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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0364500 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0364500.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Branched-chain-amino-acid aminotransferase; TAIR: AT1G10070.1 branched-chain amino acid transaminase 2; Swiss-Prot: sp|Q9M439|BCAT2_ARATH Branched-chain-amino-acid aminotransferase 2, chloroplastic; TrEMBL-Plants: tr|A0A072V3G0|A0A072V3G0_MEDTR Branched-chain-amino-acid aminotransferase; Found in the gene: LotjaGi1g1v0364500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:84067303..84091043) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CTGCAATATTTGTATAAATGGGTACACGTATCACCTAAAATTTCAATCTGCAGATTCTAGAGCTGGTGCGGTCTTTTGCC TTCTTATCAGTCTTTTTCTTCCTCTTCTTCAAGGTGATGATTTTTTGTTGTACTTTCTTTATATGCTTTTTTCATTGGTG ATATGTTATTAGGCTGCATTTTGTTTTAAACGCTAGCTTTCATGTCTGCTTCTTGGGTATGTCTACAACAAGAAAATCCA AATTCACATGAATTTTCTGCAAATTAATTTTAACATATATATTATAGATGGAATAATGATACATACACATTTCATTACAT CTTTCATCTTATTTTTACACATTTTTCTTCTTATTTTTTTTATATTTTTTGTCACATCACAAATCAAATCACTCATTTAT CTCTTCTCTTCTCATTTACTTAAGGTGGAGATGGAAATGAGAAGTTAAGACAACATTATCCATTGTCTCTTCATTGTAGA TGATATACGCTCCAAAACTATTGTATTTTAAGGTTATGCACAAAGTTTAAGAGTTCATTAATGTTATAATTTGACCGAAA CACTCTTATCTAATATGAGTTATATGAAAGAGGAGAATGTAGTGCCTGTTTGGTTTTCAGCAAGGAAGTCCGTTTGAAGC ATTGAAATTCGATATCACAATTTCCAATGCGCATTCAACAAACGGAATGCACTTGTTGGGTTGAGTGAATGTGCTTTCAC ATTCACTCAACTGAAAACCAAACAGGCTCGTAAATCATTGGTCTAATTGATGAGAATTGTGATTGGTTGAAATAAAAGAT GATACTTGGGAAATACAATATTAAATGAGGACATGAATGGAAGAGAATGAGATAAAGTGTTTTGGATATGTAAAACAACA ATGGTTTGAAATTTCTATATTTTATTTATTAATTTATTTCCAACTCACTTATCTCCAATGTAATTGGATGATGAGTTATT 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AAGAAAAGATGAACGCACCACTTATTCCATTTAATTGTAAATTTACTTTAGGGATAATAATTAATAAGTAACTGTCTTCA TCCCTGAAATGTGAAATTTAGGGATTGTTTGAAGGCACGAAAGCATGCAGAAGCGAAAATGGGCGATTGCTGCTCTTCCG TCCAGAGGAAAATGCCATCCGCATGAAGATTGGCGCCGAGAGAATGTGCATGCAATCCCCTTCAATCGATCAATTCGTCG ATGCTCTCAAGCAAACTGCACTTGCAAACAAGCGTTGGGTAAGATCATCCTAAACTAAATCAATGCATTTCAATGATTTC GTGTTACATTTGAATTTCCTCACACAATTGATGTAAACCCTTATCAGATTCCTCCACCGGGTAAAGGATCATTGTATATG