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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0062500 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0062500.1 |
| Related isoforms 12 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Transcriptional corepressor LEUNIG; TAIR: AT4G32551.1 transcriptional corepressor LEUNIG; Swiss-Prot: sp|Q9FUY2|LEUNG_ARATH Transcriptional corepressor LEUNIG; TrEMBL-Plants: tr|V7CVF3|V7CVF3_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0062500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:10513449..10535207) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CCCTTCAATATTTCTTCCCAAATTCTCTGCTTTTCCCTTGAAGTCGTGTTCCTCTGGCTTCGCTTTCTACCGTTCCCTTT TCTCATGCTTCTTTGTCTTTCTGCTACGAGATAAACTCTTGTGTTTGCCGATTGTTACTGCTCAGTTTCCTAGACTTTGA AACCTTCACAACCTCGTTCATTCCCTCACCACCGTTCAAGCTCGTTGTGTCAGAATGTCTCAGACTAACTGGGAAGCTGA TAAGATGTAAGTGTTTTTTGCTTTGTGTTTATTTTTTTTTATATTTTCTATTGAATCTTGGTGTTTTAATCAGTTTTGGA ACATGGGTTTTTGTTCTTACTCAGAATCTTTGCTTTCTTTTGTTGATTTGGGTTCTGGGTTTGTGGTTTTTCGTTTAATG GTGTTTTAGGTTGGTTTATTTTCCTGGGTTTGGTTTTATATGTGTTAGGTTTTCATGAAAATTTTGATGTGTGTTAGGGT TTTTGAGGCTATGCTAGTATAAGGGGTTGCTTTGCATTGAATGAAAATTTCACTTTTAATTGCTGAACTCTTGGTTCCTG CATTTTTTGTTGATTTGGGTTCTGGGTTTGTGGTTTTTCATTTAATGGTGTTTTAGGTTGGTTTATTTTCTTGGGTTTGG TTTTCATGTATATTTGAGAATATTTTGATGAGTGTGTTAGGGTTTTTTAGGCTATGCAAGTATAAGGAGTTTCTTTGCAT TGAATGAAAATTTCACTTTTAATTGTTGAACTCTTGGTTCCTGCATTTGGGTTTGCTGATATTTATGGTCACGAGATATA CTCAGTGTAAAGATCTAAACTTTGATTCTAACAGTTCAATTGCTTATGCAACCTGTGTTTGCTTGTGCTATGGGATTTCA GGTTAGATGTTTACATCTATGATTACCTAGTGAAGAGGGATTTGAAGGCTTCGGCTCAAGCTTTTCAAGCTGAAGGGAAA 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GTTTGAAAAAATGCGAATTGTAAGCTATCGGTTACTCGAATATGTCTAGCCAAGATATATTATCATGGTGAAAGATTTAT ACTGATCCTTTATGAAGATTGCATTTGCTGTTGCACAAAGCAAATAGGCAACGTGGTTGTTTCTACTGGAGAGAGGTCTT ATAAGAAGAAACACTAATTATACTTTCAATAAGAATAAAATACTTCTGACACTCCTGTATATATTTCCAAACAATTTTGT ACTTCAACTGTAATGGTATATACTCTATTAATTTCTCTACATAAAGCATTGCTGATTTTACTGTTTTGAATGTGGCACCA TGATTGTAGGGTCATACAAACTCTATACATTCTGTGTGTTGGGATCCTTCTGGGGAGTTTCTGGCATCTGTCAGTGAAGA