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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi5g1v0062500 |
Transcript ID | LotjaGi5g1v0062500.3 |
Related isoforms 12 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | Transcriptional corepressor leunig-like protein; TAIR: AT4G32551.1 transcriptional corepressor LEUNIG; Swiss-Prot: sp|Q9FUY2|LEUNG_ARATH Transcriptional corepressor LEUNIG; TrEMBL-Plants: tr|V7CVF3|V7CVF3_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0062500 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:10513465..10534630) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CCCAAATTCTCTGCTTTTCCCTTGAAGTCGTGTTCCTCTGGCTTCGCTTTCTACCGTTCCCTTTTCTCATGCTTCTTTGT CTTTCTGCTACGAGATAAACTCTTGTGTTTGCCGATTGTTACTGCTCAGTTTCCTAGACTTTGAAACCTTCACAACCTCG TTCATTCCCTCACCACCGTTCAAGCTCGTTGTGTCAGAATGTCTCAGACTAACTGGGAAGCTGATAAGATGTAAGTGTTT TTTGCTTTGTGTTTATTTTTTTTTATATTTTCTATTGAATCTTGGTGTTTTAATCAGTTTTGGAACATGGGTTTTTGTTC TTACTCAGAATCTTTGCTTTCTTTTGTTGATTTGGGTTCTGGGTTTGTGGTTTTTCGTTTAATGGTGTTTTAGGTTGGTT TATTTTCCTGGGTTTGGTTTTATATGTGTTAGGTTTTCATGAAAATTTTGATGTGTGTTAGGGTTTTTGAGGCTATGCTA GTATAAGGGGTTGCTTTGCATTGAATGAAAATTTCACTTTTAATTGCTGAACTCTTGGTTCCTGCATTTTTTGTTGATTT GGGTTCTGGGTTTGTGGTTTTTCATTTAATGGTGTTTTAGGTTGGTTTATTTTCTTGGGTTTGGTTTTCATGTATATTTG AGAATATTTTGATGAGTGTGTTAGGGTTTTTTAGGCTATGCAAGTATAAGGAGTTTCTTTGCATTGAATGAAAATTTCAC TTTTAATTGTTGAACTCTTGGTTCCTGCATTTGGGTTTGCTGATATTTATGGTCACGAGATATACTCAGTGTAAAGATCT AAACTTTGATTCTAACAGTTCAATTGCTTATGCAACCTGTGTTTGCTTGTGCTATGGGATTTCAGGTTAGATGTTTACAT CTATGATTACCTAGTGAAGAGGGATTTGAAGGCTTCGGCTCAAGCTTTTCAAGCTGAAGGGAAAGTGTCCTCGGACCCTG 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ATCTCAATATGGTATCTATATCCTGACGAGAGGCAGCCCTAATATATGATTACACAGTGGACCCACTAGCTACCAATGCA AATTCAGAAATTGTGCACCATCTCCATTTTCTTGGCCCTCTTTATTGCTGTGTTCTCATTTCAGTAAGTTAAGACCTTTT CCACCCGAGGACCTCATCACAAGCGTGGCCTCTGATAAGAACCTTGGGAGAACCACACCACAAAAGCTAGCTGTTGTAGT TGGAGAGCCCAAGGCCTTATAAACCCCACATTAGAATCCCATCCTTCCAATTTGTGACTCAAGTCCCATACCTTGCAATT GGGTCCTAACATCCCACCACGCTCCGCAGCCCCGGCAGCCACGCAGGCTGGCTGTGCACTAGCCCCTTGACTAGTCCCGG