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LotjaGi1g1v0342700.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0342700
Transcript ID LotjaGi1g1v0342700.1
Related isoforms 10
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Golgi-body localization protein domain isoform 1; TAIR: AT1G58250.1 HYPERSENSITIVE TO PI STARVATION 4; Swiss-Prot: sp|Q6IMT1|SAB_ARATH Protein SABRE; TrEMBL-Plants: tr|K7KU85|K7KU85_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0342700
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:80490910..80525983) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

AGCACATGCAACTTCGCAGTTATAGATTTTTCTTGCACAAACAAACAGTGACTCCTCCCTGCACGTTTCCCGAAAACCAA AACGAGCACCCACGTTGATTCTCCTGTGCCGGCGTCACACCTGGTAATTCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTGTCTCCA CCATGATGCCTTGGATCACCGAGCACCTCACGGATCGGATCTGATCTCAGGTACTATAAAACACCAATCAACGCTTCCGA TCGCGACGCAACCATCACCATTTCTAGGGTTCTACTTTCTCCCTCTCCTTAATTCTTCTTCTGCTATGGAGTTTCGTCAC AGCTTCGCGCAATTCCGAGAGCATGATTGATAATTCAACCATTTTCTACACACAACTGCTTTCCCCTCTTCCGAAATGGC AGCTTCTCCTGTCAATTTCCTCTTCGGATTCTTGCTGCTTTCTATTACATTGTGGCTTCTCTTCATGTAAGTCCCTGCTT CACTTTTTTGCTTACTGAATTTATCGCATTCGTTGTTTTTTAACTGCTTAGCTGTTTAGGTTGGAGAATATGTTGCTTTT TTAGGGTGGACTTAGTAGTATGACAGTTTGGTATGTAAGGGGCAATCAATTTTACCAGTTAGGTATGTTATCAGGGGGAA TTGTTCTAGAATTCTAGCACTTAGCACTACACTACACTGTAGAAGACATCGTATTCATTCTCTGTTTCTAAGAATAGGGA GTTCCGTTGAGCAGTTTACCATCTAATCGTAATTCAGTCAACAACATTAACTCGCTCAAAAATCCCACCCGGTAAACCTC AGTGTAGATAAGGACTGGATGCATTAAGACCTGTTGCATAGAACAGACGAGTAGTGCTTGATGAATACTCTTCAATGTAT GTGAGCGTGATCAAATTATATTGAAGATACCAACAAGGTGTAGCACAACTGGTAGATAGTTGGGCTCCTTAACCATCTAG 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0342700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGCAGCTTCTCCTGTCAATTTCCTCTTCGGATTCTTGCTGCTTTCTATTACATTGTGGCTTCTCTTCATATTTGCTTC TGGGTTGCTGGCATGGATTTTGAGCTGGATTTTGGGAGCATCTGTTGGGTTCCGTGTTGGTGGATGGAAATGTTTAAGGG ATGTGGTAGTGAAGTTTAAAAAGGGTACTGTGGAATCTATATCTGTTGGTGAAATTAAACTTAGCTTACGCCAGTCCCTG