CTCTGTCAGGGTCTGGACTCTTGGAACAGGGGGTGAAGGGGAATGCGTTCATGAGCTTAGCTGTAATGGCAATAAATTTC ACTCATGTGTTTTCCACCCAACGTATCCTTCAATGCTGGTCATTGGTTGTTACCAGGCAAGTCTATATCCATTCTTAGTT TCATTTCCATTTTGAGCATTGATAGAATCGCAAATTTTTGAAATTGATTTCTTTATTTGCAAAATTAGAGGAATTGGTTT GGTCTTGATTGGATTCAAGTCATGTATTTACAGTTTAGAAATGTGCATGATTTTGTTGGGTTTGAGTGCATTTGATTTGA TTTAGTTATTTAATTGACAATTTAACCTTTATCAGTGCACCCACCTCATCTGTTCTAAGTTGGGAACAGTAAAATCTTCA AAACAAAATGATTTCGTTTCACCTTCTTGGTGTTCCAAATATGGTGATTGTTTTGCAAATCAATTGATTTCATACTTTTG TATTGAATGAGAACTGATTTCTAGCAACTGCGGCAATCAAAGCCTTTCCCATAGGTGAAATCGGCTACATGGAATAACTG GTGCCATAATGCCTTCTTATGAATCCAGTTCAACCCTTTGCAATCCCTATAAATTCTTCGTCACTAGCACCCTTGGCTGC GTCCTTTGAAATGCTTCACCATCTTGATTATTCTTATTCTTCAAGTATCCCTGGAATTCTTTTCCGAACACTTGGACATT TATGACGAGCTGTTAGGGTTAGATTAACCCAAACAGCCAACCAACAAAAGAATAGGGATAAAAGGGTAATTGTCTGAATA AAAATACTGAATCTATTATTAAAATAGAAACCCAAGGGGCTCGAGTTGAAGAAATGAACATGGTCTAAAAGAACTAAGGC AATGAGGAGAAGAGTTGGTTGAATGATGTGTGTTCATGGAAGCTCGAATGCGGAGCCAAGAGACTGCAGTGCAAGAGATA TTGCTGCAGCAAGAGGAGCTTCAACGAGAATACGAAAACAGGGACTGAAGTAAGTGGGAGAAGCATAAATTTCCGCAGGT ATAATATGCTGAATATCAGGAAAGGAGGAAGAAGGGCTTATGTTTTAAATGTGATGAGTTCTCACTTAGGCATGACTGCA TGAGTGCAAGATTAAGCAGTTAAGGGTCATACATGGTATTAGAGGAAGATCTTGTAGACCAAAGAGATGAATTGGAGGGT GAGTAGGAAATCATAGAATAGGGAGTGATACCAGCTCAACTCGATTTGCATAGTATAGCATGGCTGACCAGTAAAAATTC CTTAAAATTGTGGGGTCAATTGTGTGATCCGAAGGATGCCTCACATAACTTATTTTTCATAAGCTAGTTGAGAATCTGTA GTTGCTGTAGGAAAAAACCTCTCAGTATTTGGTTAAGGTTGGCGATGGCTATAATGTGAATGCAAATGGGGTTTTTAGAG ATCTAAATCATGACACCTTGATATATTTGGATCACAATCTTCAGTTACTACGCAGAAATCTCACCCATCAAAATAATTTA AAATCTTTGTAAATATGGTTTAGGTTGATGTGAGCCATCGGATTACAACTTCATCACCCTGCAGTTATTTAATTACTCTA GGGGATCTAAGTCCTATCTATTTTATTCTCTGGTGTTTCATTTAAATACACGCTAATTCATTCAATGTCTTTCTTTTGCT GTATCAATTGTAATTGTTATTTTGATGCGGCTTCTCTTTAGAATTCTGATCTTCTGATTATATTTTTTACCGAATAATAG TAATTAAATGTTATCCTTGATATTGATGTAATTTTGACCTGTTTCAATTTGTTGTACCATTATTGCAGTCATTGGAACTC TGGGACATGACCGAGAACAAGACAATGACTCTGTCTGCTCATGAAGGTCTAATTGCTGCATTGGCAGTTTCAACTGTAAA TGGTTTGGTTGCTTCAGCCAGTCATGACAAGTTTGTCAAGCTCTGGAAGTAACCTGTCTGCCTCTGCAAAACAGGTAGTT TTATCAGTGTTGATCGCAGATTTGGATTTCCTGCTGTAAAAAAATCCCTAAAGCCGCTGTAGTCATGGCTTCATAGCCAT