GCGAACACTGCACTGCCGGCGTCACCACCCACACTGCTCGTTTGTAGCTGAGAGACATGGTGGAAGGCTCTGATACCAAT TGATAAGAACCTTGGGAGAACCACACCACAAAAGCCAAGGTTCTTATCAGCCTCTTTCGTTAAGATGTATCATGTTCCAC AAGATCCACCTCTTCCGCCTCCTTTTGAAGCTTGTTGACGTTGGCACAATTCCATCACTTAGCTTAATCCAAGACCTAAA TCTGCTAGGAACTCATATTTTTATAGTATATTTCTAACAATATGCACAAATATTTGATTGCTTGGTTAATTTTCTTATCA TCTTCTGGGTTTATTCAAATTTATGTTATGTTGGGAAAAAGTTTGTTATTTTAGTCGCATGTAAATGTAAGGTCTATGTA AGAGCTAGAGTAATTGCATGATCTGAGTCCCTTTGCTCTTTTGGATTTTAATGGATTGTGTTGTTTTCTTATTTTGTATT CTACTTCAACTTATATGAAATTATCATTGCAGCCTGGCTATTCGCTTCGTACCTTTACAGGACATTCTGCATCTGTTATG TCACTAGATTTTCACCCTAATAAGGACGACCTTATCTGCTCTTGTGATTTTGATGGCGAGATACGATATTGGAGCATTAA TAATGGCAGTTGTGCTAGAGTGTCCAAGGTAGAATTTTATTTTAAGCACAATTGTTTGTTTCATAGTTTGTGTATTGAAG TTAAAGTGTTCAGTTTAATTTGCAAAAGTGACGATTTTTCTCGCCAATTAGGGTGGTACTGCACAGATGAGATTTCAACC TCGTCTAGGGAGGTACCTTGCTGCAGCTGCAGAGAACGTTGTTTCTATATTTGATGTGGAGACACAAGCATGCCGATATT CACTAAAGGTTGGTTCAAATAAATTTCAGAAGTCTCTTGAGACTTGCACCTTACCTTCCTCTCTGTTCATAATCTGAAGC AGAAATCAAAACAAATTGCTTTATGATTTTCATTTAGGAAAACAACTTGGATCTAGTTAGTTCTTGTGTTACTGGTAACA TAGTACAAGATGGTTGAAACAGGGGCGGGAGTAAAGGAGGTTACATATTGCATTCATAACAATTGCGATAAAAAAAGTGT GCCTGTTAGAGCCTATTTTTCCCTTTTATTTTGCAGTATTGTTCAGTCACTGATTTGTATTTCTATATCTTTAATTCTGA AGACACTTCATTTCAACGCTTGATGTAGTTCCTACCCATATGTTCATAATTTATAGTCTTTTTGACAGTCACAACTCACA AGAATTGTATATTTCTGATTACTGCATGATAAGCTCTGTAGCAGAAATTGCTTATTTCTAGATTTTAGTTGCAATTTCTT CCAGACACAGCAGTTTTTTTCCTTTTACAGGCCGTCCACTAGGTCTAATTGTGTATACTGTGCAGACTCCTAGGCATTGA TCAGGAAAATTTATATTGGCTCAGTAGAAAACATGCAACTGATTACATCATACTTGTTTCTTGAGTTTGAAAAAATGCGA ATTGTAAGCTATCGGTTACTCGAATATGTCTAGCCAAGATATATTATCATGGTGAAAGATTTATACTGATCCTTTATGAA GATTGCATTTGCTGTTGCACAAAGCAAATAGGCAACGTGGTTGTTTCTACTGGAGAGAGGTCTTATAAGAAGAAACACTA ATTATACTTTCAATAAGAATAAAATACTTCTGACACTCCTGTATATATTTCCAAACAATTTTGTACTTCAACTGTAATGG TATATACTCTATTAATTTCTCTACATAAAGCATTGCTGATTTTACTGTTTTGAATGTGGCACCATGATTGTAGGGTCATA CAAACTCTATACATTCTGTGTGTTGGGATCCTTCTGGGGAGTTTCTGGCATCTGTCAGTGAAGACTCTGTCAGGGTCTGG