GTCAAACTTGGTGTGGGTTTCATTTCTCGTGATCCGAAGCTGCAAGTGTTAATATGCGACTTAGAAGTTGTAATGAGGCC TTCAAATAAAAGCCCGGGGAAGAAGAAAATCAAGAAATCCCGTGCTTCAGGCAAGGGAAAGTGGATGATTGTAGGCAATA TTGCAAGATATTTGTCAGTTGGTGTGACTGATCTGGTTCTGAAGACACAAAATTTTACTGTTGAGATCAAGGAATTGAAT GTGGATATATCTAAAGATGGTGGATCCAAGTCAAATGTGATAGTTAGACTACAAATATTGCCTATCCTTGTTCACATTGG TGAGCCACGGCTTAGTTGTGATCAGTTATCTGATTTAAGTGGTGGAGGAAGCATTTCATCTGGCCAGGCATCTATTGCTG CTATAGAAAGGTCTTCTGCCCCTTTTATCTGTGAAAATTTCTCCGTGTCATGTGAAATTGGTCATGATAGGGAAGTGGGT ATAATTATTAAGAATGTGGACGTTTCCAGTGGAGAGGTCACTCTGAATTTGAATGAGGAGTTGCTTTTGAAAAGAAAAAG TTCATCAGAGTCTTCTTCTAGCTCTGACAGTATTATAGGGTTGCGAGCTGATTCTATAAGCACAAAAAAACCATCAAAGC AGCAGCAAACACTTGCATCCTTCTCCAAGTATAGTTCTATGTTTCCTGAAAAGGTCAACTTCAATCTACCAAAGCTGGAT GTGAGTTTCGTGCACCGTGAACATGGTCTTTCTTTTGAAAACAACATCATGGGTATCCAGTTGAAAAGCACCAAATCACG ATCCACTGAGGATGTTGGGGAGAGTACACGCCTTGATTTTCAAGTGGAGTTTAGTGAAATTCATCTTCTTAGAGAAGCTG GTTCTTCCATCCTGGAGATATTGAAGGTGGACTTGATTTCTTTTGTGTATATCCCAGTACAGCCAATTTCACCTGTTAGA GCTGAAACTGAAATCAAGCTAGGAGGCACTCAATGCAACATCATAATGAGCAGGATAAAGCCTTGGTTACTCCTCCATTT TTCTAAGAAGAAAAAAATGGTACTTCGAGAAGAAGCTTCTGTTGTTGTAAAGCCACAATCATCTGATAGTAAGACTATCA TGTGGACATGCAATGTCTCAGCTCCAGAAATGACAATAGTGCTTTTCGATATGGTTGGTTCTCCGGTGTATCATGGTTGC TCACAATCATCACATTTGTTTGCAAACAACGTTTCAAATATGGGGACTACAGTACACGTTGAACTTGGAGAGTTAAATCT TCATTTGGCTGATGAATATCAGGAATCCTTGAAAGAAAGTGTTTTTGGTGTAGAATCAAATTCTGCCTCCATTATGCACA TTGCTAAGGCAAGTTTGGATTGGGGGAAAAAGGACATGGAGTCATTTGAAGAAGATGGTCTTAGGTGTAGATTAGGTTTA TTAGTTGATGTGACAGGCATGGGAGTTTATCTAAATTTTAAGCGTATAGCATCACTCATATCAACAGCTATATCATTTCA AGCTCTATTGAAAGGCCTATCTGCTTCGAAGAAAAAATTGACTCCGAGTCGTGGCCATTTATCAAAACCTTCGGGGAAGG GAACTCAGTTGTTGAAATTTAATCTTGAAAGGTGTTCAGTACATGTATGGGGTGAAACAGGCTTGGAAAATACAATTGTT CCAGATCCCAAGCGGGTTAATTATGGTTCACAGGGTGGTAGAGTTATAATAAATGTGTCTGCAGATGGCACCCCGCGTAA CGCAAACATAATGTCTACTATTTCGGATGAACTCCCGAAGATCAAGTACTCTGTCTCTTTTGAAATCGTTCAATTTAGTG TGTGTGTGAACAAAGAGAAACAATCCACCCAGATGGAACTTGAAAGAGCCAGATCTGTCTATCAGGAATATATGGAGGAA AATAGGCCAGTAACAAAGGTGACATTGTTTGATATGCTAAATGCTAAACTTGTAAAGCGTTCAGGTGGCCTTAAAGAAAT