CCGATCTTTAATTAGACGGTTTAAATTTATAAAGACCAATTGTGTATGATTGTCATTTTAAATCCCAACGATTCGATCTT GATTCGACGACTACCAAAATGACTTCAGAAAGTTTTGACTGCATGGAATCCGGATCTGTTGATCACATGACCTTTTATGT TGTATGGTAAATTAACCTATAGAGATCTCTGTTTCATTATTGTTTACTTAGAGATCTCTGTTCTTGTATCATCTACATTG GCTATTTATAATACCATTCGGTGAGTGCTGATCCAGTTTCAGGCAGAACCCATGTCTGCAGCGACAACCTAAAAGTGGGA AAATTCAAACGTGCAAACGTATTTATTTATTACTATATCTTTTTATTTGTGTTGTCGTTTTAGATGTAAATAATGGTTCT CTGAAAGATGAATCAGTACTTATTAACCAGAATAATGTTTGGTTGACACTCCAAACACTTGCACCAAGTAAGATAAATGT GAGATGTGATAAATGATGTAATAAGAATAAAAGAGAAAGATAAGAAGAGTCAGTGAGTAGAAATGAGATAGAAGATAATG TGAAAGTGCGAATCAATCAATACTCTCGAGTTTGATCAGTGTAACTCATCATCAAGTTTGCATAGACCACAAACATAAGC TTAACATTTGATAATAATATTCCAATGTCTTGCACCTAGGATCGACTAAACTGAGACCTATAAGAGTCGGCCTATATGAC CGATACTATTTTTAAGAATTCACGTCGGCCGAAGTGCGAAGTGAGTTACGTCGCCTTAGAGTACCAATGCTAGACTTTGT GTTTGCCACAACTTCATTTCGTCTAATGTCATCCATGACACAAACAATAAATTAGATTTAAAATCGGTTTTTACCTTATT AGTATTTACTTTTGACCGACCTTAATAACTGTTTTTCTTGTAGTTTCGTCAAAACTACAAAGTAAAAGTTGAGGTGACTA GTTGAAACATAACTCTTGCGTAATTAGTGGGGAAGGATCATTTCTTTAACAAATTGCACATCTCGATATTGTTTCACAA
CDS sequence (LotjaGi5g1v0062500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTCTCAGACTAACTGGGAAGCTGATAAGATGTTAGATGTTTACATCTATGATTACCTAGTGAAGAGGGATTTGAAGGC TTCGGCTCAAGCTTTTCAAGCTGAAGGGAAAGTGTCCTCGGACCCTGTTGCTATTGATGCCCCGGGAGGATTTCTGTTTG AGTGGTGGTCAGTTTTCTGGGACATATTTATTGCCAGGACTAATGAGAAGCATTCAGAGGTTGCTGCATCTTACATTGAG ACACAACTAGTTAAGGCTAGGGAGCAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACA ACAACAACAACAACCACAACCTCAGCAGTCACAACATCAGCAACAACAACATCAGCAACAACAACAGCAACAACAGCACA TGCAGATGCAGCAGATGATGTTACAAAGGCATGCTCAGCAGCAACAGCCGCAACATCAACAGCCACCACCTCAACAACAG GGTAGGGATAGGTCTCATCTCTTAAATGGTGGTACTAATGGGTTAGTTGGAAACGCTAGCACTGCAAGTGCATTAGCAAC AAAGATGTATGAGGAAAGGTTAAAACTGCCCCTTCAAAGGGATTCTTTGGAAGATGCAGCAATGAAGCAGAGATTTGGAG ACCAACTCTTGGACCCAAATCATGCCACAATATTGAAGACATCTGGAGCTACTGGCCAGCCTTCAGGGCAAGTTTTGCAT GGTGCTGCTGGTGCGATGTCTCCACAAGTTCAAGCTCGTAGTCAGCAATTACCTGGGTCTACTCTGGATATAAAAAGTGA GATTAATCCTGTTTTAAATCCCAGAGCAGCGGGTCCTGAAGGATCATTGATAGCAATTCCTGGATCTAACCAAGGTAGCA ACAATTTGACTTTGAAAGGGTGGCCACTCACAGGGTTGGAACAACTACGTTCTGGTATGCTTCAGCAACAAAAACCTTTT