AGGCCTCTCCTCTTAGGAAGTGGTCCAGTTTTGGGTTTGGCTCCTGCACCTGAATACACTTTCCTTGTATATGCTTCCCC TGCTCGTAACTATTTCAAGGTTAGTGATACTTCGTTTGATTTTTACTAACTTCAACTTACTTCATAAATTCAATCTTGTT TCTTTGTTCCCACCGCAGGAGGGTTCCGCGCCGCTCAGCTTGTTCGTGGAGGAGGATTTTGACCGTGCTTCTCGCCGCGG CACCGGAAGCGTGAAAACCATATCTAACTATGCTCCGGTATGCATTTTTCATGTCTTTAATTGAAACCAAACCAAACTAA ATTATTATCTTGTGTATAAATTAAACATCAGAACAATATAAAATGACATAGTTTTTGTTCATTTTTGTTTGGTTTAGCTG TGAGTTGTTCAAAACTTTTATTTATTGGTCGCAGCTTTCCCCAATTTCTTTGACTGTCAATTTTTCATCTAAAGTATATG TTCAGTGAATTTGGACAAAAATGTAAAGGGGGTGTTTGGACTTTGGAGTATTCAGTAAGTTGTGCTACTTGTCTTGATCT GTAGGTCTTATTGGCAGAACAAAAAGCCAAGGACAGAGGATTTTCGGATGTGTTATACCTTGATTCAGCGACCAAGAAAA ATCTGGAGGAGGTCTCTTCTTGTAACATTTTTATTGCCAAGGTATTATTCTGGTAGCATTTTTCTCATAAGAATGTTGCA ATACCTCGATCGACATATGATGAGTGACGTGGAAGAACAAAAGAAAAATGTACACTAACTTAGAGCTAGTGTTTGTAAGC TAATGGGAGCATACATGGCATGTCTTTCATAACCAAAGTCCAGAATTAGAAGTTGTGATGTTAATTATGGTTCTATCTGA TTTAATGCAAGAAATTACACTAAACTGATTAAAAAATGTAAGTAGATTGTCATCAAAAGTTTGAGATTTTGTATGTAAAC ATGGATTGGAATGAATAGGAGGTATTTTCTATATTTAATGGATCATATGATATGATCAAACATACAACATAAGATAAAAA AATAATAATGAGGTTGTGTTAGAGAACAGAATTTTAGACAATTGCAGTTAAGTTGGATTGTTTACCTTCCCTTTTTGCGC ATGTTACTAAATGATTTAGTGAAATTCAATCTATAGAGCAAATTATCAACTGTCTGTATTCACTTGTAACTGGCCAATCT AATTCGTTTCCTAATCTCGCAGGGAAAATGCATCTCAACACCTGCTACCAATGGAACCATACTTCCCGGAATCACCAGAA AAAGTGTAATTGAAATTGCTGGTGATCTTGGCTATCAGGTAAGAATATATACTTGTGGCTCCTACATTCAATATTTTGTG CTTGTGTTTGGATATTAGTTGAGTGCCAACTTGAATAGACTCTTATCTTGATACTCCCTCCGTTCCCATATATAAGTCAC ATTTTGAGAAAAAAAAAATTTCCAAAATATAAGTCACTTTTTAGATATCTAGAAAGCATTAAATTCAGTTTTCCAAATTT ACCCTTATATATACTCCTATACTCCTGCTTATCATTCCCCATGCCACTATCATTTACCACTAAATTTAATTACTCCATAA ACTAACCCAAATTTTCACAACATTTTGACTTGGTGACCGAGACAATTAATTGGCACAAGAAAAGTTAGAAAAAATTGATG AATTGAGGTGTTGTTGCTCTCAATATAAGTCTAACAAATTCATATCTATTTCCATTTGGAGTAAACTGTTTGGAGCCCAC ATTAACATTAGAGTATCAATATATAAGCTGAAACTGTTTTGGTTCCCAAAAAACAAATTTGGTGGGAAAAATTTTAGTGT GAAAATTTTAGTGAAAAGGCTTGGAAGGAACTGTTTTGGTTCCAAAAAAACAAAATTGATGGGAAAATTTTTAGTATAAA AATTTCATTTCAAAGCTTGGATGAAAATTTTGGTGTTGGAGGGAGTTTTATTTCACATGATAAATTCATATCTGATTTTA CGCCTAGCCTACTCAAACTTAAGTTGGAGGGAGTAATGTACAATTAAAACAATATTGAATGACTCATTGTTATATGGAGT