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LotjaGi5g1v0062500.3

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi5g1v0062500
Transcript ID LotjaGi5g1v0062500.3
Related isoforms 12
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Transcriptional corepressor leunig-like protein; TAIR: AT4G32551.1 transcriptional corepressor LEUNIG; Swiss-Prot: sp|Q9FUY2|LEUNG_ARATH Transcriptional corepressor LEUNIG; TrEMBL-Plants: tr|V7CVF3|V7CVF3_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0062500
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr5:10513465..10534630) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CCCAAATTCTCTGCTTTTCCCTTGAAGTCGTGTTCCTCTGGCTTCGCTTTCTACCGTTCCCTTTTCTCATGCTTCTTTGT CTTTCTGCTACGAGATAAACTCTTGTGTTTGCCGATTGTTACTGCTCAGTTTCCTAGACTTTGAAACCTTCACAACCTCG TTCATTCCCTCACCACCGTTCAAGCTCGTTGTGTCAGAATGTCTCAGACTAACTGGGAAGCTGATAAGATGTAAGTGTTT TTTGCTTTGTGTTTATTTTTTTTTATATTTTCTATTGAATCTTGGTGTTTTAATCAGTTTTGGAACATGGGTTTTTGTTC TTACTCAGAATCTTTGCTTTCTTTTGTTGATTTGGGTTCTGGGTTTGTGGTTTTTCGTTTAATGGTGTTTTAGGTTGGTT TATTTTCCTGGGTTTGGTTTTATATGTGTTAGGTTTTCATGAAAATTTTGATGTGTGTTAGGGTTTTTGAGGCTATGCTA GTATAAGGGGTTGCTTTGCATTGAATGAAAATTTCACTTTTAATTGCTGAACTCTTGGTTCCTGCATTTTTTGTTGATTT GGGTTCTGGGTTTGTGGTTTTTCATTTAATGGTGTTTTAGGTTGGTTTATTTTCTTGGGTTTGGTTTTCATGTATATTTG AGAATATTTTGATGAGTGTGTTAGGGTTTTTTAGGCTATGCAAGTATAAGGAGTTTCTTTGCATTGAATGAAAATTTCAC TTTTAATTGTTGAACTCTTGGTTCCTGCATTTGGGTTTGCTGATATTTATGGTCACGAGATATACTCAGTGTAAAGATCT AAACTTTGATTCTAACAGTTCAATTGCTTATGCAACCTGTGTTTGCTTGTGCTATGGGATTTCAGGTTAGATGTTTACAT CTATGATTACCTAGTGAAGAGGGATTTGAAGGCTTCGGCTCAAGCTTTTCAAGCTGAAGGGAAAGTGTCCTCGGACCCTG 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ATTGTAAGCTATCGGTTACTCGAATATGTCTAGCCAAGATATATTATCATGGTGAAAGATTTATACTGATCCTTTATGAA GATTGCATTTGCTGTTGCACAAAGCAAATAGGCAACGTGGTTGTTTCTACTGGAGAGAGGTCTTATAAGAAGAAACACTA ATTATACTTTCAATAAGAATAAAATACTTCTGACACTCCTGTATATATTTCCAAACAATTTTGTACTTCAACTGTAATGG TATATACTCTATTAATTTCTCTACATAAAGCATTGCTGATTTTACTGTTTTGAATGTGGCACCATGATTGTAGGGTCATA CAAACTCTATACATTCTGTGTGTTGGGATCCTTCTGGGGAGTTTCTGGCATCTGTCAGTGAAGACTCTGTCAGGGTCTGG ACTCTTGGAACAGGGGGTGAAGGGGAATGCGTTCATGAGCTTAGCTGTAATGGCAATAAATTTCACTCATGTGTTTTCCA CCCAACGTATCCTTCAATGCTGGTCATTGGTTGTTACCAGGCAAGTCTATATCCATTCTTAGTTTCATTTCCATTTTGAG CATTGATAGAATCGCAAATTTTTGAAATTGATTTCTTTATTTGCAAAATTAGAGGAATTGGTTTGGTCTTGATTGGATTC AAGTCATGTATTTACAGTTTAGAAATGTGCATGATTTTGTTGGGTTTGAGTGCATTTGATTTGATTTAGTTATTTAATTG