TGCTGTCTGCTCTCTTTTCAGTGCCACTGACATTACTCTAAGGTGGGAACCTGATGTGCATTTATCACTTATTGAACTTG TTCTCCAGCTGAAATTACTGATACACAAAAGCAAGCTTCAGGAGCACGGTAATGAACACATGGGAGACGTGTCTCATGCA CAAGATGCTAATTGGAAACAGGAAACTACCATTGAATCTGGGCATCTGGAAAAGCAGAAAAAGAAAGAATCTATTTTTGC CGTTGATGTAGAAATGTTGAGTATTTCCGCTGGGCTAGGAGATGGGGTTGATGCTATGGTTCAAGTACAGTCAATTTTCT CCGAGAATGCTCGTATAGGAGTGCTCCTAGAAGGACTTATGCTTAGTTTTAATGGGGCCCGAGTTTTCAAGAGTAGTCGG ATGCAAATTTCACGAATTCCTAGTGTCTCTGCTAGTACATCTGATGCGAAAGGACACGTAATTACAACATGGGATTTGGT AATCCAAGGTCTTGATATTCACATTTGCATGCCATACCGTTTGCAATTGCGTGCTATTGATGATGTCATTGAGGATATGA TACGAGGTTTGAAGCTCATAATTGCTGCTAAGACAAATTTGATTTTTCCTGTGAAAAAAGAGAGCTCTAAAGTTAAGAAA CCTAGTTCTGTACAATTTGGATGCATAAAATTTTGCATACGCAAGTTAACTGCTGATATTGAAGAGGAACCAATGCAGGG ATGGCTTGATGAGCACTATCAATTGCTGAAGAAAGAGGCTGGTGAGTTAGCTATCCGGTTGAACTTTCTAGATGAATTAA TATCGAAGGCCAAACACAGTCCAAAATCTGCTGACACCATTGAGATTGATGTAAAAGATTCTTCTACTATTGAGTCCACG AGAGAGGAAATTTATAAAAGATCATTCCGATCATATTACCAGGCATGCCAGAATCTAGTGTTATCTGAAGGGTCAGGTGC TTGTGGAGAAGATTTCCAAACTGGCTTCAAACCTAGTACTTCAAGGAGATCACTTCTTTCAATATCCGCACAAGATTTAG ATGTTAGCTTGAAAAAAATTGATGGTGGGGATGCCGGGATGATTGATGTTCTGAAGAAGCTTGATCCTGTCTGTTTTGAG AAAGATATACCATTTTCTCGACTGTATGGGGCAAATATTCTCTTAAGTACAGGCTCTCTTGTGGTCCAGCTTCGGAATTA CACATTTCCTCTTTTCTCTGGAAGTTCTGGTAAATGTGAAGGTCGTCTTGTTTTGGCTCAGCAGGCAACTAGCTTTCAAC CTCAAATATATCAAGATGTCTATGTTGGGAGATGGAGGAAGGTTCGCATGCTTCGATCAGCTACTGGTACTACTCCACCA ATGAAAACATACTCAGATTTGCCTTTACATTTCCAGAAAGGTGAAGTGTCATTTGGGGTGGGTTATGAACCAGCTTTTGC AGACGTTAGTTATGCTTTCACCGTAGCACTTCGGAGGGCTAATCTAAGTGTTAGGCATCCTGGTCCACTTATTCTTCCAC CAAAAAAGGAGCGGAGTTTGCCGTGGTGGGATGACATGAGAAATTACATACATGGAAAAATTTCCTTGCTCTTTTCTGAA TCAAGATGGAATATTTTGGCAAGTACAGATCCTTACGAAAAAGTTGACAAACTTCAAATTGTGACCAGCTTTATGGAAAT TCACCAGTCCGACGGTCGTGTTTTTGTTTCTGCTGAAGATTTTAAGATTTTATTGAGTAGTTTGGAGACTTTGGCAAACA GACGAGGTTTCAGAATTCCAACAGGTGTCTCTGGTGCTTTTCTGGAAGCCCCGGTCTTTACTCTTGAGGTTACGATGGAC TGGGATTGTGAATCTGGAAATCCCATGGATCATTATTTATTTGCACTTCCAGTTGAGGGAAAACCTCGTGACAGAGTATT TGATCCCTTCAGATCCACTTCTCTCTCCCTTCGATGGAACTTCTCTCTTAGACCCTTTCCTCCTTCATCAGAAAAGCATC