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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0076600 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0076600.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Anaphase-promoting complex subunit 1; TAIR: AT5G05560.2 E3 ubiquitin ligase; Swiss-Prot: sp|Q9FFF9|APC1_ARATH Anaphase-promoting complex subunit 1; TrEMBL-Plants: tr|G7K258|G7K258_MEDTR Anaphase-promoting complex subunit 1; Found in the gene: LotjaGi1g1v0076600 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:11027178..11071146) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GGGGGAATTAAAGCCCGCTTCAGCGCTTCTTCTTTGATTTCACACTCGCTTCTTCTCTCTCAAGGGTGCTTCCTCTCTCG CCGACCCTCCCTCACACCGGCGCTGGTTCCTCCGCCGTGGGTTCTCCGCCGTGGGTTCTGCTTCTTCACTCGCTTAACTC GTTTCTTCAGGGGCGGGACACTCGCTTCCTGTTATGCGACACACTCTACACTTCACTTTCCCCTCCATTTTCCACACCAC CATTCTCCACCTTCACTGTGAGCTCCGAAAATGTCCATAGGCGAGCGTCGCTTATCGTTACTGGGCGAGTTCAAACCCTT CGGCCTCATAGCCGAAGCTCTCGACGGAAAACCCCCTGACACTGTAACTGACAAGTACGATTACTTCCTTTTCGATCCAG AAATCGCTCGAGATAGAGACGCTGAGGACGATTGCGATGAAGTTGCTTCCGCATTGAACAATCGCGGCGATCACGAGCTT TTCATCCGCGGGAATCGGTAATTTCTTTCTTTCCTAAACCCTTGTTTCTGTGCTTAGTTGCTTGTGAAGATGCTGAAGCT AACAACTAGGAAATGGAAAGAGAAATTAAACAGTTGATTTGCAATTTTCAGTTTCAAATACTGTTGTTGTTTTTGCTGAG CATGATTATCACTTTATCTGAAATTACATGTGCTTGTTACAGGATTATATGGTCGATTGGCGCGAGAGTTTTTAAGCGAT TTACCTTGCCGCATCCGATCGTTAAGGTGTGTTTTTTCGACCTTTCATGCCTATAGTTTGGTTTCCTTGACCTCTTACAA TTGTCGCTTTCGTACGACTCGATTTTCCTTGGTTGGTGAAGGAAGGTTATTGTTTCTTTTGTGGACATTTTTTAAAATTT TGGGAATTTTTCTTTGCAATTTTTTCGTTAAGCGGGAAGTCAAAGCTACTAGTTTGAGACTGTAGAGAAAATGCTCTACA 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AATATTTGCATGTTGAAATTACTGTGGGATTGACATCAAAATAAAAGAAAATGAATTCATTTGATTCAAATAAAAAGGAC TGAGAGTTCGAGAACCTCAGCTTCTCTCTCTAGAATCCCTATTCTTACAATATGGATGCCTTACAATGAGTCCTGTTTTA TGCCCTACTAACTTCCGGACTAACCATTCATACTTTAGGCTGGTTAGCTATTATGACAATAACAACCTAAAAATCATCCC ATAACTGTCACTCCCCTATTCCTATCAGCGATACGCTCAGTTTCATCTATCTTTGCATCATAATTAACCAGACATGCCTT GTCGAGGGCTTTTCTTCATCGAGGTTTTGTTTTCTTTATCTTATATCAGTTCATAAATCATATTCTGTTATTCCCTAGAT