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LotjaGi1g1v0342700.2

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0342700
Transcript ID LotjaGi1g1v0342700.2
Related isoforms 10
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Golgi-body localization protein domain isoform 1; TAIR: AT1G58250.1 HYPERSENSITIVE TO PI STARVATION 4; Swiss-Prot: sp|Q6IMT1|SAB_ARATH Protein SABRE; TrEMBL-Plants: tr|K7KU85|K7KU85_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0342700
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:80490973..80523251) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CGTTTCCCGAAAACCAAAACGAGCACCCACGTTGATTCTCCTGTGCCGGCGTCACACCTGGTAATTCACTCTCTCTCTCT CTCTCTCACTGTCTCCACCATGATGCCTTGGATCACCGAGCACCTCACGGATCGGATCTGATCTCAGGTACTATAAAACA CCAATCAACGCTTCCGATCGCGACGCAACCATCACCATTTCTAGGGTTCTACTTTCTCCCTCTCCTTAATTCTTCTTCTG CTATGGAGTTTCGTCACAGCTTCGCGCAATTCCGAGAGCATGATTGATAATTCAACCATTTTCTACACACAACTGCTTTC CCCTCTTCCGAAATGGCAGCTTCTCCTGTCAATTTCCTCTTCGGATTCTTGCTGCTTTCTATTACATTGTGGCTTCTCTT CATGTAAGTCCCTGCTTCACTTTTTTGCTTACTGAATTTATCGCATTCGTTGTTTTTTAACTGCTTAGCTGTTTAGGTTG GAGAATATGTTGCTTTTTTAGGGTGGACTTAGTAGTATGACAGTTTGGTATGTAAGGGGCAATCAATTTTACCAGTTAGG TATGTTATCAGGGGGAATTGTTCTAGAATTCTAGCACTTAGCACTACACTACACTGTAGAAGACATCGTATTCATTCTCT GTTTCTAAGAATAGGGAGTTCCGTTGAGCAGTTTACCATCTAATCGTAATTCAGTCAACAACATTAACTCGCTCAAAAAT CCCACCCGGTAAACCTCAGTGTAGATAAGGACTGGATGCATTAAGACCTGTTGCATAGAACAGACGAGTAGTGCTTGATG AATACTCTTCAATGTATGTGAGCGTGATCAAATTATATTGAAGATACCAACAAGGTGTAGCACAACTGGTAGATAGTTGG GCTCCTTAACCATCTAGTCCAGGGTTTGATTACTGGGTGATGCGTATGGAGAAGCATTTGTTGGGAGAGGCCTACCCACT 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0342700.