CCACATCTTCCATTACTAGTGATAATATTGAAGAAAGTGCCAGTGTATTTGAGCCCCCTCATGTATCTCAGAATGTTTCA TCAGTGTCCCCGACCTTTAACTTTGGAGCTCATGATCTAGCATGGATCTTAAGATTCTGGAGCTTGAACTACAATCCTCC ACATAAACTGCGCAGCTTCTCTCGTTGGCCTCGTTTTGGAGTTCCAAGAGTTGCCAGGTCAGGCAATCTTTCACTTGATA AGGTGATGACTGAATTTATGCTCCGTTTAGATTCCACACCGGCCTGCATAAAAAACATGCCTTTACATGATGATGATCCA GCCAAAGGACTGACTTTCGTAATGACTAAACTGAAGTATGAACTGTGTTATAGTAGGGGGAAGCAAAAGTATACTTTTGA AAGCAAGCGTGACATTCTTGATCTTGTTTACCAAGGTCTTGACCTTCATATGCTCAAGGCTTTCCTAAATAAAGAAGCAT CTCCTAGTGTTGCCAAAGTAGTTAACATGGTACTGAAAAGCTCACAATCTGTTTCTCTGGACAAAATCCCCAGTGAAAAA GTTTACATAACAGACAAAAATCGTGATGATGGGTTTCTGTTGTCCTCTGACTACTTCACTATCAGAAGACAATCCCCAAA GGCTGATCCGGCAAGGTTACTAGCATGGCAAGAAGCAGGAAGAAGAAATGCTGAGTTGACATATGTACGCTCTGAGTTTG AAAATGGGAGTGAAACTGATGAACATATGCGGTCTGACCCAAGCGATGATGATGGTTACAATGTGGTAATAGCTGACAAT TGTCAGCGCGTATTTGTCTATGGTCTTAAGCTTTTGTGGACTATTGAAAACAGAGATGCTGTTTGGGCCTGGGTTGGTGG TTTATCCAAAGCCTTTGAACCTCCCAAGCCCTCTCCATCACGACAGTATGCGCAGAGGAAATTACATGAGGAAAACAAAA GGCATGACGGAGATGATTTTCGACAAGATGATGTTTCCAAGTGCCCTCCCACTGGTAAAATTACCAATTCTCCCTCTTTT CAGGACGCAAGTACTTCTGGATTACTTTCTTCTCCACCTAATTCAGTTAAGGTGGACAACTTGTCGTCTGCTAAAAGCGA GAACACAAATGATTCAGATGGGACCCGACACTTCATGGTGAATGTTATTGAGCCACAGTTTAATCTTCACTCCGAGGATG CAAATGGTAGGTTTCTGCTTGCTGCTGTAAGCGGCCGTGTTTTAGCTCGATCGTTTCATTCAGTCCTTCAAGTTGGTTAT GAGATGATTGAGCAAGCACTTGGTACTACAGACGTACATATAAGTGAATACCAACCTGAAATGACATGGAAAAGAATGGA GTTCTCTGTTATGTTGGAGCATGTACAAGCTCATGTTGCACCAACAGATGTTGATCCAGGAGCTGGACTACAGTGGCTTC CGAAAATTCTCAGAAGCTCGCCAAAAGTAATGCGTACAGGCGCTCTTCTCGAGAGAGTTTTTATGCCTTGTAATATGTAC TTTAGGTACACAAGGCACAAAGGGGGCACGCCAGAATTGAAGGTGAAGCCCTTGAAGGAGCTCATATTCAATTCTCATAA TATAACGGCAACAATGACATCTCGCCAGTTTCAGGTCATGCTTGATGTGTTGACAAATCTTCTCTTTGCACGCCTTCCAA AGCCTCGAAAAAGTAGCCTGTCATTTCCTGCCGAAGATGATGAAGATGTTGAGGAGGAAGCAGATGAGGTGGTTCCTGAT GGTGTTGAAGAAGTGGAACTTGCAAAAATCAACCTTGAGAAACAAGAGAGAGAACAGAAGTTGCTTCTTGATGATATTCG AGAATTGTCTCTTTGGTGTGATCCTTCTACAGATCTACATCCAGAAAAGGAAAGTGACTTGTGGATGATAAATGGCGGAA