TTGTATTGAAGATCAAAGATGATAAGCAATGATGCTTTAACTATTTACATACACTTGTTGCATATACTATTACATTACAC TCCTTTTCTGTAAAGATGGTGTAATCTCTAAATAAACTAATGAAACATGCTTGCAGATCTGATGTTGATTTCAAGGAATT TTGCTTGCAAGTATTATTTGAGTGTGTGAGCAAGGACAGACCAGCTCTTTTACAGGTAATGTACTTAGAATTTAGAAAGG CCAATTTTTTTTTTCTCTAAGTTCAACAAAATAATGATGGTCCAATATATGGTGTGTTTGTATTGCCATCAGGACATGTA AACATGAGAACTTGCATGTAGTGTCATCATTGAGGTTGACATGCGTCCTTTTTTTTGGAGGGGGGCGGGACTGCAACACG ACACATGCTTAAGAACTTTAAATGTTGGCACAGGGATTAAGTTGTTTAAATTATTTGTGTGATTCACATGGAAAGTTGTA ATACAATTGGATGCATCTCATGATTTATGATTTGCTGACCCAAATGTAAGACTTGTAAAATGTGATATTTACCACTGCAA 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ACATGGATAATTGTAAATGTTGAATTCAGAGGACAATGTGCAAAAGTATTCATACTGATTACAAACAGGTAAGTGTTCAA ATAAAATCACAATTGTAACACTCTGGCTCAACCCATTTTAGATGAAAGAAAAAGGAAAAGAAGAGAGGAAAATGATATAT ATTATGACGTGATAGGTTGAGAAGATAGAAGAGAAAAATTAAGTATATATGAGATGTTGTTATTCTTCAGGTGTTTAAAA ATCATGATCATTTTGAGTATTGCAAGTGAGATAAATGATTTTGTTTGCCGAAATAATCCTCCATATTTATCTACATACCA ATTTCACACGACTTCATAAACCTTCATTCTTATCAAGTTCGGATAAAGGAAAAAAAATTGTTCCTCTTTTAAAATAATAT TAATTATGATGTTTTTTTACTTGTAATTCTATATCCATACTAATTCTGAAGTATGATAAATAATTCTCAACCAGACTAAA GATTAAAGATAGTCACCGAATGATAACTCAAGTTGTATGAGTTATGAGGCATATGAGTTTGGTAGAGGAGGTCCAAGGAT CAAACCTTGGAGGGAATAATTTATCTTTCCAATGTACTAAAAAAAGATTAAAAGATAAATTGGAAAGTTTTTTAAAAAAT GAAGAAATTCCTAATAAAATTTTATATTATATTTGTAATTATTTTTAATTTGACTAATTATATAAATAAAATTGAAGGTA GCACGATAAGTTAGAACACAATGACGCAACACATTTGTTTCAAAGTGTAAATATTTTTTACACATACATCCAATGATATG TTGCCAAATCAGAAAATATGTTTTTAATTTAATTAAAATAAAAATGAACATAACTGCTTTTGAATATGTGGTATTCAGTT ATTAGACGTCTGCGTAAAATTATTGGGTACAACCATTAAACTCTTTTATTTATATATCCTTATCTATGACATTTTTTTTT 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0076600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
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GGAACCACCCTTTCCCTTAAAATTTCTCCAAGTTTATTCAGATGGCTTGAGAACTGCTTGCAACATGGATGGAGCTGTGC TAATATTAGTGATCTTCCATCTTTAGTCCTTAAAGATGGATGTTCTGTGGTAAGTTTGGCACGGAAAATAGTTTGCTTTT ACAGTATATTATCTGGTGCCAATTTGCTCGGAAAGAAGCTTTCTTCTGGTGTTTACTGCAACATCGCCACTGGATCACAT TCTTCAAAAGAGGAGCTTACTATGTTAGCGATGGTTGGTGAAAGATTTGGACTTCAACAGCTGGATTCACTGCCTTCTGG