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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0062500 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0062500.4 |
| Related isoforms 12 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Transcriptional corepressor leunig-like protein; TAIR: AT4G32551.1 transcriptional corepressor LEUNIG; Swiss-Prot: sp|Q9FUY2|LEUNG_ARATH Transcriptional corepressor LEUNIG; TrEMBL-Plants: tr|V7CVF3|V7CVF3_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0062500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:10513465..10534630) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CCCAAATTCTCTGCTTTTCCCTTGAAGTCGTGTTCCTCTGGCTTCGCTTTCTACCGTTCCCTTTTCTCATGCTTCTTTGT CTTTCTGCTACGAGATAAACTCTTGTGTTTGCCGATTGTTACTGCTCAGTTTCCTAGACTTTGAAACCTTCACAACCTCG TTCATTCCCTCACCACCGTTCAAGCTCGTTGTGTCAGAATGTCTCAGACTAACTGGGAAGCTGATAAGATGTAAGTGTTT TTTGCTTTGTGTTTATTTTTTTTTATATTTTCTATTGAATCTTGGTGTTTTAATCAGTTTTGGAACATGGGTTTTTGTTC TTACTCAGAATCTTTGCTTTCTTTTGTTGATTTGGGTTCTGGGTTTGTGGTTTTTCGTTTAATGGTGTTTTAGGTTGGTT TATTTTCCTGGGTTTGGTTTTATATGTGTTAGGTTTTCATGAAAATTTTGATGTGTGTTAGGGTTTTTGAGGCTATGCTA GTATAAGGGGTTGCTTTGCATTGAATGAAAATTTCACTTTTAATTGCTGAACTCTTGGTTCCTGCATTTTTTGTTGATTT GGGTTCTGGGTTTGTGGTTTTTCATTTAATGGTGTTTTAGGTTGGTTTATTTTCTTGGGTTTGGTTTTCATGTATATTTG AGAATATTTTGATGAGTGTGTTAGGGTTTTTTAGGCTATGCAAGTATAAGGAGTTTCTTTGCATTGAATGAAAATTTCAC TTTTAATTGTTGAACTCTTGGTTCCTGCATTTGGGTTTGCTGATATTTATGGTCACGAGATATACTCAGTGTAAAGATCT AAACTTTGATTCTAACAGTTCAATTGCTTATGCAACCTGTGTTTGCTTGTGCTATGGGATTTCAGGTTAGATGTTTACAT CTATGATTACCTAGTGAAGAGGGATTTGAAGGCTTCGGCTCAAGCTTTTCAAGCTGAAGGGAAAGTGTCCTCGGACCCTG 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ATCTCAATATGGTATCTATATCCTGACGAGAGGCAGCCCTAATATATGATTACACAGTGGACCCACTAGCTACCAATGCA AATTCAGAAATTGTGCACCATCTCCATTTTCTTGGCCCTCTTTATTGCTGTGTTCTCATTTCAGTAAGTTAAGACCTTTT CCACCCGAGGACCTCATCACAAGCGTGGCCTCTGATAAGAACCTTGGGAGAACCACACCACAAAAGCTAGCTGTTGTAGT TGGAGAGCCCAAGGCCTTATAAACCCCACATTAGAATCCCATCCTTCCAATTTGTGACTCAAGTCCCATACCTTGCAATT