GATCTATGCTGATCCAAGGACTTAAGAGAGAACTTCTAAGTGCACAAAAATCTAGGAAAGCTGCATCTGTATCACTACGG ACGGCTCTTCAAAAAGCTGCACAGCTACGTCTAACAGAGAAGGAGAAAAACAAGAGTCCTTCCTATGCTATGCGTATATC ATTGCAAATTAACAAAGTTGTTTGGAGCATGCTTGTTGATGGTAAATCTTTTGCTGAAGCCGAGATTAATGATATGATAT ATGACTTTGACCGGGATTACAAGGATGTTGGTGTTGCTCAATTTACTACAAAATATTTTGTTGTCAGAAACTGCCTGCCT AATGCCAAGTCTGATATGCTTTTGTCGGCATGGGATCCTCCATCCGAATGGGGAAAAAAAGTGATGCTTCGAGTAGATGC ACAGCAGGGAGCTCCAAAGGATGGAAATTCTCCCCTTGAACTTTTCCAGGTAGAGATTTATCCCCTTAAGATCCACTTAA CGGAGACAATGTACAGAATGATGTGGGAGTATTTCTTTCCAGAAGAAGAACAAGATTCCCAACGACGACAGGAGGTTTGG AAGGTTTCAACCACGGCTGGTGCAAGGCGTGTAAAGAAAGGTTCATCAGTCCTTGAAGCTTCTGCTTCAAACAGTCATTC AATAAAAGAGTCTGAGACCTCATCCAAATCTGGCATATCTGCAGTGCTATTTCCTGCAACAAATCAGCCTTCTGTCCATG TTGATTCAGCTCAGGCATCCAAAGCTGAAAATGTCAAAGAAAACTCTGGTACTGGTACAACCCCTGAGTTGAGAAGAACA TCTTCTTTTGACCGAAGTTGGGAAGAGACTGTTGCAGAATCTGTAGCAAATGAACTTGTCTTACAAAGTTTCTCTTCCTC AAAAGATGGTCCATTTGGTTCTACGGAGCAACAAGATGAAGCATCTAAGAATAAATCAAAAGATTACAAAGTTGTTAAAG GTGGTCGTGCATCTCATGAAGAAAAAAAGGTAGCTAAGTCACATGAAGAAAAGAGATCTAGGCCACGAAAGATGATGGAG TTTCACAACATTAAAATTAGCCGGGTTGAGTTGTTGGTTACATATGAAGGGCAAAGGTTTGTTGTGAATGATCTCAAACT AATGATGGATCAATTTCACCGGCCTGAGTTTACTGGGACTTGGCGAAGACTATTTTCACGAGTTAAGAAACACATCATTT GGGGAGTCCTGAAGTCTGTAACTGGAATGCAGGGGAGGAAATTTAATAACAAAGGTCAGAGTCAGCCTACCGGAGCTGGT GTTCCTGAAATTGACCTTAATTTTAGTGACAATGAAGGCCAGGCAGGAAAATCTGATCAATATCCACCATCTTGGCCTAA GCGTCAAGGTGATGGTGCAGGTGATGGATTTGTAACATCCATTAGAGGACTGTTCAATACTCAACGTCGCAAGGCAAAGG CATTCGTGCTACGAACTATGAGGGGTGAAGCTGAGAATGATTTTCAAGGTGATTGGAGTGAAAGTGATGTTGAGTTCTCC CCTTTTGCGAGGCAACTCACAATTACAAAAGCCAAGAAACTTATTAGGAGGCATACTAAGAAGTTTCGCTCCAGAGGACA AAAAGGTTCAACTTCTCAACAAAGAGAATCTCTACCATCATCACCAAGAGAGACAACCCCATTTGACAGTGATTCTTCAA GTGGATCCTCACCCTATGAAGATTTTCATGAATAG