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGCAGCTTCTCCTGTCAATTTCCTCTTCGGATTCTTGCTGCTTTCTATTACATTGTGGCTTCTCTTCATATTTGCTTC TGGGTTGCTGGCATGGATTTTGAGCTGGATTTTGGGAGCATCTGTTGGGTTCCGTGTTGGTGGATGGAAATGTTTAAGGG ATGTGGTAGTGAAGTTTAAAAAGGGTACTGTGGAATCTATATCTGTTGGTGAAATTAAACTTAGCTTACGCCAGTCCCTG GTCAAACTTGGTGTGGGTTTCATTTCTCGTGATCCGAAGCTGCAAGTGTTAATATGCGACTTAGAAGTTGTAATGAGGCC TTCAAATAAAAGCCCGGGGAAGAAGAAAATCAAGAAATCCCGTGCTTCAGGCAAGGGAAAGTGGATGATTGTAGGCAATA TTGCAAGATATTTGTCAGTTGGTGTGACTGATCTGGTTCTGAAGACACAAAATTTTACTGTTGAGATCAAGGAATTGAAT GTGGATATATCTAAAGATGGTGGATCCAAGTCAAATGTGATAGTTAGACTACAAATATTGCCTATCCTTGTTCACATTGG TGAGCCACGGCTTAGTTGTGATCAGTTATCTGATTTAAGTGGTGGAGGAAGCATTTCATCTGGCCAGGCATCTATTGCTG CTATAGAAAGGTCTTCTGCCCCTTTTATCTGTGAAAATTTCTCCGTGTCATGTGAAATTGGTCATGATAGGGAAGTGGGT ATAATTATTAAGAATGTGGACGTTTCCAGTGGAGAGGTCACTCTGAATTTGAATGAGGAGTTGCTTTTGAAAAGAAAAAG TTCATCAGAGTCTTCTTCTAGCTCTGACAGTATTATAGGGTTGCGAGCTGATTCTATAAGCACAAAAAAACCATCAAAGC AGCAGCAAACACTTGCATCCTTCTCCAAGTATAGTTCTATGTTTCCTGAAAAGGTCAACTTCAATCTACCAAAGCTGGAT GTGAGTTTCGTGCACCGTGAACATGGTCTTTCTTTTGAAAACAACATCATGGGTATCCAGTTGAAAAGCACCAAATCACG ATCCACTGAGGATGTTGGGGAGAGTACACGCCTTGATTTTCAAGTGGAGTTTAGTGAAATTCATCTTCTTAGAGAAGCTG GTTCTTCCATCCTGGAGATATTGAAGGTGGACTTGATTTCTTTTGTGTATATCCCAGTACAGCCAATTTCACCTGTTAGA GCTGAAACTGAAATCAAGCTAGGAGGCACTCAATGCAACATCATAATGAGCAGGATAAAGCCTTGGTTACTCCTCCATTT TTCTAAGAAGAAAAAAATGGTACTTCGAGAAGAAGCTTCTGTTGTTGTAAAGCCACAATCATCTGATAGTAAGACTATCA TGTGGACATGCAATGTCTCAGCTCCAGAAATGACAATAGTGCTTTTCGATATGGTTGGTTCTCCGGTGTATCATGGTTGC TCACAATCATCACATTTGTTTGCAAACAACGTTTCAAATATGGGGACTACAGTACACGTTGAACTTGGAGAGTTAAATCT TCATTTGGCTGATGAATATCAGGAATCCTTGAAAGAAAGTGTTTTTGGTGTAGAATCAAATTCTGCCTCCATTATGCACA TTGCTAAGGCAAGTTTGGATTGGGGGAAAAAGGACATGGAGTCATTTGAAGAAGATGGTCTTAGGTGTAGATTAGGTTTA TTAGTTGATGTGACAGGCATGGGAGTTTATCTAAATTTTAAGCGTATAGCATCACTCATATCAACAGCTATATCATTTCA AGCTCTATTGAAAGGCCTATCTGCTTCGAAGAAAAAATTGACTCCGAGTCGTGGCCATTTATCAAAACCTTCGGGGAAGG GAACTCAGTTGTTGAAATTTAATCTTGAAAGGTGTTCAGTACATGTATGGGGTGAAACAGGCTTGGAAAATACAATTGTT CCAGATCCCAAGCGGGTTAATTATGGTTCACAGGGTGGTAGAGTTATAATAAATGTGTCTGCAGATGGCACCCCGCGTAA CGCAAACATAATGTCTACTATTTCGGATGAACTCCCGAAGATCAAGTACTCTGTCTCTTTTGAAATCGTTCAATTTAGTG