GGGTCCTAACATCCCACCACGCTCCGCAGCCCCGGCAGCCACGCAGGCTGGCTGTGCACTAGCCCCTTGACTAGTCCCGG GCGAACACTGCACTGCCGGCGTCACCACCCACACTGCTCGTTTGTAGCTGAGAGACATGGTGGAAGGCTCTGATACCAAT TGATAAGAACCTTGGGAGAACCACACCACAAAAGCCAAGGTTCTTATCAGCCTCTTTCGTTAAGATGTATCATGTTCCAC AAGATCCACCTCTTCCGCCTCCTTTTGAAGCTTGTTGACGTTGGCACAATTCCATCACTTAGCTTAATCCAAGACCTAAA TCTGCTAGGAACTCATATTTTTATAGTATATTTCTAACAATATGCACAAATATTTGATTGCTTGGTTAATTTTCTTATCA TCTTCTGGGTTTATTCAAATTTATGTTATGTTGGGAAAAAGTTTGTTATTTTAGTCGCATGTAAATGTAAGGTCTATGTA AGAGCTAGAGTAATTGCATGATCTGAGTCCCTTTGCTCTTTTGGATTTTAATGGATTGTGTTGTTTTCTTATTTTGTATT CTACTTCAACTTATATGAAATTATCATTGCAGCCTGGCTATTCGCTTCGTACCTTTACAGGACATTCTGCATCTGTTATG TCACTAGATTTTCACCCTAATAAGGACGACCTTATCTGCTCTTGTGATTTTGATGGCGAGATACGATATTGGAGCATTAA TAATGGCAGTTGTGCTAGAGTGTCCAAGGTAGAATTTTATTTTAAGCACAATTGTTTGTTTCATAGTTTGTGTATTGAAG TTAAAGTGTTCAGTTTAATTTGCAAAAGTGACGATTTTTCTCGCCAATTAGGGTGGTACTGCACAGATGAGATTTCAACC TCGTCTAGGGAGGTACCTTGCTGCAGCTGCAGAGAACGTTGTTTCTATATTTGATGTGGAGACACAAGCATGCCGATATT CACTAAAGGTTGGTTCAAATAAATTTCAGAAGTCTCTTGAGACTTGCACCTTACCTTCCTCTCTGTTCATAATCTGAAGC AGAAATCAAAACAAATTGCTTTATGATTTTCATTTAGGAAAACAACTTGGATCTAGTTAGTTCTTGTGTTACTGGTAACA TAGTACAAGATGGTTGAAACAGGGGCGGGAGTAAAGGAGGTTACATATTGCATTCATAACAATTGCGATAAAAAAAGTGT GCCTGTTAGAGCCTATTTTTCCCTTTTATTTTGCAGTATTGTTCAGTCACTGATTTGTATTTCTATATCTTTAATTCTGA AGACACTTCATTTCAACGCTTGATGTAGTTCCTACCCATATGTTCATAATTTATAGTCTTTTTGACAGTCACAACTCACA AGAATTGTATATTTCTGATTACTGCATGATAAGCTCTGTAGCAGAAATTGCTTATTTCTAGATTTTAGTTGCAATTTCTT CCAGACACAGCAGTTTTTTTCCTTTTACAGGCCGTCCACTAGGTCTAATTGTGTATACTGTGCAGACTCCTAGGCATTGA TCAGGAAAATTTATATTGGCTCAGTAGAAAACATGCAACTGATTACATCATACTTGTTTCTTGAGTTTGAAAAAATGCGA ATTGTAAGCTATCGGTTACTCGAATATGTCTAGCCAAGATATATTATCATGGTGAAAGATTTATACTGATCCTTTATGAA GATTGCATTTGCTGTTGCACAAAGCAAATAGGCAACGTGGTTGTTTCTACTGGAGAGAGGTCTTATAAGAAGAAACACTA ATTATACTTTCAATAAGAATAAAATACTTCTGACACTCCTGTATATATTTCCAAACAATTTTGTACTTCAACTGTAATGG TATATACTCTATTAATTTCTCTACATAAAGCATTGCTGATTTTACTGTTTTGAATGTGGCACCATGATTGTAGGGTCATA CAAACTCTATACATTCTGTGTGTTGGGATCCTTCTGGGGAGTTTCTGGCATCTGTCAGTGAAGACTCTGTCAGGGTCTGG