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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0210100 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0210100.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | ATP-dependent RNA helicase-like protein; TAIR: AT5G08110.3 UBQ, helicase-c and DEAD-like helicase domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q05549|HRQ1_YEAST ATP-dependent helicase HRQ1; TrEMBL-Plants: tr|K7KW92|K7KW92_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0210100 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:45977252..46002591) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AAATTGGAGGGAGTGGTGTGTAAGTCTGCCGGTTTGTTCCGCAGAGGAAACCGCAATCAATAGAAGAGAGGGAACCAAAT TCCCATGAAGTTCAAGAGACAACAGCAATGGCAGAGAACAACGAGAAAGAAATCCAAATCCGAACCCTAACTGGTGAATC CACTACTCTTCACATCACTCCCTCCGCCACCGTCCAACACCTCAAGCTCCTCCTCAACCACTCATTCTCACCCGCCACAA ACTCCCCAAATTTCCACCTCTTTTTCAAGGCAAGCACACTCACACACTCTTTCAATTTCACTATCCATTCACTCACACAC TATTCGAATTTCGCGATGCGAAGCAATGGCATTTTGCTATGAATGCGAGGTACTCACGCATTGCTTGTCTGTTTCAGGGT GAAAAATTGCGATTGCAGGCAAAGATTGGTTCTTACCCAATTCAACTAGGCGAGTTTCTCGTCCTGGTTCCCTTTTCCAA GAAGGATTCAACTTCAACCGGGACGCAAAACCCGGACCCGGTTCTCGATTCTTCAAATGTTGCTAACAGCGCCTCTGGTT CAACCTCTAACCTTGCTGATTCCACATGGTCTAATATCATGGAGGATTTGTCGCATTTGCGTGATGGCACCGCTGAATGT GGCGATAACAGTGCATCTAATTCAGAGTTTGGAGCATTTGCTTCTGAACCAAGTAAAGGGGGTTTAGGTTTAGGTTTAGG TTTAGGTCAGGAGAAGCAGATTGAGCTTCCTTATCATCTCATACTGAACACGCTGGATTGTACTTGCGTTTTCAGTGAGC ATAATTGCGAGGTTTTTTCGAAGGTTTTGGAGTCTGTGAACTGTTTATCTGACCTGCCTCTGGGACACTGCAAGCTGTTG AGAAAAGCACGTTTGGAGGGAGCTTTTGTCAAGGGTGGTGTTACATGCTTGTGTCCACCATGGTTGAAGACAGTAGTAAA 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TTGCAATAGATTTGTTTGTTTTTCTGAGATTTTGTTTTTATTATCTGATGTCCATTTTGGAATTCAAGTTTATGGCTATT TAGTTGTTAAAAGGAAAGATGCTCATGCAATTGATTCGCTGTAAATTGACAGACGCGAAATTCTTCACGACACAGCCCCG CATCTAGTGGATTCCATATGTGCATATCGTGGTGGCTACATTGCAGAGGTGAATTTTACTTCTCTCTCTTTCTGGGTTTA TAAATAAGCATTTAATATGTGCATTTGTGCATCCATGCTTGCCTGTGCACACATAATCTTTCTTCCGGTCTACAAACATT