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Protein sequence (LotjaGi1g1v0342700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MAASPVNFLFGFLLLSITLWLLFIFASGLLAWILSWILGASVGFRVGGWKCLRDVVVKFKKGTVESISVGEIKLSLRQSL VKLGVGFISRDPKLQVLICDLEVVMRPSNKSPGKKKIKKSRASGKGKWMIVGNIARYLSVGVTDLVLKTQNFTVEIKELN VDISKDGGSKSNVIVRLQILPILVHIGEPRLSCDQLSDLSGGGSISSGQASIAAIERSSAPFICENFSVSCEIGHDREVG IIIKNVDVSSGEVTLNLNEELLLKRKSSSESSSSSDSIIGLRADSISTKKPSKQQQTLASFSKYSSMFPEKVNFNLPKLD VSFVHREHGLSFENNIMGIQLKSTKSRSTEDVGESTRLDFQVEFSEIHLLREAGSSILEILKVDLISFVYIPVQPISPVR AETEIKLGGTQCNIIMSRIKPWLLLHFSKKKKMVLREEASVVVKPQSSDSKTIMWTCNVSAPEMTIVLFDMVGSPVYHGC SQSSHLFANNVSNMGTTVHVELGELNLHLADEYQESLKESVFGVESNSASIMHIAKASLDWGKKDMESFEEDGLRCRLGL LVDVTGMGVYLNFKRIASLISTAISFQALLKGLSASKKKLTPSRGHLSKPSGKGTQLLKFNLERCSVHVWGETGLENTIV PDPKRVNYGSQGGRVIINVSADGTPRNANIMSTISDELPKIKYSVSFEIVQFSVCVNKEKQSTQMELERARSVYQEYMEE NRPVTKVTLFDMLNAKLVKRSGGLKEIAVCSLFSATDITLRWEPDVHLSLIELVLQLKLLIHKSKLQEHGNEHMGDVSHA QDANWKQETTIESGHLEKQKKKESIFAVDVEMLSISAGLGDGVDAMVQVQSIFSENARIGVLLEGLMLSFNGARVFKSSR MQISRIPSVSASTSDAKGHVITTWDLVIQGLDIHICMPYRLQLRAIDDVIEDMIRGLKLIIAAKTNLIFPVKKESSKVKK PSSVQFGCIKFCIRKLTADIEEEPMQGWLDEHYQLLKKEAGELAIRLNFLDELISKAKHSPKSADTIEIDVKDSSTIEST REEIYKRSFRSYYQACQNLVLSEGSGACGEDFQTGFKPSTSRRSLLSISAQDLDVSLKKIDGGDAGMIDVLKKLDPVCFE KDIPFSRLYGANILLSTGSLVVQLRNYTFPLFSGSSGKCEGRLVLAQQATSFQPQIYQDVYVGRWRKVRMLRSATGTTPP MKTYSDLPLHFQKGEVSFGVGYEPAFADVSYAFTVALRRANLSVRHPGPLILPPKKERSLPWWDDMRNYIHGKISLLFSE SRWNILASTDPYEKVDKLQIVTSFMEIHQSDGRVFVSAEDFKILLSSLETLANRRGFRIPTGVSGAFLEAPVFTLEVTMD WDCESGNPMDHYLFALPVEGKPRDRVFDPFRSTSLSLRWNFSLRPFPPSSEKHPTSSITSDNIEESASVFEPPHVSQNVS SVSPTFNFGAHDLAWILRFWSLNYNPPHKLRSFSRWPRFGVPRVARSGNLSLDKVMTEFMLRLDSTPACIKNMPLHDDDP AKGLTFVMTKLKYELCYSRGKQKYTFESKRDILDLVYQGLDLHMLKAFLNKEASPSVAKVVNMVLKSSQSVSLDKIPSEK VYITDKNRDDGFLLSSDYFTIRRQSPKADPARLLAWQEAGRRNAELTYVRSEFENGSETDEHMRSDPSDDDGYNVVIADN CQRVFVYGLKLLWTIENRDAVWAWVGGLSKAFEPPKPSPSRQYAQRKLHEENKRHDGDDFRQDDVSKCPPTGKITNSPSF QDASTSGLLSSPPNSVKVDNLSSAKSENTNDSDGTRHFMVNVIEPQFNLHSEDANGRFLLAAVSGRVLARSFHSVLQVGY EMIEQALGTTDVHISEYQPEMTWKRMEFSVMLEHVQAHVAPTDVDPGAGLQWLPKILRSSPKVMRTGALLERVFMPCNMY FRYTRHKGGTPELKVKPLKELIFNSHNITATMTSRQFQVMLDVLTNLLFARLPKPRKSSLSFPAEDDEDVEEEADEVVPD GVEEVELAKINLEKQEREQKLLLDDIRELSLWCDPSTDLHPEKESDLWMINGGRSMLIQGLKRELLSAQKSRKAASVSLR TALQKAAQLRLTEKEKNKSPSYAMRISLQINKVVWSMLVDGKSFAEAEINDMIYDFDRDYKDVGVAQFTTKYFVVRNCLP