ACTCTTGGAACAGGGGGTGAAGGGGAATGCGTTCATGAGCTTAGCTGTAATGGCAATAAATTTCACTCATGTGTTTTCCA CCCAACGTATCCTTCAATGCTGGTCATTGGTTGTTACCAGGCAAGTCTATATCCATTCTTAGTTTCATTTCCATTTTGAG CATTGATAGAATCGCAAATTTTTGAAATTGATTTCTTTATTTGCAAAATTAGAGGAATTGGTTTGGTCTTGATTGGATTC AAGTCATGTATTTACAGTTTAGAAATGTGCATGATTTTGTTGGGTTTGAGTGCATTTGATTTGATTTAGTTATTTAATTG ACAATTTAACCTTTATCAGTGCACCCACCTCATCTGTTCTAAGTTGGGAACAGTAAAATCTTCAAAACAAAATGATTTCG TTTCACCTTCTTGGTGTTCCAAATATGGTGATTGTTTTGCAAATCAATTGATTTCATACTTTTGTATTGAATGAGAACTG ATTTCTAGCAACTGCGGCAATCAAAGCCTTTCCCATAGGTGAAATCGGCTACATGGAATAACTGGTGCCATAATGCCTTC TTATGAATCCAGTTCAACCCTTTGCAATCCCTATAAATTCTTCGTCACTAGCACCCTTGGCTGCGTCCTTTGAAATGCTT CACCATCTTGATTATTCTTATTCTTCAAGTATCCCTGGAATTCTTTTCCGAACACTTGGACATTTATGACGAGCTGTTAG GGTTAGATTAACCCAAACAGCCAACCAACAAAAGAATAGGGATAAAAGGGTAATTGTCTGAATAAAAATACTGAATCTAT TATTAAAATAGAAACCCAAGGGGCTCGAGTTGAAGAAATGAACATGGTCTAAAAGAACTAAGGCAATGAGGAGAAGAGTT GGTTGAATGATGTGTGTTCATGGAAGCTCGAATGCGGAGCCAAGAGACTGCAGTGCAAGAGATATTGCTGCAGCAAGAGG AGCTTCAACGAGAATACGAAAACAGGGACTGAAGTAAGTGGGAGAAGCATAAATTTCCGCAGGTATAATATGCTGAATAT CAGGAAAGGAGGAAGAAGGGCTTATGTTTTAAATGTGATGAGTTCTCACTTAGGCATGACTGCATGAGTGCAAGATTAAG CAGTTAAGGGTCATACATGGTATTAGAGGAAGATCTTGTAGACCAAAGAGATGAATTGGAGGGTGAGTAGGAAATCATAG AATAGGGAGTGATACCAGCTCAACTCGATTTGCATAGTATAGCATGGCTGACCAGTAAAAATTCCTTAAAATTGTGGGGT CAATTGTGTGATCCGAAGGATGCCTCACATAACTTATTTTTCATAAGCTAGTTGAGAATCTGTAGTTGCTGTAGGAAAAA ACCTCTCAGTATTTGGTTAAGGTTGGCGATGGCTATAATGTGAATGCAAATGGGGTTTTTAGAGATCTAAATCATGACAC CTTGATATATTTGGATCACAATCTTCAGTTACTACGCAGAAATCTCACCCATCAAAATAATTTAAAATCTTTGTAAATAT GGTTTAGGTTGATGTGAGCCATCGGATTACAACTTCATCACCCTGCAGTTATTTAATTACTCTAGGGGATCTAAGTCCTA TCTATTTTATTCTCTGGTGTTTCATTTAAATACACGCTAATTCATTCAATGTCTTTCTTTTGCTGTATCAATTGTAATTG TTATTTTGATGCGGCTTCTCTTTAGAATTCTGATCTTCTGATTATATTTTTTACCGAATAATAGTAATTAAATGTTATCC TTGATATTGATGTAATTTTGACCTGTTTCAATTTGTTGTACCATTATTGCAGTCATTGGAACTCTGGGACATGACCGAGA ACAAGACAATGACTCTGTCTGCTCATGAAGGTCTAATTGCTGCATTGGCAGTTTCAACTGTAAATGGTTTGGTTGCTTCA GCCAGTCATGACAAGTTTGTCAAGCTCTGGAAGTAACCTGTCTGCCTCTGCAAAACAGGTAGTTTTATCAGTGTTGATCG