TGTATCTCTTCCACTTCGTCATGCATTAGATAAGTGTCGAGATTCTCCTCCCAATAACTGGCCAGCAGCTGCCTATGTCC TTCTTGGTCGCCAAGATTTGGCAATGTCAACTTTGGCACGTGAATGCAATTATAAAGATATTGAAACACCAACCAATGTT AATGTAATCTCTATGTCCACACCTTATATGCTAAATCTGCATCCAGTGTCTTCTACTATTTCTGATGCAATTGGATTCGA AGGAACAAAGTTTGAGGACACAGATTCAGTTGATGGGTCTACGACGGATGGTATGGAACATATTTTCAACTCTAGTACAC AGTTGCGCTATGGTCGTGATCTAAGATTGAACGAGGTTAGACGTCTTTTGTGCTCTTCAAGACCTGTGGCAATTCAAACA TCTGTTAACCATAGTGCTTCTGATCAGGACCTCCAGCAGGCTCAATTGTGGCACCTTGCCCAAAGAACCACTTCACTTCC TCTTGGACGTGGAGCATTTACTCTCGCAACCATACATACACTCCTGACTGAGGCTTTTATTGTGCCGAAGCTTGTATTAG CGGGTCGGTTGCCGGCCCAACAGAATGCAACCGTTAATCTCGATCCCAACATCAGGAACATACAAGAACTAAGGTCTTGG CCTGAGTTTCATAATGCTGTTGCTGCAGGCCTTAGACTAGCCCCCTTTCAGGGAAGGATGTCAAGAACATGGATAATTTA TAATAAACCCGAGGAGCCAAATTCTGTTCATGCCGGACTACTTCTTGCTCTAGGAGTGCATGGATATCTGCGTGTATTGA CTATTACGGACATTTACCAGTATTTATATCAGGAGCATGAAAGTACTACTGTAGGATTGATGCTTGGCCTCGCAGCTTCT TATAGAGGCACTATGCAACCAACTATATCAAAGAGTCTTTGTGTTCATATTCCTGTACGTCATCCATCATCCTATCCAGA ATTGGAGGTTCCAACCTTGCTTCAGTCTGCAGCTTTAATGTCTCTGGGTATTCTTTATGAAGGTTCAGCTAACCCACAAA CAATGCAGGTTTTATTGGGTGAAATTGGGCGCCGAAGTGGGGGTGACAATGTTCTTGAGCGAGAGGGTCATGCTGTTTCC GCGGGATTTGCTCTGGGTCTTGTTGCACTGGGACGGGGAGAAGATGCACTTGGCTTTATTGAGACATGTGTGAATCGTCT GTTTCTCTACCTTGGTGGCAATGTTCACAGTGAGAAATCTCATTTTTCGACAATCTCAATGGACGAAAATCGTGGTTCTG CGCAGATGATGGATGGTACAACAGTCAATATTGACGTCACTGCACCTGGAGCCACAATTGCTCTTGCTTTGATGTTTTTA AAGACAGAATCTGAGGCTATCGTGTCTAGGCTCTCAATTCCAAGCACACGTTTTGATTTGCAATATGTACGGCCTGACTT CATAATGCTTCGAGTCATTGCTCGAAATTTAATAATGTGGAGCAGGGTTCATCCCTCAAAAGATTGGGTTTGGTCCCAAA TTCCTGAAATTGTGAGATGTGGTGTAGAAGGCCTTGAAGGTGATGACAATGATATTGACGATATGGACGCTGAGGCTTTT ATACAAGCCTATGTTAATATAGTAGCTGGAGCTTGTATATCTCTTGGACTGGTTTTTGCTGGCACAAGAAATGGAGACGC CCAGGAATTGCTTTATGAATTTGCTATATACTTTCTCAATGAGATCAAGCCCGTTTCCCCTACAAGTGGAAAGTTTTTGC CAAAGGGACTGTCTCGCTACATTGATCGGGGCACATTGGAGACATGCCTTCACCTTATCGTTCTTTCACTATCGGTGGTT ATGGCTGGATCTGGACATTTACAGACCTTTCGGCTGTTGAGATTCCTTAGGAGCAGAAATTGTGCAGATGGGCAGTCAAG TTATGGTATTCAAATGGCAGTAAGCTTAGCTATTGGTTTCTTATATCTTGGTGGTGGAATGAGAACATTTTCAACAAACC