ATGATGTGCATTGTCATGTTCATTTAACTTATTTACTGGTGAACTGCTAAGTGCCATTTGCCGAAGTAAAATGCTATTTC CCCCAGGGATAAGCATAAGATGCTCTGATTTCATCCAAGTGAAGTCCTTTATGTGGTCATTTCCTTTTTGGACTTTTGCC TTATAATATTCCTTTTCATATCTTATACCTGGCTTTAATATTTATCTCATGGTAAGCTGGGATAAATAGAAACATATATG TGAATTGTGAAGTCTGTTAGGGACTTGGTATAAATGCTCTTTAATGAGATTCTTTAGCCATCCATTGAAACAATACAACA TATAGAATTTTCATGCGCTCTGAAACCTAGAGATCTATTGTTGTTCTTAAGTTGCTGCGTGTCCTCTGTGCTACCCCTTC TTTGGCACATTTATGTAAAAAAATTATTCAATATAGAAATACTGTAAAAAATTATGTACATTTGTAATTCTATTCATTAC TGATATTATTGACATGGGCTTGATCCATGCAAGTGAGTTTTCCTAGTTAGGTACGTCTTGGTTGATATATATATATATAT ATCTGAGTATGGTTTTAAGCCCTTTTACTCAGTATATTGTTATAATCTTTCTTTGTTAGATTATTCCATTTATTTTAAAG TTTCTTGTAATCTGATACTTGGCAGTTGTCATTGTTATCAGATTTTATGTTTACCCTTGGTTGAATCTTTTTGTGTATTT AGTAATTGTTAGAACCCAGCCAAGAAGAAGATAGAAACTATGATATTGTGGAATATGAACCCTAATTCCTAAATAAGAAT TAGAGAGAATGTACAAATTAAGTTGCAGAGCATTCGAGAGGCTCTGCTCTCTCCCAAGTCCCAATTTCCTAAATGATCCC AAAAGATACCTAAACTCTTCTAGCAATCCCTTATTTATAGGCTATAAGCCCACTAACACTAAGCCCACTAACAATAAGCC CACTCTAATTCTAGGTCTCTATCAGTAATGAAGCTCTGTAGCAAGAAATTAATCTCCACATGCATTGGATTCTTCTTTTG ACCATTTCTCATTTAATCCATTAGTAGTGTTCATGCTTTTCTTTTGTTTGATTATTGGGATGATCCATTTTGGTTATTTT ATGGTTCTCTGAGACTTCATATTGGTCCTTCACGTTGGCAGGAAAGAAGAAAGATAGAGAGTGCATTTTTTGGTGGTAAA ATTTGTGGTGTTGCTGCAACTAATGCTCTTGAGTTGGGCATTGATGTTGGGGAAATTGATGTCACTCTGCATCTAGGATT TCCTGGTAGTATTGCAAGGTAGCTTTGATGCTTTGATGTCTGTCCATATTAAACCTTTTCAACTGCTTGTTTTTGGAGTT GTCGGATTTCCTTTTTATTTTTCTTTAAATCTTTTGTTCTCTTAGCTTGTGGCAACAAGCTGGAAGAGGTGGGAGGAGAG ATAGACCATCCCTTGCTGTCTATGTTGCATTCGGTGGGCCACTTGATCAATACTTCATGAAAAATCCTAAGAAACTTTTT GAGAGACCGATTGAATGCTGTCATATTGATTCCAGAAACAAGCAGGTTCTTAACTTTTTGATTACTTACATAGTTTTAAC AAATATAGGGATTATTCTAATTATGGCAGACTTCATTCAGGTTCTTGAGCAACATATGGCCTGTGCAGCTCTTGAACACC CTCTGAATGTGCATTATGATGAGAAGTACTTTGGCTCTTGCTTAGAAAGTGTTTTGATTTCTCTAAAAGCGAGAGGATAC TTGAGATTTGATCTGTCATCGGTTCCTTCTTCTAGAATATGGCACTACATTGGTCCAGAGGTATATATGTGATCAAATTA AGTTCTTGTCTGTCTGGTCTAGTTGAATAATTTATTATTGAGCTCTAAGAAATATTTGAAGATTATAAGATTAGTATTTT TTCTTGTTTTTTCACTGTACTTATTAAATTCCAGAAATCACCTTCACAAGCAGTCAATATCCGTGCAATAGAAACGGTAA GATACAGTGTCATAGATCAGAAAAAGAATGAAGTCCTTGAAGAGGTAGAGGAAAGCAAGGCTTTCTTTCAGGTAGTGACT