CAGATTTGGATTTCCTGCTGTAAAAAAATCCCTAAAGCCGCTGTAGTCATGGCTTCATAGCCATCCGATCTTTAATTAGA CGGTTTAAATTTATAAAGACCAATTGTGTATGATTGTCATTTTAAATCCCAACGATTCGATCTTGATTCGACGACTACCA AAATGACTTCAGAAAGTTTTGACTGCATGGAATCCGGATCTGTTGATCACATGACCTTTTATGTTGTATGGTAAATTAAC CTATAGAGATCTCTGTTTCATTATTGTTTACTTAGAGATCTCTGTTCTTGTATCATCTACATTGGCTATTTATAATACCA TTCGGTGAGTGCTGATCCAGTTTCAGGCAGAACCCATGTCTGCAGCGACAACCTAAAAGTGGGAAAATTCAAACGTGCAA ACGTATTTATTTATTACTATATCTTTTTATTTGTGTTGTCGTTTTAGATGTAAATAATGGTTCTCTGAAAGATGAATCAG TACTTATTAACCAGAATAATGTTTGGTTGACACTCCAAACACTTGC
CDS sequence (LotjaGi5g1v0062500.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTCTCAGACTAACTGGGAAGCTGATAAGATGTTAGATGTTTACATCTATGATTACCTAGTGAAGAGGGATTTGAAGGC TTCGGCTCAAGCTTTTCAAGCTGAAGGGAAAGTGTCCTCGGACCCTGTTGCTATTGATGCCCCGGGAGGATTTCTGTTTG AGTGGTGGTCAGTTTTCTGGGACATATTTATTGCCAGGACTAATGAGAAGCATTCAGAGGTTGCTGCATCTTACATTGAG ACACAACTAGTTAAGGCTAGGGAGCAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACA ACAACAACAACAACCACAACCTCAGCAGTCACAACATCAGCAACAACAACATCAGCAACAACAACAGCAACAACAGCACA TGCAGATGCAGCAGATGATGTTACAAAGGCATGCTCAGCAGCAACAGCCGCAACATCAACAGCCACCACCTCAACAACAG GGTAGGGATAGGTCTCATCTCTTAAATGGTGGTACTAATGGGTTAGTTGGAAACGCTAGCACTGCAAGTGCATTAGCAAC AAAGATGTATGAGGAAAGGTTAAAACTGCCCCTTCAAAGGGATTCTTTGGAAGATGCAGCAATGAAGCAGAGATTTGGAG ACCAACTCTTGGACCCAAATCATGCCACAATATTGAAGACATCTGGAGCTACTGGCCAGCCTTCAGGGCAAGTTTTGCAT GGTGCTGCTGGTGCGATGTCTCCACAAGTTCAAGCTCGTAGTCAGCAATTACCTGGGTCTACTCTGGATATAAAAAGTGA GATTAATCCTGTTTTAAATCCCAGAGCAGCGGGTCCTGAAGGATCATTGATAGCAATTCCTGGATCTAACCAAGGTAGCA ACAATTTGACTTTGAAAGGGTGGCCACTCACAGGGTTGGAACAACTACGTTCTGGTATGCTTCAGCAACAAAAACCTTTT ATACAGTCTCCTCAACCTTTTCATCAACTTCCGATGTTGACGCCACAACATCAACAACAGCTTATACTAGCACAACAAAA TTTAGCATCACCATCTGCCAATGATGACAATAGAAGACTCCGAATGCTACTAAATAATAGGAATATGGGTGTAAGTAAGG ATGGTCTTTCAAATCCTGTGGGTGATGTAGTATCAAATGTTGGATCACCTCTTCAAGCAGGTGGCCCTCCTTTTCCTCGT GGCGATACAGATATGTTAATGAAGTTGAAACTGGCTCAGTTTCACCAACATCAGCAGCAGAACGCCAATTCACAGCAGCA GCAACTTCAACAGCATGCTCTTTCAAATCCGCAATCTCAGACTTCAAATCTTAACATGCATCAGCAGGATAAAGTAGCGG GAGGCAATGTCAATGTCGATGGTAGCATGTCAAACACCTTTAGAGGAAATGATCAGGTTACCAAAAACCAGACTGGTAGA