AGTACAACTTTAGAGATAGTGGGATATTAATACAATTTTCAGATAAAGAGAAGAATTAATTGGATTGCTAAACTTTTAAA TGGGGGCAGTTTAGGAAAATTAATTAGAAATTTTACAAATTTATTGCTTTCTAACTAGATTTTAACTACTTTCTTAATCT AAGATAATTAGTTAATTGTGACTTATATATGGGAACGGAGAGAGTATATAAGAAGAGCTATATTCACTTTTTATGTTGAA GTGCGTGCTAATGTCCGTTTACACTAAAGCTATTGGATATACAAACATATTGTTTCTGGCTTTTTGAATTCATGATCAGT CTTTCTCACAGACAGTAAAAATTTGAATATTCCTTTGTTATGTTTGTTTAAGCTATACCAGGTATTGATAATTAGTTTAA ATTTTCTTCTGACGAATTTTCTGTTGAAGTTTTCAGCAAATTAAAGTCGTATAACCCATTAGTATTGTCTTCTATAGCAA CAAAAGACTTATCATACTAAGTGTAGTATTGTCTTCTAAACCAGTATAAATAGAAATATAAATAGGAACACTAATCTTTT AAAAAAGAAAGTCATTACAATTTACAACAAAGTAGTCTTACGAAGTTTAAGGAAAACAAATGTTTGACCAAAACACTTGT TTGAAGTTCACATCATAGAGTTGATCAAATTAGAGCTTTGTATATTATTTTTCTCTTTCAGTTTACCGATTGACCAAATT GGTTCAGGTAGAAGAGCGTGCTGTAAACGTGGATGAATTGATTGAGGCTGATGAAGTGTTCTGCACAGGAACTGCTGTTG GTGTTGCAGCTGTAGGCAGTATCGCATACCAGGACAGAAGGTAATTGGTAACTTACATGTATAACAATGTAACTTACGTT TTTAGATTAAGTAAAGCTAATTTCTTCTCTGATCATATATCAACTACTTAAAACTTCTTCTCTAGATATATTACAAATCT TCATTTACTAGATATTTTATTGCAATTTTATTAAACAGGTATAATAAATGCACCATATTAGTCCAAAATTTACTGAAATA TTATGTTATATATCTGCAGGGTGGAATATAAGACAGGTTCTGGAACCATTTGTCAAGAGCTGTACAAAACTATTTTAGGA ATTCAAATGGGTATTATTGAAGATAAGAAGGGGTGGATCGTTGAAATTGATTAATACGTTCGGTTGCATCTGCTGTCTTA ATATCTTCCAGTGACTTCCTGTTTCTTTGAATTTGTAGATATTCTCCATCATCTTAAAACTACCCATTCAAATTTGCTTC AGGGTTTTCTCCAAACCTTCTAGATTGTTTACGAATTTAAATCTTCCAAATCCGAACTGTCACCTTGCAAGTTTTCCTTT CTTTCTTGGCACGTACACATTCAGCACATTTGTGCTGTACACATTCATCACACTCCCCATGGCCAAAACTCCAGGTTTAA ACTCATTTGTTATGATATAAGAAAATAGTGAGGTAATTGGAAATTTTGTTGTTGAACTCCATTTCTACCATCATCCTCCT CTTAATTAAGTATCTTTCTCCTTTGTCAATAATCAAATTACCCAAAAGTTGCTTGTCCTCTGCCGATGCTCTGTCTCCAT CGTGTCACTACAATTCATGGTTGCTCACTGGTTTGGTGTTGTTGTTTTGATGATTCCTACCTTATGGACCACAACTTCTG TGTAGTTCTGTATTTATTACCTTCTCTATGTTACTACTTCCAAATTTCATTTGTAGTTAACTGAAATATGTAAGAAAAAT GAAAAACAGTATGAAATATTGGAATATTTATGTTGCATAATGAAAAAAGTGAAAATGATATAAAGATTGGGCATGATGCT GCCATTTCACAGATTCATATACTTGTTTATGGGTTTTCGTGTGGGCGAAAGGAATCAGTAATGTGTGTTTTCTTTACAAT GGAACTCATTATCTTGTAAGTTCACAAATAACGATACTTATTTAAATTTGGCTTTGTTTACCATGGACTAATAAAAATTT