TGTGTGTGAACAAAGAGAAACAATCCACCCAGATGGAACTTGAAAGAGCCAGATCTGTCTATCAGGAATATATGGAGGAA AATAGGCCAGTAACAAAGGTGACATTGTTTGATATGCTAAATGCTAAACTTGTAAAGCGTTCAGGTGGCCTTAAAGAAAT TGCTGTCTGCTCTCTTTTCAGTGCCACTGACATTACTCTAAGGTGGGAACCTGATGTGCATTTATCACTTATTGAACTTG TTCTCCAGCTGAAATTACTGATACACAAAAGCAAGCTTCAGGAGCACGGTAATGAACACATGGGAGACGTGTCTCATGCA CAAGATGCTAATTGGAAACAGGAAACTACCATTGAATCTGGGCATCTGGAAAAGCAGAAAAAGAAAGAATCTATTTTTGC CGTTGATGTAGAAATGTTGAGTATTTCCGCTGGGCTAGGAGATGGGGTTGATGCTATGGTTCAAGTACAGTCAATTTTCT CCGAGAATGCTCGTATAGGAGTGCTCCTAGAAGGACTTATGCTTAGTTTTAATGGGGCCCGAGTTTTCAAGAGTAGTCGG ATGCAAATTTCACGAATTCCTAGTGTCTCTGCTAGTACATCTGATGCGAAAGGACACGTAATTACAACATGGGATTTGGT AATCCAAGGTCTTGATATTCACATTTGCATGCCATACCGTTTGCAATTGCGTGCTATTGATGATGTCATTGAGGATATGA TACGAGGTTTGAAGCTCATAATTGCTGCTAAGACAAATTTGATTTTTCCTGTGAAAAAAGAGAGCTCTAAAGTTAAGAAA CCTAGTTCTGTACAATTTGGATGCATAAAATTTTGCATACGCAAGTTAACTGCTGATATTGAAGAGGAACCAATGCAGGG ATGGCTTGATGAGCACTATCAATTGCTGAAGAAAGAGGCTGGTGAGTTAGCTATCCGGTTGAACTTTCTAGATGAATTAA TATCGAAGGCCAAACACAGTCCAAAATCTGCTGACACCATTGAGATTGATGTAAAAGATTCTTCTACTATTGAGTCCACG AGAGAGGAAATTTATAAAAGATCATTCCGATCATATTACCAGGCATGCCAGAATCTAGTGTTATCTGAAGGGTCAGGTGC TTGTGGAGAAGATTTCCAAACTGGCTTCAAACCTAGTACTTCAAGGAGATCACTTCTTTCAATATCCGCACAAGATTTAG ATGTTAGCTTGAAAAAAATTGATGGTGGGGATGCCGGGATGATTGATGTTCTGAAGAAGCTTGATCCTGTCTGTTTTGAG AAAGATATACCATTTTCTCGACTGTATGGGGCAAATATTCTCTTAAGTACAGGCTCTCTTGTGGTCCAGCTTCGGAATTA CACATTTCCTCTTTTCTCTGGAAGTTCTGGTAAATGTGAAGGTCGTCTTGTTTTGGCTCAGCAGGCAACTAGCTTTCAAC CTCAAATATATCAAGATGTCTATGTTGGGAGATGGAGGAAGGTTCGCATGCTTCGATCAGCTACTGGTACTACTCCACCA ATGAAAACATACTCAGATTTGCCTTTACATTTCCAGAAAGGTGAAGTGTCATTTGGGGTGGGTTATGAACCAGCTTTTGC AGACGTTAGTTATGCTTTCACCGTAGCACTTCGGAGGGCTAATCTAAGTGTTAGGCATCCTGGTCCACTTATTCTTCCAC CAAAAAAGGAGCGGAGTTTGCCGTGGTGGGATGACATGAGAAATTACATACATGGAAAAATTTCCTTGCTCTTTTCTGAA TCAAGATGGAATATTTTGGCAAGTACAGATCCTTACGAAAAAGTTGACAAACTTCAAATTGTGACCAGCTTTATGGAAAT TCACCAGTCCGACGGTCGTGTTTTTGTTTCTGCTGAAGATTTTAAGATTTTATTGAGTAGTTTGGAGACTTTGGCAAACA