ACTCTTGGAACAGGGGGTGAAGGGGAATGCGTTCATGAGCTTAGCTGTAATGGCAATAAATTTCACTCATGTGTTTTCCA CCCAACGTATCCTTCAATGCTGGTCATTGGTTGTTACCAGGCAAGTCTATATCCATTCTTAGTTTCATTTCCATTTTGAG CATTGATAGAATCGCAAATTTTTGAAATTGATTTCTTTATTTGCAAAATTAGAGGAATTGGTTTGGTCTTGATTGGATTC AAGTCATGTATTTACAGTTTAGAAATGTGCATGATTTTGTTGGGTTTGAGTGCATTTGATTTGATTTAGTTATTTAATTG ACAATTTAACCTTTATCAGTGCACCCACCTCATCTGTTCTAAGTTGGGAACAGTAAAATCTTCAAAACAAAATGATTTCG TTTCACCTTCTTGGTGTTCCAAATATGGTGATTGTTTTGCAAATCAATTGATTTCATACTTTTGTATTGAATGAGAACTG ATTTCTAGCAACTGCGGCAATCAAAGCCTTTCCCATAGGTGAAATCGGCTACATGGAATAACTGGTGCCATAATGCCTTC TTATGAATCCAGTTCAACCCTTTGCAATCCCTATAAATTCTTCGTCACTAGCACCCTTGGCTGCGTCCTTTGAAATGCTT CACCATCTTGATTATTCTTATTCTTCAAGTATCCCTGGAATTCTTTTCCGAACACTTGGACATTTATGACGAGCTGTTAG GGTTAGATTAACCCAAACAGCCAACCAACAAAAGAATAGGGATAAAAGGGTAATTGTCTGAATAAAAATACTGAATCTAT TATTAAAATAGAAACCCAAGGGGCTCGAGTTGAAGAAATGAACATGGTCTAAAAGAACTAAGGCAATGAGGAGAAGAGTT GGTTGAATGATGTGTGTTCATGGAAGCTCGAATGCGGAGCCAAGAGACTGCAGTGCAAGAGATATTGCTGCAGCAAGAGG AGCTTCAACGAGAATACGAAAACAGGGACTGAAGTAAGTGGGAGAAGCATAAATTTCCGCAGGTATAATATGCTGAATAT CAGGAAAGGAGGAAGAAGGGCTTATGTTTTAAATGTGATGAGTTCTCACTTAGGCATGACTGCATGAGTGCAAGATTAAG CAGTTAAGGGTCATACATGGTATTAGAGGAAGATCTTGTAGACCAAAGAGATGAATTGGAGGGTGAGTAGGAAATCATAG AATAGGGAGTGATACCAGCTCAACTCGATTTGCATAGTATAGCATGGCTGACCAGTAAAAATTCCTTAAAATTGTGGGGT CAATTGTGTGATCCGAAGGATGCCTCACATAACTTATTTTTCATAAGCTAGTTGAGAATCTGTAGTTGCTGTAGGAAAAA ACCTCTCAGTATTTGGTTAAGGTTGGCGATGGCTATAATGTGAATGCAAATGGGGTTTTTAGAGATCTAAATCATGACAC CTTGATATATTTGGATCACAATCTTCAGTTACTACGCAGAAATCTCACCCATCAAAATAATTTAAAATCTTTGTAAATAT GGTTTAGGTTGATGTGAGCCATCGGATTACAACTTCATCACCCTGCAGTTATTTAATTACTCTAGGGGATCTAAGTCCTA TCTATTTTATTCTCTGGTGTTTCATTTAAATACACGCTAATTCATTCAATGTCTTTCTTTTGCTGTATCAATTGTAATTG TTATTTTGATGCGGCTTCTCTTTAGAATTCTGATCTTCTGATTATATTTTTTACCGAATAATAGTAATTAAATGTTATCC TTGATATTGATGTAATTTTGACCTGTTTCAATTTGTTGTACCATTATTGCAGTCATTGGAACTCTGGGACATGACCGAGA ACAAGACAATGACTCTGTCTGCTCATGAAGGTCTAATTGCTGCATTGGCAGTTTCAACTGTAAATGGTTTGGTTGCTTCA GCCAGTCATGACAAGTTTGTCAAGCTCTGGAAGTAACCTGTCTGCCTCTGCAAAACAGGTAGTTTTATCAGTGTTGATCG