GTAGTTCCATTGCTGCTTTGCTCATTACTCTATATCCACGCTTGCCCACGGGTCCAAATGATAATAGGTGCCACCTTCAG GCATTTCGCCATCTGTATGTCCTTGCAACAGAGGCACGATGGATTCAGACAGTTGATGTTGACACAGGTCTGCCTGTTTA TGCTCCTGTTGAGGTCACAGTCAGAGAAACTGAGCATTATGCAGAATCAAACTTTTGTGAGGTCACCCCTTGCCTTCTGC CAGAACGAGATATTTTGAAAAGAATACGTGTTTGCGGGCCTCGCTACTGGCCTCAAGTTATAGACTTTACCCCTGATGAT AAACCTTGGTGGAATTTCGGTGACAATAATAATCCGTTTAATTCTGGTATTCTTTTTATCAAAAGAAAAGTTGGAGCTTG TTCATATGTTGATGATCCCATTGGGTGCCAGTCACTACTGTCACGAGCAATGCACAAGGTGTTTGGCCTGACAAGTTCAA AACCATCTGATACAATCACTGACATCCATAGTGTATCTGGTTCTATCTCAGTTGATCAGTTAGTCAGTACCTTCTCATCT GATCCTAGTTTGATTGCTTTTGCACAACTATGCTGTGATCCCTCTTGGAATAATAGATCTGATGTTGATTTCAAGGAATT TTGCTTGCAAGTATTATTTGAGTGTGTGAGCAAGGACAGACCAGCTCTTTTACAGGTATATTTATCATTATACACAACGG TTGAATCAATGGTTGATCAAATTGCTACTGCTGCCATTGTTTGTGGTGACTCTCTCTCTATATCTGGTTTTAAGCTTTCG CTGACTTATATCGAGGCATTGATGTCCGGAAAATTATCTTCACCAAAAGGCGGTATTGTACAATCAGCGTTCATTGGTTC TCTTAGGAAGAAAGTGGAAGAGCTCCTAAATTGCTCTCAGGAATTGAAGGATGATTTTCATACATATTTGAAATTGGGAA AATGGCCTGATGGGGAATCCCAAGATAAACGTTCGATTCTTCTTTCTTGCTATCTTCAGTGGTTTGACGTACCAGCTTCA TCCGTAATCAGGCTAGCTATAGATCGAGTCAAACCTAAGCTTATGTCATCATCTTCAGTTCCCTTGTTGCGTCTGTGTTT TCCAAGAACTCATATCAATGTTATTAGCGAGATAGATAGATGTTTGAGATGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0076600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSIGERRLSLLGEFKPFGLIAEALDGKPPDTVTDKYDYFLFDPEIARDRDAEDDCDEVASALNNRGDHELFIRGNRIIWS IGARVFKRFTLPHPIVKVCWCHLGHTAEALLCVLQNKCLMIYNTSGEIVSLPLPRTITSIWPLPFGLLLQQEVEATTPSR IPFSSTSPLFSARDILLSSSGHIQKGEGSLVSSHLILMDPLDEEQPTFIQERGKLNVMKEYDEKTIWTSDLVPLMASYNK GKMQHSLWVAEIVNYNFDEAATSSLNINPMGVLPKHLSFRRIWQGKGSQTAACKVFMATDDDTAPIVCFFHQEQKKMLSV SLQSVEINSEIVFDVKPDTSWIIAAVAASPVTVTRPRVKVGLLPYSDILVLTPENVLLLYSGKQCLCRYVLPSCLNKDKI LHDWKLPETSSVPMDLKITGLADAVEGRVNVVVNNRQMFRCALRQSPSSSLANDCITALADGLSSSFYRHFIGLLWKNDD PADLSETESSVDSEWGSFCHVIMQICGKYNIISQKRSGPVSHSAWDFLLSSQFHNNFCKVNSMFGVSCAAPLNQLESNPP KSSIDGKQSSEKPFYNELLMESLESLHALYESLKLDSLRKRDLELLAILLCNMADFLGENNYMDHYIRDFPGLCKKFQMS GTTLSLKISPSLFRWLENCLQHGWSCANISDLPSLVLKDGCSVVSLARKIVCFYSILSGANLLGKKLSSGVYCNIATGSH SSKEELTMLAMVGERFGLQQLDSLPSGVSLPLRHALDKCRDSPPNNWPAAAYVLLGRQDLAMSTLARECNYKDIETPTNV