ATACAGTCTCCTCAACCTTTTCATCAACTTCCGATGTTGACGCCACAACATCAACAACAGCTTATACTAGCACAACAAAA TTTAGCATCACCATCTGCCAATGATGACAATAGAAGACTCCGAATGCTACTAAATAATAGGAATATGGGTGTAAGTAAGG ATGGTCTTTCAAATCCTGTGGGTGATGTAGTATCAAATGTTGGATCACCTCTTCAAGCAGGTGGCCCTCCTTTTCCTCGT GGCGATACAGATATGTTAATGAAGTTGAAACTGGCTCAGTTTCACCAACATCAGCAGCAGAACGCCAATTCACAGCAGCA GCAACTTCAACAGCATGCTCTTTCAAATCCGCAATCTCAGACTTCAAATCTTAACATGCATCAGCAGGATAAAGTAGCGG GAGGCAATGTCAATGTCGATGGTAGCATGTCAAACACCTTTAGAGGAAATGATCAGGTTACCAAAAACCAGACTGGTAGA AAGAGAAAACAGCCCGTATCTTCCTCTGGTCCTGCCAATAGCTCAGGAACAGCAAATACGGCAGGCCCATCTCCAAGTTC AGCACCCTCAACGCCCTCAACGCATACAGCTGGTGATGTGATGTCAATGCCTGCTCTACCTCATAATGGTAGCTCATCAA AGCCATTAATGATGTTTGGCACTGATGGCACCGGAACTCTTACCTCACCTTCCAATCAATTGGCTGATGTGGACCGTTTT GTTGAGGATGGATCTCTTGATGACAATGTGGAGTCTTTTTTATCCCATGATGATACAGACCCTAGAGATAATGTTGGTCG TTGTATGGATGTAAGCAAAGGATTCTCATTTTCGGAAGTAAATTCTGTACGCGCAAGTACAAACAAAGTTGTCTGTTGCC ATTTCTCATCTGATGGGAAATTGCTTGCAAGTGGTGGTCATGATAAAAAGGCTGTTTTATGGTACACAGATTCTCTGAAG CAGAAGGCTACTCTTGAAGAGCATTCATCTTTAATCACCGATGTCCGTTTCAGTCCAAGCATGCCTCGTCTCGCAACATC TTCATATGACAAAACTGTTAGGGTTTGGGATGTTGACAATCCTGGCTATTCGCTTCGTACCTTTACAGGACATTCTGCAT CTGTTATGTCACTAGATTTTCACCCTAATAAGGACGACCTTATCTGCTCTTGTGATTTTGATGGCGAGATACGATATTGG AGCATTAATAATGGCAGTTGTGCTAGAGTGTCCAAGGGTGGTACTGCACAGATGAGATTTCAACCTCGTCTAGGGAGGTA CCTTGCTGCAGCTGCAGAGAACGTTGTTTCTATATTTGATGTGGAGACACAAGCATGCCGATATTCACTAAAGGGTCATA CAAACTCTATACATTCTGTGTGTTGGGATCCTTCTGGGGAGTTTCTGGCATCTGTCAGTGAAGACTCTGTCAGGGTCTGG ACTCTTGGAACAGGGGGTGAAGGGGAATGCGTTCATGAGCTTAGCTGTAATGGCAATAAATTTCACTCATGTGTTTTCCA CCCAACGTATCCTTCAATGCTGGTCATTGGTTGTTACCAGGCAAGTCTATATCCATTCTTAGTTTCATTTCCATTTTGA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0062500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSQTNWEADKMLDVYIYDYLVKRDLKASAQAFQAEGKVSSDPVAIDAPGGFLFEWWSVFWDIFIARTNEKHSEVAASYIE TQLVKAREQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQPQPQQSQHQQQQHQQQQQQQQHMQMQQMMLQRHAQQQQPQHQQPPPQQQ GRDRSHLLNGGTNGLVGNASTASALATKMYEERLKLPLQRDSLEDAAMKQRFGDQLLDPNHATILKTSGATGQPSGQVLH GAAGAMSPQVQARSQQLPGSTLDIKSEINPVLNPRAAGPEGSLIAIPGSNQGSNNLTLKGWPLTGLEQLRSGMLQQQKPF IQSPQPFHQLPMLTPQHQQQLILAQQNLASPSANDDNRRLRMLLNNRNMGVSKDGLSNPVGDVVSNVGSPLQAGGPPFPR