ACAATTTAACCTTTATCAGTGCACCCACCTCATCTGTTCTAAGTTGGGAACAGTAAAATCTTCAAAACAAAATGATTTCG TTTCACCTTCTTGGTGTTCCAAATATGGTGATTGTTTTGCAAATCAATTGATTTCATACTTTTGTATTGAATGAGAACTG ATTTCTAGCAACTGCGGCAATCAAAGCCTTTCCCATAGGTGAAATCGGCTACATGGAATAACTGGTGCCATAATGCCTTC TTATGAATCCAGTTCAACCCTTTGCAATCCCTATAAATTCTTCGTCACTAGCACCCTTGGCTGCGTCCTTTGAAATGCTT CACCATCTTGATTATTCTTATTCTTCAAGTATCCCTGGAATTCTTTTCCGAACACTTGGACATTTATGACGAGCTGTTAG GGTTAGATTAACCCAAACAGCCAACCAACAAAAGAATAGGGATAAAAGGGTAATTGTCTGAATAAAAATACTGAATCTAT TATTAAAATAGAAACCCAAGGGGCTCGAGTTGAAGAAATGAACATGGTCTAAAAGAACTAAGGCAATGAGGAGAAGAGTT GGTTGAATGATGTGTGTTCATGGAAGCTCGAATGCGGAGCCAAGAGACTGCAGTGCAAGAGATATTGCTGCAGCAAGAGG AGCTTCAACGAGAATACGAAAACAGGGACTGAAGTAAGTGGGAGAAGCATAAATTTCCGCAGGTATAATATGCTGAATAT CAGGAAAGGAGGAAGAAGGGCTTATGTTTTAAATGTGATGAGTTCTCACTTAGGCATGACTGCATGAGTGCAAGATTAAG CAGTTAAGGGTCATACATGGTATTAGAGGAAGATCTTGTAGACCAAAGAGATGAATTGGAGGGTGAGTAGGAAATCATAG AATAGGGAGTGATACCAGCTCAACTCGATTTGCATAGTATAGCATGGCTGACCAGTAAAAATTCCTTAAAATTGTGGGGT CAATTGTGTGATCCGAAGGATGCCTCACATAACTTATTTTTCATAAGCTAGTTGAGAATCTGTAGTTGCTGTAGGAAAAA ACCTCTCAGTATTTGGTTAAGGTTGGCGATGGCTATAATGTGAATGCAAATGGGGTTTTTAGAGATCTAAATCATGACAC CTTGATATATTTGGATCACAATCTTCAGTTACTACGCAGAAATCTCACCCATCAAAATAATTTAAAATCTTTGTAAATAT GGTTTAGGTTGATGTGAGCCATCGGATTACAACTTCATCACCCTGCAGTTATTTAATTACTCTAGGGGATCTAAGTCCTA TCTATTTTATTCTCTGGTGTTTCATTTAAATACACGCTAATTCATTCAATGTCTTTCTTTTGCTGTATCAATTGTAATTG TTATTTTGATGCGGCTTCTCTTTAGAATTCTGATCTTCTGATTATATTTTTTACCGAATAATAGTAATTAAATGTTATCC TTGATATTGATGTAATTTTGACCTGTTTCAATTTGTTGTACCATTATTGCAGTCATTGGAACTCTGGGACATGACCGAGA ACAAGACAATGACTCTGTCTGCTCATGAAGGTCTAATTGCTGCATTGGCAGTTTCAACTGTAAATGGTTTGGTTGCTTCA GCCAGTCATGACAAGTTTGTCAAGCTCTGGAAGTAACCTGTCTGCCTCTGCAAAACAGGTAGTTTTATCAGTGTTGATCG CAGATTTGGATTTCCTGCTGTAAAAAAATCCCTAAAGCCGCTGTAGTCATGGCTTCATAGCCATCCGATCTTTAATTAGA CGGTTTAAATTTATAAAGACCAATTGTGTATGATTGTCATTTTAAATCCCAACGATTCGATCTTGATTCGACGACTACCA AAATGACTTCAGAAAGTTTTGACTGCATGGAATCCGGATCTGTTGATCACATGACCTTTTATGTTGTATGGTAAATTAAC CTATAGAGATCTCTGTTTCATTATTGTTTACTTAGAGATCTCTGTTCTTGTATCATCTACATTGGCTATTTATAATACCA TTCGGTGAGTGCTGATCCAGTTTCAGGCAGAACCCATGTCTGCAGCGACAACCTAAAAGTGGGAAAATTCAAACGTGCAA ACGTATTTATTTATTACTATATCTTTTTATTTGTGTTGTCGTTTTAGATGTAAATAATGGTTCTCTGAAAGATGAATCAG TACTTATTAACCAGAATAATGTTTGGTTGACACTCCAAACACTTGC 