GACTCAAAGATTGAAAGAGTTTTTCTACAAATTAATTTTAACATGTAAGAAACATATTGTAAATAAAATGTACTAAATGT TAGTAGTAAAGACATTAATATATATTAGAAAAGAACAACTTCTAGCATGACGTTACACGTTAGCTTTTCCACCTTGGCCC TATTTGCCCTTACCTTATTTCTCCTGATATTTTACACGTGCTAAACCTAAACTCTTTCTCCTCCTCTTTCAATTTGCGCC GCTCACCATCAACGTATTATTCTAATCTGAAATCTTCTTCTTCCTCCTGTGACTTTGTTTCTCTCTGCGCCCAAACCCTA ACGCCACCAAGCTTAATTCATACGTTCACCGTTCTTCTTCAACACTCTTTCTTGCACGGTTAAATTTTTTCCACATGTGC CCTGATTTCTCCAAGCTCTTCCTCCTCCTCTTTCAATTGCGCGGCTCCTCTCACCTCTTCTCATTGACTGCTCATCGGTT TACAAAAGAGGTTCATGCTGGCAAAGGCGGCGGCGGCGGCGGAAGGTTGCTAGGGTTTTGCAGGCTCCGTCGGTTGTGTG TGTGATTCGTTTCGATTCCCAAACTATTGGTGACAGTTACACTGTGAAAGAGAGAAGGTGGAATTATCAGAGGGAGGAGT CAATTTTGATCTTCGTATTTGTTTAAAAGTTGTAATTGCATGGAACGACAACAACAGCAACCAGAGCAGAGCCACCTCCT CAGTAGCGGAGGTGATTCCCCACCACCCTTTCTTGCATTTTTCTTTTTGTGAAATCATAAAAAGGCCATCTTATTATTAA AGCACTAAATTAACAATTTTGAATGGAATGCAGATGTTCATTTACAGCATAGCATGGACCTCCTGGGTACACTTTTGCAA TTCTGTTCCTGTACAAACACGGGAGGAGAAGGATGTTTATGGTATTCCTTGAGAGAGCTTGAACATAAAAGAGGTATGAG AAGCAAGCCATTGAAAAGAAGTAAGAATTTTTAATTTCTTTAGTTTGTCTTTCCTGAAACT
CDS sequence (LotjaGi1g1v0364500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGGGAGTTACAGCAGCTATGCATCTCAACCCTCCCTTGTTGAAATCCCAGACCAAACATACAGTGACGATGAATATGC CAATGTGGATTGGGACAACCTTGGATTTGAACTAATGCCAACTGATTACATGTACATTGATAAATGTTGCGCGGGTCAAA AATTTGTACGAGGACAGCTTAGTCGTTATGGCAACATCGAACTGAGCCCATCAGCTGGGGTTCTAAATTATGGTCAGGGA TTGTTTGAAGGCACGAAAGCATGCAGAAGCGAAAATGGGCGATTGCTGCTCTTCCGTCCAGAGGAAAATGCCATCCGCAT GAAGATTGGCGCCGAGAGAATGTGCATGCAATCCCCTTCAATCGATCAATTCGTCGATGCTCTCAAGCAAACTGCACTTG CAAACAAGCGTTGGATTCCTCCACCGGGTAAAGGATCATTGTATATGAGGCCTCTCCTCTTAGGAAGTGGTCCAGTTTTG GGTTTGGCTCCTGCACCTGAATACACTTTCCTTGTATATGCTTCCCCTGCTCGTAACTATTTCAAGGAGGGTTCCGCGCC GCTCAGCTTGTTCGTGGAGGAGGATTTTGACCGTGCTTCTCGCCGCGGCACCGGAAGCGTGAAAACCATATCTAACTATG CTCCGGTCTTATTGGCAGAACAAAAAGCCAAGGACAGAGGATTTTCGGATGTGTTATACCTTGATTCAGCGACCAAGAAA AATCTGGAGGAGGTCTCTTCTTGTAACATTTTTATTGCCAAGGGAAAATGCATCTCAACACCTGCTACCAATGGAACCAT ACTTCCCGGAATCACCAGAAAAAGTGTAATTGAAATTGCTGGTGATCTTGGCTATCAGGTAGAAGAGCGTGCTGTAAACG TGGATGAATTGATTGAGGCTGATGAAGTGTTCTGCACAGGAACTGCTGTTGGTGTTGCAGCTGTAGGCAGTATCGCATAC