GACGAGGTTTCAGAATTCCAACAGGTGTCTCTGGTGCTTTTCTGGAAGCCCCGGTCTTTACTCTTGAGGTTACGATGGAC TGGGATTGTGAATCTGGAAATCCCATGGATCATTATTTATTTGCACTTCCAGTTGAGGGAAAACCTCGTGACAGAGTATT TGATCCCTTCAGATCCACTTCTCTCTCCCTTCGATGGAACTTCTCTCTTAGACCCTTTCCTCCTTCATCAGAAAAGCATC CCACATCTTCCATTACTAGTGATAATATTGAAGAAAGTGCCAGTGTATTTGAGCCCCCTCATGTATCTCAGAATGTTTCA TCAGTGTCCCCGACCTTTAACTTTGGAGCTCATGATCTAGCATGGATCTTAAGATTCTGGAGCTTGAACTACAATCCTCC ACATAAACTGCGCAGCTTCTCTCGTTGGCCTCGTTTTGGAGTTCCAAGAGTTGCCAGGTCAGGCAATCTTTCACTTGATA AGGTGATGACTGAATTTATGCTCCGTTTAGATTCCACACCGGCCTGCATAAAAAACATGCCTTTACATGATGATGATCCA GCCAAAGGACTGACTTTCGTAATGACTAAACTGAAGTATGAACTGTGTTATAGTAGGGGGAAGCAAAAGTATACTTTTGA AAGCAAGCGTGACATTCTTGATCTTGTTTACCAAGGTCTTGACCTTCATATGCTCAAGGCTTTCCTAAATAAAGAAGCAT CTCCTAGTGTTGCCAAAGTAGTTAACATGGTACTGAAAAGCTCACAATCTGTTTCTCTGGACAAAATCCCCAGTGAAAAA GTTTACATAACAGACAAAAATCGTGATGATGGGTTTCTGTTGTCCTCTGACTACTTCACTATCAGAAGACAATCCCCAAA GGCTGATCCGGCAAGGTTACTAGCATGGCAAGAAGCAGGAAGAAGAAATGCTGAGTTGACATATGTACGCTCTGAGTTTG AAAATGGGAGTGAAACTGATGAACATATGCGGTCTGACCCAAGCGATGATGATGGTTACAATGTGGTAATAGCTGACAAT TGTCAGCGCGTATTTGTCTATGGTCTTAAGCTTTTGTGGACTATTGAAAACAGAGATGCTGTTTGGGCCTGGGTTGGTGG TTTATCCAAAGCCTTTGAACCTCCCAAGCCCTCTCCATCACGACAGTATGCGCAGAGGAAATTACATGAGGAAAACAAAA GGCATGACGGAGATGATTTTCGACAAGATGATGTTTCCAAGTGCCCTCCCACTGGTAAAATTACCAATTCTCCCTCTTTT CAGGACGCAAGTACTTCTGGATTACTTTCTTCTCCACCTAATTCAGTTAAGGTGGACAACTTGTCGTCTGCTAAAAGCGA GAACACAAATGATTCAGATGGGACCCGACACTTCATGGTGAATGTTATTGAGCCACAGTTTAATCTTCACTCCGAGGATG CAAATGGTAGGTTTCTGCTTGCTGCTGTAAGCGGCCGTGTTTTAGCTCGATCGTTTCATTCAGTCCTTCAAGTTGGTTAT GAGATGATTGAGCAAGCACTTGGTACTACAGACGTACATATAAGTGAATACCAACCTGAAATGACATGGAAAAGAATGGA GTTCTCTGTTATGTTGGAGCATGTACAAGCTCATGTTGCACCAACAGATGTTGATCCAGGAGCTGGACTACAGTGGCTTC CGAAAATTCTCAGAAGCTCGCCAAAAGTAATGCGTACAGGCGCTCTTCTCGAGAGAGTTTTTATGCCTTGTAATATGTAC TTTAGGTACACAAGGCACAAAGGGGGCACGCCAGAATTGAAGGTGAAGCCCTTGAAGGAGCTCATATTCAATTCTCATAA TATAACGGCAACAATGACATCTCGCCAGTTTCAGGTCATGCTTGATGTGTTGACAAATCTTCTCTTTGCACGCCTTCCAA