CAGATTTGGATTTCCTGCTGTAAAAAAATCCCTAAAGCCGCTGTAGTCATGGCTTCATAGCCATCCGATCTTTAATTAGA CGGTTTAAATTTATAAAGACCAATTGTGTATGATTGTCATTTTAAATCCCAACGATTCGATCTTGATTCGACGACTACCA AAATGACTTCAGAAAGTTTTGACTGCATGGAATCCGGATCTGTTGATCACATGACCTTTTATGTTGTATGGTAAATTAAC CTATAGAGATCTCTGTTTCATTATTGTTTACTTAGAGATCTCTGTTCTTGTATCATCTACATTGGCTATTTATAATACCA TTCGGTGAGTGCTGATCCAGTTTCAGGCAGAACCCATGTCTGCAGCGACAACCTAAAAGTGGGAAAATTCAAACGTGCAA ACGTATTTATTTATTACTATATCTTTTTATTTGTGTTGTCGTTTTAGATGTAAATAATGGTTCTCTGAAAGATGAATCAG TACTTATTAACCAGAATAATGTTTGGTTGACACTCCAAACACTTGC
CDS sequence (LotjaGi5g1v0062500.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTCTCAGACTAACTGGGAAGCTGATAAGATGTTAGATGTTTACATCTATGATTACCTAGTGAAGAGGGATTTGAAGGC TTCGGCTCAAGCTTTTCAAGCTGAAGGGAAAGTGTCCTCGGACCCTGTTGCTATTGATGCCCCGGGAGGATTTCTGTTTG AGTGGTGGTCAGTTTTCTGGGACATATTTATTGCCAGGACTAATGAGAAGCATTCAGAGGTTGCTGCATCTTACATTGAG ACACAACTAGTTAAGGCTAGGGAGCAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACA ACAACAACAACAACCACAACCTCAGCAGTCACAACATCAGCAACAACAACATCAGCAACAACAACAGCAACAACAGCACA TGCAGATGCAGCAGATGATGTTACAAAGGCATGCTCAGCAGCAACAGCCGCAACATCAACAGCCACCACCTCAACAACAG GGTAGGGATAGGTCTCATCTCTTAAATGGTGGTACTAATGGGTTAGTTGGAAACGCTAGCACTGCAAGTGCATTAGCAAC AAAGATGTATGAGGAAAGGTTAAAACTGCCCCTTCAAAGGGATTCTTTGGAAGATGCAGCAATGAAGAGATTTGGAGACC AACTCTTGGACCCAAATCATGCCACAATATTGAAGACATCTGGAGCTACTGGCCAGCCTTCAGGGCAAGTTTTGCATGGT GCTGCTGGTGCGATGTCTCCACAAGTTCAAGCTCGTAGTCAGCAATTACCTGGGTCTACTCTGGATATAAAAAGTGAGAT TAATCCTGTTTTAAATCCCAGAGCAGCGGGTCCTGAAGGATCATTGATAGCAATTCCTGGATCTAACCAAGGTAGCAACA ATTTGACTTTGAAAGGGTGGCCACTCACAGGGTTGGAACAACTACGTTCTGGTATGCTTCAGCAACAAAAACCTTTTATA CAGTCTCCTCAACCTTTTCATCAACTTCCGATGTTGACGCCACAACATCAACAACAGCTTATACTAGCACAACAAAATTT AGCATCACCATCTGCCAATGATGACAATAGAAGACTCCGAATGCTACTAAATAATAGGAATATGGGTGTAAGTAAGGATG GTCTTTCAAATCCTGTGGGTGATGTAGTATCAAATGTTGGATCACCTCTTCAAGCAGGTGGCCCTCCTTTTCCTCGTGGC GATACAGATATGTTAATGAAGTTGAAACTGGCTCAGTTTCACCAACATCAGCAGCAGAACGCCAATTCACAGCAGCAGCA ACTTCAACAGCATGCTCTTTCAAATCCGCAATCTCAGACTTCAAATCTTAACATGCATCAGCAGGATAAAGTAGCGGGAG GCAATGTCAATGTCGATGGTAGCATGTCAAACACCTTTAGAGGAAATGATCAGGTTACCAAAAACCAGACTGGTAGAAAG