NAKSDMLLSAWDPPSEWGKKVMLRVDAQQGAPKDGNSPLELFQVEIYPLKIHLTETMYRMMWEYFFPEEEQDSQRRQEVW KVSTTAGARRVKKGSSVLEASASNSHSIKESETSSKSGISAVLFPATNQPSVHVDSAQASKAENVKENSGTGTTPELRRT SSFDRSWEETVAESVANELVLQSFSSSKDGPFGSTEQQDEASKNKSKDYKVVKGGRASHEEKKVAKSHEEKRSRPRKMME FHNIKISRVELLVTYEGQRFVVNDLKLMMDQFHRPEFTGTWRRLFSRVKKHIIWGVLKSVTGMQGRKFNNKGQSQPTGAG VPEIDLNFSDNEGQAGKSDQYPPSWPKRQGDGAGDGFVTSIRGLFNTQRRKAKAFVLRTMRGEAENDFQGDWSESDVEFS PFARQLTITKAKKLIRRHTKKFRSRGQKGSTSQQRESLPSSPRETTPFDSDSSSGSSPYEDFHE
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Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius
SIGNAL_PEPTIDE
1 31 31 - –
Phobius
SIGNAL_PEPTIDE_N_REGION
1 7 7 - –
PANTHER
PTHR15678
4 2624 2621 0.0 –
PANTHER
PTHR15678:SF10
4 2624 2621 0.0 –
Phobius
SIGNAL_PEPTIDE_H_REGION
8 26 19 - –
TMHMM
TMhelix
12 34 23 - –
Phobius
SIGNAL_PEPTIDE_C_REGION
27 31 5 - –
Phobius
NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN
32 2624 2593 - –
Coils
Coil
700 720 21 - –
SMART
SM01214
1146 1294 149 3.2E-53
IPR019441
Pfam
PF10347
1196 1293 98 6.6E-5
IPR019441
MobiDBLite
mobidb-lite
1653 1672 20 - –
MobiDBLite
mobidb-lite
1654 1669 16 - –
MobiDBLite
mobidb-lite
1713 1793 81 - –
MobiDBLite
mobidb-lite
1723 1746 24 - –
MobiDBLite
mobidb-lite
1749 1793 45 - –
Pfam
PF10351
1913 2459 547 6.3E-107
IPR019443
MobiDBLite
mobidb-lite
1977 1996 20 - –
Coils
Coil
2005 2025 21 - –
MobiDBLite
mobidb-lite
2251 2276 26 - –
MobiDBLite
mobidb-lite
2257 2276 20 - –
MobiDBLite
mobidb-lite
2292 2320 29 - –
MobiDBLite
mobidb-lite
2292 2325 34 - –
MobiDBLite
mobidb-lite
2346 2396 51 - –
MobiDBLite
mobidb-lite
2360 2396 37 - –
MobiDBLite
mobidb-lite
2466 2513 48 - –
MobiDBLite
mobidb-lite
2574 2624 51 - –
MobiDBLite
mobidb-lite
2586 2617 32 - –

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

Unable to find any GO terms for the transcript with the identifier.

Genome browser

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0342700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…