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LotjaGi5g1v0062500.7

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi5g1v0062500
Transcript ID LotjaGi5g1v0062500.7
Related isoforms 12
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Transcriptional corepressor leunig-like protein; TAIR: AT4G32551.1 transcriptional corepressor LEUNIG; Swiss-Prot: sp|Q9FUY2|LEUNG_ARATH Transcriptional corepressor LEUNIG; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0FPP1|A0A0R0FPP1_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0062500
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr5:10514331..10534060) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

TTAGATGTTTACATCTATGATTACCTAGTGAAGAGGGATTTGAAGGCTTCGGCTCAAGCTTTTCAAGCTGAAGGGAAAGT GTCCTCGGACCCTGTTGGTTAGTTACCTAGAAACAAAGAAGTTGGATTTGATGTTTCTGTTTTGGCCATTTTATTGATTT GGTTTCTTTTGTGTGATGGTAATGAGGGATTGCAGCTATTGATGCCCCGGGAGGATTTCTGTTTGAGTGGTGGTCAGTTT TCTGGGACATATTTATTGCCAGGACTAATGAGAAGCATTCAGAGGTTGCTGCATCTTACATTGAGGTTGGTTCGGAAAAA TTTGCATTGTTTTTCATTTTTAGCTTCCTACTGGCGTACTAGATCTGATTTGTATGATTGTGCTGGAAGTTAGCATAAAA ATGGCGACATTCTGACAGTTGATTAACTTTTGATGTATGTGTTCATGTATTCAAGAAGGAACCTTATACATTTGACCATA TATTACTTCCAAATTTTGCTCCCTAAGTCGCTAACCAATAAATGATTTGGCTGGTAATTGCTTTCCATAAGTAGTTGAAG GGAAAGTTGGTATCTTTTCTCTAAATCTAGCTTTTCTTAAATAAGATTGCAGAAAGATATTTGTTTTTAATTTCCAAGAT TCTGACTAGGTTGCTAGCAGTATGATTTTAAAAAATATATTGTTTGAGCAAGTGATTATCTGTCTAATGGTGATTATGAT TGTTTGATATTTTAATTTTCCCTAACATGCAATCATAAAACTGTTTCCATGTAAATTTGTGGTGGCAAATTGAAGGTTTT GGTTTGTGAAACTCTCTTTGCAGACACAACTAGTTAAGGCTAGGGAGCAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAA CAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACCACAACCTCAGCAGTCACAACATCAGCAACAACAACATCAGCA 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CTCCTAGGCATTGATCAGGAAAATTTATATTGGCTCAGTAGAAAACATGCAACTGATTACATCATACTTGTTTCTTGAGT TTGAAAAAATGCGAATTGTAAGCTATCGGTTACTCGAATATGTCTAGCCAAGATATATTATCATGGTGAAAGATTTATAC TGATCCTTTATGAAGATTGCATTTGCTGTTGCACAAAGCAAATAGGCAACGTGGTTGTTTCTACTGGAGAGAGGTCTTAT AAGAAGAAACACTAATTATACTTTCAATAAGAATAAAATACTTCTGACACTCCTGTATATATTTCCAAACAATTTTGTAC