-29 | ||
| Gene3D | 1929 | 2076 | 148 | 1.8E-29 | – | |
| Pfam | 1932 | 2069 | 138 | 3.8E-18 | ||
| PRINTS | 2040 | 2068 | 29 | 8.0E-35 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity | Catalysis of the hydrolysis of nonterminal peptide bonds in a polypeptide chain by a mechanism using a cysteine residue at the enzyme active center, and requiring the presence of calcium. | ||
| Biological process | Proteolysis | The hydrolysis of proteins into smaller polypeptides and/or amino acids by cleavage of their peptide bonds. |
Expression pattern of LotjaGi4g1v0386800.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
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