AGAAAACAGCCCGTATCTTCCTCTGGTCCTGCCAATAGCTCAGGAACAGCAAATACGGCAGGCCCATCTCCAAGTTCAGC ACCCTCAACGCCCTCAACGCATACAGCTGGTGATGTGATGTCAATGCCTGCTCTACCTCATAATGGTAGCTCATCAAAGC CATTAATGATGTTTGGCACTGATGGCACCGGAACTCTTACCTCACCTTCCAATCAATTGTGGGATGATAAAGATCTTGAA TTGCAGGCTGATGTGGACCGTTTTGTTGAGGATGGATCTCTTGATGACAATGTGGAGTCTTTTTTATCCCATGATGATAC AGACCCTAGAGATAATGTTGGTCGTTGTATGGATGTAAGCAAAGGATTCTCATTTTCGGAAGTAAATTCTGTACGCGCAA GTACAAACAAAGTTGTCTGTTGCCATTTCTCATCTGATGGGAAATTGCTTGCAAGTGGTGGTCATGATAAAAAGGCTGTT TTATGGTACACAGATTCTCTGAAGCAGAAGGCTACTCTTGAAGAGCATTCATCTTTAATCACCGATGTCCGTTTCAGTCC AAGCATGCCTCGTCTCGCAACATCTTCATATGACAAAACTGTTAGGGTTTGGGATGTTGACAATCCTGGCTATTCGCTTC GTACCTTTACAGGACATTCTGCATCTGTTATGTCACTAGATTTTCACCCTAATAAGGACGACCTTATCTGCTCTTGTGAT TTTGATGGCGAGATACGATATTGGAGCATTAATAATGGCAGTTGTGCTAGAGTGTCCAAGGGTGGTACTGCACAGATGAG ATTTCAACCTCGTCTAGGGAGGTACCTTGCTGCAGCTGCAGAGAACGTTGTTTCTATATTTGATGTGGAGACACAAGCAT GCCGATATTCACTAAAGGGTCATACAAACTCTATACATTCTGTGTGTTGGGATCCTTCTGGGGAGTTTCTGGCATCTGTC AGTGAAGACTCTGTCAGGGTCTGGACTCTTGGAACAGGGGGTGAAGGGGAATGCGTTCATGAGCTTAGCTGTAATGGCAA TAAATTTCACTCATGTGTTTTCCACCCAACGTATCCTTCAATGCTGGTCATTGGTTGTTACCAGTCATTGGAACTCTGGG ACATGACCGAGAACAAGACAATGACTCTGTCTGCTCATGAAGGTCTAATTGCTGCATTGGCAGTTTCAACTGTAAATGGT TTGGTTGCTTCAGCCAGTCATGACAAGTTTGTCAAGCTCTGGAAGTAA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0062500.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSQTNWEADKMLDVYIYDYLVKRDLKASAQAFQAEGKVSSDPVAIDAPGGFLFEWWSVFWDIFIARTNEKHSEVAASYIE TQLVKAREQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQPQPQQSQHQQQQHQQQQQQQQHMQMQQMMLQRHAQQQQPQHQQPPPQQQ GRDRSHLLNGGTNGLVGNASTASALATKMYEERLKLPLQRDSLEDAAMKRFGDQLLDPNHATILKTSGATGQPSGQVLHG AAGAMSPQVQARSQQLPGSTLDIKSEINPVLNPRAAGPEGSLIAIPGSNQGSNNLTLKGWPLTGLEQLRSGMLQQQKPFI QSPQPFHQLPMLTPQHQQQLILAQQNLASPSANDDNRRLRMLLNNRNMGVSKDGLSNPVGDVVSNVGSPLQAGGPPFPRG DTDMLMKLKLAQFHQHQQQNANSQQQQLQQHALSNPQSQTSNLNMHQQDKVAGGNVNVDGSMSNTFRGNDQVTKNQTGRK RKQPVSSSGPANSSGTANTAGPSPSSAPSTPSTHTAGDVMSMPALPHNGSSSKPLMMFGTDGTGTLTSPSNQLWDDKDLE