AGCCTCGAAAAAGTAGCCTGTCATTTCCTGCCGAAGATGATGAAGATGTTGAGGAGGAAGCAGATGAGGTGGTTCCTGAT GGTGTTGAAGAAGTGGAACTTGCAAAAATCAACCTTGAGAAACAAGAGAGAGAACAGAAGTTGCTTCTTGATGATATTCG AGAATTGTCTCTTTGGTGTGATCCTTCTACAGATCTACATCCAGAAAAGGAAAGTGACTTGTGGATGATAAATGGCGGAA GATCTATGCTGATCCAAGGACTTAAGAGAGAACTTCTAAGTGCACAAAAATCTAGGAAAGCTGCATCTGTATCACTACGG ACGGCTCTTCAAAAAGCTGCACAGCTACGTCTAACAGAGAAGGAGAAAAACAAGAGTCCTTCCTATGCTATGCGTATATC ATTGCAAATTAACAAAGTTGTTTGGAGCATGCTTGTTGATGGTAAATCTTTTGCTGAAGCCGAGATTAATGATATGATAT ATGACTTTGACCGGGATTACAAGGATGTTGGTGTTGCTCAATTTACTACAAAATATTTTGTTGTCAGAAACTGCCTGCCT AATGCCAAGTCTGATATGCTTTTGTCGGCATGGGATCCTCCATCCGAATGGGGAAAAAAAGTGATGCTTCGAGTAGATGC ACAGCAGGGAGCTCCAAAGGATGGAAATTCTCCCCTTGAACTTTTCCAGGTAGAGATTTATCCCCTTAAGATCCACTTAA CGGAGACAATGTACAGAATGATGTGGGAGTATTTCTTTCCAGAAGAAGAACAAGATTCCCAACGACGACAGGAGGTTTGG AAGGTTTCAACCACGGCTGGTGCAAGGCGTGTAAAGAAAGGTTCATCAGTCCTTGAAGCTTCTGCTTCAAACAGTCATTC AATAAAAGAGTCTGAGACCTCATCCAAATCTGGCATATCTGCAGTGCTATTTCCTGCAACAAATCAGCCTTCTGTCCATG TTGATTCAGCTCAGGCATCCAAAGCTGAAAATGTCAAAGAAAACTCTGGTACTGGTACAACCCCTGAGTTGAGAAGAACA TCTTCTTTTGACCGAAGTTGGGAAGAGACTGTTGCAGAATCTGTAGCAAATGAACTTGTCTTACAAAGTTTCTCTTCCTC AAAAGATGGTCCATTTGGTTCTACGGAGCAACAAGATGAAGCATCTAAGAATAAATCAAAAGATTACAAAGTTGTTAAAG GTGGTCGTGCATCTCATGAAGAAAAAAAGGTAGCTAAGTCACATGAAGAAAAGAGATCTAGGCCACGAAAGATGATGGAG TTTCACAACATTAAAATTAGCCGGGTTGAGTTGTTGGTTACATATGAAGGGCAAAGGTTTGTTGTGAATGATCTCAAACT AATGATGGATCAATTTCACCGGCCTGAGTTTACTGGGACTTGGCGAAGACTATTTTCACGAGTTAAGAAACACATCATTT GGGGAGTCCTGAAGTCTGTAACTGGAATGCAGGGGAGGAAATTTAATAACAAAGGTCAGAGTCAGCCTACCGGAGCTGGT GTTCCTGAAATTGACCTTAATTTTAGTGACAATGAAGGCCAGGCAGGAAAATCTGATCAATATCCACCATCTTGGCCTAA GCGTCAAGGTGATGGTGCAGGTGATGGATTTGTAACATCCATTAGAGGACTGTTCAATACTCAACGTCGCAAGGCAAAGG CATTCGTGCTACGAACTATGAGGGGTGAAGCTGAGAATGATTTTCAAGGTGATTGGAGTGAAAGTGATGTTGAGTTCTCC CCTTTTGCGAGGCAACTCACAATTACAAAAGCCAAGAAACTTATTAGGAGGCATACTAAGAAGTTTCGCTCCAGAGGACA AAAAGGTTCAACTTCTCAACAAAGAGAATCTCTACCATCATCACCAAGAGAGACAACCCCATTTGACAGTGATTCTTCAA GTGGATCCTCACCCTATGAAGATTTTCATGAATAG 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0342700.