NVISMSTPYMLNLHPVSSTISDAIGFEGTKFEDTDSVDGSTTDGMEHIFNSSTQLRYGRDLRLNEVRRLLCSSRPVAIQT SVNHSASDQDLQQAQLWHLAQRTTSLPLGRGAFTLATIHTLLTEAFIVPKLVLAGRLPAQQNATVNLDPNIRNIQELRSW PEFHNAVAAGLRLAPFQGRMSRTWIIYNKPEEPNSVHAGLLLALGVHGYLRVLTITDIYQYLYQEHESTTVGLMLGLAAS YRGTMQPTISKSLCVHIPVRHPSSYPELEVPTLLQSAALMSLGILYEGSANPQTMQVLLGEIGRRSGGDNVLEREGHAVS AGFALGLVALGRGEDALGFIETCVNRLFLYLGGNVHSEKSHFSTISMDENRGSAQMMDGTTVNIDVTAPGATIALALMFL KTESEAIVSRLSIPSTRFDLQYVRPDFIMLRVIARNLIMWSRVHPSKDWVWSQIPEIVRCGVEGLEGDDNDIDDMDAEAF IQAYVNIVAGACISLGLVFAGTRNGDAQELLYEFAIYFLNEIKPVSPTSGKFLPKGLSRYIDRGTLETCLHLIVLSLSVV MAGSGHLQTFRLLRFLRSRNCADGQSSYGIQMAVSLAIGFLYLGGGMRTFSTNRSSIAALLITLYPRLPTGPNDNRCHLQ AFRHLYVLATEARWIQTVDVDTGLPVYAPVEVTVRETEHYAESNFCEVTPCLLPERDILKRIRVCGPRYWPQVIDFTPDD KPWWNFGDNNNPFNSGILFIKRKVGACSYVDDPIGCQSLLSRAMHKVFGLTSSKPSDTITDIHSVSGSISVDQLVSTFSS DPSLIAFAQLCCDPSWNNRSDVDFKEFCLQVLFECVSKDRPALLQVYLSLYTTVESMVDQIATAAIVCGDSLSISGFKLS LTYIEALMSGKLSSPKGGIVQSAFIGSLRKKVEELLNCSQELKDDFHTYLKLGKWPDGESQDKRSILLSCYLQWFDVPAS SVIRLAIDRVKPKLMSSSSVPLLRLCFPRTHINVISEIDRCLR
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 1349 | 1349 | - | – | |
| PANTHER | 14 | 264 | 251 | 0.0 | ||
| Pfam | 110 | 207 | 98 | 2.4E-14 | ||
| PANTHER | 285 | 1801 | 1517 | 0.0 | ||
| Pfam | 1290 | 1320 | 31 | 2.9E-4 | ||
| Phobius | 1350 | 1367 | 18 | - | – | |
| Phobius | 1368 | 1387 | 20 | - | – | |
| Phobius | 1388 | 1407 | 20 | - | – | |
| Phobius | 1408 | 1803 | 396 | - | – | |
| Pfam | 1593 | 1758 | 166 | 1.0E-34 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Cellular component | Anaphase-promoting complex | A ubiquitin ligase complex that degrades mitotic cyclins and anaphase inhibitory protein, thereby triggering sister chromatid separation and exit from mitosis. Substrate recognition by APC occurs through degradation signals, the most common of which is termed the Dbox degradation motif, originally discovered in cyclin B. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0076600.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
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