AAGAGAAAACAGCCCGTATCTTCCTCTGGTCCTGCCAATAGCTCAGGAACAGCAAATACGGCAGGCCCATCTCCAAGTTC AGCACCCTCAACGCCCTCAACGCATACAGCTGGTGATGTGATGTCAATGCCTGCTCTACCTCATAATGGTAGCTCATCAA AGCCATTAATGATGTTTGGCACTGATGGCACCGGAACTCTTACCTCACCTTCCAATCAATTGGCTGATGTGGACCGTTTT GTTGAGGATGGATCTCTTGATGACAATGTGGAGTCTTTTTTATCCCATGATGATACAGACCCTAGAGATAATGTTGGTCG TTGTATGGATGTAAGCAAAGGATTCTCATTTTCGGAAGTAAATTCTGTACGCGCAAGTACAAACAAAGTTGTCTGTTGCC ATTTCTCATCTGATGGGAAATTGCTTGCAAGTGGTGGTCATGATAAAAAGGCTGTTTTATGGTACACAGATTCTCTGAAG CAGAAGGCTACTCTTGAAGAGCATTCATCTTTAATCACCGATGTCCGTTTCAGTCCAAGCATGCCTCGTCTCGCAACATC TTCATATGACAAAACTGTTAGGGTTTGGGATGTTGACAATCCTGGCTATTCGCTTCGTACCTTTACAGGACATTCTGCAT CTGTTATGTCACTAGATTTTCACCCTAATAAGGACGACCTTATCTGCTCTTGTGATTTTGATGGCGAGATACGATATTGG AGCATTAATAATGGCAGTTGTGCTAGAGTGTCCAAGGGTGGTACTGCACAGATGAGATTTCAACCTCGTCTAGGGAGGTA CCTTGCTGCAGCTGCAGAGAACGTTGTTTCTATATTTGATGTGGAGACACAAGCATGCCGATATTCACTAAAGGGTCATA CAAACTCTATACATTCTGTGTGTTGGGATCCTTCTGGGGAGTTTCTGGCATCTGTCAGTGAAGACTCTGTCAGGGTCTGG ACTCTTGGAACAGGGGGTGAAGGGGAATGCGTTCATGAGCTTAGCTGTAATGGCAATAAATTTCACTCATGTGTTTTCCA CCCAACGTATCCTTCAATGCTGGTCATTGGTTGTTACCAGTCATTGGAACTCTGGGACATGACCGAGAACAAGACAATGA CTCTGTCTGCTCATGAAGGTCTAATTGCTGCATTGGCAGTTTCAACTGTAAATGGTTTGGTTGCTTCAGCCAGTCATGAC AAGTTTGTCAAGCTCTGGAAGTAA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0062500.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSQTNWEADKMLDVYIYDYLVKRDLKASAQAFQAEGKVSSDPVAIDAPGGFLFEWWSVFWDIFIARTNEKHSEVAASYIE TQLVKAREQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQPQPQQSQHQQQQHQQQQQQQQHMQMQQMMLQRHAQQQQPQHQQPPPQQQ GRDRSHLLNGGTNGLVGNASTASALATKMYEERLKLPLQRDSLEDAAMKQRFGDQLLDPNHATILKTSGATGQPSGQVLH GAAGAMSPQVQARSQQLPGSTLDIKSEINPVLNPRAAGPEGSLIAIPGSNQGSNNLTLKGWPLTGLEQLRSGMLQQQKPF IQSPQPFHQLPMLTPQHQQQLILAQQNLASPSANDDNRRLRMLLNNRNMGVSKDGLSNPVGDVVSNVGSPLQAGGPPFPR GDTDMLMKLKLAQFHQHQQQNANSQQQQLQQHALSNPQSQTSNLNMHQQDKVAGGNVNVDGSMSNTFRGNDQVTKNQTGR KRKQPVSSSGPANSSGTANTAGPSPSSAPSTPSTHTAGDVMSMPALPHNGSSSKPLMMFGTDGTGTLTSPSNQLADVDRF VEDGSLDDNVESFLSHDDTDPRDNVGRCMDVSKGFSFSEVNSVRASTNKVVCCHFSSDGKLLASGGHDKKAVLWYTDSLK QKATLEEHSSLITDVRFSPSMPRLATSSYDKTVRVWDVDNPGYSLRTFTGHSASVMSLDFHPNKDDLICSCDFDGEIRYW SINNGSCARVSKGGTAQMRFQPRLGRYLAAAAENVVSIFDVETQACRYSLKGHTNSIHSVCWDPSGEFLASVSEDSVRVW TLGTGGEGECVHELSCNGNKFHSCVFHPTYPSMLVIGCYQSLELWDMTENKTMTLSAHEGLIAALAVSTVNGLVASASHD KFVKLWK