TTCAACTGTAATGGTATATACTCTATTAATTTCTCTACATAAAGCATTGCTGATTTTACTGTTTTGAATGTGGCACCATG ATTGTAGGGTCATACAAACTCTATACATTCTGTGTGTTGGGATCCTTCTGGGGAGTTTCTGGCATCTGTCAGTGAAGACT CTGTCAGGGTCTGGACTCTTGGAACAGGGGGTGAAGGGGAATGCGTTCATGAGCTTAGCTGTAATGGCAATAAATTTCAC TCATGTGTTTTCCACCCAACGTATCCTTCAATGCTGGTCATTGGTTGTTACCAGGCAAGTCTATATCCATTCTTAGTTTC ATTTCCATTTTGAGCATTGATAGAATCGCAAATTTTTGAAATTGATTTCTTTATTTGCAAAATTAGAGGAATTGGTTTGG TCTTGATTGGATTCAAGTCATGTATTTACAGTTTAGAAATGTGCATGATTTTGTTGGGTTTGAGTGCATTTGATTTGATT TAGTTATTTAATTGACAATTTAACCTTTATCAGTGCACCCACCTCATCTGTTCTAAGTTGGGAACAGTAAAATCTTCAAA ACAAAATGATTTCGTTTCACCTTCTTGGTGTTCCAAATATGGTGATTGTTTTGCAAATCAATTGATTTCATACTTTTGTA TTGAATGAGAACTGATTTCTAGCAACTGCGGCAATCAAAGCCTTTCCCATAGGTGAAATCGGCTACATGGAATAACTGGT GCCATAATGCCTTCTTATGAATCCAGTTCAACCCTTTGCAATCCCTATAAATTCTTCGTCACTAGCACCCTTGGCTGCGT CCTTTGAAATGCTTCACCATCTTGATTATTCTTATTCTTCAAGTATCCCTGGAATTCTTTTCCGAACACTTGGACATTTA TGACGAGCTGTTAGGGTTAGATTAACCCAAACAGCCAACCAACAAAAGAATAGGGATAAAAGGGTAATTGTCTGAATAAA AATACTGAATCTATTATTAAAATAGAAACCCAAGGGGCTCGAGTTGAAGAAATGAACATGGTCTAAAAGAACTAAGGCAA TGAGGAGAAGAGTTGGTTGAATGATGTGTGTTCATGGAAGCTCGAATGCGGAGCCAAGAGACTGCAGTGCAAGAGATATT GCTGCAGCAAGAGGAGCTTCAACGAGAATACGAAAACAGGGACTGAAGTAAGTGGGAGAAGCATAAATTTCCGCAGGTAT AATATGCTGAATATCAGGAAAGGAGGAAGAAGGGCTTATGTTTTAAATGTGATGAGTTCTCACTTAGGCATGACTGCATG AGTGCAAGATTAAGCAGTTAAGGGTCATACATGGTATTAGAGGAAGATCTTGTAGACCAAAGAGATGAATTGGAGGGTGA GTAGGAAATCATAGAATAGGGAGTGATACCAGCTCAACTCGATTTGCATAGTATAGCATGGCTGACCAGTAAAAATTCCT TAAAATTGTGGGGTCAATTGTGTGATCCGAAGGATGCCTCACATAACTTATTTTTCATAAGCTAGTTGAGAATCTGTAGT TGCTGTAGGAAAAAACCTCTCAGTATTTGGTTAAGGTTGGCGATGGCTATAATGTGAATGCAAATGGGGTTTTTAGAGAT CTAAATCATGACACCTTGATATATTTGGATCACAATCTTCAGTTACTACGCAGAAATCTCACCCATCAAAATAATTTAAA ATCTTTGTAAATATGGTTTAGGTTGATGTGAGCCATCGGATTACAACTTCATCACCCTGCAGTTATTTAATTACTCTAGG GGATCTAAGTCCTATCTATTTTATTCTCTGGTGTTTCATTTAAATACACGCTAATTCATTCAATGTCTTTCTTTTGCTGT ATCAATTGTAATTGTTATTTTGATGCGGCTTCTCTTTAGAATTCTGATCTTCTGATTATATTTTTTACCGAATAATAGTA ATTAAATGTTATCCTTGATATTGATGTAATTTTGACCTGTTTCAATTTGTTGTACCATTATTGCAGTCATTGGAACTCTG GGACATGACCGAGAACAAGACAATGACTCTGTCTGCTCATGAAGGTCTAATTGCTGCATTGGCAGTTTCAACTGTAAATG GTTTGGTTGCTTCAGCCAGTCATGACAAGTTTGTCAAGCTCTGGAAGTAA 