LQADVDRFVEDGSLDDNVESFLSHDDTDPRDNVGRCMDVSKGFSFSEVNSVRASTNKVVCCHFSSDGKLLASGGHDKKAV LWYTDSLKQKATLEEHSSLITDVRFSPSMPRLATSSYDKTVRVWDVDNPGYSLRTFTGHSASVMSLDFHPNKDDLICSCD FDGEIRYWSINNGSCARVSKGGTAQMRFQPRLGRYLAAAAENVVSIFDVETQACRYSLKGHTNSIHSVCWDPSGEFLASV SEDSVRVWTLGTGGEGECVHELSCNGNKFHSCVFHPTYPSMLVIGCYQSLELWDMTENKTMTLSAHEGLIAALAVSTVNG LVASASHDKFVKLWK
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
PANTHER | 2 | 97 | 96 | 0.0 | – | |
PANTHER | 2 | 97 | 96 | 0.0 | – | |
SMART | 8 | 40 | 33 | 5.1E-4 | ||
ProSiteProfiles | 8 | 40 | 33 | 9.642 | ||
Pfam | 10 | 36 | 27 | 6.6E-7 | ||
Coils | 83 | 111 | 29 | - | – | |
MobiDBLite | 110 | 178 | 69 | - | – | |
PANTHER | 136 | 895 | 760 | 0.0 | – | |
PANTHER | 136 | 895 | 760 | 0.0 | – | |
MobiDBLite | 224 | 254 | 31 | - | – | |
MobiDBLite | 413 | 451 | 39 | - | – | |
MobiDBLite | 413 | 553 | 141 | - | – | |
MobiDBLite | 457 | 517 | 61 | - | – | |
MobiDBLite | 525 | 553 | 29 | - | – | |
Gene3D | 587 | 745 | 159 | 7.5E-39 | ||
SMART | 604 | 643 | 40 | 2.7E-5 | ||
SUPERFAMILY | 605 | 895 | 291 | 1.19E-65 | ||
CDD | 607 | 895 | 289 | 5.22812E-64 | – | |
ProSiteProfiles | 611 | 895 | 285 | 39.443 | ||
Pfam | 611 | 642 | 32 | 0.0038 | ||
ProSiteProfiles | 611 | 652 | 42 | 9.673 | ||
SMART | 646 | 685 | 40 | 1.2E-9 | ||
Pfam | 650 | 685 | 36 | 1.3E-6 | ||
ProSiteProfiles | 653 | 688 | 36 | 15.254 | ||
ProSitePatterns | 672 | 686 | 15 | - | ||
SMART | 689 | 729 | 41 | 5.5E-8 | ||
Pfam | 692 | 729 | 38 | 6.0E-5 | ||
ProSiteProfiles | 696 | 738 | 43 | 13.082 | ||
SMART | 732 | 768 | 37 | 170.0 | ||
Gene3D | 746 | 895 | 150 | 3.9E-28 | ||
SMART | 771 | 809 | 39 | 3.0E-9 | ||
Pfam | 774 | 808 | 35 | 8.1E-7 | ||
ProSiteProfiles | 778 | 810 | 33 | 9.907 | ||
SMART | 815 | 854 | 40 | 0.39 | ||
SMART | 856 | 895 | 40 | 3.4E-5 | ||
Pfam | 858 | 895 | 38 | 0.079 | ||
ProSiteProfiles | 863 | 895 | 33 | 12.48 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
---|---|---|---|---|
Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0062500.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…