CDS sequence (LotjaGi5g1v0062500.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGTCTCAGACTAACTGGGAAGCTGATAAGATGTTAGATGTTTACATCTATGATTACCTAGTGAAGAGGGATTTGAAGGC TTCGGCTCAAGCTTTTCAAGCTGAAGGGAAAGTGTCCTCGGACCCTGTTGCTATTGATGCCCCGGGAGGATTTCTGTTTG AGTGGTGGTCAGTTTTCTGGGACATATTTATTGCCAGGACTAATGAGAAGCATTCAGAGGTTGCTGCATCTTACATTGAG ACACAACTAGTTAAGGCTAGGGAGCAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACA ACAACAACAACAACCACAACCTCAGCAGTCACAACATCAGCAACAACAACATCAGCAACAACAACAGCAACAACAGCACA TGCAGATGCAGCAGATGATGTTACAAAGGCATGCTCAGCAGCAACAGCCGCAACATCAACAGCCACCACCTCAACAACAG GGTAGGGATAGGTCTCATCTCTTAAATGGTGGTACTAATGGGTTAGTTGGAAACGCTAGCACTGCAAGTGCATTAGCAAC AAAGATGTATGAGGAAAGGTTAAAACTGCCCCTTCAAAGGGATTCTTTGGAAGATGCAGCAATGAAGAGATTTGGAGACC AACTCTTGGACCCAAATCATGCCACAATATTGAAGACATCTGGAGCTACTGGCCAGCCTTCAGGGCAAGTTTTGCATGGT GCTGCTGGTGCGATGTCTCCACAAGTTCAAGCTCGTAGTCAGCAATTACCTGGGTCTACTCTGGATATAAAAAGTGAGAT TAATCCTGTTTTAAATCCCAGAGCAGCGGGTCCTGAAGGATCATTGATAGCAATTCCTGGATCTAACCAAGGTAGCAACA ATTTGACTTTGAAAGGGTGGCCACTCACAGGGTTGGAACAACTACGTTCTGGTATGCTTCAGCAACAAAAACCTTTTATA CAGTCTCCTCAACCTTTTCATCAACTTCCGATGTTGACGCCACAACATCAACAACAGCTTATACTAGCACAACAAAATTT AGCATCACCATCTGCCAATGATGACAATAGAAGACTCCGAATGCTACTAAATAATAGGAATATGGGTGTAAGTAAGGATG GTCTTTCAAATCCTGTGGGTGATGTAGTATCAAATGTTGGATCACCTCTTCAAGCAGGTGGCCCTCCTTTTCCTCGTGGC GATACAGATATGTTAATGAAGTTGAAACTGGCTCAGTTTCACCAACATCAGCAGCAGAACGCCAATTCACAGCAGCAGCA ACTTCAACAGCATGCTCTTTCAAATCCGCAATCTCAGACTTCAAATCTTAACATGCATCAGCAGGATAAAGTAGCGGGAG GCAATGTCAATGTCGATGGTAGCATGTCAAACACCTTTAGAGGAAATGATCAGGTTACCAAAAACCAGACTGGTAGAAAG AGAAAACAGCCCGTATCTTCCTCTGGTCCTGCCAATAGCTCAGGAACAGCAAATACGGCAGGCCCATCTCCAAGTTCAGC ACCCTCAACGCCCTCAACGCATACAGCTGGTGATGTGATGTCAATGCCTGCTCTACCTCATAATGGTAGCTCATCAAAGC CATTAATGATGTTTGGCACTGATGGCACCGGAACTCTTACCTCACCTTCCAATCAATTGTGGGATGATAAAGATCTTGAA TTGCAGGCTGATGTGGACCGTTTTGTTGAGGATGGATCTCTTGATGACAATGTGGAGTCTTTTTTATCCCATGATGATAC AGACCCTAGAGATAATGTTGGTCGTTGTATGGATGTAAGCAAAGGATTCTCATTTTCGGAAGTAAATTCTGTACGCGCAA GTACAAACAAAGTTGTCTGTTGCCATTTCTCATCTGATGGGAAATTGCTTGCAAGTGGTGGTCATGATAAAAAGGCTGTT TTATGGTACACAGATTCTCTGAAGCAGAAGGCTACTCTTGAAGAGCATTCATCTTTAATCACCGATGTCCGTTTCAGTCC AAGCATGCCTCGTCTCGCAACATCTTCATATGACAAAACTGTTAGGGTTTGGGATGTTGACAATCCTGGCTATTCGCTTC GTACCTTTACAGGACATTCTGCATCTGTTATGTCACTAGATTTTCACCCTAATAAGGACGACCTTATCTGCTCTTGTGAT TTTGATGGCGAGATACGATATTGGAGCATTAATAATGGCAGTTGTGCTAGAGTGTCCAAGGGTGGTACTGCACAGATGAG ATTTCAACCTCGTCTAGGGAGGTACCTTGCTGCAGCTGCAGAGAACGTTGTTTCTATATTTGATGTGGAGACACAAGCAT GCCGATATTCACTAAAGGGTCATACAAACTCTATACATTCTGTGTGTTGGGATCCTTCTGGGGAGTTTCTGGCATCTGTC AGTGAAGACTCTGTCAGGGTCTGGACTCTTGGAACAGGGGGTGAAGGGGAATGCGTTCATGAGCTTAGCTGTAATGGCAA TAAATTTCACTCATGTGTTTTCCACCCAACGTATCCTTCAATGCTGGTCATTGGTTGTTACCAGTCATTGGAACTCTGGG ACATGACCGAGAACAAGACAATGACTCTGTCTGCTCATGAAGGTCTAATTGCTGCATTGGCAGTTTCAACTGTAAATGGT TTGGTTGCTTCAGCCAGTCATGACAAGTTTGTCAAGCTCTGGAAGTAA 