CDS sequence (LotjaGi5g1v0062500.7) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGCAGATGCAGCAGATGATGTTACAAAGGCATGCTCAGCAGCAACAGCCGCAACATCAACAGCCACCACCTCAACAACA GGGTAGGGATAGGTCTCATCTCTTAAATGGTGGTACTAATGGGTTAGTTGGAAACGCTAGCACTGCAAGTGCATTAGCAA CAAAGATGTATGAGGAAAGGTTAAAACTGCCCCTTCAAAGGGATTCTTTGGAAGATGCAGCAATGAAGCAGAGATTTGGA GACCAACTCTTGGACCCAAATCATGCCACAATATTGAAGACATCTGGAGCTACTGGCCAGCCTTCAGGGCAAGTTTTGCA TGGTGCTGCTGGTGCGATGTCTCCACAAGTTCAAGCTCGTAGTCAGCAATTACCTGGGTCTACTCTGGATATAAAAAGTG AGATTAATCCTGTTTTAAATCCCAGAGCAGCGGGTCCTGAAGGATCATTGATAGCAATTCCTGGATCTAACCAAGGTAGC AACAATTTGACTTTGAAAGGGTGGCCACTCACAGGGTTGGAACAACTACGTTCTGGTATGCTTCAGCAACAAAAACCTTT TATACAGTCTCCTCAACCTTTTCATCAACTTCCGATGTTGACGCCACAACATCAACAACAGCTTATACTAGCACAACAAA ATTTAGCATCACCATCTGCCAATGATGACAATAGAAGACTCCGAATGCTACTAAATAATAGGAATATGGGTGTAAGTAAG GATGGTCTTTCAAATCCTGTGGGTGATGTAGTATCAAATGTTGGATCACCTCTTCAAGCAGGTGGCCCTCCTTTTCCTCG TGGCGATACAGATATGTTAATGAAGTTGAAACTGGCTCAGTTTCACCAACATCAGCAGCAGAACGCCAATTCACAGCAGC AGCAACTTCAACAGCATGCTCTTTCAAATCCGCAATCTCAGACTTCAAATCTTAACATGCATCAGCAGGATAAAGTAGCG GGAGGCAATGTCAATGTCGATGGTAGCATGTCAAACACCTTTAGAGGAAATGATCAGACTGGTAGAAAGAGAAAACAGCC CGTATCTTCCTCTGGTCCTGCCAATAGCTCAGGAACAGCAAATACGGCAGGCCCATCTCCAAGTTCAGCACCCTCAACGC CCTCAACGCATACAGCTGGTGATGTGATGTCAATGCCTGCTCTACCTCATAATGGTAGCTCATCAAAGCCATTAATGATG TTTGGCACTGATGGCACCGGAACTCTTACCTCACCTTCCAATCAATTGTGGGATGATAAAGATCTTGAATTGCAGGCTGA TGTGGACCGTTTTGTTGAGGATGGATCTCTTGATGACAATGTGGAGTCTTTTTTATCCCATGATGATACAGACCCTAGAG ATAATGTTGGTCGTTGTATGGATGTAAGCAAAGGATTCTCATTTTCGGAAGTAAATTCTGTACGCGCAAGTACAAACAAA GTTGTCTGTTGCCATTTCTCATCTGATGGGAAATTGCTTGCAAGTGGTGGTCATGATAAAAAGGCTGTTTTATGGTACAC AGATTCTCTGAAGCAGAAGGCTACTCTTGAAGAGCATTCATCTTTAATCACCGATGTCCGTTTCAGTCCAAGCATGCCTC GTCTCGCAACATCTTCATATGACAAAACTGTTAGGGTTTGGGATGTTGACAATCCTGGCTATTCGCTTCGTACCTTTACA GGACATTCTGCATCTGTTATGTCACTAGATTTTCACCCTAATAAGGACGACCTTATCTGCTCTTGTGATTTTGATGGCGA GATACGATATTGGAGCATTAATAATGGCAGTTGTGCTAGAGTGTCCAAGGGTGGTACTGCACAGATGAGATTTCAACCTC GTCTAGGGAGGTACCTTGCTGCAGCTGCAGAGAACGTTGTTTCTATATTTGATGTGGAGACACAAGCATGCCGATATTCA CTAAAGGGTCATACAAACTCTATACATTCTGTGTGTTGGGATCCTTCTGGGGAGTTTCTGGCATCTGTCAGTGAAGACTC TGTCAGGGTCTGGACTCTTGGAACAGGGGGTGAAGGGGAATGCGTTCATGAGCTTAGCTGTAATGGCAATAAATTTCACT CATGTGTTTTCCACCCAACGTATCCTTCAATGCTGGTCATTGGTTGTTACCAGTCATTGGAACTCTGGGACATGACCGAG AACAAGACAATGACTCTGTCTGCTCATGAAGGTCTAATTGCTGCATTGGCAGTTTCAACTGTAAATGGTTTGGTTGCTTC AGCCAGTCATGACAAGTTTGTCAAGCTCTGGAAGTAA 