TCTACCTACTGAATACTGATACACGTGGAAAAGGAATTTTCTACCATTCAAATATGAAAAGAATACTGTCTTATGTTTTC TATTACTACCTCATAAAGTATATTCATGTTTTACACTTTTACTTGACTCAGGTATATGAAGGCGCTGTGTACATGTGCCA GGGGAAAACCTATTTGGTTGAAAAATTAGATCTATCTAACAAAACTGCTTTTTGCAAAGAGGCTGATCTGAAGTATTATA CGAAGACACGGGATTATACTGATATTCATGTCATTGGGGGTAATATTGTATGTCATCTCCAATTTGATAGAGTTCCTTTG GATTATCTTTTAAACTGATAGCATGTAACTGTTAGAAACTGTTTTCTGATGATCTGTTGAAGTTATAGGGTCTTAGATAC GGAAAGATAGAAAAGGGAGAATAAGGACTATATTATGGTATTATATATGATATAATAGAAAAAGCACTAATTCTTTTTTT ATACCAATTCTGGACTTCTAATCCTAATTAATGACAAAAAACATTTAAACTCCTAAACCTTATTAAATAAGGAAAAAACT CGTGATATATAAAGAAATATGGAAACTAATCCAAAGATATACATTAAGATACTCAGATACTTGGATAATATGAAGATAGT GAAATGCTAGTAACACTCTCTTTCTAACACTCTTTTTGATTGGTCAAAATCCATGTAGGGTCCACTAAGTTATATGGGGC CCACTCCCAATTTGGTGGGACCTACAGGGATTGTAACCAATTAAAGGGGGGTGTTAGAAAGAGTGTTACTAGCACTCCTC TATCAAGATATTATTAGATATTTTTGATATAACCTAACATTACCTCTAAGGTTGAGCTTACTAGTATCAGTATACTATAT CATCCTTAAATTCAGTGAAATGCCACCATTTACATCAAATTTTAAAAGATGGATCTGATGGATAATGCAAGTGATGTTCA GGTCTTTAAAAACTCATTTCCCTGCGATTCTCAGGCTTATCCAGTAAAAGTTTCCACTAACATGCTTCCAAAAACAAATG CTCGAGCTCATGTATGCAAAGTAACTACTACTTGGTTTGGATTTTATCGCATTTGGAGAGGAAGCAATCAAATCTTTGAT ACTGTTGACCTAGCTCTTCCTCAATATTCATACGAGTCGCAGGTGAATTTGAGCATTTTTAGAATTTTTCTCTCTTTTAA TTATCCTTCTCTGGCTCCTGTGTCTTAACGTCAATATGTTATTTGCTTCTCAATAGGCAGTTTGGATTCCAGTGCCACAG TCAATAAAAGAAGCAGTAGTCAAGCAAAATTATGATTTCCGTGGAGGTTTGCATGCTGCTTCACATGCTGTTTTACACGT AGTGCCTTTGTAAGTTTCTTATAAATATTAGTTTTTAAGTTTTGGCATCAGCATGATATACAGAAGCCTTATTTCTTCTA TCTATGATGTGGAGATTGTTTGGAGTTAGTACATGCTAATCATTTTGTAATTATTTTAGCTTAAGTATCTTCCATTTTGT GTTTTGTCATTTTCGTTCAGACCCCTTAACATTAATTGTTGATATTGATAATACTAATATCATTCTAAGAATAAGCTCCA TCTAACCGCCTGGTAACACCCCTTAATTACACTCTGCTCATCTTTTTTTTCATAAATTATACTGATCTCCCCTTGTTTTT AATTTTTCACCTGTATGTAAGCCTATAGGGAGGATTTATGCATAGGAATAATTTTAAAATTGTCTTACAAACATGGGAGG TTAGTACGATTTCCAAAAGTGGAGAGGTGGGTGTAGTTGGAGGAACATTCAAGATTTTGAAGTCACTATTGTTATTAATT ATTAGCATGATTAGTATTGAAGCAGAAAACTATGTAGTTATTTTAAAAGCTTCCTAGAACACTTCCAATGTTTAGAGATC CGCATGTAAAAATTATACAACTGTTAAGATTAAGAGTTCTTTGGGTTTTTTTTTTTTTTGATGAGCAAGAGTTCTTTGGT