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 2 | 97 | 96 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 2 | 97 | 96 | 0.0 | – | |
| ProSiteProfiles | 8 | 40 | 33 | 9.642 | ||
| SMART | 8 | 40 | 33 | 5.1E-4 | ||
| Pfam | 10 | 36 | 27 | 6.5E-7 | ||
| Coils | 83 | 111 | 29 | - | – | |
| MobiDBLite | 110 | 178 | 69 | - | – | |
| PANTHER | 136 | 887 | 752 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 136 | 887 | 752 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 414 | 452 | 39 | - | – | |
| MobiDBLite | 414 | 551 | 138 | - | – | |
| MobiDBLite | 458 | 518 | 61 | - | – | |
| MobiDBLite | 526 | 551 | 26 | - | – | |
| Gene3D | 579 | 738 | 160 | 7.4E-39 | ||
| SMART | 596 | 635 | 40 | 2.7E-5 | ||
| SUPERFAMILY | 597 | 887 | 291 | 1.33E-65 | ||
| CDD | 599 | 887 | 289 | 2.95254E-64 | – | |
| ProSiteProfiles | 603 | 644 | 42 | 9.673 | ||
| Pfam | 603 | 634 | 32 | 0.0038 | ||
| ProSiteProfiles | 603 | 887 | 285 | 39.443 | ||
| SMART | 638 | 677 | 40 | 1.2E-9 | ||
| Pfam | 642 | 677 | 36 | 1.3E-6 | ||
| ProSiteProfiles | 645 | 680 | 36 | 15.254 | ||
| ProSitePatterns | 664 | 678 | 15 | - | ||
| SMART | 681 | 721 | 41 | 5.5E-8 | ||
| Pfam | 684 | 721 | 38 | 5.9E-5 | ||
| ProSiteProfiles | 688 | 730 | 43 | 13.082 | ||
| SMART | 724 | 760 | 37 | 170.0 | ||
| Gene3D | 739 | 887 | 149 | 3.9E-28 | ||
| SMART | 763 | 801 | 39 | 3.0E-9 | ||
| Pfam | 766 | 800 | 35 | 8.1E-7 | ||
| ProSiteProfiles | 770 | 802 | 33 | 9.907 | ||
| SMART | 807 | 846 | 40 | 0.39 | ||
| SMART | 848 | 887 | 40 | 3.4E-5 | ||
| Pfam | 850 | 887 | 38 | 0.078 | ||
| ProSiteProfiles | 855 | 887 | 33 | 12.48 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0062500.4, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…