Protein sequence (LotjaGi5g1v0062500.7) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MQMQQMMLQRHAQQQQPQHQQPPPQQQGRDRSHLLNGGTNGLVGNASTASALATKMYEERLKLPLQRDSLEDAAMKQRFG DQLLDPNHATILKTSGATGQPSGQVLHGAAGAMSPQVQARSQQLPGSTLDIKSEINPVLNPRAAGPEGSLIAIPGSNQGS NNLTLKGWPLTGLEQLRSGMLQQQKPFIQSPQPFHQLPMLTPQHQQQLILAQQNLASPSANDDNRRLRMLLNNRNMGVSK DGLSNPVGDVVSNVGSPLQAGGPPFPRGDTDMLMKLKLAQFHQHQQQNANSQQQQLQQHALSNPQSQTSNLNMHQQDKVA GGNVNVDGSMSNTFRGNDQTGRKRKQPVSSSGPANSSGTANTAGPSPSSAPSTPSTHTAGDVMSMPALPHNGSSSKPLMM FGTDGTGTLTSPSNQLWDDKDLELQADVDRFVEDGSLDDNVESFLSHDDTDPRDNVGRCMDVSKGFSFSEVNSVRASTNK VVCCHFSSDGKLLASGGHDKKAVLWYTDSLKQKATLEEHSSLITDVRFSPSMPRLATSSYDKTVRVWDVDNPGYSLRTFT GHSASVMSLDFHPNKDDLICSCDFDGEIRYWSINNGSCARVSKGGTAQMRFQPRLGRYLAAAAENVVSIFDVETQACRYS LKGHTNSIHSVCWDPSGEFLASVSEDSVRVWTLGTGGEGECVHELSCNGNKFHSCVFHPTYPSMLVIGCYQSLELWDMTE NKTMTLSAHEGLIAALAVSTVNGLVASASHDKFVKLWK 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
MobiDBLite 1 45 45 -
PANTHER 3 758 756 0.0
PANTHER 3 758 756 0.0
MobiDBLite 281 416 136 -
MobiDBLite 281 319 39 -
MobiDBLite 325 380 56 -
MobiDBLite 388 416 29 -
Gene3D 450 608 159 5.9E-39
SMART 467 506 40 2.7E-5
SUPERFAMILY 468 758 291 9.42E-66
CDD 470 758 289 1.08746E-64
Pfam 474 505 32 0.0031
ProSiteProfiles 474 515 42 9.673
ProSiteProfiles 474 758 285 39.443
SMART 509 548 40 1.2E-9
Pfam 513 548 36 1.0E-6
ProSiteProfiles 516 551 36 15.254
ProSitePatterns 535 549 15 -
SMART 552 592 41 5.5E-8
Pfam 555 592 38 4.9E-5
ProSiteProfiles 559 601 43 13.082
SMART 595 631 37 170.0
Gene3D 609 758 150 2.8E-28
SMART 634 672 39 3.0E-9
Pfam 637 671 35 6.7E-7
ProSiteProfiles 641 673 33 9.907
SMART 678 717 40 0.39
SMART 719 758 40 3.4E-5
Pfam 721 758 38 0.065
ProSiteProfiles 726 758 33 12.48

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi5g1v0062500.7, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…