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MAASPVNFLFGFLLLSITLWLLFIFASGLLAWILSWILGASVGFRVGGWKCLRDVVVKFKKGTVESISVGEIKLSLRQSL VKLGVGFISRDPKLQVLICDLEVVMRPSNKSPGKKKIKKSRASGKGKWMIVGNIARYLSVGVTDLVLKTQNFTVEIKELN VDISKDGGSKSNVIVRLQILPILVHIGEPRLSCDQLSDLSGGGSISSGQASIAAIERSSAPFICENFSVSCEIGHDREVG IIIKNVDVSSGEVTLNLNEELLLKRKSSSESSSSSDSIIGLRADSISTKKPSKQQQTLASFSKYSSMFPEKVNFNLPKLD VSFVHREHGLSFENNIMGIQLKSTKSRSTEDVGESTRLDFQVEFSEIHLLREAGSSILEILKVDLISFVYIPVQPISPVR AETEIKLGGTQCNIIMSRIKPWLLLHFSKKKKMVLREEASVVVKPQSSDSKTIMWTCNVSAPEMTIVLFDMVGSPVYHGC SQSSHLFANNVSNMGTTVHVELGELNLHLADEYQESLKESVFGVESNSASIMHIAKASLDWGKKDMESFEEDGLRCRLGL LVDVTGMGVYLNFKRIASLISTAISFQALLKGLSASKKKLTPSRGHLSKPSGKGTQLLKFNLERCSVHVWGETGLENTIV PDPKRVNYGSQGGRVIINVSADGTPRNANIMSTISDELPKIKYSVSFEIVQFSVCVNKEKQSTQMELERARSVYQEYMEE NRPVTKVTLFDMLNAKLVKRSGGLKEIAVCSLFSATDITLRWEPDVHLSLIELVLQLKLLIHKSKLQEHGNEHMGDVSHA QDANWKQETTIESGHLEKQKKKESIFAVDVEMLSISAGLGDGVDAMVQVQSIFSENARIGVLLEGLMLSFNGARVFKSSR MQISRIPSVSASTSDAKGHVITTWDLVIQGLDIHICMPYRLQLRAIDDVIEDMIRGLKLIIAAKTNLIFPVKKESSKVKK PSSVQFGCIKFCIRKLTADIEEEPMQGWLDEHYQLLKKEAGELAIRLNFLDELISKAKHSPKSADTIEIDVKDSSTIEST REEIYKRSFRSYYQACQNLVLSEGSGACGEDFQTGFKPSTSRRSLLSISAQDLDVSLKKIDGGDAGMIDVLKKLDPVCFE KDIPFSRLYGANILLSTGSLVVQLRNYTFPLFSGSSGKCEGRLVLAQQATSFQPQIYQDVYVGRWRKVRMLRSATGTTPP MKTYSDLPLHFQKGEVSFGVGYEPAFADVSYAFTVALRRANLSVRHPGPLILPPKKERSLPWWDDMRNYIHGKISLLFSE SRWNILASTDPYEKVDKLQIVTSFMEIHQSDGRVFVSAEDFKILLSSLETLANRRGFRIPTGVSGAFLEAPVFTLEVTMD WDCESGNPMDHYLFALPVEGKPRDRVFDPFRSTSLSLRWNFSLRPFPPSSEKHPTSSITSDNIEESASVFEPPHVSQNVS SVSPTFNFGAHDLAWILRFWSLNYNPPHKLRSFSRWPRFGVPRVARSGNLSLDKVMTEFMLRLDSTPACIKNMPLHDDDP AKGLTFVMTKLKYELCYSRGKQKYTFESKRDILDLVYQGLDLHMLKAFLNKEASPSVAKVVNMVLKSSQSVSLDKIPSEK VYITDKNRDDGFLLSSDYFTIRRQSPKADPARLLAWQEAGRRNAELTYVRSEFENGSETDEHMRSDPSDDDGYNVVIADN