ACGAATGTTACTTCTCAATTCATTCAAGCAAGATGTCGATTGGTCATGAACTATCTTGTTGGCACGCGAAAGATGAACTA CATGTGGCTCTGAAATTGCTTAATTGTCAAATGAGTATTCAGATGCTTCCCTTTGGTGTGTTTATGCGTATGTTTAAAGG AAGGAATTCTGCTGTGGATGTCTCCTCTTTGAGATGTTAGTGAAGTTTAGGGTATATTTAATTTGAGGAAACATATTCTG TTTTTATTGACATGTTCTTACTTTATTGCTTTTTTCCAAATATATAATATTTAAAACATAAAACAATAAAACACTTCTCA TCCTCTGTCCTATAGAACCTCTGAAAACAAGAGACAAATTGAAAATAACACTTTAGTAATTAATAAAAAGTTTAAAACTG GAAATGGAATAGGAAATATTTTCTTTCACCATTCAAGCCCAATAAATCAATCTTTTTCCTGTACATTGGACGTTGTATTG GCCAAAGATAAGAAGTAAAACTTTACTTGTCTAGCAGAGTCCACTACATTCTATTTTCTAAATGGTTGGTCATTTAGACT AACTGACTAAGAAATGAAAACCTGTTCCTCTCTCTAGTTTACAATCTTGATTTTTTTTTTCACGTATAATTCTTATTAAC TTCATGTCTATATATTATGATACTTTTGGTTGCAGACATATAACATGCAACATGTCTGACTTGTCTCCTGAGTGTCCAAA TCCCCACGATAGCCGATATTACCCTGAAAGAATTCTAATATATGATCAACATCCTGGAGGGTCTGGAATTTCAGTTCAGG TAAATAACATGAGACGTTTATCAGTTTAGACGTTTTTTGCGTACTTTTTTGTTTTCATCAATACTTAAGTGATGCTTTTG TTTTTTCTGTTTTCGATGTTAAATTAAACGGTGGTAACATACTGGTTGTTTCTGGAATAAAAAATTTCCCTTCATAATTT TTGGGATTGTTTTATAGGTTCAACCCTATTTCACGAAGTTCCTAGCAGCTGCGCTAGAAGTTCTCACATCTTGCTGCTGC TCAGCGGAAGTAGGTTGCCCTAGTTGTATTCAGGTCTGGATCAAACATCTTTTTTTAAGATATAAAAGTAGTTTCATAAA AAAAATTATATTTTTTATTTGAACTTCTAGGTTTTGGAGTGTATTTATGTGTATATATTGCATCAAATGTTGGCAGACAG TTTTCAATTTCATAAAGCTTTTGTATATTGCAGAGCTTTGCATGCCATGAGTATAACGAGGTTTTACACAAGGATGCAGC CATTATGATCATCAAGGTGGTGACTTATTTTGATCCTTATGATTTTCTGTGGATAATAGCATTTCCACTTTCACTTTGAT AACCATTGATGTTGTCCTTTCAGGGGATTTTGGATGCAGAGAGCTAGTACCTCAAAGTATGTGCTGGCTATTTTGAAGTC TATTTAGGGAGAAAGCTCTCATTAAGTTTTTATTTAAGGGGAGCGGTAAAGGTATCCACTCCTAAATTTTATTGAGTTAA AATGACAACAATTTCTTAAATTGCGGTTGTGGTTAGGTCACAATTCTTGATTGACAAAAAATTGTAGACAAATATGGTTG ATGGAGCTGCAATTGTGGTTGCAATATAGTCGTGGAGACTAAAAAATGTTTTTTTTTTTTTGAAATGTAAAAAATGTTAA TATTGCTACCGTAGCAGCTGTTGTGAATTGTAGTTTAAAACCATGGTTACGATTATTGCG