GDTDMLMKLKLAQFHQHQQQNANSQQQQLQQHALSNPQSQTSNLNMHQQDKVAGGNVNVDGSMSNTFRGNDQVTKNQTGR KRKQPVSSSGPANSSGTANTAGPSPSSAPSTPSTHTAGDVMSMPALPHNGSSSKPLMMFGTDGTGTLTSPSNQLADVDRF VEDGSLDDNVESFLSHDDTDPRDNVGRCMDVSKGFSFSEVNSVRASTNKVVCCHFSSDGKLLASGGHDKKAVLWYTDSLK QKATLEEHSSLITDVRFSPSMPRLATSSYDKTVRVWDVDNPGYSLRTFTGHSASVMSLDFHPNKDDLICSCDFDGEIRYW SINNGSCARVSKGGTAQMRFQPRLGRYLAAAAENVVSIFDVETQACRYSLKGHTNSIHSVCWDPSGEFLASVSEDSVRVW TLGTGGEGECVHELSCNGNKFHSCVFHPTYPSMLVIGCYQASLYPFLVSFPF
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 2 | 97 | 96 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 2 | 97 | 96 | 0.0 | – | |
| ProSiteProfiles | 8 | 40 | 33 | 9.642 | ||
| SMART | 8 | 40 | 33 | 5.1E-4 | ||
| Pfam | 10 | 36 | 27 | 6.2E-7 | ||
| Coils | 83 | 111 | 29 | - | – | |
| MobiDBLite | 110 | 178 | 69 | - | – | |
| PANTHER | 136 | 841 | 706 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 136 | 841 | 706 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 414 | 551 | 138 | - | – | |
| MobiDBLite | 414 | 452 | 39 | - | – | |
| MobiDBLite | 458 | 518 | 61 | - | – | |
| MobiDBLite | 526 | 551 | 26 | - | – | |
| Gene3D | 579 | 735 | 157 | 7.2E-39 | ||
| SMART | 596 | 635 | 40 | 2.7E-5 | ||
| SUPERFAMILY | 597 | 843 | 247 | 3.26E-57 | ||
| CDD | 599 | 838 | 240 | 1.88973E-51 | – | |
| ProSiteProfiles | 603 | 644 | 42 | 9.673 | ||
| ProSiteProfiles | 603 | 810 | 208 | 34.223 | ||
| Pfam | 603 | 634 | 32 | 0.0036 | ||
| SMART | 638 | 677 | 40 | 1.2E-9 | ||
| Pfam | 642 | 677 | 36 | 1.2E-6 | ||
| ProSiteProfiles | 645 | 680 | 36 | 15.254 | ||
| ProSitePatterns | 664 | 678 | 15 | - | ||
| SMART | 681 | 721 | 41 | 5.5E-8 | ||
| Pfam | 684 | 721 | 38 | 5.6E-5 | ||
| ProSiteProfiles | 688 | 730 | 43 | 13.082 | ||
| SMART | 724 | 760 | 37 | 170.0 | ||
| Gene3D | 736 | 844 | 109 | 4.4E-18 | ||
| SMART | 763 | 801 | 39 | 3.0E-9 | ||
| Pfam | 766 | 800 | 35 | 7.7E-7 | ||
| ProSiteProfiles | 770 | 802 | 33 | 9.907 | ||
| SMART | 807 | 845 | 39 | 37.0 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0062500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…