Protein sequence (LotjaGi5g1v0062500.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MSQTNWEADKMLDVYIYDYLVKRDLKASAQAFQAEGKVSSDPVAIDAPGGFLFEWWSVFWDIFIARTNEKHSEVAASYIE TQLVKAREQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQPQPQQSQHQQQQHQQQQQQQQHMQMQQMMLQRHAQQQQPQHQQPPPQQQ GRDRSHLLNGGTNGLVGNASTASALATKMYEERLKLPLQRDSLEDAAMKRFGDQLLDPNHATILKTSGATGQPSGQVLHG AAGAMSPQVQARSQQLPGSTLDIKSEINPVLNPRAAGPEGSLIAIPGSNQGSNNLTLKGWPLTGLEQLRSGMLQQQKPFI QSPQPFHQLPMLTPQHQQQLILAQQNLASPSANDDNRRLRMLLNNRNMGVSKDGLSNPVGDVVSNVGSPLQAGGPPFPRG DTDMLMKLKLAQFHQHQQQNANSQQQQLQQHALSNPQSQTSNLNMHQQDKVAGGNVNVDGSMSNTFRGNDQVTKNQTGRK RKQPVSSSGPANSSGTANTAGPSPSSAPSTPSTHTAGDVMSMPALPHNGSSSKPLMMFGTDGTGTLTSPSNQLWDDKDLE LQADVDRFVEDGSLDDNVESFLSHDDTDPRDNVGRCMDVSKGFSFSEVNSVRASTNKVVCCHFSSDGKLLASGGHDKKAV LWYTDSLKQKATLEEHSSLITDVRFSPSMPRLATSSYDKTVRVWDVDNPGYSLRTFTGHSASVMSLDFHPNKDDLICSCD FDGEIRYWSINNGSCARVSKGGTAQMRFQPRLGRYLAAAAENVVSIFDVETQACRYSLKGHTNSIHSVCWDPSGEFLASV SEDSVRVWTLGTGGEGECVHELSCNGNKFHSCVFHPTYPSMLVIGCYQSLELWDMTENKTMTLSAHEGLIAALAVSTVNG LVASASHDKFVKLWK 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 2 97 96 0.0
PANTHER 2 97 96 0.0
SMART 8 40 33 5.1E-4
ProSiteProfiles 8 40 33 9.642
Pfam 10 36 27 6.6E-7
Coils 83 111 29 -
MobiDBLite 110 178 69 -
PANTHER 136 895 760 0.0
PANTHER 136 895 760 0.0
MobiDBLite 224 254 31 -
MobiDBLite 413 451 39 -
MobiDBLite 413 553 141 -
MobiDBLite 457 517 61 -
MobiDBLite 525 553 29 -
Gene3D 587 745 159 7.5E-39
SMART 604 643 40 2.7E-5
SUPERFAMILY 605 895 291 1.19E-65
CDD 607 895 289 5.22812E-64
ProSiteProfiles 611 895 285 39.443
Pfam 611 642 32 0.0038
ProSiteProfiles 611 652 42 9.673
SMART 646 685 40 1.2E-9
Pfam 650 685 36 1.3E-6
ProSiteProfiles 653 688 36 15.254
ProSitePatterns 672 686 15 -
SMART 689 729 41 5.5E-8
Pfam 692 729 38 6.0E-5
ProSiteProfiles 696 738 43 13.082
SMART 732 768 37 170.0
Gene3D 746 895 150 3.9E-28
SMART 771 809 39 3.0E-9
Pfam 774 808 35 8.1E-7
ProSiteProfiles 778 810 33 9.907
SMART 815 854 40 0.39
SMART 856 895 40 3.4E-5
Pfam 858 895 38 0.079
ProSiteProfiles 863 895 33 12.48

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi5g1v0062500.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…