CDS sequence (LotjaGi1g1v0210100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCAGAGAACAACGAGAAAGAAATCCAAATCCGAACCCTAACTGGTGAATCCACTACTCTTCACATCACTCCCTCCGC CACCGTCCAACACCTCAAGCTCCTCCTCAACCACTCATTCTCACCCGCCACAAACTCCCCAAATTTCCACCTCTTTTTCA AGGGTGAAAAATTGCGATTGCAGGCAAAGATTGGTTCTTACCCAATTCAACTAGGCGAGTTTCTCGTCCTGGTTCCCTTT TCCAAGAAGGATTCAACTTCAACCGGGACGCAAAACCCGGACCCGGTTCTCGATTCTTCAAATGTTGCTAACAGCGCCTC TGGTTCAACCTCTAACCTTGCTGATTCCACATGGTCTAATATCATGGAGGATTTGTCGCATTTGCGTGATGGCACCGCTG AATGTGGCGATAACAGTGCATCTAATTCAGAGTTTGGAGCATTTGCTTCTGAACCAAGTAAAGGGGGTTTAGGTTTAGGT TTAGGTTTAGGTCAGGAGAAGCAGATTGAGCTTCCTTATCATCTCATACTGAACACGCTGGATTGTACTTGCGTTTTCAG TGAGCATAATTGCGAGGTTTTTTCGAAGGTTTTGGAGTCTGTGAACTGTTTATCTGACCTGCCTCTGGGACACTGCAAGC TGTTGAGAAAAGCACGTTTGGAGGGAGCTTTTGTCAAGGGTGGTGTTACATGCTTGTGTCCACCATGGTTGAAGACAGTA GTAAAGGCGTTTGCTTTCATAAACATTTTCTCCGCGTTTCTTCATTTGCAGCGTCGAAACATTACTGCATTTTTACTGGA AGAGGCACTTAATCAGGTTGCCAAGTTTGGAGTCAAACTTGGTCTTCATGACGTGAAGCATCTTTCCCTTCTTTGTCCTA ATCTAGTGTGTTTTGTGGATGAAGTAGAGAAGGCAAGTTTTGGTGATGTCATTGTTGTAGTTAACCATTCAACCAGTGAT AAAGATCAAGTTGAAGATAATCCTAGTGGAGCTCGCAAGTGGTTGTCTGCTTCAAAGATTGTCAGTACATTGAAGAGAAG GGACAGTTCTTTCCGAAAATATCTAGGGTGGGCTTTTGAGCAGATGCCGTTTGAATTTGGAGATGAGATGGCAGTTGGAA CTACCTTGGAAGAAATGCTTGCAGCAATTAAAGACCATAGTTTTGTTGGAAAAGAAAACAAATCAAAACGTGTAAAGAGA AGCTCAACTACTAAAAAACCTGACAACCACATTGGATGTCATGACACTAAATCATTACTGGCTGTGGACATGGTTGAACA TCTTAAGAAAGGAATTGGATCTGAAGGACAGATTGTGTACATTGAAGACATATGTGCTAGAAAAGCCACTTTCAGCGAGA TCCCAACTGAACTTTCAGAGAAAATGAGATCTGCACTGAAAAGCATTGGAATTTCCAAATTGTATAGTCACCAGGCAGAC GCTATACAAGCCTCCCTTCATGGGAAGAATGTTGTTGTAGCTACAATGACATCTAGCGGCAAATCTCTTTGCTACAATCT GCCAGTTCTAGAAGAGTTGTTGAAGAATTCATCATCATGTGCTTTGTATATATTTCCAACAAAGGCATTAGCTCAAGATC AACTAAGAGCTTTGTTATACATGACAAAAGGATTTGATGTTGACTTAAATATTGGTATATATGATGGTGACACGTCTCAT AGTGAGAGGACATGGTTACGTAGTAACTCTAGACTGTTGATCACAAATCCAGATATGTTACACATATCAATCTTGCCCCA CCATCGGCAATTTAGTCGGGTTTTATCAAATCTGAGGTTTGTGGTCATTGATGAAACTCATACGTACAAGGGAGCATTTG GAAGTCATACTGCCCTTATATTAAGAAGGCTAAGGAGACTCTGTTCACATGTATATGGAGCCGTTCCTTCTTTTGTTTTT TCTACTGCGACTTCAGCAAATCCTCTTGAGCATTCTATGGAACTTGCAAATTTACCAACCCTGGAGCTATTTCAGAACGA TGGCAGTCCATCTGCCAGGAAACTTTTCATCCTTTGGAATCCTATTCTTCGTCCAAAAGATATCTTGAAGAAAGCTCAGT TTGCAATTGGTAATAATGAGTTGGCAGATGAAAGTGCTAATTTTGTTCGTTCAAGCCCAATTGTGGATGTTTCACGCCTT