CQRVFVYGLKLLWTIENRDAVWAWVGGLSKAFEPPKPSPSRQYAQRKLHEENKRHDGDDFRQDDVSKCPPTGKITNSPSF QDASTSGLLSSPPNSVKVDNLSSAKSENTNDSDGTRHFMVNVIEPQFNLHSEDANGRFLLAAVSGRVLARSFHSVLQVGY EMIEQALGTTDVHISEYQPEMTWKRMEFSVMLEHVQAHVAPTDVDPGAGLQWLPKILRSSPKVMRTGALLERVFMPCNMY FRYTRHKGGTPELKVKPLKELIFNSHNITATMTSRQFQVMLDVLTNLLFARLPKPRKSSLSFPAEDDEDVEEEADEVVPD GVEEVELAKINLEKQEREQKLLLDDIRELSLWCDPSTDLHPEKESDLWMINGGRSMLIQGLKRELLSAQKSRKAASVSLR TALQKAAQLRLTEKEKNKSPSYAMRISLQINKVVWSMLVDGKSFAEAEINDMIYDFDRDYKDVGVAQFTTKYFVVRNCLP NAKSDMLLSAWDPPSEWGKKVMLRVDAQQGAPKDGNSPLELFQVEIYPLKIHLTETMYRMMWEYFFPEEEQDSQRRQEVW KVSTTAGARRVKKGSSVLEASASNSHSIKESETSSKSGISAVLFPATNQPSVHVDSAQASKAENVKENSGTGTTPELRRT SSFDRSWEETVAESVANELVLQSFSSSKDGPFGSTEQQDEASKNKSKDYKVVKGGRASHEEKKVAKSHEEKRSRPRKMME FHNIKISRVELLVTYEGQRFVVNDLKLMMDQFHRPEFTGTWRRLFSRVKKHIIWGVLKSVTGMQGRKFNNKGQSQPTGAG VPEIDLNFSDNEGQAGKSDQYPPSWPKRQGDGAGDGFVTSIRGLFNTQRRKAKAFVLRTMRGEAENDFQGDWSESDVEFS PFARQLTITKAKKLIRRHTKKFRSRGQKGSTSQQRESLPSSPRETTPFDSDSSSGSSPYEDFHE 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 31 31 -
Phobius 1 7 7 -
PANTHER 4 2624 2621 0.0
PANTHER 4 2624 2621 0.0
Phobius 8 26 19 -
TMHMM 12 34 23 -
Phobius 27 31 5 -
Phobius 32 2624 2593 -
Coils 700 720 21 -
SMART 1146 1294 149 3.2E-53
Pfam 1196 1293 98 6.6E-5
MobiDBLite 1653 1672 20 -
MobiDBLite 1654 1669 16 -
MobiDBLite 1713 1793 81 -
MobiDBLite 1723 1746 24 -
MobiDBLite 1749 1793 45 -
Pfam 1913 2459 547 6.3E-107
MobiDBLite 1977 1996 20 -
Coils 2005 2025 21 -
MobiDBLite 2251 2276 26 -
MobiDBLite 2257 2276 20 -
MobiDBLite 2292 2320 29 -
MobiDBLite 2292 2325 34 -
MobiDBLite 2346 2396 51 -
MobiDBLite 2360 2396 37 -
MobiDBLite 2466 2513 48 -
MobiDBLite 2574 2624 51 -
MobiDBLite 2586 2617 32 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

Unable to find any GO terms for the transcript with the identifier.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0342700.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…