CAGGACAGAAGGGTGGAATATAAGACAGGTTCTGGAACCATTTGTCAAGAGCTGTACAAAACTATTTTAGGAATTCAAAT GGGTATTATTGAAGATAAGAAGGGGTGGATCGTTGAAATTGATTAA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0364500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MGSYSSYASQPSLVEIPDQTYSDDEYANVDWDNLGFELMPTDYMYIDKCCAGQKFVRGQLSRYGNIELSPSAGVLNYGQG LFEGTKACRSENGRLLLFRPEENAIRMKIGAERMCMQSPSIDQFVDALKQTALANKRWIPPPGKGSLYMRPLLLGSGPVL GLAPAPEYTFLVYASPARNYFKEGSAPLSLFVEEDFDRASRRGTGSVKTISNYAPVLLAEQKAKDRGFSDVLYLDSATKK NLEEVSSCNIFIAKGKCISTPATNGTILPGITRKSVIEIAGDLGYQVEERAVNVDELIEADEVFCTGTAVGVAAVGSIAY QDRRVEYKTGSGTICQELYKTILGIQMGIIEDKKGWIVEID
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 4 | 361 | 358 | 9.5E-206 | – | |
| PANTHER | 4 | 361 | 358 | 9.5E-206 | – | |
| Gene3D | 6 | 188 | 183 | 3.0E-56 | ||
| PIRSF | 9 | 361 | 353 | 4.8E-110 | ||
| SUPERFAMILY | 20 | 357 | 338 | 7.19E-99 | ||
| TIGRFAM | 58 | 360 | 303 | 3.2E-93 | ||
| CDD | 67 | 348 | 282 | 1.43684E-119 | ||
| Pfam | 80 | 318 | 239 | 2.9E-39 | ||
| Gene3D | 189 | 361 | 173 | 1.3E-59 | ||
| ProSitePatterns | 244 | 273 | 30 | - |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Catalytic activity | Catalysis of a biochemical reaction at physiological temperatures. In biologically catalyzed reactions, the reactants are known as substrates, and the catalysts are naturally occurring macromolecular substances known as enzymes. Enzymes possess specific binding sites for substrates, and are usually composed wholly or largely of protein, but RNA that has catalytic activity (ribozyme) is often also regarded as enzymatic. | ||
| Molecular function | Branched-chain-amino-acid transaminase activity | Catalysis of the reaction: a branched-chain amino acid + 2-oxoglutarate = L-glutamate + a 2-oxocarboxylate derived from the branched-chain amino acid. | ||
| Biological process | Branched-chain amino acid metabolic process | The chemical reactions and pathways involving amino acids containing a branched carbon skeleton, comprising isoleucine, leucine and valine. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0364500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…