TTTGCAGAAATGGTTCAGCATGGCCTTCGCTGCATTGCATTTTGTAAATCACGGAAACTTTGTGAGCTTGTTTTATGCTA TACACGCGAAATTCTTCACGACACAGCCCCGCATCTAGTGGATTCCATATGTGCATATCGTGGTGGCTACATTGCAGAGG AAAGAAGAAAGATAGAGAGTGCATTTTTTGGTGGTAAAATTTGTGGTGTTGCTGCAACTAATGCTCTTGAGTTGGGCATT GATGTTGGGGAAATTGATGTCACTCTGCATCTAGGATTTCCTGGTAGTATTGCAAGCTTGTGGCAACAAGCTGGAAGAGG TGGGAGGAGAGATAGACCATCCCTTGCTGTCTATGTTGCATTCGGTGGGCCACTTGATCAATACTTCATGAAAAATCCTA AGAAACTTTTTGAGAGACCGATTGAATGCTGTCATATTGATTCCAGAAACAAGCAGGTTCTTGAGCAACATATGGCCTGT GCAGCTCTTGAACACCCTCTGAATGTGCATTATGATGAGAAGTACTTTGGCTCTTGCTTAGAAAGTGTTTTGATTTCTCT AAAAGCGAGAGGATACTTGAGATTTGATCTGTCATCGGTTCCTTCTTCTAGAATATGGCACTACATTGGTCCAGAGAAAT CACCTTCACAAGCAGTCAATATCCGTGCAATAGAAACGGTAAGATACAGTGTCATAGATCAGAAAAAGAATGAAGTCCTT GAAGAGGTAGAGGAAAGCAAGGCTTTCTTTCAGGTATATGAAGGCGCTGTGTACATGTGCCAGGGGAAAACCTATTTGGT TGAAAAATTAGATCTATCTAACAAAACTGCTTTTTGCAAAGAGGCTGATCTGAAGTATTATACGAAGACACGGGATTATA CTGATATTCATGTCATTGGGGGTAATATTGCTTATCCAGTAAAAGTTTCCACTAACATGCTTCCAAAAACAAATGCTCGA GCTCATGTATGCAAAGTAACTACTACTTGGTTTGGATTTTATCGCATTTGGAGAGGAAGCAATCAAATCTTTGATACTGT TGACCTAGCTCTTCCTCAATATTCATACGAGTCGCAGGCAGTTTGGATTCCAGTGCCACAGTCAATAAAAGAAGCAGTAG TCAAGCAAAATTATGATTTCCGTGGAGGTTTGCATGCTGCTTCACATGCTGTTTTACACGTAGTGCCTTTACATATAACA TGCAACATGTCTGACTTGTCTCCTGAGTGTCCAAATCCCCACGATAGCCGATATTACCCTGAAAGAATTCTAATATATGA TCAACATCCTGGAGGGTCTGGAATTTCAGTTCAGGTTCAACCCTATTTCACGAAGTTCCTAGCAGCTGCGCTAGAAGTTC TCACATCTTGCTGCTGCTCAGCGGAAGTAGGTTGCCCTAGTTGTATTCAGAGCTTTGCATGCCATGAGTATAACGAGGTT TTACACAAGGATGCAGCCATTATGATCATCAAGGGGATTTTGGATGCAGAGAGCTAG
Protein sequence (LotjaGi1g1v0210100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAENNEKEIQIRTLTGESTTLHITPSATVQHLKLLLNHSFSPATNSPNFHLFFKGEKLRLQAKIGSYPIQLGEFLVLVPF SKKDSTSTGTQNPDPVLDSSNVANSASGSTSNLADSTWSNIMEDLSHLRDGTAECGDNSASNSEFGAFASEPSKGGLGLG LGLGQEKQIELPYHLILNTLDCTCVFSEHNCEVFSKVLESVNCLSDLPLGHCKLLRKARLEGAFVKGGVTCLCPPWLKTV VKAFAFINIFSAFLHLQRRNITAFLLEEALNQVAKFGVKLGLHDVKHLSLLCPNLVCFVDEVEKASFGDVIVVVNHSTSD KDQVEDNPSGARKWLSASKIVSTLKRRDSSFRKYLGWAFEQMPFEFGDEMAVGTTLEEMLAAIKDHSFVGKENKSKRVKR SSTTKKPDNHIGCHDTKSLLAVDMVEHLKKGIGSEGQIVYIEDICARKATFSEIPTELSEKMRSALKSIGISKLYSHQAD AIQASLHGKNVVVATMTSSGKSLCYNLPVLEELLKNSSSCALYIFPTKALAQDQLRALLYMTKGFDVDLNIGIYDGDTSH SERTWLRSNSRLLITNPDMLHISILPHHRQFSRVLSNLRFVVIDETHTYKGAFGSHTALILRRLRRLCSHVYGAVPSFVF STATSANPLEHSMELANLPTLELFQNDGSPSARKLFILWNPILRPKDILKKAQFAIGNNELADESANFVRSSPIVDVSRL FAEMVQHGLRCIAFCKSRKLCELVLCYTREILHDTAPHLVDSICAYRGGYIAEERRKIESAFFGGKICGVAATNALELGI DVGEIDVTLHLGFPGSIASLWQQAGRGGRRDRPSLAVYVAFGGPLDQYFMKNPKKLFERPIECCHIDSRNKQVLEQHMAC AALEHPLNVHYDEKYFGSCLESVLISLKARGYLRFDLSSVPSSRIWHYIGPEKSPSQAVNIRAIETVRYSVIDQKKNEVL EEVEESKAFFQVYEGAVYMCQGKTYLVEKLDLSNKTAFCKEADLKYYTKTRDYTDIHVIGGNIAYPVKVSTNMLPKTNAR AHVCKVTTTWFGFYRIWRGSNQIFDTVDLALPQYSYESQAVWIPVPQSIKEAVVKQNYDFRGGLHAASHAVLHVVPLHIT CNMSDLSPECPNPHDSRYYPERILIYDQHPGGSGISVQVQPYFTKFLAAALEVLTSCCCSAEVGCPSCIQSFACHEYNEV LHKDAAIMIIKGILDAES
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Gene3D | 1 | 94 | 94 | 8.6E-8 | – | |
| SUPERFAMILY | 5 | 94 | 90 | 2.24E-7 | ||
| ProSiteProfiles | 7 | 78 | 72 | 10.528 | ||
| Pfam | 9 | 78 | 70 | 2.9E-6 | ||
| CDD | 9 | 78 | 70 | 6.82769E-6 | – | |
| MobiDBLite | 85 | 114 | 30 | - | – | |
| PANTHER | 309 | 1158 | 850 | 1.4E-264 | – | |
| PANTHER | 309 | 1158 | 850 | 1.4E-264 | – | |
| Gene3D | 447 | 658 | 212 | 1.7E-41 | – | |
| SMART | 470 | 676 | 207 | 1.8E-26 | ||
| CDD | 474 | 655 | 182 | 1.00216E-79 | – | |
| Pfam | 476 | 645 | 170 | 6.6E-26 | ||
| ProSiteProfiles | 482 | 663 | 182 | 17.897 | ||
| SUPERFAMILY | 483 | 838 | 356 | 5.07E-41 | ||
| CDD | 676 | 840 | 165 | 3.61849E-66 | – | |
| Gene3D | 709 | 890 | 182 | 8.2E-21 | – | |
| ProSiteProfiles | 716 | 872 | 157 | 12.994 | ||
| Pfam | 723 | 829 | 107 | 1.3E-10 | ||
| SMART | 750 | 831 | 82 | 2.9E-12 | ||
| Pfam | 1107 | 1189 | 83 | 4.7E-20 | ||
| Coils | 1216 | 1218 | 3 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Nucleic acid binding | Interacting selectively and non-covalently with any nucleic acid. | ||
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). | ||
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0210100.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…